琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳
1.原理
琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。
其分析原理与其他支持物电泳最主要区别是：它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。
琼脂糖凝胶具备网络结构，物质分子通过时会受阻力，大分子物质在汹涌时受的阻力小，因此在凝胶电泳中，磁铁颗粒的拆分不仅依赖于天量电荷的性质和数量，而且还依赖于分子大小，这就大大提高了辨别能力。
但由于其孔径相当大，对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道，现广为应用于核酸的研究中。
蛋白质和核酸会根据ph不同带有不同电荷，在电场中受力大小不同，因此跑的速度不同，根据这个原理可将其分开。
电泳缓冲液的ph在6~9之间，离子强度0.02~0.05为最适。
常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。
琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的dna片段，其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低，但它制备容易，分离范围广。
普通琼脂糖凝胶分离dna的范围为0.2-20kb，利用脉冲电泳，可分离高达10^7bp的dna片段。
dna分子在琼脂糖凝胶中泳动时存有电荷效应和分子筛效应。
dna分子在低于等电点的ph溶液中带负电荷，在电场中向负极移动。
由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质，相同数量的双链dna几乎具备等量的净电荷，因此它们能够以同样的速率向负极方向移动。
2操作方式流程
准备干净的配胶板和电泳槽
琼脂糖凝胶电泳：水平电泳
注意dna酶污染的仪器可能会降解dna，造成条带信号弱、模糊甚至缺失的现象。
(1)电泳方法
1
一般的核酸检测只需要琼脂糖凝胶电泳就可以；如果需要分辨率高的电泳，特别是只有几个bp的差别应该选择聚丙烯酰胺凝胶电泳；用普通电泳不合适的巨大dna链应该使用脉冲凝胶电泳。
注意巨大的dna链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。
(2)凝胶浓度
对于琼脂糖凝胶电泳，浓度通常在0.5～2%之间，低浓度的用以展开大片段核酸的电泳，高浓度的用以展开大片段分析。
低浓度胶坚硬，小心操作方式和采用质量不好的琼脂糖就是解决办法。
特别注意高浓度的胶可能将并使分子大小相似的dna拎难于辨别，导致条带缺位现象。
(3)缓冲液
常用的缓冲液有tae和tbe，而tbe比tae有着更好的缓冲能力。
电泳时使用新制的
缓冲液可以明显提高电泳效果。
注意电泳缓冲液多次使用后，离子强度降低，ph值上升，缓冲性能下降，可能使dna电泳产生条带模糊和不规则的dna带迁移的现象。
三羟甲基氨基甲烷（tris(hydroxymethyl)aminomethane，通常缩写为tris）就是一
种有机化合物，其分子式为(hoch2)3cnh2。
tris被广为应用于生物化学和分子生物学实验中的缓冲液的制取。
比如，在生物化学实验中常用的tae和tbe缓冲液（用作核酸的熔化）都须要使用tris。
(4)电压和温度
电泳时电压不应该超过20v/cm，电泳温度应该低于30℃，对于巨大的dna电泳，温
度应该低于15℃。
注意如果电泳时电压和温度过高，可能导致出现条带模糊和不规则的
dna带迁移的现象。
特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象
(5)dna样品的纯度和状态
注意样品中含盐量太高和含杂质蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。
乙醇沉
淀可以去除多余的盐，用酚可以去除蛋白。
注意变性的dna样品可能导致条带模糊和缺失，也可能出现不规则的dna条带迁移。
在上样前不要对dna样品加热，用20mmnacl缓冲液
稀释可以防止dna变性。
(6)dna的上样
2
正确的dna上样量是条带清晰的保证。
注意太多的dna上样量可能导致dna带型模糊，而太小的dna上样量则导致带信号弱甚至缺失。
(7)marker的选择
dna电泳一定必须采用dnamarker或未知大小的也已对照dna去估算dna片段大小。
marker必须挑选在目标片段大小附近ladder成株的，这样对目标片段大小的估算才比较
精确。
须要特别注意的就是marker的电泳同样也必须合乎dna电泳的操作方式标准。
如
果挑选λdna/hindiii或者λdna/ecori的酶乌marker，须要预先65℃冷却5min，冰上
加热后采用。
从而防止hindiii或ecori酶乌导致的粘性接点引致的片段相连接圆形或条
带信号强等现象。
(8)凝胶的染色和观察
实验室常用的核酸染色剂就是溴化乙锭（eb），染色效果不好，操作方式便利，但是
稳定性高，具备毒性。
特别注意观测凝胶时应根据染料相同采用最合适的光源和唤起波长，如果唤起波长不对，条带则难于观测，发生条带模糊不清的现象。
3废旧编辑
(1)dna片段的胶回收方法
电泳洗清法
低熔点琼脂糖凝胶电泳挖块法冻融回收法玻璃奶回收法柱回收法(2)胶回收注意事项
a.将电泳槽用ddh2o反反复复冲洗整洁，放入新鲜酿制的杀菌电泳缓冲液；
3
b.根据点样量制取最合适厚度的琼脂糖凝胶板；
c.切胶时尽可能包住C99mgdna片段的凝胶；
d.要尽量减少dna在紫外下的照射时间以减少对dna的损伤；
e.熔胶要完全。
loadingbuffer
loadingbuffer的中文名字叫上样缓冲液，6*的缓冲液中可以显示两条带，前面的紫兰色的条带是溴酚蓝，在0.6%、1%、1.4%和2%琼脂糖凝胶电泳中，溴酚兰的迁移率分别与1kb、0.6kb、0.2kb和0.15kb的双链线性dna片段大致相同；后面的兰色条带是二甲苯青，它在1%和1.4%琼脂糖中电泳时，其迁移速率分别与2kb和1.6kb的双链线性dna 大致相似。
而对于page胶他们的迁移速率也分别不同。
1.主要用途
loadingbuffer的功能主要存有两个：
第一，里边的指示剂溴酚蓝和二甲苯青ff起到指示的作用，显示电泳的进程，以便我们适时终止电泳；
第二，里边的成分甘油可以加强样品密度，并使样品密度大于tae，从而下陷至点样孔中，避免样品飞出点样孔。
另外，有的buffer是加有sds的，一般都会写明。
sds主要是促使聚合酶变性，因为没有除尽的聚合酶会结合在dna双链上影响它的迁移速率。
细胞裂解后的裂解液，加loading100℃加热，也是为了中止酶促反应，防止提取的蛋白质降解。
2.制备方法
loadingbuffer通常布局：(1)6×loadi ngbuffer:30mmedta36%(v/v)glycerol
0.05%(w/v)xylenecyanolff0.05%(w/v)bromophenolblue主要用于dna电泳
4
(2)10×loadingbuffer:30mmedta50%(v/v)glycerol
0.25%(w/v)xylenecyanolff0.25%(w/v)bromophenolblue主要用作rna电泳
注：（1）10×loadingbuffer中仅有色素溴酚蓝（bromophenolblue)一种染料（浓度0.05%）；
（2）6×loadingbuffer中不含色素溴酚蓝（bromophenolblue)、二甲苯青蓝ff （xylenecyanolff)两种染料（浓度都就是0.05%）
在琼脂糖凝胶（0.5%~1.4%）中溴酚蓝（bromophenolblue）约与300bp的双链线状dna的迁移速度相同，二甲苯腈蓝ff则与4kbp的双链线状dna的迁移速度相等。
6×loadingbuffer就是用以上样的；10×loadingbuffer就是stopbuffer，就是暂停酶促发展反应的，如果一定会用10×loadingbuffer的上样当然也可以，唯一必须特别注意的就是：10×loadingbuffer中多了一样sds，它可以并使酶类如taq酶变性，以pcr 产物为基准，在电泳泳道上可以产生一片云气，如果电泳走的距离长，和多出一条拎没什么区别（大概1000bp左右）。
(3)5×sds-pageloadingbuffer配制方法组份浓度：
250mmtris-hcl（ph6.8）10%（w/v）sds0.5%（w/v）bpb50%（v/v）甘油5%（w/v）β-巯基乙醇酿制量：5ml酿制方法：
5。
琼脂糖凝胶电泳原理
琼脂糖凝胶电泳原理简介琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和检测生物大分子的方法。
它基于琼脂糖凝胶作为分离介质，通过电场作用使分子在凝胶中按照大小和形态的差异进行迁移，达到分离的目的。
该原理广泛应用于核酸和蛋白质的分离与分析领域。
原理琼脂糖凝胶电泳原理如下： 1. 凝胶制备：首先将琼脂糖与缓冲液混合并加热溶解，随后冷却形成凝胶。
凝胶的浓度可以根据需要调整，一般较低浓度的琼脂糖凝胶用于分离大分子，较高浓度的琼脂糖凝胶用于分离小分子。
2. 样品加载：将待分离的样品加入凝胶孔中。
琼脂糖凝胶是一种多孔的基质，具有类似于过滤器的功能。
样品中的分子会被凝胶网状结构所限制，在电场作用下沿凝胶中的微小通道向电极处迁移。
3. 电泳过程：连接正负极电源，通过电场使得带电分子根据大小和形态的差异在凝胶中迁移。
电泳时间的长短与迁移距离成正比，某些情况下可以通过控制电场强度或者时间来调节分离效果。
4. 可视化检测：根据需要，可以利用染色剂或标记物对凝胶中的分子进行可视化检测。
例如，核酸可以通过乙溴化氢染色可视化，蛋白质可以通过银染法或共价标记物进行检测。
琼脂糖凝胶电泳的原理主要涉及到两个方面：凝胶基质和电场迁移。
凝胶基质琼脂糖凝胶是一种由聚糖构成的多孔基质，其主要成分是琼脂糖和缓冲液。
琼脂糖是一种天然的含羟基多糖，具有较好的凝胶性质。
琼脂糖的浓度和凝胶构建方式可以根据需要来设计，以实现对待分离分子大小和分辨率的调控。
电场迁移琼脂糖凝胶电泳是利用电场作用使带电分子在凝胶中迁移。
电泳过程中，凝胶中的聚糖构成了一套通道网络，负载着电场的分布，变为一种微电泳介质。
带电分子受到电场力的影响，在凝胶中的通道中迁移。
根据分子的大小和形态的差异，迁移速率不同，从而实现分离效果。
较小的分子会迁移得更远，而较大的分子会受到较大的凝胶阻力，迁移距离较短。
应用琼脂糖凝胶电泳在生物学领域的应用非常广泛。
主要包括以下几个方面： - 核酸分离与分析：琼脂糖凝胶电泳可以用于核酸的分离与分析。
琼脂糖凝胶电泳-完整整理
基因组分析
分子诊断
用于分离和鉴定基因组DNA片段，如限制 性片段长度多态性分析、基因突变检测等 。
用于检测和鉴定基因突变、病原微生物DNA 等，如聚合酶链式反应（PCR）产物电泳、 单链构象多态性分析等。
基因克隆
测序
用于分离和纯化目的基模板，如末端测 序、全基因组测序等。
达差异。
04 琼脂糖凝胶电泳实验问题 与解决
常见问题
条带弥散
由于点样量过多或电压过高，导致条带弥散。
条带过宽
由于凝胶浓度不合适或样品浓度过高，导致 条带过宽。
条带拖尾
样品中蛋白质降解或核酸酶污染，导致条带 拖尾。
条带不亮
由于染料浓度过低或曝光时间过短，导致条 带不亮。
问题分析
条带弥散
可能是由于点样量过多或电压过高， 导致DNA在凝胶中扩散。
琼脂糖凝胶电泳-完 整整理
目录
CONTENTS
• 琼脂糖凝胶电泳介绍 • 琼脂糖凝胶电泳实验操作 • 琼脂糖凝胶电泳结果分析 • 琼脂糖凝胶电泳实验问题与解决 •凝胶电泳的定义
01
琼脂糖凝胶电泳是指在琼脂糖凝 胶中进行的电泳技术，主要用于 分离、鉴定和纯化DNA片段。
浓度比较
通过条带亮度，比较不同 样品中目标DNA片段的浓 度。
纯度评估
根据条带的亮度与背景噪 音的比例，评估DNA片段 的纯度。
结果应用
基因克隆
01
通过琼脂糖凝胶电泳检测目的基因是否被正确克隆到载体中。
突变分析
02
利用电泳结果判断是否存在基因突变或点突变。
基因表达分析
03
通过比较不同组织或细胞系中目的基因的表达水平，分析其表
01
条带分析
琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶的特点
（一）优点 1.因不含硫酸根和羧基，几乎消除了琼脂的电渗 2.对蛋白质吸附极微，故无拖尾现象。 3.凝胶结构均匀，孔径较大，可用来分离酶的复合 物、核酸、病毒 等大分子物质。 4.透明度较好，可直接或干燥成薄膜后进行染色。 5.不吸收紫外光，可直接利用紫外光吸收法作定量 测定 6.有热可逆性
（三）结 构 特 征
CM 甘油三脂 胆固醇 蛋白质 带电量（Q） pH8.6为例 颗粒大小（mm） 密度 电泳速度 形态 多 多 少 少 大 低 慢 规则 不规则 VLDL LDL HDL 少 少 多 多 小 高 快
pH 8.6 > pI ，各种脂蛋白均带负电，电 泳时由负极到正极；VLDL为圆形，受阻力 小，LDL形态不规则，受阻力大，所以VLDL 跑在前。
2. 按超速离心法分 乳糜微粒(chylomicron,CM) ( < 0.96 ) 极低密度脂蛋白 (0.961.006) (very low density lipoprotein, VLDL) 中间密度脂蛋白 (1.0061.019) (intermediate density lipoprotein, IDL) 低密度脂蛋白LDL(1.0191.063) (low density lipoprotein, LDL) 高密度脂蛋白HDL(1.0631.21) (high density lipoprotein, HDL)
脂 蛋 白
血清脂蛋白(lipoprotein)的组成 ApoA ApoB 蛋白质：即载脂蛋白 ApoC ApoD ApoE
甘油三酯 （TG） 磷脂 （PL） 游离胆固醇 （FC） 胆固醇酯 1. 按电泳法分 乳糜微粒（chylomicron,CM） -脂蛋白 （-位） 前-脂蛋白（2-位）） -脂蛋白 （1-位）
deae琼脂糖凝胶 电泳
deae琼脂糖凝胶电泳
DEAE琼脂糖凝胶电泳是一种常用的离子交换层析技术，用于分离和纯化带有不同电荷的生物大分子（如蛋白质和核酸）。
下面是该技术的基本原理和步骤：
1. DEAE琼脂糖：DEAE（二乙氨乙基）琼脂糖是一种具有阳离子交换性质的树脂。
它可以与带有负电荷的生物大分子发生静电相互作用。
2. 样品加载：首先将待分离的样品加载到经过预处理的DEAE琼脂糖凝胶柱中。
样品中带有负电荷的生物大分子会被DEAE树脂吸附。
3. 洗脱：通过以逐渐增加浓度或pH值的缓冲溶液，洗脱在DEAE琼脂糖上吸附的目标生物大分子。
这样，不同带电性质的生物大分子就可以被分离开来。
4. 收集分馏：根据样品中目标生物大分子的特点和需求，收集分离出的纯化目标物。
DEAE琼脂糖凝胶电泳是一种常见且有效的离子交换技术，广泛应用于生物化学、分子生物学和生物医学研究中。
它可以实
现对生物大分子的分离和纯化，有助于深入了解生物分子的结构和功能。
琼脂凝胶电泳和琼脂糖凝胶电泳
琼脂凝胶电泳和琼脂糖凝胶电泳1. 什么是琼脂凝胶电泳？大家好，今天我们来聊聊一个科学小话题——琼脂凝胶电泳和琼脂糖凝胶电泳。
听起来有点复杂，其实它就像是科学界的“选美比赛”，不过选的不是小姐姐，而是分子哦！这两个小家伙都是用于分离和分析生物分子的方法，主要在基因和蛋白质的研究中大显身手。
琼脂凝胶电泳是用琼脂凝胶来分离生物大分子，比如DNA、RNA和蛋白质；而琼脂糖凝胶电泳则是用琼脂糖，专门用于DNA的分析。
听起来是不是有点像“同门兄弟”的感觉呢？1.1 琼脂凝胶电泳的工作原理琼脂凝胶电泳的原理其实很简单。
想象一下，一条河流，河水流动，河里的石头和沙子各自沉浮。
琼脂凝胶就像这条河，而DNA分子就像在河里漂浮的小石头。
电流流过时，带电的分子在电场的作用下开始移动，移动的速度和距离就取决于它们的大小和形状。
小分子跑得快，大分子跑得慢，最终在凝胶里形成不同的位置，像极了学校运动会上那场激烈的接力赛。
1.2 琼脂糖凝胶电泳的应用而琼脂糖凝胶电泳主要是针对DNA的。
因为DNA分子比较大，所以我们需要用琼脂糖来制造凝胶。
这个过程可不简单，首先得把琼脂糖溶解，然后倒入模具里，等它凝固。
接着，咱们就可以把样品放进去，通电后就能观察到DNA分子的分离了。
这就像在举行一场大聚会，大家按身高、体重分组，最后排成一条长龙，看看谁的身形最抢眼！2. 准备工作与步骤当然，做电泳可不是随便搞搞就完事的。
咱们得先做好准备工作。
首先要准备好琼脂和琼脂糖，根据实验需求调配浓度，这就像做饭调味一样，浓度太高，分子跑不动；浓度太低，又不够清晰，真是个“难兄难弟”。
然后，得把样品和缓冲液混合，搅拌均匀，这一步就像调色板，颜色调和得越好，最后的效果才越惊艳！2.1 凝胶的制备接下来，咱们需要制作凝胶。
把琼脂和琼脂糖加热至完全溶解，然后迅速倒入模具，待其凝固。
这个过程就像等待美食出炉一样，既期待又有点小紧张。
凝固后，再在凝胶上打个小洞，放入样品，别忘了在样品的旁边加上分子量标准，这样最后才能评比，看看谁最出色。
琼脂糖凝胶电泳详解
一、简介琼脂糖凝胶电泳是以琼脂糖凝胶作为支持介质、利用核酸分子在电场中时的电荷效应和琼脂凝胶的分子筛效应，达到分离核酸混合物的一种电泳技术。
1、琼脂糖的分子筛效应1）琼脂糖（Agarose）来源于海洋红藻细胞壁，是一种大分子线性聚合物，基本结构是由D-半乳糖和3,6-anhydro-α-L-半乳糖通过β-1,4糖苷键结合而成的双糖单位在α-1,3糖苷键的连接下形成的一个长链。
琼脂糖具有亲水性，并几乎完全不存在带电基团，对敏感的大分子极少引起变性和吸附，是理想的惰性载体。
常用作电泳、层析等技术中的半固体支持物，用于生物大分子或小分子物质的分离和分析。
琼脂糖在水中一般加热到90℃以上溶解，温度下降到40℃左右形成良好的半固体状凝胶。
琼脂糖加热溶解后分子呈随机线团状分布，当温度降低时链间糖分子上的羟基通过氢键作用相连接，形成直径从50nm-200nm不等的孔径结构，孔径的大小由凝胶浓度控制。
琼脂糖凝胶中孔径的大小，影响了通过的核酸分子的大小以及通过的速度。
通常来说，琼脂糖凝胶的浓度越高，孔径越小，能够通过的核酸分子越小，迁移速度也越慢。
DNA片段越小，所需的胶浓度越大；而DNA 片段越长，所需的胶浓度则越小。
选择合适的胶浓度才能更好的分离片段。
2）琼脂的质量评价琼脂糖通常通过其凝胶强度和电内渗情况判断质量好坏。
强度越高，凝胶性能越好。
质量较好的琼脂糖强度通常在1200g/cm2以上，硫酸根含量在0.2%以下，电内渗在0.13以下。
琼脂糖是从琼脂中分离而来的。
琼脂由琼脂糖和琼脂果胶组成的，琼脂果胶是由许多更小的分子组成的异质混合物，和琼脂糖结构相似，但带硫酸根和羧基组分，凝胶能力差。
在琼脂糖制备过程中需要把琼脂果胶尽量去除，否则琼脂糖有可能存在极微量硫酸根和丙酮酸取代电离基团，附着到琼脂糖的多糖基质上，造成电内渗（EEO）。
电内渗会导致缓冲液中产生正电荷反向离子，它们向负极移动，从而造成与DNA反方向迁移的液流，使DNA的分离效果变差。
琼脂糖凝胶电泳的基本过程
琼脂糖凝胶电泳的基本过程
琼脂糖凝胶电泳是一种常用的蛋白质分离与检测方法，其基本过程如下：
1. 准备琼脂糖凝胶：将适量的琼脂糖加入缓冲液中，加热溶解后冷却至适合凝胶形成的温度，通常为室温或4℃。
2. 注射样品：将待检测的样品（通常是蛋白质混合物）与一定量的加载缓冲液混合，并用微量注射器将样品缓慢地注射到琼脂糖凝胶的加载孔中。
3. 开始电泳：将装有琼脂糖凝胶的电泳槽中注入足够的电泳缓冲液，确保琼脂糖凝胶完全被液体覆盖。
然后将电泳槽连接到电源上，设定适当的电压和时间，开始电泳。
4. 蛋白质分离：在电场的作用下，由于蛋白质的不同特性（如分子大小、电荷等），蛋白质会在琼脂糖凝胶中以不同的速度移动。
较小的蛋白质会更快地移动，较大的蛋白质会移动得更慢。
5. 染色和可视化：电泳结束后，可以通过染色等方法对琼脂糖凝胶中的蛋白质进行标记，常见的染色方法有银染色、草酸染色、共蛋白染色等。
然后使用适当的设备（如紫外线透射仪）对染色后的凝胶进行图像记录和分析。
6. 分析结果：根据不同蛋白质在凝胶中的迁移距离和密度，可以对样品中的蛋
白质进行定性和定量分析，从而了解样品中蛋白质的组成和相对含量。
琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳一、琼脂糖凝胶的特点天然琼脂是一种多糖，主要由琼脂糖（约80%）和琼脂凝集素组成。
琼脂糖是一种中性物质，由半乳糖及其衍生物组成，不带电荷，而琼脂凝胶是一种含有硫酸盐和羧基的强酸性多糖。
因为这些基团是带电的，所以它们在电场的作用下能产生强烈的电渗作用。
此外，硫酸盐能与一些蛋清物质相互作用，影响电泳速度和分离效果。
因此，目前平板电泳常用琼脂糖作为电泳载体，其优点如下。
1.琼脂糖凝胶电泳操作简单，电泳速度快，样品无需预先处理即可电泳。
2.琼脂糖凝胶结构均匀，含水量大（约占98％~99％），近似自由电泳，样品扩散较自由电流，对样品吸附极微，因此电泳图谱清晰，分辨率高，重复性好。
3.琼脂糖透明，无紫外线吸收。
电泳过程和结果可直接用紫外灯检测和定量测定。
4.电泳后区带易染色，样品极易洗脱，便于定量测定。
制成干膜可长期保存。
目前，琼脂糖常用作分离蛋白质和同工酶的电泳载体。
琼脂糖电泳和免疫化学的结合已经发展成为免疫电泳技术，它可以识别其他方法无法识别的复杂系统。
由于超微技术的建立，可以检测到0.1ug蛋白质。
琼脂糖凝胶电泳也常用于分离、鉴定核酸，如dna鉴定，dna限制性内切核酸酶图谱制作等。
由于这种方法操作方便，设备简单，需样品量少，分辨能力高，已成为基因工程研究中常用实验方法之一。
二、dna的琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳分离核酸主要基于它们的相对分子质量和分子构型，并且与凝胶浓度密切相关。
1.核酸分子大小与琼脂糖浓度的关系①dna分子的大小在凝胶中，dna片段迁移距离（迁移率）与碱基对的对数成反比，因此通过已知大小的标准物移动的距离与未知片段的移动距离时行比较，便可测出未知片段的大小。
但是当dna分子大小超过20kb时，普通琼脂糖凝胶就很难将它们分开。
此时电泳的迁移率不再依赖于分子大小，因此，就用琼脂糖凝胶电泳分离dna时，分子大小不宜超过此值。
2.琼脂糖浓度如下表所示。
不同大小的DNA需要用不同浓度的琼脂糖凝胶分离。
琼脂糖凝胶电泳
一、实验原理琼脂糖凝胶电泳是分离和纯化DNA 片段的常用技术。
把DNA样品加入到一块包含电解质的多孔支持介质（琼脂糖凝胶）的样品孔中，并置于静电场上。
由于DNA分子的双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基，因此在电场中向正极移动。
在一定的电场强度下，DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应。
具有不同的相对分子质量的DNA片段泳动速度不一样，因而可依据DNA分子的大小来使其分离。
凝胶电泳不仅可分离不同分子质量的DNA，也可以分离相对分子质量相同，而构型不同的DNA分子。
在电泳过程中可以通过示踪染料或相对分子质量标准参照物和样品一起进行电泳而得到检测。
相对分子质量标准参照物相对可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
在凝胶中加入少量溴化乙锭(ethidium bromide, EB)，其分子可插入DNA的碱基之间，形成一种络合物，在254～365nm 波长紫外光照射下，呈桔红色荧光，因此也可对分离的DNA进行检测。
一般琼脂糖凝胶电泳适用于大小在0.2kb～50kb范围内的DNA片段。
本实验介绍琼脂糖凝胶的制备以及琼脂糖凝胶电泳在DNA片段分离中的应用方法。
二、仪器及试剂1.仪器及耗材：水平电泳槽、电泳仪、凝胶成像分析系统、微波炉、微量移液器、透明胶带、点样板或parafilm、100 ml或250 ml锥形瓶、量筒、吸头等。
2.试剂及配制：50×TAE缓冲液的配制：2 mol/L Tris-乙酸，0.05 mol/L EDTA（pH 8.0）配制1000 mlTris 242 g冰乙酸 57.1 ml0.5 mol/L EDTA 100 ml加入600 ml去离子水后搅拌溶解，将溶液定容至1 L后。
高温高压灭菌，室温保存。
1×TAE缓冲液的配制：称量20 ml的50×TAE缓冲液，再加入980 ml的去离子水。
溴化乙啶贮存液：10 mg/ml 溴化乙啶配制：100 ml称取1 g溴化乙啶，置于100 ml烧杯中，加入80 ml去离子水后搅拌溶解。
琼脂糖凝胶电泳
分辨率与凝胶浓度的关系？ 3、DNA荧光染料的发光原理？
DNA分子在碱性环境中带负电荷，在外加电场作用下向正极泳动。DNA分 子在琼脂糖凝胶中泳动时，有电荷效应与分子筛效应。不同DNA，其分 子量大小及构型不同，电泳时的泳动率就不同，从而分出不同的区带。 琼脂糖凝胶电泳法分离DNA，主要是利用分子筛效应，迁移速度与分子 量的对数值成反比关系。
溴化乙锭(EB)为扁平状分子，在紫外光照射下发射荧光。EB可与DNA分 子形成EB-DNA复合物，其发射的荧光强度较游离状态EB发射的荧光强度 大10倍以上，且荧光强度与DNA的含量成正比。用肉眼观察，可检测到5 ng以上的DNA。
（一）制胶
1、称取1.5g琼脂糖加入盛有100 ml 0.5TAE电泳缓冲液的250 ml三角瓶中， 摇匀，在微波炉上加热至琼脂糖完全溶 解。冷却到约60℃后，加入10 l的EB， 并摇匀。
2、将溶解的琼脂糖（约50℃）倒入制胶模 具中，直至厚度为4-6 mm，插入适当的 梳子，在室温下冷却凝固。
五、实验用具
移液器 吸管头若干 加样板 量筒100 ml1 三角瓶500 ml1
六、试剂
琼脂糖 50TAE电泳缓冲液 6 载样缓冲液 （loading buffer） 溴化乙锭(EB) DNA分子量标准（DNA marker）：Marker III
七、实验步骤
（一）制胶（1% agarose gel） （二）点样 （三）电泳 （四）观察
实验三、琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳是分子克隆的核心技术之一，用于分 离、鉴定和纯化DNA片段。凝胶中DNA的位置可以用 低浓度的荧光插入染料染色直接观察。