关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
激光共聚焦显微镜操作指南说明书
激光共聚焦显微镜操作指南说明书激光共聚焦显微镜（Laser Scanning Confocal Microscope）是一种高分辨率、高对比度的显微镜，广泛应用于生物医学研究、材料科学等领域。
本操作指南将详细介绍激光共聚焦显微镜的操作流程和基本操作技巧，帮助用户正确、高效地使用该设备。
一、设备准备在开始使用激光共聚焦显微镜前，需要进行以下设备准备：1. 检查电源线和数据线是否连接正常，确保设备供电和数据传输正常；2. 检查激光源是否正常工作，激光功率是否稳定；3. 检查镜头和滤光片是否清洁，清除灰尘和污渍，确保成像质量；4. 准备适当的标本样品，并将其固定在载玻片上。
二、系统启动1. 确保设备处于待机状态，按下电源按钮，等待系统启动；2. 检查系统软件是否正常运行，若出现异常情况，及时联系维修人员进行处理；3. 检查镜头和滤光片的安装是否正确，确保成像时的光路通畅；4. 开启激光源，根据需要选择合适的激光波长和功率；5. 调节扫描镜和物镜的位置，使光线准确聚焦在样品上。
三、图像获取1. 打开激光共聚焦显微镜软件，并根据需要选择合适的成像模式；2. 调节激光功率和增益，确保图像的亮度和对比度适宜；3. 调节扫描镜的扫描速度，根据样品的要求选择合适的扫描速度；4. 调节焦距和聚焦位置，通过手动或自动对焦功能获取清晰的图像；5. 点击图像捕捉按钮，记录当前图像或录制图像序列。
四、图像处理和分析1. 通过激光共聚焦显微镜软件提供的图像处理功能，对图像进行调整和增强，以获得更好的观察效果；2. 根据需要，利用软件提供的计算和分析功能对图像进行进一步处理，如三维重建、光学切片等；3. 对图像进行定量分析时，选择合适的工具和算法，并按照要求设定参数；4. 记录和保存处理后的图像数据，以备后续分析和报告撰写使用。
五、设备关闭1. 停止图像采集和处理工作；2. 降低激光功率，关闭激光源；3. 将扫描镜和物镜返回初始位置，关闭设备；4. 断开电源和数据线，保持设备清洁干燥。
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理 ppt课件
点击左上角 as 图片格式选择第一个czi保存 保存后的图片即可用blue edition 打开
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
此方法无需转换格式。 同时打开blue edition和black edition Flie—send to ZEN2-blue edition
当旋转到 合适的角 度后，即 可圈选出 所需区域
在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
本操作在2D模式下进 行即是对所有通道同 时进行操作，若需要 单独对某一通道进行 操作，请在拆分模式 下进行。
右键单击框选的区域设置一个感兴趣的图集
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
关于激光 共聚焦显 微镜拍照 后图像的 处理
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格式。
注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
值得一提的是若图象 具有时间条则可以导 出为video
激光共聚焦操作步骤
激光共聚焦操作步骤激光共聚焦显微镜（Laser Scanning Confocal Microscope，简称LSCM），是一种光学显微镜，利用激光和扫描镜技术，能够对样品进行高分辨、高对比度的三维成像。
下面将介绍激光共聚焦显微镜的操作步骤。
1.准备工作：a.打开显微镜电源，确保仪器处于正常工作状态。
b.打开激光源电源，等待激光系统启动。
c.准备样品，将样品放置在载玻片上，并使用封口膜或密封胶固定。
2.调节孔径光阑：a.打开镜头盖，取下玻璃保护盖。
b.观察显微镜视野，调节孔径光阑的大小，以获得最佳的入射光。
c.用合适的滤光片选择适当激光激发波长。
3.调节激光功率：a.打开激光源的控制面板。
b.选择合适的激光功率，通常初次使用时可选择较低功率。
c.通过目镜观察激光处于合适的位置和方向，避免直接观察激光。
4.调节焦距：a.打开目镜盖，观察样品上的图像。
b.调节目镜的焦距，获得清晰的图像。
c.使用恰当的倍率进行观察，确保所需的细节可见。
5.调节光路：a.打开激光共聚焦显微镜软件，进行光路调节。
b.调节反射镜和聚焦镜，确保激光能够准确地聚焦在样品上。
c.通过调节扫描镜，使激光能够扫描整个样品。
6.设置扫描参数：a.在软件中选择扫描参数，如扫描速度、像素大小等。
b.减至最小的扫描区域，以便首先观察最感兴趣的区域。
c.如有需要，可以进行连续扫描或者多通道扫描的设置。
7.开始扫描：a.点击软件界面上的“开始”按钮，开始扫描。
b.观察扫描时光点在样品上的移动情况，确保图像的获取和处理是正确的。
c.根据需要调整扫描参数，以获得更好的图像质量。
8.界定感兴趣区域（ROI）：a.选择感兴趣的图像区域，用鼠标进行界定。
b.设置参数，如增益、对比度、亮度等，以便获得更好的视觉效果。
c.按下截图按钮，将感兴趣的图像保存下来。
9.分析和处理图像：a.关闭扫描功能，进入图像处理模式。
b.使用软件提供的功能分析和处理图像，如三维重建、图像拼接等。
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设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
五、图象色彩调整
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
六、导出
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
当旋转到 合适的角 度后，即 可圈选出 所需区域
在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
本操作在2D模式下进 行即是对所有通道同 时进行操作，若需要 单独对某一通道进行 操作，请在拆分模式 下进行。
默认使用black edition打开.lsm 格式文件
点击左上角 as 图片格式选择第一个czi保存 保存后的图片即可用blue edition 打开
2.格式转换(2)
此方法无需转换格式。 同时打开blue edition和black edition Flie—send to ZEN2-blue edition
二、1.文件格式
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格式。
注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
2.格式转换(1)
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
激光扫描共聚焦显微镜使用说明
激光扫描共聚焦显微镜使用说明标签：激光扫描共聚焦显微镜使用说明激光扫描共聚焦显微镜可以：（1）光切片扫描、3D图像处理、时间序列拍摄成像；（2）细胞、绿荧光蛋白、生物荧光样品观察分析；（3）荧光原位杂交分析。
详细实验方法共聚焦显微镜激光扫描法实验方法原理激光共聚焦扫描显微镜（Confocal laser scanning microscope，CLSM）用激光作扫描光源，逐点、逐行、逐面快速扫描成像，扫描的激光与荧光收集共用一个物镜，物镜的焦点即扫描激光的聚焦点，也是瞬时成像的物点。
由于激光束的波长较短，光束很细，所以共焦激光扫描显微镜有较高的分辨力，大约是普通光学显微镜的3倍。
系统经一次调焦，扫描限制在样品的一个平面内。
调焦深度不一样时，就可以获得样品不同深度层次的图像，这些图像信息都储于计算机内，通过计算机分析和模拟，就能显示细胞样品的立体结构。
实验材料细胞试剂、试剂盒荧光染料水培养基仪器、耗材激光扫描共聚焦显微镜载玻片洗瓶滴管试管实验步骤一、观察及仪器操作1. 开启仪器电源及光源一般先开启显微镜和激光器，再启动计算机，然后启动操作软件，设置荧光样品的激发光波长，选择相应的滤光镜组块。
以便光电倍增管(photo multiplier tube，PMT)检测器能得到足够的信号结果。
使用汞灯的注意事项同普通荧光显微镜。
2. 设置相应的扫描方式在目视模式下．调整所用物镜放大倍数，在荧光显微镜下找到需要检测的细胞。
切换到扫描模式，调整双孔针和激光强度参数，即可得到清晰的共聚焦图像。
3. 获取图像选择合适的图像分辨率，将样品完整扫描后，保存图像结果即可。
4. 关闭仪器仪器测定样品结束后，先关闭激光器部分，计算机仍可继续进行图像和数据处理。
若要退出整个激光扫描共聚焦显微镜系统．则应该在激光器关闭后，待其冷却至少10分钟后再关闭计算机及总开关。
二、获取三维图像激光扫描共聚焦显微镜具有细胞“CT”功能，因此，它可以在不损伤细胞的情况下，获得一系列光学切片图像。
激光共聚焦显微镜用法
激光共聚焦显微镜用法
激光共聚焦显微镜（Laser Scanning Confocal Microscope，LSCM）是一种高分辨率的显微镜，其能够通过激光束在样品表面扫描，获得高分辨率的三维图像。
以下是激光共聚焦显微镜的使用方法：
1. 样品制备：将样品制备好，并固定在载玻片或载片上，以便于放入显微镜中观察。
2. 调整显微镜：将载玻片或载片放入显微镜中，调整激光聚焦点的位置和大小，以便于观察样品的细节。
3. 设置参数：根据样品的性质和需要观察的结构，设置激光功率、扫描速度、探测器增益等参数，以获得最佳的成像效果。
4. 开始扫描：启动激光扫描仪，将激光束在样品表面扫描，获得高分辨率的三维图像。
5. 分析数据：通过软件对获得的图像进行处理和分析，以获得更详细的信息和结构。
6. 结果展示：将处理后的图像进行展示和分析，以便于研究人员对样品进行更深入的了解和研究。
总之，激光共聚焦显微镜是一种高分辨率的显微镜，其能够帮助研究人员观察和研究样品的细节和结构，为生物医学研究和材料科学研究提供了强有力的工具。
激光扫描共聚焦显微镜操作指南说明书
激光扫描共聚焦显微镜操作指南说明书[激光扫描共聚焦显微镜操作指南说明书]引言：本操作指南为用户提供激光扫描共聚焦显微镜的详细操作流程及相关注意事项。
在使用本设备之前，请仔细阅读本指南，以确保能够正确、安全地操作设备，并获得最佳的成像效果。
一、设备介绍激光扫描共聚焦显微镜是一种先进的显微镜技术，结合了共聚焦成像和激光扫描技术，可以实现高分辨率、三维成像及活细胞观察等功能。
本设备由以下主要部分组成：1. 共聚焦显微镜主体：包括光源系统、光学系统、扫描系统、探测器等核心部件。
请勿对主体进行任何未经授权的拆卸或修改。
2. 控制系统：用于控制设备的开关、成像参数设置、图像采集及处理等功能。
在操作设备之前，请确保控制系统处于正常工作状态。
二、准备工作在操作激光扫描共聚焦显微镜之前，请进行以下准备工作：1. 检查设备：确保设备的电源线、信号线、光纤等连接线路良好，无损坏或松动情况。
2. 准备标本：根据需要观察的样本类型，准备适当的标本片，并在标本片上施加适当的荧光染料。
3. 调整镜片：根据需要选择适当的镜头，并按照设备说明进行安装和调整。
三、操作步骤以下为基本的操作流程，具体步骤可能会因设备型号和厂家而有所不同，请根据实际情况进行操作：1. 打开设备电源：将电源开关置于“开启”位置，待设备启动完全后，检查设备各部分是否正常。
2. 设置成像参数：通过控制系统，设置激光波长、放大倍数、成像模式等参数。
根据标本类型及观察需求，合理选择参数设置。
3. 校准镜片：根据设备说明书，进行扫描头和标本之间的焦距调整，保证成像过程中的清晰度和准确度。
4. 开启激光：根据标本需要，选择相应的激光波长，并逐一打开相应激光。
5. 定位标本：通过显微镜目镜进行初步观察，调整位置和焦距，使标本位于成像区域。
6. 开始扫描成像：在控制系统中选择扫描图像模式，点击“开始扫描”按钮，启动扫描成像过程。
7. 图像采集和处理：根据需要，可设置图像采集的帧数、分辨率等参数，并在采集图像后进行必要的图像处理和分析。
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
右键单击框选的区域设置一个感兴趣的图集
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
五、图象色彩调整
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
六、导出
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
Huang’s lab ZEN图象处理教程
——————选取与微调整
2016.5.1 唐浚博
前言
本教程以一张共聚焦显微镜照片（20160120_crb-HA_HA-aPKC_st11-1Az_40X）为例， 讲解如何选取感兴趣区域并加以处理。
本教程仅对最基础最简单的功能进行说明。欢迎大家批评指正和完善。
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
此后仍有更新，但版本号无变化。2012与2此两个版本适用的显微镜不同，所以市面上 均有存在，但图片处理相互兼容。Zen lite为免费软件，与zessi激光共聚焦扫描显微镜一同 食用效果更佳。 /microscopy/zh_cn/downloads/zen.html#inpagetabs-1 关于blue edition和black edition的区别 blue edition处理功能更丰富；black edition的导出选项更丰富。二者互补。 理论上两个版本都应安装，安装时请注意系统位数
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在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
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Z-位置可以提取某个 时间点的图象
若要导出为多通道拼合的图片，则需要 使用black edition
同时打开blue edition和black edition
在blue edition中：文件--图象转移至 ZEN-black版本
在black edition中：file—export
当旋转到 合适的角 度后，即 可圈选出 所需区域
在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
本操作在2D模式下进 行即是对所有通道同 时进行操作，若需要 单独对某一通道进行 操作，请在拆分模式 下进行。
注意：必须同时打开两个版本此选项才能被选中
3.用ZEN blue edition 打开图片
打开后可 以看到处 理功能更 加丰富 （若安装 的是实验 通用的版 本则为中 文版）
三、图象旋转
点击左侧任务栏中的： 处理-几何
可通过两种方式旋转图象
OR
点击Rotate 2D，在参数中 点击旋转，在参数中调整夹
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
此后仍有更新，但版本号无变化。2012与2此两个版本适用的显微镜不同，所以市面上 均有存在，但图片处理相互兼容。Zen lite为免费软件，与zessi激光共聚焦扫描显微镜一同 食用效果更佳。 /microscopy/zh_cn/downloads/zen.html#inpagetabs-1 关于blue edition和black edition的区别 blue edition处理功能更丰富；black edition的导出选项更丰富。二者互补。 理论上两个版本都应安装，安装时请注意系统位数
调整夹角度数（正值为顺时 角Z度数（正值为顺时针旋
针旋转角度），点击应用
转角度），点击应用
用两种方式旋转45° 后的效果相同
应用后可以发现并非 在原图基础上修改而 是新建了一张处理过 的图象
每一次应用一种新的 效果都会在当前图象 上进行处理，并新建 一张新的图象
四、选取感兴趣区域（ROI）
默认使用black edition打开.lsm 格式文件
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
点击左上角file--save as 图片格式选择第一个czi保存 保存后的图片即可用blue edition 打开
2.格式转换(2)
此方法无需转换格式。 同时打开blue edition和black edition Flie—send to ZEN2-blue edition
右键单击框选的区域设置一个感兴趣的图集
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
五、图象色彩调整
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
六、导出
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
Huang’s lab ZEN图象处理教程
——————选取与微调整
2016.5.1 唐浚博
前言
本教程以一张共聚焦显微镜照片（20160120_crb-HA_HA-aPKC_st11-1Az_40X）为例， 讲解如何选取感兴趣区域并加以处理。
本教程仅对最基础最简单的功能进行说明。欢迎大家批评指正和完善。
二、1.文件格式
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格
式。注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
2.格式转换(1)
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
输出选项中选择full resolution
自动输出为tif格式
导出后的文件
此时的图象依然不是最终图象，还要通过ps调整分辨率等
七、结语
本教程仅对部分功能进行了说明，提供了简单的修图思路，还有很多内容需要使 用者自己探索。
关于导出格式的总结请参考另一份教程。 祝看过这个教程的各位早日发大文章！