质粒DNA的碱裂解法提取与纯化

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质粒提取 纯化试剂

质粒提取 纯化试剂

质粒提取纯化试剂
质粒提取是一种从细菌中提取和纯化质粒(即小圆环状的DNA分子)的过程。

在质粒提取过程中,需要使用一系列纯化试剂来帮助分离和纯化质粒DNA。

以下是一些常用的质粒提取纯化试剂:
1. 碱裂解试剂:用于打断细菌细胞壁和细胞膜,释放内部DNA。

常见的碱裂解试剂包括盐酸(HCl)和EDTA(乙二胺四乙酸)。

2. 酚/氯仿:用于提取DNA和脂质等有机物质,并分离DNA 与其他细胞组分。

酚/氯仿会形成两相体系,DNA会在上层的水相中。

3. 氯化物:如氯化钠(NaCl)和氯化钙(CaCl2),用于增加DNA在水相中的溶解度,改善DNA的纯化。

4. 醇:如乙醇和异丙醇,用于沉淀DNA。

通过加入醇,DNA 会在醇和水的接触界面处形成团状物质,沉淀出来。

5. 洗涤缓冲液:用于洗涤DNA颗粒,去除杂质和剩余的试剂残留。

常见的洗涤缓冲液包括醇洗涤缓冲液(含乙醇)和盐洗涤缓冲液(含盐)。

6. Elution缓冲液:用于将DNA从固相材料(如硅胶柱、离心管滤膜等)上洗脱下来,使其溶解在溶液中。

常见的Elution 缓冲液包括纯水、低盐缓冲液、TE缓冲液等。

这些试剂在质粒提取纯化过程中起着重要的作用,帮助分离和纯化质粒DNA,并去除杂质和其他细胞组分。

不同的实验室和研究目的可能会选择不同的试剂和纯化方法。

质粒DNA的提取及检测实验报告

质粒DNA的提取及检测实验报告

题目:质粒DNA的提取及检测一.实验目的:1.学习碱裂解法提取质粒的原理和方法;2.学习DNA琼脂糖凝胶电泳的原理和方法。

二.实验原理1. 质粒 (Plasmid):一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。

主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中,常常编码一些对宿主有利的酶的基因,这些基因的表型包括抗生素抗性,产生抗生素、限制酶、修饰酶等。

2.载体(Vector):要把一个有用的外源基因通过基因工程手段,转化到细胞中去进行繁殖和表达,需要运载工具,携带外源基因进入受体细胞的这种工具就叫载体。

目前除了大肠杆菌中的质粒、λ噬菌体、M13噬菌体、噬菌粒外,还有酵母人工染色体载体以及动、植物病毒载体等。

3.分离质粒DNA:(1)培养细菌使质粒扩增;(2)收集和碱裂解细菌;(3)分离和纯化质粒DNA。

4.碱裂解法(1)溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖,10mmol/EDTA-Na,25mmol/LTris-HCl (pH8.0)作用:分散细胞,螯合金属离子使酶失活,防止DNA的降解(2)溶液Ⅱ:0.4mol/L NaOH,2% SDS,临用前1:1配制作用:细胞在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与染色体DNA发生变性(3)溶液Ⅲ:5mol/L 醋酸钾60ml,冰醋酸11.5ml,双蒸水28.5ml作用:酸性条件上质粒DNA复性,留在上清液。

大肠杆菌DNA和蛋白质-SDS复合物等发生沉淀。

5.电泳带电荷的物质,在电场中的趋向运动称为电泳。

DNA的琼脂糖凝胶电泳可以分离长度为200bp至近50kb的DNA分子。

DNA的迁移率(U)的对数与凝胶浓度(T)之间存在反平行线性关系。

因此,要有效地分离不同大小的DNA片段,选用适当的琼脂糖凝胶浓度是非常重要的。

6.提取质粒在质粒提取的过程中,由于操作原因,提取的质粒可能有三种:线性DNA、开环DNA 、闭环超螺旋DNA 。

碱裂解法提取质粒DNA的研究

碱裂解法提取质粒DNA的研究

碱裂解法提取质粒DNA的研究碱裂解法是一种常用的提取质粒DNA的方法。

该方法通过将大肠杆菌等细菌细胞进行碱性处理,使其细胞壁溶解,并释放出质粒DNA。

以下是对碱裂解法提取质粒DNA的研究进行详细介绍。

首先,进行实验前的准备工作。

实验材料包括大肠杆菌含质粒的培养液,碱性裂解液,中和液,以及一些常规实验室工具。

准备条件优化的培养基,如Luria-Bertani培养基,以获得高质量的质粒DNA。

将培养的大肠杆菌细胞进行离心,取得细菌细胞的沉淀,并将其重悬于适量的碱性裂解液中。

碱性裂解液的配制对提取质粒DNA的质量具有重要影响。

通常,碱性裂解液包括Tris-HCl缓冲液(pH 8.0-8.5)、EDTA (0.1M,pH 8.0)以及SDS(0.5%-1.0%)。

在碱性裂解液中,细胞壁受到破坏,并且其中的DNA被释放出来。

为了进一步提取质粒DNA,需要添加RNase A(最终浓度为20μg/mL)来降解细胞中的RNA。

此外,可以根据需要添加蛋白酶K(最终浓度为100μg/mL)来去除大部分的蛋白质。

接下来,使用酒精沉淀法来纯化质粒DNA。

首先,加入等体积的冰冷异丙醇,使DNA和异丙醇充分混合,然后进行离心。

在高速离心后,离心管底部会形成一个白色的DNA沉淀。

利用移液枪将上层液体倒掉,然后用70%的乙醇洗涤DNA沉淀,移液枪将乙醇沉淀洗涤掉。

最后,利用离心机将样品离心至全速,将乙醇溶液除去,并风干沉淀。

最后,使用合适的缓冲液溶解DNA,以达到所需的浓度。

为了确定提取的质粒DNA的纯度和浓度,可以使用紫外光谱仪来测定其260nm和280nm的吸光度比值。

这个比值可用于评估质粒DNA中的蛋白质污染情况。

如果蛋白质污染特别严重,可以使用氯仿、酒精沉淀等方法进行进一步清除。

此外,还可以使用琼脂糖凝胶电泳来检测提取的质粒DNA的大小和完整性。

通过比较不同样品的DNA迁移位置,可以快速确定质粒DNA的大小。

总结:碱裂解法是一种非常常用且简单的提取质粒DNA的方法。

碱裂解发制备质粒DNA原理

碱裂解发制备质粒DNA原理

碱裂解发制备质粒DNA原理碱裂解法是一种常用的制备质粒DNA的方法,其原理是通过使用碱性溶液将细菌细胞膜和核酸中的蛋白质进行裂解,从而分离出质粒DNA。

下面将详细介绍碱裂解法的原理和步骤。

碱裂解法的原理是利用强碱溶液(如NaOH或KOH)对细菌细胞进行裂解,同时可去除细胞膜及其上的蛋白质,使质粒DNA从细胞内部释放出来。

此外,碱性环境可以使DNA表现为单链结构,这使得DNA与其他形式的核酸(如RNA和DNA-蛋白复合物)有所区别,有助于后续的提取和纯化。

制备质粒DNA的碱裂解法的步骤如下:1.菌液培养:选取含有质粒的细菌菌株,在适宜的培养基中培养至合适的生长期。

2.收获细菌细胞:采用离心等方法将细菌细胞从菌液中收集。

通常使用蒸馏水进行细菌菌液的稀释,以确保细菌能够在蒸馏水中悬浮均匀。

3.清洗细菌细胞:使用理化方法(如洗涤剂、EDTA、乙醇等)将细菌细胞洗净。

这一步骤的目的是去除掉附着在细菌细胞表面的杂质,减少对后续步骤的影响。

4.裂解细菌细胞:将清洗后的细菌细胞悬浮在碱性溶液(如0.2MNaOH)中,使其完全裂解。

碱性溶液的作用是破坏菌细胞膜结构,去除蛋白质,并使DNA变为单链结构。

5. 中和反应:在细菌细胞裂解后,添加中和剂(如2 M Tris-HCl, pH 7.4),将溶液的pH值迅速调整到酸性,以中和碱性溶液中的氢氧根离子。

6.沉淀DNA:通过离心将细菌细胞碎片和其他残余物沉淀下来,将上清液(含有质粒DNA)收集。

7.聚集DNA:通过旋转浓缩、加入盐类或乙醇等方法,将质粒DNA聚集成颗粒状沉淀。

8. 洗涤和纯化:使用缓冲液(如低浓度Tris-HCl或盐溶液)洗涤和纯化质粒DNA,去除残余的盐和杂质。

9.确定DNA浓度和纯度:通过分光光度法或凝胶电泳等方法,测定质粒DNA的浓度和纯度,以确定提取的质粒DNA是否适合下游实验。

总之,碱裂解法通过利用强碱溶液裂解细菌细胞,去除蛋白质,使质粒DNA释放出来,并通过离心、沉淀、洗涤和纯化等步骤,得到高纯度的质粒DNA。

质粒dna的提取及电泳检测实验报告

质粒dna的提取及电泳检测实验报告

质粒dna的提取及电泳检测实验报告一、实验目的本实验的主要目的是学习质粒DNA的提取方法和电泳检测技术,并通过实验观察质粒DNA的提取情况和电泳检测结果。

二、实验原理质粒DNA的提取方法主要采用碱裂解法,通过将细胞裂解后,用酸性物质中和碱性物质,使DNA分离出来,最后用酒精沉淀纯化。

电泳检测是通过将DNA 样品置于琼脂糖凝胶上,加上电场后,DNA在凝胶中移动,通过电泳带电的原理,将DNA分离出来,从而观察DNA的大小和形状。

三、实验步骤1.准备样品:将含有目标DNA的菌落挑出放入EP管中,加入100μl TE缓冲液(10mmol/L Tris-HCl,1.0mmol/L EDTA,pH8.0),用微量移液器均匀混合。

2.制备裂解液:取10μl 0.25mol/L NaOH加入菌液中,轻轻摇匀,并立即加入200μl 1%SDS(十二烷基硫酸钠)液,翻转混匀。

3.裂解DNA:加入150μl NaOH-SDS溶液,翻转10次,置于80℃水浴中裂解细胞壁和细胞膜,20min后取出,加入150μl冷KAc/EDTA溶液(3mol/L KAc,pH5.2,0.5mol/L EDTA),翻转混匀,冰上静置5min。

4.离心沉淀:10000r/min离心10min,将上清液移至新的96孔板中,加入0.6倍体积的冰凉乙醇,反复翻转,置于-20℃上进行冷却,离心12000r/min 10min,去掉上清液,用95%乙醇洗涤沉淀物,最后用300μl TE缓冲液溶解沉淀DNA。

5.电泳检测:取相同浓度的DNA样品,加入琼脂糖,混合后加入电泳槽中,通电检测10min。

四、实验结果经过实验操作后,取出DNA样品,通过电泳检测,观察到有一条长度合适的条带,证明质粒DNA已经成功提取,并且检测结果与对照组差异不大,说明实验操作规范,结果可信。

五、实验结论本次实验通过碱裂解法成功提取了质粒DNA,并通过电泳检测技术检测到了DNA条带,证明提取质粒DNA的方法可行,同时也说明电泳检测是一种可靠的分子生物学技术,对于DNA分离和检测有着重要的应用价值。

碱裂解法提取质粒DNA和质粒DNA的纯化

碱裂解法提取质粒DNA和质粒DNA的纯化

实验一、碱裂解法提取质粒DNA和质粒DNA的纯化一、实验目的学习并掌握基因工程操作技术中最常用的载体质粒DNA的提取方法和进一步的纯化技术。

二、实验原理在碱性溶液中,双链DNA氢键断裂,DNA双螺旋结构遭破坏而发生变性,但由于质粒DNA分子量相对较小,且呈环状超螺旋结构,即使在高碱性pH条件下,两条互补链也不会充分分离,当加入中和缓冲液时,变性质粒DNA又恢复到原来的够型;而线性的大分子量细菌染色体DNA则不能复性,与细胞碎片、蛋白质、SDS等形成不溶物,通过离心沉淀可被除去,而质粒DNA及小分子量的RNA则留在上清液中。

混杂的RNA可用RNaseA酶消除,再用酚/氯仿处理,可除去残留的蛋白质,达到纯化质粒DNA的目的。

三、实验材料大肠杆菌DH5α(含重组了约800bp DNA片断的pMD18-T质粒,Amp抗性)四、实验仪器、用具高压灭菌锅、超净工作台、恒温摇床、台式离心机、涡旋振动器、培养管、移液器、离心管、吸管头、量筒、紫外观测仪五、实验试剂LB培养基、3mol/L醋酸钠(pH5.2)、TE缓冲液(pH8.0)、无水乙醇、75%乙醇、RNaseA(10mg/ml)、goldview DNA染色剂、氯仿、琼脂糖抽提质粒DNA所需的溶液:溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖,25 mmol/L Tris-Cl(pH8.0),10 mmol/L EDTA (pH8.0);溶液Ⅱ:0.2 mol/L NaOH,1%SDS(w/v),现配现用;溶液Ⅲ:3 mol/L KAc,用冰醋酸调pH值至5.2;电泳缓冲液(0.5×TBE):45 mmol/L Tris-硼酸,1 mmol/L EDTA,pH8.0;六、实验步骤:1、质粒DNA的提取(1)在LB固体平板上挑单菌落接入2ml 含Amp的LB液体培养基中(已灭菌),37℃振摇培养过夜;(已经完成)(2)取1mL菌液放入Ep管中,12000 r/min(简写rpm)离心1min;弃尽上清;(3)加入200μL预冷的含RNaseA的溶液I,旋涡混匀;(4)加入200μL的溶液Ⅱ,温和混匀,室温静置5min以充分裂解细菌;(5)加入200μL的溶液Ⅲ,温和混匀,-20℃放置8min;(6)12000rpm离心5min;(7)吸上清至另一新的1.5mL EP管,加500μL氯仿/异戊醇(V:V=24:1)充分混匀,12000rpm离心5min;(8)小心移取上清液500μL至另一新的1.5mL EP管,加入2倍体积无水乙醇,充分混匀,-20℃静置10min,12000 rpm离心10min,弃上清;(静置期间安排制琼脂糖凝胶,每组制胶一块,具体见附件)(9)加入200μL70%乙醇洗DNA沉淀,12000rpm离心5min,倒掉乙醇,再12000rpm离心几秒钟,用移液器尽可能除去乙醇,烘箱适度风干;(10)加入20μL RTE (含10μg/mL RNaseA 的TE,pH8.0)溶解质粒DNA,37℃放置10min。

碱裂解法提取质粒DNA的实验原理和操作步骤

碱裂解法提取质粒DNA的实验原理和操作步骤

碱裂解法提取质粒DNA的实验原理和操作步骤碱裂解法是一种常用的方法,用于提取质粒DNA(plasmid DNA)纯化。

以下是具体的实验原理和操作步骤。

实验原理:碱裂解法利用碱性溶液将细菌细胞的细胞壁和细胞膜溶解,使细菌细胞内的质粒DNA被释放出来。

接着,使用中性化剂中和碱性溶液,使DNA带正电荷,而细胞中的蛋白质则带负电荷,从而能够通过离心将DNA与蛋白质分离。

最后,通过浓缩、洗涤和纯化,得到高质量的质粒DNA。

操作步骤:1.培养细菌:选取含有质粒DNA的细菌菌株,如大肠杆菌。

在含有适当抗生素的培养基中培养细菌菌株。

2.收获细菌:当菌液呈现较稠的浑浊状态时,收取细菌培养物。

使用离心机将菌液离心,分离菌体沉淀和上清液。

将上清液倒掉,保留菌体沉淀。

3.碱裂解:将菌体沉淀溶解于碱性溶液中,如盐酸和十二烷基硫酸钠(SDS)溶液。

轻轻混合并将溶液放入水浴中加热,使细菌细胞壁和细胞膜被溶解。

4.中和:使用中性化剂,如醋酸,使溶液中的酸性物质中和。

这样可以确保DNA带正电荷,而蛋白质和其他污染物则带负电荷。

5.离心:将溶液离心,在离心过程中,DNA会与细胞内其他分子分离,形成一个DNA沉淀。

上清液中含有蛋白质和其他污染物。

6.洗涤:使用洗涤缓冲液,如乙酸盐缓冲液,洗涤DNA沉淀,去除残留的污染物。

7.纯化:用去离子水溶解DNA沉淀,使其溶解在水中。

将溶解的DNA沉淀通过滤纸等过滤装置过滤掉残余杂质。

8.浓缩:通过酒精沉淀法或其他方法,将DNA溶液浓缩到所需的浓度。

9.检测:使用紫外分光光度计等方法,测定提取的质粒DNA的纯度和浓度。

注意事项:1.在实验过程中保持操作环境和仪器无菌。

2.碱裂解法中使用的溶液需准备新鲜,并避免受到污染。

3.操作过程中需要低温处理和离心操作,以保护DNA的完整性。

4.质粒DNA的提取可以根据实验目的进行进一步的扩增、测序或转染等应用。

总结:通过碱裂解法,可以从细菌中提取纯化的质粒DNA。

质粒DNA的碱裂解法提取与纯化

质粒DNA的碱裂解法提取与纯化

质粒DNA的碱裂解法提取与纯化一、试剂准备1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。

1M Tris-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。

在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。

2. 溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS。

2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。

使用前临时配置。

3. 溶液Ⅲ:醋酸钾(KAc)缓冲液,pH4.8。

5M KAc 300ml,冰醋酸57.5ml,加ddH2O 至500ml。

4℃保存备用。

4. TE:10mM Tris-HCl(pH 8.0),1mM EDTA(pH 8.0)。

1M Tris-HCl(pH 8.0)1ml,0.5M EDTA (pH 8.0)0.2ml,加ddH2O至100ml。

15 lbf/in2高压湿热灭菌20min,4℃保存备用。

5.苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)6.乙醇(无水乙醇、70%乙醇)7. 5×TBE:Tris 碱54g,硼酸27.5g,EDTA-Na2·2H2O 4.65g,加ddH2O 至1000ml。

15 lbf/in2高压湿热灭菌20min,4℃保存备用。

8.溴化乙锭(EB):10mg/ml9.RNase A(RNA酶A):不含DNA酶(DNase-free) RNase A的10mg/ml,TE配制,沸水加热15min,分装后贮存于-20℃。

10. 6×loading buffer(上样缓冲液):0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青FF,40%(W/V)蔗糖水溶液。

11. 1% 琼脂糖凝胶:称取1g琼脂糖于三角烧瓶中,加100ml 0.5×TBE,微波炉加热至完全溶化,冷却至60℃左右,加EB母液(10mg/ml)至终浓度0.5μg/ml(注意:EB为强诱变剂,操作时带手套),轻轻摇匀。

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质粒DNA的碱裂解法提取与纯化概述
细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。

各种
质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份,通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态,但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。

(Q往圣科技3452125268提供免费基因慢病毒包装)质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子,重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。

目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取,本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。

(Q往圣科技3452125268提供Science的CRISPR/cas9免费质粒加慢病毒包装)碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA 不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。

(Q往圣科技3452125268提供12万种Science的CRISPR/cas9免费质粒加慢病毒包装)纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。

例如,氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法,但这些方法相对昂贵或费时。

对于小量制备的质粒DNA,经过苯酚、氯仿抽提,RNA 酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA,所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求,故在分子生物学实验室中常用。

一、试剂准备(Q往圣科技3452125268提供Science的CRISPR/cas9免费质粒加慢病毒包装)
1.溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。

1M Tris-HCl(pH 8.0)1
2.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH
2
O至500ml。

在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。

2.溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS。

2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH
2
O至10ml。

使用前临时配置。

Q往圣科技3452125268提供12万种Science的CRISPR/cas9免费质粒加慢病毒包装
3.溶液Ⅲ:醋酸钾(KAc)缓冲液,pH
4.8。

5M KAc 300ml,冰醋酸 57.5ml,
加ddH
2
O至500ml。

4℃保存备用。

(Q往圣科技3452125268提供Science的CRISPR/cas9免费基因慢病毒包装)4.TE:10mM Tris-HCl(pH 8.0),1mM EDTA(pH
8.0)。

1M Tris-HCl(pH 8.0)1ml,0.5M EDTA(pH 8.0)0.2ml,加ddH
2
O至100ml。

15 lbf/in2高压湿热灭菌20min,4℃保存备用。

5.苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)
6.乙醇(无水乙醇、70%乙醇)
7. 5×TBE:Tris 碱54g,硼酸27.5g,EDTA-Na
2·2H
2
O 4.65g,加ddH
2
O 至
1000ml。

15 lbf/in2高压湿热灭菌20min,4℃保存备用。

8.溴化乙锭(EB):10mg/ml
9.RNase A(RNA酶A):不含DNA酶(DNase-free) RNase A的10mg/ml,TE
配制,沸水加热15min,分装后贮存于-20℃。

10. 6×loading buffer(上样缓冲液):0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青FF,40%(W/V)蔗糖水溶液。

11. 1% 琼脂糖凝胶:称取1g琼脂糖于三角烧瓶中,加100ml 0.5×TBE,微波炉加热至完全溶化,冷却至60℃左右,加EB母液(10mg/ml)至终浓度0.5μg/ml(注意:EB为强诱变剂,操作时带手套),轻轻摇匀。

缓缓倒入架有梳子的电泳胶板中,勿使有气泡,静置冷却30min以上,轻轻拔出梳子,放入电泳槽中(电泳缓冲液0.5×TBE),即可上样。

二、操作步骤
1.挑取LB固体培养基上生长的单菌落,接种于
2.0ml LB(含相应抗生素)液体培养基中,37℃、250g振荡培养过夜(约12-14hr)。

2.取1.5ml培养物入微量离心管中,室温离心8000g×1min,弃上清,将离心管倒置,使液体尽可能流尽。

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3.将细菌沉淀重悬于100μl预冷的溶液Ⅰ中,剧烈振荡,使菌体分散混匀。

4.加200μl新鲜配制的溶液Ⅱ,颠倒数次混匀(不要剧烈振荡),并将离心管放置于冰上2-3min,使细胞膜裂解(溶液Ⅱ为裂解液,故离心管中菌液逐渐变清)。

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5.加入150μl预冷的溶液Ⅲ,将管温和颠倒数次混匀,见白色絮状沉淀,可在冰上放置3-5min。

溶液Ⅲ为中和溶液,此时质粒DNA复性,染色体和蛋白质不可逆变性,形成不可溶复合物,同时K+使SDS-蛋白复合物沉淀。

6.加入450μl的苯酚/氯仿/异戊醇,振荡混匀,4℃离心12000g × 10min。

7.小心移出上清于一新微量离心管中,加入2.5倍体积预冷的无水乙醇,混匀,室温放置2-5min,4℃离心12000g×15min。

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8.1ml预冷的70%乙醇洗涤沉淀1-2次,4℃离心8000g×7min,弃上清,将沉淀在室温下晾干。

9.沉淀溶于20μl TE(含RNase A 20μg/ml),37℃水浴30min以降解RNA 分子,-20℃保存备用。

三、质粒DNA的电泳检测
观察琼脂凝胶中DNA的最简单方法是利用荧光染料溴化乙锭进行染色。

该物质含有一个可以嵌入DNA的堆积碱基之间的一个平面基团,这个基团的固定位置及其与碱基的密切接近,导致染料与DNA结合并呈现荧光,其荧光产率比游离染料溶液有所增加。

DNA吸收254nm处的紫外辐射并传递给染料,而被结合的染料本身则在302nm和366nm有光吸收。

这两种情况下,被吸收的能量可在可见光谱红橙区的590nm处重新发射出来。

因此,当凝胶中含有游离溴化乙锭时即可以检测到少量的DNA。

取制备的质粒DNA 1-2μl,加适当loading buffer混匀上样,采用 1-5V/cm 的电压,使DNA分子从负极向正极移动至合适位置,取出凝胶置紫外灯下检测,摄片。

四、注意事项
本裂解法小量制备质粒 DNA重复性好,一般无麻烦。

若所提取质粒 DNA不能被限制性内切酶切割,可通过酚/氯仿再次抽提,以清除杂质来解决问题。

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