GST pulldown手册—翻译
GST pulldown实验技术

➢ 3、以预实验确定的最佳IPTG浓度、时间和温度诱导表达靶蛋 白(IPTG 0.5mM,28℃,200 rpm培养10~16小时);
➢ 4、诱导适当时间后,4℃,5000 rpm/min离心10min后弃上清 (如需要该步沉淀能保存在-80℃);
GST pull-downFra bibliotek示意图Western Blot
GST pull-down应用
Western Blot
用于验证两个已知蛋白的相互作用 筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白
GST pull-down流程
GST-A融合蛋白的制备 • B蛋白的制备 • 体外蛋白的结合 • Western blot检测
Western Blot
➢ 1.1 GST-A融合蛋白的表达
➢ 5、重悬沉淀:按10ml菌液沉淀用1ml PBS重悬,并加入PMSF; ➢ 6、冰上超声沉淀重悬液:5S 间隔5S 至悬液透明(一般可容性
蛋白:10ml菌液沉淀用1ml PBS重悬液超声6~9min可透明); ➢ 7、12000 rpm/min,4℃离心10min,将上清转移至新的离心管,
B蛋白的来源: ➢ 1.1 (His)-B融合蛋白的原核表达与纯化 ➢ 1.2 (HA/Myc/Flag)-B融合蛋白的真核表达
Western Blot
➢ 1.1.1 (His)-B融合蛋白的原核表达
➢ 1、活化冻存菌种His和His-B:按1: 50比例将表达蛋白的冻存菌 液加入5ml LB(Amp+),37℃,200 rpm培养过夜;
Western Blot
1. GST-A融合蛋白的制备
GST pull-down实验技术

Western Blot
1. GST-A融合蛋白的制备
1.1 GST-A融合蛋白的表达 1.2 GST-A融合蛋白的纯化
Western Blot
Western Blot
1.1 GST-A融合蛋白的表达
1、活化冻存菌种GST和GST-A:按1: 50比例将表达蛋白的冻存 菌液加入5ml LB(Amp+),37℃,200 rpm培养过夜;
GST pull-down 示意图
Western Blot
GST pull-down应用
Western Blot
用于验证两个已知蛋白的相互作用 筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白
GST pull-down流程
GST-A融合蛋白的制备 • B蛋白的制备 • 体外蛋白的结合 • Western blot检测
3、在管中加入预冷的200微升PBS(沿壁加入,小心勿剧烈,以 免打断珠子与蛋白的连接),轻晃悬浮珠子,将Sepharose洗涤 一次, 3000 rpm/min,4℃离心3min,弃上清;
4、重复步骤3三次(最后一次以小枪头吸净珠子表面液体,吸 净但不吸走珠子),即获得结合有GST-A融合蛋白的Sepharose;
1.2 GST-A融合蛋白的纯化
Western Blot
5、如果用于检测,在Sepharose 加入15~20微升1×蛋白电泳上 样缓冲液,于沸水中煮5~10min。
6、12000 rpm/min离心5min,取上清做SDS-PAGE和WB检测。
2. B蛋白的制备
Western Blot
Western Blot
1.1 GST-A融合蛋白的表达
5、重悬沉淀:按10ml菌液沉淀用1ml PBS重悬,并加入PMSF; 6、冰上超声沉淀重悬液:5S 间隔5S 至悬液透明(一般可容性
gst pull down技术原理

gst pull down技术原理嘿,咱今儿个就来讲讲 gst pull down 技术原理哈!你说这技术啊,就像是一场奇妙的魔术表演呢!gst pull down 技术,简单来说,就是让两个蛋白能够亲密接触,然后把它们一块儿给“揪”出来。
这就好比是在一个大派对里,我们要找到特定的两个人,然后把他们拉到一起。
想象一下哈,细胞里面有那么多的蛋白,就像派对上的一群人,熙熙攘攘的。
而我们的 gst 标签呢,就像是一个特别的标记,能让我们一眼就认出我们要找的那个蛋白。
这可太重要啦,不然在那么多蛋白里找,不就像大海捞针嘛!然后呢,我们把带有 gst 标签的蛋白和其他蛋白放在一起,让它们相互作用。
这就好像是给他们创造机会,让他们互相了解,看看能不能擦出点火花来。
一旦它们结合在一起了,嘿,我们就可以通过特定的方法,把它们一块儿给拉下来。
这感觉就像是用一个神奇的网,把那两个有缘分的蛋白给网住啦!你说这技术妙不妙?它能帮我们搞清楚蛋白之间的关系,就像搞清楚人与人之间的关系一样重要呢!通过 gst pull down 技术,我们能知道哪些蛋白是好朋友,哪些蛋白可能有点小矛盾。
这对于研究细胞的各种活动可太关键啦!比如说,在细胞的信号传导过程中,不同的蛋白要相互配合才能完成任务。
要是没有 gst pull down 技术,我们怎么能知道哪些蛋白是一起干活的好搭档呢?而且啊,这技术还能帮我们发现新的蛋白相互作用呢!就像是在派对上发现了以前不认识的有趣的人,然后发现原来他们和我们的好朋友也有联系。
你看,gst pull down 技术不就是这样一个神奇又实用的工具嘛!它能让我们深入了解细胞这个神秘世界里的各种关系和秘密。
总之啊,gst pull down 技术真的是科研领域里的一把利器,它让我们对蛋白世界的探索变得更加容易和有趣啦!它就像一盏明灯,照亮我们在细胞世界里前行的道路,让我们能不断发现新的惊喜和奥秘呢!你说这技术是不是超厉害的呀!。
GSTPullDown(以Rac1活性检测为例)(原创)

GSTPullDown(以Rac1活性检测为例)(原创)1、⽤GST-PAK-CRIB融合蛋⽩载体转化BL21感受态细菌,37℃培养过夜,12-16h之后出现菌
落;
2、挑取阳性单克隆,接种到含有抗⽣素的LB液体培养基中,在37℃恒温摇床中剧烈振摇⾄菌
液OD600值在0.4-0.6之间时,加⼊IPTG 0.1mmol/L诱导,继续孵育3-4h,离⼼,收集菌体(可
以-70℃保存备⽤);
3、加⼊2 ml细菌裂解液(含蛋⽩酶抑制剂),重新悬浮菌体,冰上振荡15 min;
4、12000 rpm离⼼10 min,取上清;
5、向上清中加⼊100 µl的含有⾕胱⽢肽的琼脂糖磁珠(⽤之前需⽤washing buffer洗涤3
次),4℃旋转混合⾄少30min,再⽤washing buffer洗3次;
6、从培养的细胞中提取全蛋⽩,取蛋⽩200µg,与上述琼脂糖磁珠混合,⽤washing buffer 补
⾜300 µl,4℃旋转孵育⾄少1 h,⽤于沉淀细胞中的⽬的蛋⽩,(注:此步反应的温度和孵育时
间均需根据不同的的蛋⽩进⾏优化,孵育的最后阶段进⾏略微的涡旋震荡能够去掉⾮特异性结
合的蛋⽩,降低背景);
7、⼩⼼移去上清,⽤400 µl washing buffer 洗3-5次,第⼀次可室温孵育5 min,并在孵育过程
中偶尔进⾏混匀;
8、向琼脂糖磁珠中加⼊30 µl 2×SDS-PAGE加样缓冲液,沸⽔浴5 min,直接加样进⾏SDS-
PAGE蛋⽩电泳;
9、以下实验操作同westernblotting(见前天实验流程)。
GST-pulldown操作说明

GST Pulldown(研究GST-CDC-48与Rpn11相互作用)1、取两只1.5mL EP管,标记为实验组和对照组,并向每支管中分别加入25μL GST-beeds 20%乙醇充分混合液。
2、加入Wash buffer 1 洗涤两次,每次500μL,5000rpm,4℃离心30s去除上清液。
Wash buffer 配比如下:Tris-HCL 50 mMNaCL 100mMTriton X 100 0.1%DTT 1mMpH 7.5注意:操作轻柔,避免beeds的损失;超纯水清洗注射器避免交叉污染。
3、分别在对照组和实验组中加入等物质量的GST(25kD)蛋白和GST-cdc48(130kD)蛋白,其中GST蛋白为20μg,GST-cdc48蛋白为20*(130/25)=104μg。
4、使用Buffer 1 调整上述反应体积为300μL,4℃慢摇孵育1h。
5、5000rpm,4℃离心30s去除上清液。
6、对照组和实验组分别加入5倍摩尔数的Rpn11蛋白,Rpn11蛋白的量为20*(51/25)*5=200μg。
7、使用Buffer 1 调整上述反应体积为300μL,4℃慢摇孵育1h。
8、5000rpm,4℃离心30s去除上清液。
9、使用Wash buffer 1 洗涤三次,每次500μL,操作如前。
换用500μL Wash buffer 2再洗涤一次,彻底吸除buffer。
Wash buffer 2 配比如下:Tris-HCL 50 mMNaCL 100mMDTT 1mMpH 7.510、再往对照组和实验组分别加入30μL 2×SDS PAGE loading buffer,混匀,沸水煮5min。
12000rpm离心三分钟,取10μL点样跑小孔聚丙烯酰胺凝胶。
聚丙烯酰胺凝胶泳道图如下。
11、其中Input上样量为GST-pulldown 的1/5.。
(完整word版)GST_pull_down试验方法(自己总结),推荐文档

12.GST蛋白的表达和纯化12.1 GST蛋白的表达(1) 将表达GST融合蛋白的质粒转入BL21大肠杆菌菌株中。
(2) 挑单克隆于3ml LA(LB+Amp)培养基中,37℃摇菌过夜,获得种子液。
(3) 将种子液稀释于50ml2XYTA(YTG+Amp)培养基中,使起始OD600为0.1。
(4) 28℃,220rpm摇菌培养2小时。
(5) 加入50μl 100mM IPTG,16~27℃摇菌培养1~8小时。
(6) 收菌,将菌液倒入大离心管,2管/50ml菌液,4℃ 5krpmx5min离心,弃上清。
(7) 加入10ml PBS/管,重悬细胞,5krpm离心5min,弃上清。
(8) 加入2ml PBS/管,重悬细胞。
转移至5ml离心管。
(9) 超声破壁破壁前,在细胞悬液中加20μl 10mg/ml PMSF,80μl蛋白酶抑制剂(100x)。
破壁参数:Frequency:100~200w 60s, pause 20s run 40s,5cycles破至菌体由浑浊变为澄清。
加100μl 20% TritonX-100,冰上放置30min。
(10) 将裂解液分入1.5ml离心管中,4℃离心12krpm×10min,取上清。
(11) 吸取少量上清,加入蛋白电泳上样缓冲液,在沸水中煮3min。
离心(12krpm,1min),取上清作SDS-PAGE电泳,检测表达情况。
12.2 准备50%GST Sepharose 4Bslurry(1) 将原75%Glutathione Sepharose 4B的slurry弹至混匀。
(2) 取677μl原液/管,3krpm离心5min,弃上清。
(3) 加500μl PBS,颠倒混匀,3krpm离心5min,弃上清。
反复5次。
(4) 加500μl PBS,颠倒混匀,配成50%Glutathione Sepharose 4B备用。
12.3 GST融合蛋白的纯化(1) 在新鲜制备的细胞裂解液上清中加入20μl 50%Glutathione Sepharose 4B,4℃,摇床上摇,反应30min~60min。
GST-pull-down操作流程

GST pull down操作流程一、表达GST融合蛋白1、6mlLB+单克隆+Amp,37℃,250rmp培养过夜2、5ml菌液加入400ml LB+Amp的1L锥形瓶中中,37℃,250rmp,2h,OD600≈0.6-0.83、取1ml菌液保存于Ep管中,sample14、大瓶加入400ul(1:1000)IPTG,4h5、取1ml菌液保存于Ep管中,sample26、诱导后的收菌,6000rpm×8min 4度,去尽上清,置于冰上7、加入20ml,-20度预冷的PBS+1%Triton-100+PMSF(1:100 PMSF)(先加15ml,再加5ml)吹打混匀8、(1)压力破碎仪破碎(2)冰上超声破碎,开2秒,停9秒,总20分钟。
至裂解液清澈9、14000rpm,20分钟,4℃离心,分离上清,取50ul sample310、取GST-Beads(400ul)到柱子管中,用预冷的PBS洗去其中的Triton-x-100,加上清(?),4度,旋转孵育1h如果是小量纯化,就是50ul的GST-beads放EP管,加细菌裂解液1ml11、收集50ul的样品sample4,可与sample3作对照,检测beads的结合效率12、用-20度预冷1%的Triton-x-100 in PBS洗3次,PBS洗3次1000转 2min,弃上清,留beads等体积的液体(小量PBS是1ml洗,多次)13、用大枪头剪去少许(beads:PBS=1:1),吸出10ul跑样,检测纯化情况14、sample1,2,3,4加sample buffer,100度 10min,12000rmp 30sSDS-PAGE 每样10ul15、4度保存GST-pro-beads(如果不做pull-down,可以洗脱)sample1:诱导前sample2:诱导后sample3:上清sample4:纯化后上清二、裂解细胞1、收集细胞(胰酶处理好,防止细胞破碎)1000rmp,5min,RT2、PBS 洗,离心1000rmp,5min3、加400ul IP lysis buffer(0.1%Triton)1:100加cocktail冰上孵育 30minIP Lysis buffer 500ml:HEPES 5.95gNacl 4.38gEGTA 0.38gPH=7.44、针头过5次5、冰上,旋转孵育,15min6、14000rpm,20min,4度,留上清,去沉淀三、表达纯化HIS-tagged protein1、500ml LB 高温灭菌2、接种单克隆到5ml LB,加抗生素,37度,250转,过夜3、把菌液转移到500mlLB,加抗生素中,37度,250转,OD~0.7(看到云雾)4、加入IPTG 250-500ul,诱导4小时(温度摸索)5、6000转,4度,15min,弃上清,用10ml lysis buffer 溶解沉淀6、加入50ul PMSF,超声破碎,(300w,工作5,间歇10,全程10min)7、12000转,4度,20min8、柱中加入1ml ni-beads,上清转移至柱中,4度,旋转孵育1小时,(每种蛋白需要自行摸索相应的最佳条件,为防止蛋白降解,以下均在冰上)小量就是50ul的NI-beads放EP管,加细菌裂解液1ml9、用Wash buffer 1 10ml每次,洗2次(小量是1ml洗)用Wash buffer 2 5ml每次,洗2次(小量是1ml洗)收集洗脱液电泳检测每种wash buffer 的最佳用量(防止将蛋白洗脱)10、用Elution buffer洗脱蛋白2-4次,每次0.5ml,取1ul洗脱液在NC膜上,丽春红染色,颜色越深,蛋白量越大,取蛋白量最大的做Pull downLysis buffer50mM NaH2PO4,PH8.0300mM Nacl10mMImidazoleWash buffer 150mM NaH2PO4,PH8.0300mM Nacl20mM ImidazoleWash buffer 250mM NaH2PO4,PH8.0300mM Nacl40mM ImidazoleElution buffer50mM NaH2PO4,PH8.0300mM Nacl300mM ImidazoleElution buffer 40ml50mM NaH2PO4 0.312g300mM Nacl 0.701g300mM Imidazole 0.8171g三、pull down实验1、his-pro加入到已纯化的GST-Pro的EP管中,用PBS补足液体到600ul左右,以便蛋白之间能充分结合!2、4℃旋转结合,4h3、PBS+0.1%Triton-100洗3次,PBS洗3次,1000转 2min,1:1留。
GST pull-down

百泰派克生物科技
GST pull-down
Pull down(拉下实验)是一种体外亲和纯化蛋白的技术,Pull down技术将已知蛋白(诱饵蛋白)利用亲和试剂标签(如谷胱甘肽-S-转移酶、组氨酸六肽、生物素)进行标记,再特异性识别混合体系中的配体蛋白(靶蛋白),以达到富集、分离、纯化某种配体蛋白质的目的,是在体外研究蛋白与蛋白相互作用的有力工具。
GST pull-down实验,也称GST融合蛋白沉降技术,是利用谷胱甘肽S-转移酶(GST)标记诱饵蛋白进行的Pull down实验。
GST pull-down可用于证实已知的蛋白或肽的相互作用,也可以用来挖掘未知的蛋白或肽的相互作用。
百泰派克生物科技提供高效快速的GST pull-down 蛋白互作分析服务,可用于鉴定两种已知的兴趣蛋白质可能存在的直接相互作用,以及寻找可能与目标蛋白存在相互作用关系的未知蛋白,欢迎免费咨询。
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普洛麦格公司GST pull-down 试剂盒手册-步骤部分翻译
第一部分:TNT® T7 Quick 转录/翻译反应制备捕获蛋白技术
1.V8871共4个试剂中取3个试剂,从-70℃保存环境中拿出解冻,RQ1 DNase第一次
使用后可放置在-20℃保存。
→TNT® T7 Quick Master Mix 手温溶解或在冰上溶解,其他样品室温溶解或冰上放置。
2.按下表加样,获得捕获蛋白,30℃孵育60-90min。
Components Reaction Volume(不用35S蛋氨酸)TNT® T7 Quick Master Mix 40ul
Methionine,1mM 1ul
Plasmid DNA template(s)0.5ug/ml 2ul
Nuclease-Free Water to 50ul
第二部分:GST融合蛋白固定到Magne GST TM颗粒上的相关技术
实验组:1ml GST-融合蛋白细菌培养物
对照组:1ml GST蛋白细菌培养物→→低表达蛋白需要加大样品量
当然,Magne GST TM颗粒本身也可以作为阴性对照。
◆细菌裂解步骤
1.从1ml左右菌液中收获细菌→加入Magne GST TM细胞裂解液之前先冻融细菌可增加某
些菌种的裂解效果,如BL 21菌种,方法可选用:-20℃冷冻15-20min或干冰冷冻5-10min。
2.室温中,在每个菌液中加入Magne GST TM细胞裂解液200ul,吹打并重悬浮菌液。
3.加入RQ1无RNA酶DNA酶2ul。
(可省略)→该步骤可增加GST-融合蛋白纯度并降
低蛋白粘度,若加入5ul可明显降低粘度,但是也可以省略该步骤。
4.25℃放置在平面摇床上,缓慢振荡,孵育20-30min。
◆Magne GST TM颗粒平衡步骤
1. 上下颠倒Magne GST TM颗粒使其重悬浮成均匀液体。
2. 取1.5mlEP管,加入已充分重悬浮的Magne GST TM颗粒20ul →在诱捕捕获蛋白时
不要让Magne GST TM颗粒放置过久,会因沉淀而降低结合效率。
3. 将Magne GST TM颗粒放在磁力架上的试管处,一般几秒钟之间会发生磁性捕获。
4. 小心倾倒EP管,弃掉上清液。
5. 将Magne GST TM颗粒从磁力架上移开,加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液250ul,
用移液枪吹打数次使其重悬浮,或上下颠倒数次。
6. 重复3—5步骤2次,一共需要洗涤3次。
◆结合步骤
1.完成以上步骤,加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液100ul并上下颠倒重悬浮颗粒。
注:加入1%BSA(牛血清白蛋白)可减少非特异性结合及可能的潜在背景。
使用5%浓度的IGEPL CA-630也能达到同样效果。
BSA的使用量应按照特定的目的蛋白进行优化。
2.在Magne GST TM颗粒重悬浮液中加入200ul细胞溶菌产物→细菌裂解步骤中获得。
3.在旋转平台上室温孵育30min(稳定温和混合)。
◆洗涤步骤
1.将以上EP管放在磁力架上,使Magne GST TM颗粒被磁力捕获,移除上清液→上清液
可用于凝胶分析。
2.加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液250ul至上一步骤的EP管中并轻轻上下颠倒数
次,使其混合均匀,室温孵育5min。
3.再次用磁力架行磁力捕获,小心移除上清液→洗涤液可用于凝胶分析。
4.加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液250ul至上一步骤的EP管中并轻轻上下颠倒数
次,使其混合均匀→该步骤不需要室温孵育5min。
5.第3次使用磁力架行磁力捕获,小心移除上清液→洗涤液可用于凝胶分析。
6.重复4-5步骤,一共进行3次洗涤。
7.最后加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液20ul→→可选:取3-5ul该液体,加入1×SDS
上样缓冲液20ul,煮沸洗涤蛋白5min,进行SDS-PAGE分析。
8.推荐使用5ul以上体积的GST-融合蛋白或GST对照蛋白进行pulldown系统分析。
第三部分:捕获、洗涤并分析目的捕获蛋白技术
◆捕获步骤
1.每5ul第二部分获取的GST-融合蛋白(或GST对照蛋白)加入20ul第一部分通过TNT®
T7 Quick 转录/翻译反应制备的产物。
2.加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液175ul,使其变成200ul反应体系。
→Magne GST TM
结合/洗涤缓冲液是一个中性PBS缓冲液。
3.在室温条件下放置与旋转平台上孵育1h,使其轻轻混合。
→该步骤有助于消除非特异
性黏附蛋白和降低背景。
4.将EP管放入磁力架中,行磁力捕获,小心移除上清液→上清液可保存待进一步分析。
◆洗涤步骤
(最佳洗涤体积及次数可能需要按情况进行优化)
1.加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液400ul于上一部分的EP管中,上下轻轻颠倒混匀。
2.室温孵育5min,并在此期间间断上下颠倒EP管数次。
3.将EP管放入磁力架中,行磁力捕获,小心移除上清液,并保留上清液有待进一步分析。
→该步骤获取的上清液很重要,务必保留,留作结果分析。
4.加入Magne GST TM结合/洗涤缓冲液400ul,上下轻轻颠倒混匀→该步骤后不需要孵育
5min。
5.将EP管放入磁力架中,行磁力捕获,小心移除上清液→上清液可保存待进一步分析。
6.重复4至5步骤3次,一共进行5次洗涤。
→每次移除的上清液都可保存待进一步分
析。
◆洗脱步骤
1.在上一部分EP管中沉淀中加入1×SDS上样缓冲液20ul。
2.室温孵育5min,使其混合均匀。
3.将EP管放入磁力架中,行磁力捕获,小心吸取洗脱液,保存,并行进一步分析。
→诱
饵蛋白和捕获蛋白复合体就在该洗脱液中,务必保留,留作结果分析。
◆分析步骤
以上各步骤获取的上清液及重要的洗脱液,加入适当蛋白质上样缓冲液后,煮沸5min,行WB检测。
目的蛋白的显示可以用考马斯亮蓝染色或者用相关抗体检测。