研究生高级菌物学菌物在生物界中的地位及分类
真菌分类学讲义第一章菌物的基本概念

主讲教师:林英任博士教授林英任,1951年11月生,男,汉族,安徽金寨人,中共党员,博士。
1974年毕业于安徽农学院林学系,并留校任教。
1998年于东北林业大学研究生部毕业,获博士学位。
历任安徽农学院助教、讲师、副教授。
现任安徽农业大学教授,森林保护学、微生物学专业博士生导师。
兼任中国菌物学会理事,《菌物研究》期刊编委,安徽省植物病理学会常务理事。
获省首届青年科技奖,被遴选为省高校中青年学科带头人培养对象,省首批跨世纪学术和技术带头人,享受省政府特殊津贴。
林英任教授主要从事林木病理学、菌物学的教学与科研工作。
主讲“森林(经济林、园林植物)病理学”、“林病流行与治理”、“高级菌物学”、“拉丁文”等课程。
指导硕士、博士研究生多名。
先后主持“中国真菌志·斑痣盘菌目卷研编”、”斑痣盘菌科及相关类群分子系统学研究”等国家自然科学基金项目4项和“安徽盘菌资源及其经济重要性研究”等省级科研项目10余项。
在国内外学术刊物上发表论文60余篇,主要有“中国斑痣盘菌目分类研究”、“盘菌纲一新属——新齿裂菌属”、“国内新见的木本药用植物病害”、“中华猕猴桃病害及其防治”等。
合著《牯牛降科学考察集》、《果树常见病虫害防治》等。
曾获国家农业科技推广奖、省自然科学二等奖、省科技进步三等奖(2项)、省高校科技进步一等奖和校“九五”科技先进个人一等奖。
课程内容《高级菌物分类学》以Ainsworth et al.(1973)的分类体系为基本框架,同时参考Hawksworth et al.(1995)和Kirk et al.(2001)的有关分类主张,系统讲授鞭毛菌、接合菌、子囊菌、担子菌和半知菌亚门及其下属各分类阶元的分类地位和鉴别特征。
此外对菌物的一般性状、植物病原菌的治理和病菌、害虫天敌及食药用菌的开发利用等情况作简要介绍。
旨在学生为识别、发掘、利用和改造菌物打下良好基础。
适用学科专业森林保护学、微生物学专业研究生。
植物病理学:第三章 第二节 菌物的分类

二、菌物分类系统
(一)菌物分类的目的: 根据国际上已经承认的一些分类系统给
每一种菌物命名,以便交流有关菌物的各 方面的知识;指出已知菌种之间的亲缘关 系,因为亲缘关系相近的种其生物学特性 也相似
(二)分类系统:
1. Ainsworth系统(1973):采用Whittaker的五 界系统,将所有菌物归于真菌界,并将真菌界
MycoBank
MycoBank /
MycoBank
/Biolomics.aspx?Table =Mycobank
MycoBank
/Biolomics.aspx?Table =Mycobank
6) 担子菌门(Basidiomycota) 柄锈菌亚门(Pucciniomycetes) 黑粉菌亚门(Ustilaginomycotina) 伞菌亚门(Agaricomycotina)
小结
菌物包括粘菌、卵菌和真菌,在生物八界 分类系统中,菌物被分别归入原生动物界、 假菌界和真菌界中
菌物分类系统是根据菌物在形态、生理、 生化、遗传、生态、超微结构及分子生物 学等多方面的特征建立起来的
第三章 植物病原菌物
第二节 菌物的分类
主要从事亚热带地区木材腐朽菌(多孔菌目)和炭疽菌的 多样性、形态学、分子系统发育学和生态学等方面研究
一、菌物在自然界中的地位
1.传统的两界分类系统:林奈( Linnaeus, 1753)─ 瑞典人 动物界:各种动物 植物界:藻菌植物、苔藓植物、蕨类
植物和种子植物四个门 此后有一些变化:
纲(Class) 冬孢菌纲 Teliomycetes 目(Order) 锈菌目Uredinales 科(Family) 柄锈菌科 Pucciniaceae 属(Genus) 柄锈菌属 Puccinia 种(Species) 禾谷种 graminisห้องสมุดไป่ตู้变种(Variety) 小麦变种 var. tritici
第一讲菌物的分类

本 原生生物界 书
黏菌门 原质菌门
根肿菌纲
用 藻菌界
的
丝壶菌门 网黏菌门 卵菌门
卵菌纲
的分类系统)
分 菌物界(本书基本采用的还是Ainsworth 类 系
壶菌门
壶菌纲
接合菌门
接合菌纲 毛菌纲
统
采用的是2001年 <菌物辞典> 第九版的分界地位
Smith,1981,1988)将细胞生物分为八界, 创立了八界系统学说。
1995年出版的《菌物词典》 (第8版)接受 了八个界的系统。
生物八界系统
古细菌界 Archaebacteria 真细菌界 Eubacteria 古动物界 Alveolates 原生生物界 Protozoa* 假菌界 Chromista* 真菌界 Fungi* 植物界 Plantae 动物界 Animlia
2001年出版的《菌物词典》 (第9版)与(第8版)相 似,但有如下变动: 1、将藻物界的卵菌门4个目增加到12个目。 2、将子囊菌分为8个纲,56个目。 3、担子菌门下取消了冬孢菌纲,设立了锈菌纲。 4、取消了“有丝分裂孢子真菌”的名称,改用 “无性态真菌”。
八界系统
菌物分类的多界系统
本 菌物界(本书基本采用的还是Ainsworth
子囊菌门
的分类系统)
书
用
的 分 类 系
半子囊菌纲 不整囊菌纲 核菌纲 虫囊菌纲 盘菌纲 腔菌纲
担子菌门
腹菌纲 层菌纲 冬孢菌纲
半知菌类(无性态菌物)
芽孢纲 丝孢纲 腔孢纲
统
采用的是2001年 <菌物辞典> 第九版的分界地位
3-分类-菌物界各门

l (2) 粘菌是介于动物和真菌之间的一群生物。 粘菌大多数生于森林中阴暗和潮湿的地方,在腐
木上、落叶上或其它湿润的有机物上。 l (3)约500种。大多数粘菌为腐生菌,无直接的经济意
义,只有极少数粘菌寄生在经济植物上,危害寄主。
一、粘菌门
发网菌属Stemonitis,属于粘菌纲:
有真正的变形体,通常产生具鞭毛的游动细胞,子实体的外 表有一层包被包围着孢子。
l (3) 无性生殖。游动孢子具有等长的双鞭毛,茸鞭在 前,尾鞭在后。
l (4) 有性生殖。为卵式生殖,产生的合子称卵孢子, 卵菌因而得名。
l (5) 在核循环、赖氨酸生物合成途径、色氨酸合成酶 沉 降 图 型 、 DNA 的 GC( 鸟 嘌 呤 、 胞 嘧 啶 ) 百 分 比 , 25s RNA分子量、细微形态结构特征等方面,卵菌与真菌有 本质的区别。亦即在“生理学、生物化学、细胞学、分 子生物学”等方面不同于真菌。
孢子植物学
概念、主要特征、生态意义、系统地位
廖文波 中山大学生命科学学院 2001年2月19日-7月14日
研究生课程:《孢子植物学》讲义
第二章 菌 物
l 菌物概论 l 粘菌门 l 卵菌门 l 真菌门 l 菌物的起源和演化 l 菌物与人类生活的关系
菌物概论
1、菌物界的建立 l (1) 1753年, 林奈(Linneaus)将生物界划分为两个界, 即:
3-分类-菌物界各门

4、真菌的繁殖
l (1) 营养繁殖: 菌丝断裂、细胞分裂、形成特殊的繁殖细胞。
① 芽生孢子blastospore: 从营养细胞出芽形成,芽生孢子脱离母体 后,即长成1个新的个体。 ② 厚壁孢子chlamydospore: 是菌丝中个别细 胞膨大形成的休眼孢子,其原生质浓缩,细胞壁加厚,在渡过不良环境 后再萌发为菌丝体。 ③ 节孢子(arthrospore): 是由菌丝细胞的依次断裂 形成。
植物界、动物界。
二界分类系统是一个简单、明了的分类法,在日常生活中仍 沿用至今, 它含有一个普通的、广泛意义。
l (2) 1969年, 魏泰克(Whittaker)提出五界系统,即: 原核生物界、原生生物界、植物界、菌物界、动
物界。 其中, 多细胞的真核生物,按营养方式(光合作
用、自养、异养、蚕食等)分为3界: 植 物 界 Plantae 、 真 菌 界 Fungi 、 动 物 界
各1条。 l (3) 有性生殖, 产生静配子, 卵配。
卵囊中具有1个或数个卵。
二、卵菌门 Oomycota
1、卵菌门与真菌门的区别
l (1) 卵 菌 营养菌丝无分隔,仅在繁殖时基部出现横 隔,与低等真菌相似。菌体与大多数真菌一样,为分 枝的丝状体,称菌丝体(mycelium)。
l (2) 细胞壁多含纤维素、半纤维素,而真菌门细胞壁 多含几丁质。
Animalia。
l (3) 1993年, 在全国菌物学会上,裘维蕃院士认为早期将“Fungi” 翻释为“真菌界”是一个错误,应译为: 菌物界。 fungi, i, m. 磨菇。
2-2菌物的分类及主要类群

• 命名起点:《国际植物命名法规》(1981) 菌物和植物的命名起点都是 1753年5月1日。
• 合格发表:有拉丁文描述;清晰的照片或 绘图;发表在正式的刊物上;必需保存模 式标本(type)。
• 优先权:第一个发表的具有优先权,其它 以后发表的名称都是该名称的异名 (synonym)。
真菌界分类检索表
1.原生质团或假原生质团存在 粘菌门 1.原生质团或假原生质团缺乏2(真菌门) 2. 有能动细胞(游动孢子),有性孢子为卵孢子
鞭毛菌亚门 2.无能动细胞 3 3.具有性阶段 4 3. 缺有性阶段 半知菌亚门 4.有性孢子为子囊孢子 子囊菌亚门 4.有性孢子为接合孢子接合菌亚门 4.有性孢子为担孢子担子菌亚门
• 学名需改动,建立新组合时,将原定名人 用括号括起来。
• 一种菌物只能有一个学名,对于半知菌 的允许有性阶段和无性阶段采用不同的 学名。
• 学名用拉丁文书写,采用双名法命名: 属名+种加词(+命名人)
如:Puccinia graminis Pers.
Puccinia recondida Rob. et. Desm.
型:Puccinia graminis f.sp.tritici。
变种(variety,var. ):不同群体有形态差异和对寄主科\属的选择性
禾柄锈菌(Puccinia graminis)
小麦禾柄锈菌(P.graminis var. tritici) 燕麦禾柄锈菌(P.graminis var. avenae)
专化型(forma specialis, f.sp.)不同群体无形态差异,对寄主科\属具选择性
尖镰孢菌(Fusarium oxysporum)
菌物分类学

菌物分类学菌物分类学是生物学中的一个重要分支,主要研究真菌的分类、命名和归类。
真菌是一类特殊的生物体,既不属于植物,也不属于动物,具有自己独特的特征和生命周期。
通过对真菌进行分类,可以更好地了解它们的特征、生态习性和与人类生活的关系。
真菌的分类根据传统分类体系,真菌被分为四个主要的门:接合菌门、担子菌门、子囊菌门和线形菌门。
而根据现代分类系统的研究,真菌还包括霉菌、酵母菌以及其他特殊种群。
接合菌门接合菌门包括了许多常见的真菌,如黑曲霉、纹枯黑曲霉、表生豆状短梗孢等。
这类真菌的生殖方式是通过产生具有性实体的接合孢子来进行繁殖。
担子菌门担子菌门是真菌中最大的一个门,包括了大多数的蘑菇、伞菌和鹅膏菌等。
这类真菌的特点是其菌盖上携带有担子,担子通过生殖孢子的形式进行繁殖。
子囊菌门子囊菌门是指通过产生子囊来进行繁殖的真菌。
这类真菌包括了草地黑粉菌、弯孢黑霉等。
子囊菌类真菌的子囊可以在其子囊床上产生子囊孢子。
线形菌门线形菌门中包括了一类特殊的真菌,它们以产生分生子的链状结构为特征,如硬麴霉、黑链麴霉等。
霉菌霉菌是一类不完全真菌,与其他真菌相比,它们的生殖方式相对简单,常常通过产生分生孢子进行繁殖。
霉菌的分类相对较为复杂,可以根据其菌丝结构、形态特征和生理特点进行分类。
酵母菌酵母菌是一类单细胞真菌,它们以产生芽孢进行繁殖,并且可以在无氧条件下进行发酵过程。
酵母菌的分类一般根据其形态特征以及生理特点进行划分。
真菌分类的意义真菌的分类在生物学研究中具有重要的意义。
首先,对真菌进行分类可以帮助我们更好地了解它们的物种多样性和进化关系。
不同的真菌物种具有不同的形态特征、生态特点和遗传特征,通过分类可以清晰地描述和比较这些特征,为进一步研究提供基础。
其次,真菌的分类对于人类的生活和健康具有重要的意义。
许多真菌是病原体或者产生毒素的,它们会对人类、动物和植物的健康造成威胁。
通过对真菌进行分类,可以更好地了解其生态习性、生活史和致病机制,从而更好地应对真菌相关的疾病。
第十三章真菌的分类学地位(普通真菌学)

(3)Alexopoulus(1979)的系统 ( )
①裸菌门 ②鞭毛菌门 ③无鞭毛菌门
(4)Smith(1995)的系统 ( )
①壶菌门、 ②接合菌门、 ③子囊菌门、 ④担子菌门、 ⑤半知菌类 壶菌门、 接合菌门、 子囊菌门、 担子菌门、
真菌界的5 真菌界的5个门 真菌界5 真菌界5个门的主要特征 门
一、真菌DNA碱基的分类鉴定 通过测定不同真菌DNA的四个碱基中A、G、 C、T的组成来鉴定真菌,在真菌分类中有两 个作用 1、可以鉴定真菌的种、属 2、可以作为判定真菌科属间的亲缘关系的 参考标准
二、核酸分析技术
基于Southern Southern杂交技术的分子标记 1、基于Southern杂交技术的分子标记 利用限制性内切酶酶解及凝胶电泳分离不同 的生物DNA分子,然后用经标记的特异DNA探 针与之进行杂交,通过放射自显影或非同位 素显色技术来揭示DNA的多态性,主要有RFLP 和VNTR。
真菌界(五界系统) 真菌界(五界系统)
《The Dictionary of Fungi, 1983》
粘菌门(Myxomycota)---7个纲 粘菌门(Myxomycota)---7 真菌门(Eumycota)---5个亚门 真菌门(Eumycota)---5 鞭毛菌亚门(Mastigomycotina)--3个纲 接合菌亚门(Zygomycotina)--2个纲 子囊菌亚门(Ascomycotina)--5个纲 担子菌亚门(Basidiomycotina)--3个纲 半知菌亚门(Deuteromycotina)--3个纲
壶 菌 接合菌 子囊菌 担子菌 半知菌
营 养 体
无性繁殖
有性生殖
原质团或没有隔 休眠孢子囊或 游动孢子 膜的菌丝体 卵孢子 菌丝体,典型的 孢囊孢子 接合孢子 没有隔膜 有隔膜的菌丝体, 分生孢子等 子囊孢子 少数是单细胞 有隔膜的菌丝体 有隔膜的菌丝体 或单细胞 不发达 担孢子
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
第三节 菌物的起源及演化
一、菌物起源的两个学派
l菌物来自藻类:根据性器官的形态及交配方式推测,认 为菌物是失去色素并变成异养的藻类。这种起源是多元 的——鞭毛菌来自绿藻,接合菌来自接合藻,子囊菌来 自红藻,担子菌则由子囊菌演化而来。
l菌物来自原始鞭毛生物:许多菌物系统发育研究者认为 菌物来自原始的鞭毛生物。鞭毛生物的演化也是多元的 ——后生单鞭毛者演化为壶菌,前生单鞭毛的演化为丝 壶菌,双鞭毛的演化为卵菌,子囊菌由藻状菌演化而来。 现今持此观点的人居多。
3. Hawksworth et al.(1995)分类体系:
在《Ainsworth & Bisby’s Dictionary of the Funpi, 8th edn.》中,部分采用Cavalier-Smith(1988~1989)生物 八界系统,把菌物(广义的真菌)置于真核生物超界 中,涉及原生动物界、假菌(类藻菌)界和真菌界3界、 11门及1类,共知72065种。
根据Hawksworth et al.(1995),菌物所涉及 的三个界主要区别如下:
l原生动物界——异养(吞食营养)或自养(光合 作用);细胞壁在营养生长时缺,存时成分不一; 线粒体网壁(冠状突起)管状;鞭毛的茸毛非管状。
l假菌界——自养(光合或吸收营养);胞壁常含 纤维素,缺几丁质和β-葡聚糖;线粒体网壁管状; 鞭毛的茸毛管状。
第六章 菌物在生物界中的 地位及分类
第一节 菌物分类的目的和依据
二、依据:通常以形态解剖学、细胞学(超微结构 等)、生理生化学(氨基酸序列、蛋白质或RNA凝胶 电泳、DNA的GC%、血清学反应、胞壁的多糖组分及 结构、赖氨酸的生物合成途径、多元不饱和脂肪酸种 类、培养性状等)、生态学(寄主或基物种类、对环 境因子的要求等)特征为依据,尤以有性型的形态结 构特征为主要依据。必要时以个体发育特征和系统发 育资料等为辅助依据。对疑难或近似种类,则应根据 有关分子生物学性状和表型特征综合分析其分类地位。 目前RAPD(随机扩增多态性DNA)、RFLP(限制性 片段长度多态性)分析和DNA序列测定等较先进技术, 已愈来愈多地用于菌物鉴定和分类。
二、命 名
l 采用 Linnaeus 的双名法以及后增加的三名法、 四名法。
如齐整小核菌: Sclerotium rolfsii Sacห้องสมุดไป่ตู้ .
属名 种加词 命名人姓氏(Saccardo)
又如围小丛壳: Glomerella cingulata (Stonem.) Spauld. et Schrenk
第二节 菌物在生物界中的地位
一、林奈(Linnaeus,1753)两界系统 植物界——菌藻植物门(后单列为真菌门) 动物界
一、目的:世界菌物约有100~150万种,已描述 80060种,为避免混乱、便于交流,必须按较合理的 分类系统给每一种(或其他分类阶元)菌物进行命 名,并确定它在该系统中的分类地位;此外,应尽 可能指出与已知种类之间的亲缘关系。
l真菌界——异养(吸收/渗透营养);胞壁含几丁 质和β-葡聚糖;线粒体网壁扁平,鞭毛的茸毛缺 (即无茸鞭)。
4. Kirk et al. ( 2001 ) 分类体系:
即《安、比氏菌物词典》第九版的分类体系,仍 维持该书第八版的基本框架,只是取消了网柱菌门 (Dictyosteliomycota),将其降级为粘菌门下的网柱 菌纲(Dictyosteliomycetes),形成菌物3界10门1类 系统;已知菌物种数增至80060种。
第五节 菌物分类系统及大纲
一、几个重要的菌物分类系统
1. 传统分类体系(1965年以前): 3纲(藻状菌、子囊菌、担子菌纲)1类(半知菌 类)。
2. Ainsworth et al .(1973)分类体系: l在《The Fungi:An Advanced Treatise, Vol.4》中
将菌物界分为粘菌门和真菌门。粘菌门分4纲,真 菌门分5亚门18纲68目。 l该系统近二、三十年来在我国乃至世界许多国家 被广泛采用。
二、Whittaker(1969)五界系统
生物
原核类——原核生物界(细菌、蓝藻)
单细胞——原生生物界
真核类
植物界(光合作用)
多细胞 真菌界(吸收营养)
动物界(吞食营养 )
三、陈世骧(1979)六界系统
真核总界
植物界 真菌界 动物界
原核总界 蓝藻界 细菌界
非细胞总界 —— ?病毒界
四、Cavalier-Smith(1988~1989)八界系统
真核生物超界(Domain Eukaryota) 原生动物界(Kingdom Protozoa) 集胞菌门(Acrasiomycota) 网柱菌门(Dictyosteliomycota) 粘菌门(Myxomycota) 原质团菌门(Plasmodiophoromycota) 假菌(类藻菌)界(Kingdom Chromista) 丝壶菌门(Hyphochytriomycota) 网粘菌门(Labyrinthulomycota) 卵菌门(Oomycota) 真菌界(Kingdom Fungi) 子囊菌门(Ascomycota) 担子菌门(Basidiomycota) 壶菌门(Chytridiomycota) 接合菌门(Zygomycota) 有丝裂孢菌物(Mitosporic Fungi)
最初命名人 改名人
再如松木层孔菌一变种——冷杉木层孔菌:
Phellinus pini ( Thore ex Fr. ) Ames var. abietis Karst.
最早描述者 代为发表者 种的改名者 变种
或按前者描述 重新命名后发表者
(varietas)
变种命名者
l两个种名问题
国际植物命名法规规定,与其它生物类群不同, 一种菌物可以有两个名称。一个是无性阶段名称,一 个是有性阶段名称。
二、菌物的演化
l Whittaker(1969)认为菌物起源于单细胞鞭毛 生物,有壶菌、卵菌、丝壶菌、根肿菌等7条演 化线,其中主轴为壶菌演化线:鞭毛生物 →壶 菌 → 接合菌 → 子囊菌 → 担子菌。
l余永年(1984)提出的菌物起源及演化的可能途径:
第四节 菌物的分类等级及命名
一、分类等级(阶元)