动物遗传育种中的计算方法
家禽育种原理和方法
家禽育种原理和方法一、育种原理(一)确定合理的育种目标育种目标：就是要求在育种中改进那些性状，这些性状各向什么方向发展，改进量是多少。
在家禽育种计划中，最重要的决策是确定合理的育种目标。
如果育种目标确定不当，遗传进展将向低效甚至错误的方向发展，从而导致育种公司在经济收益上的损失和市场竞争中的失利。
因此，确定合理的育种目标将为整个育种工作起到导航的作用。
确定育种目标是一项综合性的工作市场需求：衡量育种工作成效的标准，不但要看每年遗传进展的大小，而且要看这种遗传进展满足市场需求的程度。
现有育种群的状况。
竞争对手的产品性能。
(二)充分利用加性和非加性遗传效应1.加性遗传效应的利用——选择通过选择获得遗传进展有三个基本条件：性状有变异变异是可以遗传的变异是可以度量的2.利用非加性遗传方差——杂交(三)高强度选择只有高强度的选择才能获得较大遗传进展，高强度选择可在一定程度上弥补选择准确性的不足。
家禽(尤其是鸡和鸭)本身的两个特点为高强度选择提供了条件。
第一个特点是高繁殖力；第二个特点是饲养成本相对较低，所以可以保持很大的观察群，作为选择的基础。
(四)保持性状间的综合平衡家禽的性状众多，但本身是一个整体，在育种中必须考虑到生物体的这种关联性，保持性状间的合理平衡，即所谓平衡育种。
保持性状间的平衡，一方面是针对选择性状间的遗传对抗(负遗传相关)，另一方面是克服自然选择的阻力。
二、基本选择方法(一)个体选择也称为大群选择(mass selection)，根据个体表型值进行选择。
这种方法简单易行，适用于遗传力高的性状。
在肉鸡的育种中选择体重时常用此法。
鸡群生产性能的正态分布(二)家系选择根据家系均值进行选择，选留和淘汰均以家系为单位进行。
这种方法适用于遗传力低的性状，并且要求家系大、由共同环境造成的家系间差异或家系内相关小。
家系均值基本能反映家系平均育种值的大小。
对产蛋量作选择时都采用此法，但必须注意保证足够大的家系(>30只)，而且家系成员要在测定鸡舍内随机分布。
动物遗传育种与繁殖---选配
（2）当畜群很大时，可随机抽取一定数量的 动物，逐个计算近交系数。然后用样本平均数 代表畜群平均近交系数。
（3）将畜群中的个体按近交程度分类。先求 出每类的近交系数，再以其加权平均数来代表 畜群的平均近交系数。
（4）对于长期不从外边引进种畜的闭锁畜群， 平均近交系数可用下边的公式估算：
n ΔF = 1/8Ns + 1/8Nd
第七章 选 配
选配就是有目的地决定公母畜配对，是一 种有意识地组合后代的遗传基础以达 到利用良种的目的。
第一节 选配的作用和种类 一、选配的作用 1、创造必要的变异 2、加快遗传性稳定 3、把握变异方向，实现定向培育
第七章 选 配
选配的种类 1、品质选配 一般是指表型选配。是按个
体的质量性状和数量性状的表现，即考 虑交配双方的品质对比来进行选配。
第七章 选 配
2、亲缘选配 考虑交双方有无亲缘关系。有较近的亲缘
关系叫近亲交配；简称近交。反之，叫非亲缘 交配，简称远交。 三、选配计划的制定 选配计划又叫选配方案。 是育种场公母畜配种具体执行 方案和时间表。
第七章 选 配
第二节 近 交 一、近交的概念 二、近交程度的分析 三、近交的遗传效应及应用
N=3
N=3
Fs=（1/2）3+（1/2）3 = 0.25
2、计算X的近交系数
Fx = (1/2)2*(1+0.25) = 0.3125 = 31.25%
x的共同祖先是S, 同时s本身又是x的父亲，故 s连接父母的通路只有一条，既S D，N=2。
第七章 选 配
2、畜群近交程度的估算
（1）当畜群较小时，可先求出每个个体的近交 系数，再计算其平均值。
能、生理活动以及与适应性有关的各性状表现 出的衰退现象。
估计育种值的方法概述
国际瞭望GLOBAL NEWS海外文摘对公猪肉质异味质量控制的研究最近，德国哥廷根大学的Johanna Trautmann博士对公猪肉质异味的感官质量控制进行了深入研究，其研究结果总结如下。
需要谨慎选择公猪异味评估者选择程序的第一部分是进行气味测试，主要目的是客观地描述公猪肉质异味评估员的遴选过程。
该测试主要是分析雄烯酮和粪臭素的检测阈值以及评估员通过易于使用的纸质气味条区分和鉴定各种浓度水平的物质的能力。
随后，对25个脂肪样品进行异味检测，以评估嗅觉性能对肉质感官质量控制的影响。
评估员对雄烯酮和粪臭素的嗅觉敏锐度显示出相当大的个体间变异性。
由此可知，评估员的嗅觉性能显著影响脂肪样品评级为公猪肉质异味的概率。
热铁是公猪异味检测的最佳选择第二部分的主要目的是填补先前研究中用于公猪肉质异味评价的样品制备差异。
在本次研究中，通过3个常用的工具加热脂肪样品以检测公猪肉质异味，即微波、热铁和热水法。
审核小组由10个评估员组成，对72个脂肪样品进行比较。
加热方法显著影响偏差评级的概率。
与假定的“金标准”（化学分析）相比，当考虑灵敏度和特异性时，通过热铁处理的肉品质量更好一些。
此外，结果显示，与单个评估者的评估结果相比，审核组的评估结果更准确。
恒定噪声不影响人们嗅觉第三部分的主要目的是质疑广泛的建议，即感官测试应该在没有外来噪声的环境中进行。
然而，当在屠宰环境中进行评估时，大家对评估结果有所质疑。
在本研究中，选择了两组成员：通常在无声条件下工作的大学小组和通常在屠宰场工作的屠宰场小组。
我们针对40个公猪肉质样品研究了气味辨别、气味识别和气味检测阈值。
结果表明，噪声不影响评估员对肉品有无异味的结果判断。
雄甾烯酮和粪臭素相互作用影响肉品的感官判断第四部分的主要目的是深入分析雄烯酮和粪臭素的气味及气味相互作用。
因此，采用气相色谱质谱法对1 043只公猪的脂肪样品进行感官评价和公猪肉质异味化合物的定量测定。
每个样品由10个训练有素的评估者评价，得到11 000个以上的个体评分，对其进行统计分析。
两对等位基因自由交配配子法求概率
概率在生物学中是一个非常重要的概念。
而两对等位基因自由交配配子法求概率，是生物遗传学中的一个基础知识点。
在这篇文章中，我将深入探讨这个主题，从简单的概念解释到实际应用，以便你能全面理解这个概念并能够灵活运用于生物学的实际问题中。
1. 什么是两对等位基因？在遗传学中，基因是决定个体遗传性状的因子。
每个基因都有两个等位基因，一个来自父亲，一个来自母亲。
在自由交配配子法中，研究的对象是两对等位基因。
2. 为什么要用自由交配配子法求概率？自由交配配子法是一种用来计算遗传概率的方法，通过这种方法可以计算出某一种基因型的后代的可能性。
这对于了解生物个体的遗传规律和预测后代的遗传特征非常重要。
3. 求解概率的具体步骤为了求解两对等位基因自由交配配子法求概率，首先需要确定父代的基因型，然后通过自由交配的原则，计算出各种基因型的后代的可能性。
具体的步骤包括染色体分离、配子组合和可能基因型的形成。
4. 实际应用举例在实际生活中，两对等位基因自由交配配子法求概率可以被应用在很多领域，比如农业、医学和动物育种等。
我们可以通过这种方法预测某种遗传病的传播风险，或者预测杂交品种的后代表现。
总结回顾：通过对两对等位基因自由交配配子法求概率的研究，我们能够更好地理解生物个体的遗传规律，预测后代的遗传特征，甚至指导农业生产和医学诊断。
在实际应用中，我们可以灵活运用这一方法来解决各种生物遗传学问题。
个人观点和理解：我认为，深入理解两对等位基因自由交配配子法求概率对于生物学和遗传学的学习至关重要。
只有掌握了这一方法，我们才能更好地理解生物个体遗传规律，预测后代遗传特征，并且应用于实际生活中。
希望通过这篇文章的阐述，你能够对这一方法有一个更全面、深刻的理解。
遗传学是生物学的一个重要分支，研究个体间遗传性状的传递规律和遗传变异。
在遗传学中，基因是决定个体遗传性状的因子。
每个基因都有两个等位基因，一个来自父亲，一个来自母亲。
这些等位基因是可以相互组合，造成不同遗传特征的基础。
基因流nm的计算
基因流nm的计算基因流，即基因迁移或基因交流，指不同种群间基因的相互转移现象。
在生物演化的过程中，基因流是一个非常重要的因素。
它可以增大物种间基因的相似性，促进物种的进化和适应性。
基因流的计算是通过分析DNA序列的差异进行的，包括基因多态性、遗传距离、基因流和迁移速率等。
一般来说，基因流的计算需要进行一系列的步骤。
首先，需要收集多个样本的DNA序列数据，这些数据可以通过测序技术或测序数据库得到。
然后，通过基因多态性对这些数据进行分析，确定各个样本之间的遗传距离。
遗传距离是评估不同个体、种群和物种之间基因相似性和差异的指标之一。
一般有Jukes-Cantor距离、Kimura-2距离、Maximum-Likelihood距离、Neighbor-Joining距离等。
之后，可以使用一些计算方法计算各个种群之间或个体之间的基因流和迁移速率。
差异限制的分子时钟等方法和树模型可以在无导向的基础上描述基因流情况，集约型农业与渔业过度捕捞等人类活动可导致基因流减缓，另外也可以通过人工干预提高不同种群间的基因流。
基因流计算不仅在研究物种进化的基本机制方面具有重要意义，而且在许多其他领域也被广泛应用。
例如，在人类遗传学中，基因流是一种常用的方法来测算人类种群之间的遗传相似性和差异，也可用于寻找人类种群之间的相似性和差异，并推断人类的迁徙和互动历史。
此外，在动物育种中，基因流计算也是一种常用的方法，用来评估动物品种之间基因的相似性和差异，推断适合交叉育种的品种等。
综上所述，基因流是基因在不同种群之间发生迁移的现象，在生物演化过程和人类学研究中具有重要影响，基因流计算是分析多个物种基因遗传的关系和相似性的一种常用的方法。
基因流的计算需要对DNA序列数据进行遗传距离分析，然后使用相应的计算方法计算各个物种之间或者个体之间的基因流和迁移速率。
基因流计算在许多领域有着广泛的应用，包括了人类遗传学、动物育种和生物多样性保护等领域。
肉牛遗传评估方法
肉牛遗传评估方法引言：肉牛遗传评估是指通过对肉牛的遗传性状进行评估和分析，以确定其遗传价值和育种潜力的方法。
肉牛遗传评估是肉牛育种工作中的重要环节，可以帮助肉牛养殖者选择和配对合适的肉牛，提高肉牛的育种效果和经济效益。
本文将介绍肉牛遗传评估的一些常用方法。
一、表型评估方法表型评估是通过对肉牛的外部性状进行观察和测量，以评估其遗传特性的方法。
常见的表型评估方法包括测量体重、胸围、体高等指标，评估肉牛的生长发育状况、体型特征等。
通过对表型数据的收集和分析，可以了解肉牛的生长速度、体型大小、肉质品质等特征，为肉牛的选配和育种提供依据。
二、基因型评估方法基因型评估是通过对肉牛的基因组进行检测和分析，以评估其遗传基因型的方法。
常见的基因型评估方法包括单倍体基因分型、DNA 标记分析等。
单倍体基因分型是通过对肉牛DNA进行测序和分析，确定其基因型，并可预测其遗传特性。
DNA标记分析是利用特定的DNA标记位点，对肉牛的基因组进行扫描和分析，鉴定与肉牛重要性状相关的基因。
基因型评估可以提供更准确的遗传信息，帮助肉牛养殖者更好地选择和配对肉牛。
三、遗传参数评估方法遗传参数评估是通过对肉牛的后代进行观察和测量，以评估其遗传参数的方法。
遗传参数包括遗传方差、遗传相关等，用于描述和评估肉牛遗传特性的遗传变异程度和相关性。
通过对肉牛后代的数据进行收集和分析，可以计算得到遗传参数，并判断肉牛的遗传特性对于育种的响应程度。
遗传参数评估可以帮助肉牛养殖者了解肉牛的育种潜力和遗传规律，为肉牛的选配和育种提供科学依据。
四、遗传标记评估方法遗传标记评估是利用遗传标记对肉牛进行评估和选择的方法。
遗传标记是指与肉牛重要性状相关的DNA序列或染色体区段。
通过对肉牛的DNA进行标记，可以快速而准确地评估肉牛的遗传特性。
常见的遗传标记评估方法包括QTL定位、关联分析等。
QTL定位是通过对肉牛基因组的扫描和分析，确定与肉牛重要性状相关的QTL位点，为肉牛选配和育种提供指导。
第四章实验动物的育种繁殖教材
目的 掌握有关实验动物育种繁殖的基本理论、基 本知识和基本技能。
重点 重点掌握近交系动物和封闭群动物的育种、 保种和繁殖方法，实验动物的性别鉴定、动情周期、 发情鉴定、配种方法等。
第一节 第二节 第三节 第四节 第五节
实验动物育种繁殖基本技术 近交系动物的育种繁殖 封闭群动物的育种繁殖 杂种一代和重组近交系的育种繁殖 携带特定基因品系的育种繁殖
动情周期：哺乳动物性成熟后，卵巢、子 宫、阴道等出现周期性的变化，动物表现周期 性的动情现象。分为动情前期、动情期、动情 后期和动情间期（休情期）。
产（孕）后发情：产后不久出现发情且能 接受交配的现象。
产后妊娠：边哺乳边怀孕。
实验动物配种方法
两种配种方式：长期同居与定期同 居
三种配比方式：一雌一雄、多雌一 雄和多雌多雄
遗传性状：生物体能世代相传的形
态特征、生理特征、代谢类型、行为本 能等。
质量性状：指明显的不连续变异 的性状，如毛色。通常由一对等位基因 控制。
数量性状：指连续的界限不清楚的 性状，如体重。受微效多基因控制。
质量性状的判断
杂交试验判定法：通过杂交、互交、 回交、纯交等方法，按孟德尔遗传定律 来分析判断。
个无限大的群体中，如果没有近 交、突变、迁移等因素的作用， 则群体的基因（型）频率保持不 变。即(p+q)2=p2 +2pq+q2 =1
基因型频率计算
Aa(♀)× Aa (♂ )
雄性配子 A p 及频率 a q
雌性配子及频率
Ap
aq
AA p2 Aa pq
Aa q p aa q2
( p+q)2=p2 +2pq+q2 =1
动物遗传育种与繁殖---数量性状的遗传
在一个大群体中：固定环境值方差=0 随机环境偏差总和=0
即：P = G + E = A + D + I = A 表型方差 Vp= Vg + Ve
H2（广义遗传力）= VD/Vp h2 （狭义遗传力） = VA/Vp
第四章 数量性状的遗传
第一节 数量性状的遗传基础 3、通径系数理论
单箭头表示因果关系，方向是由因到果； 用双箭头代表平等的相关关系。
X1 Y3
X2
有关变量间关系图解
第四章 数量性状的遗传
第一节 数量性状的遗传基础
3、通径系数理论
X3代表饲养条件，是X1与X2的共同原因，
把它省略了就用一条双箭头代替两条单箭头线。 单箭头线叫做通径，双箭头线叫做相关线。
第四章 数量性状的遗传
第三节 数量性状的重复力 二、重复率的计算
re = MSB – MSW/ MSB+（n-1）MSW 三、重复率的应用 1、验证遗传力估计的正确性 2、确定性状需要度量的次数 3、估计畜禽个体最大生产能力（p79） 4、评定动物的育种值
第四章 数量性状的遗传
第四节 数量性状的遗传相关 一、遗传相关的概念 动物所表现的各种
（2）基因的非加性效应 数量性状的各个基因的效应是累加的。
但是，基因除具有加性效应外，还有非加性效 应。
由等位基因间相互作用产生的效应产生 的效应叫做显性效应。
由非等位基因之间相互作用产生的效应， 叫做上位效应或互作效应。
第四章 数量性状的遗传
第一节 数量性状的遗传基础 2、数量性状的遗传基础
（2）基因的非加性效应 原因：
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动物遗传育种中的计算方法
随着科学技术的不断发展，计算方法在动物遗传育种中的应用也越来越广泛。
计算方法的应用，可以大大提高遗传育种的效率和精度，为动物生产提供更好的品种和更高的经济效益。
本文将从计算方法在育种中的基本原理、应用场景和未来发展方向三个方面进行探讨。
一、计算方法在育种中的基本原理
计算方法主要是利用计算机进行数据处理和分析，通过建立数学模型，对大量的遗传信息进行计算和预测。
计算方法在育种中的基本原理就是将遗传信息转化为数字信息，进而进行计算和分析。
这种方法的优点在于可以减少人工干预，消除主观因素的影响，提高育种效率和精度。
计算方法在育种中的应用主要分为两种类型：一种是基于遗传信息的计算方法，另一种是基于表型信息的计算方法。
基于遗传信息的计算方法包括基因型预测、遗传参数估计和基因组选择等，这些方法主要是通过对遗传信息的计算和分析，预测和选择更优秀的个体进行育种。
基于表型信息的计算方法主要是基于动物的性状表现，通过建立表型-基因型关系模型，预测和选择更优秀的个体进行育种。
二、计算方法在育种中的应用场景
1. 基因型预测
基因型预测是指通过基因分型数据，预测个体的基因型。
这种方法可以用于基因标记较多的情况下，对个体基因型的预测，从而实现对个体的基因组选择。
基因型预测主要是通过基因频率、连锁不平衡
和基因型概率等计算方法，对个体基因型进行预测。
这种方法在育种中的应用较为广泛，可以实现对遗传背景的精确控制，提高遗传育种的效率和精度。
2. 遗传参数估计
遗传参数估计是指利用育种试验数据，对遗传参数进行估计。
这种方法可以用于估计遗传力、遗传相关和遗传环境互作等遗传参数。
遗传参数估计主要是通过方差分析和线性模型等计算方法，对育种试验数据进行分析和处理。
这种方法在育种中的应用较为广泛，可以实现对遗传背景的精确控制，提高遗传育种的效率和精度。
3. 基因组选择
基因组选择是指利用基因组信息，对个体进行选择。
这种方法可以用于基因标记较多的情况下，对个体的基因组选择。
基因组选择主要是通过基因频率、连锁不平衡和基因型概率等计算方法，对个体基因组进行选择。
这种方法在育种中的应用较为广泛，可以实现对遗传背景的精确控制，提高遗传育种的效率和精度。
三、计算方法在育种中的未来发展方向
随着科学技术的不断发展，计算方法在育种中的应用也将不断发展和完善。
未来计算方法在育种中的发展方向主要有以下几个方面： 1. 基因组预测
基因组预测是指通过基因组信息，预测个体的表现性状。
这种方法可以用于基因标记较多的情况下，对个体表现性状的预测，从而实现对个体的选择。
基因组预测主要是通过基因频率、连锁不平衡和基
因型概率等计算方法，对个体表现性状进行预测。
这种方法可以更加精确地预测个体表现性状，提高遗传育种的效率和精度。
2. 基因编辑
基因编辑是指通过基因编辑技术，对个体基因进行修饰和改变。
这种方法可以用于快速改善个体遗传背景，提高育种效率和精度。
基因编辑主要是通过基因编辑技术和计算方法相结合，对个体基因进行修饰和改变。
这种方法可以更加精确地改变个体遗传背景，提高遗传育种的效率和精度。
3. 大数据分析
大数据分析是指利用大数据技术，对大量的育种数据进行分析和处理。
这种方法可以用于发现新的遗传因素和遗传规律，提高育种效率和精度。
大数据分析主要是通过大数据技术和计算方法相结合，对大量的育种数据进行分析和处理。
这种方法可以更加精确地发现新的遗传因素和遗传规律，提高遗传育种的效率和精度。
四、结论
计算方法在动物遗传育种中的应用已经成为不可或缺的一部分，可以大大提高遗传育种的效率和精度，为动物生产提供更好的品种和更高的经济效益。
计算方法在育种中的应用将不断发展和完善，未来的发展方向主要是基因组预测、基因编辑和大数据分析等方面。