GET磁共振操作指南Functool
一、Functool 简介
Functool 是 AW工作站及 Console操作台上的一个选配软件包。它用于对符合条件的数据组图像加以分析后处理。
符合条件的数据组指：数据组中每个层面含有多幅图像，这些多幅的图像或是含有时间变化，或是B值的变化，或是含有频率的变化。
含有时间变化的图像有：Dynamic contrast，Perfusion，fMRI（BOLD）。
含有B值变化的图像: Diffusion。
含有频率变化的图像：MRS (acquired with the Probe/SI)。
所有图像要求是同样的扫描层面、同样的扫描中心、同样的扫描像素。最多可载入1024幅图像。
分析处理的结果以曲线图或参数伪彩图来表示，这些结果可供保存照像或彩色打印。
注：在启动Functool之前，结束其他所有的应用软件（如Main Viewer, 3D Analysis, IVI, Reformat, etc）。
二、Functool 界面介绍：
一、载入图像并启动Functool：
1，在Browser中选择符合条件的图像，点击。显示如
下界面：
弥散图像的后处理按键2，左侧界面属于功能版面，各个按键的注释及功能见下图
灌注及动态扫描的后处理
灌注及动态扫描的后处理
功能版面按键注释 选择新的处理科研软件
对所选处理方式的功能设定
图像的保存与照相 界面设定 切换至图Functool 关闭
Functool 图像显示 剪切、复制、用曲线的形式表示
不同时相
用柱状图的形式表示在某一以列表的形式表示
不同相位
3，Functool 工具栏各项按键说明
4，当选择某一个重建功能后即进入到图像显示窗口。在显示的图像上，凡是红色注释的地方都可直接进行改动：点击左键；用鼠标/
键盘的左键/右键改动数字或字母；或用中键直接向两边拖拉。
调节窗宽窗位 图像滚动 显示/隐藏网格 显示/隐藏注释 添加注释
自由划感兴趣区
融合/分裂 选择 旋转/翻移动/恢复正常
放大/缩小
平滑/非平滑 对称
方形/圆形组合/分
方形/多角形序列窗 图表窗
左上角的序列窗：
1．点击该处可隐去或显示被检查者的姓名。
2．点击该处选择不同的层面：
3．点击DFOV旁的数字可对图像进行放大，或将已放大的图像缩小(不能缩小原始图像)。
4．点击rank 旁的红色数字，对同一层面不同时相或不同B 值的
图像加以选择。
5．点击红色数字手动调节窗宽窗位。
6．点击四周显示方位的字母，可在显示平面内的移动图像。
６ １ ２
３
6 6 6
在序列窗内，点击鼠标右键，弹出功能菜单。
右上角的图表区：
可以曲线图、柱状图或表格三种不同形式表示ROI 内的信号强度随时间（B 值或频率）变化情况（见第四页）。MR 中以曲线图最为常用 。
设置背景图
恢复正
重新设置ROI 形态 保存功能窗全部显示 创建注释
隐藏波谱扫描的显示序列数据
1．调节纵轴上下两端的数字，可改变纵轴标尺的范围：可分别以绝对值、相对值或百分比代表信号强度变化。
2．调节横轴左右两端的数字，可改变横轴标尺的范围：可分别代表图像的序号、时间、B值或频率ppm。
3．调节光标的大小，有平滑后处理的功能图像作用。
4．点击该处，可改变显示信号强度的方式（平均值AVG、最大值MAX、最小值MIN、标准偏差DEV）。
5．如果有多个ROI被定义，点击该处可选择多条曲线的显示方式。这些曲线可重叠在一起，也可分为多个单独的小图表。6．如果有ROI被定义，在图表区随着鼠标会出现一十字形可移动的标尺。
在图表区，点击鼠标右键，弹出功能菜单。
下方的功能图：通过调节不同的功能计算，可得到伪彩函数图。
两个功能窗可以显示不同的伪彩函数图 １
２
３ ４ ５ ６ 显示或隐去偏
用于定义横轴标尺的意义，rank 代表图像号；time 代表
用于定义纵轴标尺的意义，absolute 绝对值；relative 相以表格形式显示图像MR 单位
以直方图的形势表示在某一个横坐标单位上，MR 单位
以屏幕保存的形式保存图像
显示单一表
创建注释或隐去
1．计算函数，点击它可以切换到不同的计算函
数，利用像素的信号强
度大小计算出不同的函
数值。
2．色标范围，用于规定伪彩显示范围。功能图是
以不同的色彩代表函数
的大小。调节色标范围
决定显示信号强度的范
围。与窗宽窗位的意义
相同。１２
3．选中的ROI的相应的后处理参
数的结果。
在图表窗内，点击鼠标右键，弹出功能菜单。
在功能窗的左下角为参数图选择不同的设置背景图
恢复正
重新设置ROI形态保存功能窗全部显示创建注释
隐藏波谱ROI
多个显
三、利用Functool进行图像后处理的主要步骤：
从Browser中选择欲处理的图像，点击Functool启动该软件。
选择适当的后处理图标１
0%Transpara ent
表示背景图表示78%的透明度，可同
点击左上角图像的rank值，查看患者在采集过程中是否有移动，以避免产生错误的分析结果。
定义ROI，查看时间信号强度曲线。
点击工具栏上方的功能键，进行必要的参数调节。然后点击Compute。
保存所得图像，退出Functool界面。
下面将对下列分析方法举例说明
1，弥散成像扫描及后处理（Diffusion Weight Imaging）2，动态增强扫描及后处理(Dynamic Contrast Imaging)
3，脑功能成像及后处理（Functional MRI---BOLD）
4，灌注成像及后处理(Perfusion Dynamic Susceptibility Imaging) 5，波谱成像后处理（Magnetic Resonance Spectroscopy）
弥散成像扫描及后处理（Diffusion Weight Imaging）
一、扫描方法：
1．脉冲序列：single shot SE DWI EPI
2．主要参数：B值＝ 1000，三个弥散方向，SPF减少周围神经刺激症（PNS）。
3．图像特点：含两组图像，B值为零T2加权图及B值为1000弥散加权图。二、利用Functool进行图像后处理： GE公司提供的用于分析弥散加权图像DWI的数学模式有两种，ADC（表观弥散系数）及
静息态功能磁共振数据分析工具包使用手册
静息态功能磁共振数据分析工具包 使用手册 宋晓伟（Dawnwei.song@https://www.360docs.net/doc/b53109622.html,） 文档版本: 1.3 文档修订日期: 2008-2-25 北京师范大学 认知神经科学与学习国家重点实验室
目录 一、开发背景介绍 (1) 二、软件用途和技术特点 (4) 三、设计与实现 (4) 四、测试 (5) 五、使用要求 (5) 六、使用方法演示 (6) (一)计算功能连接 (7) (二)计算局部一致性 (9) (三)计算低频振幅 (11) 七、详细使用说明 (13) (一)安装REST (13) (二)卸载REST (13) (三)启动REST (13) (四)在REST中设置待处理的数据目录 (16) (五)Mask 的设定 (16) (六)在REST中设定输出参数 (17) (七)可选项：去线性漂移 (18)
(八)可选项：滤波 (19) (九)局部一致性计算参数的设定 (20) (十)低频振幅计算参数的设定 (21) (十一)功能连接参数的设定 (21) (十二)点击“Do all”开始计算 (23) (十三)耗时估计 (24) (十四)其它工具 (24) 八、附注说明 (26) 九、参考文献 (28)
一、开发背景介绍 大脑是人体中最迷人也是人们了解最少的部分，科学家哲学家们一直在寻找大脑与行为、情感、记忆、思想、意识等的关系，却缺少一个非侵入性的高分辨率的技术方法来直接观察并确立这种联系，直到上世纪末功能磁共振成像（functional magnetic resonance imaging, fMRI）的出现（Ogawa et al., 1990），既能让人们观察到大脑结构又能让人们观察大脑结构的某一部分所具有的特定功能（Clare, 1997）。fMRI机制是血氧水平依赖性（Blood oxygen level dependent, BOLD）信号的变化。 目前认识到的大多数的脑功能都是通过对任务或刺激的控制，并同时记录与任务或刺激相应的行为学上的变化和神经活动的变化来得到的。从Hubel和Wiesel电生理学上的实验，到现在神经影像学上的认知激活实验范式，都说明这种方法是很成功的。如图1被试睁眼或闭眼交替进行，这种简单的任务刺激范式所带来的BOLD信号的变化可以清楚地在大脑的特定区域看到（图1是在视觉区），从而把大脑的功能和解剖结构联系了起来（Fox et al., 2007）。这种基于任务刺激的实验范式一般都使用广义线性模型（General linear model, GLM）计算刺激或控制变量的效应，检测相应于刺激的大脑激活区，从而认识大脑的功能。 图1、传统fMRI任务激活范式的分析：睁眼闭眼任务范式和初级视觉皮层的某个体素的BOLD信号。 （引自Fox et al., 2007） 对任务状态fMRI数据的分析和处理，研究者现在一般都使用软件SPM（Friston, 1995）或AFNI（Cox, 1996），这两个软件都可以使研究者很方便地基于GLM模型来分析和处理任务状态的fMRI数据。如图2是包括2个控制变量的GLM模型，研究者需要提供给软件的是设计矩阵，即研究者的控制变量，然后使用软件SPM（Friston, 1995）或AFNI（Cox, 1996）就可以很方便地估计出控制变量的效应大小，进而找到受控制变量影响的脑区，即和任务刺激相对应而激活的脑区。
静息态功能核磁共振发展及其应用
静息态功能核磁共振技术发展及其应用 一、什么是静息态功能核磁共振技术 （一）、功能磁共振技术及其原理 人脑是自然界进化最为复杂的产物，揭示脑的奥秘是当代自然科学面临的最重大的挑战之一。近年来随着脑成像技术及神经科学的发展，人们对脑的研究已不仅局限于解剖定位，更多的是对脑功能活动基本过程的深入研究。功能磁共振成像是90年代以后发展起来的一项新技术，它结合了功能、影像和解剖三方面的因素，是一种在活体人脑中定位各功能区的有效方法，它具有诸多优势，如无创伤性、无放射性、具有较高的时间和空间分辨率、可多次重复操作等，因此，功能磁共振成像(functional magnetic resonance imaging，fMRI )作为脑功能成像的首选方法已被较广泛应用。功能磁共振成像主要是基于血流的敏感性和血氧水平依赖性(blood oxygenation level dependent，BOLD )对比度增强原理进行成像。所谓血氧水平依赖性是指大脑皮层的微血管中的血氧浓度发生变化时，会引起局部磁场发生变化，从而引起核磁共振信号强度的变化。采用基于 BOLD的功能磁共振成像技术进行脑活动研究在近十年中得到了迅速的发展，BOLD f MRI以空间和时间分辨率均较高的优势,逐渐成为对活体脑功能生理、病理活动研究的重要手段之一。其无创性和可重复性使之在临床得以迅速而广泛的应用和认同功能磁共振检查方法对人体无福射损伤，并且其时间及空间分辨率较高，一次成像可同时获得解剖影像及功能影像。功能磁共振成像原理是通过磁共振信号检测顿脑内血氧饱和度及血流量，从而间接反映神经元的活动情况，达到功能成像的目的。BOLD 技术是功能磁共振成像的基础；神经元活动增强时，脑功能区皮层的血流量和氧交换増加，但与代谢耗氧量增加不成比例，超过细胞代谢所需的氧供应量，其结果可导致功能活动区血管活动氧合血红蛋白増高，脱氧血红蛋白相对减少。脱氧血红蛋白是顺磁性物质，其铁离子有４个不成对电子，磁矩较大，有明显的Ｔ２缩短效应。因此，脱氧血红蛋白减少，导致Ｔ２＊和Ｔ２弛豫时间延长，信号増高，使脑功能成像时功能活动去抑制的皮层表现为高信号。功能磁共振成像应用于人脑功能的研究，最常用的方法是利用各种刺激诱导局部脑组织血氧水平依赖信号发生变化，间接反映神经元的活动,这种方法被称为“事件相关功能性磁共振( event-related f MRI)”。
最全神经系统解剖图
最全神经系统解剖图！ 令狐采学 导读： 神经系统是人体内起主导作用的功能调节系统。人体的结构与功能均极为复杂，体内各器官、系统的功能和各种生理过程都不是各自孤立地进行，而是在神经系统的直接或间接调节控制下，互相联系、相互影响、密切配合，使人体成为一个完整统一的有机体，实现和维持正常的生命活动。 同时，人体又是生活在经常变化的环境中，神经系统能感受到外部环境的变化对体内各种功能不断进行迅速而完善的调整，使人体适应体内外环境的变化。可见，神经系统在人体生命活动中起着主导的调节作用，人类的神经系统高度发展，特别是大脑皮层不仅进化成为调节控制人体活动的最高中枢，而且进化成为能进行思维活动的器官。 因此，人类不但能适应环境，还能认识和改造世界。 神经系统由中枢部分及其外周部分所组成。 中枢部分包括脑和脊髓，分别位于颅腔和椎管内，两者在结构和功能上紧密联系，组成中枢神经系统。 神经系统是由脑、脊髓、脑神经、脊神经、和植物性神经，以及各种神经节组成。能协调体内各器官、各系统的活动，使之成为完整的一体，并与外界环境发生相互作用。
脑部 脑干脑室系统 大脑供血动脉3D扫描CT成像磁共振成像&人脑模型对比人脑区域图 神经分布图 小脑皮质结构 小脑 脑岛 基底核 海马和穹窿 各种剖面图 12对颅神经各自对应的脑区 形象记忆交感神经与副交感神经系统 几种常见致死性脑病的CT表现 脑损伤 不同部位脑病的瞳孔变化 常见的作用于中枢神经系统的药品 各种颅内出血 几种类型脑出血的CT表现 急性颅内高压所致脑疝的分型
颅顶层次面神经——一巴掌就能记住 神经病变时瞳孔对光的反射 脑脊液循环 动眼神经、滑车神经和外展神经损伤的鉴别 头痛困扰，你属于哪一种 脊柱 外周部分包括12对脑神经和31对脊神经，它们组成外周神经系统。外周神经分布于全身，把脑和脊髓与全身其他器官联系起来，使中枢神经系统既能感受内外环境的变化（通过传入神经传输感觉信息），又能调节体内各种功能（通过传出神经传达调节指令），以保证人体的完整统一及其对环境的适应。神经系统的基本结构和功能单位是神经元（神经细胞），而神经元的活动和信息在神经系统中的传输则表现为一定的生物电变化及其传播。