pubmed推送简介
PubMed 简介的个性介绍PPT
下图为检索“Cancer”的第9674页的前三个结果
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亲手下厨， 亲手下厨，亲自试验
盗用小惠老师的名字 咱注册了一个NCBI账户 结果中文用户名不给咱通过
客户端
pubmed客户端 pubmed客户端 完全免费，界面
汉化，支持中文查询，mesh词中英 文对照，可免费快速获得全文。
New Data
PubMed
Collect
Pre-Medline
Process
Medline
PubMed
• OLDMEDLINE 含1950年至1965年期间
发表的200万篇生物医学文献。 OldMedline的记录没有MeSH字段和摘 要，记录的标记为：[PubMedOLDMEDLINE for Pre1966]。
搜索试一试
1.在客户端的作者一栏中打“吴小慧”，结 果。。。。。。
2.在客户端的第一栏中打“wuxiaohui”，结 果。。。。。。
在网站上的搜索结果
• PreMedline 收集未正式给予MeSH词、
出版类型等深度标引信息的一个临时 库。NLM每天把最新记录加入到 PreMedline库中，每条记录均带有 [PubMed--in Process]标志。工作人 员在一周内将这些记录标引，然后转 入MEDLINE，同时从PreMedline中删去。
包含了什么？ 包含了什么？
数据类型： 期刊论文 综述 与其它数据库的相关记录和链接 数据来源： MEDLINE OLDMEDLINE Record in process Record supplied by publisher ……
• MEDLINE ？收录1966年以来的包含医学、
你不知道的PubMed（1）-追踪研究领域最新文献！
你不知道的PubMed（1）-追踪研究领域最新文献！PubMed数据库是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的生物医学信息检索系统，是一个免费的搜寻引擎，提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要，其核心主题为医学，但亦包括其他与医学相关的领域，像是护理学或者其他健康学科，除此之外还提供与综合分子生物学数据库的链接，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据，3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
作为生物医学专业使用最广泛的数据库，其检索方式可参加我们前期的推送：本系列推送随后将介绍PubMed数据库的其他功能。
1如何追踪研究领域最新文献？PubMed提供了两种追踪文献的途径，第一种是RSS订阅源方式，第二种是邮件发送方式。
在开始之前，我们需要准备软件，浏览器与RSS订阅源软件（类似的软件有很多，本推送选择Foxmail软件进行演示）。
图 1 PubMed官方主页首先，我们需要构建各自研究领域的检索表达式，如干细胞与骨关节炎：("Osteoarthritis"[Mesh]) AND (((("Stem Cells"[Mesh] OR "Stem Cell Research"[Mesh]))) OR "stem cell"[Title/Abstract])图 2 检索历史界面然后点击检索结果的数字，显示检索结果界面，可以看见如图所示Create RSS 和 Create alert，即创建RSS订阅源链接和创建邮箱提醒。
图 4 检索结果界面点击Create RSS，出现如下图所示界面，选择展示的文献数量，可供选择的有5，10,15,20,50,100，并命名订阅源的名字。
点击XML，在跳转后的页面中复制网址链接。
图4 创建订阅源界面安装Foxmail后点击如图标示的RSS图标，可看到如下图所示界面，有新建订阅和更新订阅，点击添加订阅输入刚才复制的订阅源网址，即可创建订阅，点击更新订阅追踪研究领域最新的文献。
PubMed简介及使用说明
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库，目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料，并提供部分免费及付费全文连结服务，需要收费的全文，读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主，PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容：1. 对于超出学科范围(如：资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中；2. 收录即将出版的医学论文；3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下：1.PubMed：生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide：包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein：整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料，并可参照Taxonomy资料库，了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure：分子构造资料库。
5.Genome：基因组合序列资料库。
6.PopSet：可查询某族群的基因序列，了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM：遗传学资料库。
8.Taxonomy：在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books：收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
PUBMED简介（PUBMEDabstract）
PUBMED简介（PUBMED abstract）Source: /sjs/pubmedjj.htmA brief introduction to PubMed retrieval systemPubMed retrieval system /PubMed /The PubMed system was developed by the National Center for Biotechnology Information (NCBI), an online retrieval system for retrieving MEDLINE and PreMED-LINE databases. MEDLINE is the most important bibliographic abstracts database ofU.S.National Library of Medicine, which covers medicine, nursing, dentistry, veterinary medicine, health care and basic medicine. More than 4000 kinds of biomedical journals have been collected in more than 70 countries and regions in the world, with over 1000 entries of bibliography abstracts in 1966.PreMEDLINE is a temporary database of medical literature. It receives new data every day, providing users with basic bibliographic entries and abstracts, which are moved to MEDLINE once a week after indexing and processing.PubMed also accepts the document entry data provided by the publisher via electronic communication, which is illustrated with [MEDLINE, record, in, process], and is marked with the [Record as supplied by publisher]. The daily entries are constantly sent to the PreMEDLINE database, but some entries due beyond MEDLARS database scope, will never be replaced by PreMEDLINE or MEDLINE entry, for example in the comprehensive scientific journal (Science or Nature) on the table the geography etc..Main features of PubMed systemPubMed searchThe use of the Details keyThe use of the --URL key for storage retrieval policyFeature column (Feature Bar) introducedSearch results display, save, print--------------------------------------------------------------------------------Main features of PubMed system1. vocabulary automatic conversion function (Automatic, Term, Mapping)In the search questions box of the PubMed home, type a search word, and the system will use the following 4 tables or indexes sequentially to retrieve the retrieved words and then retrieve them.(1) MeSH conversion table (MeSH, Translation, Table), including MeSH words, see words, sub topics, etc.. If the system has found the word matching the search word, it will automatically translate it into the corresponding MeSH word and TextWord word (Title noun and abstract word). For example, type"Vitamin H", and the system converts it to "Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]" after retrieval.(2) of the conversion table (Journal Tanslation Table), including full name, abbreviation of MEDLINE and ISSN. The conversion table can type of name into the "MEDLINE Name]" after the retrieval of the abbreviation [Journal. For example, in the search questions box, type "New England Journal of medicine", and PubMed converts it to "N, Engl, J, Med, [Journal, Name]".(3) phrase list (Phrase, list). The unified medical language system in the table and form phrases from MeSH containing synonyms or different English vocabulary writing (UMLS: Unified Medical Language System) and supplementary concept (material) name [Supplementary Concept (Substance) Name]. If the PubMed system is not found and the retrieval word matching the words in the MeSH and of the conversion table, will find a short list.(4) author index (Author, Index). If the word entered does not find the matching word in the above table, or the typed word is a phrase followed by an 1~2 letter, the PubMed is the author index. If you still can't find matching words,PubMed will break the word and repeat the automatic vocabulary conversion process until the word matches the word entered. If there are still no matching words, individual words are joined together (in AND) to retrieve in all fields.For example, "single cell", the system automatically divides it into two words: "single" and "cell" retrieval, and itsretrieval expression is "single AND cell"". To check the conversion of the search term, click the "Details" key.2. word retrieval functionPubMed allows the use of * numbers as a wildcard for word retrieval. If you type 'bacter *', the system will find the words in the previous section, such as bacteria, bacterium, bacteriophage, and bacter, and retrieve them separately. If the word is less than 150, PubMed will be one by one word retrieval, if more than 150 (such as Staph*), PubMed will display the following warning: "Wildcard search for'term*'used only the first Lengthen the root word 150 variations. to search for all endings". Truncation function is limited to words and is invalid for phrases. Such as: "infection*" includes "infections", but does not include "infection control" and so on.When using the truncation function, the PubMed system automatically turns off the lexical conversion function.3. mandatory search functionAs mentioned above, the PubMed homepage and search box type questions a phrase and click "Go", with the high speed automatic conversion function to find the corresponding word matching and retrieval system; however, when the type of words, no words, PubMed will enter the words off after the automatic repeat vocabulary conversion process, if still no match, the system will be decomposed into words and phrases, AND together in all fields in search. Obviously, the results of this retrieval arenot consistent with the user's requirements. Therefore, PubMed allows double quotation marks ("" "" ") to enforce systematic phrase retrieval. For example, in the PubMed page retrieval type "Single cell" question box, and use double quotes, and then click "Go", the system will be as an integral phrase retrieval in all fields in the database.Using double quotation marks automatically turns off the lexical conversion function.4. link function(1) linking relevant documents. Each document in the PubMed system has a related literature link. In the display state of the retrieval results, there is a "Related Articles" hyperlink on the right of each record. Click on the chain, the system shows the relevant documents from high to low according to the relevance of the document. Using the search history (History) button can further restrict the relevant literature. Click on "History", enter the relevant search numbers into the query box, and then type additional conditional words, and finally click "Go"". If you type "#7 AND english[la]" in the query question box, the search can be further limited to the English literature.(2) link NCBI (National, Center, for, Biotechnology, Information) database. PubMed built hyperlinks on its home page with 5 NCBI databases. These databases include: Protein[amino acid sequence database (protein), Nucleotide (DNA sequence) database, Popset (population, phylogenetic or mutation sequence) database, Structure (molecular structure model) andGenome database (genome sequence database).(3) linking external resources. PubMed provides links from search results to full journal text, biological data, sequence centers, and more. This function is achieved by linking to the above resource site. In the status of the search results, click "LinkOut" to enter the relevant web site.(4) link related books. Click on "Books" to refer to the abstract page of the related books.Some of the phrases on the book Abstract page are hyperlinks, and click the phrase hyperlink to connect to the page list of the relevant books and find the phrases on the table.In addition, the PubMed system allows the user to view the cited journal name table, click on the PubMed Journal Brower on the home page, and PubMed provides the user with the abbreviated name and ISSN number of the journal.PubMed searchPubMed system search range: MEDLINE database and PreMEDLINE database.1. words (subject) retrievalOn the PubMed homepage question box type English words or phrases (uppercase or lowercase can enter or click the "Go", PubMed is using the vocabulary automatically search, and search results are directly displayed on the home page below. Forexample, type "vitamin C common cold", then enter or click Go, and PubMed begins to retrieve and displays the search results.If the search results do not meet the requirements, can increase or delete the box in question words, or in the Details state (see Details key usage) to modify search, can also use the "Limits" (see Limits.) select restricted condition after retrieval. In addition, users can use wildcards, * * or double quotation marks to make word search or mandatory search as needed.2. authors searchIn the question box type author surname name and initials, format: author name space name acronyms, such as Smith JA, then press enter or click on Go, the system will automatically go to the field of retrieval, and display the search results.If you enter the author's last name, the system will first find the author's last name in the MeSH conversion table. After you've checked, the system retrieves the topic fields and title and digest fields, otherwise the system will retrieve them in all fields.If you use double quotes around the author's name and use the author field identifier - [au] to qualify, such as "Smith JA" [au], then the system retrieves only author fields.3. of the searchIn the question of the box type or MEDLINE form, referred toas ISSN, for example: molecular biology of the cell Mol Biol, or cell, or 1059-1524, then press enter or click on Go in the field of retrieval, the system will display the search results, and. If the words in the vocabulary of MeSH and the same, for example: Gene Therapy, Science or Cell, PubMed will use the word as the word retrieval MeSH. In this case, need of field identification -- [ta] is defined as "gene therapy[TA"".Single word title also need to be qualified, with [TA]: Scanning[TA]. Otherwise, the system will retrieve in all fields. The use of the MEDLINE can be retrieved or referred to all relevant records in the database. Retrieval using the ISSN number does not guarantee an earlier record in the checked database.If there should be input of parentheses, brackets omitted. For example: J, Hand, Surg[, Am] J Hand Surg Am should be typed.4. Boolean logic searchThe PubMed system allows Boolean logic retrieval, but type Boolean logic operators (AND, OR, or NOT) in the question box. Such as: vitamin, C, OR, zinc.Boolean logic searches sequentially from left to right, but parentheses can be used to change their order of operations. For example, common, cold, AND (vitamin, C, OR, zinc), the first search in parentheses is the first operation.Boolean logical retrieval allows you to add field identifiers after the retrieval word to qualify the retrieval field (fieldidentifiers are enclosed in square brackets and placed behind the search words). The format of its retrieval expression is: search word [field identifier], Boolean operator, search word [field ID]. Such as: [dna[, MH], AND, Crick, [au] AND 1993 [DP];又如：ansthma /治疗[MH]回顾[葡]和孩子，学前[MH]各种字段标识见表1。
一PubMed数据库简介
些记录标引，然后转入 MEDLINE ，同时
从PreMedline中删去。
New Data
PubMed
Collect
Pre-Medline
Process
Medline
PubMed
出版商提供的书目信息：出版商
提供的是整本期刊的信息，若有
部分没有被MEDLINE收录，PubMed 仍保存，在记录中做[PubMed--as
检索提示区
对各项检索功能的简单描述
NCBI数据库
Nucleotide：DNA序列数据库
Protein：蛋白质序列数据库 Genome：基因组序列数据库 Structure：分子结构模型数据库 Popset：种群、种系发生或突变序列数据库
Taxonomy：微生物类别数据库
OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库。
五、 PubMed辅助检索工具（二）
2. Preview/Index： Preview是对检索结果进行预览，显示检索结果的
条数和最近三次检索式，用户可根据具体情况在 检索提问框中用逻辑运算符组配新的检索式。 Index是对提交的检索词列出按字顺排列的某一字段 的索引词表的位置和数量（括弧内），可用流动 条来回进行查看列表。选中的词高亮显示，然后 选择合适的逻辑运算符进行检索。
杂志名检索
在检索框中键入杂志全名molecular biology of the cell 也可以直接键入Medline的期刊标准缩写 形式，如：mol boil cell， 键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码） 进行检索，如1059-1524。 Cell transplantation [ta]
文献检索pubmed讲解资料
PubMed基本检索
smith j
作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写)， 之间不用标点 键入作者姓名
PubMed基本检索
"smith j"[au]
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换，实 现精确查找
PubMed基本检索
期刊检索
在检索框中键入期刊名，如：European journal of immunology，系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成"Eur J Immunol"[Journal] OR "european journal of immunology"[All Fields]进行检索。
期刊数据库的作用： 1、可以查看期刊的详细信息，包括出版国家，出版社，出版语言， 期刊类目等等； 2、可以根据期刊的主题分类，查看medline收录的各学科的期刊， 比如查看medline收录的关于麻醉学(Anesthesiology)方面的期 刊； 2、方便检索某本期刊上被PubMed收录的所有文章。
• PubMed收录的期刊最早追溯至1865年，共收录了70余个国家
36000余种期刊，1900多万篇文献；
• PubMed 的子集Medline收录的文献最早追溯至1902年，现有
记录1790多万篇；
• 目前每年增加约60余万条文献记录； • 在全部记录中有76%的文献为英文；在2000年以来的记录中
提纲
• PubMed概况 • PubMed功能栏介绍 • 认识PubMed文献 • PubMed基本检索 • PubMed高级检索 • 主题词MeSH检索 • 循证及临床查询检索 • PubMed全文获取 • PubMed RSS学科跟踪
概况
pubmed使用介绍资料
PubMed简介——是什么？
NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么？
生物数据库 永久数据的大的组织体 结合计算机软件执行更新、查询与存取数据 的功能。 容易取得信息并且只取得回答特殊生物问题 的信息 Entrez： NCBI的数据库搜寻与存取系统，可 用来获取单一数据库或许多数据库的整合数 据。 目前，NCBI提供的公开（Open Access）数据 库包括如下：
PubMed简介——是什么？
MEDLINE：[pubmed-indexed for medline]
数据来源
Publisher-Supplied Citations：出 版商提供的电子文献 [PubMed-as supplied by Publisher]。 In Process Citations：每天收录， 尚未经规范处理的数据。 [pubmed-in process]
PubMed简介——是什么？
PubMed简介——是什么？
NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么？
Entrez 一个整合的访问序列，定位，分类和结构数据的搜索和检索 系统。 整合的数据库包括核酸序列，蛋白序列，大分子结构，全基 因组，和通过PubMed检索的MEDLINE。 可以检索相关的序列，结构和参考文献。
/ （汉化）
英文检索
PubMed简介——是什么？
新版PubMed首页 特色： 简洁、清新 检索速度较快
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围
数据类型：期刊论文、综述以及与其他数 据资源链接。 特点：
NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦
NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦注：在本文中的叙述中，所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。
PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）提供，可通过NCBI网站的Entrez检索系统（Entrez retrieval system）进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。
此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。
PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。
其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。
如果该出版商有网站，则NCBI会提供相应的网络出口。
MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。
PubMed服务内容概括基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。
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作者索引表
No Mapping
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备注：
如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时， PubMed就将短语劈开，再重复以上顺序单独分别查找， 直到找到相匹配的词。如果仍找不到匹配词，则用 AND 将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找。 例 ： h1n1 flu 转 换 为 h1n1[All Fields] AND ("influenza, human"[MeSH Terms] OR ("influenza"[All Fields] AND "human"[All Fields]) OR "human influenza"[All Fields] OR "flu"[All Fields])
录均带有[PubMed--Indexed for MEDLINE]标志。
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MEDLINE的组成
《Index Medicus》（医学索引） 《Index to Dental Literature》
（牙科文献索引） 《International Nursing Index》 （国际护理索引）
Pubmed
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主要内容：
第三章 第一节 西文文摘型检索工具 1.pubmed检索系统
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Pubmed----检索系统 P70
由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的，是全 球最著名的免费医学专业题录型数据库网上检索系统。从 1997年6月起，PubMed在网上免费向用户开放。它具有收录 范围广泛、更新速度快、检索系统完备、链接广泛的特点。 ❖ >5000来源期刊,其中英文期刊约占85% ❖ >1900万条高质量的题录摘要 ❖ 每日完成来自全球的检索>200万次 ❖ 医学\护理\牙科\兽医\保健\临床前 ❖ 生命科学的期刊 ❖ 全文链接超过 3000+种 ❖ 数据更新迅速:星期二到星期六每日更新
自动词汇匹配
MeSH Translation Table
主题词注释表
❖PubMed对输入检索
框中的检索词进行智 Journals Translation Table
期刊注释表
检索词拆分
能化地校对，将其逐
AND
步地与其数据库中的
各类术语匹配的原则。
Common Phrase List
常用词组表
Author Index
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OLD MEDLINE
1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for
Pre1966]标记表示。
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pubmed主页地址
/pubmed
美国国立卫生研究院(National Institutes of Health, NIH) 美国国立医学图书馆（National Library of medicine,NLM） 美国国立生物技术信息中心 （National Center for Biotechnology Information，ncbi）
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PreMedline
收集未正式给予MeSH词、出版类型等深度标引信 息 的 一 个 临 时 库 。 NLM 每 天 把 最 新 记 录 加 入 到 PreMedline 库 中 ， 每 条 记 录 均 带 有 [PubMed--in Process]标志。工作人员在一 周内将这些记录标引，然后转入MEDLINE，同 时从PreMedline中删去。
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举例 ❖检索心力衰竭(heart failure)的文献
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强制检索
❖ PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。
❖ 如：在PubMed主页的检索提问框中键入“heart failure”，并用双引号引起来。点击“GO”按钮，系统 会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进 行检索。
或 /
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PubMed基本检索
❖ 自由词检索 ❖ 主题词检索 ❖ 布尔逻辑检索 ❖ 字段限制检索
著者检索 刊名检索
❖ 截词检索 ❖ 强制检索
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自由词检索 在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写
均可），点击GO按钮，PubMed系统会自动在 主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中查询 与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的“自 动词汇匹配功能”。
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PubMed系统包含的数据库
（1）MEDLINE (2）PreMEDLINE (3）Record supplied by Publisher (4) OLD MEDLINE
(5) NCBI其它数据库的相关记录
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MEDLINE
是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中 最大的生物医学数据库，收录1966年以来 70多个国家近4000多种生物医学期刊的 书目信息和著者文摘，每周更新。每条记
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New Data
Collect
Pre-Medline Process
Medline
Med
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Record supplied by Publisher ❖ 出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有
被MEDLINE收录，PubMed仍保存，在记录中做 如下标记： ❖[PubMed--as supplied by publisher] 。