LTA基因单核苷酸多态位点与胃癌易感性的研究

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谷胱甘肽硫转移酶A1(GSTA1)基因多态性与前列腺癌和膀胱癌易感性的Meta分析

谷胱甘肽硫转移酶A1(GSTA1)基因多态性与前列腺癌和膀胱癌易感性的Meta分析

谷胱甘肽硫转移酶A1(GSTA1)基因多态性与前列腺癌和膀胱癌易感性的Meta分析谭于龙;钱辉军【摘要】Objective To explore the association between genetic polymorphism of glutathione S-transferase A1 ( GSTA1) and susceptibility to prostate cancer and bladder caner .Methods PubMed and other databases were searched ,identi-fied 9 relevant literatures of relationship between genetic polymorphism of glutathione S -transferase A1( GSTA1) and susceptibility to prostate cancer and bladder caner ,containing 1989 cases and 2246 controls.Meta-analysis was applied,and odds ratio(ORs) with 95%confidence intervals ( CIs) was used to evaluate the connection .Results There was no significant association between GSTA1 polymorphism and susceptibility to prostate cancer [( AA vsBB:OR=0.92,95%CI:0.68~1.23,P=0.56);( AB vsBB:OR=1.02,95%CI:0.86~1.21,P=0.83);( AA/AB vs BBOR=1.01,95%CI:0.86~1.17,P=0.93);( AA vs AB/BB:OR=0.91,95%CI:0.69~1.20,P=0.51)].No statistical significance existed between GSTA1 polymorphism and suscep-tibility to bladder cancer[(AA vsBB:OR=0.97,95%CI:0.71~1.33,P=0.85);(AB vsBB:OR=1.11,95%CI:0.93~1.31,P=0.25);(AA/AB vs BBOR=1.07,95%CI:0.92~1.25,P=0.37);(AA vs AB/BB:OR=0.87,95%CI:0.64~1.18,P=0.37)].Conclusion GSTA1 polymorphism is not the independent risk factor for prostate cancer and bladder cancer .%目的探讨谷胱甘肽硫转移酶A1(GSTA1)基因多态性与前列腺癌及膀胱癌易感性的关系.方法通过检索PubMed等数据库,获取GSTA1基因多态性与前列腺癌或膀胱癌的文献9篇,对1989例病例和2246例对照进行meta分析,以比值比(OR)和95%可信区间(CI)作为效应指标.结果各遗传模型的Meta分析显示:GSTA1基因多态性与前列腺癌易感性的相关性无统计学意义[(AA vsBB:OR=0.92,95%CI:0.68~1.23,P=0.56);(AB vsBB:OR=1.02,95%CI:0.86~1.21,P=0.83);(AA/AB vs BBOR=1.01,95%CI:0.86~1.17,P=0.93);(AA vsAB/BB:OR=0.91,95%CI:0.69~1.20,P=0.51)].各遗传模型的Meta分析显示:GSTA1基因多态性与膀胱癌易感性的相关性无统计学意义[(AA vsBB:OR=0.97,95%CI:0.71~1.33,P=0.85);(AB vsBB:OR=1.11,95%CI:0.93~1.31,P=0.25);(AA/AB vs BBOR=1.07,95%CI:0.92~1.25,P=0.37);(AA vsAB/BB:OR=0.87,95%CI:0.64~1.18,P=0.37)].结论单独的GSTA1基因多态性不是前列腺癌和膀胱癌的易感因素.【期刊名称】《实用癌症杂志》【年(卷),期】2016(031)003【总页数】4页(P417-420)【关键词】谷胱甘肽硫转移酶A1;基因多态性;前列腺癌;膀胱癌;肿瘤易感性【作者】谭于龙;钱辉军【作者单位】430060 武汉大学人民医院;430060 武汉大学人民医院【正文语种】中文【中图分类】R737前列腺癌和膀胱癌是泌尿生殖系统常见的肿瘤。

血清α-L-岩藻糖苷酶、甲胎蛋白、异常凝血酶原检测在原发性肝癌诊断中的价值研究

血清α-L-岩藻糖苷酶、甲胎蛋白、异常凝血酶原检测在原发性肝癌诊断中的价值研究

DOI:10.19368/ki.2096-1782.2024.02.005血清α- L-岩藻糖苷酶、甲胎蛋白、异常凝血酶原检测在原发性肝癌诊断中的价值研究尚应春邳州市中医院检验科,江苏邳州221300[摘要]目的分析在诊断原发性肝癌患者时采取血清α-L-岩藻糖苷酶(α-l-fucosidase, AFU)、甲胎蛋白(α-fetoprotein, AFP)、异常凝血酶原Ⅱ(Protein Induced by Vitamin K Absence or Antagonist-Ⅱ, PIVKA-Ⅱ)检测的价值。

方法选取2022年8月—2023年8月邳州市中医院收治的83例原发性肝癌患者以及肝硬化患者作为研究对象,依据疾病类型不同,分为良性组(肝硬化患者41例)、观察组(原发性肝癌患者42例),另选择83例健康人群作为对照组。

检测3组血清AFU、AFP、PIVKA-Ⅱ指标,分析上述指标水平,同时通过ROC曲线分析单项以及联合检测诊断原发性肝癌的价值。

结果两组患者AFU、AFP、PIVKA-Ⅱ指标均显著高于对照组,且观察组AFU、AFP、PIVKA-Ⅱ指标水平高于良性组,差异有统计学意义(P均<0.05)。

联合检测时,AUC提升至0.912,灵敏度提升至89.63%,特异度提升至99.10%,高于单独检测。

结论在诊断原发性肝癌患者中,采用联合AFU、AFP、PIVKA-Ⅱ检测方式,有较为理想的诊断价值,能够为完善治疗方案奠定基础,可以作为诊断原发性肝癌的有效方法之一。

[关键词]血清α-L-岩藻糖苷酶;甲胎蛋白;异常凝血酶原;原发性肝癌;诊断价值[中图分类号]R446 [文献标识码]A [文章编号]2096-1782(2024)01(b)-0005-04Value of Serum α-L-fucosidase, Alpha-fetoprotein and Abnormal Pro⁃thrombin Detection in the Diagnosis of Primary Liver CancerSHANG YingchunDepartment of Clinical Laboratory, Pizhou Hospital of Traditional Chinese Medicine, Pizhou, Jiangsu Province, 221300 China[Abstract] Objective To analyze the diagnostic value of serum α-L-fucosidase (AFU), α-fetoprotein (AFP), protein induced by vitamin K absence or antagonist-Ⅱ (PIVKA-Ⅱ) in patients with primary liver cancer. Methods A total of 83 patients with primary liver cancer and liver cirrhosis admitted to Pizhou Hospital of Traditional Chinese Medicine from August 2022 to August 2023 were selected as the study subjects. According to different disease types, they were divided into benign group (41 patients with liver cirrhosis), observation group (42 patients with primary liver cancer), and 83 healthy people as control group. Serum AFU, AFP and PIVKA-Ⅱ indexes were detected in the 3 groups, and the levels of the above indexes were analyzed, and the value of single and combined detection in the diagnosis of pri‐mary liver cancer was analyzed by ROC curve. Results AFU, AFP and PIVKA-Ⅱ indexes in two groups were signifi‐cantly higher than those in control group, and the levels of AFU, AFP and PIVKA-Ⅱ indexes in observation group were higher than those in benign group, and the differences were statistically significan (all P<0.05). In the combined detection, the area under curve (AUC) was increased to 0.912, the sensitivity was increased to 89.63%, and the speci‐ficity was increased to 99.10%, which was higher than that of the single detection. Conclusion In the diagnosis of pa‐tients with primary liver cancer, the combination of AFU, AFP and PIVKA-Ⅱ detection has ideal diagnostic value, which can lay a foundation for the improvement of treatment plan, and can be used as one of the effective methods for the diagnosis of primary liver cancer.[作者简介] 尚应春(1982-),男,本科,副主任技师,研究方向为临床生物化学检验。

TRIM_蛋白家族在胃癌中作用的研究进展

TRIM_蛋白家族在胃癌中作用的研究进展

TRIM蛋白家族在胃癌中作用的研究进展闫丹措1,陶嘉楠2,马秀雯1,王学红21 青海大学研究生院,西宁810016;2 青海大学附属医院消化内科摘要:胃癌是起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤,其发病率和死亡率在全球范围内均居前列。

但胃癌的发病机制尚不完全清楚。

因此,深入探索胃癌的发病机制具有重要意义。

三结构域(TRIM)蛋白家族是一类以结构特征命名的蛋白质家族,能够参与蛋白质泛素化修饰、调控抑癌基因p53表达、促进炎症信号通路激活等生物学过程。

研究发现,胃癌组织TRIM蛋白高表达,并且其表达强度与患者预后密切相关。

这一发现为胃癌的早期诊断和靶向治疗提供了新的线索。

TRIM蛋白家族在胃癌细胞的增殖、凋亡、侵袭和迁移等生物学过程中发挥重要作用。

TRIM59、TRIM28、TRIM11、TRIM65、TRIM38、TRIM62和TRIM10作为TRIM蛋白家族成员,在胃癌的分子诊断、预后评估和靶向治疗中具有广泛的应用前景。

关键词:胃癌;三结构域蛋白家族;蛋白质泛素化;p53;炎症信号通路doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2024.01.025中图分类号:R737.9 文献标志码:A 文章编号:1002-266X(2024)01-0102-05胃癌是起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤,其发病率和死亡率在全球范围内均居前列[1]。

然而,由于胃癌发病隐匿,临床症状轻微且缺乏特异性表现,早期确诊率较低,往往在晚期才被发现,导致治疗效果有限。

在我国胃癌患者5年生存率甚至不足50%[2]。

目前,胃癌仍以手术治疗为主,同时辅以化疗或靶向治疗。

然而,从当前胃癌的诊疗现状来看,缺乏早期诊断标志物,可供选择的化疗药物较少,并且靶向治疗也相对滞后。

因此,迫切需要寻找更可靠的诊断指标和更有效的治疗方案。

三结构域(TRIM)蛋白是一类以结构特征命名的蛋白质家族,在人体内广泛存在。

TRIM蛋白能够参与蛋白质泛素化、细胞信号传导、上皮间质转化(EMT)等生物学过程。

LTA804C/A基因变异与冠心病易感性、严重度和分子标志物之间的关系

LTA804C/A基因变异与冠心病易感性、严重度和分子标志物之间的关系
s c p i iiy,l so e ert nd m olc a a r or na y h a tdie s ( H D ) us e tb lt e in s v iy a e ulrm ke sofc o r c r s a e C . M e ho s S qu nc pe ii t d e e es cfc
prm e s— l m e a e c i e c i ( i r — y r s han r a ton PCR— po ・ SSP) w a s d f hede e ton o n yp s a d al ls i s u e ort t c i fge ot e n lee n LT A 4 o us 80 lc
i 4 CHD a i n s a d 8 c n r l. Die s d v s e n m b r ( n1 8 p te t n 1 o to s 1 s a e e s l u e s DVN) a d se o i e e iy i t g a S I b n t n t s v rt n e r l( S ) y c
摘 要 :目 的
关系 。方 法
研 究 淋 巴 毒 素一( TA)0 C A基 因 变 异 与 冠 心 病 ( HD 易 感 性 、 变 严 重 度 和 分 子 标 志 物 之 间 的 aL 84 / C ) 病
用 聚合 酶链 反 应一 列 特 异 性 扩 增 技 术 ( C — S 对 14例 C 序 P R S P) 8 HD 患 者 和 18例 对 照 组 (C 分 别 1 TI )
维普资讯
中 国心 血 管 杂 志 2 0 08年 2月 第 1 第 1 3卷 期
L A 8 4 / 基 因变 异 与 冠 心 病 易 感 性 、 重 度 和 T 0 CA 严

《2024年ELAVL1通过增强TL1AmRNA稳定性促进胃癌细胞增殖和迁移》范文

《2024年ELAVL1通过增强TL1AmRNA稳定性促进胃癌细胞增殖和迁移》范文

《ELAVL1通过增强TL1A mRNA稳定性促进胃癌细胞增殖和迁移》篇一摘要:本文探讨了ELAVL1基因通过增强TL1A mRNA稳定性的作用机制,对胃癌细胞增殖和迁移的影响。

研究结果显示,ELAVL1的表达与胃癌细胞的生长和转移密切相关,揭示了其潜在的治疗靶点。

本文采用分子生物学技术、细胞生物学实验等方法,详细探讨了ELAVL1的作用机制及其对胃癌发展的影响。

一、引言胃癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,其高发病率和死亡率已成为重要的公共卫生问题。

随着分子生物学的发展,基因在胃癌发生发展中的作用日益受到关注。

其中,ELAVL1(胚胎致死异常视蛋白样1)作为一种RNA结合蛋白,在多种癌症中发挥重要作用。

本研究旨在探讨ELAVL1通过增强TL1A mRNA稳定性对胃癌细胞增殖和迁移的影响。

二、材料与方法1. 材料:选用胃癌细胞系及正常胃黏膜细胞系,ELAVL1及TL1A的特异性引物、抗体等。

2. 方法:通过实时荧光定量PCR、Western blot等技术检测ELAVL1及TL1A的表达水平;采用RNA稳定性实验验证ELAVL1对TL1A mRNA稳定性的影响;利用细胞增殖和迁移实验探讨ELAVL1对胃癌细胞生物学行为的影响;并采用分子生物学技术,如荧光报告基因分析、siRNA干扰等,探究其作用机制。

三、实验结果1. ELAVL1与TL1A表达的关系:在胃癌细胞中,ELAVL1的表达与TL1A的表达呈正相关。

通过RNA稳定性实验发现,ELAVL1能够增强TL1A mRNA的稳定性。

2. ELAVL1对胃癌细胞增殖的影响:通过细胞增殖实验发现,ELAVL1的表达增加能够显著促进胃癌细胞的增殖。

3. ELAVL1对胃癌细胞迁移的影响:划痕实验和Transwell迁移实验显示,ELAVL1的高表达有助于胃癌细胞的迁移能力增强。

4. 作用机制探讨:通过荧光报告基因分析和siRNA干扰等技术,发现ELAVL1通过与TL1A mRNA结合,增强其稳定性,从而促进胃癌细胞的增殖和迁移。

宫颈癌相关基因单核苷酸多态性研究进展

宫颈癌相关基因单核苷酸多态性研究进展
摘要 # 被认为是决定人乳 !! " ! 宫颈癌是妇科常见的恶性肿瘤之一 $ 与机体遗传背景相关的基因多态性 % 头瘤病毒 & %;C 感 染 后 宫 颈 癌 发 病 与 否 及 预 后 的 重 要 因 素$ 单 核 苷 酸 多 态 性 = . / ( #B ( & ) ) " / (, & * . D’ B & % ’ 是指某基因中人群发生率超过 4A 的单碱基替换或缺失现象 $ 本 & # ) %# . ! ) % " ’ & + %B " ) / " * = & / ^ Y C $ 0 B 文就近年来与宫颈癌相关的单核苷酸多态性的研究进展综述如下 $ " 关键词 # ! 单核苷酸多态性 ( ! 宫颈癌 ( ! 易感性 ( ! 化疗敏感性 L ’ 0 ’ . / G ES ’ K ’ ( ) B ’ : H ) ;V 9 : ( ’W > G ( ’ ) H 9 * ’F ) ( B ) / E 9 0 B 0 9 :L ’ ( . H ’ *X ’ : ’) ;M ’ / K 9 G . (M . : G ’ / ?5 $ &% !C;9 8 D + 8
:;D8G 9 ,%C;< = $ & A O , $%G @8G Q > & A ’ , & " 1 #C 3 , & $* " L ) & /< & , 7 " 0 1 , # ) 1 , # $ ’%* , L 3 > $ & -6! E . ; 2
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务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)筛查及生物信息学分析

务川黑牛TLR2基因的单核苷酸多态性(SNP)筛查及生物信息学分析

啊邮才2021•3REPRODUCTION&BREEDING务川黑牛TLR2基因的单核昔酸多态性(SNP)筛查及生物信息学分析姜涛,秦雅晶,罗皎兰,米小梅,王进千,刘丽霞(西北民族大学生命科学与工程学院,兰州730030)中图分类号:S823.3文献标识码:A文章编号:1004-4264(2021)03-0014-06DOI:10.19305/ki.11-3009/S.2021.03.004摘要:采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对务川黑牛TLR2基因的单核昔酸多态性(SNP)位点进行筛查,并利用生物信息学软件预测各SNP位点对TLR2基因mRNA和蛋白质结构的影响。

结果表明,务川黑牛TLR2基因共有18个SNP位点,其中有9个位点是错义突变,分别导致相应的氨基酸发生改变。

生物信息学分析发现,T978A.G1010A和G"理A位点导致mRNA自由能升高,降低了mRNA二级结构稳定性,其余位点均导致自由能降低,增加了mRNA二级结构稳定性。

预测结果显示,务川黑牛TLR2基因各SNP位点的蛋白质二级结构和三级结构也相应发生了改变。

研究结果可为务川黑牛TLR2基因的深入研究提供基础资料,为务川黑牛抗病分子标记筛选提供理论基础。

关键词:务川黑牛;TLR2基因;SNP;生物信息学务川黑牛是贵州省务川县的地方肉用牛品种,其体收稿日期:2020-07-19基金项目:西北民族大学国家级大学生创新创业训练计划资助项目(202010742108)。

作者简介:姜涛(2000-),男,江苏连云港人,在读本科生,主要研究方向为生物化学和分子生物学。

通讯作者:刘丽霞(1983-),女,甘肃陇南人,博士,高级实验师,主要从事动物遗传育种研究工作。

质健壮,产肉性能好,具有性早熟、适应能力强、遗传性稳定、抗病力强等特点,是中国地方牛品种基因库的宝贵资源巾。

Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)是一种模式识别受体(pattern recognition receptor,PRR),它主要的功能是识别来源于微生物的具有保守结构的病A Review of Protein and Amino Acid Nutrition Research in Dairy CowsZHOU Qi1,JIN Yi-quan1,YANG Zhi-qiang1'2,ZHANG Zheng-zhen1,GONG Yi1,SU Yan-jing1'2,PU Xin-qian1,CHEN Wei1(1.Bright Farming Co.,Ltd,Shanghai200436;2.Shanghai Institute ofDairy Science,Shanghai200436)Abstract:Improving the utilization of feed nitrogen has always been the original intention of animal nutritionists dedicated to protein nutrition research・This article contains six aspects content of feed crude protein,non-protein nitrogen and rumen ammonia utilization,urea cycle,forage protein,restrictive amino acid balance,and milk urea nitrogen.And it provides an overview of the explorations and discoveries made by dairy nutritionists since the foundation of the Journal ofDairy Science in1917.It is expected to be a reference for dairy cattle practitioners and dairy nutritionist to further improve the utilization of nitrogen in feed.Key words:Protein;Amino acid;Utilization;Dairy cows;Review写514啊邮才2021•3REPRODUCTION&BREEDING表1务川黑牛TLR2引物序列位置引物序列S-3'退火温度(七)目的片段长度(bp)TLR2-1Fl:5'-GGACAATGCCACGTGCTT-3‘RUGCACTGATCTCAAGCTCCTCAAGd'56.8522TLR2-2F2:5,-TGAGGAGCTTGAGATCAGTG-3,R2:5,-ACTGTGTATCCTTGTGCTGG-3,57.9822TLR2-3F3:5'-CCTAGGTAATGTGGAGACG—3R3:5'-AAGGAGGCATCTGGTAGAG-3“56.8574TLR2-4F4:5'-CCAGCACAAGGATACACAGT-3R4:5,-CTTCATGTACCACAGTCCGT-357.9526TLR2-5F5:5,-TTCCTGTTGCTCCTGCTCAC-3,R5:5'-GACCACCACCAGACCAAGAC-3‘5&6599原体相关分子模式(pathogen-associated molecular patterns.PAMP)[21,在机体抗病原体感染中发挥重要作用回。

氯吡格雷抵抗的研究进展

氯吡格雷抵抗的研究进展

氯吡格雷抵抗的研究进展∗王金芳;王晏文【摘要】双联抗血小板治疗是急性冠脉综合征的基础治疗,联用氯吡格雷明显获益于单用阿司匹林治疗,且可预防支架内血栓形成。

然而,由于氯吡格雷抵抗许多患者仍发生缺血性事件,氯吡格雷的代谢变化较大,与基因型、伴随疾病及药物的相互作用均有关。

该文将对氯吡格雷抵抗的定义、具体的量化标准、临床结局及解决该问题的有效策略作一综述。

【期刊名称】《医药导报》【年(卷),期】2016(035)012【总页数】6页(P1327-1332)【关键词】氯吡格雷;血小板聚集;血小板反应性【作者】王金芳;王晏文【作者单位】长江航运总医院神经内科,武汉430010;长江航运总医院神经内科,武汉 430010【正文语种】中文【中图分类】R973.2;R543.3DOI 10.3870/j.issn.1004-0781.2016.12.010氯吡格雷联合阿司匹林的双联抗血小板治疗已是急性冠脉综合征的基础治疗,亦能有效预防经皮冠状动脉介入治疗(percutaneous coronary intervention,PCI)术后支架内血栓形成[1]。

但许多患者仍发生缺血性事件,究其原因,部分是由高血小板反应性(high residual platelet reactivity,HRPR)所致,HRPR可以定义为负荷量的抗血小板药物后仍表现为高血小板反应,亦被称为氯吡格雷抵抗[2]。

4%~30%使用氯吡格雷的患者可能会出现氯吡格雷抵抗,而氯吡格雷抵抗的患者中高达40%可能会再发血栓事件[3]。

笔者对氯吡格雷抵抗的定义、血小板功能测定、临床结局及解决方案的有效策略作一简要综述。

氯吡格雷是一个“前药”,是一种无活性的噻吩吡啶类抗血小板聚集药物,其在小肠的吸收受到ABCB1基因编码的质子泵P糖蛋白(P-glycoprotein,P-gp)调控(主要是SR-26334),吸收后在肝脏细胞色素P450(CYP)氧化酶系的作用下大部分(约85%)被转化成无活性的代谢产物排出体外,小部分(约15%)产生具有活性的代谢产物(主要为一种硫醇衍生物),该活性代谢产物不可逆的阻断血小板膜上的二磷酸腺苷(ADP)受体,阻断ADP对腺苷环化酶的抑制作用,促进环磷酸腺苷依赖的舒血管物质磷酸蛋白的磷酸化,从而抑制凝血因子Ⅰ与血小板糖蛋白GP Ⅱb/Ⅲa受体结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化,进而抑制血小板聚集[4]。

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LTA基因单核苷酸多态位点与胃癌易感性的研究何选秋;李粉霞;杨学习【摘要】目的通过对江西地区汉族胃癌患者和正常人群中淋巴毒素-α(LTA)基因单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs909253基因型的检测,探讨rs909253位点与胃癌患者易感性的关系.方法利用Sequenom-MassArray-IPLEX检测194例胃癌和250例对照LTA基因多态位点rs909253的基因分型,并利用非条件logistic回归对检测结果进行相关统计.结果 LTArs909253多态位点GG、GA、从三种基因型在胃癌的频率分别为26.4%、52.0%和21.6%,与对照组(35.6%、46.4%和18.0%)相比,统计学上无显著意义(x2=4.403,P=0.111);但胃癌组和正常组的等位基因频率分布差异临近显著,P值达0.059;对年龄和性别进行校正后,携带等位基因G的胃癌发病风险有所增加(OR=1.315,95%CI:1.001~1.728).结论江西汉族人群胃癌的遗传易感性可能与LTA基因rs909253位点的单核苷酸多态性有关,G等位基因为其发病的危险因素.【期刊名称】《分子诊断与治疗杂志》【年(卷),期】2011(003)004【总页数】4页(P241-244)【关键词】淋巴毒素-α;单核苷酸多态性;胃癌【作者】何选秋;李粉霞;杨学习【作者单位】南方医科大学第一临床医学院,广东,广州,510515;南方医科大学生物技术学院,广东,广州,510515,;南方医科大学生物技术学院,广东,广州,510515,【正文语种】中文胃癌是目前世界癌症发病率第四、死亡率第二的恶性肿瘤。

其病因复杂,遗传和环境因素在其发生发展过程中发挥重要作用[1]。

LTA又称TNF-β,是体内重要致炎细胞因子,该基因位于6p21.3,处于HLA-B和HLA-C之间,其第1内含子+252位点(rs909253)多态性可影响LTA基因的转录水平[2]。

目前,国外已有多篇关于LTA基因与胃癌易感性的研究[3~5],但相关研究结论不一致。

国内的研究主要在江苏、福建、宁夏等[6~8],尚无关于江西汉族人群的报道,本研究选取江西省南昌地区198例胃癌病人和250例正常对照者进行研究,探讨LTA基因rs909253多态性与胃癌易感性的关系。

1 资料和方法1.1 临床资料研究对象来自江西南昌大学第一附属医院,包括胃癌组和健康对照组,均为江西省南昌市及其周边区域的汉族居民,且相互间无血缘关系。

所有病例经病理学检查确诊,正常对照为同期健康体检人员,无肿瘤家族史。

胃癌组194例,其中男135例,女59例,平均年龄(58.47±16.21岁);健康对照组250例,其中男144例,女106例,平均年龄(54.72±12.63岁)。

样品为200µL外周全血,置于-70 ℃保存。

1.2 方法1.2.1 DNA的提取:用DNA提取试剂盒(天根生物技术有限公司)提取DNA,提取步骤参照说明书,提取好的DNA保存于-70 ℃备用。

1.2.2 引物的设计与合成:针对LTA+252位点(rs909253)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,用Sequenom MassArray Designer 3.0软件设计PCR扩增及延伸引物,其中特异性扩增引物序列为5'-ACGTTGGATGAGACA GAGAGAGACAGGAAG-3'和5'-ACGTTGGATGA CTCTCCATCTGTCAGTCTC-3';延伸引物序列为5'-GAAGGGAACAGAGAGGAA-3'。

引物由上海英骏生物公司合成。

1.2.3 基因分型:利用Sequenom MassArray质谱阵列技术(美国,Sequenom 公司)对LTA基因rs909253位点进行基因分型。

方法如下:①多重PCR反应扩增DNA样本;②虾碱性磷酸酶(shrimp alkaline phosphatase,SAP)反应,去除未反应完的dNTP;③单碱基延伸反应(single base extension,SBE),在SNP位点处延伸上带有荧光信号标记的单个碱基;④将所得反应产物用树脂脱盐后经自动点样仪点样于SpectroCHIP芯片上;⑤将点制后的芯片用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测,根据单碱基延伸的等位基因的分子质量差异进行基因分型。

1.2.4 统计学处理:分别统计病例组和对照组基因型分布频率,经Hardy-Weinberg平衡检验后,用SPSS13.0软件包进行分析,应用χ2检验分析病例组和对照组基因型的分布差异,用比值比(OR)及95%CI表示相对危险度,P<0.05认为具有统计学意义。

2 结果2.1 LTA基因rs909253的基因型分布LTA基因rs909253位点在江西地区汉族人群中存在GG、GA和AA多态型(见图1),G/G基因型在分子量5926 Da处有峰图,A/A基因型在分子量6006 Da 处有峰图,G/A基因型在以上两个分子量处均有峰图。

三种基因型在健康对照组中的分布频率分别为GG 26.4%,GA 52.0%,AA 21.6%;胃癌组为GG 35.6%,GA 46.4%,AA 18.0%,都符合Hardy-Weinberg平衡规律(P>0.05)。

2.2 不同种族人群rs909253的等位基因频率比较图1 LTA基因rs909253多态性GG、GA和AA特征质谱图Figure1 Schematicof the GG, GA and AA polymorphism of rs909253表1 不同种族人群rs909253的基因型分布频率比较Table1 Distribution of genotypes and alleles of LTA +252(rs909253)由表1可见,在不同地区的种族人群中,rs909253位点的基因型分布频率差异具有统计学意义(χ2=20.77,P=0.008)。

欧洲人群的GG基因型的分布频率(8.3%)明显低于其他种族人群中GG基因型的分布;日本、中国北京和中国江西人群的rs909253位点的基因型分布频率差异无统计学意义,虽然江西人群的GG基因型的分布频率略高,而AA基因型分布频率低于日本和北京。

2.3 LTA基因rs909253多态性和胃癌组的易感性的关系胃癌组LTA rs909253基因型频率分别为GG 35.6%,GA 46.4%,AA 18.0%与正常对照组的基因型分布频率差异无统计学意义(χ2=4.403,P=0.111);但在Logistic回归中,对年龄和性别进行校正后,与AA基因型相比,携带GG和GA 基因型的个体患胃癌的患病风险增加,OR值分别为1.670(95% CI: 0.961~2.902)和1.108(95% CI: 0.664~1.850),其中GG基因型的差异趋于显著,P值达到0.069。

变异基因型GG+GA占82.0%,与对照组的78.4%相比高出3.6%,差异无统计学意义(χ2=0.863,P=0.353)。

胃癌组的LTA+252G和A等位基因频率分别为58.2%和41.8%,与对照组差异临近显著水平(χ2=3.576,P=0.059);Logistic回归中对年龄和性别进行校正后,携带等位基因G的胃癌发病风险增加(OR=1.315, 95% CI: 1.001~1.728, P=0.049),G 等位基因可能是胃癌的危险因子。

详见表2。

表2 LTA rs909253的基因型和等位基因的频率分布图Table2 Distribution of genotypes and alleles of LTA +252(rs909253)2.4 不同性别LTA rs909253与胃癌易感性的关系由表3可以看出男性和女性胃癌患者的突变基因型和正常组相比差异均无统计学意义(χ2=3.729,P=0.155;χ2=1.899, P=0.389)。

男性和女性病例组的变异基因型(GG+AA)均高于正常组,分别为2.1%、7.9%,但差异无统计学意义。

表3 不同性别中LTA rs909253多态性与胃癌易感性的关系Table3 Frequency of LTA rs909253 on gastric cancer between different genders2.5 不同年龄LTA rs909253多态性与胃癌易感性的关系由表4可以看出小于等于50岁和大于50岁胃癌患者的突变基因型和正常组相比差异无统计学意义(χ2 =1.977, P=0.372;χ2=2.810, P=0.245)。

3 讨论SNP是基因组水平上由单个核苷酸变异引起的一种DNA序列多态性,已被作为第3代遗传标志,基本满足对疾病相关基因定位研究的需要[9]。

Sequenom-MassArray-IPLEX SNP检测平台其基本原理为基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDITOF MS)技术。

该系统是一种高通量的检测系统,可以高效自动化地筛查SNPs,适合大规模筛查的需要[10]。

LTA即淋巴毒素α是淋巴细胞受抗原或有丝分裂原等刺激活化后分泌的一种细胞因子,属于肿瘤坏死因子家族,具有抗肿瘤、抗病毒、广泛的诱导炎症和免疫调节功能。

目前研究较多的为LTA+252位点(rs909253)单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性的相关性。

研究提示,LTA+252(A→G)等位基因突变可影响血浆中TNF-β的含量和体外TNF-β的表达 [2],从而诱导产生 TNF-α 及 IL-1、IL-6、IL-8、IFN-γ等多种致炎细胞因子,促进胃癌的发生。

LTA+252位点的突变与胃癌相关性的研究在国内外已有不少报道,但结论尚不一致。

Gen Suzuki等[3]通过对日本人群的研究认为携带LTA+252位点G等位基因和GG基因型的个体患胃癌的相对危险性增加。

但Lee等[4]在韩国人群、Gonzalez等[5]在西班牙人群、Mahajan等[11]在波兰人群、Deans等[12]在英国人群中的研究则认为LTA +252 G/A位点多态性与胃癌无关。

国内的研究,傅冷西等[7]、陈晓露等[13]对福建汉族人群的研究认为LTA+252位点的A等位基因和AA基因型与胃癌发病易感性显著相关;而符刚[6]、李立人等[14]对江苏汉族人群的研究则发现GA杂合子是胃癌的危险因素。

但王美丽等[8]对中国宁夏汉族人的研究未发现位点多态性与胃癌的相关性。

表4 不同年龄中LTA rs909253多态性与胃癌易感性的关系Table4 Frequence of LTA rs909253 on gastric cancer between different age本研究在江西汉族人群中发现LTA +252 G/A位点的基因型分布频率在胃癌组和对照组间的差异无统计学意义,但等位基因的分布频率差异接近显著水平(χ2=3.576, P=0.059),携带+252 G等位基因患胃癌的相对危险性增加(OR=1.315, 95% CI: 1.001~1.728)。

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