RT-PCR实验步骤
RT-PCR的具体步骤

4.弃上清的操作,我们一般将EP管倒置在平铺于桌面的卷纸上,吸干。
5.最后一步弃酒精,将RNA溶于DEPC水的操作,我们的做法是:先按4的步骤吸干酒精,
其实这样还是不彻底的,再将EP管小离心后用20μl小枪头(DEPC处理过的)吸出多余的酒 精。最后用200μl中枪头(DEPC处理过的)吸11.5μl(20μl体系,如果是40μl体系则加倍)的DEPC水至EP管中,吹打助溶,然后转移至200μl的EP管(这些EP管中可以事先加好Oligo(dT)15,以节省枪头)中。
脂糖凝固)后现进行电泳。
2.1.5%:同上,将琼脂糖的量改为1.5g
六.需购置材料
Taq酶(-20度保存)(配10×buffer和MgCl2):不需要使用高保真Taq酶,一般的就行。个人感觉天为时代的普通Taq酶就很不错。
dNTP(4度保存):向生物公司购买,原装和分装均可。
oligo(dT)15(-20度保存):可以向生物公司购买Invitrogen合成的廉价货, 每支10元,稀释后 使用(注意稀释浓度),也可以购买Promega的原装货,稀释10倍后使用, 稀释液4度保存。
1.DEPC水:吸出1ml DEPC放在1000ml容量瓶中加双蒸水定容至1000ml,配成1‰DEPC水,并充分振荡混匀备用。
2.75%乙醇:用无水乙醇+DEPC水配,然后放-20℃保存(DEPC水需先高压,高压时注意:
1.装DEPC水的瓶子在盖子和瓶之间要放上线头;2.高压时间在40-45分钟, 所以水要适当多
干,EP管和匀浆管装入饭盒后甩干,然后在37度孵箱烘干)。高压后烤干备用。如果DEPC处理过的物品时间已超过一个星期,再次使用前应再次高压。
RT-PCR步骤

RT-PCR实验步骤佚名一、组织抽提:1.取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末2.移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆3.移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打4.冰上孵育5分钟5.离心12,000g 4℃ 5分钟取上清液移入1.5ml新离心管6.加0.2 ml氯仿,震荡,冰上孵育5分钟7.离心<12,000g 4℃ 10分钟取上层液相移入1.5ml新离心管8.加0.5 ml异丙醇,震荡,冰上孵育5分钟9.离心<12,000g 4℃ 5分钟弃去上清液10.加入1 ml 75%乙醇,震荡11.离心<7,500g 4℃ 5分钟弃去上清液12.室温下使之变透明13.加入DEPC处理水10μl --35μl 溶解RNA(可保存在液氮或低温冰箱)14.走RNA变性电泳观察18s,28s条带,分光光度计检测260/280吸光度比值,计算RNA浓度二、RT反应体系(第一步):约20分钟1.65℃ 15分钟2.立即放入冰浴RT反应体系(第二步):约2小时1.37℃ 1.5小时2.94℃ 5-10分钟3.反应物保存于-20℃或进行PCR三1、PCR反应体系:约4.5小时1.94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟为第一个步1个循环2.94℃ 45秒,55℃ 40秒,72℃ 1分钟为第二步30个循环3.72℃ 10分钟4.取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳三2、PCR反应体系:约5小时1.94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟为第一个步1个循环2.94℃ 45秒,50℃ 40秒,72℃ 1分钟为第二步40个循环3.72℃ 10分钟4.取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳四、电泳:约1.25小时1.配0.5×TBE电泳缓冲液300 ml2.胶浓度1.7%(40ml 0.5×TBE加0.68g胶)3.微波炉中火2分钟溶解胶4.冷却至60℃加入溴乙锭2μl(10mg/ml的终浓度0.5μg/ml)5.放入梳子,浇板,待凝固6.加8μl PCR反应产物+2μl溴酚兰7.电泳50-80V(每㎝ 5V)。
RT-PCR的具体步骤

RT-PCR的具体步骤RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)是一种常见的分子生物学技术,用于检测RNA分子。
在本文中,我们将介绍RT-PCR的具体步骤,以便您更加全面地了解这种技术。
1.总RNA提取首先需要从细胞中提取RNA。
这可以通过商用试剂盒或手工方法实现。
如果使用试剂盒,则遵循其说明书中的步骤。
如果手工提取RNA,则需要使用三个基本试剂:细胞裂解缓冲液、氯仿和异丙醇。
步骤如下:•将细胞收集在管中,加入裂解缓冲液。
•冷冻-解冻样品3次,使细胞壁破裂并释放RNA。
•加入氯仿并混合。
•离心样品,使沉淀分离出来。
•将上层溶液转移到另一个管中,加入异丙醇。
•冷藏或冷冻,然后离心。
•去除上层液体,并在无水酒精中对RNA进行洗涤和沉淀。
2.反转录在提取出RNA后,需要将其转录为DNA,即逆转录。
这可以通过使用反转录酶(RT)实现。
在反转录步骤中,会加入反转录引物和其他试剂来增强逆转录效果。
这些引物是由需要扩增的RNA序列的反向互补核酸序列构成的。
这些步骤如下:•将RNA加入反转录反应混合物中,该混合物包含反转录酶、引物和其他必要试剂。
•反转录混合物通常通过加热来促进逆转录引物结合到RNA模板上,并形成RNA-DNA杂交链。
随后,反转录酶在杂交链上寻找RNA模板,并通过降低杂交链的熔点来将反转录引物延伸为cDNA链。
3.PCR扩增完成逆转录后,需要进行PCR扩增以增加cDNA的数量。
PCR是一种将 DNA 扩增到数以百万计的技术,能够扩增非常小的DNA模板。
PCR的步骤如下:•在PCR反应混合物中加入适当的引物和其他必要试剂。
•该反应混合物包括DNA聚合酶、模板DNA、引物和核苷酸。
•反应混合物被放入PCR机器中,按照特定的程序进行加热和冷却,使DNA链复制为两条新的DNA链。
•扩增程度由PCR反应的周期数决定。
4.分析最后,将扩增的DNA分离并分析它们的大小、类型和量。
这可以通过游离电泳或毛细管电泳等技术实现。
RT-PCR实验步骤

RT-PCR实验步骤一、总RNA提取1. 取200mg组织,放到1.5mlEP管中,加入1mlTrizol剪碎。
2. 震荡30s。
3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。
4. 12000×g,4℃离心,15min。
5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。
6. 加等体积异丙醇,-20℃,30min。
7. 12000×g,4℃离心,10min。
在管底部可见微量RNA沉淀8. 弃上清,加75%乙醇1ml,振荡。
9. 7500×g,4℃离心,10min。
10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥5-10min。
11. 沉淀溶于20μlDEPC水,取1μl加入79μlDEPC水测OD260/OD28012. 计算浓度与纯度,-70℃保存。
二、逆转录合成cDNA第一链反应体系如下混匀快速离心一次反应条件如下-20℃ 冰箱冻存三、PCR反应混匀快速离心一次反应条件如下PCR产物-20℃冰箱保存取PCR产物8μl 加5×Loading Buffer 2μl 2%琼脂糖凝胶电泳120V。
100mA 30min 溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果。
RT-PCR实验方法总结1,2RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。
要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。
2. RT按要求做,一般不会出太大问题。
3. PCR,按常规。
但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。
1)RT和PCR时的引物设计是不是一定要先知道目的基因的序列?必须在RT时,引物设计有3种方法即a:Random 9mers;b:Oligo dT-Adaptor Primer;和c:特异的下游引物。
如果用a和b方法,是扩增的所有的cDNA(理论上),还要用此产物做PCR 的模板继续扩增。
RT-PCR步骤

RNA提取(-80℃保存)1.取50-100mg组织加入1ml Trizol,剪碎,振荡30s2.转入一新EP管中(),室温保存5min3.加氯仿,振荡混合(手摇剧烈),室温放置5min4.12000 rpm 4℃离心15min5.转移上层水相(吸70%)到一新EP管中,加异丙醇,振荡混合,室温保存10min6.12000rpm 4℃ 离心15min7.倒掉上清,加1ml 75%无水乙醇(4℃保存),振荡混合,7500rpm 4℃ 离心5min8.倒掉上清,室温或37℃放置20min(EP管倒置在滤纸上)使RNA沉淀干燥9.加20ul DEPC水至EP管中10.在50℃孵育3-5min(或手握3-5min),使RNA充分溶解注意:操作过程中带手套口罩,所用到的仪器设备须经去除RNA酶处理(灭菌或DEPC水浸泡)测RNA浓度(以750ul体系为例)11.调零:750ul DEPC水12.测量:745ul DEPC水 + 5ul RNA13.总RNA浓度= OD260×40×稀释倍数(150倍)ug/ml14. = OD260×40×150 ug/ml15. = OD260×6 ug/ul16.A260/A280应在之间逆转录(cDNA:一周内-20℃保存,长期-80℃保存)方法一:以通用试剂盒为例,反应体系20ul1.RNA短暂离心2.RNA模板,再加入Oligo(dt) 1ul,加DEPC水补齐至10ul.轻轻混合均匀,短时间离心3.将反应液置于65℃ 5min 冰上1min,短时间离心4.按顺序加入:5×buffer 4ul200ul核糖核苷酸酶抑制剂10mm dNTP MIX 1ul逆转录酶 1ulRNase-free H2O轻轻混合均匀,短时间离心5.将混合物置于37℃,60min6.75℃加热15min,中止上述反应,置于冰上注意事项1.RNA提取和逆转录时所用器具均应在1‰DECP水中避光浸泡过夜,再高压烘干2.DECP水配制(先加DEPC,再加水,避光过夜,然后高压)3. 75%无水乙醇配制(DEPC水:无水乙醇=1:3)4. RNA提取和逆转录时应全程佩戴一次性手套和口罩聚合酶链反应PCR(产物-20℃保存)方法一:1.25ul的反应体系,冰上操作,稍后短时间离心Template 1ul/3ulPrimer 1 1ulPrimer 2 1ul10*Taq Buffer 5uldNTPs(10mM) 1ulTaq酶 1ulddH2O 补至25ul循环:① 94℃ 5min② 94℃ 45s③Tm+4℃ 45s④72℃ 45s 2 29-34 (从第2步开始循环30-35个循环)⑤ 72℃ 10min⑥ 4℃ 12hPCR结束后-20℃保存或置于冰上开始电泳。
rt-pcr反应步骤

rt-pcr反应步骤
RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)是一种用于检测RNA的技本。
它可以将RNA转录成DNA,然后进行聚合酶链式反应来扩增特定的DNA片段。
以下是RT-PCR的一般步骤:
1. 样品处理,首先需要从样品中提取RNA。
这包括细胞或组织
的裂解以释放RNA,并使用适当的试剂将RNA纯化出来。
2. 逆转录,提取的RNA经过逆转录反应,使用逆转录酶(如
M-MLV逆转录酶)将RNA转录成相应的cDNA(互补DNA)。
3. PCR准备,为了进行PCR,需要将逆转录产生的cDNA与引物(primer)和DNA聚合酶(如Taq聚合酶)放入PCR反应管中。
引
物是一小段与目标DNA序列互补的DNA片段,它们将指导DNA聚合
酶在特定区域合成新的DNA链。
4. PCR扩增,PCR反应进行数个循环,每个循环包括三个步骤,变性、退火和延伸。
在变性步骤中,反应混合物被加热以使DNA解链。
在退火步骤中,引物与目标DNA结合。
在延伸步骤中,DNA聚
合酶在引物的引导下合成新的DNA链。
这些循环会使目标DNA片段
指数级增加。
5. 结果分析,最后,通过凝胶电泳或其他技术,可以分析PCR 反应产生的DNA片段,确定是否存在感兴趣的基因或RNA。
总的来说,RT-PCR是一个用于检测和定量RNA的强大技术,它结合了逆转录和聚合酶链式反应的步骤,可以在研究和临床诊断中发挥重要作用。
rt-pcr的步骤和注意事项

RT-PCR的步骤和注意事项RT-PCR(逆转录聚合酶链反应)是一种常用的分子生物学技术,用于检测和分析RNA的数量和表达水平。
下面是RT-PCR的基本步骤和一些需要注意的事项。
步骤1.提取RNA:RT-PCR的第一步是从样品中提取RNA。
常见的方法包括酚/氯仿提取法和商用RNA提取试剂盒。
2.逆转录:逆转录是将RNA转录成cDNA的过程。
逆转录反应需要逆转录酶和引物。
在逆转录反应中,RNA被逆转录酶逆转录为单链cDNA。
3.退火:将逆转录产生的单链cDNA进行退火,以得到双链cDNA。
退火的温度和时间应根据引物的特异性进行优化。
4.PCR扩增:将退火得到的双链cDNA作为模板进行PCR扩增。
PCR扩增需要DNA聚合酶和引物。
PCR扩增的温度和时间也应根据引物的特异性进行优化。
5.分析产物:将PCR扩增产物进行凝胶电泳分析或者实时荧光定量PCR分析,以检测和定量RNA的表达水平。
注意事项在进行RT-PCR实验时,有几个注意事项需要遵守:1.RNase污染:RNase是一种可以降解RNA的酶,极易污染实验室环境。
为了避免RNase污染,所有操作前都应使用RNase去除液对实验表面进行彻底清洁,并在操作过程中使用RNase-free的试剂和器具。
2.质控:在RT-PCR实验中应常规进行阴性对照和阳性对照。
阴性对照是用纯水代替RNA模板,而阳性对照是使用已知含有目标RNA的样品。
质控实验的结果应该符合预期,以确保实验的准确性和可靠性。
3.引物设计:引物是RT-PCR实验中非常重要的因素,合适的引物设计可以提高实验的特异性和灵敏度。
引物的选择应避免自身互补性,长度一般为18-24个碱基,GC含量在40-60%之间。
此外,引物的Tm值应相近,以确保PCR扩增的效果。
4.反应体系:RT-PCR反应体系的准备需要精确的计量。
反应的组分通常包括模板RNA,引物,逆转录酶,逆转录缓冲液,核苷酸混合液,PCR缓冲液,DNA聚合酶,dNTPs和MgCl2等。
RT-PCR实验原理与步骤

RT-PCR实验原理与步骤【实验原理】RT-PCR 是以RNA 为模板经逆转录反应(Reverse Transcription,RT)产生cDNA第一链,再以cDNA 为模板进行PCR 扩增以检测目的基因的表达情况。
【实验仪器】1. 恒温金属浴2. PCR 扩增仪【试剂及配制】RNA PCR Kit (AMV) Ver 3.0试剂包括:1. AMV 反转录酶XL (5 U/ul)2. 10×反转录反应缓冲液3. RNAase 抑制剂(40 U/ul)4. 随机引物9 mers (50 pmol/ul)5. RNAase Free dH2O6. TaKaRa Ex TaqTM HS (5 U/ul)7. 5×PCR 反应缓冲液8. dNTP Mixture (各10 mM)【实验步骤】1. 反转录反应1)按下列组成配制反转录反应液MgCl2 2ul2. PCR 反应1)按下列组成配制PCR 反应液2)把此反应液加入到第一阶段反转录结束后的PCR 反应管中,轻轻混匀;3)按以下条件进行PCR 反应:94 ℃ 2 min,94℃ 30 sec、55 ℃ 30 sec、72℃ 4 min、30 cycles,72℃ 5 min。
4)琼脂糖凝胶电泳检测结果。
【注意事项】1. PCR 条件设定退火温度可根据实际情况适当地提高或降低(50℃~60℃)。
延伸时间因目的序列长度不同而不同。
cDNA 量较少时,循环次数可增加为40~50 次。
2. 当同时需要进行数次反应时,应先配制各种试剂的混合液(MasterMix),然后再分装到每个反应管中。
3. 使用酶类时,应轻轻混匀,避免起泡;分取前要小心地离心搜集到反应管底部;由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取时应慢慢吸取。
4. 酶制品应在实验前才从-20℃中取出,使用后也应立即放回-20℃中保存。
5. 分装试剂时务必使用新的Tip 头,防止样品间污染。
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RT-PCR实验步骤RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。
要求:1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。
2. RT按要求做,一般不会出太大问题。
3. PCR,按常规。
但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。
1)RT和PCR时的引物设计是不是一定要先知道目的基因的序列?必须在RT时,引物设计有3种方法即a:Random 9mers;b:Oligo dT-Adaptor Primer;和c:特异的下游引物。
如果用a和b方法,是扩增的所有的cDNA(理论上),还要用此产物做PCR 的模板继续扩增。
如果用c方法,那么要去那里查它的序列呢?问题:在做RT-PCR遇到一怪现象,即对同一动物不同组织扩增同一段基因,结果从一种组织中可以扩出我的目的基因,条带非常的好,而另一组织在同样的条件下却得到许多非特异性的条带,尝试其他条件同样无法得到满意的结果,百思不得其解!(注:已肯定该基因在两种组织中都表达,且内参照在两种组织都可扩增出来)从这两种组织中提取的RNA的量是不一样的,我测过吸光度,差异还很大,会不会和这有关呢?请高手指教!解答:1.RT-PCR有两种做法:条件具备的话可用kit进行一步法进行;若条件不太好的话可分两步进行逆转录再PCR。
但后来发现两步法的结果更加理想,条带特异性强且无拖尾现象,我推测是体系更加单一比较利于PCR的进行,当然也可能是我买的kit不太好。
(promega)。
2.RT-PCR应具备的条件高质量的RNA(保留后可做5‘,3’RACE);引物的(最好产物短点);若涉及粗略定量的话还应考虑RNA的浓度或是cDNA的浓度(如果由内标分子更好,但我发现其实很不容易将RNA的浓度以及内标分子的表达量调整的完全一样);体系的均一性等。
3.RACE我做过RACE(3’RACE是宝生物的Kit;5‘RACE是Gibico),但现在再进行另一个同源基因的3‘RACE时却怎么也P不出来,这两个基因是由同一对引物扩增出来的,其中一个已经获得了全序列(RACE的方法),而另一个基因的3’UTR却增么也扩不出来,我推测是不是该基因的3‘UTR太长的缘故,我都快绿了,有无RT-PCR的常用内标b-actin 和GAPDH的使用有选择性吗?比如不同的细胞,不同的刺激。
有关内参:RT-PCR内参照可以在一个管子里做(那样也是图好看一些),最好分开两管,把除了引物之外的mixture统一配,拍照后,算目的基因和内参的比值,这就是基因表达的相对浓度。
问:我曾经作过同一管的PCR,内有actin 和目的基因引物。
虽然可见到两条均一条带但图片质量不理想(而且酶量、Mg2+加倍)。
请教mxbdna2003 ,你是如何处理同一管的PCR的各成分的浓度?答:it should determined the amount of RNA. but it not for the quantitity of the PCR. it just was convienent to guess the amount ot the template<(for RT and PCR) and bettrer for publication and editor if he don not know the preocedure much. but the amount just using "accurate piptte" is wrong. it shoud be remembered to do the inner control of housekeeping gene everytime.在同一管中做RT,其实没有什么问题,不需要taq魅加量,taq酶就像你用某一种东西的数量去概括,因该选那种多的东西,说一座房子是由2000块砖造成的,比说又29根梁更准确吧。
更不要说没有看家基因不看家的缺点,因为他是服务于整个基因组表达谱什么的。
PE有专门的用于实时PCR的内参试剂盒,就是用18s,不过我们看懂使用的那条序列,不知有没有人用过,告知其序列和genbank号。
正好问一下,我查了一些序列,一直没有去合成,主要是因为手上的actin的荧光探针还没有完,当初和成了一堆。
有那位高手用过18s的内参,请问您的序列(我指的是模板的序列)?原位杂交最好用RNA做探针,效果好一些,反正你有钱卖roche 的盒子,而且量也能保证,因为转录过程嘛,沿着一条线突突地跑就是了。
正义反义也容易理清。
我觉得做RT-PCR的方法和条件及应注意的事项就是那么几条,许多专业书都有详细的描述,但是许多人还是历经多次磨难,有时就是得不出结果。
因此,我认为因为每个人所要克隆的片断不同,引物不同等,因此对不同的人来说还是有他自己的特殊性,我的以下经历说明:做实验时各人的情况不同,做不出时还是要好好动一下脑子。
记得我开始我的RT-PCR时,按常规方法,提取总RNA后,首先用自己设计的下游引物进行逆转录,不断改变反应条件,进行了N次均没有结果。
后来考虑到本人的克隆的PCR的片断位于我们实验另一位同学克隆的片断当中,而该同学已经用RT-PCR克隆出她的片断(尽管她用这些RT-PCR产物做模版再进行PCR时也没办法重复出她的产物),因此,我先用她的引物和条件扩增出她的片断,然后用她的RT-PCR产物作模板(有点改进,逆转录反应换用了9mers随机引物),用我的引进物进行一般PCR,终于得到我的产物,测序结果完全正确。
尽管我的这个经历别人很人遇到,但足可以说明实验可以有自己的模式,书本的知识和别人的经验很重要,但有时也不定要受到书本框框和别人经验的限制请问:1 引物的特异退火温度怎样设定?可以根据gc 和at含量算出吗?可以用引物报告单上的Tm值吗?2 PCR时20微升体系中cDNA应加多少比较合适?MgCl2应加多少?各个成分的量有无确定标准?3 PCR结果跑电泳,actin有,但跑不出目的条带,有几种原因?与cDNA的量少有关吗?Mg离子太多是否会抑制Taqase的活性?一般来说引物报告单伤得是对的,也可以自己算,实际上重要的各条引物一致,剩下的可以摸的.20中是指体积还是量?只要不明显改变体系的离子强度,加1,2ul都可以的.mg要调的,但我总觉得没有书里讲的那么玄乎,我都是常年不变的.如果内参照有,目的没有,至少证明不是"美丽惹"的祸.原因书里应该都说了.在所有RNA实验中,最关键的因素是分离得到全长的RNA。
而实验失败的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染。
由于RNA酶广泛存在而稳定,一般反应不需要辅助因子。
因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解,而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果,所以RNA的制备与分析操作难度极大。
在实验中,一方面要严格控制外源性RNA酶的污染;另一方面要最大限度地抑制内源性的RNA酶。
RNA酶可耐受多种处理而不被灭活,如煮沸、高压灭菌等。
外源性的RNA酶存在于操作人员的手汗、唾液等,也可存在于灰尘中。
在其它分子生物学实验中使用的RNA酶也会造成污染。
这些外源性的RNA酶可污染器械、玻璃制品、塑料制品、电泳槽、研究人员的手及各种试剂。
而各种组织和细胞中则含有大量内源性的RNA 酶。
一、防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。
2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。
3. 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10min,然后用0.1% DEPC水冲洗,晾干。
4. 配制的溶液应尽可能的用0.1% DEPC,在37℃处理12hr以上。
然后用高压灭菌除去残留的DEPC。
不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。
5. 操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。
6. 设置RNA操作专用实验室,所有器械等应为专用。
二、常用的RNA酶抑制剂1. 焦磷酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。
它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
2. 异硫氰酸胍:目前被认为是最有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。
它既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用。
3. 氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。
4. RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。
RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。
5. 其它:SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用。
mRNA的分离与纯化真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。
绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。
这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U)琼脂糖亲合层析分离纯化mRNA 的理论基础就在于此。
mRNA的分离方法较多,其中以寡聚(dT)-纤维素柱层析法最为有效,已成为常规方法。
此法利用mRNA 3’末端含有Poly(A+)的特点,在RNA流经寡聚(dT)纤维素柱时,在高盐缓冲液的作用下,mRNA被特异地结合在柱上,当逐渐降低盐的浓度时或在低盐溶液和蒸馏水的情况下,mRNA被洗脱,经过两次寡聚(dT)纤维柱后,即可得到较高纯度的mRNA。
寡聚(dT)纤维素柱纯化mRNA一、试剂准备1.3M醋酸钠(pH 5.2)2.0.1M NaOH3.1×上样缓冲液:20mM Tris-HCl(pH 7.6);0.5M NaCl;1M EDTA(pH 8.0);0.1%SLS(十二烷基氨酸钠。
配制时可先配制Tris-HCl(pH 7.6)、NaCl、EDTA(pH 8.0)的母液,经高压消毒后按各成分确切含量,经混合后再高压消毒,冷却至65℃时,加入经65℃温育(30min)的10%SLS至终浓度为0.1%。
4.洗脱缓冲液:10mM Tris-HCl(pH 7.6);1mM EDTA(pH 8.0);0.05% SDS5.无水乙醇、70%乙醇6.DEPC二、操作步骤1.将0.5-1.0g寡聚(dT)-纤维悬浮于0.1M的NaOH溶液中。