聚丙烯酰胺凝胶电泳

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聚丙烯酰胺凝胶电泳简称PAGE

聚丙烯酰胺凝胶电泳简称PAGE

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凝胶浓度的选择与被分离物质分子量密切相关
二、电泳的原理
1. 聚丙烯酰胺凝胶电泳( native-PAGE)

生物大分子在聚丙烯酰胺凝胶中泳动时,有电荷效应与分 子筛效应。不同的核酸或蛋白质,它们的分子量大小及构 型不同,所带净电荷的多少不同。电泳时的泳动率就不 同,从而分出不同的区带。在电泳分离后能保持蛋白质和 酶等生物大分子的生物活性。
三、电泳操作流程 (SDS-PAGE)
1.制备PAGE胶
固定玻璃板 灌注分离胶,水封, 静置待凝固 吸干水,灌注浓缩胶,插入梳子, 静置待凝固
注意: a.催化剂TEMED要在注胶前加入,否则胶凝结而无法灌注. b.空气中的氧气的存在影响凝胶的聚合,因此,水封的 目的是隔绝空气中的氧气,并且使分离胶顶部平整。
相对迁移率 mR =
蛋白质样品区带中心迁移距离(cm) 溴酚蓝区带中心迁移距离(cm)
四、电泳的应用
常规的聚丙烯酰胺凝胶电泳适合于核苷酸多态性和蛋 白质的分析、分离。 SDS-PAGE则常用于测定蛋白质的分子量和蛋白质的 亚基数。目前已发现有些蛋白质不能用 SDS-PAGE测定分 子量。如电荷异常或构象异常的蛋白质,带有较大辅基的 蛋白质(某些糖蛋白)以及一些结构蛋白,如胶原蛋白等。
c.Acr和Bis具有神经毒,操作时应戴手套。Acr/Bis储液于棕色 瓶4℃保存。
2.加样
电泳槽内注入电极缓冲液, 使其完全淹没浓缩胶顶部, 小心拔出梳子
经SDS处理的样品, 于沸水中加热3 min, 以除去亚稳态聚合。
用微量移液器于距 槽底三分之一处进样
3.电泳
加样后的凝胶,应立即电泳。 样品进浓缩胶,电流控制在20-30 mA; 样品进分离胶,电流控制在40-50 mA。 待溴酚蓝条带泳动到距离胶板前沿约1-2cm处, 停止电泳。

电泳技术-聚丙烯酰胺凝胶电泳

电泳技术-聚丙烯酰胺凝胶电泳

.电泳技术.第一节第二节电泳技术概述常见电泳技术.常见电泳技术第二节纸电泳和醋酸纤维薄膜电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳梯度凝胶电泳等电聚焦电泳二维聚丙烯酰胺凝胶电泳印迹电泳毛细管电泳二、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)聚丙烯酰胺凝胶是由单体丙烯酰胺(acrylamide,简称Acr) 和交联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺(m ethylene-bisacrylamide,简称Bis)在加速剂和催化剂的作用下聚合并联成三维网状结构的凝胶,以此凝胶为支持物的电泳称为聚丙烯酰胺凝胶电泳。

polyacrylamide gel electrophoresis,简称PAGE.PAGE应用围广,可用于蛋白质、酶、核酸等的分离、定性、定量及少量的制备,测定相对分子质量、等电点等。

.1、聚丙烯酰胺凝胶的特点①可用于分离不同分子量的生物大分子聚丙烯酰胺凝胶的特点②更高的灵敏度:10-9~10-12 mol/L③化学惰性好,电泳时不会产生“电渗”④电泳分离的重复性好⑤透明度好,便于照相和复印⑥机械强度好,有弹性,便于操作和保存.⑦无紫外吸收⑧可用作固定化酶的惰性载体2、凝胶聚合的原理及有关特性(1)聚合反应凝胶单体丙烯酰胺加速剂四甲基乙二胺AcrTEMED交联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺Bis催化剂过硫酸铵(AP) 或核黄素.(2)凝胶孔径的可调性及其有关性质①凝胶性能与总浓度及交联度的关系T(Acr和Bis总浓度)(%)= C(交联剂百分比)(%)= abmbab100100其中a=Acr克数,b=Bis克数,m=缓冲液体积(mL)a/b(W/W)与凝胶的机械性能密切相关a/b>100 a/b=30 凝胶脆易碎,坚硬呈乳白色凝胶呈糊状,易于断裂完全透明而又有弹性C=6.5−0.3T不同浓度的单体对凝胶性能影响很大,Davis的实验发现Acr<2%,Bis<0.5%,凝胶就不能聚合。

当增加Acr浓度时要适当降低Bis的浓度。

SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳

SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
7、Tris-甘氨酸电泳缓冲液:30.3gTris,188g甘氨酸,10gSDS,用蒸馏水溶解至1000ml,得0.25mol/L Tris-1.92mol/L甘氨酸电极缓冲液。临用前稀释10倍。
8、转移缓冲液:配制1L转移缓冲液,需称取2.9g甘氨酸、5.8gTris碱、0.37g SDS,并加入200ml甲醇,加水至总量1L。
ß
把膜置于第二抗体中,温和振荡2小时
ß
在TBST中洗膜1小时,中间更换4次
ß
显影,定影这一步骤为最重要的步骤之一,非常容易出现问题,必须小心仔细,我们在实验中采用的是上海康成公司生产的第二代化学超敏发光试剂盒,说明书另附PDF。在实验中发现有时发光很快减弱;肉眼可以看到发光,但是底片显不出来等问题。联系了康成公司的技术员,改动如下:膜与发光显色剂接触时间改为2分钟(不是说明书中的5min),底片压片时间2分钟。显影时有一些基本的原则,如严格的避光,压片前注意排除气泡,压片过程中底片不能接触液体等,按照一定的规则放置膜。将底片压片曝光结束后,将其中一角折起以助定位。定影后将膜贴于显出的条带,条带旁表明marker条带。底片注明实验日期、名称。
(2)分类
western显色的方法主要有以下几种:
i.放射自显影
ii.底物化学发光ECL
iii.底物荧光ECF
iv.底物DAB呈色
现常用的有底物化学发光ECL和底物DAB呈色,体同水平和实验条件的是用第一种方法,目前发表文章通常是用底物化学发光ECL。只要买现成的试剂盒就行,操作也比较简单,原理如下(二抗用HRP标记):反应底物为过氧化物+鲁米诺,如遇到HRP,即发光,可使胶片曝光,就可洗出条带。
2.针对样品的常见问题
B.做线粒体膜UCP2蛋白的Western Blot(以下简写成Western Blot),提取线粒体后冻存(未加蛋白酶抑制剂),用的博士德的一抗,开始还有点痕迹,现在越来越差,上样量已加到120μg,换了个santa cruz的一抗仍不行。是什么原因?蛋白酶抑制剂单加PMSF行吗?

聚丙烯酰胺凝胶电泳

聚丙烯酰胺凝胶电泳

聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳法1.仪器装置通常由稳流电泳仪和圆盘或平板电泳槽组成。

其电泳室有上、下两槽,每个槽中都有固定的铂电极,铂电极经隔离电线接于电泳仪稳流挡上。

2.试剂(1)溶液A 取三羟甲基氨基甲烷36.6g,四甲基乙二胺0.23ml,加0.1mol/L盐酸溶液48ml,再加水溶解并稀释至100ml,置棕色瓶内,在冰箱中保存。

(2)溶液B 取丙烯酰胺30.0g、次甲基双丙烯酰胺0.74g,加水溶解并稀释至100ml,滤过,置棕色瓶内,在冰箱中保存。

(3)电极缓冲液(pH8.3) 取三羟甲基氨基甲烷6g、甘氨酸28.8g,加水溶解并稀释至1000ml,置冰箱中保存,用前稀释10倍。

(4)溴酚蓝指示液取溴酚蓝0.1g,加0.05mol/L氢氧化钠溶液3.0ml 与90%乙醇5ml,微热使溶解,加20%乙醇制成250ml。

(5)染色液取0.25%(W/V)考马斯亮蓝G<[250]>溶液2.5ml,加12.5%(W/V)三氯醋酸溶液至10ml。

(6)稀染色液取上述染色液2ml,加12.5%(W/V)三氯醋酸溶液至10ml。

(7)脱色液 7%醋酸溶液。

3.操作(1)制胶取溶液A2ml,溶液B5.4ml,加尿素2.9g使溶解,再加水4ml,混匀,抽气赶去溶液中气泡,加0.56%过硫酸铵溶液2ml,混匀制成胶液,立即用装有长针头的注射器或细滴管将胶液沿管壁加至底端有橡皮塞的小玻璃管(10×0.5cm)中,使胶层高度达6~7cm, 然后徐徐滴加水少量,使覆盖胶面,管底气泡必须赶走,静置约30分钟,待出现明显界面时即聚合完毕,吸去水层。

(2)标准品溶液及供试品溶液的制备(3)电泳将已制好的凝胶玻璃管装入圆盘电泳槽内,每管加供试品或标准品溶液50~100μl,为防止扩散可加甘油或40%蔗糖溶液1~2滴及0.04%溴酚蓝指示液1滴,也可直接在上槽缓冲液中加0.04%溴酚蓝指示液数滴,玻璃管的上部用电极缓冲液充满,上端接负极、下端接正极。

聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤

聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤

聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤
聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis,简称PAGE)是一种常用的分离和分析蛋白质的方法。

以下是一般
的聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤:
1. 制备凝胶:将聚丙烯酰胺和交联剂(通常是二甲基亚砜)在缓冲液中混合,加热溶解,然后迅速倒入电泳槽或制备模具中,留下一端可以装入电极。

2. 固化凝胶:将凝胶慢慢冷却至室温,使其固化。

这通常需要约30分钟至1小时。

3. 准备样品:将待测样品与一定体积的加载缓冲液混合均匀(可以包含甲基绿或其他荧光染料),并加热处理。

这样做是为了使样品蛋白质裂解、去除二硫键、破坏二级和三级结构,以使所有蛋白质都呈线性链状。

4. 加载样品:用微量移液器向凝胶中的小孔加入已经处理好的样品。

5. 进行电泳:将电泳槽连接至电源并设定合适的电压和电流。

根据待测蛋白质的大小和分子量,可以选择不同的电泳条件(如电压、电流和时间)。

6. 着色和显影:电泳结束后,用染料染色或其他方法可视化蛋白质。

通常使用染料如明胶蓝或银染法来增强蛋白质的显色。

7. 分析和解读:根据电泳图像,分析和解读样品中的蛋白质分离情况,如判断蛋白质的相对分子量、纯度等。

请注意,以上步骤仅为一般的聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤,具体操作可能会根据实验目的和需求有所变化。

同时,操作和设备使用时应遵守实验室安全规定。

sds聚丙烯酰胺凝胶电泳

sds聚丙烯酰胺凝胶电泳

SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳1. 引言SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)是一种常用的蛋白质分离和分析方法。

通过SDS(十二烷基硫酸钠,Sodium Dodecyl Sulfate)将蛋白质变性并赋予负电荷,在凝胶电泳中,根据蛋白质的分子量大小,使蛋白质在电场中向阳极方向运动,从而实现蛋白质的分离。

SDS-PAGE广泛应用于蛋白质的分子量测定、复杂蛋白质混合物的分离、蛋白质组学研究等领域。

它具有简单易行、高分辨率、高灵敏度以及可以与其他技术(如质谱、Western blot 等)结合等优点。

本文将介绍SDS-PAGE的原理、实验步骤和关键注意事项,并提供相关的Markdown文本格式输出,以便读者在实验中参考。

2. 原理SDS-PAGE的原理基于SDS的作用。

SDS是一种带有负电荷的表面活性剂,能够使蛋白质在水溶液中均匀地带上负电荷,同时使蛋白质变性并展开成线性构象。

在电泳过程中,SDS包裹在蛋白质中,使蛋白质的电荷密度保持均一,从而使蛋白质的迁移速率仅与蛋白质的分子量有关,而与蛋白质的电荷无关。

SDS-PAGE通常在聚丙烯酰胺凝胶上进行。

聚丙烯酰胺是一种化学稳定性强的凝胶材料,通过聚合物的交联形成网状结构。

在凝胶电泳过程中,根据蛋白质分子量的不同,蛋白质能够在凝胶孔隙中以不同程度的速率迁移。

3. 实验步骤3.1. 制备凝胶1.准备1.5 M的Tris缓冲液,pH 8.8。

2.准备汀凝胶的原液,将30%丙烯酰胺溶液、1.5 MTris缓冲液和10%过硫酸铵按照体积比例(29:1:10)混合均匀。

3.快速加入TEMED(N,N,N’,N’-四甲基乙二胺)溶液至原液中,并迅速倒入凝胶模具中。

4.在凝胶模具上方加入异丙醇以防止凝胶表面生成凝胶。

3.2. 样品处理1.取适量的蛋白质样品。

2.加入相应的样品加载缓冲液(含有SDS和还原剂,以及测量样品体积比例的溶液)。

3.在冰上煮沸5分钟,使蛋白质样品变性并带上负电荷。

聚丙烯酰胺凝胶电泳

聚丙烯酰胺凝胶电泳

聚丙烯酰胺凝胶电泳
聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术是一种常用的生物分子电泳分
离技术,它可以用来分离、鉴定、分析不同分子量的碱基链,以及抗
原和抗体。

PAGE是通过聚丙烯酰胺凝胶作为分离层来分离和分析物质
的一种电泳技术,具有灵活性好、精密度高等优点,一直被应用于生
物学研究中。

聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)作为生物分子电泳的基础技术,用
于分离纯化各种类型的微缩生物,包括蛋白质,核酸和糖苷。

由于这
种技术具有灵活性强、精密度高,一直广泛应用于多学科领域。

分离Pakage包括多个步骤,包括以下几种步骤:样品制备、电泳、高压灌注、凝胶固定等。

PAGE技术的工作原理是利用水相中分子在凝胶中受到质子交换效应、静电力场和电迁移矢量力的影响,使不同分子类型在空间上形成
不同分布,进而可以检测出不同分子类型的特征。

聚丙烯酰胺凝胶的
特点是可以用来分离和分析多种组分,而且可以快速、灵活、有效地
分离出不同的分子,可以用来分析多种环境和生物样本中的物质。

PAGE技术在生物研究中具有重要现实价值,使用PAGE可以快速、精准地检测出各种生物体中不同类型的碱基链和抗原抗体。

另外,PAGE的质量控制指标相当严格,可以保证对检测结果的精准度。

由此
可见,这种PAGE技术在分离物质方面有无可比拟的优势,受到了生物
学研究的广泛应用。

SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳

SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳

SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)实验报告一、实验目的1.学习SDS-PAGE分离蛋白质的原理;2.掌握垂直板电泳的操作方法。

二、实验原理1、电泳:(1)定义:是指带电粒子在电场中向与其自身所带电荷相反的电极方向移动的现象。

(2)影响电泳效果的因素:①带电颗粒的大小和形状:颗粒越大,电泳速度越慢,反之越快;②颗粒的电荷数:电荷越少,电泳速度越慢,反之越快;③溶液的粘度:粘度越大,电泳速度越慢,反之越快;④溶液的pH值:影响被分离物质的解离度,离等电点越近,电泳速度越慢,反之越快;⑤电场强度:电场强度越小,电泳速度越慢,反之越快;⑥离子强度:离子强度越大,电泳速度越慢,反之越快;⑦电渗现象:电场中,液体相对于固体支持物的相对移动;⑧支持物筛孔大小:孔径小,电泳速度慢,反之则快。

2、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)(1)定义聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE):是以聚丙烯胺凝胶作为载体的一种区带电泳。

SDS-PAGE:是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二烷基磺酸钠)(2)SDS的作用SDS是一种阴离子去垢剂,可与蛋白质结合,形成SDS-蛋白质复合物。

由于SDS带有大量负电荷,好比蛋白质穿上带负电的“外衣”,蛋白质本身带有的电荷则被掩盖,即消除了蛋白质分子之间电荷差异。

因此在电泳时,蛋白质分子的迁移速度则主要取决于蛋白质分子大小(3) SDS-PAGE分类:¾SDS-PAGE按照缓冲液pH值和凝胶孔径差异分为连续系统和不连续系统两大类:连续系统:电泳体系中缓冲液pH值及凝胶浓度相同,带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷和分子筛效应。

不连续系统:缓冲液离子成分,pH,凝胶浓度及电位梯度均不连续性,带电颗粒在电场中泳动不仅有电荷效应,分子筛效应,还具有浓缩效应,因而其分离条带清晰度及分辨率均较前者佳(4)聚丙烯胺凝胶的生成:聚丙烯胺凝胶由丙烯酰胺单体(Acr)和N,N’-甲叉双丙烯酰胺(Bis)在催化剂作用下聚合而成。

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聚丙烯酰胺凝胶电泳
(Polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE)
聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺(acrylamide,Acr)单体相互聚合成多条长链,再与N,N-甲叉双丙烯酰胺(methylene-bisacrylamide,Bis)在引发剂和加速剂的作用下交联而成的凝聚胶多孔聚合物。

凝胶孔径的大小可通过控制单体和交联剂的浓度来调节,从而满足不同分子量物质的分离要求。

不同浓度的聚丙烯酰胺非变性凝胶的有效分离范围如表所示:
表1 DNA在聚丙烯酰胺凝胶中的有效分离范围
丙稀酰胺[%(w/v)]a有效分离范围(bp)二甲苯青FF b溴酚蓝b
3.51000-2000 460 100
5.080-500 260 65
8.060-400 160 45
12.040-200 70 20
15.025-150 60 15
20.0 6-100 45 12
a.N,N′-亚甲双丙稀酰胺占丙稀酰胺浓度的1/30
b.给出的数字是迁移率与染料相同的双链DNA片段的粗略大小(核苷酸对)。

聚丙烯酰胺凝胶的制备和电泳都比琼脂糖凝胶更为费事。

聚丙烯酰胺凝胶几乎总是铺于两块玻璃板之间,两块玻璃板由间隔片隔开冰封以绝缘胶布。

在这种配置形式下,大多数丙烯酰胺溶液不会与空气接触,所以氧对聚合的抑制仅限于凝胶顶部的一个窄层里。

聚丙烯酰胺凝胶一律是进行垂直电泳,根据分离的需要,其长度可以在10-100cm之间。

聚丙烯酰胺凝胶与琼脂糖凝胶相比有3个主要优点:(1)分辨力强,长度仅仅相差0.2%(即500bp中的1bp)的DNA分子即可分开;(2)所能装载的DNA分子量远远琼脂糖凝胶:多达10μg的DNA可以加样于聚丙烯酰胺凝胶的一个标准样品槽(1cm×1mm)而不致显著影响分辨力;(3)从聚丙烯酰胺凝胶中回收的DNA纯度很高,可适用于要求最高的实验(如鼠胚胎微注射)。

常用的是两种聚丙烯酰胺凝胶:
(1)用于分离和纯化双链DNA片段非变性聚丙烯酰胺凝胶
(2)用于分离、纯化单链DNA的变性聚丙烯酰胺凝胶
非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
【原理】
非变性聚丙烯酰胺凝胶用于分离和纯化小分子双链DNA片段(<1 000bp),多数双链DNA在此胶中的迁移率大略与其大小的对数值成反比,但迁移率也受碱基组成和序列的影响,同等大小的DNA分子可能由于空间结构的不同而使迁移率
相差10%,故不能用它来确定双链DNA 的大小。

【试剂及配置】
1. 30%丙烯酰胺:丙烯酰胺29g ,N ,N'-甲叉双丙烯酰胺1g ,加水到100ml ,加热至37℃溶解,室温避光保存,存贮期间溶液pH 值应≤7.0。

2. 5×TBE 缓冲液(pH8.3):54 Tris 碱,27.5硼酸,20ml 0.5mol/L
EDTA(pH8.0),加水至1L 。

3. 10%过硫酸铵(AP ):AP 1g 加水定容到10ml ,4℃下可存贮数周。

4. TEMED (N ˊ,N ˊ,N ˊN ˊ-四甲基乙二胺)。

5. DNA 分子量标准。

6. 6×凝胶上样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青FF,30%甘油溶于水中。

7. 溴化乙锭(EB )1mg/ml 或银盐染色法所需试剂。

【操作步骤】
1.用洗涤剂浸泡玻璃板,填条和样品梳,必要时用KOH/甲醇清洗(100ml 甲醇加5gKOH 配置),水洗后再用乙醇淋洗。

每块玻璃板的一面都用聚硅氧烷溶液处理,以防凝胶与玻片贴紧并减少卸胶时凝胶破裂的可能性。

2.装好灌胶用的玻璃片及垫条,用琼脂糖封住底、左、右三边。

(进口Bio -Rad 垂直板电泳设备可不用封胶)
3.依所分离DNA 的大小来确定合适的凝胶浓度,如表所示
表2 制备聚丙烯酰胺凝胶所用试剂的体积
制备不同浓度(%)凝胶所用试剂的体积 3.5 5.0 8.0 12.0 20.0
30%丙稀酰胺 11.6 16.6 26.6 40.0 66.6
ddH 2O 67.7 62.7 52.7 39.3 12.7 5×TBE 20.0 20.0 20.0 20.0 20.0 10%过硫酸铵 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7
4.每100ml 胶液中加入35μlTEMED ,迅速混匀,用注射器注入胶床,插入
样品梳,应密切注意胶内不要有气泡,检查有无凝胶渗漏。

5.室温下聚合约30min ,聚合完全时可见梳齿下二条折光线,小心拔出样品梳。

6.在电泳槽中加入1×TBE 缓冲液,使缓冲液覆盖样品孔,并用缓冲液冲洗样品孔。

7.于DNA 样品加1/5体积6×凝胶上样缓冲液混合,小心注入样品孔中(加样量为3~5μl )。

8.接上电极,以5V/cm (1~8V/cm )的电压进行电泳。

9.参照染料迁移至所需位置时,切断电源,取出凝胶。

按下列方法之一进行染色或显影,检测DNA 的位置:
(1)溴化乙锭染色法:由于PAG 能抑制EB 的荧光量,故用该法时,DNA 量需大于10ng 。

将凝胶和玻璃板一起放入含0.5μg/mlEB 的1×TBE
缓冲液中,
30~45min后取出,水洗,紫外检测仪观察并照相。

(2)银盐染色法:
①10%乙醇固定3min;
②双蒸水洗1min;
③2%HNO3洗3min;
④双蒸水洗1min;
⑤0.18%AgNO3轻摇20min;
⑥双蒸水洗1min;
⑦3%Na2CO3显影30min(临用前配置,每100ml加入10μl甲醛)。

【问题与讨论】
●如何判断丙烯酰胺是否已聚合?
丙烯酰胺聚合后梳子下方可以看见折光率不同的纹线。

●“微笑”DNA是怎样造成的?
①凝胶太厚导致电泳时产生的热量很大,DNA条带出现微笑样弯曲
②电泳时电压太高,凝胶中部产热不同而致DNA条带弯曲
●为什么有时候DNA条带成波浪形弯曲或严重扭曲?
①在拔出梳子后没有立即彻底冲洗加样孔,梳子残留的少量丙烯酰胺溶液
在加样孔中聚合产生不规则的表面,引起DNA条带变形。

②在电泳槽和凝胶中使用的不是同一批次的电泳缓冲液,离子强度或PH值
的微小差异会形成缓冲液前沿,使DNA片断的迁移发生严重扭曲
●在银染中背景太深是如何造成的?
甲醛加的太多或是Na2CO3配置的时间过久已发生了变化。

变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
【原理】
变性聚丙烯酰胺凝胶是在核苷酸碱基配对抑制剂(尿素或甲酰胺)存在的情况下聚合而成的,用于分离和纯化单链DNA(RNA)片段,核酸的迁移率和碱基的组成及序列无关,常用于:①测定双链DNA的长度;②回收寡核苷酸。

此方法迅速、简单、分辩率高,虽然产量较低(<50%所加样品),但也足以满足大部分工作的需要。

多用于分离同位素标记的探针、分析SI核酸酶的产物和DNA测序等。

【试剂及配制】:
1.5×TBE缓冲液(pH8.3):54gTris碱,27.5g硼酸,20ml0.5mol/LEDTA(pH8.0),
加水至1L。

2.42%丙稀酰胺:丙稀酰胺40g,N,Nˊ-甲叉双丙稀酰胺2g,加ddH2O至100ml,
加热至37℃溶解,室温避光保存。

3.TEMED(Nˊ,Nˊ,NˊNˊ-四甲基乙二胺)。

4.尿素。

5.10%过硫酸铵(AP)。

6.2×甲酰胺上样缓冲液:
5×TBE 0.2ml
去离子甲酰胺 0.9ml
10%溴酚蓝 50μl
7.7.0.3mol/L乙酸钠(pH7.5)。

8.8.TE缓冲液(10mmol/L Tris·Cl,1mmol/L EDTA,pH8.0)。

【操作步骤】
1.制备PAG-尿素凝胶,按寡核苷酸长度权择适当浓度的凝胶(12%,15%,19%的
尿素PAG分别对应被分离合适的寡核苷酸长度40~100,25~40,<25mer)。

按下列混合:称取25.2尿素(终浓度7mol/L),取12ml 5×TBE,42%丙烯酰胺(所需量),加水至60ml,加10%AP200μlTEMED30μl,混合并倒胶(避免气泡产生),在室温下聚合30min以上。

2.取出样品梳,安装电泳装置,在电泳槽中入1×TBE,1500V电压预电泳15~
30min。

3.用等体积的2×甲酰胺上样缓冲液稀释样品(上样前可在90℃加热3min以消除
二级结构的干扰),产生清晰的带需要10μg寡核苷酸。

4.用TBE冲洗上样孔数次,洗净尿素,上样。

5.1500V电压进行电泳,当溴酚蓝迁移至凝胶底部时,停止电泳。

6.卸下玻璃板,取出凝胶块,染色或显影,检测DNA的位置。

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