分子生物学精华版

分子生物学精华版 1 / 5 ORF：开放阅读框、ori：复制原点、ARS：自主性复制序列、hnRNA：核内不均一RNA、SnRNA：核内小RNA、IS：插入序列、Tn：复合转座子、homebox：同源异型盒、IPTG：异丙基硫代-β-D-半乳糖苷、TATAbox：位于-25～-30 bp处的TATAAAAG序列、CAATbox：位于-70～-78 bp处的CCAATG序列、GCbox：-90区、OCTbox：八核苷酸序列框、TF：转录因子、SSB：单链结合蛋白、Ribozyme：核酶、intron：内含子、exon：外显子、ORC：复制起始复合物、PCNA：增殖细胞核抗原、RFC：复制因子C、IHF：宿主整合因子、RF：阅读框、PDI：蛋白质二硫键异构酶、PPI：肽酰脯氨酸顺反异构酶、SRP：信号肽识别颗粒、DP：停泊蛋白，SRP受体、NLS：核定位序列、promoter：启动子、terminator：终止子、attenuator：衰减子、CAP：降解物基因活化蛋白、SD序列：核糖体结合序列、HLH：螺旋-环-螺旋、homeodomain：同源异型域、TIFs：转录起始因子、GTFs：基础转录因子、UCE：上游控制元件、UBF：上游结合因子、PSEbox：近侧序列元件、TAF：TBP相关因子、TBP：TATA识别结合蛋白、

enhancer：增强子、silencer：沉默子、UAS：上游激活序列、NM：核基质、MAR：基质结合区域、dNTP：脱氧核糖三磷酸、SNP：单核苷酸多态性 1、 前导链：以亲代DNA3`-5`链为模板。连续合成的新DNA链 滞后链：以亲代DNA5`-3`链为模板。不连续合成的新DNA链 2、简单转座子（插入序列）：最简单的转座子，只含有转座酶 复合转座子：除有转座酶外还有其他表现型基因 3、有意义链：正链，编码链，和RNA同义 无意义链：负链，模板链，和RNA反义 4、内含子：在RNA原初转录本中被切除，而最终不表达的片段 外显子：在RNA原初转录本中剪接中保留并连在一起最终表达的片段 5、兼并密码子：编码同一氨基酸的一组密码子 偏爱密码子：兼并密码子中使用频率最高的密码子 6、无义突变：发生在终止密码处，使有义密码变成终止密码或者终止密码变成有义密码 错义突变：由有义密码的点突变引起，突变结果只改变一个氨基酸，改变后产生一个性质相似的氨基酸 7、信号肽：分泌和跨膜蛋白在合成过程中N端共有序列，它能引导跨膜和分泌性蛋白的肽链通过内质网膜和到达内质网腔。最终被内质网上的信号肽酶切除，因此成熟的分泌蛋白N端无信号肽 导肽：为线粒体定位信号，富含带正电荷的氨基酸，丝氨酸含量特别高 8、抑制基因突变：第二次点突变抑制了第一次突变造成的表现型，使野生型表现型得以恢复（并非真正的恢复突变） 移码突变：在核苷酸链上插入或删去一个碱基，就会导致其后的密码子的阅读框发生改变的现象 9、基因组：对一般二倍体高等生物，能维持配子或配子体正常功能的最低数目的一套染色体DNA 功能基因组：由表达基因构成的基因组 10、衰减子：在合成代谢基因内部受环境影响，有终止子功能，形成不完整mRNA，降低基因表达的DNA序列 终止子：在一个基因3`端或操纵子3`具有转录终止功能的DNA序列 启动子：操纵子中位于操纵基因一端的核苷酸序列，其中含有以校正遗传起始的一切信号，并决定RNA合成的最大速度 增强子：在真核生物中，增强启动子起动效率的某些序列 绝缘子： 沉默子：在真核生物中，对启动子起动效率起负调控作用的序列 11、溶源途径：噬菌体感染大肠杆菌后，其基因组与细菌染色体整合，成为细菌染色体DNA的一部分，随着细菌染色体的复制而复制，不引起噬菌体的组装和细菌的裂解 溶菌途径：噬菌体DNA从细菌染色体上分离，形成环状，其上操纵子按一定时间顺序表达，利用寄主复制、转录、翻译系统，并利用寄主的营养物质合成自己的酶、外壳蛋白及基因组，组装成噬菌体颗粒，溶破细菌释放出噬菌体颗粒 12、持家基因：在每个细胞都表达的基因，即其功能对每个细胞都需要的基因 分子生物学精华版 2 / 5 奢侈基因：只在特定细胞中表达低丰富蛋白和酶的基因 13、应答元件：诱导型转录因子结合的顺式元件 诱导因子：识别并特异地结合在起始位点上游元件上，其活性受调控，在特定时间、条件或特定的组织中合成或被活化 上游因子：识别并特异地结合在起始位点上游元件上，其活性不受调控，可结合和作用于具有其识别序列的元件上，可提高启动效率 基础因子：与RNApolⅡ结合形成位于起始位点周围的复合体，据顶转录起始位点 上游元件：启动子上游的顺式作用元件 顺式作用元件：是指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的特异DNA序列。包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等 反式作用因子：能与顺式作用元件结合的可扩散蛋白 转录因子：真核RNA聚合酶不能识别DNA上的结合位点，识别这些序列的是调节转录的反式作用因子 基础转录因子：是启动子在起动RNA合成时的必需因子，与RNApol结合形成围绕在起始位点周围的复合物，其结合通用启动子序列，能在任何细胞中转录，而不依赖与组织特异性的调控序列 上游转录因子：识别并特异地结合在上游顺式元件上，其活性不受调控，可作用于具有其识别序列的任何启动子上，可提高启动效率 诱导型转录因子：识别并特异地结合在上游顺式元件上，其活性受调控，在特定时间、条件或特定的组织中合成或被活化 14、RNA编辑：在mRNA水平上发生的碱基取代、插入或缺失 RNA剪切：mRNA前体在核酶的作用下剪去内含子的加工 可变剪切：mRNA按照不同方式剪接，产生两种或多种mRNA的剪切 15、同源异型盒：是DNA上编码一类与发育有关的调控蛋白上与DNA结合的结构域的序列 同源异型域：这一调控蛋白上与DNA结合的结构域 同源异型蛋白： 同源异型基因： 16、cDNA：互补DNA cccDNA： 反义RNA：和mRNA序列互补的小分子，起调节因子作用 17、5`UTR：mRNA上5`端的非编码区，与mRNA和核糖体的识别和结合有关 3`UTR：mRNA上3`端的非编码区，与加polyA尾巴有关，与mRNA的未定性有关 18、λ的抗终止蛋白： 抗终止信号; 19、端粒：真核生物染色体的末端特殊序列，由简单而串联重复的序列组成 端体： 20、单复制子：整个基因组只含有一个复制原点和一个复制终点的复制子 多复制子：基因组含有多个复制原点和多个复制终点的复制子 21、编码：成熟mRNA相邻三个碱基决定一种氨基酸 读码：氨酰tRNA与mRNA三联体密码的相互识别 22、引物酶：即DnaG，负责DNA复制起始阶段RNA引物合成的酶 引发体：由DnaB解旋酶和DnaG引物酶及其它蛋白因子构成的复制体 组成型表达：一个启动子若仅含有为基础因子和上游因子所识别的元件，则此启动子能在任何类型的细胞中进行转录和表达 分子伴侣：细胞中帮助新生肽链正确组装，形成成熟蛋白质，而本身不是最终功能蛋白质分子的组成成分的分子 共翻译易位：正在翻译的核糖体通过信号肽插入内质网上的特殊通道结合于内质网上，并使正在延伸的肽链转移至内质网内，切去信号肽后，蛋白质停留在内质网内，或通过高尔基体转移至溶酶体，或形成分泌小泡分泌出去 锌指结构：一种DNA结合结构域，其中2个His和2个Cys与Zn配位使锌指成环，锌指由7~8个氨基酸联结 融合蛋白： 蓝白斑筛选：某些质粒带有大肠杆菌的半乳糖苷酶基因片段，在半乳糖苷酶基因的基因区外又另外引入了一段含多种单一限制酶位点的DNA序列。这些位点上如果没有克隆外源性DNA片段，在质粒被导入lac-的大肠杆菌后，质粒携带的半乳糖苷酶基因将正常表达，与大肠杆菌的半乳糖苷酶基因互补，产生有活性的半乳糖苷酶，加入人工底物X-gal和诱导剂IPTG后，出现蓝色的菌落。如果在多克隆位点上插入外源DNA片段，将使lac Z基因灭活，不能生成半乳糖苷酶，结果菌落出现白色。由于这种颜色标志，重组克隆和非重组克隆的区分一目了然 同工受体RNA：转运同一种氨基酸携带不同反密码子的tRNA 分子生物学精华版 3 / 5 回文序列： 核骨架： 复制子：具有一个复制起点和一个复制终点并能在细胞中自主复制的单位 同源重组：减数分裂过程中染色体间的物质交换，即DNA分子的断裂和在重组酶作用下的交换连接 位点专一重组：在专一酶的作用下，在DNA特定位点上发生断裂和重接，从而产生精确的DNA重排的DNA重组方式 转座重组：转座子在基因的许多位点反复插入而实现的重组 Holliday结构：两个DNA分子交叉重组时，在连接处形成一个四螺旋作为中间产物 转座子：能够反复插入到基因中许多位点的特殊DNA片段，它们可以从一个位点转移到另一个位点，从一个复制子到另一个复制子 1.简述同位素标记、密度梯度离心技术在分子生物学研究中的应用 ⑴N15-标记研究DNA的半保留复制：把细菌放在含N15H4Cl的培养液中培养若干代，分离出的DNA是含N15的“重”DNA，密度比一般含N14的DNA高。用密度梯度离心法，N15-DNA形成的致密带位于普通N14-DNA所形成的致密带的下方。 把含N15－DNA的细菌放回含普通的NH4Cl培养液中培养。细菌在营养条件充足时，20分钟就可以生长成新一代。提取子一代的DNA再作密度梯度离心分析，发现其致密带介于重带与普通带之间，看不到有单独的重带或普通DNA带。 实验结果说明：子一代DNA双链中有一股是N15

单链，而另一股是N14单链。前者是从亲代接受和保留下来的，后者则是完全新合成的。密度梯度离心实验，

完全支持半保留复制的设想。 含N15-DNA的细菌在普通培养液中继续培育出子二代，其DNA则是中等密度的DNA与普通DNA各占一半这也进一步证明复制是采取半保留式的。实验还可按子3代、子4代……进行下去，N15－DNA则按1／8、1／16…¨的几何级数逐渐被“稀释”掉。 ⑵H3-标记研究DNA的半不连续复制，即连接酶突变核酸序列特点研究等：用H3脉冲标记大肠杆菌培养物，优先标记的是新合成的DNA。新合成的大多数是一些含有1000核苷酸的短片段，若再将菌放到不带H3的培养基中保温，发现H3出现在大片断中了。若用DNA连接酶突变的菌株作以上测试，H3一直出现在小片段中，说明DNA的复制是不连续的。 2.DNA复制中都包括那些酶系统和蛋白因子，这些酶在复制中的各自作用是什么？ （1）解旋酶：DNA复制时，解旋酶在ATP的作用下可促使DNA母链不断解开形成单链； 单链DNA结合蛋白：防止单链DNA形成发卡结构，保持伸展状态，保护单链DNA不被水解； DNA拓扑异构酶I，使DNA磷酸二酯键单链断裂断裂，形成DNA nick，使DNA可以旋转以释放解链时的张力； DNA拓扑异构酶II：使DNA复制完毕后“互锁”的两个子代环状DNA解离； 引物酶：引物酶以单链DNA为模板，利用核糖核苷酸合成RNA作为DNA合成的引物； DNA聚合酶I的功能a. 5’→3’聚合作用，b. 3’→5’外切酶活性（校对作用），c. 5’→3’外切酶活性（切除修复作用）； DNA聚合酶III的功能：主要是合成新的DNA链； DNA聚合酶II的功能：主要与修复有关； DNA连接酶，借助ATP水解提供的能量，催化DNA单链nick的5’-端与3’-端生成磷酸二酯键。 3.简述遗传密码表的特点及其生物学意义 1) 密码的基本单位是三联体密码子，以5′→3′方向、非重叠、无标点的方式编码在核酸分子上。 2) 简并性：同一种氨基酸有两个或更多密码子的现象称为密码子的简并性。编码同一种氨基酸的密码子,称为同义密码子。密码的简并性可以减少有害突变，对维持生物物种的稳定性有重要意义。 3) 摆动性或变偶性：在密码子的三个碱基中，专一性主要取决于头两位碱基，第三个碱基比前两个碱基专一性小，因此，与反密码子（在tRNA上）互补配对时，第三个碱基有较大的灵活性，当第三位碱基发生突变时，仍可翻译出正确的氨基酸。密码的变偶性减少了密码阅读时的误差，增加了翻译的准确性。 4) 通用性：各种低等和高等生物，基本上共用同一套遗传密码。这说明了原核细胞和真核细胞的遗传密码是通用的，它们有共同的起源。 5) 变异性：各种不同生物的遗传密码可能出现一些变异，这是生物进化的根据之一。 6) 连续性：两个密码子之间没有任何核苷酸加以隔开。因此插入或删去一个碱基，就会导致其后的密码子的阅读框改变，造成移码突变。 起始密码子和终止密码子：在64种密码子中， AUG既是编码甲硫氨酸（Met）的密码子，又是肽链合成的起始密码子。有3组密码子（UAA、UAG、UGA）不编码任何氨基酸，而是肽链合成的终止密码子。 4.比较原核生物和真核生物基因组的特点。 原核生物基因组的特点：A.基因组小，一般具有单一的复制起始点；B.单个染色体，一般呈环状；C.染色体DNA不和蛋白质固定地结合 ；D.重复序列少；E. 很