12_第七章-聚类分析

合集下载

聚类分析方法

聚类分析方法

聚类分析方法聚类分析是一种常用的数据分析方法,它可以将数据集中的对象按照其相似性进行分组,形成若干个簇。

通过聚类分析,我们可以发现数据中的内在结构,帮助我们更好地理解数据集的特点和规律。

在实际应用中,聚类分析被广泛应用于市场分割、社交网络分析、图像处理等领域。

本文将介绍聚类分析的基本原理、常用方法和应用场景,希望能够帮助读者更好地理解和应用聚类分析。

聚类分析的基本原理是将数据集中的对象划分为若干个簇,使得同一簇内的对象相似度较高,不同簇之间的对象相似度较低。

在进行聚类分析时,我们需要选择合适的相似性度量方法和聚类算法。

常用的相似性度量方法包括欧氏距离、曼哈顿距离、余弦相似度等,而常用的聚类算法包括K均值聚类、层次聚类、DBSCAN等。

不同的相似性度量方法和聚类算法适用于不同的数据类型和应用场景,选择合适的方法对于聚类分析的效果至关重要。

K均值聚类是一种常用的聚类算法,它通过不断迭代更新簇中心的方式,将数据集中的对象划分为K个簇。

K均值聚类的优点是简单、易于理解和实现,但是它对初始簇中心的选择较为敏感,容易收敛到局部最优解。

层次聚类是另一种常用的聚类算法,它通过逐步合并或分裂簇的方式,构建一棵层次化的聚类树。

层次聚类的优点是不需要事先确定簇的个数,但是它对大数据集的处理效率较低。

DBSCAN是一种基于密度的聚类算法,它能够发现任意形状的簇,并且对噪声数据具有较强的鲁棒性。

不同的聚类算法适用于不同的数据特点和应用场景,我们需要根据具体情况选择合适的算法进行聚类分析。

聚类分析在实际应用中有着广泛的应用场景。

在市场分割中,我们可以利用聚类分析将顾客分为不同的群体,从而制定针对性的营销策略。

在社交网络分析中,我们可以利用聚类分析发现社交网络中的社区结构,从而发现潜在的影响力人物。

在图像处理中,我们可以利用聚类分析对图像进行分割和特征提取,从而实现图像内容的理解和识别。

聚类分析在各个领域都有着重要的应用,它为我们理解和利用数据提供了有力的工具。

数据挖掘第七章__聚类分析

数据挖掘第七章__聚类分析
火龙果 整理
Chapter 7. 聚类分析
• 聚类分析概述 • 聚类分析的数据类型
• 主要聚类分析方法分类
划分方法(Partitioning Methods)
分层方法
基于密度的方法
基于网格的方法
基于模型(Model-Based)的聚类方法
火龙果 整理
• 差异度矩阵
– (one mode)
0 d(2,1) 0 d(3,1 ) d ( 3, 2 ) : : d ( n,1) d ( n,2)
0 : ... ... 0
火龙果 整理
1.数据矩阵 数据矩阵是一个对象—属性结构。它是n个对象组
6.3 聚类分析中的数据类型
假设一个要进行聚类分析的数据集包含 n
个对象,这些对象可以是人、房屋、文件等。
聚类算法通常都采用以下两种数据结构:
火龙果 整理
两种数据结构
• 数据矩阵
– (two modes)
x11 ... x i1 ... x n1 ... x1f ... ... ... xif ... ... ... xnf ... x1p ... ... ... xip ... ... ... xnp
• 保险: 对购买了汽车保险的客户,标识那些有较高平均赔偿 成本的客户;
• 城市规划: 根据类型、价格、地理位置等来划分不同类型的 住宅; • 地震研究: 根据地质断层的特点把已观察到的地震中心分成 不同的类;
火龙果 整理
生物方面,聚类分析可以用来对动物或植物分类,或 根据基因功能对其进行分类以获得对人群中所固有的
(6.2)
火龙果 整理

聚类分析

聚类分析

第七章聚类分析第一节遗传距离数量性状遗传研究中,常常需要在多性状水平上度量个体或群体间的亲疏关系,遗传距离是在多性状水平上概括这些研究对象间的亲缘关系疏远程度的有效统计量之一。

通过对遗传距离的聚类分析,不仅可以认识所研究对象(个体或群体)间亲缘关系的远近,还可进一步研究不同类群间关系远近与杂种优势的关系,为杂交育种和杂种优势的利用提供理论和材料依据。

下面首先介绍有关遗传距离的基本概念—样品与变量,然后介绍遗传距离的具体计算,第三部分介绍聚类分析。

一、样品与变量遗传距离可以通过三种不同类型信息获得:表型信息、分子(包括DNA和蛋白质)标记信息和系谱信息,由这三种信息求得的遗传距离分别称为表型遗传距离、遗传标记距离和系谱遗传距离。

在聚类分析中有两个很重要的概念:样品和变量。

样品是所研究的对象,如不同群体、不同品种以及变异群体内的不同个体等。

为了研究样品间的关系,需要拟定一些指标来测试这些样品,这些指标就是变量,如株高、产量、籽粒长度、胚颜色等为表型性状变量;采用分子生物学技术获得的“0、1”型标记变量被称为分子标记变量。

样品间表型性状变量和分子标记变量的遗传距离计算方法不同,下面分别叙述。

二、基于数量性状表型数据的遗传距离(一)数据变换一般来说,用来考察样品的表型性状变量有多个,这些变量使用的量纲会有不同,取值范围也不相同。

为了使不同量纲、不同取值范围的数据能放在一起进行比较,通常需要对原始数据进行变换处理,使之变成无量纲而具可比性。

假设有n个样品,m个变量,y表示第i个样品在第j个变量的观测值,ij==。

观测值数据列于表7-1。

1,,;1,,i n j m11 y1. 标准差标准化变换:*(1,2,,;1,2,,)ij jij jy y y i n j m s -=== (7-1)变换后的数据*ij y 无量纲,每个变量的样本均值为0,标准差为1。

2. 极差标准化变换:*(1,2,,;1,2,,)ij j ij jy y y i n j m R -=== (7-2)变换后的数据*ij y 无量纲,每个变量的样本均值为0,极差为1,且|*ij y |﹤1。

聚类分析的基本概念与方法

聚类分析的基本概念与方法

聚类分析的基本概念与方法聚类分析(Cluster Analysis)是一种将数据分组或分类的统计学方法,通过将相似的对象归为同一组,使得组内的对象之间更加相似,而不同组之间的对象则差异较大。

它是数据挖掘和机器学习领域中常用的技术之一,被广泛应用于市场分析、生物信息学、图像处理等领域。

一、聚类分析的基本概念聚类分析基于相似性的概念,即认为具有相似特征的对象更有可能属于同一类别。

在聚类分析中,每个对象都被视为一个数据点,而聚类则是将这些数据点分组。

基本概念包括以下几点:1. 数据点:数据集中的每个样本或对象都被看作是一个数据点,它具有多个特征或属性。

2. 相似性度量:聚类分析的关键是如何计算数据点之间的相似性或距离。

常用的相似性度量包括欧氏距离、曼哈顿距离、闵可夫斯基距离等。

3. 簇/类别:将相似的数据点归为一组,这个组被称为簇或类别。

簇内的数据点相似度较高,而不同簇之间的数据点相似度较低。

4. 聚类算法:聚类分析依赖于具体的算法来实现数据点的分组。

常见的聚类算法有K均值聚类、层次聚类、密度聚类等。

二、聚类分析的方法1. K均值聚类(K-means Clustering):K均值聚类是一种迭代的聚类方法,它将数据点分成K个簇,每个簇代表一个样本集。

算法的基本思想是通过最小化簇内数据点与簇中心之间的平方误差来确定最优的簇中心位置。

2. 层次聚类(Hierarchical Clustering):层次聚类是一种基于树状结构的聚类算法,它根据数据点之间的相似性逐步合并或分割簇。

层次聚类分为凝聚型和分裂型两种方法,其中凝聚型方法从单个数据点开始,逐步合并最相似的簇;分裂型方法从所有数据点开始,逐步分割最不相似的簇。

3. 密度聚类(Density-Based Clustering):密度聚类基于密度可达的概念,将具有足够高密度的数据点归为一簇。

核心思想是在数据空间中通过密度连通性来确定簇的边界,相对于K均值聚类和层次聚类,密度聚类能够有效处理不规则形状和噪声数据。

聚类分析原理及步骤

聚类分析原理及步骤

聚类分析原理及步骤
一,聚类分析概述
聚类分析是一种常用的数据挖掘方法,它将具有相似特征的样本归为
一类,根据彼此间的相似性(相似度)将样本准确地分组为多个类簇,其中
每个类簇都具有一定的相似性。

聚类分析是半监督学习(semi-supervised learning)的一种,半监督学习的核心思想是使用未标记的数据,即在训
练样本中搜集的数据,以及有限的标记数据,来学习模型。

聚类分析是实际应用中最为常用的数据挖掘算法之一,因为它可以根
据历史或当前的数据状况,帮助组织做出决策,如商业分析,市场分析,
决策支持,客户分类,医学诊断,质量控制等等,都可以使用它。

二,聚类分析原理
聚类分析的本质是用其中一种相似性度量方法将客户的属性连接起来,从而将客户分组,划分出几个客户类型,这样就可以进行客户分类、客户
细分、客户关系管理等,更好地实现客户管理。

聚类分析的原理是建立在相似性和距离等度量概念之上:通过对比一
组数据中不同对象之间的距离或相似性,从而将它们分成不同的类簇,类
簇之间的距离越近,则它们之间的相似性越大;类簇之间的距离越远,则
它们之间的相似性越小。

聚类分析的原理分为两类,一类是基于距离的聚类。

聚类分析(共8张PPT)

聚类分析(共8张PPT)
第4页,共8页。
聚类分析
三、聚类分析中的测度与标准化
在聚类分析技术的发展过程中,形成了很多种测度相似性的方法。每一种方法 都从不同的角度测度了研究对象的相似性。
在数据采集过程中,一般可以用三种方式采集数据:二分类型数据、等级类型 数据和连续类型数据。在进行聚类分析时可以根据不同的数据特点采用相应的测度 方法。
尽量避免绝对数据。
研究个案 A B C
受教育年限 10 16 6
年收入(万元) 2
1.5 1
年收入(元) 20000 15000 10000
A、B、C在不同距离单位时的距离图
A
B
B
10.01
C
A
10000
C
单位:万元
第6页,共8页。
单位:元
聚类分析
四、常用两种聚类分析方法
1.快速聚类法
快速聚类过程是初始分类的有效方法。适用于大容量样本的情形,由用户指定须聚类的 类数之后,系统采用标准迭代算法进行运算,把所有的个案归并在不同的类中。
m维空间中点与点之间的某种距离就可用来描述样品之间的亲疏程度。 而聚类分析则较常使用于将变量属性相似程度较高的观察值,加以分类,使类与类间的异质性达到最大,而同一类的几个观察值同质性很高。 ③对数据进行变换处理,(如标准化或规格化);
mm维维空 空间间中中点点与与点点实之之际间间的的应某某用种种距距时离离,就就可可两用用者来来描描的述述主样样品品要之之差间间的的别亲亲在疏疏程程于度度因。。子分析是针对“变量”予以分组,而聚类分析 按照这种方则法是不断将进“行合观并察,直值到个把所体有”的样予品以合为分一组个,大类亦为即止。因子分析时,根据因变量(题项)间关系密切与 四⑦、最常 后用绘两制否种系,聚统类聚将分类变析谱方系量法图予,按以不分同的类分(类标分准为或不几同个的层分类面原因则,子得)出不;同而的分聚类类结果分。析则较常使用于将变量属性相似 从数据结构程和度统计较形高式上的看观,因察子值分析,是加一种以“横分向类合并,”的使方类法,与聚类类分间析的则是异一质种“性纵向达合到并”最的方大法,。 而同一类的几个观察值 适每用一于 种大方容法同量都质样从本不性的同很情的形角高,度。由测用度户了指研定究须对聚象类的的相类似数性之。后,系统采用标准迭代算法进行运算,把所有的个案归并在不同的类中。 研究学生学业差异、因教师素教分学水析平:等等横,向都需简要化对研,究聚对象类进分行分析类:。纵向分组

聚类分析大数据课件

聚类分析大数据课件

5
Techniques
第七章 聚类分析
• 什么是聚类分析? • 数据类型及其相似性与非相似性计算 • 算法复杂性及近似算法概念 • 划分方法
– k-center、k-cluster、k-means、谱聚类NCut • 层次方法
– 单链接与全链接
2024年8月6日星期二
Data Mining: Concepts and
Data Mining: Concepts and
26
Techniques
天河一号有关数据
• 天河一号由140个机柜组成,占地约70 0平方米,总重量约160吨。
• 6144个通用处理器, 5120个加速处理器,内 存总容量98TB,存储容量为2PB 。
• 峰值运算速度为每秒4700万亿次、持续运算 速度2507万亿次每秒浮点运算。
解决方案:启发式方法与近似算法!
2024年8月6日星期二
Data Mining: Concepts and
28
Techniques
一些定义
• P = {C1, C2, …, Ck}:n个对象的一个划分,满足条件
Ci (i = 1, 2, …, k), V = iCi, 及Ci Cj = (i j)。
• k-Center:最大半径最小化
min r(P)
PPnk
k 3: NP-Hard问题!
• k-Cluster:最大直径最小化:
min d (P)
PPnk
k 3: NP-Hard问题!
2024年8月6日星期二
Data Mining: Concepts and
30
Techniques
一些常见的优化准则
d(i, j) q (| xi1 x j1 |q | xi2 x j2 |q ...| xip x jp |q)

聚类分析详解ppt课件

聚类分析详解ppt课件

以上我们对例6.3.1采用了多种系统聚类法进行聚类,其结果 都是相同的,原因是该例只有很少几个样品,此时聚类的过 程不易有什么变化。一般来说,只要聚类的样品数目不是太 少,各种聚类方法所产生的聚类结果一般是不同的,甚至会 有大的差异。从下面例子中可以看到这一点。
动态聚类法(快速聚类)
(4) 对D1 重复上述对D0 的两步得 D2,如此下去 直至所有元素合并成一类为止。
如果某一步Dm中最小的元素不止一个,则称此现 象为结(tie),对应这些最小元素的类可以任选一对 合并或同时合并。
27
二、最长距离法
类与类之间的距离定义为两类最远样品间的距离, 即
DKL
max
iGK , jGL
聚类分析应注意的问题
(1)所选择的变量应符合聚类的要求
如果希望依照学校的科研情况对高校进行分类,那么可以 选择参加科研的人数、年投入经费、立项课题数、支出经 费、科研成果数、获奖数等变量,而不应选择诸如在校学 生人数、校园面积、年用水量等变量。因为它们不符合聚 类的要求,分类的结果也就无法真实地反映科研分类的情 况。
主要内容
引言 聚类分析原理 聚类分析的种类 聚类分析应注意的问题 聚类分析应用 聚类分析工具及案例分析
聚类分析的种类
(1)系统聚类法(也叫分层聚类或层次聚类) (2)动态聚类法(也叫快速聚类) (3)模糊聚类法 (4)图论聚类法
系统聚类法
对比
常用的系统聚类方法
一、最短距离法 二、最长距离法 三、中间距离法 四、类平均法 五、重心法 六、离差平方和法(Ward方法)
对比
k均值法的基本步骤
(1)选择k个样品作为初始凝聚点,或者将所有样品分成k 个初始类,然后将这k个类的重心(均值)作为初始凝聚点。
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
(i ) ( A , B ) ( B , A ) ( ii ) (A, B) 0 (iii) (A, B) 随 A , B 之 间间的相似性增
(A, 其中,
B)

称为个体A与B之间的相似系数, rkl
和sij因为虽然满足上述性质(i),却并不满足性 质(ii),但是经过7.1和7.2的变换后就满足了。
找出其中的最小值,以确定最佳分割点。最小值 记为:
v m ( 2 ) min
* 1 i m 1
vm (2 | i)
(m 2,3,...n)
(3)由vm*(2)及V中的元素计算
1 p
p
d
ij

k 1
( x ik x
jk
)
2
III Pearson距离
m
d
ij


k 1
( x ik x sk
2
jk
)
2
IV Mahalanobis距离
d ij ( x i x j ) S
1
( xi x j )
上述距离系数是对时间点而言的,对空间点
之间距离的度量可以类似地定义,只需将i,j换
应该注意的是,不同的目的选用不同的指标作为分 类的依据。例如,对少年为选拔运动员所选用的指
标就不同于为分课外活动小组所选用的指标,对啤
酒按价格进行分类和按成分进行分类所选用的指标 也是不同的。
2.变量聚类
变量聚类在统计学中又称为R型聚类。
反映同一事物特点的变量有很多,我们往往
根据所研究的问题选择部分变量对事物的某一方 面进行研究。由于人类对客观事物的认识是有限 的,往往难以找出真正彼此独立的有代表性的变 量,而影响对问题的进一步认识和研究。
* *
*
* * *
* * *
*
空间中的p个点
例: 设有p=6个空间点的要素场,计算它们的相
关阵及相关距离系数,表中上三角阵列出各点之 间相关系数,下三角阵列出相关距离系数,系数 以弧度为单位。从相关距离系数阵出发作逐级归 并。 第一级根据相似系数最小为最相似的原则把 l 与 2点归为一类,其相似水平 (记为α)定义为它们 间的距离即为0.142。 第二级考察在3,4,5,6点中哪一点与第一级 的组最相似,即分别计算
例如,在回归分析中由于自变量的共线性导
致偏回归系数不能真正反映自变量对因变量的 影响,等等。 因此,往往先要进行变量聚类,找出彼此独 立且有代表性的自变量,而又不丢失大部分信 息(如主成分分析)。
在生产活动中也有很多需要进行变量聚类的 实例:制衣业制定衣服型号就是根据人体各部分 尺寸数据找出最有代表性的指标,如身长、胸围 、裤长、腰围等作为上衣及裤子的代表性指标。 制鞋业中制定鞋的型号也是如此。 变量聚类使批量生产成为可能。
无论哪种聚类分析得出的结论都是为了某种
目的所做的工作,往往并非在自然界真实存在。
常用的聚类方法
逐步并类法 :一开始,每个样品自成一类,然后按
一定的规则每次缩小一类,直到所有的样品都成为
“一类”为止。又称为“合二为一” 逐步分解法:一开始,所有样品的全体成为一类,
然后按一定的规则每次将一类分为两类,直到无法
各段变差之和作为某种分割的优劣标准,以最小
者为最优。因此变差的计算是十分重要的。
变差的计算 设一变量的有序样本x1,x2,….xn,分为若干
段,
由 第 i 个 值 到 第 j 个 值 (j=1 , 2 . … , n-
1;j>i)的某段变差计算公式为
j
v (i, j ) w here x (i, j )
可分为止。又称“一分为二”。
调优法:先给定一个初始分类,按照某种最优准则
,不断调整分类,最终得到合理的分类。
§1 相似性度量
在聚类分析中,需要对不同个体(空间点或
时间点)进行相似分析,相似的就归为一类, 客观地度量任两个个体的相似程度大致有下面 几种指标: 相关距离系数
相似系数
1. 相关距离系数
在实际问题中,研究 n 个时间观测点之间
的相关系数没有明显的物理意义。 因为,在计算两时间点相关系数时,要用 到空间点的平均值和方差,再加上如果变量是 不同气象要素时,在实际解释上更为困难。
虽然rkl和sij是衡量两个空间点和时间点相关程度
的 ,但还不能用它们作为聚类过程的相似性系 数,因为一般的相似系数应具有如下性质:
第7章 聚类分析
第3章 判别分析
第七章 聚类分析
分类学是人类认识世界的基础科学研究、社会科学研究、工农业生产各个领域。
在大气科学研究中,存在着两种不同的分类问
题:
1)事先不知道分类的类别和分类数目,也不 清楚样本的属性,需要根据一定的规则进行分类— 聚类问题; 2)事先已经知道分类的类别,用因子判定预
( p ) (
k 1
x ik x
jk
)
p
(1) p=1,域块距离(Block distance)
m
d
ij
(1 )

k 1
x ik x
jk
(2) p=2, 欧氏距离( Euclidean 距离)
m
d
ij
(2)

k 1
( x ik x
jk
)
2
实际中更常用平方欧氏距离
II 平均距离
基本原理
第二步把其余的组与第一步合并组进行比较, 以哪一组与它最相似为原则进行归并。由于相 似系数具有可加性,可用平均相似系数作衡量 判据。
如此下去,每一次都将“最相似”(或“最近”)
的两组归并,直到所有个体归并为一组为止。
归并过程可制成枝形图(或称树图)。
* * * *
* * *
**
* * * **
( 12 14 24 ) 1 . 281 ( 12 15 25 ) 1 . 906 ( 12 16 26 ) 1 . 902
其中以 θ(1,2,3) 为最小,故 3 点归到 1 , 2 点的一类, 相似水平为0.393。
但比这一级距离还小的有θ56=0.330,故实际上在这
第2步:重新计算串组后的距离系数矩阵D(1)。 做法是将已经合并的1,5点看做时间空间中的 一个新点,记为15。其与其它数据点之间的距 离系数用前一步距离系数的平均值代替。
例如,计算第K个点(k=2,3,4,6)与15点的
新距离系数
d
(1 ) k ;15
1 (d 2
(0) k ;1
d
(0) k ;5
)
第3步:以新的相似距离系数矩阵为基础,重复
第2步的过程,做新的合并后,又重新计算串组 后的距离系数矩阵。 最后的结果是一个树状图。其中的横坐标叫做 “串组水平”。 如果分为2类,则1951、1955和1953年为一类, 代表气温是下降型;1952、1956和1954年为另 一类,代表气温有上升趋势类。
2* 1*
3*
4*
6* 5*
(1 , 2 , 3 ) (1 , 2 , 4 ) (1 , 2 , 5 ) (1 , 2 , 6 )
1 3 1 3 1 3 1 3
( 12 13 23 )
1 3
( 0 . 142 0 . 547 0 . 491 ) 0 . 393
(y
i 1
i
y)
2
2.相似系数
研究要素场不同时间点之间的相似程度。 衡量第 i 个时间点与第 j 个时间点之间相似程度用:
ij arccos
where
s ij
p p
s ij
x ik x
p 2 ik jk

k 1

k 1
x

k 1
x
2 jk
上面的sij衡量了两个时间点之间的相关程度,它常在Q 型因子分析中用来代替两个变量的相关系数。
聚类分析的原则是同一类中的个体有较大的 相似性,不同类中的个体差异很大。 根据分类对象的不同,分为样本聚类和变量 聚类。
1.样品聚类 样品聚类在统计学中又称为Q型聚类。 就是对事件 Cases( 或称样品或称观测量)进行 聚类。是根据被观测的对象的各种特征,即反映被 观测对象特征的各变量值进行分类。 样品聚类是进行判别分析的之前的必要工作。
用来研究要素场中不同空间点之间的相似程度
。设对 p 个空间点的要素场,抽取 n 个时间点的样
本资料,那么衡量第 k 个与第 l 个空间点之间的 相似程度可用相关距离系数:
kl arccos rkl
n
(x
i
x )( yi y )
n 2
相关系数
r
i 1 n
(x
i 1
i
x)
可见第 4 点与 1 , 2 , 3 点最相似,归为一类,记
此为I类;5,6点为II类。
6个空间点可分
为二类,分级水平为 1.091 . 分 类 过 程 可 绘成树图. 由图可见,若要
把 6 个点分为三类,
则1,2,3为一类,4 点独成一类,5,6点 为另一类。分类水平 为0.393.
§3
平均权重串组法
θ及α的数值变化在0到π之间,
θ=0时为完全相似,
θ=π时则为完全不相似。
不同个体的相似系数还可以进行相加或平均, 这些在原来的rkl和sij中都是不能解释的。
3.距离系数 在聚类分析中,也可以使用距离系数进行聚类, 距离比较近的个体可以归为一类。
I Minkovski 距离
m p 1
d
ij
一水平下还应有另一类,即5,6点组成的一类。 第三级,余下的第4点应归哪一类,计算
相关文档
最新文档