单核苷酸多态性影响基因功能的机制

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单核苷酸多态性在人类疾病中的作用研究

单核苷酸多态性在人类疾病中的作用研究

单核苷酸多态性在人类疾病中的作用研究单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指基因序列中单个核苷酸的变异。

在人类基因组中,SNP数量高达数百万,且人与人之间差异较大。

这些变异可能对基因功能造成影响,与许多疾病的发病机制有关。

SNP与遗传性疾病SNP是一种常见的遗传变异,与遗传性疾病密切相关。

例如,外显子基因突变可以导致乳腺癌、肝癌、卵巢癌等常见癌症的发生。

除此之外,SNP也与许多常见疾病的风险相关,如心血管疾病、糖尿病、自身免疫性疾病等。

SNP对基因表达的影响SNP位于基因序列中,可能会影响基因表达。

例如,某些SNP与乳腺癌发生风险有关,其作用机制主要包括影响基因的表达,包括上游调节元件和显性编码区域。

通过影响转录因子的结合能力,SNP可以影响并且改变基因的表达模式,从而发挥不同的影响。

这些变化可能导致基因编码的蛋白质产生缺陷,或者增加突变的风险。

SNP与个体反应的差异SNP可能决定了个体对药物反应的差异。

例如,使用治疗癌症的药物间充质细胞毒性药物的时候,某些SNP可能会导致这种药物在某些人身上没有有效作用,也可能导致其他人产生毒性反应。

因此,预测个体对药物的反应可以更好地指导药物治疗。

SNP与环境因素的交互作用SNP可能会通过交互作用影响个体对环境因素的反应。

例如,一项研究表明,某些SNPs与木尘暴露相关,可能会导致气道炎症和哮喘的风险增加。

变异体型的基因可能会导致对某些环境因素更敏感,也可能解释为什么一些个体暴露于环境因素的时候没有出现健康问题,而另一些出现了健康问题。

SNP与疾病风险评估根据人类基因组计划的成果,识别SNP可以为预测疾病风险提供可靠的线索。

通过分析个体基因组,可以预测其罹患某种疾病的风险,并制定个性化的治疗和预防计划。

例如,家族性乳腺癌基因突变的女性携带者的罹患乳腺癌的风险非常高,可以通过对此类基因进行测序,进行早期筛查和治疗,以减少罹患乳腺癌的风险。

浅谈单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡

浅谈单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡

浅谈单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡单核苷酸多态性,单倍型及连锁不平衡是一些基因组学领域中的重要概念。

它们在遗传学、系统发育学、植物学等多个领域都有重要的应用。

本文结合实例,从科学角度讨论单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡。

一、单核苷酸多态性单核苷酸多态性是指一个特定位点中,有多种可能出现的单核苷酸类型。

一般情况下,在一个特定基因序列位点中,只有一种基因序列类型出现,而单核苷酸多态性是指在同一个序列位点可以出现多种基因序列类型。

单核苷酸多态性的发现,是由于多核苷酸的突变。

在基因组的多核苷酸中,突变的发生十分频繁,因此,同一个序列位点中可能出现多种基因序列类型。

此外,在不同的基因序列变异中,有可能出现多种单核苷酸类型。

举一个实例来说明,在某个植物体细胞中,一个序列位点中有三种基因序列类型(A、T、C),则该位点即为单核苷酸多态性。

研究表明,单核苷酸多态性可以影响基因组的表达,从而对生物功能产生影响。

二、单倍型单倍型是指在一个特定的位点上,一个特定的基因序列(如A、T、C)只出现一次,而另一个基因序列(如A、T、C)并不存在。

在基因组中,单倍型类型是非常普遍的,特别是在低等生物中,如细菌和植物体。

单倍型的作用,主要是在保护基因组的稳定性,保持基因的父代性,并且有助于基因的修复。

在某些特殊的情况下,如当有多个基因突变的发生时,单倍型可以避免突变的严重性。

单倍型也有助于细胞的正常功能,保持基因的进化性。

三、连锁不平衡连锁不平衡是指在父亲染色体和母亲染色体中,有一个染色体比另一个染色体多出一些基因序列,而一些基因序列可能不存在,这样会造成染色体的不平衡状态。

连锁不平衡的发生,主要是由于基因突变和特殊的多倍体细胞状态等原因,如非整倍体多倍体,双胞多倍体等,这些都可能会造成连锁不平衡的产生。

连锁不平衡对生物功能的影响很大,可能会造成生理因素的改变,如某些遗传性疾病的发生率增加,有些基因表达水平的改变,以及免疫系统的改变等等。

snp标记的原理

snp标记的原理

snp标记的原理SNP标记是一种常见的分子遗传学工具,它能够用来鉴定基因多态性以及确定基因型。

SNP全称为单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism),即单碱基突变。

SNP指的是DNA序列中某个碱基上的变异,这种变异只涉及到一个碱基,包括点突变和单核苷酸插入/缺失。

SNP标记与其他分子遗传学工具相比,具有以下优势:1. 多态性程度高,种类丰富:SNP标记分布于整个基因组,数量多,约在人类基因组中每1000个碱基中便可发现一个SNP。

并且,SNP基因型多样性很高,不仅仅在种群之间有差异,在个体中也可能体现出不同的表型特征。

2. 操作简便:由于SNP标记只是单碱基突变,其检测比较简便,可以使用PCR或者质谱等方法检测。

3. 信息量大:SNP标记是一种能够确定基因组位置的有序遗传标记,它可以被用来构建遗传连锁图、区分近缘种、识别特定的基因型以及其他很多的遗传分析。

SNP标记的产生机制SNP在自然界中最初的来源主要归于自然突变。

随着时间推移,由于交叉或重组等原因,SNP的分布就不再是随机的,而是带有可观的遗传规律性。

然后,由于人类和动物农业的发展,人类已经开始经常性地利用SNP标记在实验室中进行部分发育基因的研究。

现在,SNP单核苷酸多态性可以通过人工的基因生物技术得到。

SNP标记的检测方法SNP标记是更容易检测的遗传标记之一,因为它仅涉及到单个碱基的变异。

大多数情况下,SNP标记可以通过PCR扩增方法进行检测。

PCR通过引物扩增目标DNA片段,并添加标记物。

标记物通常与眼身染色体、非放射性同位素或荧光素有关。

PCR扩增成功后,在目标DNA序列中进行检测并鉴定单个碱基的变异。

质谱法、酶切法和芯片技术等等也可以用来鉴定SNP标记,其中,芯片技术把SNP标记盘在一张DNA芯片上,通过杂交技术进行检测,可使同时检测大量SNP标记更为方便。

总之,SNP标记是一种基于单核苷酸多态性的有效分子遗传学工具,应用广泛,可以用来解析复杂的遗传问题,对于了解基因型、构建遗传连锁图、快速筛选多态基因、识别特定的积性或隐性基因、评估遗传多样性和演化等方面都有很大作用。

单核苷酸多态性的研究及其生物学意义

单核苷酸多态性的研究及其生物学意义

单核苷酸多态性的研究及其生物学意义单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)指的是基因组中存在的单个核苷酸的碱基变异,这种突变通常在不同个体之间产生区别,是人类基因组的主要遗传变异形式。

SNPs在人类遗传学研究中发挥着重要作用,并具有广泛的生物学意义。

SNPs的研究对于揭示人类基因型与表型之间的关系具有重要意义。

通过对SNPs的分析和比较,可以确定在特定基因型的个体中是否存在患病风险或疾病的易感性。

比如,有些SNPs与罕见疾病或普遍疾病(如心血管疾病、癌症、肥胖等)的发生有关。

这些SNPs被用作早期诊断和预测个体风险的生物标志。

此外,SNPs也可以用于遗传学研究中的群体遗传结构分析。

通过对SNPs的分析可以确定个体间的遗传关系、不同种群的遗传特征以及人类种群的起源、迁移和演化历史。

这对于了解人类基因的起源、遗传多样性的形成机制以及种群遗传学的基本规律具有重要意义。

SNPs的研究还有助于药物治疗的个体化。

不同个体对药物反应存在差异,这与SNPs的存在和不同个体的基因型有关。

药物疗效和药物代谢酶的活性受SNPs的影响,因此个体基因型对于药物疗效和安全性具有重要影响。

比如,药物代谢酶基因的SNPs可以解释药物的代谢差异,从而影响药物在体内的水平和暴露时间。

了解个体SNPs的信息,可以为药物的剂量调整和个体化治疗提供依据,提高治疗效果和降低药物不良反应的发生。

SNPs的研究方法包括基因组测序、基因芯片和PCR等分子生物学实验技术。

随着高通量测序技术的发展,大规模SNPs的筛查和定量已成为可能。

此外,利用函数预测和生物信息学分析方法,可以对SNPs进行进一步的功能研究和功能注释。

这有助于深入理解SNPs的生物学意义,揭示SNPs与基因表达调控、蛋白质结构和功能以及病理生理过程之间的关系。

综上所述,SNPs的研究在生物学中具有广泛的意义。

通过分析和研究SNPs,我们可以揭示个体的遗传特征、疾病易感性以及个体对药物的反应差异。

基因多态性的影响及遗传机制研究

基因多态性的影响及遗传机制研究

基因多态性的影响及遗传机制研究遗传学是一门致力于研究遗传规律、遗传现象和基因多态性等科学的综合性学科。

基因多态性指的是人类基因组对同一基因的不同变异型,其中的DNA序列有可能影响性状变异,极大程度地影响个体的生物多样性和健康状况。

基因多态性的影响人类基因组中的几乎所有基因均存在多个突变位点,这些位点可以影响覆盖该基因的转录因子的结合性质、启动子活性等,决定了基因转录的数量和速度。

基因多态性的不同变异型具有不同的功能,而这种功能多态性意味着在表达和/或相互配对时,它们对化学信号的响应以及同一物种的个体间的生命系统变化显著不同。

这就表明了基因多态性是一个显著地影响个体生命质量和健康状况的因素。

基因多态性的影响范围已经覆盖到了从心血管疾病、癌症和代谢性疾病到帕金森病、自闭症等复杂性疾病,上至儿童时期的发育问题,下至老年时期的肺癌等问题,多种疾病和障碍都与基因多态性有直接和间接联系。

基因多态性的遗传机制基因多态性是基因组中一种常见的自然现象。

多种突变机制都有可能导致基因多样性。

它们在遗传决定中的作用可能是常染色体隐性、常染色体显性或性染色体中的基因移位或嵌合。

其中,常见的基因多态性通常与单核苷酸多态性(SNP)有关。

SNP是指基因组中频率至少为1%的不同单个核苷酸变异,通常以单个碱基互换为主,也涉及几十个碱基段的差异。

最近,人们对SNP的分析及其与疾病和健康有关的机制做了很多工作。

SNP的数量非常大,质量也受到了精细处理,在全球范围内也建立了SNP数据库,为SNP研究提供了宝贵的资源。

通过对多个单核苷酸多态性(SNP)进行基因分型,可以识别以前没有注重或检测的人类基因多态性,这有助于将基因多态性描述为更复杂的遗传过程。

结语基因多态性的研究在医学、生物学、人类学和遗传学等领域都有大量的应用。

基因多态性也成为了一个新的研究方向,其背后包含了量子、计算生物学、生物医学工程学等多个学科的知识。

虽然我们还有很多需要了解和学习的东西,但正是这种不断探索和深入研究的方式推动了领先科学家们的新一轮创新和发现。

浅谈单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡

浅谈单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡

浅谈单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡是现代遗传学研究中的一个重要的概念。

单核苷酸多态性可以被定义为指同一基因座上有多个可变的单核苷酸序列,其中一种单核苷酸序列可以常见于某一人群中的一部分或者大部分人,而另一种则少见或者稀有。

单倍型又称作基因型形成,是指每个个体拥有一种特定的单核苷酸序列。

连锁不平衡指的是两个单倍体间出现的多态性,也可以被称为“配偶序列不一致”,是由于父母遗传给子代的两个基因型不一致造成的。

第二段:研究发现,单核苷酸多态性可以在细胞和分子水平上影响生物学实验结果,并且可以影响生物学实验之中的生物学过程。

单核苷酸多态性可以影响细胞信号转导,调节蛋白质翻译,以及影响某些基因的表达。

研究发现一些重要疾病可以与单核苷酸多态性有关,即某些单核苷酸的变异可能会导致或促进疾病的发生,例如糖尿病和肿瘤。

第三段:研究表明,单倍型及连锁不平衡是由单核苷酸多态性产生的。

当两个单倍体的单核苷酸序列在某一位点上不一致时,就会导致连锁不平衡。

例如,父母某一基因座上的单核苷酸序列分别为A1和A2,则他们的子代可能会拥有三种不同的基因型,即A1A1,A1A2和A2A2。

而A1A2基因型就是连锁不平衡的表现形式。

第四段:连锁不平衡及其产生的单倍型有着重要的实际意义。

它们可以用来诊断遗传疾病,对相关疾病的发病机理有重要的指导作用。

单核苷酸多态性也被广泛用于基因定位,从而可以帮助科学家研究包括遗传病在内的一些疾病的发病机制。

此外,单核苷酸多态性还可以被用于分析遗传多样性,研究物种演化,以及优化育种。

第五段:综上所述,单核苷酸多态性、单倍型及连锁不平衡是一个重要的概念。

它们可以帮助人们了解遗传多样性,指导基因的定位,诊断遗传性疾病,甚至有助于物种的演化。

在未来,这些概念将能够帮助我们更好地掌握遗传学的基础知识,在相关的研究和应用中发挥重要作用。

单核苷酸多态性名词解释

单核苷酸多态性名词解释

单核苷酸多态性名词解释
单核苷酸多态性是指一个特定基因变异,这种突变可能会使同一位点上出现多种不同的碱基组合,而这些不同的碱基组合又会影响到该位点所承担的生物功能。

单核苷酸多态性可以大致分为三种类型:第一种是偶然多态性,它是一种无害变异,不会对携带者的健康造成影响。

第二种是有害变异,它会对携带者的健康造成影响,甚至会促使某些疾病的发生。

第三种是有益变异,它可以增强人类身体的抗病能力,或者促进某些疾病的抗病能力。

单核苷酸多态性变异也与环境因素有很大关系,受到自然环境影响程度不同,不同地区的单核苷酸多态性可能会有很大的差异。

因此,单核苷酸多态性变异的研究也有助于研究社会的生态环境,从而了解环境变化和社区病毒介导的遗传变异之间的关系。

此外,单核苷酸多态性变异也可能会影响人类的营养摄入,比如在几乎相同的种群中,某些携带者会产生抗药性,这些携带者对某种营养物质的摄入有不同的需求。

此外,单核苷酸多态性变异也可能会影响人类的运动能力,比如某些携带者有着更高的耐力,而另一些携带者可能更容易疲劳。

单核苷酸多态性变异的研究也可以帮助人们更加全面地了解疾
病的发生机制,因为有些疾病是由特定的变异引发的,而这些变异又可能会受到一些外部因素的影响,而变异研究也可以为医学界提供新的潜在治疗或预防措施。

总而言之,单核苷酸多态性的研究对人们的健康、社会生态环境
和营养摄入、运动能力等多个方面产生了巨大的影响,是当今研究的一大关注点。

只有通过对这些变异的深入研究,我们才能更加客观地了解这些变异,为人类健康提供更好的服务。

07 单核苷酸多态性(SNP)实验

07 单核苷酸多态性(SNP)实验

单核苷酸多态性(SNP)实验SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。

据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较于度多态性(RFLP)分析还是微卫星标记(STR),都要广泛得多。

实验方法原理:SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。

据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较于限制性片段长度多态性(RFLP)分析还是微卫星标记(STR),都要广泛得多。

SNP是我们考察遗传变异的最小单位,据估计,人类的所有群体中大约存在一千万个SNP位点。

一般认为,相邻的SNPs倾向于一起遗传给后代。

于是,我们把位于染色体上某一区域的一组相关联的SNP等位位点称作单体型(haplotype)。

大多数染色体区域只有少数几个常见的单体型(每个具有至少5%的频率),它们代表了一个群体中人与人之间的大部分多态性。

一个染色体区域可以有很多SNP位点,但是我们一旦掌握了这个区域的单体型,就可以只使用少数几个标签SNPs(tagSNP)来进行基因分型,获取大部分的遗传多态模式。

实验材料:组织样品试剂、试剂盒:液氮、PBS、GA缓冲液、GB缓冲液、蛋白酶K、无水乙醇、蛋白液、漂洗液等仪器、耗材:离心管、离心机、废液收集管、吸附柱、水浴锅、分光光度计、低温冰箱等实验步骤:一、DNA抽提1. 取新鲜肌肉组织约100 mg,PBS漂洗干净,置于1.5 ml离心管中,加入液氮,迅速磨碎。

2. 加200 μl 缓冲液GA,震荡至彻底悬浮。

加入20 μl 蛋白酶K(20 mg/ml)溶液,混匀。

3. 加220 μl 缓冲液GB,充分混匀,37℃消化过夜,溶液变清亮。

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号 通 路 和 经 典 的 Wn t 信 号 通 路 ,促 进 成 骨 细 胞 分 化 及 骨 形 成 。
海默病 ( AD) 星形细 胞增多和快 速认知下降 相关。研
究显示,C C 、GC基 因型 相 比 G G 基 因 型 , 认 知 下 降 更 快 ; 此 外 , 相 比 G 等 位 位 点 ,含 有 C 等位 位 点时 , 显 示 出 更 严 重 的 星 形 细 胞 增 多 …】 。 在 内含 子 区 S NP 影 响 基 因 功 能 的 分 子 机 制 方 面 , 有研 究 显 示 , 基 因 内 含 子 一 侧剪 接 位 点 处 的 S N P
生 化 、细 胞 水 平 的研 究 表 明,r S NP 也 可 通过 影 响 基 因产 物 , 引起 细 胞信 号通 路 的 改变 。例 如 ,对 于 人 类 MD M2 癌 基 因启 动 子 区 的 一个 r S N P ( G / T ) ,基 因 型 从G G、G T到 1 T r ,MD M2 蛋 白 水 平依 次 降 低 ,G G基
作者 简介: 刘越( 1 9 8 4 一 ) ,男,硕士生,E — ma i l :l i u y u e 6 6 @s t u x j t u . e d u . c n ;吕社民( 1 9 5 9 一 ) ,男,教授,博士,联 系作者,E — ma i l :
l u s h e mi n @ma i l . x j t u . e d u . c a
体 或 群 体 疾 病 的 易 感 性 、 抵 抗 力 、 药 物 反 应 性 及 其
般 来 说 ,基 因组 中大 约 平 均 每 1 0 0 0 个 碱 基 就 会 有 一
个S N P , 人 类 的所 有群 体 中大 约 存在 3 0 0 万个 S N P位 点。根据在 基 因中的位置,S NP可 分 为 基 因 编 码 区 S N P ( c o d i n g S N P , c S N P ) 、基 因 内含 了区 S NP 和 基 冈 调 控区S N P ( r e g u l a t o r y S N P , r S N P ) 。其 中 c S N P根 据 是 否改 变 编 码 的 氨基 酸 又 可 分 为 同义 c S N P( s y n o n y mo u s
可影响剪接位 点活性 ,进 而影响基 因的功 能。例如 , 日本学 者通 过体 内和体 外实验 ,发 现杜 氏肌营 养不
良症 ( DMD) 基因 3 2 号 内含 子 第 5 位 上 的 一个 S N P ( G /
2 .同义 c S N P对基因功 能的影响
同义 c S N P由 于其 不 改变 编 码 的氨 基 酸 , 过 去 一 直认 为它 不 会 改 变 基 因 的功 能 。 近 来 , 随 着这 方 面 研 究 的 日益深 入 , 人 们 发 现 同 义 c S NP也 可 影 响 基 因 的
单核苷 酸 多态性 影 响基 因功 能的机 制
刘 越 吕社 民
( 西 安交通 大学 医学 院遗传 学 与分 了生物学 系, 西安 7 1 0 0 6 1 )

要 :单 核苷酸 多态性 ( S i n g l e nu c l e o t i d e p o l ymo r p h i S m, S NP) , 最 早 是 作 为 一 种 基 因 组 作 图 的 遗 传 标 记 , 随 着

2l 4 ・
《 牛命 的化 学 2 0 0 8 年2 8 卷 2期 C HE MI S T RY OF L I F E 2 0 0 8 ,2 8 ( 2 )
● Cu r r e n t To p i1 3 3 6 ( 2 0 0 8 ) 0 2 — 0 2 1 4 - 0 3
区域 的一组相关联的 S NP等位位点被称作单体型。
S N P作 为 一 种 人 类 常 见 DN A 变 异 , 日益 受 到 人
们的重视。随着 S N P 检测技术的发展,人量的 S NP 数
据 被 公 布 。对 于 S N P的认 识 ,最 甲 . 将 它 视 为 一种 基 因 组 作 图 的遗 传 标 记 , 一 个 染 色 体 区域 可以 有 很 多 S N P
分析 表明:多巴胺 D 4受体基 因启动子区的一个 r S N P ( 一 5 2 1 C / T ) 与韩 国男孩注意力缺失 / 过动症( A DH D ) 的发
病 有 关 。研 究 结 果 显示 ,1 Y r 基因型人群相比 C T 、C C
基 因型人群表现出更高的 AD HD发 病程 度等级 】 。
1 .非 同义 c S N P对基因功 能的影响 非同义 c S N P , 由于其 改变编 码的氨基酸, 对基
因功能 的影响易于理解 ,常用 的研究方法是关联分析 和生化、细胞水平的分 析。近来有研究表明,非同义
c S N P可 通 过 影 响 基 因产 物 , 引 起 细 胞 信 号通 路 方 面
通路,使患脑梗塞 的风 险增加…。在 S NP与骨形成 的
● 知 识 介 绍
“ 生命 的化 学 2 0 0 8 年2 8 卷2 期

21 5 ・
CHE MI S T RY OF L I F E 2 0 0 8 ,2 8 ( 2 )
研 究 方 面 , 一 种 编 码 软 骨 中 间层 蛋 白 的基 因 C I L P 中 的一 个 非 同义 c S N P ( 1 1 8 4 T / C ) 与 腰 椎 问盘 疾 病 的 易 感 性 相 关 ,研 究 表 明 , 等 位 位 点 C的 存 在 可 使 T GF — B 1 信号通路得到 抑制_ 2 】 。一种决定骨量 的蛋白 L R P 5 ( 低 密度 脂 蛋 白受 体 相关 蛋 白 5 ) 基 因 的一 个 非 同 义 c S NP ( 4 5 7 4 C / T ) ,T等 位 位 点 的 存在 可 通 过 B MP 2 介 导 的 信
c S N P ) 和非同义c S NP( n o n . s y n o n y mo u s c S NP ) 。 基 冈 某

他遗 传表 型的差 异,这 种方 法提 出较早 ,使用 频率 也较 高 。第二种 是生化 和细胞 水平 的分 析,通 过分
析酶活 力、细胞信 号通路等来解释 S NP对 基 因 功 能 的影 响。第三种分析 方法是基于 S NP影 响基 因 表 达 的分子机 制研究,通 过分析 S NP对 基 因 转 录 、 翻 译 及 翻 译 后 蛋 白 质 折 叠 的 影 响 , 从 而 更 深 刻 地 解 释 S NP影 响基 因 功 能 的 机 理 。
功能。
A) ,等位位 点从 G到 A的转变 可使 剪接供体位 点完
全 失 活 】 。
4 .基 因调控 区 r S N P对基 因功能的影响
在调控 区 r S NP影 响基 因功 能 的研 究方 面 , 关 联
在 同义 c S NP影 响 基 因 功 能 的 分 子 机 制 方 面 , 通 过研究人类氨酰t R NA合 成酶 及 复 制 蛋 白 A的 c S N P与 mR N A- " 级 结构 的关 系, 发 现 同义 c S N P 可 引起 mR N A 二 级 结 构 的不 同H 】 。 在 密 码 子 水 平 可 能 的机 制 , 有 研
究表明,在不 同的蛋 白质二级结构( 如0 c 螺旋、B 折叠)
问 , 同义 密 码家 族 的 密 码 子 使 用 是 非 随机 的, 密 码 子 的 结 构 偏 好 性 与 密 码 子 第 2个 位 置 上 的 碱 基 相 关 i s 】 。 也 有 研 究认 为 , 这 种 结构 偏 好性 与密 码 子 第 3个位 置 上的 碱 基 相 关 [ 6 1 。 同义 c S N P也 可 引 起 核糖 体 通 过 m R NA 特 定 区域 时 速 度 的 加 快 或 变 慢 , 影 响 翻 译 动 力 学 , 最 终 使 蛋 白 质 的 结 构 和 功 能 发 生 改 变 。
中 图 分 类 号 :Q3 1
单核 苷酸 多态性( s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y mo r p h i s m,
S N P )是指 基 因组 D NA 序 列 上 群体 发 生 频 率 人 于 l % 的单个 核苷酸 差异 。 1 9 9 6年 , 它 是 由美 国 M I T 的 L a n d e r 最 早 提 出, 被 称 为 “ 第= = 三 代 DN A遗传标 记” 。

( Ha P Ma P计划 ) 开 始 实 施 , 该 计 划 最 终 将 鉴 定 出 2 0 - 1 0 0万 个标 签 S NP 位 点。
近 来的研 究表明,S NP作为 一种单个核 苷酸水 平 的基 因多态性 ,其 本身 也可影 响基 因的功能 。对 于这 方面 的研 究,常 用的分 析方 法有 3种。第 一种 是基 于遗传流行病 学的关联分析 ,分析 S NP引起个
因型可影响 p 5 3 肿瘤抑制 的通路,加速 肿瘤形 成_ l 4 】 。
对于 r S NP影 响 基 因功 能 的分 子 机 制 , 有研 究 表 明, 基 因调 控 区 的 r S NP可 通 过 影 响 启 动 子 元 件 来 调 节基因的功能。 例如, I F N— Y 基 因启 动 子 区 含 一个 r S N P
最近的研 究表明: 多向性耐药基 因 1 ( MD R1 ) 第
3 4 3 5 位 的一 个 同义 c S N P ( 3 4 3 5 C / T ) 可 改变 MD R 1 基 因 产 物 的 功 能 。这 种 机 制 不 是 通 过 改 变 m R NA及 蛋 白 的 产 量 水 平 ,而 是 通 过 改变 m R NA 的构 象 、蛋 白 的折 叠 及 细 胞 定 位 , 进 而 影 响基 因 功 能 的 发 挥 r 8 1 。
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