生物样本库发展的现状

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生物样本库发展的现状

一、国际生物样本库建设现状概况

1.1 北美地区的生物样本库

生物样本作为转化医学研究的重要资源,正在日益受到各国高度的重视。在美洲有影响力的组织有1999年成立的国际生物和环境资源协会(ISBER)和2005年由美国NCI成立的生物存储库和生物标本研究实验室(OBBR)。

1.1.1 ISBER

国际生物和环境样本库协会(International Society for Biological and Environmental Repositories, ISBER)是美国研究病理学会下辖的一个分支机构。它试图通过建立规范和标准,利用培训等方式影响发展中国家的样本库建设,使其达到一定的质量和标准。目前,ISBER下辖6个不同类型的生物样本库,分别是动物样本库、环境样本库、人体样本库、微生物样本库、博物馆样本库、植物/种子样本库。

除此之外,ISBER设置了若干个专门性的工作组,每个工作组由具有专门知识和经验的个人组成,通过白皮书或其他出版物,及时解决生物样本库建设过程中遇到的问题。这些工作组包括样本库自动化工作组、样本库融资工作组、生物样本科学工作组、临床生物样本工作组、环境生物样本工作组、信息和情报工作组、生物样本库知情同意工作组、制药学术工作组、以及人体组织样本的权利和控制工作组。通过这些工作组的工作,逐步推进ISBER在生物样本库建设过程中各个领域内的专业性和权威性。

1.1.2 OBBR

2005年美国国立癌症研究所(National Cancer Institute, NCI)成立了美国国家癌症中心生物样本库和生物样本研究办公室(Office of Biorepository and biospecimen Research,OBBR)。OBBR致力于制定一个共同的生物样本库标准,以便于指导,协调和发展机构搜集生物样本资源的能力和提高所搜集生物样本的质量以确保其满足研究需要。

OBBR工作目标:

1.确立生物样本库作为研究的新领域,确定高效保存生物样品使其

适用于基因组和蛋白质组研究的各种搜集和处理协议;

2.推广普及第一版的最佳操作规范,以协调各机构政策和程序。并

不断在此基础上总结完善,改进提高生物样本库的最佳做法;

3.促进发展生物样本的质量标准的建立专业第三方标准监督机构;

4.发展生物样本库业务的新技术;

5.与国际社会协调,以协调政策和程序,促进多国研究。

1.1.3 P3G

随着人类基因组计划,国际单体型图,以及对易感基因的报告工作的完成,创造了一个规模庞大,迫切需要从人口特征进行解读的样本数据集。通过对这个数据集的解读将使生物医学界解开引起疾病的复杂的遗传和环境相互作用关系。2003年,加拿大筹建的公共人群基因组项目((Public Population Project in Genomics,P3G),主要从事人群生物样本库和遗传流行病学研究。

P3G是由一个国际财团支持的,致力于开发和管理上述研究工作相关的,一个多学科的非营利和非商业组织。其目标是促进人口基因组学领域的研究人员之间的合作,促进比较和合并在世界各地进行的基因组研究的成果。P3G旨在促进合作,优化设计,促进生物样本库工作的协调,并促进知识转让,建立适应科学发展的人类基因组研究的伦理道德标准。通过P3G开发的工具,支持和网络,实现帮助国际研究界考虑个人,家庭和社区更有效的卫生保健战略,从而更好地预防疾病,调整药品和其他治疗方案。

1.2 欧洲生物样本库

1.2.1 UKbiobank

在英国有影响力的是1999年提议设立、2006年开始试运营的,目前世界最大医疗资源和资料数据库——英国Biobank,目前该样本库搜集了50万来自英国各地40岁-69人口捐赠的样本。样本包括血样、尿样、遗传数据和生活方式等个人的医疗详细信息,向研究“遗传和环境的复杂互做与患病危险”的研究人员提供其所采集的材料,研究英国人的健康状况受生活方式、环境和基因影响的情况,寻求对癌症、心脏病、糖尿病、关节炎和老年痴呆等疾病的预防、诊断和治疗的更好途径。目前已经完成50万人的样本搜集工作。

英国样本库是一个非赢利慈善机构,由英国卫生部,医学研究理事会、苏格兰行政院,及惠康信托医疗慈善基金共同出资成立。此外,该机构还获得了威尔士议会及有关健康研究的慈善机构(如英国心脏研究基金和英国癌症研究基金会)的支持。该样本库建设启动资金约六千两百万英镑,总部设在曼彻斯

特大学。目前,全英国大约20所著名的大学参与其建设及科研。英国样本库的样本主要来自于公众志愿者的捐赠,其建设的目的,就是试图通过结合对这些志愿者过去多年累积下来的医疗资料和生活方式及习惯等进行跟踪研究,找到那些引发大范围环境压力和对生命健康造成威胁的因素。

1.2.2 BBMRI

欧盟2008计划筹建的泛欧洲生物体样本库与生物分子资源研究设施(Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure,BBMRI )是欧盟研究基础战略路线图的重要组成内容1。 BBMRI旨在整合和升级欧洲现有生物样品收集、技术和专家资源平台。是为了扩大和维持欧洲研究和产业,特别是生物医学和生物领域在全球范围内竞争力。通过建立可以被泛欧洲和世界利用的生物医学和生物研究所需要的基础设施、资源和技术能力,特别是所建立起的创新能力将其恰当地融合到欧洲的道德,法律和社会建设的框架中。

BBMRI将可以提供不同形式的生物相关材料(DNA、组织、细胞、血液和其他体液及相关的医疗、环境、生活方式和随访数据);大人群研究;临床案例/对照人群;生物分子资源(包括抗体和亲和分子库、siRNA文库、蛋白、细胞资源等);高通量分析技术平台和其他工具行技术;样品管理的统一标准;数据库和生物计算基础设施的统一标准;伦理、法律和社会等服务。

BBMRI作为欧洲生物样本库建设经验,标准化操作规范的制定者和信息系统的开发者的先驱,关注通过建立必要的医疗设施满足欧洲公民对于健康持续改善的关注而建立的研究所需新型的,大规模的资源设施。

为了维系这个庞大网络的运转,BBMRI被设计成一个分布式枢纽结构,通过枢纽节点协调各项活动,包括样本收集,管理,分配和数据分析。生物样本库,分子生物学资源和技术中心等BBMRI成员,都可以成为具体领域的枢纽。此外,BBMRI也吸引公共或私人多个合作伙伴(如大学,医院,企业),提供生物样品,数据,技术或服务。BBMRI在奥地利的格拉茨设立协调总部,负责协调参加国国家节点的活动协调。

1除BBMRI外,欧盟还规划了其他基础设施。其中,欧洲高级医药研究转化基础设施(EATRIS)和欧洲临床研究基础网络(ECRIN)与BBMRI共同构成与从研究、发现到开发各个步骤相对应的人体生物样品管理的基础设施平台。而整合结构生物学平台(INSTRUCT)、作为人体疾病模型小鼠功能基因组学平台(INFRAFRONTIER)与BBMRI等一起构成生物分子资源管理基础设施平台。生物信息学基础设施(ELIXIR)则是上述基础设施平台之间的数据共享平台。

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