相关分析及其原理(全)

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全基因组关联分析的原理和方法

全基因组关联分析的原理和方法

全基因组关联分析(Genome-wide association study;GWAS)是应用基因组中数以百万计的单核苷酸多态性(single nucleotide ploymorphism ,SNP)为分子遗传标记,进行全基因组水平上的对照分析或相关性分析,通过比较发现影响复杂性状的基因变异的一种新策略。

随着基因组学研究以及基因芯片技术的发展,人们已通过GWAS方法发现并鉴定了大量与复杂性状相关联的遗传变异。

近年来,这种方法在农业动物重要经济性状主效基因的筛查和鉴定中得到了应用。

全基因组关联方法首先在人类医学领域的研究中得到了极大的重视和应用,尤其是其在复杂疾病研究领域中的应用,使许多重要的复杂疾病的研究取得了突破性进展,因而,全基因组关联分析研究方法的设计原理得到重视。

人类的疾病分为单基因疾病和复杂性疾病。

单基因疾病是指由于单个基因的突变导致的疾病,通过家系连锁分析的定位克隆方法,人们已发现了囊性纤维化、亨廷顿病等大量单基因疾病的致病基因,这些单基因的突变改变了相应的编码蛋白氨基酸序列或者产量,从而产生了符合孟德尔遗传方式的疾病表型。

复杂性疾病是指由于遗传和环境因素的共同作用引起的疾病。

目前已经鉴定出的与人类复杂性疾病相关联的SNP位点有439 个。

全基因组关联分析技术的重大革新及其应用,极大地推动了基因组医学的发展。

(2005年, Science 杂志首次报道了年龄相关性视网膜黄斑变性GWAS结果,在医学界和遗传学界引起了极大的轰动, 此后一系列GWAS陆续展开。

2006 年, 波士顿大学医学院联合哈佛大学等多个研究机构报道了基于佛明翰心脏研究样本关于肥胖的GWAS结果(Herbert 等. 2006);2007 年, Saxena 等多个研究组联合报道了与2 型糖尿病( T2D ) 关联的多个位点, Samani 等则发表了冠心病GWAS结果( Samani 等. 2007); 2008 年, Barrett 等通过GWAS发现了30 个与克罗恩病( Crohns ' disrease) 相关的易感位点; 2009 年, W e is s 等通过GWAS发现了与具有高度遗传性的神经发育疾病——自闭症关联的染色体区域。

回归分析与相关分析

回归分析与相关分析

回归分析与相关分析导言回归分析与相关分析是统计学中常用的两种分析方法,用于研究变量之间的关系。

在本文中,我们将对回归分析和相关分析进行详细探讨,并介绍它们的原理、应用和实例。

一、回归分析回归分析是通过建立一个数学模型来描述一个或多个自变量与因变量之间的关系。

它可以帮助我们预测因变量的取值,并理解自变量对因变量的影响程度。

1.1 简单线性回归简单线性回归是回归分析中最常见的一种方法,它假设自变量和因变量之间存在线性关系。

通过最小二乘法,我们可以得到最佳拟合直线,从而预测因变量的取值。

1.2 多元线性回归多元线性回归是对简单线性回归的拓展,它可以同时考虑多个自变量对因变量的影响。

通过最小二乘法,我们可以得到最佳的多元回归方程,从而预测因变量的取值。

1.3 逻辑回归逻辑回归是回归分析在分类问题上的一种应用。

它能够根据自变量的取值,预测因变量的类别。

逻辑回归常用于预测二分类问题,如预测一个学生是否会被大学录取。

二、相关分析相关分析是研究两个或多个变量之间相关关系的一种方法。

它可以帮助我们了解变量之间的关联程度,以及一个变量是否能够作为另一个变量的预测因子。

2.1 皮尔逊相关系数皮尔逊相关系数是一种衡量两个连续变量之间线性相关程度的统计量。

它的取值范围在-1到1之间,当相关系数接近1时,表示两个变量正相关;当相关系数接近-1时,表示两个变量负相关;当相关系数接近0时,表示两个变量无相关关系。

2.2 斯皮尔曼相关系数斯皮尔曼相关系数是一种衡量两个变量之间的非线性相关程度的统计量。

它的取值范围也在-1到1之间,但它适用于衡量非线性关系和顺序关系。

斯皮尔曼相关系数广泛应用于心理学和社会科学领域。

应用实例为了更好地理解回归分析与相关分析的应用,让我们通过一个实际案例来说明。

假设我们想研究某个国家的人均GDP与教育水平之间的关系。

我们收集了10个州的数据,包括每个州的人均GDP和受教育程度指数。

我们可以利用回归分析来建立一个数学模型,从而预测人均GDP与受教育水平之间的关系。

相关性分析报告(correlationanalysis)

相关性分析报告(correlationanalysis)

相关性分析(correlation analysis)➢概述相关性分析可以用来验证两个变量间的线性关系,从相关系数r我们可以知道两个变量是否呈线性关系、线性关系的强弱,以及是正相关还是负相关。

➢适用场合·当你有成对的数字数据时;·当你画了一张散点图,发现数据有线性关系时;·当你想要用统计的方法测量数据是否落在一条线上时。

➢实施步骤尽管人工可以进行相关性分析,然而计算机软件可以使计算更简便。

按照以下的介绍来使用你的软件。

分析计算出相关性系数r,它介于-l到1之间。

·如果r接近0则两个变量没有线性相关性;·当r接近-l或者1时,说明两个变量线性关系很强;·正的r值代表当y值很小时x值也很小,当y值很大时r值也很大;·负的r值代表当y值很大时x值很小,反之亦然。

➢示例图表5.39到图表5.42给出了两个变量不同关系时的散点图。

图表5.39给出了一个近似完美的线性关系,r=0.98;图表5.40给出了一个弱的负线性相关关系,R=-0. 69,与图表5.39比较,数据散布在更宽的范围内;在图表5.41中,两个变量不相关,r=0.l5;在图表5.42中,相关性分析计算出相同的r值——=0.15,但是,在这个情况下显然两个变量是相关的,尽管不是线性的。

➢注意事项·如果,r=0,则变量不相关,但是可能有弯曲的相关性,如图表5.42那样。

为避免这种情况,首先画出数据的散点图来判断它们的关系。

相关性分析只对于存在线性关系的变量有意义。

·相关性分析可以证实两个变量间关系的强弱,但不能计算出那条回归线,如果想找到最符合的线,请参阅回归分析。

·对于系数的决定,回归分析中使用r2,它是相关系数r一的平方。

END。

spss相关分析的原理及应用

spss相关分析的原理及应用

SPSS相关分析的原理及应用1. 简介SPSS(Statistical Package for the Social Sciences)是一种常用的数据统计和分析软件,广泛应用于社会科学、教育、医学等领域。

其相关分析功能是SPSS的重要组成部分,可用于研究数据中变量之间的关系以及预测未来的趋势。

本文将介绍SPSS相关分析的原理和应用。

2. 原理2.1 相关分析的基本概念相关分析用于研究两个或多个变量之间的关系。

其中最常用的是皮尔逊相关系数(Pearson correlation coefficient),用于衡量连续变量之间的线性相关性。

皮尔逊相关系数的取值范围为-1到1,接近1表示正相关,接近-1表示负相关,接近0表示无相关。

2.2 相关分析的假设在进行相关分析之前,需要满足一定的假设条件。

这些假设包括: - 变量是正态分布的; - 变量之间的关系是线性的; - 变量具有线性相关性。

2.3 相关系数的计算方法在SPSS中,可以使用相关分析功能来计算皮尔逊相关系数。

该功能可以同时计算多个变量之间的相关系数,并自动生成相关矩阵。

相关矩阵展示了所有变量两两之间的相关性,便于进一步分析和解释。

3. 应用3.1 研究变量之间的关系相关分析在社会科学研究中经常用于分析变量之间的关系。

例如,研究人员可以使用相关分析来研究收入与教育水平之间的关系,分析变量之间的相关性可以帮助研究者发现潜在的模式和趋势。

3.2 预测未来的趋势相关分析可用于预测未来的趋势。

例如,一个公司可以使用历史销售数据和市场营销费用作为变量,通过相关分析来预测未来销售额与市场营销费用之间的关系。

这可以帮助公司制定更有效的市场策略和预算安排。

3.3 评估变量之间的相关性相关分析可以帮助研究者评估变量之间的相关性。

例如,在医学研究中,研究人员可以使用相关分析来评估不同药物剂量与患者疾病症状之间的相关性。

这可以帮助研究人员确定最佳药物剂量,并了解不同剂量的效果差异。

典型相关分析

典型相关分析

一、典型相关分析的概念典型相关分析(canonical correlation analysis ) 就是利用综合变量对之间的相关关系来反映两组指标之间的整体相关性的多元统计分析方法。

它的基本原理是:为了从总体上把握两组指标之间的相关关系,分别在两组变量中提取有代表性的两个综合变量U1和V1 (分别为两个变量组中各变量的线性组合),利用这两个综合变量之间的相关关系来反映两组指标之间的整体相关性。

二、条件:典型相关分析有助于综合地描述两组变量之间的典型的相关关系。

其条件是,两组变量都是连续变量,其资料都必须服从多元正态分布。

~*、相关计算如果我们记两组变量的第一对线性组合为U1 1X V1 1Y1(a11 1 1 a21 , , a p1 )1 (11 ,21 , ,q1 )Var (U1) 1Var (X ) 111 1Var (V1) 1Var (Y ) 1 1 22 1 1典型相关分析就是求和,使二者的相关系数达到最大。

1 1典型相关分析希望寻求 a 和b 使得p 达到最大,但是由于随 机变量乘以常数时不改变它们的相关系数, 为了防止不必要的结 果重复出现,最好的限制是令 Var(U) =1和Var (V ) = 11.实测变量标准化;2.求实测变量的相关阵R;XXl,…,X3.求A 和B;A1XXXY 1YYYX B1YY YX1XXXY4、求A 和B 的特征根及特征向量;A 关于 ,的特征向量(a i ,比,…,ap ),求B 关于i的特征向量(bi 1, b i2, •…bi P ) 5、计算Vi 和Wi ;V i b i1X 1 b i2X 21X Y Y Yrp1!qqb ip X p Wiai1Y 1ai2丫 2a iq Y qR「i6、Vi 和Wi 的第i 对典型相关系数应用典型相关分析的场合是:可以使用回归方法, 但有两个或两个以上的因变量;特别是因变量或准则 变量相互间有一定的相关性,无视它们之间相互依赖 的关系而分开处理,研究就毫无意义。

相关分析与回归分析的基本原理

相关分析与回归分析的基本原理

相关分析与回归分析的基本原理1. 引言相关分析与回归分析是统计学中常用的两种数据分析方法,它们可以帮助研究者理解变量之间的关系,并根据这些关系进行预测。

本文将介绍相关分析和回归分析的基本原理,包括其定义、应用场景以及计算方法。

2. 相关分析2.1 定义相关分析是一种用来研究两个或多个变量之间关系的统计方法。

它通过计算相关系数来衡量变量之间的相关性。

相关系数的取值范围为-1到1,其中-1表示完全的负相关,1表示完全的正相关,0表示无相关关系。

2.2 应用场景相关分析可应用于许多领域,如市场研究、医学研究、金融分析等。

例如,在市场研究中,我们可以使用相关分析来研究产品销量与广告投入之间的关系,了解其相关性,并根据相关性进行决策。

2.3 计算方法计算两个变量之间的相关系数可以使用皮尔逊相关系数或斯皮尔曼相关系数。

皮尔逊相关系数适用于连续变量,而斯皮尔曼相关系数适用于有序变量或非线性关系。

3. 回归分析3.1 定义回归分析是一种用来研究变量之间关系的统计方法,其基本思想是通过构建适当的数学模型来描述一个或多个自变量对因变量的影响。

回归分析可以帮助预测未来的观察值,并理解变量之间的因果关系。

3.2 应用场景回归分析可以应用于各种预测和建模的场景。

例如,在金融领域,回归分析可以用来预测股票价格的变动,了解影响股价的各种因素,并根据这些因素进行投资决策。

3.3 计算方法回归分析通常使用最小二乘法来拟合变量间的线性关系。

在回归分析中,自变量可以是单个变量或多个变量,而因变量是需要预测或解释的变量。

通过最小化残差平方和,可以得到最佳拟合的回归模型。

4. 相关分析与回归分析的联系与区别4.1 联系相关分析和回归分析都是用来研究变量之间关系的统计方法,它们都可以帮助研究者理解变量之间的相关性和影响程度。

4.2 区别相关分析主要关注变量之间的相关性,通过计算相关系数来衡量相关性的强度和方向;而回归分析则更加关注自变量对因变量的影响程度和预测能力,适用于建立因果关系和预测模型。

数据分析之相关分析的原理方法误区及生活实例03

数据分析之相关分析的原理方法误区及生活实例03

数据分析之相关分析的原理方法误区及生活实例五、相关分析的其他方法及案例分析常用的三种相关性检验技术,Pearson相关性的精确度最高,但对原始数据的要求最高。

Spearman等级相关和Kendall一致性相关的使用范围更广,但精确度较差。

1.Spearman相关当定距数据不满足正态分布,不能使用皮尔逊相关分析,这时,可以在相关分析中引入秩分,借助秩分实现相关性检验,即先分别计算两个序列的秩分,然后以秩分值代替原始数据,代入到皮尔逊相关系数公式中,得到斯皮尔曼相关系数公式:数据要求:•不明分布类型的定距数据;•两个数据序列的数据一一对应,等间距等比例。

数据序列通常来自对同一组样本的多次测量或不同视角的测量。

结论分析:在斯皮尔曼相关性分析中,也能够得到相关系数(r)和检验概率(Sig.),当检验概率小于0.05时,表示两列数据之间存在相关性。

2.Kendall相关当既不满足正态分布,也不是等间距的定距数据,而是不明分布的定序数据时,不能使用Pearson相关和Spearman相关。

此时,在相关分析中引入“一致对”的概念,借助“一致对”在“总对数”中的比例分析其相关性水平。

Kendall相关系数计算公式如下:Kendall相关实质上是基于查看序列中有多少个顺序一致的对子的这个思路来判断数据的相关性水平。

在Kendall相关性检验中,其核心思想是检验两个序列的秩分是否一致增减。

因此,统计两序列中的“一致对”和“非一致对”的数量就非常重要。

下面举例说明Kendall相关系数的计算过程:假设有两个数据序列A和B的秩分序列分别是{2,4,3,5,1},{3,4,1,5,2},即相对应的秩对为(2,3)(4,4)(3,1)(5,5)(1,2)。

在按照A 的秩分排序后,得到新的秩对(1,2)(2,3)(3,1)(4,4)(5,5),此时B的秩分序列变成了{2,3,1,4,5}。

在这种情况下,针对第一个B值2,后面有3,4,5比它大,有1比它小,所以一致对为3,非一致对为1;第二个数字3,有4,5比它大,有1比它小,所以一致对为2,非一致对为1;依次类推,总共有8个一致对,2个非一致对。

《数字信号处理》第四章 相关分析

《数字信号处理》第四章 相关分析

对函数两边同时作傅立叶变换有:
F
r12( )


r12 (
)e j2f
d



x1
(t
)
x2
(t
)dtej2f d


x1
(t
)

x2
(t
)ej2f d dt

第二节 相关函数的性质
这是由于:
① r(τ)完全由它的能量谱或功率谱P(f )来决定; ② P(f ) =∣X(f )∣2
具有相同的振幅谱而不同相位谱的信号,可以 有相同的自相关函数。
第一节 相关
相关函数r(τ)存在的条件是:
信号x1(t)和x2(t)是绝对可积函数。
即:
x12
(t)dt

,


x(t)dt

x 2 2
(t)dt


与自相关函数相对应,如果参与相关的两个信号是
不同的信号,则其相关函数称为互相关函数。
第一节 相关
t
min
xe2 (t)

x
2
(t
)dt
1


x(t

)
y(t
)dt

2

x
2
(t
)dt

y2 (t)dt



若令
xy

x(t) y(t)dt
x2 (t)dt y2 (t)dt


则相对误差可表示为
min

1

(t

)dt
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苏州大学《机械工程测试技术基础》课程作业题目:信号的相关分析及其应用姓名:王臻学号:1442404033年级:_14 级专业:车辆工程2017年04月02日信号的相关分析及其应用一、实验目的1、理解相关性原理,掌握信号的自相关函数、互相关函数的求法。

2、了解自相关和互相关的特性和应用。

二、实验原理1、相关的概念相关是指客观事物变化量之间的相依关系,当两个随机变量之间具有某种关系时,随着某个变量数值的确定,另一变量却可能去许多值,但取值有一定的概率统计规律,这时称两个随机变量存在着相关关系。

在统计学中是用相关系数来描述两个变量x ,y 之间的相关性,相关系数的公式为:yx y x y x E σσμμρ)])([(xy --=注:E 为数学期望;x μ为随机变量x 的均值,x μ=E[x];y μ为随机变量y 的均值,y μ=E[y];x σ,y σ为随机变量x ,y 的标准差;2xσ=E[(x-x μ)2]2y σ=E[(y-y μ)2]利用柯西—许瓦兹不等式:E[(x-x μ)(y-y μ)]2≦E[(x-x μ)2]E[(y-y μ)2] 式中xyρ是两个随机变量波动量之积的数学期望,称之为协方差或相关性,表征了x 、y 之间的关联程度;x σ、y σ分别为随机变量x 、y 的均方差,是随机变量波动量平方的数学期望。

故知|xy ρ|≤1,当xy ρ的绝对值越接近1,x 和y 的线性相关程度越好,当xyρ接近于零,则可以认为x,y 两变量无关。

2、信号的自相关函数假如x (t )是某各态历经随机过程的一个样本记录,x (t+τ)是x (t )时移后τ后的样本,在任何t=i t 时刻,从两个样本上分别得到两个值x (i t )和x(i t +τ),而且x (t )和(t+τ)具有相同的均值和标准差。

例如把)+τρt x t x ()(简写成)τρ(x ,那么有:)τρ(x =202)()(1lim xTxT dt t x t x Tσμτ⎰-+∞→对各态历经随机信号及功率信号可定义自相关函数)τ(R x 为:)τ(R x ⎰+=∞→TT dt t x t x T)()(1lim τ则:)τρ(x =22)(xxx R σμτ-显然)τρ(x 和)τ(R x 均随τ而变化,而两者成线性关系。

如果该随机过程的均值x μ=0,则)τρ(x 2)(xx R στ=。

3、自相关函数()x R τ具有如下主要特性a.222(0),(0)()x x x x x x R R R σμψτ=+=≥ b.()()x x R R ττ=-即自相关函数是偶函数。

c.当时移τ很大或τ→∞时,随机的()x t 与()x t τ+之间就不存在内在的联系,彼此无关。

即2()0,()x x x R ρττμ→∞→→∞→4、信号的互相关函数两个各态经过程的随机信号x(t)和y(t)的相互关系函数)τ(R xy 定义为:dt t y t x T R TT xy )()(1lim)(0ττ⎰+=∞→ 当时移τ足够大或∞→τ时,x(t)和y(t)互相不相关,xy ρ∞→,而)τ(R xy →x μy μ。

)τ(R xy 的最大变动范围在x μy μ -x σy σ之间,即:)()()(y x y x xy y x y x R σσμμτσσμμ+≤≤-式中x μ、y μ——分别为x(t)、y(t)的均值;x σ、y σ——分别为x(t)、y(t)的标准差。

如果x(t)和y(t)两信号是同频率的周期信号或者包含有同样频率的周期成分,那么即使τ∞→,互相关函数也不收敛并会出现该频率的周期成分。

如果两信号含有频率不等的周期成分,则两则不相关。

这就是说,同频率相关,不同频不相关。

5、互相关的特性a.互相关函数不是偶函数,其图形不对称,但与其共轭函数对称。

即()()x y x y R R ττ≠-b.最大值不是出现在0τ=处,而是在某时移量0ττ=处 。

时移量0τ反映两信号()x t 、()y t 之间主传输通道的滞后时间(图1),也表明两信号在时差0τ处相关程度最大。

最大值为:0()xy x y x yR τσσμμ=+c.若随机信号()x t 和()y t 中没有同频率的周期分量,则当τ很大时彼此之间互不相关,即 :()0,()xy xy x yR ρττμμ→∞→→∞→d.两个具有相同频率的周期信号的互相关函数仍是周期信号,且互相关函数中保留了原信号的频率、幅值以及相位差的信息。

而两个不同频率的周期信号是不相关的。

图1三、自相关函数、互相关函数求法的实例分析1、求正弦函数dt t x t x )sin()(0ϕω+=的自相关函数,初始相角ϕ为一随机变量。

)τ(R x ⎰+=∞→TT dt t x t x T)()(1limτdt t t x T T ])(sin[)sin(10200ϕτωϕω+++=⎰式中0T 为正弦函数的周期,0T ωπ2=。

令θϕω=+t ,则ωθd dt =。

于是,⎰=)+=ππ202202sin(sin 2)(ωτθωτθθτcps x d x R x2、求t t x ωsin )(=和Z n T t y nT TnT T t nT TnT T t ∈==++∈++-∈-,2,{)(]43,4(,1]4,4(,1ωπ的互相关函数。

)sin(2])sin()1()sin()sin()1([1)((1()((44343414000ωτωτωωτωωτωτττπ=--+-+--=)-=)+1=)⎰⎰⎰⎰⎰-TT T T TTTxy dt t dt t L dt t T dt t y t x T dt t y t x T R四、互相关函数的应用1、钢带运动的非接触测量互相关技术广泛应用于各种测试中。

工程中还经常用两个间隔一定距离的传感器来不接触地测量运动物体的速度。

如图2所示,测量热轧钢钢带速度的示意图。

钢带表面的反射光经透镜聚焦在相距为d 的两个光电池上。

反射光强度的波动,经过光电池转换为电信号,再进行相关处理。

当可调延时τ等于钢带上某点在两个测试点之间经过所需的时间τd 时,互相关函数为最大值。

钢带的运动速度d d v τ/=。

图2设两传感器接收到的信号分别为:)1.0(2sin 2sin -==t y t x π、π,则,两信号函数互相关。

)2.02cos(21)]1.0-(2[sin )2sin(1lim )()(1lim )(0ππππ+=-=+=⎰⎰∞→∞→ττττTT TT xy dt t t T dtt y t x T R当N n ∈=,1.0-n τ时,取最大值,考虑到被测量为时间,所以当9.0=τ时取最大值。

MATLAB 程序代码如下:clc;clear; dt=0.001; t=-1:dt:1; x=sin(2*pi*t); y=sin(2*pi*(t-0.1)); subplot(2,1,1); plot(t,x); hold onplot(t,y);axis([-1 1 -1 1]);[a,b]=xcorr(x,y,'unbiased');subplot(2,1,2); plot(b*dt,a); axis([-1 1 -1 1]);图像如下(图3):图32、确定输油管裂损位置图4是确定深埋在地下的输油管裂损位置的例子。

漏损处K 视为向两侧传播声响的声源,在两侧官道上分别放置传感器1和2,因为放传感器的两点距漏损处不等远,则漏油的声响传至传感器就有时差,在互相关图上m ττ=处)(R 21τx x 有最大值,这个m τ就是时差,由m τ就可确定漏损的位置:m v τ21s =式中,s 为两传感器的中点至漏损处的距离;v 为音响通过管道的传播时间。

图4现设传感器1和传感器2接收到的声音的电信号分别为x1=90sin(π(n-0.1Fs))、x2=50sin(pi*(n-0.3*Fs)。

MATLAB代码如下:clear;N=1000;n=0:N-1;Fs=500;t=n/Fs;Lag=200;x1=90*sinc(pi*(n-0.1*Fs));x2=50*sinc(pi*(n-0.3*Fs));[c,lags]=xcorr(x1,x2,Lag,'unbiased');subplot(2,1,1),plot(t,x1,'r');hold on;plot(t,x2,'b:');legend('信号x1','信号x2');xlabel('时间/s');ylabel('x1(t) x2(t)');title('信号x1和x2');hold off;subplot(2,1,2),plot(lags/Fs,c,'r');xlabel('时间/s');ylabel('Rxy(t)');title('信号x1和x2的相关');可以清楚的看到第二个信号相对于第一个信号延迟了0.2s,即在-0.2s处出现了相关极大值,因此可以采用该项技术检测延迟信号,再乘声音在管道中的传播速度,则可以确定深埋地下的输油管裂损位置,以便开挖维修。

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