基因工程常见问题梳理
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基因工程常见问题梳理
基因工程常见问题梳理
1、什么是星星活性,产生的原因及解决方案?
星星活性是指在极端非标准条件下,限制性内切酶能切割与识别序列相似的序列,而造成误切的现象。
产生的原因:
1) 甘油浓度过高,大于5%;
2) 酶过量,>100U/ul;
3) Mg2+被其他的二价金属离子取代;
4) pH过高,>8.0;
5) 添加了有机溶剂DMSO、乙醇等;
6) 离子强度低,<25mmol/l。
2、限制性内切酶的发现、分类和各类的特点:
限制性内切酶的发现是20世纪60年代,噬菌体侵染大肠杆菌之后,DNA在感染宿主中会被降解,从而提出了限制酶切和限制酶的概念。1970年,H.Smith偶然发现了HindIII,揭开了限制酶的面纱。
主要分为三类:
I类、III类:限制作用需要ATP
II类:最常使用的一类限制酶,识别序列主要有4-6个核苷酸,回文结构,与甲基化的反应分开,限制作用不需要ATP。
3、不同条件的两种限制性内切酶,双酶切时应该采取什么措施?
1) 同步双酶切:配置同时适合这两种限制酶的最佳缓冲体系,同时加入两种酶;
2) 分步酶切:分开加酶时遵循先低盐后高盐原则,而且可以在加入第二种酶的时
候使第一种酶失活,避免产生星星活性。
3) 使用配有特殊缓冲液的酶进行酶切:在大多数情况下采用标准缓冲液的酶也能
在这些特殊缓冲液中进行酶切,这保证了对缓冲液有特殊要求的酶也能良好工
作。由于内切酶在非最佳缓冲液中进行酶切时,反应速度会减慢,因此需要增
加酶量,延长反应时间。
4、差异杂交的基本原理和思路
差异杂交要拥有两种不同的细胞群体:在一个细胞群体中的目的基因正常表达,在另一个细胞群体中的目的基因不表达。在这种情况下便可制备两种不同的mRNA提取物。其一是含有目的基因的mRNA的总mRNA,另外一种是不含有目的基因mRNA的总mRNA。因此,可以通过这两种mRNA的cDNA拷贝为探针,对由表达目的基因的细胞总mRNA 构建的克隆库进行筛选。
思路:
将来自一种细胞的mRNA反转录形成cDNA的第一链,用这种细胞的cDNA与另一种细胞过量表达的mRNA进行杂交。如果在第一种细胞中是特异表达的mRNA,则会产生特
异的cDNA链,不会与第二种细胞的mRNA杂交。通过羟基磷灰石柱层析,洗脱未形成杂交体的cDNA,它代表第一种细胞中特异表达的基因。以该链为探针,第一种细胞的cDNA文库的重复拷贝杂交,跟探针能够杂交克隆的是在组织细胞中特异表达的mRNA。再对这样的克隆进行测序比较,鉴定,就分离得到这种组织特异表达的基因,所有包含重组体的菌落,阳性反应在X射线上呈现黑色的点。比较这两种底片对照原平板。便可以挑选所有含有
目的基因的菌落,供进一步研究使用。