质粒DNA的提取及其琼脂糖凝胶电泳实验报告
质粒dna提取及电泳检测实验报告

质粒dna提取及电泳检测实验报告质粒DNA提取及电泳检测实验报告引言质粒DNA提取及电泳检测是生物学实验中常用的技术手段,用于分离和检测质粒DNA样本中的目标序列。
本实验旨在通过提取质粒DNA并进行电泳检测,验证提取的质粒DNA的纯度和完整性。
材料与方法1. 材料:- 质粒DNA样本- 细菌培养液- 细菌裂解液- 氯仿- 异丙醇- TE缓冲液- 琼脂糖- TAE缓冲液- DNA分子量标记物2. 方法:1. 质粒DNA提取:a. 将细菌培养液中含有质粒DNA的细菌进行离心,收集细菌沉淀。
b. 加入适量的细菌裂解液,裂解细菌细胞,释放质粒DNA。
c. 加入氯仿,离心分离上清液和有机相。
d. 收集上清液,加入异丙醇,使DNA沉淀。
e. 用TE缓冲液溶解DNA,得到质粒DNA提取物。
2. 质粒DNA电泳检测:a. 准备琼脂糖凝胶,加入TAE缓冲液,制备电泳槽。
b. 加载质粒DNA提取物和DNA分子量标记物于琼脂糖凝胶孔中。
c. 连接电源,进行电泳分离。
d. 观察电泳结果,记录质粒DNA的迁移情况和分子量。
结果与讨论通过质粒DNA提取及电泳检测实验,我们成功地提取到质粒DNA,并进行了电泳分离和检测。
在电泳结果中,我们观察到质粒DNA 片段在凝胶中呈现出带状分布,且迁移距离与分子量呈正相关关系。
根据电泳结果,我们可以初步判断质粒DNA的纯度和完整性。
如果质粒DNA在电泳过程中呈现单一的清晰带状分布,且没有明显的附加杂带,说明质粒DNA的纯度较高,没有明显的污染物。
而如果质粒DNA呈现模糊或多条不清晰的带状分布,可能存在其他DNA片段或杂质的污染。
通过电泳结果中质粒DNA片段的迁移距离,我们可以估算出质粒DNA的大致分子量。
通过与DNA分子量标记物的比对,我们可以初步判断质粒DNA的大小和可能的构造。
这对于进一步的研究和应用具有重要意义。
结论通过质粒DNA提取及电泳检测实验,我们成功地提取到质粒DNA,并验证了其纯度和完整性。
质粒DNA的提取及其琼脂糖凝胶电泳实验报告

一、实验名称:质粒DNA的提取与纯化,DNA琼脂糖凝胶电泳二、实验原理:1.质粒DNA的提取:质粒是一类存在于几乎所有细菌等微生物中染色体之外(细胞质中)呈游离状态的双链、闭环的DNA分子,能够自主复制和稳定遗传,以超螺旋形式存在,是最常用的基因克隆载体。
除质粒外,大肠杆菌中还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂质等物质,因此需要裂解细胞并除去蛋白质和染色体DNA等物质才能分离纯化出质粒DNA。
分离制备质粒DNA的方法很多,其中常用的方法有碱裂解法、煮沸法、SDS法、羟基磷灰石层析法等。
在实际操作中可以根据宿主菌株类型、质粒分子大小、碱基组成和结构等特点以及质粒DNA的用途进行选择。
本实验使用碱裂解法,即利用SolutionⅠ、Ⅱ、Ⅲ三种溶液分离提取质粒DNA.其原理如下。
(1)碱裂解法提取大肠杆菌质粒DNA的原理:碱裂解法提取质粒DNA是根据共价闭合环状质粒DNA和线性染色体DNA之间变性与复性的差异来分离质粒DNA,达到分离提纯质粒DNA的目的。
在pH值高达12.6的碱性条件下,线性的DNA因氢键断裂,双螺旋结构解开而变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的大部分氢键会被断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链相互缠绕,不会完全分离。
当加入pH4.8乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA复性,恢复其天然构象,以可溶状态存在于液相中;而线性的染色体DNA由于两条互补链彼此已完全分开、分子量大、结构复杂而相互缠绕形成不溶性网状结构。
与不稳定的大分子RNA、变形的蛋白质以及细菌碎片等一起沉淀而被除去。
进一步用酚、氯仿使蛋白质变性去除蛋白质杂质,然后用无水乙醇沉淀,即可获得纯化的质粒DNA。
SolutionⅠ、Ⅱ、Ⅲ三种溶液以及无水乙醇沉淀DNA的具体作用和原理如下。
(2)四种溶液作用及原理:①Solution I的作用:悬浮大肠杆菌菌体,增加溶液的粘度,维持渗透压及防止DNA受机械剪切力作用而降解。
质粒dna的提取及电泳检测实验报告

质粒dna的提取及电泳检测实验报告一、实验目的本实验的主要目的是学习质粒DNA的提取方法和电泳检测技术,并通过实验观察质粒DNA的提取情况和电泳检测结果。
二、实验原理质粒DNA的提取方法主要采用碱裂解法,通过将细胞裂解后,用酸性物质中和碱性物质,使DNA分离出来,最后用酒精沉淀纯化。
电泳检测是通过将DNA 样品置于琼脂糖凝胶上,加上电场后,DNA在凝胶中移动,通过电泳带电的原理,将DNA分离出来,从而观察DNA的大小和形状。
三、实验步骤1.准备样品:将含有目标DNA的菌落挑出放入EP管中,加入100μl TE缓冲液(10mmol/L Tris-HCl,1.0mmol/L EDTA,pH8.0),用微量移液器均匀混合。
2.制备裂解液:取10μl 0.25mol/L NaOH加入菌液中,轻轻摇匀,并立即加入200μl 1%SDS(十二烷基硫酸钠)液,翻转混匀。
3.裂解DNA:加入150μl NaOH-SDS溶液,翻转10次,置于80℃水浴中裂解细胞壁和细胞膜,20min后取出,加入150μl冷KAc/EDTA溶液(3mol/L KAc,pH5.2,0.5mol/L EDTA),翻转混匀,冰上静置5min。
4.离心沉淀:10000r/min离心10min,将上清液移至新的96孔板中,加入0.6倍体积的冰凉乙醇,反复翻转,置于-20℃上进行冷却,离心12000r/min 10min,去掉上清液,用95%乙醇洗涤沉淀物,最后用300μl TE缓冲液溶解沉淀DNA。
5.电泳检测:取相同浓度的DNA样品,加入琼脂糖,混合后加入电泳槽中,通电检测10min。
四、实验结果经过实验操作后,取出DNA样品,通过电泳检测,观察到有一条长度合适的条带,证明质粒DNA已经成功提取,并且检测结果与对照组差异不大,说明实验操作规范,结果可信。
五、实验结论本次实验通过碱裂解法成功提取了质粒DNA,并通过电泳检测技术检测到了DNA条带,证明提取质粒DNA的方法可行,同时也说明电泳检测是一种可靠的分子生物学技术,对于DNA分离和检测有着重要的应用价值。
质粒dna的提取实验报告思考题doc

质粒dna的提取实验报告思考题篇一:质粒DNA的提取及其琼脂糖凝胶电泳实验报告及思考题1.实验目的:(1)通过本次实验学习和掌握碱裂解法提取质粒;(2)通过本次实验学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术;2.实验材料及用品(1)实验仪器(apparatus):恒温培养箱(Constant temperature incubator)、恒温摇床(Constant temperature shaking table)、高速离心机(High speed centrifuge)、漩涡振荡器(Vortex mixer)、超净工作台(Bechtop)、高压灭菌锅(Autoclave)、微量加样器(Pipettes)、烧杯( beaker)、量筒(graduated cylinder)、玻璃棒(stir bar)、微波炉(microwave)、天平(Pan balance)、电泳梳子(comb)、电泳槽(electrophoresis tank)、电泳器(Electro-phoresis System)、紫外灯(Ultraviolet transilluminator )3)、材料与试剂(Reagents):①溶液I(Solution Ⅰ):50mmol/L 葡萄糖;25mmol/L 三羟基甲基氨基甲烷(Tris)Tris-HCl(pH8.0);10mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA) pH8.0溶液I可成批配制,每瓶约100ml,10磅高压蒸气灭菌15分钟,贮存于4℃。
②溶液Ⅱ(Solution Ⅱ):新鲜配制,等体积混合0.2mol/L NaOH(临用前用10mol/L贮存液现用现稀释);1% SDS (可用10%贮存液稀释配制)注意:SDS易产生气泡,不要剧烈搅拌。
③溶液III (Solution Ⅲ,100mL):加上后混匀会形成絮状沉淀60mL5mol/L KAc,11.5mL 冰醋酸,28.5mL H2O (该溶液钾离子浓度为3mol/L,醋酸根离子浓度为5mol/L)④TE液缓冲液:10 mmol/L Tris-HCl(pH8.0);1 mmol/L EDTA(pH8.0)⑤70% 乙醇;⑥平衡酚:氯仿 1:1:将量取25 ml Tris-HCl(pH8.0)平衡苯酚,加入24 ml 氯仿和 1 ml 异戊醇,充分混合后,移入棕色玻璃瓶中,4℃保存。
质粒DNA的分离提取与琼脂糖凝胶电泳

分子生物学实验报告实验名称:质粒DNA的分离提取与琼脂糖凝胶电泳班级:生工xx姓名:xxx学号:xxxxxxxxx质粒DNA的分离提取与琼脂糖凝胶电泳1引言质粒(plasmid)是存在于细菌染色体外的一个或多个能独立复制并稳定遗传的小型环状双链DNA分子,分子量一般在0.2~10kb范围内[1]。
质粒由于其特殊的性质,已广泛地用作基因工程中的DNA分子无性繁殖的运载体,同时它也是研究DNA结构与功能的较好模型。
我们将通过本次实验了解质粒的特性及其在分子生物学研究中的作用,并掌握质粒DNA分离纯化的原理,学习碱裂解法分离质粒DNA和琼脂糖凝胶电泳分离的方法,同时熟练掌握移液器及离心机的使用。
2材料和方法2.1 实验原理2.1.1质粒DNA分离纯化原理质粒具有复制和控制机构,能够在细胞质中独立自主地进行自身复制,并使子代细胞保持它们恒定的拷贝数。
从细胞生存来看,没有质粒存在,基本上不妨碍细胞的存活,因此质粒是寄生性的复制子。
根据质粒的这种特性,通常采用DNA体外重组技术和微生物转化等基因工程的技术和方法,使重组到质粒的某种基因(如干扰素基因)带进受体细胞(如具有一定特性的大肠杆菌细胞等)表达它的遗传性质,改变或修饰寄主细胞原有的代谢产物,或产生新的物质(如干扰素)。
pMD18-T Vector是一种高效克隆PCR产物 (TA Cloning) 的专用载体。
这种载体是由pUC18载体改建而成,在pUC18载体的多克隆位点处的Xba I和Sal I识别位点之间插入了EcoR V识别位点,用EcoR V进行酶切反应后,再在两侧的3’端添加“T”而成。
因大部分耐热性DNA聚合酶进行PCR反应时都有在PCR产物的3’末端添加一个“A”的特性,所以使用这两种制品可以大大提高PCR产物的连接、克隆效率[2]。
所有分离质粒DNA的方法都包括3个基本步骤:培养细菌使质粒扩增;收集和裂解细菌;分离和纯化质粒DNA。
目前应用于质体DNA的纯化或抽取的方法众多,例如碱溶裂法(alkaline lysis)、热裂解法(boiling method)、氯化铯(CsCl)纯化法,及市售柱层析套管法等。
实验一、质粒DNA的提取及检测实验报告

实验一、质粒DNA的提取及检测【实验目的】1、掌握碱裂解法提取质粒的原理和步骤2、掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术3、学会PCR操作的基本技术第一部分质粒DNA的提取一、实验原理:碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。
在pH值介于~这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。
当加入的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
二、仪器与试剂1、仪器恒温摇床、台式离心机2、试剂溶液I、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、无水乙醇、TE缓冲液、胰RNA酶、酚、氯仿三、实验步骤1、将2mL含相应抗生素(Amp:50μg/mL)的LB液体培养基加入到试管中,接入含pUC19质粒的大肠杆菌,37℃振荡培养过夜。
2、取培养物倒入微量离心管中,4000r/min离心2min。
3、吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。
4、将细菌沉淀悬浮于100μL溶液I中,充分混匀,室温放置10 min。
5、加200μL溶液Ⅱ(新鲜配制),盖紧管皿,混匀内容物,将离心管放冰上5min。
6、加入150μL溶液Ⅲ(冰上预冷),盖紧管口,颠倒数次使混匀。
冰上放置15min。
7、12000r/min,离心15min,将上清转至另一离心管中。
8、向上清中加入等体积酚:氯仿(1:1)(去蛋白),反复混匀,12000r/min,离心5min,将上清转移到另一离心管中。
9、向上清加入2倍体积无水乙醇,混匀后,室温放置5~10min。
12000r/min,离心5min。
质粒DNA的提取与琼脂糖凝胶电泳鉴定

实验题目质粒DNA的提取与琼脂糖凝胶电泳鉴定实验目的掌握质粒提取的原理与各种试剂的作用和琼脂糖凝胶电泳原理和操作实验原理质粒存在于细菌,线粒体等,独立于染色体之外,能够稳定遗传并自我复制,是一个双链环装DNA。
对数期大肠埃希菌含有质粒。
溶液一可使细菌充分重悬,溶液二使细菌裂解,释放质粒和基因组DNA.溶液三起到中和作用,使得质粒DNA迅速复性,而基因组DNA因为分子巨大,复性时间长。
离心后,质粒DNA留在上清液,而基因组DNA和细胞碎片沉淀在离心管。
琼脂糖凝胶电泳蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此泳动的速度不同,根据这个原理可将其分开。
电泳缓冲液的pH在6~9之间,离子强度0.02~0.05为最适。
常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。
用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长度为200bp至近50bp的DNA。
此外,直接用低浓度的核酸染料进行染色,可以确定DNA 在凝胶中的位置。
实验主要步骤质粒DNA提取1.取4ml细菌平均分两份加入离心管,以12000r/min离心1min,去除上清液2.加100ul用冰预冷溶液I,移液枪打散细菌沉淀使其成为悬浮液3.加入200ul溶液II,盖紧盖口,翻转五次,充分混合,避免振荡,置于冰上4.加入150ul冰预冷溶液III,盖紧盖口,翻转离心管5次,温和摇匀直到粘稠的细菌裂解物出现,放于冰上5min5.离心管以12000r/min离心5min6.取上清液加入等量的酚:氯仿混合液,轻轻摇匀,以12000r/min离心7min7.取上清液加入2倍体积100%乙醇沉淀DNA,轻轻摇匀,12000r/min离心5min,去除上清液,倒置在滤纸上干燥8.用1ml70%乙醇洗涤DNA沉淀,按照步骤7去除上清液,空气干燥10min9.用50ul无菌水溶解质粒DNA琼脂糖凝胶电泳:1.制胶。
将电泳缓冲液和琼脂糖在微波炉中熔化,混匀,冷却至55°℃,加入EB染料,倒入已封好的凝胶灌制平台上,插上样品梳。
质粒提取实验报告

1. 学习并掌握碱裂解法提取质粒DNA的原理和操作步骤。
2. 掌握DNA琼脂糖凝胶电泳技术,用于检测提取的质粒DNA。
3. 熟悉实验室安全操作规程,提高实验技能。
二、实验原理质粒是细菌细胞质中独立于染色体之外的小型环状双链DNA分子,具有自主复制能力。
在基因工程中,质粒常作为载体携带外源基因进行扩增和表达。
本实验采用碱裂解法提取质粒DNA,其原理是利用碱性环境使细菌细胞壁和细胞膜破裂,蛋白质变性,从而使质粒DNA与蛋白质等杂质分离。
随后,通过酚-氯仿抽提、乙醇沉淀等步骤纯化质粒DNA。
三、实验材料1. 大肠杆菌菌种(含有质粒)2. LB液体培养基3. 碱裂解液(含SDS、NaOH)4. 酚-氯仿5. 乙醇6. TE缓冲液7. 琼脂糖8. 电泳缓冲液9. DNA分子量标准10. 紫外线灯11. 凝胶电泳仪12. 离心机13. 微量移液器14. 玻璃棒1. 菌液制备:将含有质粒的大肠杆菌接种于LB液体培养基中,37℃培养过夜。
2. 离心:取1.5ml菌液,4000r/min离心5min,弃上清液。
3. 碱裂解:向沉淀中加入100μl碱裂解液,混匀,室温放置5min。
4. 酚-氯仿抽提:取1/3体积的酚-氯仿,加入上述裂解液,混匀,室温放置10min。
5. 离心:4000r/min离心10min,取上清液。
6. 乙醇沉淀:向上清液加入等体积的乙醇,混匀,-20℃放置1h。
7. 离心:8000r/min离心10min,弃上清液。
8. 溶解:用50μl TE缓冲液溶解沉淀,即为提取的质粒DNA。
9. DNA琼脂糖凝胶电泳:取5μl提取的质粒DNA,加入1μl DNA分子量标准,进行琼脂糖凝胶电泳。
10. 观察:打开紫外线灯,观察电泳结果。
五、实验结果1. 琼脂糖凝胶电泳结果显示,提取的质粒DNA在相应位置出现条带,与DNA分子量标准相符。
2. 提取的质粒DNA纯度较高,无杂质。
六、实验讨论1. 碱裂解法提取质粒DNA操作简便,效率较高,是实验室常用的提取方法。
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一、实验名称:质粒DNA的提取与纯化,DNA琼脂糖凝胶电泳
二、实验原理:
1.质粒DNA的提取:
质粒是一类存在于几乎所有细菌等微生物中染色体之外(细胞质中)呈游离状态的双链、闭环的DNA分子,能够自主复制和稳定遗传,以超螺旋形式存在,是最常用的基因克隆载体。
除质粒外,大肠杆菌中还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂质等物质,因此需要裂解细胞并除去蛋白质和染色体DNA等物质才能分离纯化出质粒DNA。
分离制备质粒DNA的方法很多,其中常用的方法有碱裂解法、煮沸法、SDS法、羟基磷灰石层析法等。
在实际操作中可以根据宿主菌株类型、质粒分子大小、碱基组成和结构等特点以及质粒DNA的用途进行选择。
本实验使用碱裂解法,即利用SolutionⅠ、Ⅱ、Ⅲ三种溶液分离提取质粒DNA.其原理如下。
(1)碱裂解法提取大肠杆菌质粒DNA的原理:
碱裂解法提取质粒DNA是根据共价闭合环状质粒DNA和线性染色体DNA之间变性与复性的差异来分离质粒DNA,达到分离提纯质粒DNA的目的。
在pH值高达12.6的碱性条件下,线性的DNA因氢键断裂,双螺旋结构解开而变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的大部分氢键会被断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链相互缠绕,不会完全分离。
当加入pH4.8乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA复性,恢复其天然构象,以可溶状态存在于液相中;而线性的染色体DNA由于两条互补链彼此已完全分开、分子量大、结构复杂而相互缠绕形成不溶性网状结构。
与不稳定的大分子RNA、变形的蛋白质以及细菌碎片等一起沉淀而被除去。
进一步用酚、氯仿使蛋白质变性去除蛋白质杂质,然后用无水乙醇沉淀,即可获得纯化的质粒DNA。
SolutionⅠ、Ⅱ、Ⅲ三种溶液以及无水乙醇沉淀DNA的具体作用和原理如下。
(2)四种溶液作用及原理:
①Solution I的作用:悬浮大肠杆菌菌体,增加溶液的粘度,维持渗透压及防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,在溶液I中加入EDTA,是要把大肠杆菌细胞中的二价金属离子都螯合掉,从而起到抑制DNA酶对DNA的降解和抑制微生物生长的作用。
另外也可保证溶菌酶活性。
②Solution II的作用:提供碱性条件,pH高达12.6,使大肠杆菌瞬间裂解,促使染色体DNA和质粒DNA变性。
所含离子型表面活性剂十二烷基酸钠(SDS)可使细胞膜、核膜发生破裂,充分溶解膜蛋白。
同时,磺酸基与蛋白质形成复合物而变形沉淀。
③Solution III的作用:为KAc-HAc缓冲液。
该溶液所含有的高浓度钾离子与溶液体系中的十二烷基磺酸钠发生反应形成十二烷基磺酸钾,从而将与之结合的绝大部分大肠杆菌蛋白质以及很长的基因组DNA一起沉淀,与质粒分离开来;另外溶液III所含有的醋酸中和溶液Ⅱ的强碱性,使pH降至中性,因为长时间的碱性条件会打断DNA;基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100kb大小的片段,就没有办法再被PDS共沉淀,这样就跟质粒DNA共存了。
而且在整个质粒DNA 的提取过程中,沉淀DNA时用无水乙醇及在高盐、低温条件下进行都是为了用化学或物理手段将基因组DNA分子和蛋白质发生变性、在体系中的溶解度降低,较充分的分离提纯出实验所需的质粒DNA
④无水乙醇的作用:是实验中最常用的沉淀DNA的方法。
DNA 溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合.一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的最终含量占67%左右。
乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。
也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。
2.质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳:
利用DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时的电荷效应和分子筛效应而达到分离、鉴定DNA的目的。
DNA分子在高于等电点的pH溶液环境中带负电荷,在电场中向正极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即DNA分子本身的构型和大小。
不同的分子因为所带电荷、分子质量或者构型的不同,在同一电泳系统中的泳动速度不同,因而可以彼此分离,并检测起分子量大小。
未切割的质粒DNA在其泳道上也许会出现几个条带,之所以这样是由于质粒DNA 在琼脂糖凝胶中的迁移距离是由其分子构象及其碱基对大小所决定的。
凝胶中DNA的位置可以用低浓度荧光染料如溴化乙锭(EB)染色直接观察到,甚至含量少至20 Pg的双链DNA在紫外激发下也能直接检测到,从而对DNA进行定性或定量的测定。
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