PubMed检索示例-作者单位的检索

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pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。

它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。

二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。

基本检索的结果会按照相关性排序。

2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。

高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。

3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。

例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。

三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。

检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。

四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。

可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。

2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。

例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。

3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。

五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。

pubmed检索

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NCBI PubMed简介与检索指南黄庆第三军医大学西南医院检验科(重庆市 400038)注:在本文中的叙述中,所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来,如以基因治疗为主题词检索,在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。

一. PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部(NIH, National Institues of Health)的国家医学图书馆(NLM, Nationa Library of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI, National Center for Biotechnology Information)提供,可通过NCBI网站的Entrez检索系统(Entrez retrieval system)进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。

此外,PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务,与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据,提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。

Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统,可检索NCBI网站的主要数据库,如PubMed,核酸与蛋白序列,基因组序列,蛋白结构,OMIM 等等。

PubMed是一类提供生物医学引文资料检索的数据库,此外,它还针对网上资源,提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源,如核酸蛋白序列、OMIM入口等,以及其它生命科学数据库。

其引文内容的提供方式,由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。

如果该出版商有网站,则NCBI会提供相应的网络出口。

MEDLINE及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。

PUBMED检索_非常全面!!

PUBMED检索_非常全面!!

期刊检索
如果刊名是Mesh词(如:Gene Therapy、Science、Cell),或刊名 是单个单词(Scanning),如只想将 其作为刊名检索,需加刊名字段标识 [ta]。 推荐使用刊名全称或缩写查找, 因为有些过早的文献没有ISSN。
词组检索
对于输入PubMed的多词词组,PubMed会 查询词组索引,如果查到相应词组则将其作为一 个检索词来检索。如果未查到相应词组,则将其 拆分成单个词,分别进行检索并以逻辑和 (AND)进行组配,如:single cell相当于检索 single AND cell。可通过如下方式强制将其作 为一个词组进行检索:
自动匹配检索
对于输入检索框中未加标识的检索词, PubMed依次在下列词表中查找匹配的内容: 1.MeSH translation table 2.Journals translation table 3.Full Author translation table 4.Author index 5.Full Investigator (Collaborator) translation table
PubMed检索
2012年9月
概 况
PubMed(/pubmed)
是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM) 的国家生物 技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)开发 的一个以网络为基础的医学文献检索 系统,是NCBI庞大的检索体系Entrez的 一部分。
检索字段及标识符
MH(Mesh Terms): 主题词 MAJR(Mesh Major Topic): 主要主题词 PG(Pagination): 页码(起页) PT(Publication Type): 出版类型 SB(Subset): 文献子集 SH(Mesh Subheadings): 副主题词 TA(Journal Title Abbreviation): 刊名缩写 TI(Title): 文章题名 TIAB(Title/Abstract): 题名摘要 TW(Text Words): 文本词 VI(Volume): 卷号

PubMed检索

PubMed检索

PubMed检索PubMed检索步骤1、PUBMED 词汇自动转换功能:例如:在键入“Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]),看一下主题词是什么?所用词汇是否合适?然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检中的篇数、所用时间。

也可点击“limit"进行检索。

检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号进行强制检索词检索。

2、著者强制检索:作者用双引号括起来"zhang y" [au];比较一下分别输入zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au];"zhang y" [au] 检索结果的区别。

3、刊名检索:可用刊名全称或缩写、ISSN号,再加上刊名子段限定符,如:输入J Tradit Chin Med [ta] ,然后敲回车或点击Go,系统将在刊名子段中检索,并显示检索结果。

点击“History”可以查看检索历史。

4、布尔逻辑检索:系统允许使用布尔逻辑检索,布尔逻辑运算符要大写(AND、OR或NOT)。

5、剪贴板:使用"send to Clipboard",可把检索结果存入剪贴板,剪贴板最多可存放500条记录。

只要剪贴板中有记录,就可点击Clipboard查看其中的记录(记录为summary格式),粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录题录。

6、当前页显示篇数默认为20篇,如果需要可调整当前页的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。

检索结果默认summary 格式(题录格式),可以选择display下拉菜单中的Abstract(文摘),以文摘格式显示。

如何使用pubmed进行 文献检索

如何使用pubmed进行 文献检索
1997年9月26日, MEDLINE网络版开通, 取名PubMed,并向全球免费开放。
一、PubMed简介
• 很多医务工作者宁可在每次检索时 都花上成倍的时间,却不愿花上几个小 时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事, 必先利其器",PubMed就好像一把功能强 大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动 扳机就可以发射子弹,更重要的是,你 要知道如何利用准星瞄准,如何把这把 枪的功能发挥到及至。
• 回溯年代:1948年至今 • 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围:
• 基础生命科学 临床生命科学
• 生物科学
解剖学
• 组织学
化学与药物
• 心理学
社会医学
• 农业
医技设备学
• 医技工业学
医学信息学
使用词表:MeSH(医学主题词表)
4.2 PreMEDLINE
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
• Publication Type[PT]:出版类型 review[pt]
• Title[TI] :文章题名 • Text Words[TW]:文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词,PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换,然后进行检索。 ① MeSH表:包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表: 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表:文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表: PubMed所收录的的作者姓名组成。

Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识

Pubmed基本的检索知识Pubmed是医学专业常用的数据库,对于医学科研工作至关重要,但是对于Pubmed最基本的检索知识你都了解吗?下面介绍了Pubmed三种检索方式,检验一下你都get到了吗?Pubmed主界面1基本检索引文状态标记值分为:[PubMed-indexed for MEDLINE]、[PubMed-in process]、[PubMed-OLDMEDLINE]、[PubMed – as supplied by publisher]四种状态。

[PubMed-indexed for MEDLINE]:被MEDLINE所收录并被标引MeSH主题词,具有完整的书目题录信息,检索此类文章方法:在检索框输入medline [sb]。

[PubMed-in process]:每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、每星期当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。

检索此类文章方法:在检索框输入inprocess [sb]。

[PubMed-OLDMEDLINE]:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。

OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要。

检索此类文章方法:在检索框输入oldmedline [sb] [PubMed –as supplied by publisher]:是由出版商提供的电子文献MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到In Process Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID 而没有MEDLINE UI。

布尔逻辑运算符(检索时需大写)AND可用来表示其所连接的两个检索项的交叉部分,也即交集部分。

pubmed引文检索

pubmed引文检索

pubmed引文检索
在PubMed上进行引文检索(Citation Search)是一种查找特定文献的方法。

这允许你查找引用了或被引用了某一篇文章的其他文章。

以下是在PubMed上执行引文检索的一般步骤:
1.搜索原始文章:进入PubMed,使用文章的标题、作者或PMID(PubMed唯一标识符)等信息,找到你感兴趣的原始文章。

2.进入文章页面:点击文章标题,进入文章的详细页面。

3.找到引文选项:在文章详细页面中,查找引文或相关记录的选项。

通常,这个选项位于页面的右侧或下方。

4.进行引文检索:点击引文或相关记录的链接,这将显示引用了或被引用了原始文章的其他文章列表。

5.筛选和浏览引文:根据需要,你可以使用PubMed提供的筛选选项来缩小结果,例如按日期、文章类型等。

浏览引文列表,找到你感兴趣的文献。

6.查看引文详细信息:点击引文列表中的文献标题,以查看有关该文献的详细信息。

请注意,有时不是所有的引文信息都会在PubMed中显示,这取决于文献的可用性和PubMed数据库的更新。

此外,引文检索的准确性也受到引用格式和文献数据库互操作性的影响。

PUBMED数据库检索

PUBMED数据库检索
PubMed - indexed for MEDLINE



PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法

基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries

PUBMED具有自动词语匹配功能,系统将按顺 序自动使用如下3种索引,对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词,系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献?
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录


充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索,重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索



PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献
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共检出1264篇文章。
但是,惊现三医大作者的文献!错误 检出了不需要的文献,检索出现了问 题。。。
检出结果右下侧可查看系统 实际进行的检索操作 (details),可用来检查检 索中出现的问题(注意学会 阅读检索式)。
原来系统将“chongqing”、“medical”、“university” 分开检索后再进行逻辑与的运算(请回忆PubMed词 组检索规则),即只要作者地址字段中同时含有这三 个词的记录就会被检出。而我们的检索需求是将这三 个词作为一个整体进行检索。可加“”来解决这一问
但新的问题又产生了:浏览 结果时发现记录28,重庆医 科大学还有其他翻译方法:
Chongqing University of Medical Science。如果用加 引号的检索词“chongqing medical university”将无法 检出将重庆医科大学写成这 种写法的文献。如何解决? 这相当于同义词,同一概念 有不同表达方式。要检全文 献,将同义词全部写出,用 逻辑或连接起来即可。
Chongqing medical university
在检索框中输入检索词(可利用在线翻 点击Search按钮 译工具或电子词典翻译检索词,检索词 不区分大小写)
出版时间限定 原文语种限定
检索词所在字段
4.查看检索结果
改变显示设置
检索结果默认以题录格式显示,只 显示标题、作者、出处、PMID(文 献标题有“[ ]”,表示原文语种非英 文)。可改成文献格式,查看作者 地址字段,验证检索结果是否满意
PubMed检索示例:
查找PubMed收录的2005年以来重 庆医科大学作者发表的中文文献
1. 分析课题:
• 检索条件:
要查找XXX数据库收录的文献,用此数据库检索即可。 此外本题有三个检索条件: ➢ 重庆医科大学作者(指作者单位为重庆医科大学) ➢ 2005年至今(指文献出版时间为2005年至今) ➢ 中文文献(指原文语种为中文)[PubMed主要收录的 是英文文献,但也收录了其他一些语种的文献] 。
检查details,没有问题。
*更简单的方法
• 选好限定条件后利用高级检索来进行检索词的输入。 因为高级检索也可进行字段限定检索
点击进入高级检索
①选择入口字段 ②输入检索词
Chongqing medical university
③点击index按钮
④点击AND按钮
①选择入口字段 ②输入检索词
5.修正检索策略
检出结果数量发生了很大的变化。
此次检索我们没有再次进入Limits选择限定条件。因为限 定条件一旦选定,若不取消,则在后面的检索中始终存在。 因此,请注意:检索完成后,若不再需要此限定条件,一 定要点击“Remove”去除掉限定条件;若限定条件发生变 化,则点击“Change”重新进入Limits进行修改。
• 注意利用Search Details来检查自己的检索式是不是 有问题。
此状态下点击“Result”下的数字,就可查看具体的检索结果了。
6.对结果进行处理
对当前检索式进行RSS示记录数、排序
输入处理:发送到 文件、剪帖板、文 献集、邮件。。。
结果过滤:所有检出文 献、综述(review)、免 费全文(Free Full Text)
小结
• 检索时一定要注意选词! PubMed的词语自动转换功 能主要是针对主题内容的检索而言的,如果是检索某 机构作者发表的文献,一定要事先了解这个机构的名 称有哪些写法。不同写法之间用OR连接。可考虑使 用Index功能。
• 如果是检索某一主题内容的文献,可以不用考虑同义 词,直接在基本检索状态输入检索词就可以了(但词 组检索不能加引号,否则将关闭自动转换功能)。
Chongqing medical university
③点击index按钮
⑤输入其他检索词
Chongqing university of medical science
⑥点击index按钮
⑧点击OR按钮
⑦选择需要的词
发现我们刚刚还漏掉了另 一个检索词
⑨点击Search或Preview
若点击Preview,则不直接显示检索具体结果,而是在下方的检索史(Search History)中 预览结果数量。请比较#2和#4的检索结果。由于我们前面进行的检索(#2)漏掉了一个 检索词,导致检索结果少了202篇。
• 检索条件之间的逻辑关系:
三个检索条件要同时满足,它们之间是逻辑与的关系。
2.选择检索途径
• 作者单位为字段限定检索,即检索入口为 作者地址(affiliation);语种和出版时间均 可在Limits当中进行限定。因此,可在 Limits当中选择限定条件,再利用检索输入 框输入检索词。
3.进入Limits进行检索
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