lncrna芯片分析-自己总结(1)
lncrna特征,作用机制,生物学功能
lncrna特征，作用机制，生物学功能
LncRNA（长链非编码RNA）是一种包含超过200个核苷酸的RNA，不能被翻译成蛋白质，但具有多种重要的生理功能。
LncRNA的作用机制主要包括以下几个方面：
- 调节染色体结构：在雌性哺乳动物中，X染色体失活（XCI）可以使早期胚胎发育过程中的两个X染色体之一沉默，从而实现剂量补偿。
从非活跃X染色体（Xi）转录而来的非X特异性转录本（XIST）触发一系列级联的事件，导致染色体重构以实现稳定沉默。
- 调节染色质重塑：许多核定位的LncRNA与染色质有关，参与了顺式或反式的染色质重塑。
- 影响染色质修饰：XIST介导的XCI模型是XIST直接招募多梳蛋白抑制复合体2（PRC2），导致组蛋白H3K27me3染色体广泛沉积，从而建立整个Xi的抑制性染色质。
- 在转录调控中的作用：LncRNA BLACAT2可以与血管内皮生长因子-C（VEGF-C）的启动子区域形成三螺旋结构，促进了DNA甲基转移酶重要组分WDR5的募集，增加了VEGF-C启动子区域的甲基化水平，促进了其表达增加。
LncRNA的生物学功能包括以下几个方面：
- 参与染色体重构：通过调节染色体结构，参与了X染色体失活等过程。
- 调节染色质重塑：通过参与染色质重塑过程，影响了基因的表
达和调控。
- 影响染色质修饰：通过影响染色质修饰，参与了多能性基因的
激活和沉默。
- 在转录调控中的作用：通过与基因启动子区域相互作用，调节
了基因的转录和表达。
LncRNA是一类重要的非编码RNA，在染色体重构、染色质重塑、染色质修饰和转录调控等方面发挥着重要的生物学功能。
lncRNA是如何搭上癌症的，看完这篇就懂了
lncRNA是如何搭上癌症的，看完这篇就懂了转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台lncRNA在癌症中的作用可谓不容小觑，包括表观遗传调控、DNA损伤和细胞周期调控、对microRNA的调控、参与信号转导通路和介导激素导致的癌症。
它们可以作为癌基因和抑癌基因的转录调控分子。
比如过表达的HOTAIR lncRNA与恶性乳腺癌、结肠癌、肝癌和胃肠道间质瘤有关。
而lncRNA TARID可以预防癌症形成，通过甲基化抑癌基因的表达。
长非编码RNA(lncRNAs)在癌症中的生物学功能,包括表观遗传调控、DNA损伤和细胞周期控制，对microRNA的调控，参与信号转导途径，介导激素导致的癌症等。
表观遗传调控表观遗传是指遗传表型和基因表达发生了可遗传的改变，而不涉及DNA 序列的变化，主要包括DNA 甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等修饰形式。
近年来研究表明，lncRNAs 通过表观遗传调控介导癌症发生中起到至关重要的作用。
lncRNAs 能够通过表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等多个层面调节基因的表达，从而参与癌症中细胞增殖、分化和凋亡等多种生物学过程。
在癌症发展过程中，lncRNAs 参与了多种表观遗传复合物的调节过程，从而抑制或激活基因的表达。
例如，lncRNAs可以与多梳蛋白复合体结合来调控癌症发生。
PRC1和2是已知的致癌基因，能够导致许多恶性肿瘤的发生。
FAL1 lncRNA 与PRC1的亚基BMI1结合。
在卵巢癌,FAL1被证明可以加快癌症的进展和缩短病人的生存时间。
FAL1与BMI1结合可阻止BMI1降解以稳定PRC1复合物，这可使PRC1占据和抑制p21等目标基因的启动子,导致细胞周期失调和增加肿瘤发生的机会。
除了PRC复合物,lncRNAs还与SWI/SNF染色质重塑复合物有关，SWI/SNF是一类重要的依赖ATP的染色质重塑复合物,能够改变核小体的高级折叠结构，干扰组蛋白与DNA结合，暴露启动子序列的结合位点，使转录因子能与特异性启动子序列结合，从而激活基因转录。
LncRNA：LncRNA的前世今生以及临床思路分析
LncRNA：LncRNA的前世今生以及临床思路分析前言：近年来，LncRNA相关研究在国内外的热度居高不下，早在1991年，Xist 调控X染色体的失活就登上Nature，但当时认为这只是一种特殊情况。
2007年Howard Chang在Cell上发表题为“Functional demarcation of active and silent chromatin domains in human HOX loci by noncoding RNAs”的论文（图1），正式开启了LncRNA火热的十年。
接下来从以下8个方面来介绍：LncRNA的定义、LncRNA的发现、LncRNA的分类、LncRNA的功能、LncRNA的作用模式、LncRNA的争议、LncRNA的常用数据库以及LncRNA的研究模式。
图1图2-谷歌学术显示该文章引用量高达2854次一、LncRNA的定义LncRNA(Long non-coding RNA)，是长度大于200个核苷酸的非编码RNA，一些LncRNAs，长度超过90kb，也被称为macroRNA，如Airn 和KCNQ1OT1。
标准“非编码”是指在转录本中缺少开放阅读框和/或保守密码子，2011年Cell发表论文表明LncRNA可以被核糖体吸引，其中一些能翻译产生小肽（图3）。
编码肽的能力与转录产物充当功能性RNA的能力并不一定冲突，事实上，越来越多的证据表明双功能转录产物既可以作为蛋白质模板，也可以作为LncRNAs。
图3-Cell论文证实LncRNA能翻译产生小肽二、LncRNA的发现LncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II 转录的副产物，不具有生物学功能。
然而，1991年，Nature等杂志刊文证实Xist参与X染色体失活的调控（图4）。
此后越来越多的研究表明，LncRNA在众多生命活动过程中发挥重要作用，LncRNA开始引起人们广泛的关注。
lncRNA四种经典作用模式详解，必读综述
lncRNA四种经典作用模式详解，必读综述4种模式，道尽lncRNA分子机制研究的典型思路。
lncRNA红火，功能万全，众人皆知。
目前，lncRNA相关研究已呈井喷之势，但其功能的某些领域仍是一片蓝海，静待大家去深海寻宝，而这就需要各位学员对lncRNA研究的必备常识储备有一定的积累。
因而，本期《文献精读》就选取了该领域里的一篇里程碑式经典综述，聚焦lncRNA的分子机制，来一展lncRNA的通天彻地之能。
“神”一般的明星分子——lncRNA小小的lncRNA实际上蕴含着大大的能量，细胞内的很多生物学功能都有它们的身影出没。
通常生物功能越复杂、越多样性，非编码核酸所占的比例越来越高，而它所发挥的生物学作用也就越来越重要。
既然如此，lncRNA从何而来也是必要解答的重要问题。
其实，就其编码容量和表达水平而言，lncRNA都能达到最高值；唯独保守性，lncRNA降为最低，由此可见lncRNA的功能具有多样性和复杂性。
首先，lncRNA可在基因表达的不同阶段、不同层次、不同水平对基因表达进行调控。
lncRNA不仅仅参与了机体正常的生物学功能，同时也涉及了多种疾病的进程；还可以与染色质重构复合体结合，从而改变染色质的结构和转录过程。
Signal lncRNA其实，《三十六策》的第22策“移花接木”已经提到了lncRNA 作用机制的四种模式——signal（信号）、decoy（诱骗）、guide （引导）和scaffold（结构骨架）。
而本篇综述也以此分类模式，来分别展示lncRNA的相应分子功能。
研究发现，在不同的刺激条件和信号通路下，一些lncRNA将会被特异性地转录，并会作为信号传导分子参与特殊信号通路的传导。
比如lncRNA可以直接结合染色体中邻近位置的DNA调节基因表达，即顺式调控模式（cis-regulation）。
通常可从等位基因特异性、解剖特异性表达、DNA 损伤诱导、多能性与重编程、寒冷诱导、增强子 RNA 为代表的协同活性以及重复检测等方面进行具体的阐释。
一文参透：lncrna研究思路、模式和大数据库应用
一文参透：lncRNA研究思路、模式和数据库应用...作者：解螺旋.老谈导语当很多小伙伴还徘徊在miRNA时，lncRNA已经横空出世，还没得来得及反应过来lncRNA到底是怎么回事时，circRNA 又开始崭露头角了。
科研就是这样，你落后一步，便步步落后，跟娶媳妇生孩子是一样一样的。
说回正题，应部分解螺旋粉丝的要求，今天老谈帮大家整体梳理了曾经红极一时、目前热度不减的IncRNA的研究思路和模式以及相关工具，希望能对那些想在IncRNA研究上有所作为的小伙伴能助上一臂之力。
lncRNA研究思路IncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程。
很多人看到lncRNA的热度还没有过去，经常会问老谈如果没有相关的工作基础，如何开始lncRNA的研究?今天我们就褪去虚伪外衣，研究的大方向是这样子的：1. 寻找到lncRNA分子2. lncRNA分子表型研究3. lncRNA 通过何种机制调节表型？老谈将这些研究方向及实验手段按层次的方式绘成流程图，如下所示：首先，是样本的准备与收集。
高质量的样本是实验结果具有可靠性的前提。
其次，是lncRNA检测。
可以先通过芯片的方式高通量筛选到目的基因，然后通过q-PCR或Northern blot的方法验证所得到的芯片结果。
再次，其研究方向根据研究目的而定。
如果是研究生物标志物，那么可以通过收集更多的临床样本，研究lncRNA对疾病的指示作用。
如果是研究其功能，则是研究其细胞表型、分子表型及机制。
小伙伴们是不是觉得这和miRNA的总体研究思路相似呢？这时可以根据各自的实验平台条件选择相应的研究。
值得注意的是，lncRNA的功能研究并不像miRNA一样通过3’UTR影响翻译套路，总的来说lncRNA机制研究套路还不成熟。
对于很多科研工作者而言，lncRNA分子的获得及其细胞表型的获得并非难事，关键在于如何进行下一步研究，这时候就要涉及到对功能研究的定位。
有关lncRNA不得不看的十篇综述！
有关lncRNA不得不看的十篇综述！不太清楚别人对SCI文章的偏好如何，相比于Research Article，本宫更喜欢看Review，因为Review能给人更加全面的认知，会觉得自己真的涨姿势了！一篇好的综述会让人觉得自己不是在看一篇严肃的科技论文，而是在看一篇散文或者说是博物小品文，能够让人沉浸其中！LncRNA现在辣么火，X湿兄也要开始讲座了，本宫拿出自己珍藏多年的LncRNA综述分享给大家，下面就开始愉悦的阅读之旅吧！1、Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function (Nat Rev Genet,2016 Jan)当LncRNA这个曾经基因组中的“暗物质”逐渐为我们所认知，我们意识到自己过去错得有点离谱，基因毕竟是进化了几亿年的老妖精，怎会如此轻易地被我们看透？！这篇综述详细地讲述了有关LncRNA机制研究的最新成果，读完全文，你会对LncRNA的作用机制将会有更全面地领悟。
LncRNA的转录后过程2、Genome regulation by long noncoding RNAs (Annu Rev Biochem. 2012)本文详述了LncRNA对基因组的调节作用。
LncRNA的调节作用可以说是对中心法则的挑战？亦或是补充？总之，非编码RNA的发现让我们在RNA的功能认知上有了全新的视角。
本文最后还提出了对未来LncRNA研究的展望，虽是2012年的展望，但现在看来仍不过时！对RNA生物调节功能的认知时间表3、Long Noncoding RNAs in Cancer Pathways (Cancer Cell. 2016 April 11)这篇综述详述了lncRNA与癌症表型的关系，以及阐述了其中的分子机制和涉及到的信号通路。
文中还详细整理了LncRNA在不同癌症中对基因突变位点的影响、癌症监测诊断中以及预后中的作用。
ncRNA系列专题（三）丨RNA界谁的情商最高？——lncRNA作用机制
ncRNA系列专题（三）丨RNA界谁的情商最高？——lncRNA作用机制都说做人难，做好人更难，好人全靠高情商。
都说lncRNA情商极高，与上层领导(DNA)关系暧昧，与同事(RNA)关系很铁，与下属(蛋白质)关系紧密，八面玲珑的lncRNA那是相当吃得开啊。
想在生物行业这个圈子里混得好，还得多向lncRNA学习。
来，咱们今天就向大家分析分析lncRNA如何在圈子里如鱼得水，嘿嘿！图1 （网络来源图片，和珅）lncRNAs作用范围广泛，机制非常复杂，这里从基因调控的角度重点讲一讲。
为了方便大家的理解，咱们先来看看lncRNA的特点。
简单讲，lncRNA的本质是RNA，是由核苷酸组成的长链，有以下几个优势：1. 通过碱基互补配对，轻松与靶DNA序列结合；2. 通过碱基互补配对，轻松与靶RNA序列结合；3.其丝带般的特点可以折叠形成二级或三级结构，轻松与多种蛋白质结合。
LncRNA的牛皮可不是乱吹的，接下来给大家逐一带来相关文献报道作为论据支撑！LncRNA与染色质和DNAlncRNA重塑染色质Deng et al.发现HoxB lincRNA的表达量上调能调控心源性中胚层发育，促进造血循环。
HoxB lincRNA能够作为染色质循环结构的调控因子引导Setd1a/MLL1到hoxb基因，控制血液系统相关基因的转录[1]。
图2. HoxB基因在中胚层和造血过程中发挥着关键的作用DNA绑定Postepska-Igielska et al.认为调控因子lncRNA Khps1能够通过联系SPHK1的启动子激活原癌基因的表达。
在这个过程中，Khps1与SPHK1通过RNA-DNA绑定的方式诱导染色质修饰酶建立转录本疏松的结构，并激活E2F1基因的转录[2]。
图3. lncRNA Khps1与SPHK1基因发生绑定的作用机制促进染色质成环通过FACS纯化技术和RNA-seq，Jiang et al.全面论述了在人内胚层和胰腺系细胞的转录本动力学，以及鉴定了100余个特异性lncRNA。
长链非编码RNALncRNA研究，读这篇文章就足够了！
长链非编码RNALncRNA研究，读这篇文章就足够了！1.认识一下长非编码RNA定义非编码RNA (non-coding RNA，ncRNA)指不翻译成多肽的RNA。
按照长度不同，短于200nt的归为小非编码RNA (small ncRNAs，sncRNAs)，长于200nt的归为长非编码RNA (long ncRNAs，lncRNAs)。
分类根据染色体上与编码基因的相对位置将lncRNA分为反义型(antisense lncRNAs)、内含子型(intronic lncRNAs)、反向型(divergent lncRNAs)、基因间型(intergenic lncRNAs)、启动子上游型(promoter upstream lncRNAs)、启动子型(promoter-associated lncRNAs)、转录起始位点型(transc ription start site-associated lncRNAs) [1, 2] (图1)。
图1. 根据染色体上与编码基因的相对位置对ncRNA进行分类。
lncRNAs作用范围广泛，机制非常复杂，这里从基因调控的角度重点讲一讲。
为了方便大家的理解，咱们来看看lncRNA的特点。
简单讲，lncRNA的本质是RNA，是由核苷酸组成的长链，有以下几个优势：(1) 可以轻松的与同源DNA序列(转录lncRNA的基因以及序列相似的基因)结合；(2) 可以轻松的与同源RNA序列结合；(3) 其丝带般的特点可以折叠成复杂的二级结构，轻松与多种蛋白质结合。
也就是说，lncRNA情商极高，与上层领导(DNA)关系暧昧，与同事(RNA)关系很铁，与下属(蛋白质)关系紧密。
这样八面玲珑的lncRNA那肯定是相当吃得开啊。
2.lncRNA参与转录前调控顾名思义，转录前调控就是对转录事件发生之前的准备阶段进行调控，主要指染色质开放或关闭状态的调控——想要使原来不转录的基因开启转录，就需要染色质从关闭状态转换为开放状态；想要使原来转录的基因不再转录，就需要染色质从开放状态转换为关闭状态。
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lncRNA芯片分析
lncRNA芯片分析 修改时间2010/6/16 13:57:12 点击3210次
1. 归一化
lncRNA芯片采用的归一化的方法为quantile normalization。
2. 差异LncRNA的筛选
lncRNA芯片中既有lncRNA的探针又有mRNA的探针，分别做差异基因的筛选，筛选方法同表达谱的筛选方法是一致的，参见表达
谱的差异基因筛选。
3. 差异lncRNA的重注释
lncRNA芯片注释不完善，因此需要将筛选出来的lncRNA进行重注释。将差异lncRNA在基因组上位置上下游延伸，以寻找lncRNA
附近的有功能的基因。
差异lncRNA重注释示例
4. 差异lncRNA靶基因的预测
lncRNA可能通过调控相应的mRNA发挥功能，因此有必要预测lncRNA的靶基因。我们提取差异lncRNA和mRNA的序列，首先用blast
进行初筛，之后用RNAplex进行进一步筛选，以预测lncRNA可能调控的mRNA。
2
差异lncRNA靶基因预测结果示例
5. 差异lncRNA与靶基因共表达网络
预测出lncRNA的靶基因后，并可进一步在mRNA的数据中探寻该mRNA是否发生表达量的变化。由此构建差异lncRNA与靶基因相互
作用网络图。
差异lncRNA与靶基因相互作用网络图。方框代表lncRNA，圆形代表mRNA。连线表示可能的调控关系。节点面积越大，表示调控的mRNA越多，
预示该lncRNA在调控网络中所起的作用可能越大。
6. 差异lncRNA与差异mRNA的共表达分析
SBC Human lncRNA芯片能同时检测出差异表达的lncRNA和mRNA。我们将差异lncRNA和差异mRNA在一组样品中进行共表达分析，
可以发现与某个lncRNA具有相同表达模式的mRNA。
要求：每组数据3个或3个以上生物学重复
实验组：
4
对照组：
5
lncRNA与mRNA共表达分析作用图，圆形带圈代表lncRNA，圆形代表mRNA。红色为上调基因，绿色为下调基因。
6
7. 差异lncRNA靶基因的GO analysis
对lncRNA的靶基因进行GO Ontology的生物学的分类，根据Fisher's Exact Test,得到p-value，得到lncRNA靶基因对应的显著
性功能，从而了解lncRNA的功能。
8. 差异lncRNA靶基因的pathway analysis
对lncRNA靶基因按照Pathway的主要公共数据库KEGG和Biocarta来进行分类，对Pathway中的基因进行基于离散分布的显著性
分析，得到与实验目的有显著联系的Pathway 分类,由这些pathway对应相应的靶基因，从而获得该分类即导致lncRNA差异的最重要Pathway。
9. 差异lncRNA的转录因子的预测
提取lncRNA TSS的上游2000bp，下游500bp,利用HMM的算法根据数据库预测其转录因子。
1) 芯片数据预处理：对实验数据质量评估，预处理及均一化处理。
2) 差异表达lncRNA及mRNA 的筛选：根据客户提供样本量的大小与分布或实验目的，应用倍数法、
多重假设检验等手段，对两条件或多条件下的表达差异的lncRNA和mRNA分别进行计算和筛选。
※ 表达模式聚类分析：针对芯片结果进行样本及差异表达lncRNA和mRNA的聚类，寻找属于同一表达
趋势的基因或样本。
※ GO和pathway显著性富集分析：差异基因，应用数据库进行功能富集分析，挖掘具有统计学意义
的差异表达基因的功能类别。显著性P值越小，则它随机聚集差异表达基因的概率越小，其功能相关性的
非随机性就越小，该功能模块有较大的可能与疾病（或药物作用） 相关。
※ 蛋白互作网络分析：研究与指定蛋白质相互作用的其他蛋白质的信息，以使研究人员能够更加深入
地认清相关蛋白质的功能，更清楚地理解其调控机制。
3) lncRNA-mRNA共表达分析：对于每一个差异表达的lncRNAs，计算得到与之共表达的编码基因。
4) lncRNA表达模式分析：考察差异表达LncRNAs 的表达模式，将LncRNAs 以及与该LncRNAs 显著共
表达的编码基因的表达模式绘制heatmap。
5) lncRNA功能预测：筛选出表达显著相关的lncRNA-mRNA 关系对，利用成熟的mRNA 的功能来推导
lncRNA 的功能，对异常表达lncRNA 显著相关的mRNA 进行功能富集分析。
6) lncRNA cis作用机制研究：对于感兴趣的差异表达lncRNAs，搜索其上下游100K范围内的所有编
码基因，并与该lncRNAs 有显著共表达的基因取交集。这些在基因组上临近、且表达模式上共表达的基因
很可能被该lncRNAs 所调控。
7) lncRNA trans作用机制研究：计算LncRNAs 共表达的编码基因，集合与转录因子/染色质调控复合
物的靶基因集合的交集，利用超几何分布计算该交集的富集程度，得到与lncRNAs 显著相关的转录因子，
从而识别可能与lncRNAs 联合发挥调控作用的转录因子/染色质调控因子。
※ lncRNA--转录因子二元关系及网络分析
※ lncRNA--转录因子--靶基因三元关系及网络分析
[综述]长链非编码RNA（lncRNA）
来源: 新药筛选中心 /点击: 1464
lncRNA
长链非编码RNA（long noncoding RNA，lncRNA）是一类不编码蛋
白的RNA 分子，长度在200bp 以上，起初被认为是RNA 聚合酶II 转
录的副产物，不具有生物学功能；近期的研究表明lncRNA 具有保守的
二级结构，可以与蛋白、DNA 和RNA 相互作用，参与多种生物学过程
的调控，尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色，如染色质修饰、转
录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA 的诱导分子干扰基因的表
达等。随着高通量测序技术的发展，越来越多的lncRNA 被注释，但是
绝大多数的lncRNA 的功能仍然不清楚，因此lncRNA 的研究是一片非
常广阔的未知领域，具有极大的研究价值和意义。
lncRNA介绍
长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类转录本
长度超过200nt、不编码蛋白的RNA。lncRNA起初被认为是基因组转录
的“噪音”，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明lncRNA能
在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达，参与了X染色体沉
默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等
多种重要的调控过程，与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联
系。
为何细胞不惜耗费能量对这些非编码RNA的表达和定位进行严格
调控呢这些RNA分析究竟有何功能RNA测序技术的发展使人们得以初
窥这一神秘分子，现在lncRNA的许多相关信息都可以再新数据库中查
到，例如Broad研究所、哈佛大学和麻省理工共同开发的Human Body Map
lincRNAs catalog。虽然近年来关于lncRNA的研究进展迅猛，但是现
在人们了解到的lncRNA只是冰山一角，绝大部分的lncRNA的功能仍
然是不清楚的。随着研究的推进，各类lncRNA的大量发现，lncRNA的
研究作为RNA研究的新领域，已经成为一个非常吸引人的方向，有待
广大科学家去探寻。
lncRNA研究当前面临的一个主要挑战是，研究工具还在不断开发
和改进中，而lncRNA研究中非常关键的一步就是发现与特定疾病相关
的lncRNA。现阶段，基因芯片技术发展趋于成熟稳定，在此平台上，
通过设计不同检测lncRNA探针筛选lncRNA是一种准确快捷的方法。
lncRNA特征
lncRNA通常较长，具有mRNA样结构，有些具有poly(A)尾巴，有
些没有poly(A)尾巴，分化过程中有动态的表达与不同的剪接方式，与
编码基因相比，lncRNA表达量更低。
※ 组织特异性：不同组织之间的lncRNA表达量不同。
※ 时空特异性：同一组织或器官的不同生长阶段，其中的lncRNA
表达量也会变化。
※ lncRNA启动子同样可以结合转录因子，如Oct3/4，Nanog，CREB，
Sp1，c-myc，Sox2与p53，局部染色质组蛋白同样具有特征性的修饰
方式与结构特征。
※ 大多数的lncRNA在组织分化发育过程中，都具有明显的时空
表达特异性，如有人针对小鼠的1300个lncRNA进行研究，发现在脑
组织中的不同部位，lncRNA具有不同的表达模式。
※ 在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。
※ lncRNA的亚细胞位置上也呈多样化，在细胞核、细胞质和细胞
器均有分布，甚至某些lncRNA具有独特的亚细胞位置，有可能是全新
的亚细胞构成。
lncRNA功能
lncRNA可从染色质重塑、转录调控及转录后加工等多种层面实现
对基因表达的调控：
a) lncRNA通过招募染色质重塑复合物至特定的基因组位点使其发
生催化活性。如HOTAIR21，Xist、RepA和Kcnqot1招募Polycomb complex
至HoxD位点，使得X染色体或Kcnq1功能域的组蛋白H3 第27位赖氨
酸发生3甲基化（me3K27），诱导异染色质形成，从而抑制该区域基因