琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析
琼脂糖凝胶电泳流程

琼脂糖凝胶电泳流程
琼脂糖凝胶电泳是一种用于分离和分析DNA、RNA 或蛋白质等生物大分子的技术。
以下是一般的琼脂糖凝胶电泳流程:
1. 准备电泳缓冲液:根据需要选择适当的电泳缓冲液,如TAE (Tris-乙酸-EDTA)或TBE(Tris-硼酸-EDTA)缓冲液。
缓冲液用于维持电泳过程中的酸碱平衡和离子浓度。
2. 制备琼脂糖凝胶:将琼脂糖粉末加入电泳缓冲液中,按照一定的比例加热溶解,制备琼脂糖凝胶。
通常根据需要选择不同浓度的琼脂糖凝胶,如0.8%、1%或1.2%等。
3. 制备样本:将待分析的DNA、RNA 或蛋白质样本与适量的电泳缓冲液混合,使其溶解或悬浮。
4. 加载样本:将样本小心地加载到琼脂糖凝胶的孔中,可以使用移液器或微量注射器。
加载时要避免产生气泡。
5. 电泳:将加载好样本的琼脂糖凝胶放入电泳槽中,连接电源,进行电泳。
根据样本的性质和目的,选择适当的电泳条件,如电压、电流和电泳时间。
6. 观察和记录:电泳过程中,DNA、RNA 或蛋白质样本会根据其大小和电荷性质在凝胶中移动。
可以通过染色或荧光染料来观察和记录样本的迁移情况。
7. 分析结果:根据样本在凝胶中的迁移距离和位置,可以判断样本的大小、纯度和数量等信息。
还可以通过凝胶成像系统对电泳结果进行拍照或分析。
具体的琼脂糖凝胶电泳流程可能会根据实验目的和样本类型有所不同。
在进行实验前,建议仔细阅读相关的实验手册和操作指南,并根据实际情况进行适当的调整和优化。
琼脂糖凝胶电泳制胶

琼脂糖凝胶电泳制胶方法
1,制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml):称取0.7 g(0.5 g)琼脂糖置于锥形瓶中,加入70 ml(50ml)1×TAE,瓶口倒扣小烧杯。
微波炉加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液。
2,胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板。
取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子。
将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子,将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层。
3,室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止。
琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis)是一种常见的分离和鉴定DNA和RNA分子的实验技术。
它基于DNA和RNA分子在电场中对琼脂糖凝胶的移动速率的差异来进行分离。
以下是琼脂糖凝胶电泳的详细过程与步骤分析:1.准备琼脂糖凝胶:-准备琼脂糖溶液:按照规定比例在缓冲液中加入适量的琼脂糖并混匀。
-加热琼脂糖溶液:将琼脂糖溶液加热至完全溶解,通常在微波炉或水浴中进行。
-倒入模具:在凝胶电泳槽中设置模具,倒入热琼脂糖溶液并待其凝固。
2.准备样品:-提取DNA或RNA:采用适当的提取方法从待测样品中提取所需的DNA 或RNA。
-混合DNA或RNA与加载缓冲液:将提取的DNA或RNA与适量的加载缓冲液混合,以增加样品密度并提供电泳所需的离子浓度。
3.加载样品:-打开模具和样品孔:在琼脂糖凝胶上方打开模具,使用注射器或微量吸管在样品孔中加入适量的样品。
-加载DNA或RNA标记物:如果需要对DNA或RNA进行标记,则需要在样品中加入适量的荧光标记物,并在加载完样品后用紫外灯进行可视化检测。
4.进行电泳:-连接电极:将电泳槽连接到电源,将阳极和阴极电极分别插入缓冲液中的两端。
-调节电流:将所需电流值设置在电源上,并进行预运行电流以使电流通过样品和凝胶。
-进行电泳:打开电源,开始电泳过程,直到样品达到适当的分离位置。
5.可视化与分析结果:-停止电泳:当DNA或RNA样品达到预期位置时,关闭电源并断开电极。
-可视化:用染料(如乙溴橙)染色凝胶电泳的凝胶,或使用紫外灯照射凝胶以可视化DNA或RNA标记物的荧光。
-分析结果:使用图像捕捉设备(如凝胶图像系统)记录凝胶的图像,并根据DNA或RNA标记物的迁移距离和大小进行结果分析。
琼脂糖凝胶电泳常考操作流程

琼脂糖凝胶电泳常考操作流程
准备工具:用蒸馏水将制胶工具洗干净,准备好制胶平板,用琼脂将模具边缘封闭,架好梳子。
配制琼脂糖凝胶:根据要分离的样品(DNA)大小配制合适浓度的琼脂糖凝胶。
将一定量的琼脂糖干粉加入到合适体积的锥形瓶中,加入一定量的电泳缓冲液(30ml左右TAE)。
融化琼脂糖:将琼脂糖放入到微波炉内加热融化,冷却片刻(不烫手即可)。
浇灌凝胶:融化后的琼脂溶液摇晃混匀,倒入电泳槽中,等其凝固。
凝固凝胶:室温下凝固30-40min左右,小心的拔出梳子,取出凝固好的凝胶放入电泳槽内,准备上样。
加入电泳缓冲液:在电泳槽中倒入电泳缓冲液(TAE);没过胶面1mm左右,去除胶孔内的气泡。
上样:将DNA样品和对应体积的上样缓冲液(loading buffer)和染料混合,用抢混匀后加入到凝胶孔内。
电泳:上样结束,接通电源,红色正极,黑色负极,DNA样品有负极往正极运动,加样孔侧为负,,40-50v电压,电压30敏左右即可(<40min)。
观察结果:电压结束,关闭电源,凝胶成像仪上观察电压位置并比对marker 判断大小。
琼脂糖凝胶电泳步骤

琼脂糖凝胶电泳一、步骤:1、制胶(1%):将加入30ml 1×TAE缓冲液和0.6g琼脂糖的三角瓶在微波炉加热至沸腾,摇匀至无颗粒。
2、倒胶:先插梳子,再倒胶。
胶冷却至60℃左右(不烫手)加染料后(胶-GelRed:1ml-1ul或30ml胶+3ulGelRed)缓缓倒入电泳槽(先胶布封口,放好梳子),待胶凝固后取出梳子。
3、加样:1µl RNA + 2µl loading buffer混匀。
(点样孔置负极端即黑对黑,红对红)。
4、电泳:稳压条件下120V电泳,待溴酚蓝移动至接近胶前沿(约1cm)时停止电泳(约25min)。
5、观察结果:紫外分析仪上254nm观察,DNA存在处显亮绿色荧光条带,观察酶切后与未酶切质粒的DNA带位置,拍照。
二、注意事项:1、凝胶制备过程中,溶解的凝胶应及时倒入板中,避免倒入前凝固结块。
倒入板中的凝胶应避免出现气泡,影响电泳结果。
2、巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。
高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。
3、电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
4、如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象。
5、变性的DNA样品可能导致条带模糊和缺失,也可能出现不规则的DNA条带迁移。
在上样前不要对DNA样品加热,用20mM NaCl缓冲液稀释可以防止DNA变性。
6、太多的DNA上样量可能导致DNA带型模糊,而太小的DNA上样量则导致带信号弱甚至缺失。
琼脂糖凝胶电泳的关键操作

琼脂糖凝胶电泳的关键操作
琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物分子分离和分析方法,其关键操作包括以下几个步骤:
1. 制备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖粉末加入缓冲溶液中,充分溶解后通过加热使其完全溶解,然后倒入凝胶模具中,等待凝胶固化。
2. 样品准备与加载:将待测样品与一定量的负载缓冲溶液混合均匀,然后用微量移液管将混合液滴加到已经形成的琼脂糖凝胶槽中,确保不产生气泡。
3. 进行电泳:将琼脂糖凝胶槽放入电泳槽中,加入适量的电泳缓冲液,确保液位高过琼脂糖凝胶,然后连接电源,设定适当的电场强度和时间,进行电泳。
4. 染色与可视化:电泳结束后,将琼脂糖凝胶取出,用染色剂进行染色,例如利用乙溴蓝染色DNA,然后用透明胶纸或透明薄膜包裹琼脂糖凝胶,用紫外光透射或背光观察结果。
5. 结果分析:根据琼脂糖凝胶电泳结果,通过与已知标准品比较或使用图像分析软件,对待测样品中的生物分子进行定性和定量分析。
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤

一、实验目的琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,学习DNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术,掌握有关的技术和识读电泳图谱的方法.二、实验原理琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。
DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。
DNA分子的迁移速度与其相对分子量成反比。
不同构型的DNA分子的迁移速度不同。
如环形DNA分子样品,其中有三种构型的分子:共价闭合环状的超螺旋分子(cccDNA)、开环分子(ocDNA)、和线形DNA分子(IDNA).这三种不同构型分子进行电泳时的迁移速度大小顺序为:cccDNA>IDNA>ocDNA核酸分子是两性解离分子,pH3。
5是碱基上的氨基解离,而三个磷酸基团中只有一个磷酸解离,所以分子带正电,在电场中向负极泳动;而pH8。
0-8。
3时,碱基几乎不解离,而磷酸基团解离,所以核酸分子带负电,在电场中向正极泳动.不同的核酸分子的电荷密度大致相同,因此对泳动速度影响不大.在中性或碱性时,单链DNA与等长的双链DNA的泳动率大致相同。
影响核酸分子泳动率的因素主要是:1、样品的物理性状即分子的大小、电荷数、颗粒形状和空间构型。
一般而言,电荷密度愈大,泳动率越大。
但是不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对泳动率的影响不明显。
对线形分子来说,分子量的常用对数与泳动率成反比,用此标准样品电泳并测定其泳动率,然后进行DNA分子长度(bp)的负对数——泳动距离作标准曲线图,可以用于测定未知分子的长度大小。
DNA分子的空间构型对泳动率的影响很大,比如质粒分子,泳动率的大小顺序为:cDNA>I DNA>ocDNA但是由于琼脂糖浓度、电场强度、离子强度和溴化乙锭等的影响,会出现相反的情况.2、支持物介质核酸电泳通常使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶两种介质,琼脂糖是一种聚合链线性分子.含有不同浓度的琼脂糖的凝胶构成的分子筛的网孔大小不同,是于分离不同浓度范围的核酸分子。
琼脂糖凝胶电泳的操作步骤

琼脂糖凝胶电泳的操作步骤琼脂糖凝胶电泳是一种常用的蛋白质和核酸分析方法。
本文将介绍琼脂糖凝胶电泳的具体操作步骤,帮助读者更好地理解和掌握这一实验技术。
材料准备1.琼脂糖凝胶:根据需要选择合适的琼脂糖凝胶,通常有0.8%、1%和1.5%等不同浓度的琼脂糖凝胶可供选择。
2.海藻酸缓冲液:配制1×TAE缓冲液,将适量的氨基乙酸和琼脂糖溶解在去离子水中,并调整pH值至7.5。
样品制备1.样品处理:将待分析的蛋白质或核酸样品按照实验要求进行处理,例如进行裂解、消化等。
2.加载缓冲液:将样品与适量的样品加载缓冲液混合均匀,通常加载缓冲液中含有甘氨酸、溴酚蓝等成分,有利于负载样品。
凝胶制备1.琼脂糖溶液的制备:将适量的琼脂糖粉末加入到海藻酸缓冲液中,用力搅拌使其充分溶解。
2.加入染色剂:在溶解的琼脂糖溶液中加入适量的染色剂,如溴酚蓝,以便观察凝胶的迁移情况和样品带。
3.准备载玻片:在凝胶电泳槽的两侧放置两块玻璃板,用胶条固定,形成一个长方形的凝胶槽。
4.倒制凝胶:将制备好的琼脂糖溶液倒入凝胶槽中,并用打孔器在凝胶上打孔,用来加载样品。
电泳过程1.样品加载:将经过处理的样品加载到凝胶孔洞中,注意不要溢出或漏掉。
2.正常电泳:将凝胶槽放入电泳槽中,使凝胶完全浸泡在TAE缓冲液中,注意缓冲液的量要覆盖凝胶槽。
3.开启电源:将凝胶槽连接到电源上,并设定合适的电流和电压,开始电泳过程。
4.电泳时间:根据实验需要设定合适的电泳时间,通常为30分钟到数小时不等。
5.关闭电源:在电泳结束后,关闭电源,取出凝胶槽。
凝胶染色和成像1.染色凝胶:将电泳结束的凝胶浸泡在适量的染色液中,常用的染色剂有共染剂、Coomassie蓝等。
2.染色时间:根据染色剂的要求和实验需要,将凝胶浸泡在染色液中一定时间,以达到理想的染色效果。
3.洗涤凝胶:将染色液倒掉,用去离子水洗涤凝胶,去除多余的染色剂。
4.成像和分析:将凝胶放入凝胶成像系统中进行成像,根据需要可进行图像分析和数据提取。
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2.0
3.0 4.0 6.0
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7、电泳缓冲液
常用的电泳缓冲液
4℃ 保存备用.
TAE和TBE电泳缓冲液比较
都是常用电泳缓冲液,二者相比:
1)TAE的缓冲容量较低,如长时间电泳会被消耗,此时凝胶的 阳极一侧将发生酸性化; 2)TBE比TAE花费稍贵,但有高得多的缓冲容量; 3)双链线状DNA片段在TAE中比在TBE中迁移快10%;
琼脂糖凝胶电泳
Agarose gel electrophoresis
• 天 然 琼 脂 ( agar ) : 又 名 琼 胶 、 菜 燕 、 冻 粉 是从石花菜及其它红藻类植物提取出来的一种线 状高聚物。 琼脂糖(agarose) 半乳糖及其衍生物构成的中性物质,不带电荷
D-半乳糖
核酸凝胶电泳是分子克隆核心技术之一,用于分离、鉴
40% (m/V)蔗糖水溶液
4℃
琼脂糖凝胶中DNA的检测
通过染色, 紫外灯下检测。
2
3
M
DNA的迁移速率决定因素
1、DNA分子的大小
双链DNA分子迁移的速率与其碱基对数的常用对 数近似成反比; 2、琼脂糖浓度
浓度越低,相同核酸分子迁移越快;
3、DNA的构象
同一分子:超螺旋环状>线状>切口环状
4、凝胶和电泳缓冲液中的溴化乙锭
溴化乙锭( EB )插入双链 DNA 造成其负电荷减少、
熔化温度/ ℃
90~95 85~90 85~95 63~65 65 40~45 70 85 75 不同厂家生 产的不同商 品其凝结温 度和熔化温 度有一定差 异
不同类型琼脂糖分离DNA片段的范围
浓度 (%) 0.3 0.5 0.8 1.0 1.2 1.5 标 准 (kb) 1~50 0.7~25 0.5~15 0.25~12 0.15~6 0.08~4 0.8~10 0.4~8 0.3~7 0.2~4 0.8~10 0.4~8 0.3~7 0.2~4 高强度(kb) 低熔点(kb) 低黏度低溶 点(kb)
琼脂糖凝胶电泳法分离DNA,主要是利用分子 筛效应,迁移速度与分子量的对数值成反比 关系。因而就可依据DNA分子的大小使其分离。 该过程可以通过把分子量标准参照物和样品 一起进行电泳而得到检测。
溴化乙锭(Ethidium Bromide, EB)为扁平状 分子,在紫外光照射下发射荧光。 EB 可与 DNA 分子形成 EB-DNA 复合物,其荧光强度与 DNA 的 含量成正比。据此可粗略估计样品DNA浓度。
100μ l的0.5mg/ml EB,并摇匀。)
⑵ 用胶带将制胶板两端封好,插入适当梳子,将溶解的 琼脂糖(约50℃)倒入,室温冷却凝固。 ⑶ 充分凝固后撕掉两端的胶布,将凝胶置入电泳槽中, 加1×TAE 电泳缓冲液至液面覆盖凝胶 1-2mm,小心垂 直向上拔出梳子。 ⑷ 用移液器吸取总DNA或质粒样品4μ l于封口膜上,再加 入 2μ l 的 6X 载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。
缺点
1. 机械强度差,易破碎,浓度不能太低。
2. 易被细菌污染,不易保存,临用前配制。 3. 琼脂糖支持层上的区带易于扩散,电泳后必须 立即固定染色。 4. 与PAGE相比,分子筛作用小,区带少。
一、实验目的 掌握琼脂糖凝胶电泳分离DNA的原理和方法
二、实验原理
琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,可以形成 具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定。 DNA分子在碱性缓冲液中带负电荷,在外加电 场作用下向正极泳动。 DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与 分子筛效应。不同DNA的分子量大小及构型不同, 电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带。
定和纯化DNA或RNA片段
琼脂糖凝胶电泳的优点
1. 因不含硫酸根和羧基,几乎消除了琼脂的电渗 2. 对蛋白质吸附极微,故无拖尾现象。
3. 凝胶结构均匀,孔径较大,可用来分离酶的复合物、
核酸、病毒 等大分子物质。 4. 透明度较好,可直接或干燥成薄膜后进行染色。 5.不吸收紫外光,可直接利用紫外光吸收法作定量测定 6. 样品易回收,常用于制备。
三、实验材料、器具及药品 质粒DNA样品。
电泳仪,电泳槽,电子天平,移液器,枪头,微波炉,紫 外透射检测仪等。
琼脂糖, 1XTBE 电泳缓冲液,溴化乙锭( EB ), 6X 载样缓 冲液 四、实验步骤 ⑴ 1g 琼脂糖加入 100ml 1×TAE 电泳缓冲液中,摇匀。 在微波炉中加热至琼脂糖完全溶解。(冷却到60℃,加入
6×凝胶载样缓冲液
类型 I 6 ×缓冲液 0.25%溴酚蓝 0.25%二甲苯氰 4℃ 贮存温度
40% (m/V)蔗糖水溶液
0.25%溴酚蓝 II 0.25%二甲苯氰 15% 聚蔗糖(Type400)水溶液 0.25%溴酚蓝 III 0.25%二甲苯氰 30%甘油水溶液 IV 4℃ 室温
0.25%溴酚蓝
4)对于高分子质量的DNA,TAE的分辨率略高于TBE,对于低分 子质量的DNA,TAE要差些。超螺旋DNA在TAE中的电泳分辨率 要好于TBE。
凝胶载样缓冲液
载样缓冲液:临上样到凝胶加样孔之前与待电泳的样 品相混合的一种缓冲液。 载样缓冲液有三个作用: 1)增加样品密度保证DNA沉入加样孔内; 2)使样品带有颜色便于简化上样过程; 3)其中的染料在电场中以可以预测的泳动速率向阳 极迁移。
⑸ 打开电源开关,调节电压至 3-5V/cm ,可见到溴酚蓝 条带由负极向正极移动,电泳约30min-60min。
⑹ 将凝胶放入 EB 染液中染色 5-10min, 用清水稍微 漂洗。
⑺ 将染色后的凝胶置于紫外透射检测仪上,盖上 防护观察罩,打开紫外灯,可见到发出荧光的 DNA条带。
1
刚性和长度增加。 5、所用的电压 低电压时DNA片段迁移率与所用的电压成正比。 6、琼脂糖种类
常见的有两种:标准琼脂糖和低熔点琼脂糖;
不同类型琼脂糖的性质
琼脂糖类型
标准琼脂糖 高强度琼脂糖 修饰的低熔点/ 凝 点琼脂糖 超低熔点 低黏性低熔点琼脂 糖
凝结温度/℃
35~38 40~42 34~43 25~35 35 8~15 25~30 38 30