PubMed检索示例-作者单位的检索
pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。
例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。
pubmed检索

NCBI PubMed简介与检索指南黄庆第三军医大学西南医院检验科(重庆市 400038)注:在本文中的叙述中,所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来,如以基因治疗为主题词检索,在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。
一. PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部(NIH, National Institues of Health)的国家医学图书馆(NLM, Nationa Library of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI, National Center for Biotechnology Information)提供,可通过NCBI网站的Entrez检索系统(Entrez retrieval system)进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。
此外,PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务,与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据,提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统,可检索NCBI网站的主要数据库,如PubMed,核酸与蛋白序列,基因组序列,蛋白结构,OMIM 等等。
PubMed是一类提供生物医学引文资料检索的数据库,此外,它还针对网上资源,提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源,如核酸蛋白序列、OMIM入口等,以及其它生命科学数据库。
其引文内容的提供方式,由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。
如果该出版商有网站,则NCBI会提供相应的网络出口。
MEDLINE及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。
PUBMED检索_非常全面!!

期刊检索
如果刊名是Mesh词(如:Gene Therapy、Science、Cell),或刊名 是单个单词(Scanning),如只想将 其作为刊名检索,需加刊名字段标识 [ta]。 推荐使用刊名全称或缩写查找, 因为有些过早的文献没有ISSN。
词组检索
对于输入PubMed的多词词组,PubMed会 查询词组索引,如果查到相应词组则将其作为一 个检索词来检索。如果未查到相应词组,则将其 拆分成单个词,分别进行检索并以逻辑和 (AND)进行组配,如:single cell相当于检索 single AND cell。可通过如下方式强制将其作 为一个词组进行检索:
自动匹配检索
对于输入检索框中未加标识的检索词, PubMed依次在下列词表中查找匹配的内容: 1.MeSH translation table 2.Journals translation table 3.Full Author translation table 4.Author index 5.Full Investigator (Collaborator) translation table
PubMed检索
2012年9月
概 况
PubMed(/pubmed)
是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM) 的国家生物 技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)开发 的一个以网络为基础的医学文献检索 系统,是NCBI庞大的检索体系Entrez的 一部分。
检索字段及标识符
MH(Mesh Terms): 主题词 MAJR(Mesh Major Topic): 主要主题词 PG(Pagination): 页码(起页) PT(Publication Type): 出版类型 SB(Subset): 文献子集 SH(Mesh Subheadings): 副主题词 TA(Journal Title Abbreviation): 刊名缩写 TI(Title): 文章题名 TIAB(Title/Abstract): 题名摘要 TW(Text Words): 文本词 VI(Volume): 卷号
PubMed检索

PubMed检索PubMed检索步骤1、PUBMED 词汇自动转换功能:例如:在键入“Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]),看一下主题词是什么?所用词汇是否合适?然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检中的篇数、所用时间。
也可点击“limit"进行检索。
检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号进行强制检索词检索。
2、著者强制检索:作者用双引号括起来"zhang y" [au];比较一下分别输入zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au];"zhang y" [au] 检索结果的区别。
3、刊名检索:可用刊名全称或缩写、ISSN号,再加上刊名子段限定符,如:输入J Tradit Chin Med [ta] ,然后敲回车或点击Go,系统将在刊名子段中检索,并显示检索结果。
点击“History”可以查看检索历史。
4、布尔逻辑检索:系统允许使用布尔逻辑检索,布尔逻辑运算符要大写(AND、OR或NOT)。
5、剪贴板:使用"send to Clipboard",可把检索结果存入剪贴板,剪贴板最多可存放500条记录。
只要剪贴板中有记录,就可点击Clipboard查看其中的记录(记录为summary格式),粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录题录。
6、当前页显示篇数默认为20篇,如果需要可调整当前页的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。
检索结果默认summary 格式(题录格式),可以选择display下拉菜单中的Abstract(文摘),以文摘格式显示。
如何使用pubmed进行 文献检索

一、PubMed简介
• 很多医务工作者宁可在每次检索时 都花上成倍的时间,却不愿花上几个小 时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事, 必先利其器",PubMed就好像一把功能强 大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动 扳机就可以发射子弹,更重要的是,你 要知道如何利用准星瞄准,如何把这把 枪的功能发挥到及至。
• 回溯年代:1948年至今 • 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围:
• 基础生命科学 临床生命科学
• 生物科学
解剖学
• 组织学
化学与药物
• 心理学
社会医学
• 农业
医技设备学
• 医技工业学
医学信息学
使用词表:MeSH(医学主题词表)
4.2 PreMEDLINE
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
• Publication Type[PT]:出版类型 review[pt]
• Title[TI] :文章题名 • Text Words[TW]:文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词,PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换,然后进行检索。 ① MeSH表:包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表: 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表:文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表: PubMed所收录的的作者姓名组成。
Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识Pubmed是医学专业常用的数据库,对于医学科研工作至关重要,但是对于Pubmed最基本的检索知识你都了解吗?下面介绍了Pubmed三种检索方式,检验一下你都get到了吗?Pubmed主界面1基本检索引文状态标记值分为:[PubMed-indexed for MEDLINE]、[PubMed-in process]、[PubMed-OLDMEDLINE]、[PubMed – as supplied by publisher]四种状态。
[PubMed-indexed for MEDLINE]:被MEDLINE所收录并被标引MeSH主题词,具有完整的书目题录信息,检索此类文章方法:在检索框输入medline [sb]。
[PubMed-in process]:每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、每星期当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。
检索此类文章方法:在检索框输入inprocess [sb]。
[PubMed-OLDMEDLINE]:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。
OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要。
检索此类文章方法:在检索框输入oldmedline [sb] [PubMed –as supplied by publisher]:是由出版商提供的电子文献MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到In Process Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID 而没有MEDLINE UI。
布尔逻辑运算符(检索时需大写)AND可用来表示其所连接的两个检索项的交叉部分,也即交集部分。
pubmed引文检索

pubmed引文检索
在PubMed上进行引文检索(Citation Search)是一种查找特定文献的方法。
这允许你查找引用了或被引用了某一篇文章的其他文章。
以下是在PubMed上执行引文检索的一般步骤:
1.搜索原始文章:进入PubMed,使用文章的标题、作者或PMID(PubMed唯一标识符)等信息,找到你感兴趣的原始文章。
2.进入文章页面:点击文章标题,进入文章的详细页面。
3.找到引文选项:在文章详细页面中,查找引文或相关记录的选项。
通常,这个选项位于页面的右侧或下方。
4.进行引文检索:点击引文或相关记录的链接,这将显示引用了或被引用了原始文章的其他文章列表。
5.筛选和浏览引文:根据需要,你可以使用PubMed提供的筛选选项来缩小结果,例如按日期、文章类型等。
浏览引文列表,找到你感兴趣的文献。
6.查看引文详细信息:点击引文列表中的文献标题,以查看有关该文献的详细信息。
请注意,有时不是所有的引文信息都会在PubMed中显示,这取决于文献的可用性和PubMed数据库的更新。
此外,引文检索的准确性也受到引用格式和文献数据库互操作性的影响。
PUBMED数据库检索

提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries
PUBMED具有自动词语匹配功能,系统将按顺 序自动使用如下3种索引,对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词,系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献?
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录
总
结
充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索,重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献
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共检出1264篇文章。
但是,惊现三医大作者的文献!错误 检出了不需要的文献,检索出现了问 题。。。
检出结果右下侧可查看系统 实际进行的检索操作 (details),可用来检查检 索中出现的问题(注意学会 阅读检索式)。
原来系统将“chongqing”、“medical”、“university” 分开检索后再进行逻辑与的运算(请回忆PubMed词 组检索规则),即只要作者地址字段中同时含有这三 个词的记录就会被检出。而我们的检索需求是将这三 个词作为一个整体进行检索。可加“”来解决这一问
但新的问题又产生了:浏览 结果时发现记录28,重庆医 科大学还有其他翻译方法:
Chongqing University of Medical Science。如果用加 引号的检索词“chongqing medical university”将无法 检出将重庆医科大学写成这 种写法的文献。如何解决? 这相当于同义词,同一概念 有不同表达方式。要检全文 献,将同义词全部写出,用 逻辑或连接起来即可。
Chongqing medical university
在检索框中输入检索词(可利用在线翻 点击Search按钮 译工具或电子词典翻译检索词,检索词 不区分大小写)
出版时间限定 原文语种限定
检索词所在字段
4.查看检索结果
改变显示设置
检索结果默认以题录格式显示,只 显示标题、作者、出处、PMID(文 献标题有“[ ]”,表示原文语种非英 文)。可改成文献格式,查看作者 地址字段,验证检索结果是否满意
PubMed检索示例:
查找PubMed收录的2005年以来重 庆医科大学作者发表的中文文献
1. 分析课题:
• 检索条件:
要查找XXX数据库收录的文献,用此数据库检索即可。 此外本题有三个检索条件: ➢ 重庆医科大学作者(指作者单位为重庆医科大学) ➢ 2005年至今(指文献出版时间为2005年至今) ➢ 中文文献(指原文语种为中文)[PubMed主要收录的 是英文文献,但也收录了其他一些语种的文献] 。
检查details,没有问题。
*更简单的方法
• 选好限定条件后利用高级检索来进行检索词的输入。 因为高级检索也可进行字段限定检索
点击进入高级检索
①选择入口字段 ②输入检索词
Chongqing medical university
③点击index按钮
④点击AND按钮
①选择入口字段 ②输入检索词
5.修正检索策略
检出结果数量发生了很大的变化。
此次检索我们没有再次进入Limits选择限定条件。因为限 定条件一旦选定,若不取消,则在后面的检索中始终存在。 因此,请注意:检索完成后,若不再需要此限定条件,一 定要点击“Remove”去除掉限定条件;若限定条件发生变 化,则点击“Change”重新进入Limits进行修改。
• 注意利用Search Details来检查自己的检索式是不是 有问题。
此状态下点击“Result”下的数字,就可查看具体的检索结果了。
6.对结果进行处理
对当前检索式进行RSS示记录数、排序
输入处理:发送到 文件、剪帖板、文 献集、邮件。。。
结果过滤:所有检出文 献、综述(review)、免 费全文(Free Full Text)
小结
• 检索时一定要注意选词! PubMed的词语自动转换功 能主要是针对主题内容的检索而言的,如果是检索某 机构作者发表的文献,一定要事先了解这个机构的名 称有哪些写法。不同写法之间用OR连接。可考虑使 用Index功能。
• 如果是检索某一主题内容的文献,可以不用考虑同义 词,直接在基本检索状态输入检索词就可以了(但词 组检索不能加引号,否则将关闭自动转换功能)。
Chongqing medical university
③点击index按钮
⑤输入其他检索词
Chongqing university of medical science
⑥点击index按钮
⑧点击OR按钮
⑦选择需要的词
发现我们刚刚还漏掉了另 一个检索词
⑨点击Search或Preview
若点击Preview,则不直接显示检索具体结果,而是在下方的检索史(Search History)中 预览结果数量。请比较#2和#4的检索结果。由于我们前面进行的检索(#2)漏掉了一个 检索词,导致检索结果少了202篇。
• 检索条件之间的逻辑关系:
三个检索条件要同时满足,它们之间是逻辑与的关系。
2.选择检索途径
• 作者单位为字段限定检索,即检索入口为 作者地址(affiliation);语种和出版时间均 可在Limits当中进行限定。因此,可在 Limits当中选择限定条件,再利用检索输入 框输入检索词。
3.进入Limits进行检索