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INFOBIOGEN数据库目录biogen.fr/services/dbcat/21. 国家生物技术信息研究室/data/data.html22. 人类基因组计划情报/TechResources/Human_Genome23. 生物学软件及数据库档案/Dan/software/biol-links.html24. 蛋白质组研究:功能基因组学的新前沿(著作目录) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/LivreTOC.html序列与结构数据库一.主要的公共序列数据库1. EMBL WWW服务器http://www.EMBL-heidelberg.ed/Services/index.html2. Genbank 数据库查询形式(得到Genbank的一个记录) /genbank/query_form.html3. 蛋白质结构数据库WWW服务器(得到一PDB结构) 4. 欧洲生物信息学研究中心(EBI) /5. EBI产业支持/6. SWISS-PROT(蛋白质序列库) http://www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html7. 大分子结构数据库/cgi-bin/membersl/shwtoc.pl?J:mms8. Molecules R Us(搜索及观察一蛋白质分子) /modeling/net_services.html9. PIR国际蛋白质序列数据库/Dan/proteins/pir.html10. SCOP(蛋白质的结构分类),MRC /scop/data/scop.l.html11. 洛斯阿拉莫斯的HIV分子免疫数据库/immuno/index.html12. TIGR数据库/tdb/tdb.html13. NCBI WWW Entrez浏览器/Entrez/index.html14. 剑桥结构数据库(小分子有机的及有机金属的结晶结构) 15. 基因本体论坛/GO/二. 专业数据库1. ANU生物信息学超媒体服务(病毒数据库、分类及病毒的命名法) .au/2. O-GL YCBASE(O联糖基化蛋白质的修订数据库) http://www.cbs.dtu.dk/OGLYCBASE/cbsoglycbase.html3. 基因组序列数据序(GSDB)(已注释的DNA序列的关系数据序) 4. EBI蛋白质拓扑图/tops/Serverintermed.html5. 酶及新陈代谢途径数据库(EMP) /6. 大肠杆菌数据库收集(ECDC)(大肠杆菌K12的DNA序列汇编) http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc.html7. EcoCyc(大肠杆菌基因及其新陈代谢的百科全书) /ecocyc/ecocyc.html8. Eddy实验室的snoRNA数据库/snoRNAdb/9. GenproEc(大肠杆菌基因及蛋白质) /html/ecoli.html10. NRSub(枯草芽胞杆菌的非冗余数据库) http://pbil.univ-lyonl.fr/nrsub/nrsub.html11. YPD(酿酒酵母蛋白质) /YPDhome.html12. 酵母基因组数据库/Saccharomyces/13. LISTA、LISTA-HOP及LISTA-HON(酵母同源数据库汇编) /14. MPDB(分子探针数据库) http://www.biotech.est.unige.it/interlab/mpdb.html15. tRNA序列及tRNA基因序列汇编http://www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/index/html16. 贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的小RNA数据库/dbs/SRPDB/SRPDB.html17. SRPDB(信号识别粒子数据库) /dbs/SRPDB/SRPDB.html18. RDP(核糖体数据库计划) /19. 小核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/ssu/index.html20. 大核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/lsu/index.html21. RNA修饰数据库/RNAmods/22. 16SMDB及23SMDB(16S和23S核糖体RNA突变数据库)/Departments/Biology/Databases/RNA.html23. SWISS-2DPAGE(二维凝胶电泳数据库) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/ch2d-top.html24. PRINTS /bsm/dbbrowser/PRINTS/PRINTS.html25. KabatMan(抗体结构及序列信息数据库) /abs26. ALIGN(蛋白质序列比对一览) /bsm/dbbrowser/ALIGN/ALIGN.html27. CATH(蛋白质结构分类系统) /bsm/cath28. ProDom(蛋白质域数据库) http://protein.toulouse.inra.fr/29. Blocks数据库(蛋白质分类系统) /30. HSSP(按同源性导出的蛋白质二级结构数据库) http://www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/31. FSSP(基于结构比对的蛋白质折叠分类) /dali/fssp/fssp.html32. SBASE蛋白质域(已注释的蛋白质序列片断) http://www.icgeb.trieste.it/~sbasessrv/33. TransTerm(翻译控制信号数据库) /Transterm.html34. GRBase(参与基因调控的蛋白质的相关信息数据库) /~regulate/trevgrb.html35. REBASE(限制性内切酶和甲基化酶数据库) /rebase/36. RNaseP数据库/RNaseP/home.html37. REGULONDB(大肠杆菌转录调控数据库) http://www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/38. TRANSFAC(转录因子及其DNA结合位点数据库) http://transfac.gbf.de/39. MHCPEP(MHC结合肽数据库) .au/mhcpep/40. ATCC(美国菌种保藏中心) /41. 高度保守的核蛋白序列的组蛋白序列数据库/Baxevani/HISTONES42. 3Dee(蛋白质结构域定义数据库) /servers/3Dee.html43. InterPro(蛋白质域以及功能位点的完整资源) /interpro/序列相似性搜索1. EBI序列相似性研究网页/searches/searches.html2. NCBI: BLAST注释/BLAST3. EMBL的BLITZ ULTRA快速搜索/searches/blitz_input.html4. EMBL WWW服务器http://www.embl-heidelberg.de/Services/index.html#55. 蛋白质或核苷酸的模式浏览/compbio/PatScan/HTML/patscan.html6. MEME(蛋白质超二级结构模体发现与研究) /meme/website7. CoreSearch(DNA序列保守元件的识别) http://www.gsf.de/biodv/coresearch.html8. PRINTS/PROSIT浏览(搜索motif数据库) /cgi-bin/attwood/SearchprintsForm.pl9. 苏黎世ETH服务器的DARWIN系统http://cbrg.inf.ethz.ch/10. 利用动态规划找出序列相似性的Pima IIhttp://bmerc-www.bu.ede/protein-seq/pimaII-new.html11. 利用与模式库进行哈希码(hashcode)比较找到序列相似性的DashPat /protein-seq/dashPat-new.html12. PROPSEARCH(基于氨基酸组成的搜索) http://www.embl-heidelberg.de/aaa.html13. 序列搜索协议(集成模式搜索) /bsm/dbbrowser/protocol.html14. ProtoMap(SEISS-PROT中所有蛋白质的自动层次分类) http://www.protomap.cs.huji.ac.il/15. GenQuest(利用Fasta、Blast、Smith-Waterman方法在任意数据库中搜索) http://www.gdb.rog/Dan/gq/gq.form.html16. SSearch(对特定数据库的搜索) http://watson.genes.nig.ac.jp/homology/ssearch-e_help.html17. Peer Bork搜索列表(motif/模式序列谱搜索) http://www.embl-heidelberg.de/~bork/pattern.html18. PROSITE数据库搜索(搜索序列的功能位点) /searches/prosite.html19. PROWL(Skirball研究中心的蛋白质信息检索) /index.html序列和结构的两两比对1. 蛋白质两两比对(SIM) http://expasy.hcuge.ch/sprot/sim-prot.html2. LALNVIEW比对可视化观察程序ftp://expasy.hcuge.ch/pub/lalnview3. BCM搜索装置(两两序列比对) /seq-search/alignment.html4. DALI蛋白质三维结构比较/dali/5. DIALIGN(无间隙罚分的比对程序) http://www.gsf.de/biodv/dialign/html多重序列比对及系统进行树1. ClustalW(BCM的多重序列比对) /multi-align/multi-align.html2. PHYLIP(推测系统进行树的程序) /phylip.html3. 其它系统进行树程序,PHYLIP文档的汇编http://expasy.hcuge.ch/info/phylogeny.html4. 系统进行树分析程序(生命树列表) /tree/programs/programs.html5. 遗传分类学软件(Willi hennig协会提供的列表) /education.html6. 用于多重序列比对的BCM搜索装置/multi-align/multi-align.html7. AMAS(分析多重序列比对中的序列) /servers/amas_server.html8. 维也纳RNA二级结构软件包http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/四. 有代表性的预测服务器1. PHD蛋白质预测服务器,用于二级结构、水溶性以及跨膜片断的预测http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/predictprotein.html2. PhdThreader(利用逆折叠方法预测、识别折叠类) http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/phd_help.html3. PSIpred(蛋白质结构预测服务器) /psipred4. THREADER(戴维. 琼斯) /~jones/threader.html5. TMHMM(跨膜螺旋蛋白的预测) http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/6. 蛋白质结构分析,BMERC /protein-seq/protein-struct.html7. 蛋白质域和折叠预测的提交表http://genome.dkfz-heidelberg.de/nnga/def-query.html8. NNSSP(利用最近相邻法预测蛋白质的二级结构) /pss/pss.html9. Swiss-Model(基于知识的蛋白质自动同源建模服务器) http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html10. SSPRED(用多重序列比对进行二级结构预测) /jong/predict/sspred.html11. 法国IBCP的SOPM(自寻优化预测方法、二级结构) http://pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopm.html12. TMAP(蛋白质跨膜片断的预测服务) http://www.embl-heidelberg.de/tmap/tmap_info.html13. TMpred(跨膜区域和方向的预测) /software/TMPRED_form.html14. MultPredict(多重序列比对的序列的二级结构) /zpred.html15. BCM搜索装置(蛋白质二级结构预测) /seq-search/struc-predict.html16. COILS(蛋白质的卷曲螺旋区域预测) /software/coils/COILS_doc.html17. Coiled Coils(卷曲螺旋) /depts/biol/units/coils/coilcoil.html18. Paircoil(氨基酸序列中的卷曲螺旋定位) /bab/webcoil.html19. PREDATOR(由单序列预测蛋白质二级结构) http://www.embl-heidelberg.de/argos/predator/predator_info.html20. EV A(蛋白质结构预测服务器的自动评估) /eva/五. 其他预测服务器1. 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微生物之家网站成立于2005年3月31日, 是一个非赢利的临床微生物专业网站。
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1、中国微生物信息网络http://159.226.80.1/chinese/chinese.html
2、中国微生物资源信息共享/sdinfo
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4、中国生态系统研究网络CERN /
5、中国科学院生态环境研究中心/
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7、中国生物多样性信息中心微生物学部分/cbic.shtml
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9、All the Virology on the WWW /~dmsander/garryfavweb.html
二、研究机构:
10、中国科学院微生物研究所/
11、天津市工业微生物研究所/
12、微生物研究站(Institute of Microbiology Research)/pylorus/index.asp
13、辽宁省微生物科学研究院/
14、广州市微生物研究所/F/03/default.asp
15、浙江省微生物研究所(浙江天科高新技术发展有限公司)/
16、广东省微生物研究所/newsamplebk/
17、湖南省微生物研究所/
18、军事医学科学院微生物流行病研究所/
19、中国科学院遗传与发育生物学研究所/
20、中国科学院武汉病毒研究所/index002.htm
21、江苏省微生物研究所/docc/008.htm
22、江西省科学院——微生物研究所/microbe.asp
23、清华大学微生物实验室/
24、台湾东吴微生物学系.tw/
25、河北省科学院微生物研究所/site%5Fyjs/cpjs.htm
26、辽宁省微生物研究所/server. ... uctInfo&of=view
27、南阳微生物研究所/chanpin.htm
三、菌种保藏机构:
28、中国工业微生物菌种保藏中心/
29、中国典型培养保藏中心/
30、中国农业微生物菌种保藏管理中心/database/search.htm
31、渗流所微生物菌种库/weishengwu/index2.htm
32、广东省微生物研究所菌种保藏中心/
四、数据库:
33、中国微生物资源数据库/
34、真菌物种数据库/species/speciesnew.htm
35、全球生物物种数据库/
36、检验医学网上资源库/edu/resource/graphic/index.asp
37、中国经济真菌多媒体数据库http://159.226.80.1/ecofungi/fungimenu.shtml
38、中国微生物菌种目录http://159.226.80.1/database/catalogsc.html
39、细菌名称数据库/bacteria/bacteria.htm
40、真菌新种数据库/newsp/index.html
41、微生物物种编目数据库/species/speciesnew.htm
42、西藏大型经济真菌/xzzj/fungi_xz.htm
43、革兰氏阴性杆菌编码鉴定数据库http://159.226.80.1/database/gnb/gnb.shtml
44、法国细菌名称数据库/srs71bin/cgi ... BSN_Bacterial_Names
45、国际微生物菌种数据网络MSDN http://159.226.80.1/msdn.shtml
46、国际核酸序列数据库/srs71bin/cgi-bin/wgetz?-page+top
47、国际计算机用微生物性状编码系统http://159.226.80.1/RKC.html
48、Virus Database Online .au/viruses/welcome.html
49、E.coli database collection – ECDC .au/viruses/welcome.html
50、Molecular Microbiology Jump Station /pages/micro.html
51、WHO/TDR MALARIA DATABASE .au/MalDB-www/who.html
52、HPV Sequence Database /
五、学会:
53、中国科学院典型培养物保藏委员会/
54、中国科学院典型培养物委员会/
55、中国微生物学会/index.php
56、湖南省微生物学会/hsm/
57、Society for General Microbiology /
58、Microbiology @ Leicester /
六、科普及教程:
59、微生物的世界.tw/colony/
60、中国科普博览——微生物馆/gb/lives/microbe/microbe_basic/
61、微生物界/weishengwu/
62、微生物大世界/jiaomu1.htm
63、星光网——临床医学常见真菌图谱/partner/njczw/jltp/zj/zj.htm
64、中教育新网——微生物学教程/Special/Subject/CZSW/SWTS/WSWXJC/
65、上海第二医科大学微生物教研室/micro/
66、武汉大学微生物学专题教学网站http://202.114.65.51/fzjx/wsw/main.htm
67、华南师范大学微生物教学网站/life/teac ... icro/info_index.asp
68、西北农林科技大学——微生物教学网站/courseware/wsw/yldh.htm
69、天津医科大学——医学微生物学http://202.113.49.22/home.files/microbiology/xijunxue/index.htm
70、微生物资源在线/
71、中华基因网——微生物检验产品/ad/millipore/007.htm
72、兽医微生物学/jiaowuchu/jingpinkecheng/weishwu/
七、学术期刊:
73、Microbiology /
74、The Microbiology Network /
75、Microbiology information resources and links /
76、Microbiology Jobs and Information /dir/life_sciences/microbiology/
77、EPA Microbiology /nerlcwww/
78、Microbiology of Yahoo /science/biology/microbiology/
79、American Society for Microbiology /
80、Applied and Environmental Microbiology(full-text) /
81、Clinical Microbiology Reviews(full-text) /
82、International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology(full-text) /
83、Journal of Clinical Microbiology(full-text) /
84、Microbiology(full-text) /
85、Microbiology and Molecular biology Reviews(full-text) /
八、检验及仪器:
86、农业部微生物肥料质量监督检验测试中心/biotestlab/
87、微生物生化仪器(南京庚辰科学仪器公司)/web/fxyq/flyq/weishengwu.htm
88、检验医学网/list.aspx?cid=18
89、杭州微生物试剂有限公司/hangwei/
90、上海恒奇仪器仪表有限公司/wswjc.htm
91、化工仪器网—微生物自动分析仪/products/n ... lei=C&xiaolei=I
九、专业论坛:
92、labcn检验医学论坛——微生物论坛/bbs6/list.asp?boardid=18
十、微生物应用:
93、合肥恒星科技开发有限公司/index.htm
94、保定市冀微生物技术有限公司/qyml/produser15954.html
95、北京九隆升微生物资源开发有限公司/cpjs.htm
96、广东环凯微生科技有限公司/showroom/
97、北京金山川科技发展有限公司/index.html
98、重庆绿环微生物工程有限公司/product.htm
99、上海通微生物技术有限公司/pro2.asp?ID=5
100、杭州优活微生物开发有限公司/shf.asp
101、苏州市永安微生物控制材料厂/product.html
102、深圳市国赛生物技术有限公司——微生物检测试剂/microbe_antibody_elisa.htm
103、广东合瀛生物工程有限公司/
104、中国微生物肥料联盟/
105、全禾菌业/
106、仪征诚信微生物制品厂/pro ... xwsw&thelevel=3。

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