森林菌物分类学新进展
基于深度学习的蘑菇图像分类研究

基于深度学习的蘑菇图像分类研究作者:肖杰文赵铖博李欣洁刘钟钰庞博杨彝华王建新来源:《软件工程》2020年第07期摘要:为了解决蘑菇图像分类的问题,实现野生菌毒性快速识别,以7种蘑菇作为研究对象,提出了一种基于深度学习的蘑菇图像分类的方法。
所提出的分类方法在考虑了自然场景图像的特点下,利用图像像素信息进行特征提取,提取到的特征向量具有可辨别性、独立性和鲁棒性;轻量级ShuffleNetV2模型与作为其他常用CNN模型相比具有更高的精度。
实验表明,基于ShuffleNetV2的蘑菇分类模型的Top-1准确率为55.18%,Top-5准确率为93.55%,能够一定程度上解决蘑菇图像分类困难的问题。
未来结合移动设备和嵌入式开发,将能够用于自然环境下野生菌的自动分类,为蘑菇产业智能化和自动化提供新的思路。
关键词:深度学习;图像分类;蘑菇;卷积神经网络中图分类号:TP399 文献标识码:AAbstract: In order to cope with the problem of mushroom image classification and facilitate the rapid identification of wild mushroom toxicity, a method of mushroom image classification based on deep learning is proposed for seven kinds of mushrooms. The proposed classification method takes into account the characteristics of natural scene images and uses image pixel information for feature extraction. The extracted feature vectors are distinguishable, independent and robust; the lightweight ShuffleNetV2 model is used and has higher accuracy compared with other commonly used models such as CNN. Experiment results show that the mushroom classification model based on ShuffleNetV2 has a Top-1 accuracy of 55.18% and a Top-5 accuracy of 93.55%, which can solve,to some extent, the difficulty of mushroom image classification. If combined with mobile devices and embedded development in the future, it can be used for automatic classification of wild fungi in natural environments.Keywords: deep learning; image classification; mushroom; convolutional neural networks1 引言(Introduction)蘑菇又稱大型真菌,野生的蘑菇也称野生菌。
菌物分类学研究中常见的物种概念

菌物分类学研究中常见的物种概念
菌物分类学,又称为系统发育学,是一门研究菌物分类的学科,它的主要研究内容是菌物的系统发育和分类。
菌物分类学涉及多个学科,包括形态学、生物化学、生物物理学和遗传学等,还有细菌学、真菌学和放线菌学等。
菌物分类学的研究对象也很多,主要包括植物、动物、微生物、真菌、放线菌等。
在菌物分类学研究中,最常见的物种概念是种、属、科和目。
种是最小的菌物类别,它是由具有共同形态特征的个体组成,它们可以交配产生后代;属是数个相似的种的集合,它们具有一些共同的形态特征;科是数个相似的属的集合,它们具有共同的生物特性;目是数个相似的科的集合,它们具有共同的结构特征。
菌物分类学的研究不仅是为了认识菌物,也是为了更好地利用菌物。
菌物分类学可以帮助我们了解菌物的形态结构、生态习性、生物学特性和繁殖习性等,从而更好地利用菌物。
此外,菌物分类学还可以帮助我们更好地理解菌物之间的关系,以及菌物在生物进化过程中的角色。
菌物分类学的研究内容极为丰富,其中常见的物种概念是种、属、科和目。
它们的划分标准是菌物的形态特征、生物学特性和繁殖习性。
菌物分类学的研究不仅有助于我们认识菌物,还有助于我们更好地利用菌物,更好地理解菌物之间的关系,以及菌物在生物进化过程中的角色。
微生物学领域的新发现和研究成果

微生物学领域的新发现和研究成果微生物学是研究微生物的学科领域,而微生物包括细菌、真菌、病毒、古生菌等众多种类。
在最近几年中,微生物学的研究发展非常迅速。
科学家们不断地发现和研究各种新的微生物种类,探索它们在各个领域中的应用。
下面就让我们一起看看微生物学领域最新的一些研究成果和发现吧。
一、微生物群落的多样性微生物群落的多样性是微生物学最早研究的问题之一。
随着高通量测序技术的逐步普及,越来越多的研究发现,各种微生物群落的组成和功能十分复杂。
比如,肠道微生物群落是人体内最为复杂的微生物生态系统之一,它们与许多疾病,如肥胖症、糖尿病等有关。
近期的研究成果表明,肠道微生物群落在肯定程度上影响了宿主的行为。
比如,某些肠道细菌可以分泌反应性氮化物,这种化合物可以影响脑部神经传递物质的合成和释放。
这一发现引起了许多科学家的兴趣,他们希望通过研究肠道微生物群落的变化与宿主行为的变化之间的关系,探索肠道微生物群落对人类行为和心理的影响机制。
二、微生物的基因工程微生物的基因工程是微生物学领域最为活跃的研究方向之一。
它利用基因技术手段,从亲代微生物中提取目标基因,并将其插入到宿主微生物的基因组中。
通过这种方式,科学家们可以制造出各种新型微生物,例如,利用基因工程技术构建转基因微生物可以被用来生产各种生物制品。
例如,某些很难在自然环境中生长繁殖的微生物可以通过人工改造,让它们可以自动在大规模的容器中繁殖生长,从而制造出各种人们需要的生物制品。
同时,利用基因工程技术可以构建安全和高效的人体细胞表达系统,从而制造出大量的蛋白质、抗体等生物制品。
三、微生物与环境的关系微生物与环境的关系是微生物学领域最早被科学家所关注的问题之一。
在最近几年中,许多新型的微生物种类被发现,并研究了他们在天然环境中的分布状况、种群大小、及其生物地理学分布。
比如,深海微生物群落是被科学家们关注的一个热门研究方向。
目前,科学家们已经发现了许多生活在深海区域中的微生物种类,他们适应了极端的环境条件,并可以从海底中获取到一些重要的营养物质,如热液和热水中的矿物质,从而在海洋生态系统中发挥着重要的作用。
2-2菌物的分类及主要类群

• 命名起点:《国际植物命名法规》(1981) 菌物和植物的命名起点都是 1753年5月1日。
• 合格发表:有拉丁文描述;清晰的照片或 绘图;发表在正式的刊物上;必需保存模 式标本(type)。
• 优先权:第一个发表的具有优先权,其它 以后发表的名称都是该名称的异名 (synonym)。
真菌界分类检索表
1.原生质团或假原生质团存在 粘菌门 1.原生质团或假原生质团缺乏2(真菌门) 2. 有能动细胞(游动孢子),有性孢子为卵孢子
鞭毛菌亚门 2.无能动细胞 3 3.具有性阶段 4 3. 缺有性阶段 半知菌亚门 4.有性孢子为子囊孢子 子囊菌亚门 4.有性孢子为接合孢子接合菌亚门 4.有性孢子为担孢子担子菌亚门
• 学名需改动,建立新组合时,将原定名人 用括号括起来。
• 一种菌物只能有一个学名,对于半知菌 的允许有性阶段和无性阶段采用不同的 学名。
• 学名用拉丁文书写,采用双名法命名: 属名+种加词(+命名人)
如:Puccinia graminis Pers.
Puccinia recondida Rob. et. Desm.
型:Puccinia graminis f.sp.tritici。
变种(variety,var. ):不同群体有形态差异和对寄主科\属的选择性
禾柄锈菌(Puccinia graminis)
小麦禾柄锈菌(P.graminis var. tritici) 燕麦禾柄锈菌(P.graminis var. avenae)
专化型(forma specialis, f.sp.)不同群体无形态差异,对寄主科\属具选择性
尖镰孢菌(Fusarium oxysporum)
微生物学中的新研究成果

微生物学中的新研究成果微生物是生命中最为基础的存在之一。
它们不仅广泛地存在于自然界中,而且对于土壤、食品、水质、人类肠道等方面都有着不可或缺的作用。
随着科学技术的不断进步,微生物学研究也不断取得新的进展,打开了更多微小世界的奥秘。
一、单细胞真核生物——古菌的发现自20世纪下半叶以来,研究人员对单细胞真核生物——古菌的研究越来越深入。
古菌并不是细菌,而是一种特殊的真核生物,与其他真核生物相比,它们具有更高的温度耐受性,并且在一些高温、寒冷、高压等极端环境中依然可以存活繁殖。
例如,热泉、火山岩浆中或深海的黑海盆地等。
这也为科学家们探索宇宙生命的可能性提供了方向。
近年来的研究表明,古菌有着更多的生态功能和科学应用价值。
例如,在环境污染修复方面可用于处理重金属、放射性物质等污染物质;在药物研发方面,古菌的生物活性物质可以应用于新药开发。
二、微生物来源食品和饮料的挖掘越来越多的人开始意识到“食以安为天”的道理,对于健康的食品和饮料需求也越来越高。
微生物来源的食品和饮料不仅口感独特,而且富含多种微生物和营养物质。
近年来,关于微生物来源食品和饮料的研究也在进一步开展中。
比如,小米酒,酿制小米酒时,小米中的微生物会发酵,不仅使小米的营养成分得以更快速的吸收,而且还含有丰富的活性酵素和益生菌,有助于调节肠道菌群;红曲米因为红曲霉的存在而具有健脾开胃、降脂、抗氧化等多种功效;酸奶则因为添加的乳酸菌,有助于提高人体免疫力、促进肠胃道的健康等。
不仅如此,当前,基于微生物的人造肉,被认为是未来食品发展方向之一。
这种肉类产品是利用微生物生产相关蛋白质,并将其运用到肉类产品中。
这种蛋白质具有与天然肉类相似的结构和口感,而又因为其是经过微生物生产,不含激素、抗生素等物质,食用更安全。
三、微生物参与肠道健康的探究随着人们生活和饮食方式的改变,肠道微生物的结构也在发生变化。
而肠道微生物密切关联着人类的很多生理功能,甚至与许多疾病的发生和发展有着密不可分的联系。
生物分类学的现状和趋势

生物分类学的现状和趋势生物分类学是生物学的一门重要分支,其主要任务是对生物进行分门、纲、目、科、属、种等不同等级的分类,以及确定各种类之间的演化关系。
生物分类学的发展历程长达几百年,一直以来都是生物学研究的重要基础和理论支撑。
但是,随着科技的不断发展和人们对生物多样性的认识不断加深,现代生物分类学也面临着许多挑战和机遇。
一、生物分类学的现状生物分类学的历史可以追溯到16世纪,这时常被称为“现代生物分类学”的时期。
人们在对植物和动物的研究中,开始进行有组织的分类和命名,开创了生物物种概念的起源。
在18世纪和19世纪,生物分类学经历了极为重要的进展,包括分类学的基本原则得到建立,分类学家们提出了众多的系统分类方法,并发现了许多新的物种。
如今,随着生物多样性的研究越来越深入,生物分类学也在不断地发展壮大。
生物分类学现阶段主要的工作还是对新发现的生物物种进行分类和命名。
国际上统一采用《国际动植物命名规则》和《菌物命名规则》进行命名和分类,这两个规则是国际生物分类学委员会颁布的,涵盖了植物、动物和真菌等多个领域。
生物分类学家们运用分子生物学、形态学、生态学等多种手段,利用分系系统学的原则,不断完善对生物物种的分类,以及物种间的进化关系。
二、生物分类学的挑战生物多样性是自然现象的一个重要方面,而当前生物多样性正面临着许多威胁,这也对生物分类学提出了极大的挑战。
其中一个挑战是生物物种的快速消失。
地球上的生物物种正以空前的速度消失,很多物种都正在走向灭绝。
如何追踪和保存这些消失或即将消失的物种,是生物分类学家们的一个重要任务。
另一个挑战是关于生物分类学的科学原则的改进。
随着生物学研究的深入,许多新的科技手段和实验方法被引入到生物学研究中,这些新的科学原则需要在生物分类学中得到运用和推广。
同时,许多生物物种在形态学特征上非常相似,难以仅仅依靠形态学来进行分类和鉴定,准确的物种命名和分类变得更加困难。
三、生物分类学的趋势面对现代化发展和生物多样性的挑战,生物分类学正在向着以下趋势发展:1. 多学科融合:生物分类学的研究需要物种分类、进化、分子生物学、解剖学等多个学科的支持。
《中国大型菌物资源图鉴》札记

《中国大型菌物资源图鉴》阅读记录目录一、内容概括 (2)1.1 菌物的重要性 (2)1.2 中国菌物资源的分布与特点 (3)1.3 本书的目的与内容概述 (4)二、中国大型菌物的分类 (6)三、中国大型菌物的形态特征 (6)3.1 根据菌盖、菌褶等特征的分类 (7)3.2 根据菌肉、孢子等特征的分类 (8)3.3 根据菌丝、子实体等特征的分类 (9)四、中国大型菌物的生态分布 (11)4.1 气候条件对菌物分布的影响 (11)4.2 地形地貌对菌物分布的影响 (12)4.3 植被类型对菌物分布的影响 (14)4.4 社会经济因素对菌物分布的影响 (15)五、中国大型菌物的利用价值 (16)5.1 食用价值 (17)5.2 药用价值 (18)5.3 工业用途 (19)5.4 科学研究价值 (21)六、中国大型菌物的保护与可持续发展 (22)6.1 野生菌物资源的保护 (23)6.2 人工栽培技术的推广 (24)6.3 菌物资源的可持续利用策略 (25)七、结语 (27)7.1 中国大型菌物资源的丰富性与独特性 (28)7.2 中国大型菌物资源的研究与应用前景 (29)7.3 对未来研究的展望 (30)一、内容概括在内容方面,这本书以图文并茂的方式,清晰地展示了各类大型菌物的形态特征,使得读者能够直观地识别和了解这些生物。
结合作者的实地考察经历和科研成果,书中还提供了关于大型菌物地理分布、生态环境以及资源利用等方面的深入分析,为科研人员和爱好者提供了宝贵的参考。
值得一提的是,本书在编纂过程中得到了众多专家学者的支持与帮助,确保了内容的准确性和权威性。
通过阅读这部图鉴,我不仅增加了对菌物世界的认识和兴趣,也对中国的大型菌物资源有了更深入的了解。
这本书无疑是一部推动我国菌物学研究和资源可持续利用的重要著作。
1.1 菌物的重要性菌物在生态系统中具有举足轻重的地位,它们是地球上最古老、最丰富的生物类群之一。
菌物分类学

菌物分类学菌物分类学是生物学中的一个重要分支,主要研究真菌的分类、命名和归类。
真菌是一类特殊的生物体,既不属于植物,也不属于动物,具有自己独特的特征和生命周期。
通过对真菌进行分类,可以更好地了解它们的特征、生态习性和与人类生活的关系。
真菌的分类根据传统分类体系,真菌被分为四个主要的门:接合菌门、担子菌门、子囊菌门和线形菌门。
而根据现代分类系统的研究,真菌还包括霉菌、酵母菌以及其他特殊种群。
接合菌门接合菌门包括了许多常见的真菌,如黑曲霉、纹枯黑曲霉、表生豆状短梗孢等。
这类真菌的生殖方式是通过产生具有性实体的接合孢子来进行繁殖。
担子菌门担子菌门是真菌中最大的一个门,包括了大多数的蘑菇、伞菌和鹅膏菌等。
这类真菌的特点是其菌盖上携带有担子,担子通过生殖孢子的形式进行繁殖。
子囊菌门子囊菌门是指通过产生子囊来进行繁殖的真菌。
这类真菌包括了草地黑粉菌、弯孢黑霉等。
子囊菌类真菌的子囊可以在其子囊床上产生子囊孢子。
线形菌门线形菌门中包括了一类特殊的真菌,它们以产生分生子的链状结构为特征,如硬麴霉、黑链麴霉等。
霉菌霉菌是一类不完全真菌,与其他真菌相比,它们的生殖方式相对简单,常常通过产生分生孢子进行繁殖。
霉菌的分类相对较为复杂,可以根据其菌丝结构、形态特征和生理特点进行分类。
酵母菌酵母菌是一类单细胞真菌,它们以产生芽孢进行繁殖,并且可以在无氧条件下进行发酵过程。
酵母菌的分类一般根据其形态特征以及生理特点进行划分。
真菌分类的意义真菌的分类在生物学研究中具有重要的意义。
首先,对真菌进行分类可以帮助我们更好地了解它们的物种多样性和进化关系。
不同的真菌物种具有不同的形态特征、生态特点和遗传特征,通过分类可以清晰地描述和比较这些特征,为进一步研究提供基础。
其次,真菌的分类对于人类的生活和健康具有重要的意义。
许多真菌是病原体或者产生毒素的,它们会对人类、动物和植物的健康造成威胁。
通过对真菌进行分类,可以更好地了解其生态习性、生活史和致病机制,从而更好地应对真菌相关的疾病。
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1.谈谈菌物在生物界的分类地位及其分类历史进展。
答:目前所谓的菌物(Fungi) 旧称真菌,是具有细胞核、没有叶绿体、借助于孢子进行有性和无性繁殖的异养生物(heterotrophic)。
其营养体通常是丝状、具有分支的管状结构,并多具有几丁质、少数具有纤维素、或几丁质与纤维素两种成分的细胞壁。
菌物在生物界的分类经过了一个漫长的阶段,1735年Linnaeus提出两界系统,菌物虽不能进行光合作用也无绿色,但有细胞壁就被列为了植物,细菌虽然能动但也因为其具细胞壁被列为植物。
Hogg (1861)Haeckel(1866)及中国学者邓叔群(1966)支持动物界、植物界、微生物界三界系统,因菌物不含叶绿素为异养型生物,这区别于其他植物所以将菌物分出,即生产者-植物、分解者-菌物、消费者-动物。
后来发展为四界系统Copeland, 1938, 1956; Whittaker,1959提出原生生物界、菌物界、植物界和动物界分类系统。
随着显微镜技术的发展,可把细胞分成两大类:原核细胞和真核细胞。
原核细胞很小,其体积约为真核细胞的千分之一;原核细胞染色体为裸露DNA(即没有与蛋白质结合),其周围也没有膜与细胞其他部分隔开(即为原核),真核细胞染色体为DNA和蛋白质的结合物,且有核膜与细胞其他部分隔开(即为真核)。
这两大类细胞的差异,反映了生物进化的不同水平,所以Whittaker 1969年又提出了五界分类系统:原核生物界,包括细菌和其他原核生物;原生生物界,包括单细胞真核生物,如原生动物和多数藻类;菌物界;植物界;动物界。
这是应用最为广泛的分类系统,因它基本上反映了地球细胞生物的进化历程。
人们发现在五界分类系统中,原核界的细菌在形态上尽管很相似,但根据分子水平上的差异可明显分成两大类:古细菌和真细菌,Cavalier-Smith认为,应把原核生物界分类两界:古细菌界和真细菌界,就有了六界系统。
Cavalier-Smith,l988-l989又提出了八界分类系统即澡界、菌物、动物、植物、古真核生物、原生动物、古细菌、真细菌。
菌物(真菌)分类历史与进展第一阶段:比较形态学阶段(1729-1860)主要依据肉眼可见的宏观形态鉴别真菌,分类简单。
Persoon,D.C.H.(1801)(荷兰)《Synopsis Methodica Fungorum》,《MycologiaEuropeae》2纲、6目;Fries,E.M.(1821-1823)(瑞典人,“真菌学之林奈”)《Systema Mycologicum》4纲、16目。
第二阶段:实验生物(细胞遗传)学阶段(1860-1960)利用显微镜观察真菌细胞学、繁殖体结构,以进化论观点进行反映自然亲缘关系的分类。
DeBary(1866)(德)《Morphologie und Physiologie der Pilze》分真菌为4纲:藻状菌纲、子囊菌纲、皮下菌(纲:锈菌、黑粉菌)、担子菌纲;Gäumann E. A.(1926,1952)(瑞士)《Vergleichende(比较) Morphologie der Pilze》4纲1类:古生菌纲(Archimycetes)、藻状菌纲(Phycomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌类(ImperfectFungi);Martin G. W.(1950,1961)(美)《Out line of theFungi》/BesseyE.A.,1950(美)《Morphology and Taxonomy of Fungi》3纲1类:藻状菌纲(Phycomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌类;邓叔群(1963)《中国的真菌》4纲1类:粘菌纲(Myxomycetes)、藻状菌纲(Phycomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌类(ImperfectFungi);Alexopoulos C. J.(1952)(美)《Introductory Mycology》真菌门分4纲:藻状菌纲(Phycomycetes:单鞭毛菌亚纲、双鞭毛菌亚纲、无鞭毛菌亚纲)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌纲(Deuteromycetes);Alexopoulos C. J.(1962)(美)《Introductory Mycology》(2ed.)真菌亚门分9纲(成为现代真菌分类学基础):根肿菌纲(Plasmodiophoromycetes)、壶菌纲(Chytridiomycetes)、丝壶菌纲(Hyphochytridiomycetes)、卵菌纲(Oomycetes)、接合菌纲(Zygomycetes)、毛菌纲(Trichomycetes)、子囊菌纲(Ascomycetes)、担子菌纲(Basidiomycetes)、半知菌纲(Deuteromycetes)。
第三阶段:超微结构与生物化学阶段(1960-1990)利用电子显微镜观察真菌细胞超微结构、生物化学成分分析。
Whittaker R. H.(1969)(美)《New concept of kingdom of organism》真菌独立为界(Fungi),分3亚界、8门:裸菌亚界Acrosiomycota、Myxomycota、Labyrinthulomycota(网粘菌门)、双鞭毛菌亚界Oomycota、真菌亚界Chytridiomycota、Zygomycota、Ascomycota、Basodiomycota;Ainsworth G. C.(1973)(英)《The Fungi》(ⅣAB)真菌独立为界,其中的真菌门(Eumycota)分5亚门、18纲:鞭毛菌亚门(Mastigomycotina) 、Chytridiomycetes、Hyphochytridiomycetes、Plasmodiophoromycetes、Oomycetes;Ainsworth G. C.(1973)(英)《The Fungi》(ⅣAB)真菌独立为界,其中的真菌门(Eumycota)分5亚门、18纲:接合菌亚门(Zygomycotina)、Zygomycetes、Trichomycetes、子囊菌亚门(Ascomycotina)、Hemiascomycetes、Plectomycetes、Pyrenomycetes、Loculomycetes、Laboulmycetes、Discomycetes;Ainsworth G. C. (1973)(英)《The Fungi》(ⅣAB)真菌独立为界,其中的真菌门(Eumycota)分5亚门、18纲:担子菌亚门(Basidiomycotina)、Teliomyceres、Hynenomycetes、Gasteromyceres、半知菌亚门(Deuteromycotina)、Blastomycetes、Hyphomycetes、Coelomycetes;Hawksworth D. L. et al.(1983)《Dictionary of the Fungi》(7thed.)将真菌界(Fungi)分为:2门18纲:Myxomycota、Acrosiomycetes、Protosteliomycetes、Ceratiomyxomycetes、Dictyosteliomycetes、Myxomycetes、Plasmodiophoromycetes、Labyrinthulomycetes、Eumycota;Hawksworth D. L. et al.(1983)《Dictionary of the Fungi》(7thed.)将真菌界(Fungi)分为:2门18纲:Eumycota、Mastigomycotina、Chytridiomycetes、Hyphochytridiomycetes、Oomycetes、Zygomycotina、Zygomycetes、Trichomycetes、Ascomycotina、Noclassesrecognized、Basidiomycotina、Hynenomycetes、Gasteromyceres、Urediniomycetes、Ustilaginomycetes、Deuteromycotina、Hyphomycetes、Coelomycetes。
第四阶段:分子系统学阶段(1990)Barr(1992)菌物(Fungi)涉及3界8门:PROTOZOA(Myxomycota、Plasmodiophoromycota)、CHROMIST(Heterokonta、Oomycetes、Hyphochytridiomycetes、Labyrinthulea)、EUMYCOTA(Chytridiomycota、Zygomycota 、Ascomycota、Basidiomycota);Hawksworth D. L. et al.(1995)《Dictionary of the Fungi》(8thed.)菌物(Fungi)涉及3界11门:原生动物界(Protozoa):Acrosiomycota、Dictyosteliomycota、Myxomycota、Plasmodiophoromycota;藻物界(Chromista):Oomycota、Hyphochytridiomycota、Labyrinthulomycota;真菌界(Fungi):Chytridiomycota、Zygomycota、Ascomycota、Basodiomycota;Alexopoulos C. J. et al.(1996)《Introductory Mycology》(4thed.)菌物(Fungi)涉及3界11门:原生动物界(Prototista):Acrosiomycota、Dictyosteliomycota、Myxomycota、Plasmodiophoromycota;异鞭毛生物界(Stramenoplia):Oomycota、Hyphochytridiomycota、Labyrinthulomycota;真菌界(Fungi):Chytridiomycota、Zygomycota、Ascomycota、Basodiomycota;Kirk et al.(2008)《Dictionary of the Fungi》(10thed.)界一:原生动物界(Protozoa):8门界二:藻物界(Chromista):3门界三:真菌界(Fungi):8门Ascomycota、Basidiomycota、Blastocladiomycota(芽枝霉菌门)、Chytridiomycota、Glomeromycota(球囊霉菌门)、Neocallimastigomucota、Zygomycota。