武汉大学分子模拟实验第八章分子轨道计算和分析
武汉大学化学与分子科学学院
《分子模拟实验》实验报告
分子轨道计算和分析
指导老师：侯华
姓名：陆文心
专业：化学弘毅班
学号：2012301040179
日期：2014年10月16日、10月23日（周四下午）
一、实验内容
问题8-1-1仿照CO的例子，作出NO分子的分子轨道和能级图，比较NO和NO+的异同，定性比较NO和NO+的稳定性的相对高低。
1
2
NO 分子轨道图
NO有一个电子处在π*（反键）轨道上，这会降低氮氧键的键级，使得NO键能比NO+小，NO+比NO更稳定。
问题8-1-2用GAMESS程序优化NO和NO+的平衡构型，比较键长和能量的高低，借此验证问题8-1-1的结论。所采用的理论水平为HF/6-31G(d)。
NO优化
------------ GAMESS Interface ------------
GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) ROHF/6-31G(d)
Finish @ energy = -81100.10597 Kcal/Mol (-129.241352 Hartrees)
------------------------------------------
键长1.132A
NO+优化
------------ GAMESS Interface ------------
3
GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) RHF/6-31G(d)
Finish @ energy = -80891.961547 Kcal/Mol (-128.909653 Hartrees)
------------------------------------------
键长1.040A
从键长角度来看，NO+键长比NO短；从能量角度来看，NO能量比NO+低。综合考虑，NO+比NO稳定。
问题8-2-1选择不同的等值面值，作出CO分子的总电子密度图。
等值面值为0.000 a.u.：
等值面值为0.002 a.u.：
4
等值面值为0.015 a.u.：
问题8-3-1作出C2H6，C2H4，C2H2，NH2CH2COOH，天冬酰胺（HOOCCHNH2CH2CONH2）分子的静电势图。
C2H6：（等值面值0.011 a.u.，分辨率30）
5
C2H4：（等值面值0.509 a.u.，分辨率30）
6
C2H2：（等值面值0.808 a.u.，分辨率30）
7
NH2CH2COOH：（等值面值1.258 a.u.，分辨率30）
8
天冬酰胺（HOOCCHNH2CH2CONH2）：（等值面值0.808 a.u.，分辨率30）
9
问题8-4-1作出CO分子的静电势、HOMO轨道和LUMO轨道在总电子密度图上的映射。
CO分子在等电子密度面上静电势
CO分子的HOMO轨道在总电子密度图上的映射
10
CO分子的LUMO轨道在总电子密度图上的映射
问题8-5-1作出丙酸自由基的电子自旋密度图，并分析其电子分布情况。
UHF CALCULATION, NO. OF ALPHA ELECTRONS = 15
NO. OF BETA ELECTRONS = 14
------------ Mopac Interface ------------
11
Mopac Job: PM3 UHF 1SCF ALLVEC CHARGE=0 EF ESR GEO-OK GNORM=0.100 GRAPH MMOK SHIFT=80 SPIN
Spin Density:
C(1) 1.124
C(2) -0.0859
C(3) 0.0457
H(4) -0.0495
H(5) -0.0495
H(6) 0.0102
H(7) 0.0102
O(8) -0.009
O(9) 0.0015
H(10) 0.002406
Atomic Orbital Spin Density:
A. O. Density
-------- -----------
C1 s 0.154560
C1 px 0.168664
C1 py 0.077643
C1 pz 0.723121
C2 s -0.007687
C2 px -0.029087
12
C2 py -0.030196
C2 pz -0.018904
C3 s 0.016246
C3 px 0.005795
C3 py 0.004066
C3 pz 0.019595
H4 s -0.049535
H5 s -0.049537
H6 s 0.010203
H7 s 0.010186
O8 s 0.000020
O8 px -0.003947
O8 py -0.004156
O8 pz -0.000906
O9 s 0.000922
O9 px 0.000794
O9 py 0.000636
O9 pz -0.000902
H10 s 0.002406
Finished @ Heat of Formation = -54.70548 Kcal/Mol
自由基所在的碳原子（1）上的电子云密度最大，（2）号和（3）号碳电子云密度相对来说都较小，故电子没有发生离域。
13
14
问题8-6-1 作出HIV 蛋白酶（HIV-1 protease ，PDB ：1AAQ ）的SA 图，并分析亲水和疏水的部分。
蓝色部分为亲水部位，红色部分为疏水部位。造成该蛋白质亲水或疏水的原因为：亲水部位由亲水的集团——氨基和羧基聚集，而疏水的部位由疏水基团——饱和脂肪烃基聚集。
二、收获与感想
1. 通过本次实验，我学会了使用Chem3D 作出分子轨道图、总电子密度图、静电势图、电子自旋密度图和溶剂面图，并已经熟练掌握了用Origin 作出分子轨道能级图。
2. 使用GAMESS 程序优化分子的平衡构型时，须明白各参数的意义，才能将其设定为最合适的状态，如RHF 和UHF 区别。
3. 初步接触了输出文件，了解大小循环各自代表的意义并能在输出文件中找出来。
4. 当等值面值不同时，总电子密度图会发生改变。当等值面值小时，空间范围越大，表示分子大小和形状；当等值面值大时，空间范围越小，表示化学键信息。
5. 对于静电势图而言，分辨率越高，图像越清晰，但同时计算时间越长。
因此需要正确
处理两者关系，并不是分辨率越高越好。
6. 对于电子自旋密度图，很容易出现原子编号与计算结果不一致的情况，因此如何选择建模方式以及计算结果出来后如何修改原子编号成为关键。
7. 在作溶剂面图时，学会了另一种建模方式——从输入文件建模。
附：H2O的输出文件（有删节）
EXECUTION OF GAMESS BEGUN Thu Oct 23 15:24:35 2014
ECHO响应OF THE FIRST FEW INPUT CARDS -
INPUT CARD>! Minimize (Energy/Geometry) RHF/6-31++G(d)
INPUT CARD> $CONTRL
INPUT CARD>COORD=CART
INPUT CARD>ICHARG=0
INPUT CARD>MAXIT=50 最大循环次数iteration
INPUT CARD>MULT=1 自旋多重度
INPUT CARD>RUNTYP=OPTIMIZE
INPUT CARD>SCFTYP=RHF
INPUT CARD>UNITS=ANGS 单位
INPUT CARD> $END
INPUT CARD> $BASIS
INPUT CARD>DIFFSP=.true.
INPUT CARD>GBASIS=N31
INPUT CARD>NDFUNC=1
INPUT CARD>NGAUSS=6
INPUT CARD>POLAR=POPLE
INPUT CARD> $END
INPUT CARD> $SCF
INPUT CARD>DAMP=.false.
INPUT CARD>DEM=.false.
INPUT CARD>DIIS=.false.
INPUT CARD>DIRSCF=.true.
INPUT CARD>EXTRAP=.true.
INPUT CARD>RSTRCT=.false.
INPUT CARD>SHIFT=.false.
INPUT CARD>SOSCF=.true.
INPUT CARD> $END
INPUT CARD> $STATPT 优化方法
INPUT CARD>METHOD=QA 算法
15
INPUT CARD>NSTEP=50 大循环次数
INPUT CARD>OPTTOL=0.001 阈值tolerance
INPUT CARD> $END
INPUT CARD> $FORCE
INPUT CARD>TEMP=298.15
INPUT CARD> $END
INPUT CARD> $GUESS
INPUT CARD>GUESS=HUCKEL 初始猜测
INPUT CARD> $END
INPUT CARD> $SYSTEM
INPUT CARD>MWORDS=10 内存memory
INPUT CARD> $END
INPUT CARD> $DATA
INPUT CARD>Untitled-1
INPUT CARD>C1
INPUT CARD>O1 8.0 -0.7006 -0.7277 -0.3759 INPUT CARD>H2 1.0 0.2414 -0.7277 -0.3759 INPUT CARD>H3 1.0 -0.9237 -0.7277 -1.2911 INPUT CARD> $END
..... DONE SETTING UP THE RUN .....
10000000 WORDS OF MEMORY AVAILABLE
BASIS OPTIONS
-------------
GBASIS=N31 IGAUSS= 6 POLAR=POPLE
NDFUNC= 1 NFFUNC= 0 DIFFSP= T
NPFUNC= 0 DIFFS= F
RUN TITLE
---------
Untitled-1
THE POINT GROUP OF THE MOLECULE IS C1
THE ORDER OF THE PRINCIPAL AXIS IS 0
THE MOMENTS OF INERTIA ARE (AMU-ANGSTROM**2)
IXX= 0.606 IYY= 1.106 IZZ= 1.712
ATOM ATOMIC COORDINATES (BOHR)
CHARGE X Y Z O1 8.0 0.0000001026 -0.1230641458 0.0000000000 H2 1.0 1.3998796553 0.9765590384 0.0000000000
16
H3 1.0 -1.3998812842 0.9765577589 0.0000000000
INTERNUCLEAR DISTANCES (ANGS.)原子间距离
------------------------------
O1 H2 H3
1 O1 0.0000000 0.9420000 * 0.9420003 *
2 H2 0.9420000 * 0.0000000 1.4815698 *
3 H3 0.9420003 * 1.4815698 * 0.0000000
* ... LESS THAN 3.000
ATOMIC BASIS SET基组
----------------
THE CONTRACTED PRIMITIVE FUNCTIONS HAVE BEEN UNNORMALIZED
THE CONTRACTED BASIS FUNCTIONS ARE NOW NORMALIZED TO UNITY SHELL TYPE PRIMITIVE EXPONENT CONTRACTION COEFFICIENTS O1
1 S 1 5484.6716600 0.001831074430
1 S
2 825.2349460 0.013950172200
1 S 3 188.0469580 0.068445078098
1 S 4 52.9645000 0.232714335992
1 S 5 16.8975704 0.470192897984
1 S 6 5.7996353 0.358520852987
2 L 7 15.5396162 -0.110777549525 0.070874268231 2 L 8 3.5999336 -0.148026262701 0.339752839147 2 L 9 1.0137618 1.130767015354 0.727158577316
3 L 10 0.2700058 1.000000000000 1.000000000000
4 L 11 0.0845000 1.000000000000 1.000000000000
5 D 12 0.8000000 1.000000000000
H2
6 S 13 18.7311370 0.033494604338
6 S 14 2.8253944 0.234726953484
17
6 S 15 0.640121
7 0.813757326146
7 S 16 0.1612778 1.000000000000
H3
8 S 17 18.7311370 0.033494604338
8 S 18 2.8253944 0.234726953484
8 S 19 0.6401217 0.813757326146
9 S 20 0.1612778 1.000000000000
TOTAL NUMBER OF BASIS SET SHELLS = 9 NUMBER OF CARTESIAN GAUSSIAN BASIS FUNCTIONS = 23 NUMBER OF ELECTRONS = 10 CHARGE OF MOLECULE = 0
SPIN MULTIPLICITY = 1
NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (ALPHA) = 5 NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (BETA ) = 5
TOTAL NUMBER OF ATOMS = 3
THE NUCLEAR REPULSION ENERGY IS 9.3453203132
-------------------------------
INTEGRAL TRANSFORMATION OPTIONS
-------------------------------
NWORD = 0 CUTOFF = 1.0E-09
MPTRAN = 0 DIRTRF = T
AOINTS =DUP
----------------------
INTEGRAL INPUT OPTIONS
----------------------
NOPK = 1 NORDER= 0 SCHWRZ= T
------------------------------------------
THE POINT GROUP点群IS C1 , NAXIS= 0, ORDER= 1
------------------------------------------
DIMENSIONS OF THE SYMMETRY SUBSPACES ARE
A = 23
..... DONE SETTING UP THE RUN .....
STEP CPU TIME = 0.00 TOTAL CPU TIME = 0.0 ( 0.0 MIN)
18
TOTAL WALL CLOCK TIME= 0.0 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 100.00%
********************
1 ELECTRON INTEGRALS单电子积分
********************
...... END OF ONE-ELECTRON INTEGRALS ......
STEP CPU TIME = 0.00 TOTAL CPU TIME = 0.0 ( 0.0 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME= 0.0 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 100.00%
-------------
GUESS OPTIONS
-------------
GUESS =HUCKEL NORB = 0 NORDER= 0
MIX = F PRTMO = F PUNMO = F
TOLZ = 1.0E-08 TOLE = 1.0E-05
SYMDEN= F PURIFY= F
INITIAL GUESS ORBITALS GENERATED BY HUCKEL ROUTINE.
HUCKEL GUESS REQUIRES 6265 WORDS.
SYMMETRIES FOR INITIAL GUESS ORBITALS FOLLOW. BOTH SET(S).
5 ORBITALS ARE OCCUPIED ( 1 CORE ORBITALS).
2=A 3=A 4=A 5=A 6=A 7=A 8=A
9=A 10=A 11=A 12=A 13=A 14=A 15=A ...... END OF INITIAL ORBITAL SELECTION ......
STEP CPU TIME = 0.00 TOTAL CPU TIME = 0.0 ( 0.0 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME= 0.0 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 100.00%
--------------------
2 ELECTRON INTEGRALS双电子积分
--------------------
DIRECT SCF METHOD SKIPS INTEGRAL STORAGE ON DISK.
DIRECT TRANSFORMATION SKIPS AO INTEGRAL STORAGE ON DISK.
...... END OF TWO-ELECTRON INTEGRALS .....
STEP CPU TIME = 0.02 TOTAL CPU TIME = 0.0 ( 0.0 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME= 0.0 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 100.00%
--------------------------
RHF SCF CALCULATION SCF循环
--------------------------
NUCLEAR ENERGY = 9.3453203132
19
MAXIT = 50 NPUNCH= 2
EXTRAP=T DAMP=F SHIFT=F RSTRCT=F DIIS=F DEM=F SOSCF=T
DENSITY MATRIX CONV= 2.00E-05
SOSCF WILL OPTIMIZE 90 ORBITAL ROTATIONS, SOGTOL= 0.250
MEMORY REQUIRED FOR RHF STEP= 20171 WORDS.
DIRECT SCF CALCULATION, SCHWRZ=T FDIFF=T
SCHWARZ INEQUALITY OVERHEAD: 276 INTEGRALS, T= 0.00
NONZERO BLOCKS ITER EX DEM TOTAL ENERGY E CHANGE DENSITY CHANGE ORB. GRAD INTEGRALS SKIPPED
1 0 0 -75.756584590 -75.756584590 0.157480209 0.000000000 14604 0
---------------START SECOND ORDER SCF---------------
2 1 0 -76.001987969 -0.245403379 0.05251384
3 0.037916239 1460
4 0
3 2 0 -76.015800471 -0.013812502 0.029766053 0.013342097 1460
4 0
4 3 0 -76.017306601 -0.001506130 0.007684262 0.005173788 14604 0
5 4 0 -76.01740490
6 -0.000098305 0.001797921 0.001582001 14604 0
6 5 0 -76.017417314 -0.000012408 0.000858476 0.000386450 14604 0
7 6 0 -76.017418127 -0.000000813 0.000104016 0.000049025 14604 0
8 7 0 -76.017418142 -0.000000016 0.000022152 0.000006757 14604 0
9 8 0 -76.017418143 0.000000000 0.000007815 0.000001419 14604 0
10 9 0 -76.017418143 0.000000000 0.000000572 0.000000300 14604 0
-----------------
DENSITY CONVERGED
-----------------
TIME TO FORM FOCK OPERATORS= 0.0 SECONDS ( 0.0 SEC/ITER)
FOCK TIME ON FIRST ITERATION= 0.0, LAST ITERATION= 0.0
TIME TO SOLVE SCF EQUATIONS= 0.0 SECONDS ( 0.0 SEC/ITER)
FINAL RHF ENERGY IS -76.0174181427 AFTER 10 ITERATIONS
------------
EIGENVECTORS分子轨道的组成
------------
1 2 3 4 5
-20.5783 -1.3661 -0.7293 -0.5894 -0.5107
A A A A A
1 O 1 S 0.994561 -0.209074 0.000000 0.071175 0.000000
2 O 1 S 0.021039 0.478534 0.000000 -0.174649 0.000000
3 O 1 X 0.000000 0.000000 0.515800 0.000000 0.000000
4 O 1 Y 0.001399 0.098340 0.000000 0.560137 0.000000
20
武汉大学分子生物学真题2001-2014
一.解释概念(20分,每个4分) 卫星DNA 复制体逆转座子反式激活因子衰减子与衰减作用 三、问答题(50分) 1. 说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。(15分) 2. 简述增强子的特点和性质及作用机制。(10分) 3. 简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始(15分) 4. DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶,它是在大肠杆菌 (E.coli)R株中发现的,它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一,它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DN**段克隆到pUC质粒中,并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增,已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶,你设计如何做才能确保成功?为什么?(10分) 武汉大学2002分子生物学 三.问答: 1.简述(或绘图说明)真核细胞RNA聚合酶II转录的起始需要哪些基本转录因子及其装配过程(15分) 2.简述(或绘图说明)色氨酸操纵子弱化的机制(15分) 3.在讨论基因家庭时经常提到胚胎、胎儿和成体形成的蛋白质,这些述语是指什么现象?可用什么术语来描述这一类基因家族(5分) 4. 你正在进行Southern blot分析,并刚刚完成凝胶电泳部分,下一步是将胶浸泡在NaOH溶液中使DNA变性为单链,为了节约时间,你跳过这一步,直接把DNA 从胶上转到硝酸纤维素膜上,你将标记好的探针与膜杂交,却发现放射自显影结果是一片空白,哪里错了呢?(5分)
一、下列名词翻译成中文，并简要解释 1、Domains and motifs 2、Alternative splicing 3、Reporter genes 4、The PCR cycle 5、Restriction mapping 6、Multiple cloning sites 7、DNA libraries 8、Proteomics 9、Replicon 10、Semi-conservative replication 二、简答题(共5题,每题8分,共40分) 1、请列举三种以上蛋白质纯化技术,并说明不同纯化技术的简单原理。 2、简述DNA损伤与DNA突变之间的区别与相互关系。 3、简述密码的简并性(degeneracy)和同义密码子(synonymous codon)及其在生物学上的重要性。 4、简述原核生物转录起始与转录终止过程中所涉及的主要蛋白质和核酸结构及其具体作用。 5、简述cDNA文库的构建过程。 三、论述题(共5题,1-4题每题15分,第5题10分,共70分) 1、人类基因组计划完成的社会意义和科学意义是什么？ 2、什么是操纵子(operon)？试说明色氨酸操纵子(Trp operon)在原核基因表达调控中的调控机制和重要作用。 3、请简要解释顺式作用元件与反式作用因子,并举二例加以说明它们的相互作用方式。 4、试说明真核细胞与原核细胞在基因转录、翻译及DNA的空间结构方面存在的主要差异,表现在哪些方面？ 5、限制性核酸内切酶有哪几种类型？哪一种类型的限制酶最适合于基因工程,为什么？请简要说明其理由。
2001到2011年武汉大学分子生物学和细胞生物学真题大全
武汉大学 2001年攻读硕士学位研究生入学考试试题 科目名称:分子生物学 科目代码: 477 一、解释概念(20分,每个4分) 卫星DNA 复制体逆转座子反式激活因子衰减子与衰减作用 二、填空(30分,每空1分,请将答案写在答卷上) 1. 从病毒到高等生物的研究表明,遗传物质是。 2. 冈崎片段的发现证实了双链DNA的复制,在复制过程中,一条新生链的合成 是的,称为链;而另一条链的合成是的,称为链。 3. 大肠菌中有三种DNA聚合酶,其中的pol I的作用是,而pol III的作用是。pol I和pol III都有的三种活性是、、。 4. 由于真核细胞染色体DNA的复制要有一段RNA为引物,因此线状的DNA复制后必须存在着5’端缩短的问题。已发现有一种端粒蛋白称为,它由构成,可以使单链DNA的5’延长。 5. 对DNA损伤有几种修复系统,其中只有修复系统可以造成DNA变异,与这一系统有关的一套基因平时受到一称为的抑制蛋白所抑制,它发挥抑制作用是结合在一段约20bp 长的称为的DNA序列上,当DNA损伤时,另一种蛋白质称为把这种抑制蛋白水解后,修复系统的基因才会被激活。 6. 真核细胞中有三种依赖于DNA的RNA聚合酶分别合成不同的RNA,RNA pol I负责合成,RNA pol II负责合成,RNA pol III负责合成。 7. 大分子互相作用是分子生物学的重要内容,包括蛋白质之间、蛋白质与DNA或RNA之间的互相作用,蛋白质有四种重要的结构花式与大分子互相作用有关,这些结构花式是, , 。 8. NO是气体小分子信号,它可由脱氨产生,它的作用方式是直接与酶作用使产生cGMP(环式GMP)。 9. 真核mRNA的5’端通常有帽子结构,3’端有polyA。在polyA上游有一保守序列称为polyA信号,其序列为。polyA能提高mRNA的翻译水平是由于: (1) (2) 。 10. G-蛋白关联受体是一类重要的细胞表面受体,它的结构特色是,它发挥信号传递作用的两条途径是途径和途径。 三、问答题(50分) 1. 说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。(15分) 2. 简述增强子的特点和性质及作用机制。(10分) 3. 简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始(15分) 4. DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶,它是在大肠杆菌(E.coli)R株中发现的,它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一,它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DN**段克隆到pUC质粒中,并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增,已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶,你设计如何做才能确保成功?为什么?(10分) 武汉大学
分子光谱模拟
0.012 0.010 0.008 0.006 0.004 0.002 0.000 k (L o r e n t z ) 分子光谱模拟 姓名： 学号： 专业： 日期：151207&151214 一.实验内容 1.红外光谱模拟 1.1 用PM3理论方法计算H2O 分子红外光谱 图1-1 GAMESS 程序中PM3方法预测的H2O 分子的红外光谱 用0.974来标定计算的频率，然后做出红外光谱图
得到的振动频率分别为1698 cm-1、3770 cm-1、3880 cm-1 与标准值1594cm-1，3657cm-1，3756cm-1比较三个频率都偏大。说明半经验方法计算的红外光谱可靠性不高，若采用高水平计算方法，理论计算一实验值会符合很好，但同时会提高对计算机资源的要求。 2.拉曼光谱光谱模拟 2.1用HF/6-31G(d)计算的CH4分子的拉曼谱图 图2-1 HF/6-31G(d)计算的CH4分子的拉曼谱图 3.紫外可见光谱的模拟 3.1计算甲酸分子5个垂直激发的单重态和三重态，2个绝热激发的单重态和三重态，并确定垂直激发和绝热激发波长。 3.1.1 甲酸分子5个单重态垂直激发能(HF/6-31G(d)) ①利用GAMESS程序HF/6-31G（d）理论水平优化基态 Total Energy =-118450.0392 Kcal/Mol ②手动修改输入方式，其中NSTATE=5 甲酸分子（HCOOH）分子的5个单重态的垂直激发能
λ=1/△E(cm)=10^7/△E(nm) 经过换算，5个单重态的垂直激发波长分别为179nm、120nm、111nm、109nm、100nm均位于紫外区内。 3.1.2 甲酸分子5个三重态垂直激发能(HF/6-31G(d)) ①利用GAMESS程序HF/6-31G（d）理论水平优化基态 Total Energy =-118450.039 Kcal/Mol ②手动修改输入方式，其中NSTATE=5 MULT=3 甲酸分子（HCOOH）分子的5个单重态的垂直激发能 经过换算，5个三重态的垂直激发波长分别为198nm、195nm、122nm、116nm、109nm均位于紫外区内。 HF/6-31G(d)实验下HCOOH分子垂直激发波长表（单位：nm） 3.1.3甲酸分子2个单/三重态绝热激发能(HF/6-31G(d))
武汉大学分析化学(第五版)下册答案
仪器分析部分作业题参考答案 第一章 绪论 1-2 1、主要区别：（1）化学分析是利用物质的化学性质进行分析；仪器分析是利用物质的物理或物理化学性质进行分析；（2）化学分析不需要特殊的仪器设备；仪器分析需要特殊的仪器设备；（3）化学分析只能用于组分的定量或定性分析；仪器分析还能用于组分的结构分析；（3）化学分析灵敏度低、选择性差，但测量准确度高，适合于常量组分分析；仪器分析灵敏度高、选择性好，但测量准确度稍差，适合于微量、痕量及超痕量组分的分析。 2、共同点：都是进行组分测量的手段，是分析化学的组成部分。 1-5 分析仪器与仪器分析的区别：分析仪器是实现仪器分析的一种技术设备，是一种装置；仪器分析是利用仪器设备进行组分分析的一种技术手段。 分析仪器与仪器分析的联系：仪器分析需要分析仪器才能达到量测的目的，分析仪器是仪器分析的工具。仪器分析与分析仪器的发展相互促进。 1-7 因为仪器分析直接测量的是物质的各种物理信号而不是其浓度或质量数，而信号与浓度或质量数之间只有在一定的范围内才某种确定的关系，且这种关系还受仪器、方法及样品基体等的影响。因此要进行组分的定量分析，并消除仪器、方法及样品基体等对测量的影响，必须首先建立特定测量条件下信号与浓度或质量数之间的关系，即进行定量分析校正。 第二章光谱分析法导论 2-1 光谱仪的一般组成包括：光源、单色器、样品引入系统、检测器、信号处理与输出装置。各部件的主要作用为： 光源：提供能量使待测组分产生吸收包括激发到高能态； 单色器：将复合光分解为单色光并采集特定波长的光入射样品或检测器；样品引入系统：将样品以合适的方式引入光路中并可以充当样品容器的作用；检测器：将光信号转化为可量化输出的信号 信号处理与输出装置：对信号进行放大、转化、数学处理、滤除噪音，然后以合适的方 式输出。 2-2： 单色器的组成包括：入射狭缝、透镜、单色元件、聚焦透镜、出射狭缝。各部件的主要作用为： 入射狭缝：采集来自光源或样品池的复合光；透镜：将入射狭缝采集的复合光分解为平行光；单色元件：将复合光色散为单色光（即将光按波长排列） 聚焦透镜：将单色元件色散后的具有相同波长的光在单色器的出口曲面上成像；出射狭缝：采集色散后具有特定波长的光入射样品或检测器 2-3 棱镜的分光原理是光的折射。由于不同波长的光在相同介质中有不同的折射率，据此能把不同波长的光分开。光栅的分光原理是光的衍射与干涉的总效果。不同波长的光通过光栅衍射后有不同的衍射角，据此把不同波长的光分开。 2-6
武汉大学计算机学院 嵌入式实验报告
武汉大学计算机学院 课程实验(设计)报告 课程名称：嵌入式实验 专业、班： 08级 姓名： 学号： 学期：2010-2011第1学期 成绩（教师填写） 实 一二三四五六七八九总评验 分数 分数 (百分制)
实验一80C51单片机P1口演示实验 实验目的： (1)掌握P1口作为I/O口时的使用方法。 (2)理解读引脚和读锁存器的区别。 实验内容： 用P1.3脚的状态来控制P1.2的LED亮灭。 实验设备： （1）超想-3000TB综合实验仪 1 台 （2）超想3000仿真器 1 台 （3）连线若干根 （4）计算机1台 实验步骤： (1)编写程序实现当P1.3为低电平时，发光管亮；P1.3为高电平时，发光管灭。 (2)修改程序在执行读P1.3之前，先执行CLR P1.3，观察结果是否正确，分析在第二种情况下程序为什 么不能正确执行，理解读引脚和读锁存器区别。 实验结果： (1)当P1.3为低电平时，发光管亮；P1.3为高电平时，发光管灭。 (2)不正确。因为先执行CLR P1.3之后，当读P1.3的时候它的值就一直是0，所以发光管会一直亮而不 会灭。单片机在执行从端口的单个位输入数据的指令（例如MOV C，P1.0）时，它需要读取引脚上的数据。此时，端口锁存器必须置为‘1’，否则，输出场效应管导通，回拉低引脚上的高输出电平。 系统复位时，会把所有锁存器置‘1’，然后可以直接使用端口引脚作为输入而无需再明确设置端口锁存器。但是，如果端口锁存器被清零（如CLR P1.0），就不能再把该端口直接作为输入口使用，除非先把对应的锁存器置为‘1’（如 SETB P1.0）。 (3)而在引脚负载很大的情况（如驱动晶体管）下，在执行“读——改——写”一类的指令（如CPL P1.0） 时，需要从锁存器中读取数据，以免错误地判断引脚电平。 实验二 80C51单片机RAM存储器扩展实验 实验目的： 学习RAM6264的扩展 实验内容： 往RAM中写入一串数据，然后读出，进行比较 实验设备： （1）超想-3000TB综合实验仪 1 台 （2）超想3000仿真器 1 台
武汉大学《分子生物学》复习题库及答案
考试复习重点资料（最新版） 资料见第二页 封 面 第1页
分子生物复习题及答案 一、填空题 1．病毒ΦX174及M13的遗传物质都是单链DNA。 2．AIDS病毒的遗传物质是单链RNA。 3．X射线分析证明一个完整的DNA螺旋延伸长度为3.4nm。 4．氢键负责维持A-T间（或G-C间）的亲和力 5．天然存在的DNA分子形式为右手B型螺旋。 二、选择题（单选或多选） 1．证明DNA是遗传物质的两个关键性实验是：肺炎球菌在老鼠体内的毒性和T2噬菌体感染大肠杆菌。这两个实验中主要的论点证据是（C）。 A．从被感染的生物体内重新分离得到DNA作为疾病的致病剂 B．DNA突变导致毒性丧失 C．生物体吸收的外源DNA（而并非蛋白质）改变了其遗传潜能 D．DNA是不能在生物体间转移的，因此它一定是一种非常保守的分子E．真核心生物、原核生物、病毒的DNA能相互混合并彼此替代 2．1953年Watson和Crick提出（A）。
A．多核苷酸DNA链通过氢键连接成一个双螺旋 B．DNA的复制是半保留的，常常形成亲本-子代双螺旋杂合链 C．三个连续的核苷酸代表一个遗传密码 D．遗传物质通常是DNA而非RNA E．分离到回复突变体证明这一突变并非是一个缺失突变 3．DNA双螺旋的解链或变性打断了互补碱基间的氢键，并因此改变了它们的光吸收特性。以下哪些是对DNA的解链温度的正确描述？（C、D）A．哺乳动物DNA约为45℃，因此发烧时体温高于42℃是十分危险的B．依赖于A-T含量，因为A-T含量越高则双链分开所需要的能量越少 C．是双链DNA中两条单链分开过程中温度变化范围的中间值 D．可通过碱基在260nm的特征吸收峰的改变来确定 E．就是单链发生断裂（磷酸二酯键断裂）时的温度 4．DNA的变性（A、C、E）。 A．包括双螺旋的解链B．可以由低温产生 C．是可逆的D．是磷酸二酯键的断裂 E．包括氢键的断裂
分析化学课后答案武汉大学第五版上册完整版
第1章 分析化学概论 1. 称取纯金属锌，溶于HCl 后，定量转移并稀释到250mL 容量瓶中，定容，摇匀。计算 Zn 2+溶液的浓度。 解：213 0.325065.39 0.0198825010 Zn c mol L +--= =?g 2. 有L 的H 2SO 4溶液480mL,现欲使其浓度增至L 。问应加入L H 2SO 4的溶液多少毫升 解：112212()c V c V c V V +=+ 220.0982/0.4800.5000/0.1000/(0.480)mol L L mol L V mol L L V ?+?=?+ 2 2.16V mL = 4．要求在滴定时消耗LNaOH 溶液25~30mL 。问应称取基准试剂邻苯二甲酸氢钾(KHC 8H 4O 4)多少克如果改用 22422H C O H O ?做基准物质，又应称取多少克 解： 844:1:1NaOH KHC H O n n = 1110.2/0.025204.22/ 1.0m n M cV M mol L L g mol g ===??= 2220.2/0.030204.22/ 1.2m n M cV M mol L L g mol g ===??= 应称取邻苯二甲酸氢钾~ 22422:2:1 NaOH H C O H O n n ?= 1111 2 1 0.2/0.025126.07/0.32m n M cV M mol L L g mol g == =???=
2221 2 1 0.2/0.030126.07/0.42m n M cV M mol L L g mol g ===???=应称取22422H C O H O ?~ 6．含S 有机试样，在氧气中燃烧，使S 氧化为SO 2，用预中和过的H 2O 2将SO 2吸收，全部转化为H 2SO 4，以LKOH 标准溶液滴定至化学计量点，消耗。求试样中S 的质量分数。 解： 2242S SO H SO KOH ::: 100%1 0.108/0.028232.066/2100% 0.47110.3%nM w m mol L L g mol g = ????=?= 8．不纯CaCO 3试样中不含干扰测定的组分。加入溶解，煮沸除去CO 2，用LNaOH 溶液反滴定过量酸，消耗，计算试样中CaCO 3的质量分数。 解： 32CaCO HCl : NaOH HCl : 00 1 ()2100%100% 1 (0.2600/0.0250.2450/0.0065)100.09/2100% 0.250098.24%cV cV M nM w m m mol L L mol L L g mol g -=?=??-??=?= 9 今含有 MgSO 4·7H 2O 纯试剂一瓶，设不含其他杂质，但 有部分失水变为MgSO 4·6H 2O ，测定其中Mg 含量后，全部按MgSO 4·7H 2O 计算，得质量分数为%。试计算试剂中MgSO 4·6H 2O
武汉大学计算机网络实验报告 (2)
武汉大学教学实验报告 动力与机械学院能源动力系统及自动化专业2013 年11 月10 日
一、实验操作过程 1.在仿真软件packet tracer上按照实验的要求选择无线路由器，一般路由器和PC机构建一个无线局域网，局域网的网络拓扑图如下： 2.按照实验指导书上的表9.1（参数配置表）对路由器，ＤＮＳ服务器，ＷＷＷ服务器和ＰＣ机进行相关参数的配置： 服务器配置信息（子网掩码均为255.255.255.0） 主机名IP地址默认网关 DNS 202.2.2.1 202.2.2.2 WWW 202.3.3.1 202.3.3.3 路由器配置信息（子网掩码均为255.255.255.0） 主机名型号IP地址默认网关时钟频率ISP 2620XM e1/0:202.2.2.2 e1/1:202.3.3.3 s0/0:202.1.1.2 64000 Router2(Server) 2620XM f0/0:192.168.1.1 s0/0:202.1.1.1 Wireless Router Linksys WRT300N 192.168.1.2 192.168.1.1 202.2.2.1 备注：PC机的IP地址将通过无线路由器的设置自动分配 2.1 对router0（sever）断的配置： 将下列程序代码输到router0中的IOS命令行中并执行，对router0路由器进行设置。Router>en Router#conf t
2.3 WWW服务器的相关配置 对www服务器进行与DNS服务器相似的配置，包括它的IP地址，子网掩码，网关等，具体的相关配置图见下图： WWW服务器的相关配置图
武汉大学分子生物学试卷
2002年 三、问答： 1、简述（或绘图说明）真核细胞RNA聚合酶II转录的起始需要哪些基本转录因子及其装配过程（15分） 2、简述（或绘图说明）色氨酸操纵子弱化的机制（15分） 3、在讨论基因家庭时经常提到胚胎、胎儿和成体形成的蛋白质，这些述语是指什么现象？可用什么术语来描述这一类基因家族（5分） 4、你正在进行Southern blot分析，并刚刚完成凝胶电泳部分，下一步是将胶浸泡在NaOH溶液中使DNA变性为单链，为了节约时间，你跳过这一步，直接把DNA从胶上转到硝酸纤维素膜上，你将标记好的探针与膜杂交，却发现放射自显影结果是一片空白，哪里错了呢？（5分） 2001年 三、问答题（50分） 1．说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。（15分） 2．简述增强子的特点和性质及作用机制。（10分） 3．简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始（15分） 4． DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶，它是在大肠杆菌（E.coli）R株中发现的，它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一，它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DNA片段克隆到pUC质粒中，并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增，已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶，你设计如何做才能确保成功？为什么？（10分）
2003年分子生物学 一。下列名词翻译成中文，并简要解释4*10 1.Domains and motifs 2. Alternative splicing 3.Reporter genes 4. The PCR cycle 5.Restriction mapping 6.Multiple cloning sites 7.DNA libraries 8.Proteomics 9.Replicon 10. semi-conservative replication 二。简答题8*5 总计40分 1. 请列举三种以上的蛋白质纯化技术，并说明不同技术的简单原理。 2. 说说DNA损伤与DNA突变之间的区别和相互关系。 3. 简述密码的简并性（degeneracy）和同义密码子（synonymous codon）及其在生物上的重要性。 4. 简述原核生物转录起始与转录终止过程中涉及到的主要蛋白质和核酸结构及其具体作用。 5. 简述cDNA文库的构建过程。 三。问答题（1-4每题15，5题10，总计70） 1. 人类基因组计划完成的社会意义和科学意义是什么？ 2. 什么是操纵子（operon）?试说明色氨酸操纵子（Trp operon）在原核基因表达调控中的调控机制和重要作用。 3. 简要解释顺式作用元件与反式作用因子，并举二例说明他们的相互作用方式。 4. 试说明真核细胞与原核细胞在基因转录，翻译及DNA的空间结构方面存在的主要差异，表现在哪些方面？ 5. 限制性核酸内切酶有哪几种类型？哪一种类型的限制酶最适合于基因工程，为什么？请简要说明理由。 2004年武汉大学硕士研究生入学考试分子生物学试卷 一名词翻译与解释 1synonymous codons 2RNA editing 3Spliceosome 4Microarray 5Plaque hybridization 6Open reading frame 7Ribozyme 8RFLP
武汉大学—分析化学实验考试题目
《分析化学实验》试卷（A） 一、填空（31分，每空1分） 1 移液管、吸量管和容量瓶都是有的精确玻璃量器，均不宜放在烘箱中烘烤。 2 滴定管读数时，滴定管应保持，以液面呈处与为准，眼睛视线与在同一水平线上。 3 减重称量法常用称量瓶，使用前将称量瓶，称量时不可用手直接拿称量瓶，而要用套住瓶身中部进行操作，这样可避免手汗和体温的影响。 4 标定NaOH溶液时，常用和等作基准物质进行直接标定。 5 标定HCl溶液时，常用和等作基准物质进行直接标定。 6 使用分光光度计，拿比色皿时，用手捏住比色皿的，切勿触及，以免透光面被沾污或磨损。 7 配位滴定法中常用的氨羧配位剂是简称 8 以Zn等基准物质对EDTA进行标定时，如果以EBT为指示剂（EDTA为滴定剂）滴定是在pH约为的条件下，终点时，溶液由色变为色。XO指示剂只适用于（EDTA为滴定剂）pH约为的条件下，终点时，溶液由色变为色。如果以PAN为指示剂（EDTA为滴定剂）滴定是在pH约为的条件下，终点时，溶液由色变为色。 8． 1+1 的H2SO4溶液浓度为 mol/L； 1+1 的HCl溶液浓度为 mol/L。1+1 的NH3溶液浓度为 _mol/L。冰醋酸的浓度为 mol/L。 9.如果基准物未烘干，将使标准溶液浓度的标定结果 10. A （纵坐标）～λ（横坐标）作图为曲线，
A （纵坐标）～ C （横坐标）作图为。 二、简答（69分） 1 用减量法称取试样时，如果称量瓶内的试样吸湿，对称量结果会有什么影响影响？如果试样倒入烧杯（或其他承接容器）后再吸湿，对称量结果会有什么影响？（6分） 2 举例说明什么是络合滴定中的“置换滴定法”。（15分） 3 标定Na2S2O3时淀粉指示剂为什么应在近终点时加入？（6分） 4 .配制酸碱标准溶液时，为什么用量筒量取HCl，用台秤称取NaOH（S）、而不用吸量管和分析天平？（6分） 5.标准溶液装入滴定管之前，为什么要用该溶液润洗滴定管2～3次？而锥形瓶是否也需用该溶液润洗或烘干，为什么？（6分） 6 滴定至临近终点时加入半滴的操作是怎样进行的？（5分） 7如何测定含有Ca2+、Mg2+的混合溶液中的Ca2+、Mg2+分量？（25分）（写出原理、操作步骤、所用仪器、试剂） （lgK’MgY =8.70 ， lgK’CaY =10.69） 《分析化学实验》试卷（B） 一、填空（20分，每空1分） 1．标定NaOH溶液的邻苯二甲酸氢钾中含有邻苯二甲酸，对测定结果的影响是；标定HCl溶液的浓度时，可用Na2CO3或硼砂（Na2B4O7·10H2O）为基准物质，若Na2CO3吸水，则标定结果；若硼砂结晶水部分失去，则标定结果。 2．邻二氮菲吸光光度法测定蜂蜜中微量铁实验中，盐酸羟胺作； 醋酸钠的作用是；制作吸收光谱的目的是。将含铁试样稀释时，其最大吸收峰的波长； 3．欲配制 1000ml 0.1mol/L HCl 溶液，应取浓盐酸ml；欲配制（1+1）H2SO4应将。
武汉大学电力系统分析实验报告
电气工程学院 《电力系统分析综合实验》2017年度PSASP实验报告 学号： 姓名： 班级：
实验目的： 通过电力系统分析的课程学习，我们都对简单电力系统的正常和故障运行状态有了大致的了解。但电力系统结构较为复杂，对电力系统极性分析计算量大，如果手工计算，将花费 大量的时间和精力，且容易发生错误。而通过使用电力系统分析程序PSASP，我们能对电 力系统潮流以及故障状态进行快速、准确的分析和计算。在实验过程中，我们能够加深对电力系统分析的了解，并学会了如何使用计算机软件等工具进行电力系统分析计算，这对我们以后的学习和工作都是有帮助的。 潮流计算部分： 本次实验潮流计算部分包括使用牛顿法对常规运行方式下的潮流进行计算，以及应用PQ分解法规划运行方式下的潮流计算。在规划潮流运行方式下，增加STNC-230母线负荷的有功至1.5.p.u，无功保持不变，计算潮流。潮流计算中，需要添加母线并输入所有母线 的数据，然后再添加发电机、负荷、交流线、变压器、支路，输入这些元件的数据。对运行方案和潮流计算作业进行定义，就可以定义的潮流计算作业进行潮流计算。 因为软件存在安装存在问题，无法使用图形支持模式，故只能使用文本支持模式，所以 无法使用PSASP绘制网络拓扑结构图，实验报告中的网络拓扑结构图均使用Visio绘制， 请见谅。 常规潮流计算： 下图是常规模式下的网络拓扑结构图，并在各节点标注电压大小以及相位。 下图为利用复数功率形式表示的各支路功率（参考方向选择数据表格中各支路的i侧母
线至j侧），因为无法使用图形支持模式，故只能通过文本支持环境计算出个交流线功率，下图为计算结果。
武汉大学考研分子生物学名词
分子生物学名词解释 1、gel electrophoresis(凝胶电泳) 2、restriction endonuclease(限制性内切酶) 3、hybridization(杂交) 4、probe（探针） 5、Autoradiogram（放射自显影） 6、DNA cloning 7、DNA ligase（DNA连接酶） 10、transformants（转化子） 11、copy DNA（cDNA） 12、DNA library 13、colony hybridization（菌落杂交） 14、oligonucleotide（寡聚核苷酸） 15、site-directed mutagenesis（定位突变） 16、shotgun sequencing（鸟枪法测序） 17、contig（叠连群） 18、annotation（注释） 19、transcriptome（转录组） 20、BLAST（基本局部比对搜索工具） （11.7.2015） 21、tandem mass spectrometry（MS-串联质谱） 22、interactome（互作组） 23、DNA foot printing（DNA足迹） 24、insulator（绝缘子） 25、homeodomain（同源结构域） 26、mediator（中介蛋白） 27、bromodomain（同源调节域） 28、chromodomain（染色质结构域） 29、locus control region-LCR（位点控制区域） 30、heterochromatin（异染色质） （11.10.2015） 31、euchromatin（常染色质） 32、epigenetic regulation（表观遗传调控） 33、constitutive expression（组成型表达） 34、operator（操作子） 35、operon（操纵子） 36、CTD（c端结构域） 37、lysogenically（溶源生长） 38、lytically（裂解） 39、prophage（原噬菌体） 40、antitermination（抗终止作用） 41、retroregulation（逆向调控）
分子模拟实验实验报告设计实验二氯卡宾
分子模拟实验作业——设计实验 -----------二氯卡宾与甲醛环加成反应的理论研究 一、实验背景 在大二的有机实验中，我接触到了连续合成实验，其中有一类反应为相转移催化合成·卡宾及其反应。卡宾（Carbene）亦称为碳烯，是一类具有六个加点字的两价碳原子活性中间体，构造式为：CH2。其中的氢原子可以被其他原子或基团所取代，这类取代物称为卡宾体或取代卡宾。卡宾是缺电子的，具有很强的亲电性，可发生多种反应。在有机合成中常使之与烯烃反应以制取环丙烷衍生物，上网查阅资料后，我想到了可以结合本学期所学的分子模拟理论计算方法来模拟二氯卡宾与甲醛环加成反应。（题目来源于有机化学实验和查阅到的文献）二氯卡宾是一种取代卡宾，通常由氯仿与强碱作用产生： CHCl3 + Base ：CH2 + HB + Cl- 为了进一步探讨卤代卡宾与含有不对称π键物质环加成反应的机理,本文对单重态二氯卡宾与甲醛加成生成二氯环氧丙烷反应： 进行了量子化学从头算的研究,得到了该反应的反应机理,并对其反应机理作了理论分析说明.同时计算了该反应在不同温度下的热力学函数和动力学性质,并作了讨论。 二、实验内容 ①用分子轨道理论分析二氯卡宾与甲醛环加成的机理 用Chem3D软件做出二氯卡宾与甲醛的分子轨道能级图，计算分子轨道，并图示二氯卡宾和甲醛的HOMO和LUMO轨道的形状和能量。将所有分子轨道按能级排列次序，并以此分析两反应物的轨道匹配情况。（优化条件：Gamess Interface，HF/6-31G(d)）
对于该环加成反应的机理可借助于分子轨道图进行分析。根据轨道对称匹配条件，在反应过程中，应首先是C1的2p 空轨道插入甲醛的成键π轨道，但因甲醛中的羰基是一极性基团，π键电子云密集于氧端，故C1的2p 空轨道将从氧端插入其π轨道.因π电子向C1的2p 空轨道中的迁移，从而使二者首先生成了一半环状的中间配合物。由于二氯卡宾的?孤对电子与甲醛C 端的反键π轨道之间有着较强的成键作用，故随着反应的进行，二氯卡宾将在C1C20平面内按逆时针方向发生旋转.同时H1-C2和H2-C2键也由在中间配合物中与C1C20的共
武汉大学分析化学总结
1. 绝对误差：测量值与真实值之间的差值，即E a=x?x T,误差越小，表示测量值与真实值越接近，准确度越高；反之，误差越大，准确度越低.当测量值大于真实值时，误差为正值，表示测定结果偏高；反之，误差为负值，表示测定结果偏低.相对误差：指绝对误差相 当于真实值的百分率，表示为：E r=E a x T ×100%=x?x T x T ×100%,相对误差有大小，正负之 分. 2. 偏差（d）表示测量值（x）与平均值（x ）的差值：d=x?x .平均偏差：单次测定偏差的绝对值的平均值： d=1 d1+d2+?+d n= 1 |d i| n i=1 单次测定结果的相对平均偏差(d r)为：d r=d x ×100%. 3. 单次测定的标准偏差的表达式是： s= (x i?x )2 n i=1 相对标准偏差亦称变异系数：RSD=s r=s x ×100%. 4. 精密度←偏差←偶然误差→增加平行实验次数 ↓ d,s,RSD 准确度←误差←系统误差→针对产生的途径减免 ↓ E a,E r 5. 设测量值为A,B,C,其绝对误差为E A,E B,E C,相对误差为E A A ,E B B ,E C C ,标准偏差为s A,s B,s C,计算 结果用R表示，R的绝对误差为E R，相对误差为E R R ，标准偏差为s R. ⑴系统误差的传递公式 ①加减法：若分析结果的计算公式为R=A+B?C,则E R=E A+E B?E C. 如果有关项有系数，例如R=A+mB?C，则为E R=E A+m E B?E C. ②乘除法：若分析结果的计算公式R=A B C ，则E R R =E A A +E B B ?E C C ,如果计算公式带有系数，如 R=m AB C ,同样可得到E R R =E A A +E B B ?E C C . 即在乘除运算中，分析结果的相对系统误差等于各 测量值相对系统误差的代数和. ③指数关系：若分析结果R与测量值A有如下关系R=m A n,其误差传递关系为E R R =n E A A ， 即分析结果的相对系统系统误差为测量值的相对系统误差的指数倍. ④对数关系：若分析结果R与测量值A有下列关系R=mlgA，其误差传递关系式为 E R=0.434m E A A . ⑵随机误差的传递，随机误差用标准偏差s来表示最好，因此均以标准偏差传递.
2015年武汉大学885分子生物学考研真题(B卷)及详解【圣才出品】
2015年武汉大学885分子生物学考研真题（B卷）及详解 一、专业术语翻译与解释（共10小题，每小题4分，共40分） 1．Exon 答：Exon中文名称是外显子，是指断裂基因的一部分，包含在一个基因的转录物中，并在核内RNA剪接过程中保存下来成为细胞质中信使RNA的一部分。外显子在编码蛋白基因中处于三个明显的区域：第一部位，不翻译成蛋白质部分，是RNA转录物起始部分的信号并含有引导mRNA到核糖体进行蛋白质合成的顺序；第二部位是含有翻译成蛋白质氨基酸顺序的信息部分；第三部位是转录为mRNA的一部分含有翻译终止和加多腺苷酸尾的信号。 2．Promoter 答：Promoter中文名称是启动子，是指基因中控制基因表达（转录）的起始时间和表达的程度的一个组成部分。启动子本身并不控制基因活动，而是通过与转录因子结合而控制基因活动的。启动子就像"开关"，决定基因的活动。 3．Proteomics 答：Proteomics中文名称是蛋白质组学，是指一种基因组所表达的全套蛋白质，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
4．Frame-shift mutation 答：Frame-shift mutation中文名称是移码突变，是指由于插入或缺失非3的倍数个的核苷酸导致阅读框发生移动，随着转译成不正常的氨基酸的一种突变。这种突变通常会导致多肽链上一系列的氨基酸发生变化，严重影响后续蛋白质或酶的结构和功能。 5．Wobble hypothesis 答：Wobble hypothesis中文名称是摆动假说，是解释遗传密码简并性的假说，克里克于1966年提出。具体内容是：对氨基酸专一的密码子的头两个碱基与相应转移RNA上反密码子的第2个和第3个碱基互补配对，而密码子的第3个碱基（3＇端）与反密码子5'端碱基的配对专一性相对较差。在反密码子的5＇位置上常发现次黄嘌呤（Ⅰ）或与之相似，仅能形成2个氢键的嘧啶。 6．Single-strand binding protein 答：Single-strand binding protein中文名称是单链结合蛋白，又称DNA结合蛋白，是指结合于螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生的单链区，防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质，是DNA复制所必须酶。DNA解旋后，DNA分子只要碱基配对，就有结合成双链的趋向。 7．Tandem affinity purification 答：Tandem affinity purification中文名称是串联亲和纯化，是指一种可以经过两步特异性亲和纯化可快速得到生理条件下与靶蛋白质存在真实相互作用的蛋白质来研究体内蛋白质相互作用的新技术。
分析化学实验报告(武汉大学第五版)
分析化学实验报告 陈峻 (贵州大学矿业学院贵州花溪 550025) 摘要:熟悉电子天平得原理与使用规则,同时可以学习电子天平得基本操作与常用称量方法;学习利用HCl与NaOH相互滴定,便分别以甲基橙与酚酞为指示剂得 滴定终点;通过KHC 8H 4 O 4 标定NaOH溶液,以学习有机酸摩尔质量得测定方法、熟 悉常量法滴定操作并了解基准物质KHC 8H 4 O 4 得性质及应用;通过对食用醋总浓度 得测定,以了解强碱滴定弱酸过程中溶液pH得变化以及指示剂得选择。 关键词:定量分析;电子天平;滴定分析;摩尔质量;滴定;酸度,配制与标定 前言 实验就是联系理论与实际得桥梁,学好了各种实验,不仅能使学生掌握基本操作技能,提高动手能力,而且能培养学生实事求就是得科学态度与良好得实验习惯,促其形成严格得量得观念。天平就是大多数实验都必须用到得器材,学好天平得使用就是前提,滴定就是分析得基础方法,学好配制与滴定就是根本。 (一)、分析天平称量练习 一、实验目得: 1、熟悉电子分析天平得使用原理与使用规则。 2、学习分析天平得基本操作与常用称量法。 二、主要试剂与仪器 石英砂电子分析天平称量瓶烧杯小钥匙 三、实验步骤 1、国定质量称量(称取0、5000g 石英砂试样3份) 打开电子天平,待其显示数字后将洁净、干燥得小烧杯放在秤盘上,关好天平门。然后按自动清零键,等待天平显示0、0000 g。若显示其她数字,可再次按清零键,使其显示0、0000
g。 打开天平门,用小钥匙将试样慢慢加到小烧杯中央,直到天平显示0、5000 g。然后关好 天平门,瞧读数就是否仍然为0、5000g。若所称量小于该值,可继续加试样;若显示得量超过 该值,则需重新称量。每次称量数据应及时记录。 2、递减称量(称取 0、30~0、32 g石英砂试样 3 份) 按电子天平清零键,使其显示0、0000 g,然后打开天平门,将1个洁净、干燥得小烧杯 放在秤盘上,关好天平门,读取并记录其质量。 另取一只洁净、干燥得称量瓶,向其中加入约五分之一体积得石英砂,盖好盖。然后将 其置于天平秤盘上,关好天平门,按清零键,使其显示0、0000 g。取出称量瓶,将部分石英 砂轻敲至小烧杯中,再称量,瞧天平读数就是否在-0、30~-0、32 g 范围内。若敲出量不够, 则继续敲出,直至与从称量瓶中敲出得石英砂量,瞧其差别就是否合乎要求(一般应小于 0、4 mg)。若敲出量超过0、32 g,则需重新称量。重复上述操作,称取第二份与第三份试样。 四、实验数据记录表格 表1 固定质量称量 编号 1 2 3 m/g 0、504 0、500 0、503 表2 递减法称量 编号 1 2 3 m(空烧杯)/g 36、678 36、990 37、296 称量瓶倒出试样m1 -0、313 -0、303 -0、313 M(烧杯+试样)/g 36、990 37、296 37、607
武汉大学生命科学学院分子生物学考研试卷
2001年攻读硕士学位研究生入学考试试题 一、解释概念（20分，每个4分） 卫星DNA 复制体 逆转座子 反式激活因子 衰减子与衰减作用 二、填空（30分，每空1分，请将答案写在答卷上） 1. 从病毒到高等生物的研究表明，遗传物质是。 2. 冈崎片段的发现证实了双链DNA的复制，在复制过程中，一条新生链的合成是的，称为链；而另一条链的合成是的，称为链。 3. 大肠菌中有三种DNA聚合酶，其中的pol I的作用是，而pol III的作用是。pol I和pol III都有的三种活性是。 4. 由于真核细胞染色体DNA的复制要有一段RNA为引物，因此线状的DNA复制后必须存在着5’端缩短的问题。已发现有一种端粒蛋白称为，它由构成，可以使单链DNA的5’延长。 5. 对DNA损伤有几种修复系统，其中只有修复系统可以造成DNA变异，与这一系统有关的一套基因平时受到一称为的抑制蛋白所抑制，它发挥抑制作用是结合在一段约20bp长的称为的DNA序列上，当DNA损伤时，另一种蛋白质称为把这种抑制蛋白水解后，修复系统的基因才会被激活。 6. 真核细胞中有三种依赖于DNA的RNA聚合酶分别合成不同的RNA，RNA pol I负责合成，RNA pol II负责合成,RNA pol III负责合成。 7. 大分子互相作用是分子生物学的重要内容，包括蛋白质之间、蛋白质与DNA或RNA之间的互相作用，蛋白质有四种重要的结构花式与大分子互相作用有关，这些结构花式是，，，。 8. NO是气体小分子信号，它可由脱氨产生，它的作用方式是直接与酶作用使产生cGMP（环式GMP）。 9. 真核mRNA的5’端通常有帽子结构，3’端有polyA。在polyA上游有一保守序列称为polyA信号，其序列为。polyA能提高mRNA的翻译水平是由于： （1）（2）。 10. G-蛋白关联受体是一类重要的细胞表面受体，它的结构特色是，它发挥信号传递作用的两条途径是途径和途径。 三、问答题（50分） 1．说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。（15分） 2．简述增强子的特点和性质及作用机制。（10分） 3．简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始（15分） 4．DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶，它是在大肠杆菌（E.coli）R株中发现的，它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一，它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DNA片段克隆到pUC质粒中，并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增，已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶，你设计如何做才能确保成功？为什么？（10分）