在大肠杆菌中表达重组蛋白的流程

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大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化

大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化

大肠杆菌表达重组蛋白的超声破碎及纯化一可溶性蛋白的纯化(一)菌体的破碎1. 仪器与材料:-80℃冰箱;超声波细胞破碎仪;50mM PBS或50mM Tris-HCl pH 7.5;50ml 离心管;冷冻高速离心机2.方法2.1反复冻融2.1.1收集菌液500ml,等分10份,4000 r/min 4℃离心15min,弃上清。

2.1.2 菌体沉淀中加入相同菌液体积的50mM PBS 或50mM Tris-HCl(选择使蛋白稳定的缓冲液和pH)重悬洗涤一次。

2.1.3 然后按原菌液体积的1/4加入缓冲液重悬菌体,并加入蛋白酶抑制剂PMSF和EDTA(带His标签不加),PMSF终浓度为100μg/ml, EDTA的终浓度为。

取20μl重悬菌液进行电泳,检测蛋白表达的情况(是否表达,是可溶性表达还是包涵体表达)。

2.1.4 将菌液(经检测有表达)在-80度冰冻,室温融解,反复几次(反复冻融三次),由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。

2.2超声波处理 (对超声波及热敏感的蛋白慎用)2.2.1 将反复冻融的菌液(必要时可加入1mg/ml 溶菌酶,缓冲液pH>8.0,加入后需静置20min),进行超声破碎,超声条件:400W,工作5秒,间隔5秒,重复一定次数,(根据我们的仪器找出一个比较好的工作条件)。

直至菌体溶液变清澈为止,大约花费时间。

2.2.2 取少量经超声破碎后的菌液,10000rpm离心10分钟,分别对上清和沉淀进行检测,并用全菌作为阳性对照,检测菌体破碎程度及目标条带占总蛋白的含量。

注意事项:(1)超声破碎具体条件可根据实验情况而定,要掌握好功率和每次超声时间,降低蛋白被降解的可能。

(2)功率大时,每次超声时间可缩短,不能让温度升高,应保持在4度左右,超声时保持冰浴。

(3)菌体破碎后总蛋白浓度的测定可用Bradford法或者紫外吸收法。

(4)可通过SDS-PAGE 电泳观察菌体破碎程度及目标条带占总蛋白的含量。

重组蛋白的表达系统(详细版)

重组蛋白的表达系统(详细版)

终止子:转录终止子按照是否依赖和不依赖ρ因子的作用分为两类,这两类终止子均在终止点前含有一段7-20bp的回文序列。终止子可以保护mRNA在核外不被降解,显著延长mRNA的寿命,由此提高重组蛋白的表达量。但是对于T7系统来说,由于T7 RNA聚合酶效率极高,宿主中随时都有充足的mRNA以供翻译,因此大部分在T7系统中表达的重组蛋白并不在意质粒上是否有终止子,只有一些自身带有翻译起始信号的外源基因需要终止子。启动子受细胞类型的限制,在不同的细胞系中有很大不同,因此需根据宿主细胞(尤其是真核宿主)的类型选择不同的启动子以便于目的基因的高效表达。
表4:常用原核表达载体质粒
1.3 优化表达条件
重组蛋白的表达流程很少有一次成形的,为了提高蛋白表达量、改善蛋白质量,表达条件和白不表达时:
2
如果重组蛋白不表达(包含体和可溶蛋白都没有),首先检查cDNA和质粒是否正确,蛋白对宿主菌是否有很大毒性,然后尝试更换菌株、质粒载体和融合标签。原核蛋白在大肠杆菌中不能表达的情况很少见,通常是真核蛋白不能表达。不能表达的重组蛋白,即使在更换了宿主、载体后可以表达,表达量也不会很高,如果需要大规模生产,最好尝试酵母和昆虫细胞表达系统。
融合标签:融合标签是与目的蛋白共表达的一段多肽,方便重组蛋白的纯化、固定和检测,表3给出了常用的重组标签。如果不需要对重组蛋白进行纯化,尽量不要引入融合标签,以免影响蛋白性质;如果重组蛋白本身能够结合某种亲和柱,如某些金属结合蛋白可以结合Ni-NTA,某些糖结合蛋白能够特异识别糖类,也不必引入标签。融合标签的引入能够大大简化重组蛋白的纯化流程,并提高蛋白溶解度。商业化表达质粒,如pET、pGEX等提供了各种纯化标签和融合蛋白供选,应根据蛋白具体情况进行选择。His-tag是最常用的纯化标签,它具有很多优点:标签较短(10-20个氨基酸残基),不带电(pH8.0),免疫原性差,通常不影响重组蛋白的结构和功能,Ni2+亲和力高,能够通过一步纯化达到60%-90%的纯度。如果蛋白质溶解度不高,导致折叠困难、表达量低,可以选择较大的融合标签(GST、MBP、Trx等)帮助重组蛋白表达和折叠,提高重组蛋白溶解度,从而提高表达量。较大的融合标签有时也会导致翻译困难甚至提前中止,纯化后发现大部分都是标签蛋白也是常见现象。翻译的提前中止会大大影响重组蛋白产率和后续纯化,所以在短标签能够达到目的的时候,尽量不要选择大的融合标签。标签位置的选择也很重要:N端标签(短的或长的)自身带有启动子和适应宿主偏好的密码子,可以帮助目的蛋白表达,提高表达量,但是提前中止翻译的蛋白片段也会被一并纯化出来,降低重组蛋白纯度,对蛋白酶敏感的、自身容易降解的以及一级序列中有集中的疏水残基区的蛋白尤其要避免使用N端标签;C端标签则可以保证只有完整蛋白得到纯化。另外,如果蛋白的近N端或近C端有重要功能区,如酶活中心、配体结合位点、二硫键、多聚体稳定界面、相互作用界面等,则要避免纯化标签位于该末端,以免影响重组蛋白的结构和功能。如果融合标签对蛋白性质有较大影响,但又是纯化所必须的,就可以考虑在纯化过程中去除标签。主要有三种方法:化学裂解,如溴化氰(CNBr)、羟胺(NH2OH)等,能够简单有效地去除标签,但反应条件苛刻(羟胺需要在pH9.0下反应),特异性较差,而且会引入不必要的修饰,除包含体蛋白的处理外已经很少使用了;酶解,如PPase等,其底物一般是一段比较长的肽链,特异性强,是目前比较常用的方法,缺点是酶切反应需要较长的时间,也增加了蛋白纯化的步骤,使纯化变得繁琐;IMPACT质粒,该质粒在纯化标签和目的蛋白之间插入了一个蛋白质内含子(intein),intein具有可诱导的自切割活性,使用IMPACT质粒表达的重组蛋白,只需要改变缓冲液的pH和温度,即可切掉融合标签。

外源基因在大肠杆菌中表达简略实验步骤

外源基因在大肠杆菌中表达简略实验步骤

目的基因在大‎肠杆菌中的诱‎导表达一般程序如下‎:获得目的基因‎-准备表达载体‎-将目的基因插‎入表达载体中‎(测序验证)-转化表达宿主‎菌-诱导靶蛋白的‎表达-表达蛋白的分‎析-扩增、纯化、进一步检测。

[主要试剂]1、LB培养基。

2、100mM IPTG(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷):2.38g IPTG溶于‎100ml ddH2O 中‎,0.22μm滤膜‎抽滤,-20℃保存。

[操作步骤]1、通过PCR方‎法获得目的基‎因:以含目的基因‎的克隆质粒为‎模板,按基因序列设‎计一对引物(在上游和下游‎引物分别引入‎不同的酶切位‎点,本实验中为B‎a mHⅠ和Hiind‎Ⅲ),PCR循环获‎得所需基因片‎段。

PCR反应体‎系为:模板(含R基因的重‎组质粒)1μl上游引物PR‎11μl下游引物1μldNTP(2.5mmol/L)5μl10×PCR buffer‎(含Mg2+)10μlTaq酶1μlddH2O补‎至100μlPCR反应条‎件为:94℃变性3min;94℃变性3min、52℃复性40se‎c、72℃延伸1min‎,30个循环;最后72℃延伸8min‎。

2、构建重组表达‎载体(1)载体酶切:将表达质粒p‎R SETA用‎限制性内切酶‎(同引物的酶切‎位点)进行双酶切,酶切产物行琼‎脂糖电泳后,用凝胶回收K‎i t或冻融法‎回收载体大片‎段。

(2)R基因PCR‎产物双酶切后‎回收,在T4 DNA连接酶‎作用下连接入‎载体。

连接反应体系‎为:pRSETA‎1μlR基因片段3μlT4 DNA连接酶‎(5U/μl)1μl5×buffer‎2μlddH2O补‎至10μl3、获得含重组表‎达质粒的表达‎菌种(1)将连接产物转‎化大肠杆菌D‎H5α,根据重组载体‎的标志(抗Amp)作筛选,挑取单斑,碱裂解法小量‎抽提质粒,双酶切初步鉴‎定。

(2)测序验证目的‎基因的插入方‎向及阅读框架‎均正确,进入下步操作‎。

大肠杆菌重组蛋白表达流程

大肠杆菌重组蛋白表达流程

大肠杆菌重组蛋白表达流程大肠杆菌重组蛋白表达流程主要包括以下几个步骤:1. 选择合适的表达载体:通常选择含有启动子、转录终止子、选择标记和适当的表达调控元件的表达载体。

启动子用于驱动基因转录,转录终止子用于确定转录产物的结束位置,选择标记有助于筛选含有目的基因的转化子,而表达调控元件可以调节基因的表达水平。

2. 构建表达载体:将目的基因插入表达载体中,构建成重组表达载体。

在此过程中,需要考虑目的基因的orientation(方向)、阅读框(ORF)以及表达调控元件的活性等因素。

3. 转化大肠杆菌:将构建好的重组表达载体转化到大肠杆菌中。

转化方法有多种,如化学法(如CaCl2法)、电转化、热激转化等。

转化后,大肠杆菌吸收了外源DNA,成为重组菌株。

4. 筛选重组菌株:在含有选择性抗生素的培养基上培养转化后的菌落,筛选出含有目的基因的重组菌株。

此外,可以通过鉴定菌落的形态、颜色等特征进行初步筛选。

5. 诱导表达:将筛选出的重组菌株接种到含有诱导剂(如IPTG)的培养基中,诱导目的基因的表达。

诱导剂IPTG可以与表达载体中的启动子结合,增强基因转录和翻译的效率。

6. 收集和纯化重组蛋白:诱导表达后,菌体中会含有目的蛋白。

可以通过离心、破碎细胞、柱层析等方法分离和纯化重组蛋白。

常用的纯化标签有His标签、GST标签等,这些标签可以帮助分离和纯化目的蛋白。

7. 蛋白活性检测和应用:对纯化的重组蛋白进行活性检测,如酶活测定、蛋白互作实验等。

确认蛋白活性后,可应用于生物学研究、药物研发等领域。

需要注意的是,大肠杆菌重组蛋白表达过程中可能会遇到表达量低、蛋白包涵体等问题。

为了解决这些问题,可以尝试优化表达载体、改变诱导条件、使用融合标签等策略。

重组蛋白 工艺流程

重组蛋白 工艺流程

重组蛋白工艺流程
重组蛋白工艺流程:
目标基因的扩增。

首先,需要设计引物,这些引物应避开目标蛋白的跨膜区和二级结构,如选择N端或C端的序列。

这些引物的设计结合了目标蛋白的结构信息和基因信息,并通过第三方公司合成。

插入克隆载体。

利用PCR技术,根据目标蛋白的特异表达组织,使用设计的引物进行PCR扩增,然后进行酶切和连接,将目的片段与载体结合。

亚克隆到表达载体中。

将连接好的目的片段转化到感受态细胞中,如大肠杆菌,并进行挑菌验证,通过PCR和琼脂糖凝胶电泳来确认目的片段是否成功插入载体。

蛋白表达。

在特定的条件下,如诱导剂的存在,将重组载体转化到宿主细胞中,如大肠杆菌、酵母、哺乳动物细胞或杆状病毒-昆虫细胞系统,进行蛋白的表达。

蛋白的鉴定和纯化。

通过SDS-PAGE和western blot或荧光等方法进行蛋白的鉴定,由于载体中通常包含标签(如His标签),可以使用特定的纯化方法,如镍柱纯化,来分离和纯化重组蛋白。

质量检测和保存。

纯化后的蛋白会进行冻干处理,并进行常规的蛋白质实验验证其分子量和纯度,纯度通常需要超过95%。

通过测试后,蛋白会被储存。

大肠杆菌表达方法

大肠杆菌表达方法

大肠杆菌表达方法一.表达鉴定1、将鉴定好的质粒转化DE3(BL21),涂卡那板。

1、挑取含重组质粒的菌体单斑3-5个克隆至2ml LB(含kana50μg/ml)中37℃过夜培养,保存甘油菌。

500ul菌加500ul 40%甘油。

2、按1∶50比例稀释过夜菌,一般将100ul菌加入到含5mlLB(含kana50μg/ml)培养基的培养管中,37℃震荡培养至OD600 ≌0.6-0.8(大约需3hr)。

3、取1ml液体作为未诱导的对照组,余下的加入IPTG诱导剂至终浓度1mM作为实验组,两组继续37℃震荡培养5hr。

4、取菌体,离心12000g×2min收获沉淀,加100ul Bugbuster protein extraction reagent 重悬后在振荡器上振荡20min。

5、4度12000rpm 离心20min,弃上清,沉淀加100ul 1×SDS-Loading buffer,电泳鉴定。

二.小规模蛋白表达、纯化、复性1、取鉴定好的甘油菌10ul接种至2ml LB(含kana50μg/ml)中37℃过夜培养2、按1∶50比例稀释过夜菌,一般将2ml菌加入到含200ml LB(含kana50μg/ml)培养基的培养管中,37℃震荡培养至OD600 ≌0.6-0.8(大约需3hr)。

3、取1ml液体作为未诱导的对照组,余下的加入IPTG诱导剂至终浓度1mM作为实验组,两组继续37℃震荡培养5hr。

4、取菌体,离心12000g×2min收获沉淀,加5ml Bugbuster protein extraction reagent 重悬后在振荡器上振荡20min。

5、4度12000rpm 离心20min,弃上清,沉淀加10ml 包涵体洗涤液(10×:200 mM Tris-HCl, pH7.5, 100 mM EDTA, 10% Triton X-100),涡旋1min 充分重悬,12000rpm 离心15min,弃上清。

重组蛋白的表达

重组蛋白的表达

重组蛋白的表达1.概述分离纯化组成了基因工程的下游处理(downstream processing)时期,这一过程又和上游过程紧密相联系,上游过程的诸方面阻碍到下游的分离纯化,因此在进行目标蛋白质表达纯化时要统一考虑和整体设计,并充分考虑上游因素对下游的阻碍,如是否带有亲和标签,是否进行分泌表达。

目前应用最广泛的表达系统有三大类,分别是大肠杆菌表达系统、酵母表达系统和CHO细胞表达系统,不同的表达系统和培养方法显著阻碍下游的处理过程,目标蛋白表达是否形成包涵体,目标蛋白表达的定位(胞内、细胞内膜、周质空间和胞外),蛋白表达的量都依靠于所选择的表达系统。

选择将所表达的蛋白分泌到细胞外或周质空间能够幸免破裂细胞的步骤,同时由于蛋白质种类少,目标蛋白容易纯化;而在细胞质内表达蛋白,可能是可溶性表达,可能形成包涵体,可溶性的蛋白往往需要复杂的纯化步骤,而包涵体易于分离,纯度较高,但回收具有生物活性的蛋白却变的相当困难,需要对集合的蛋白进行变复性,通常活性蛋白的得率比较低,表1列出了不同策略对表达、纯化的阻碍,关于其中的有些缺点能够通过一定的方法进行克服和幸免,如利用DNA重组技术给外源蛋白加上一个亲和纯化的标签,有助于可溶性外源蛋白的选择性纯化,并能爱护目标蛋白不被降解(96)。

表 1 重组蛋白不同表达策略的优点和缺点表达策略优点缺点分泌表达至细胞外增强正确二硫键的形成降低蛋白酶对表达蛋白的降解可获得确定的N末端显著减少杂蛋白水平,简化纯化不需要细胞破裂表达水平低多数蛋白不能进行分泌表达表达蛋白需要进行浓缩细胞周质空间表达增强正确二硫键的形成可获得确定的N末端显著减少杂蛋白水平,简化纯化好些蛋白不能分泌进入周质空间没有大规模选择性的开释周质空间蛋白的技术周质蛋白酶可引起重组蛋白酶解胞内包涵体表达包涵体易于分离爱护蛋白质不被降解蛋白质不具有活性对宿主细胞生长没有大的阻碍,通常可获得高的表达水平需要体外的折叠和溶解,得率较低具有不确定N末端胞内可溶性蛋白表达不需要体外溶解和折叠一样具有正确的结构和功能高水平的表达常难以得到需要复杂的纯化可发生蛋白质的酶解具有不确定的N末端在细胞的提取物中,除了目标蛋白外,还含有其它各种性质的蛋白、核酸、多糖等。

(完整版)1-大肠杆菌重组蛋白表达提取及纯化实验

(完整版)1-大肠杆菌重组蛋白表达提取及纯化实验

第一天1、配置LB培养基:酵母粉15g、胰蛋白胨30g、氯化钠30g,定容至3000ml。

调节PH至7.4(2M NaOH),高压蒸汽灭菌20分钟,37℃保存。

分装成15瓶(每瓶200ml)。

2、接种(超净台要提前杀菌通风)取4瓶上述培养基,每瓶加200µlAMP(1:1000)、60µl菌液。

37℃过夜。

第二天1、扩大培养(超净台)4瓶扩至16瓶,每瓶培养基加200µlAMP,摇床培养1小时左右。

2、诱导(超净台)加40µlIPTG,加完后去除封口的除牛皮纸,扎口较松。

25℃摇床培养4小时。

3、离心获取菌体4℃,8000rpm离心25分钟。

注意配平。

4、超声波破碎菌体离心后去上清,向沉淀加入(600mlPB裂解液、300µl溶菌酶、3mlPMSF)。

将菌液转入2个烧杯中,冰浴超声波破菌,400W,75次,每次6秒,间隔2秒。

离心收集上清液。

600mlPB裂解液:20mM/L PB,10mM/L EDTA,5%甘油,1mM/L DTT,调节PH至7.4。

超声波破碎:首先用去离子水清洗探头,再将盛有菌液的小烧杯置于有冰水混合物的大烧杯中,冰水界面略高于菌液面即可。

探头浸没于菌液中,不可伸入过长。

注意破菌过程中由于冰的融化导致的液面变化。

5、抽滤(双层滤纸)洗胶(GST)。

将上述上清液抽滤,滤液与GST胶混合,磁力搅拌过夜。

第三天1、抽滤蛋白-胶混合液,滤液取样20µl,留电泳。

2、洗杂蛋白,用1×PBS+PMSF(1000:1)约400ml,洗脱若干次,用移液枪吸去上层泡沫(杂蛋白),至胶上无泡沫为止。

3、洗脱目的蛋白,洗脱液加50ml,分3次进行(15+15+15),每次加入后间歇搅拌,自然静置洗脱15分钟,抽滤,勿使胶干,合并洗脱液,取样20µl,留电泳。

用洗脱液调零,测OD280。

(OD值达到1.5为佳)4、将洗脱液置于透析袋中(透析袋应提前煮好),将透析袋置于2L透析液1中,加入磁珠置于4℃冰箱内磁力搅拌器上,4小时后换为透析液2。

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在大肠杆菌中表达重组蛋白的流程
在大肠杆菌中表达重组蛋白的流程通常包括以下步骤:
1. 克隆:首先需要将目标基因克隆到适当的表达载体中。

这可以通过PCR扩增目标基因,然后将其与表达载体连接,形成重组质粒。

2. 转化:将重组质粒转化到大肠杆菌细胞中。

可以使用化学方法(如热冲击法)或电穿孔法将质粒导入细胞。

3. 选择:转化后,将细胞分散在含有适当抗生素的琼脂平板上培养。

只有带有重组质粒的细胞能够存活并形成菌落。

4. 培养:将含有重组细胞的培养液转移到适当的培养基中,并在适当的条件下培养。

这可能包括调节温度、pH值和搅拌速度等。

5. 表达:在培养期间,目标基因会被大肠杆菌细胞转录和翻译为蛋白质。

使用适当的启动子和调控序列,可实现目标蛋白的高效表达。

6. 细胞破碎:一旦细胞达到最佳表达水平,就需要破碎细胞以释放目标蛋白。

这可以通过多种方法实现,如超声波、高压破碎或化学方法。

7. 纯化:通过使用各种分离和纯化技术(如亲和层析、凝胶过滤、离子交换层析等),从细胞裂解液中纯化目标蛋白。

以上是在大肠杆菌中表达重组蛋白的一般流程。

具体的步骤和条件可能因实验设计和目标蛋白的特性而有所不同。

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