动物遗传学-第九章 数量遗传学基础

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第9章遗传学数量性状遗传分析

第9章遗传学数量性状遗传分析

系谱和概率分析
数量性状 数量上的变化 (如高度) 连续 微效多基因 敏感 统计分析
当前3页,共45页,星期日。
数量性状包括两大类:
一 是表型为严格的连续变异的性状,如牛的泌乳量, 羊毛的长度等等;
二 是表型呈非连续变异,而遗传物质的数量呈潜在 的连续变异的性状,即只有超越某一遗传阈值时才出现的性
状,如抗病、死亡率以及单胎动物的产仔数等性状,称为阈性 状(threshold character或threshold trait)。
2)数量性状呈连续性的变异;
3)数量性状的表现容易受到环境的影响;
4)控制数量性状的遗传基础是多基因系统
数量性状的遗传在本质上与孟德尔式的遗传完全一样, 只是需要用多基因理论来解释。
当前6页,共45页,星期日。
二 数量性状遗传的多基因假说
1909年,瑞典遗传学家Nilsson-Ehle对小麦和燕麦中籽粒 颜色的遗传进行了研究,发现在若干个红粒与白粒的杂交组合 中有如下A、B、C 3种情况:
数量性状:性状之间呈连续变异状态,界限不清楚,用数 字描述的性状。如人的身高、体重,作物的产量,棉花的 纤维长度等
当前2页,共45页,星期日。
质量性状和数量性状的区别
质量性状
①.变异类型
种类上的变化 (如红、白花)
②.表现型分布
不连续
③.基因数目
一个或少数几个
④.对环境的敏感性 不敏感
⑤.研究方法
401 12.888 2.252 5.075
当前30页,共45页,星期日。
现以表5-1中玉米穗长试验的结果为例,计算各个 世代的表现型方差分量:
VP1=0.665 VP2=3.560
VF2=5.075 Ve=2.178

数量遗传学基础

数量遗传学基础

群体越小,遗传漂变的作用越大。
第二节 数量性状的遗传基础 性状的分类
质量性状 (Qualitative traits or characters)
遗传上受一对或少数几对基因控制,性状变 异不连续,表型不易受环境因素影响的性状,如: 毛色、角的有无等。
数量性状 (Quantitative traits)
配子相(Gametic phase)或连锁相(Linkage phase)
两个基因座A和B,每个基因座两个等位基因, 分别为A1、A2和B1、B2:可形成4种配子: A1B1、A1B2、A2B1、A2B2 相引相(Coupling phase): A1B1/ A2B2 相斥相(Repulsion phase):A1B2/ A2B1
质量性状、数量性状与阈性状的比较
质 量 性 状 数 量 性 状 阈 性 状
性状主要 品种特征、 类 型 外貌特征 遗传基础 单个或少数 主基因 变异表现 间断型 方 式 考察方式 描述 环境影响 不敏感
突变 (mutation): 如突变基因具有选择优势, 则 其 基 因 频 率 提 高 ; 如 是 中 性 突 变 (Neutral mutation),则其频率大小取决于遗传漂变。
迁移 (Migration): 通过不同频率的群体间 基因流动引起基因频率变化。可以是单向的, 也可以是双向的。
交配体制 (Mating system): 例如,近交提 高纯合基因型频率;杂交提高杂合基因型频率; 随交则对大的遗传平衡群体的遗传结构无影响。
遗传上受许多微效基因控制,性状变异连, 表型易受环境因素影响的性状,如:生长速度、 产肉量、产奶量等。
The generalized growth curve of young animals

数量遗传学

数量遗传学

质量性状:指由一对或对基因控制,在个体间能够明显区分,呈不连续性变异的性状。

数量性状:由微效多基因控制,在群体中不能明显区分,呈连续性变异的性状。

门阈性状:由微效多基因控制的,在群体中呈不连续分布的性状,一般能够明显地区分其表现形式。

数量遗传学:指用数理统计方法和数学分析方法研究数量性状遗传和变异规律的科学。

选择:在人类和自然干预下,某一群体的基因在世代传递的过程中,某种基因型个体的比例所发生的变化现象,称作选择。

适应度:比较群体中各种基因型(以个体平均留种子女数为标准)生存适应力的相对指标。

适应度就是特定基因型的留种率和群体最佳基因型留种率之比值。

选择系数:1减去适应度就是该基因型的选择系数。

留种率+淘汰率=1遗传漂变:如果群体规模较小,下一代的实际基因频率都可能由于抽样误差而偏离理论上应有的频率。

始祖效应:当来自大群体的一个小样本在特定环境中成为一个新的封闭群体,其基因库仅包括亲本群体中遗传变异的一小部分,并在新环境中承受新进化压力的作用,因而最终可能与亲本群分体。

这种过程在体现的般规律,称为始祖效应。

瓶颈效应:当大群体经历一个规模缩小阶段之后,以及在漂变中改变了基因库(通常是变异性减少)又重新扩大时,基因频率发生的变化。

同型交配:如果把同型交配严格地定义为同基因型交配,那么近交和同质选配都只有部分的同型交配,只有极端的近交方式——自交才是完全同型交配。

群体遗传学:专门研究群体的遗传结构及其变化规律的遗传学分支学科。

群体:是指一个种、一个变种、一个品种或一个其它类群所有成员的总和。

孟德尔群体:在个体间有相系交配的可能性,并随着世代进行基因交流的有性繁殖群体。

基因库:以各种基因型携带着各种基因的许多个体所组成的群体。

亚群:由于各种原因的交配限制,可能导致基因频率分布不均匀的现象,形成若干遗传特性有一定差异的群落通常称为亚群。

随机资本:在一个有性系列的生物群体中,任何一个雌性式雄性的个体与其任何一个相反性别的个体交配的机率是相同的。

《数量遗传学基础》课件

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03
人类健康与疾病研 究
利用数量遗传学方法研究人类复 杂疾病的发生机制,为疾病预防 和治疗提供新的思路和方法。
THANKS
感谢观看
3
疾病抵抗力增强
通过研究动物的疾病抗性基因,提高动物的疾病 抵抗力,降低养殖成本和动物疾病发生率。
人类遗传学研究
疾病预测与预防
利用数量遗传学方法,研究人类遗传性疾病的发病风险相关基因 ,为疾病的预测和预防提供科学依据。
个体差异研究
通过研究人类的数量性状基因,了解个体差异的遗传基础,为个性 化医疗和健康管理提供支持。
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• 数量遗传学概述 • 数量遗传学的基本概念 • 数量性状的遗传模型 • 数量遗传学的研究方法 • 数量遗传学的应用 • 展望与未来发展
01
数量遗传学概述
定义与特点
定义
数量遗传学是研究生物群体中数量性状遗传规律的科学。
特点
数量性状是受多基因控制的,其遗传变异规律比质量性状复 杂。
04
数量遗传学的研究方法
统计分析方法
统计分析方法
QTL分析
关联分析
元分析
这是数量遗传学中最为常见和 基础的研究方法。通过统计分 析,可以对遗传数据进行分析 和解释,探究遗传变异的来源 、分布和作用机制。
数量性状位点(QTL)分析是 利用统计学方法定位控制数量 性状的基因位点,分析基因位 点对表型变异的贡献。
表型组学研究
结合新一代测序技术和成像技术,对动植物表型组进行深入研究, 以揭示表型变异与遗传变异之间的关系。
未来发展方向与挑战
01
跨物种比较研究
比较不同物种间的遗传差异,以 揭示物种进化的机制和规律,为 生物多样性保护提供科学依据。

数量遗传学知识点总结

数量遗传学知识点总结

第一章绪论一、基本概念遗传学:生物学中研究遗传和变异,即研究亲子间异同的分支学科。

数量遗传学:采用生物统计学和数学分析方法研究数量性状遗传规律的遗传学分支学科。

二、数量遗传学的研究对象数量遗传学的研究对象是数量性状的遗传变异。

1. 性状的分类性状:生物体的形态、结构和生理生化特征与特性的统称。

如毛色、角型、产奶量、日增重等。

根据性状的表型变异、遗传机制和受环境影响的程度可将性状分为数量性状、质量性状和阈性状3 类。

数量性状:遗传上受许多微效基因控制,性状变异连续,表型易受环境因素影响的性状,如生长速度、产肉量、产奶量等。

质量性状:遗传上受一对或少数几对基因控制,性状变异不连续,表型不易受环境因素影响的性状,如毛色、角的有无、血型、某些遗传疾病等。

阈性状:遗传上受许多微效基因控制,性状变异不连续,表型易受或不易受环境因素影响的性状。

有或无性状:也称为二分类性状 ( Binary traits)。

如抗病与不抗病、生存与死亡等。

分类性状:如产羔数、产仔数、乳头数、肉质评分等。

数量性状的特点:必须进行度量,要用数值表示,而不是简单地用文字区分;要用生物统计的方法进行分析和归纳;要以群体为研究对象;组成群体某一性状的表型值呈正态分布。

3. 决定数量性状的基因不一定都是为数众多的微效基因。

有许多数量性状受主基因(major gene)或大效基因(genes with large effect)控制。

果蝇的巨型突变体基因( gt);小鼠的突变型侏儒基因( dwarf, df);鸡的矮脚基因( dw);美利奴绵羊中的Booroola 基因( FecB);牛的双肌( double muscling)基因( MSTN);猪的氟烷敏感基因( RYR1)三、数量遗传学的研究内容数量性状的数学模型和遗传参数估计;选择的理论和方法;交配系统的遗传效应分析;育种规划理论。

四、数量遗传学与其他学科间的关系理论基础奠定:孟德尔遗传学+数学+生物统计学理论体系完善:与群体遗传学关系最为密切;学科应用:与育种学最为密切,是育种学的理论基础和方法论;学科发展:与分子生物学、生物进化学、系统科学和计算机科学密切结合,并产生了新的遗传学分支学科,如分子数量遗传学等。

第九章 数量遗传学基础.

第九章 数量遗传学基础.

第九章数量遗传学基础概述一、质量性状和数量性状的遗传动物的遗传性状,按其表现特征和遗传机制的差异,可分为三大类:一类叫质量性状(Qualitative trait ), 一类叫数量性状(Quantitative trait ), 再一类叫门阈性状(Threshold trait)。

动物的经济性状(Economic trait)大多是数量性状。

因此,研究数量性状的遗传方式及其机制,对于指导动物的育种实践,提高动物生产水平具有重要意义。

质量性状:是指那些在类型间有明显界限,变异呈不连续的性状。

例如,牛的无角与有角,鸡的芦花毛色与非芦花毛色,等等。

这些性状由一对或少数几对基因控制,它不易受环境条件的影响,相对性状间大多有显隐性的区别,它的遗传表现完全服从于三大遗传定律。

数量性状:是指那些在类型间没有明显界限,具有连续性变异的性状,如产奶量、产卵量、产毛量、日增重、饲料利用率等。

门阈性状:是指由微效多基因控制的,呈现不连续变异的性状。

这类性状具有潜在的连续分布遗传基础,但其表型特征却能够明显的区分,例如,产子数,成活或死亡,精子形态正常或畸形,这类性状的基因效应是累积的,只有达到阈值水平才能表现出来。

二、数量性状的一般特征数量性状表现特点表明,数量性状受环境因素影响大,因此其表型变异是连续的,一般呈现正态分布(Normal distribution),很难分划成少数几个界限明显的类型。

例如,乳牛的产奶量性状,在群体中往往从3000kg至7000kg范围内,各种产量的个体都有。

由于数量性状具有这样的特点,所以对其遗传变异的研究,首要的任务是对性状的变异进行剖分,估计出数量性状变异的遗传作用和环境的影响程度。

具体地说,对数量性状遗传的研究必须做到以下几点:第一,要以群体为研究对象;第二,数量性状是可以度量的,研究过程要对数量性状进行准确的度量;第三,必须应用生物统计方法进行分析;第四,在统计分析基础上,弄清性状的遗传力以及性状间的相互关系。

动物育种学-第-数量遗传学基础-PPT精选

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亲缘系数(rA)为:
rACVG o GX (V X vG ,Y Y)CVA o AX (V X vA ,Y Y)A 2A 2 (2.12)
以同胞关系为例说明这一方法的应用。图 2.3是全同胞关系示意图,其中S和D分别为父 亲和母亲,括号中前面的小写字母表示父系 基因,后面的表示母系基因。由于是非近交 群体,所以,P (ef)P (gh)0 因此 :
P=G+E=A+D+I+E=A+R (2.6)
假设Cov(A,R)=0 或 rAR=0
基因效应和育种值
考察一个具有等位基因A1和A2的基因座,假 设纯合子A1A1的基因型值为+a,A2A2的基因型值 为-a,杂合子A1A2的基因型值为d,它取决于基 因的显性程度大小,无显性时d=0,完全显性时
d=+a或-a,不完全显性时介于这两者之间,超显
1 2
0
14A2 116A2A
1 4
0 81A2 614A2A
1 8
1 16
1 4A 2 1 16 D 2 1 16 A 2 A2 15D 26 D 6 14 A 2 D
1 4
0
12A2 14A2A
1 2
0
14A2 116A2A
同源一致性(identity by descent,IBD)
(Malé cot,1948):指亲属个体带有的基因是由某一 共同祖先同一基因复制而来的 。
遗传协方差的实际构成比较复杂,在忽略上位效 应和基因连锁时,它由一系列加性效应和显性效应以 及各种互作效应构成,即:
C G ( X o Y ) v ,A 2 D 2 2A 2 A 2D 2 D A 2 D (2.10)

第九章--数量遗传学基础PPT优秀课件

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第八章 群体的遗传平衡
1. 几个基本概念回顾 2. 哈代-温伯格定律的要点 3. 群体遗传分析
2021/5/25
1
几个基本概念
• 孟德尔群体
– 一群能相互交配和繁殖的个体组成的集群
• 基因型频率
–特定基因型占群体内全部基因型的比率
–特定基因型在群体内出现的概率
–同一基因座位上所有基因型频率之和等于1
2021/5/25
16
杂种优势
• 两个遗传组成不同的品种(或品系)杂交, F1代在生活力、繁殖力、抗病力等方面都 超过双亲的平均值,甚至比两个亲本各自 的水平都高的现象。
2021/5/25
17
四、数量性状的遗传基础
• 微效多基因假说
– 数量性状是由大量的、效应微小而类似的且可 加的基因控制;
– 这些基因在世代相传中服从遗传学三大基本规 律,这些基因间一般没有显隐性区别;


Xn2 …
X 1k X 2k

X n数 X..
2021/5/25
26
三、重复率的估计
重复率就是以个体分组,以个体度量 值为组内成员,计算得到的组内相关系 数。这时组间方差就是个体间方差,组 内方差就是个体内度量间方差。
re
个体间方差
b2
个体间方差 个体内度量间方差b2 w2
GADI
PADIE
2021/5/25
22
R
生物群体的数学特征
二、基因均效(average gene effect)
某个基因的平均效应,即子代从一个亲本获得了某 个基因的个体的基因型均值距离原来群体均值的 平均离差。
三、群体方差
表型方差: Vp=VG+VE, VG=VA+VD+VI 加性方差:VA
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遗传力的真值难于真正得到,一般我们查阅的遗传力都有一 定的范围。
根据特定资料估计的遗传力,只能作为一个估计值看待。
n
P
P1 P2 Pn
Pii 1nn Nhomakorabea同理可得:
n
Gi
G i
,
n
n
Ei
E i n
若E与G之间相互独立,在一个随机交配的大群体中
n
Ei 0 P G
i
群体均值能否代表群体基因型均值取决于群体大小,群 体越大,代表性愈强。
一、遗传力(heritability):
(一)概念: 亲代传递其遗传特性的能力。 或指性状的遗传方差在总方差(表型方差)中 所占的比率。
二、简单性状和复杂性状
简单(遗传)性状 (simply-inherited trait) 受很少数基因的控制,而且几乎不受环境变化的影响。
如孟德尔豌豆试验中所列举的性状都是简单(遗传)性 状。
复杂性状 (complex trait) 受多个基因的作用,而且易受遗传或非遗传因素的影
响。多在医学上使用。如糖尿病。
(二)对遗传力的理解注意事项:
遗传力是描述性状的一个特征量,遗传力大说 明受到遗传的影响大,遗传力低则环境的作用大。 性状遗传力的高低并不表示性状的好坏与畜群 的好坏。
0<h2 <1
(三)若干性状的遗传力
性状 初生重 断奶重 成年体重 椎骨数 乳头数 背膘厚 眼肌面积
表1 表猪1 一猪一些些性性状状的遗遗传传力 力
第九章 数量遗传学基础
一、质量性状和数量性状
质量性状(qualitative trait) —遗传基础是单个或少数几个基因的作用,它的 表型变异是间断的。如牛的无角与有角,兔的白 化与有色。
数量性状(quantitative trait) —可以计数或度量的性状。它的遗传基础是多基 因(polygene),表型变异是连续的。如牛的产 奶量,猪的日增重。
遗传力
性状
0.15
怀胎率
0.10~0.20
泌乳力
0.50
窝产仔数
0.70
孕期长短
0.20
系水力
0.12~0.74
肌肉 pH
0.40~0.60
肉的松软度
遗传力 0.05 0.06
0.10~0.15 0.45
0.01~0.43 0.04~0.41
0.58
(四)估计性状的遗传力方法
—遗传力是育种值对表型值的回归系数。
三、阈性状和分类性状
阈性状 (threshold trait) 遗传基础是多基因,表型变异是间断的。它也可由几个阈值把性
状划分成几个等级,如羊的一胎产羔数,可以分成0,1,2和2以上4 个等级。最极端的是一个阈值的性状,称为“全或无”性状,如存活 与死亡,发病与不发病等。
分类性状 (categorical trait) 可归为质量性状。例如根据人类的ABO血型系统,可以把所有人
➢ 母体效应不存在
— 遗传力计算示例
☺ 下表是5头公牛的女儿产奶量的资料,请根据该记录 资料计算产奶量的遗传力 。
表 5头公牛女儿的第一胎产奶量记录
单位 t
公牛
A
B
C
D
E
1
4.3
4.4
6.5
5.1
5.5
2
5.8
4.2
5.6
5.0
6.0
3
5.3
6.0
5.2
5.7
4.9
4
4.5
5.5
5.3
6.1
5.0
4个数量性状的频率分布,平均数用箭头标明, 每一柱型图基于的观察数在括号中给出。
二、微效基因作用特点
数目众多,效应微小的且易受环境影响的基因。 缺乏显性 效应可以累加 效应微小
三、数量性状的表型值
设:P——个体表型值,G——基因型效应值, E——环境效应值,则:P=G+E。
以群体为研究单位时,某一性状的表型值应以群体均值 来表示,即:
群的每个个体分为A型、B型、O型和AB型。由单基因决定的孟德尔遗 传的性状,显性与隐性也可看成是分类性状。
一、数量性状(quantitative character)
表现连续变异的,呈正态分布的,由微效多基因控 制的性状称为数量性状。 数量性状的特点: ❖变异的连续性 ❖对环境的敏感性 ❖分布的正态性 ❖多基因作用的微效性
h2
2 A
2 P
COV (A, A VP
R)
bAP
— 遗传力是育种值与表型值的相关系数的平方。
rA2P
[COV ( A, A R)]2 VPVA
(VA )2 VAVP
h2
估计方法
— 亲子回归估计方法
子女对中亲值的回归
h2 bOP
子女对一个亲本的回归
h2 2bOP
公畜内女母回归
h2 2bDM ( S )
1.01
2 W
0.59
2 W
0.59
2 S
(1.01 0.59) /10
0.042
h2
4rHS

2 s
ˆ
2 T
4 0.042 0.632
0.267
注意事项
从理论上讲,一个性状来至同一群体的资料,遗传力应该是 一个特定的数值;但是不同的估计方法,计算的遗传力之间 存在差异,有时这种差异还比较大。
方差组分估计:
ˆ
2 w
MS w
ˆ
2 D
MS D
k
MSW
ˆ
2 S
MS S
MSD dk
2 T
2 S
2 D
2 W
遗传力估计:h2
4rHS

2 s
ˆT2
h2
4rHS

2 D
ˆ
2 T
父系半同胞 母系半同胞
— 全同胞相关
hˆ2 2rFS
rFS
ˆ
2 S
ˆ
2 D
ˆT2
假设:
➢ 公畜间、母畜间、公畜和母畜间无亲缘关系
估计方法
— 同胞相关分析
变异来源 自由 平方 度和
公畜间
S-1
SSS
母畜间(公畜
内)s = 公畜数
s(d-1) SSD
后代d间= 每头公畜与Sd配(母k畜-1数)SSW k = 每头母畜产的仔畜数
均 方
MSS
MSD
期望方差
2 W
k
2 D
dk
2 S
2 W
k
2 D
2 W
MSW
二、估计方法
— 半同胞相关
VP=VG+VE VP=VA+VD+VI+VE
➢广义遗传力(heritability in the broad sense,用 H2 表示):
H 2 VG 100 % VP
➢狭义遗传力(heritability in the narrow sense,用 h2 表示):
h2 VA 100 % VP
5
5.0
4.3
5.8
5.0
5.5
6
4.5
4.5
5.1
6.1
6.7
7
5.1
4.2
4.2
5.1
2.7
8
6.1
3.7
4.7
5.6
3.8
9
5.5
3.9
6.2
4.7
5.2
10
5.7
5.6
5.6
5.5
5.6
— 遗传力计算示例
变异来源
公畜间 公畜内
自由 度
4
45
平方 和
4.04
26.60
均 期望方差

2 W
k
2 s
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