常见细菌系统鉴定手册(完整版)
光合细菌分类、鉴定及保存
红螺菌目（Rhodospirillales） 该目有2科7属。 红螺菌科（Rhodospirillaceae）6个属 醋酸杆菌科（Acetobacteraceae）1个属 红细菌目（Rhodobacterales） 有1科4属 红细菌科， （ Rhodobacteraceae） 根瘤菌目（Rhizobiales） 有3科7属 慢生根瘤菌科（Bradyrhizobiaceae）2个属 生丝微菌科（Hyphomicrobiaceae）3个属 红游动菌科（Rhodobiaceae）2个属
红螺菌目
红螺菌科 外硫红螺菌科 绿硫菌科 绿色丝状细菌
《伯杰氏系统细菌学手册》
近年的分子系统学研究表明， 近年的分子系统学研究表明，紫色非硫细菌的系统发育 是多起源的，分散在变形菌门α和 两个纲的多个科中 两个纲的多个科中， 是多起源的，分散在变形菌门 和β两个纲的多个科中， 与非光合细菌的系统发育混杂在一起。现在认为， 与非光合细菌的系统发育混杂在一起。现在认为，光 合器官的性质对种的鉴定还是重要的， 合器官的性质对种的鉴定还是重要的，但对较高分类 阶元，如科、目等则没有太大意义。 阶元，如科、目等则没有太大意义。 《伯杰氏系统细菌学手册》 《Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology》 1989年，第1版 2001年，第1版 以后的国际分类学权威书籍中，光合细菌的分类采用了 完全不同的分类系统。
醋酸杆菌科（Acetobacteraceae）只有红球形菌属（Rhodopila） 1个属。
• （2）
红细菌目（Rhodobacterales） 有1科 （红细菌科，Rhodobacteraceae）4属： 红细菌 属 (Rhodobacter) 、 红 海 菌 属 （Rhodothalassium）、小红卵菌属(Rhodovulum) 和最近才发现的Rhodobaca。
1-常见细菌分类
• Main genus :主要的种
- Escherichia coli大肠埃希菌 属, Klebsiella克雷伯菌属, Proteus变形杆菌属, Providencia普罗威登斯菌属 - Citrobacter枸橼酸杆菌属 , Enterobacter肠杆菌属, Serratia沙雷菌属 - Salmonella沙门菌属, Shigella志贺氏菌属, Yersinia耶尔森氏菌属
链球菌分类重要特征
细菌名 杆菌肽 CAMP 称 敏感 七一苷 胆汁七 6.5% 一苷 NACL _ _ _ _ + _ + _ _
A
B D
S
S+R
_
+ _
肠球菌 R
_
+
+
+
革兰阳性杆菌
棒状杆菌属
李斯特菌属 红斑丹毒丝菌
革兰阳性杆菌重要特征
细菌名称 棒状杆菌 属 菌体排列 字母排列 明显 窄-溶血圈 — 李斯特菌 属 不明显 + 红斑丹毒 丝菌 长丝 —
细菌命名
采用林奈双命名法. 一个细菌的名称有两部分组成,属名和种 名. 细菌名称常采用细菌的显著特征或发现 的地点或发现者的名字. 名称采用拉丁文或拉丁化的其他文字. 如:大肠杆菌完整的名称是: Escherichia coli: 先属名后种名 大肠埃希菌: 先种名后属名
细菌鉴定的方法
- Pseudomonas aeruginosa铜绿假单胞菌 - Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter : Ox -嗜麦芽窄食单胞菌 - Aeromonas气单胞菌属, Chryseobacterium单胞菌属, Pasteurella巴斯德氏菌 - Vibrio cholerae霍乱弧菌
伯杰氏系统细菌学手册
★生态特性
包括在自然界的分布情况，与其他生物有否寄生或共生关系, 宿主 种类及与宿主关系, 有性生殖情况, 生活史等。
★生活史
★血清学反应
常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种、亚种或 菌株。 ★对噬菌体敏感性
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3、微生物的快速鉴定和自动化分析 技术
微量多项试验鉴定系统（简易诊检技术，数码分类鉴定 法）：
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• 三域学说: 细菌域、古生菌域、真核生物域。 主要特点比较见表10-3。
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第三节 各大类微生物的分类系统纲要
1 Bergey氏原核生物分类系统纲要 《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)
针对微生物的生理生化特征，配制各种培养基、反应 底物、试剂等，分别微量(约0.1ml)加入各个分隔室 中(或用小圆纸片吸收)，冷冻干燥脱水或不干燥脱水， 各分隔室在同一塑料条或板上构成检测卡。试验时 加入待检测的某一种菌液，培养2-48小时，观察鉴 定卡上各项反应，按判定表判定试验结果，用此结 果编码，查检索表(根据数码分类鉴定的原理编制成)， 得到鉴定结果，或将编码输入计算机，用根据数码 分类鉴定原理编制的软件鉴定，打印出结果。
• 什么是微生物分类学 (microbialtaxonomy):
按照微生物的亲缘关系将 其安排成条理清楚的各种 分类单元和分类群的科学
微生物分类的目的
把各种微生物按照它 们的亲缘关系分群归 类，排成系统，以便 于人们对微生物进行 鉴定和交流
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生物界的分类 地球上的物种估计大约有150万，其中微生物 超过10万种，而且其数目还在不断增加。
(完整word版)细菌的生理生化鉴定方法
方法2.3。
5 细菌的生理生化鉴定１、形态学观察采用插片法、埋片法, 对该拮抗细菌的菌落形态特征作镜检观察。
用革兰氏染色进行油镜观察。
① 革兰氏染色溶液和试剂：革兰氏染液，草酸铵结晶紫染液，卢戈式碘液，95％乙醇，番红复染液等.试验步骤：（1) 涂片：取活跃生长期菌种按常规方法涂片（不易过厚）、干燥和固定。
(2) 初染：滴加草酸铵结晶紫染液覆盖涂菌部位1～２min，用水冲洗至流出水无色。
（3）媒染：先用卢戈氏碘液冲去残留水迹，再用碘液覆盖１min，倾去碘液，水洗至流出水无色。
(4）脱色：在上述涂片上流加95％乙醇溶液（一般20~30s）,当脱色至流出液无色时立即用水洗去乙醇。
（5）复染：将玻片上残留水用吸水纸吸去，用番红复染液染色2min,水洗,用吸水纸吸去残水晾干。
(6）镜检：用油镜观察。
②芽孢染色（1）制片:按常规方法涂片、干燥及固定。
（2）加热染色：向载玻片滴加数滴5％孔雀绿水溶液覆盖涂菌部位，用夹子夹住载玻片在微火上加热至染液冒蒸汽并维持５min,加热时应注意补充染液，切勿让涂片干涸.脱色：待玻片冷却后，用缓流自来水冲洗至流出水无色.(3）复染：用0.5％番红水溶液复染2min。
(4) 水洗:用缓流自来水冲洗至无色。
(5) 镜检：晾干载玻片后油镜镜检。
③鞭毛染色(硝酸银染色法）(1) 载玻片准备:将载玻片置于含洗衣粉或洗涤剂的水中煮沸 20min，然后用清水充分洗净,再置于 95%乙醇中浸泡，使用时取出在火焰上烧去乙醇及可能残留的油迹。
(2) 菌液制备：用接种环挑取菌落边缘菌体，悬浮于1～2mL无菌水中制成菌悬液，不能剧烈震荡。
（3) 制片:取一滴菌悬液滴到载玻片一侧，倾斜玻片,使菌悬液流向另一边,用吸水纸吸取多余的菌悬液,自然干燥。
（4）染色：滴加硝酸银染色A液覆盖3～5min，用蒸馏水充分洗去A液，再滴加B液染色约1 min，期间可用微火加热，当涂面出现明显褐色时，立即用蒸馏水冲洗。
放线菌伯杰氏系统细菌学手册
（二）种的概念
● 种：微生物的基本分类单位，具有许多共同特征的菌株的 集合。
●学名与俗名
三、亚种以下的几个分类名词
● 亚种：在种内有一个稳定特征不同于模式种的菌株，
为最低等级的分类单元。
● 型：非分类单位，种内特征小差异的菌株。 ● 菌株：同种的不同个体。
第二节 微生物在生物界的地位 五界系统：
● 三域学说（Woese等）
第三节 各大类微生物的分类系统纲要
一、Bergey氏原核生物分类系统纲要 《Bergey’s Manual of Systematic Bacterialogy》1,2版
--- 将矩阵图转换成树状谱
结果分析：
1.S （相似值）≥85% 2.S （相似值）≥65% 3.S （相似值）≤65%
（同种） （同属） （亲缘关系较远）
API数值鉴定系统 BBL鉴定系统 Biolog鉴定系统
程序： 1、获取辅助特征 2、培养菌悬液加入生化反应板培养自动扫描
自动鉴定打印结果
细菌自动鉴定程序
二、现代分类鉴定方法
细 菌 化 石
（一）微生物遗传型的鉴定
（1）DNA碱基比例的测定 （G+C）mol%： 解链温度法（Tm值） (G+C)mol%值只能做否定判断； （G+C）mol%值差别>5，属不同的种； 差别>10，属不同的属。
（2） 核酸分子杂交法
DNA-DNA杂交（固相杂交法）
细菌的分类及鉴定
【细菌坚定依据/噬菌体分型鉴定】
❖噬菌体是细菌的病毒，特定的噬菌体能侵 染特定的细菌 ❖能用噬菌体鉴定细菌有:沙门菌属，霍乱弧 菌，鼠疫杆菌等。
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【细菌的鉴定依据/蛋白质的氨基酸顺序】
➢蛋白质是核酸基因的产物， ➢氨基酸顺序直接反映mRNA顺序， ➢通过细菌蛋白质氨基酸顺序测定，比较 不同细菌系统发育关系， ➢序列相似性越高，亲缘关系愈近。
界(Kingdom) 门(Phylum或Division) 纲(C1ass) 目(Order) 科(Family) 属（genus） 种(Species)
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❖在主要分类单位之间加入次要分类单位
如:亚门(Subdivision) 亚纲(Subclass) 亚属(Subbgenus) 亚种(Subspecies) 变种(Varieta)
➢Staphylococcus sp. 表示葡萄球菌 ➢Arthrobacter spp. 表示节细菌
➢Sp：单数，spp：复数，是Species的缩写。
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细菌的分类技术
能被观察的一 些表型特征
人为分类法
细菌在进化 中的关系
自然分类法
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细菌的分类原则 （1）命名的要点：目的在于名称的稳定性，防止和杜绝 使用容易引起错误或混乱的名称，防止创造无用的名称。 （2）具有一定的界限、位置和等级的每个目或等级较低 的分类单元只能有一个唯一正确的名称。 （3）一个分类单元的名称在没有充分理由时不应更改， 除非由于进一步的分类学研究或与《国际细菌命名法规》 的规则相矛盾。 （4）细菌命名法除藻类和真菌外与植物命名法无关，除 原生动物外与动物命名法无关。 （5）全部分类单元的科学名称是拉丁文或拉丁化的词， 而不管其词源如何。这些名称通常取自拉丁文或希腊文。 给分类单元一个名称的主要目的是提供一个表示它的手段 ，而不是指明该分类单元的性状或历史。
菌种鉴定方法及手段真菌细菌检测
菌种鉴定方法及手段真菌细菌检测菌种鉴定是指通过特定的方法和手段，对样品中存在的真菌和细菌进行鉴定和分类的过程。
下面将介绍几种常见的菌种鉴定方法及手段。
1.形态学鉴定：形态学鉴定是根据菌落形态、菌丝形态和孢子形态等特征来鉴定菌种的一种方法。
常见的形态学鉴定方法包括裸眼观察、显微镜观察、染色观察等。
裸眼观察主要通过观察菌落的颜色、形状、质地等特征，结合菌丝形态进行初步判断。
显微镜观察可以观察到菌丝的形态、孢子的形状、颜色等细节特征，通过比对菌种鉴定手册等资料进行鉴定。
2.生理代谢鉴定：生理代谢鉴定是通过菌株在不同培养基上的生理代谢特点来鉴定菌种的方法。
常见的生理代谢鉴定方法包括生理生化鉴定、生长温度范围鉴定、碳源利用鉴定、氮源利用鉴定等。
通过测定菌株在不同培养基上的生长速率、产酶能力、酸碱度变化、利用不同碳源和氮源等特征，判断菌株所属的种属。
3.分子生物学鉴定：分子生物学鉴定是通过检测菌株的DNA序列来鉴定菌种的一种方法。
常见的分子生物学鉴定方法包括PCR技术、基因测序、DNA指纹图谱鉴定等。
通过提取菌株的DNA，选择合适的引物进行PCR扩增，再通过基因测序获得菌株的DNA序列，通过比对菌株的DNA序列与数据库中已知的菌种进行比对，确定菌株所属的种属。
4.免疫学鉴定：免疫学鉴定是通过检测菌株与特定抗原的反应关系来鉴定菌种的方法。
常见的免疫鉴定方法包括酶联免疫吸附试验(ELISA)、免疫印迹等。
通过与特定抗原结合，通过特异性抗体的反应来进行菌种的鉴定。
5.生化鉴定：生化鉴定是通过检测菌株的生化活性来鉴定菌种的方法。
常见的生化鉴定方法包括生化试剂盒、色谱分析、质谱分析等。
通过检测菌株在不同生化试剂上的产物或反应物的变化，进行菌种的鉴定。
综上所述，菌种鉴定方法及手段包括形态学鉴定、生理代谢鉴定、分子生物学鉴定、免疫学鉴定和生化鉴定等多种方法和手段。
不同的鉴定方法可以互相补充，提高鉴定的准确性和可靠性。
伯杰史微生物鉴定手册
伯杰史微生物鉴定手册
《伯杰史微生物鉴定手册》是由美国微生物学会织的一个委员会主编，世界有关专家共同编写的一本手册。
它主要讲述了细菌鉴定方面的内容，是细菌分类学的重要参考书籍。
随着时间的推移，手册的内容不断更新和扩充，第9版更名为《伯杰氏系统细菌学手册》，并分为4卷，以反映新的科学进展和更方便使用者的阅读。
在细菌分类学方面，手册强调了应用核酸研究的重要性，特别是在各级分类单位中全面应用核酸研究，以在表型特征的基础上，以DNA资料给予决定性的判断。
如需获取更多关于伯杰微生物鉴定手册的信息，建议前往各大电子书平台进行查阅。
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常见细菌系统鉴定手册（完整版）
引言
细菌是一类微生物，其广泛存在于自然界中的各种环境中，包括土壤、水体、空气和生物体内等。
它们的存在对于生态系统的平衡和人类的健康具有重要影响。
准确鉴定细菌的种类和特性对于科学研究、临床诊断和环境保护具有重要意义。
本文档为常见细菌系统鉴定手册，旨在帮助用户了解并进行常见细菌的鉴定工作。
目录
1.细菌的形态特征
2.细菌的生理特性
3.细菌的遗传特性
4.常见细菌的鉴定方法
–接种和培养方法
–生物化学试验
–分子生物学方法
–其他鉴定方法
5.常见细菌的鉴定实例
6.细菌鉴定的注意事项
7.总结
细菌的形态特征
在鉴定细菌时，首先需要观察和描述细菌的形态特征。
细菌的形态特征包括形状、大小、颜色、表面特征等。
常见的细菌形状有球菌、杆菌、弧菌、螺旋菌等。
细菌的大小通常以直径或长度来描述，颜色可以是透明、白色、黄色、红色等。
表面特征是指细菌菌落的形状、质地和触感等。
细菌的生理特性
细菌的生理特性是指其在生长和代谢方面的特点。
需要关注的生理特性有气体需求、温度和pH值的适宜范围、营养要求等。
例如，一些细菌需要氧气进行呼吸，被称为好氧菌；一些细菌则无需氧气，甚至不能在氧气存在下生长，被称为厌氧菌。
细菌的遗传特性
细菌的遗传特性对鉴定和分类细菌起着重要作用。
细菌的遗传物质主要是DNA，其通过突变和基因重组等方式进行遗传。
常见的细菌分类方法包括16S rRNA基因序列比对、DNA 指纹图谱分析等。
常见细菌的鉴定方法
接种和培养方法
接种和培养是最常用的细菌鉴定方法之一。
主要步骤包括样品的采集、接种培养基、温度和时间的控制等。
常用的培养基有肉汤、琼脂和MacConkey琼脂等。
接种后，细菌会在培养基上生长形成菌落，通过观察菌落形态和特性可以初步判断细菌的类型。
生物化学试验
生物化学试验是通过检测细菌在特定条件下的代谢产物来鉴定细菌。
常见的生物化学试验包括氧化-发酵试验、酸碱反应试验和酶活性检测等。
通过观察试验结果，可以确定细菌的代谢方式和特性。
分子生物学方法
分子生物学方法利用细菌的遗传特性进行鉴定。
常用的方
法包括PCR、序列比对和基因测序等。
通过检测特定基因的
存在和序列相似性，可以确定细菌的种属和进化关系。
其他鉴定方法
除了上述方法外，还有一些其他鉴定方法可供选择。
例如，质谱法可以通过检测细菌的代谢产物和生物分子进行鉴定；电镜可以观察细菌的形态和结构等。
常见细菌的鉴定实例
下面以常见的大肠杆菌为例来介绍细菌的鉴定过程。
1.形态特征：大肠杆菌为杆状细菌，长度约为2-3微
米，直径约为0.5微米。
2.生理特性：大肠杆菌需要氧气进行呼吸，可以在温
度37°C下生长，pH值在6-8之间生长最适宜。
3.生化试验：大肠杆菌发酵葡萄糖产生酸和气泡，具
有β半乳糖分解酶活性。
4.分子生物学特性：大肠杆菌16S rRNA基因序列与
已知大肠杆菌序列高度一致。
通过以上鉴定结果，可以确定该菌株为大肠杆菌。
细菌鉴定的注意事项
在进行细菌鉴定时需要注意以下几点：
1.样品采集：样品采集应注意无污染，避免其他细菌
的干扰。
2.实验操作：实验过程中应严格遵守操作规范，避免
交叉污染。
3.分析结果：鉴定结果应结合临床表现和其他实验数
据进行综合分析，以减少误判。
总结
细菌鉴定是一项复杂而重要的工作，对于科学研究和临床
诊断具有重要意义。
本文档介绍了常见细菌的形态特征、生理特性和遗传特性，并详细说明了常见的细菌鉴定方法和注意事项。
通过正确地应用这些鉴定方法，可以准确高效地鉴定细菌，为相关领域的研究和实践提供有力支持。
注：本文档仅为参考，具体细菌鉴定操作请根据实际需求和专业知识进行。