基因操作原理名词解释

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第一章

1. Gene manipulation

基因操作。将在细胞外产生的核酸(物质)分子插入到病毒,质粒或其它载体系统中,再整合到特定的宿主中,从而形成一种新的可连续繁殖的有机体。

2. Interrupted genes

间断基因。序列中间插入有与氨基酸编码无关的DNA 间隔区,使一个基因分隔成不连续的若干区段。我们称这种编码序列不连续的基因为间断基因。

3 .Promotor

启动子。DNA 分子可以与RNA 聚合酶特异结合的部位,也就是使转录开始的部位。4. Subcloning

亚克隆。当初始克隆中的外源DNA 片段较长,含有许多目的基因以外的DNA 片段时,在诸如表达、序列分析和突变等操作中不便进行,将目的基因所对应的一小段DNA 找出来,这个过程叫“亚克隆”。

第二章

1.Restriction and modification

限制和修饰。宿主特异性地降解外源遗传物质(DNA)的现象称为限制。外源遗传物质通过甲基化等作用避免宿主的限制作用称为修饰。

2. Matched ends

匹配末端。识别位点为回文对称结构的序列,经限制酶切割后,产生的相同的,互补的末端称为匹配粘端,亦即粘性末端(cohesive end)。

3. Blunt ends

平末端。在回文对称轴上同时切割DNA 的两条链,产生的没有碱基突出的末端称为平末端。

4. Isoschizomer :同裂酶。识别相同序列的限制酶称同裂酶,但它们的切割位点可能不同。

5. Isocaudiners :同尾酶。来源不同、识别序列不同,•但产生相同粘性末端的酶。

6.Site preferences :位点偏爱。某些限制酶对同一介质中的不同位置的同一个识别序列表现出不同的切割效率的现象称为位点偏爱。

7.Star activity 星星活性。在极端非标准条件下,限制酶能切割与识别序列相似的序列,这个改变的特殊性称星星活性。

8. Nicking enzyme 切口酶。有些限制酶只切割双链DNA 中的一条链,产生单链缺口,这种酶称为切口酶。

9. Klenow fragment

Klenow 片段。Klenow DNA 聚合酶是E.coli DNA polymerase 经蛋白酶(枯草杆菌蛋白酶)裂解而从全酶中除去5'--3' 外切活性的多肽大片段,而聚合活性和3'--5' 外切活性不受影响。

10 .Sequenase

测序酶。是改造的T7 噬菌体DNA 聚合酶,切除了99% 以上的3'--5' 外切活性。Sequenase Version2 切除了所有的3'--5' 外切活性,用于双脱氧链终止法对长片段进行测序。

11.Reverse transcriptase

反转录酶。即依赖于RNA 的DNA 聚合酶,它有5'--3' 合成DNA 活性,但是无3'--5' 外切活性。它来自AMV (禽成髓细胞瘤病毒)或Mo-MLV (Moloney 鼠白血病病毒,又称M-MuLV)。

12. Terminal transferase

末端转移酶。来源于小牛胸腺,是存在于前淋巴细胞及分化早期的类淋巴样细胞内的一种不寻常的DNA 聚合酶,在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP 加于DNA 分子的3' 羟基端。若dNTP 为T 或C ,此二价阳离子首选钴离子;若dNTP 为A 或G,此二价阳离子首选镁离子。

13. Ligase 连接酶。催化DNA 5' 磷酸基与3' 羟基之间形成磷酸二酯键,将两段核酸连接起来的酶。

14. T4 polynucleotide kinase T4 多核苷酸激酶。催化ATP 的γ-磷酸基转移至DNA 或RNA 的5' 末端。

15. Alkaline phosphatase

碱性磷酸酶。主要来源于牛小肠(Calf intestinal alkaline phosphatase),简称CIP 或CIAP,也有来自细菌(BAP)。催化除去DNA 或RNA 5' 磷酸。

16. S1 nuclease Sl 核酸酶。来源于米曲霉(Aspergillus oryzae),可降解单链DNA 或RNA ,产生带5' 磷酸的单核苷酸或寡核苷酸双链;对dsDNA ,dsRNA ,DNA:RNA 杂交体不敏感。

17. ExonuleaseЩ外切核酸酶Щ。来源于大肠杆菌,催化从dsDNA 3'-OH 逐一去除单核苷酸的反应,底物为dsDNA 或线状和带切口或缺口的环状DNA ,反应结果是在dsDNA 上产生长的单链区。

18. Single strand binding protein

单链结合蛋白。此蛋白能协同地与ssDNA 结合而不与dsDNA 结合,可以削弱链内二级结构的稳定性,从而加速互补多核苷酸的重新退火,并通过消除阻碍DNA 聚合酶前进的链内二级结构,而提高这些聚合酶的持续作用能力。

19. Proteinase K 蛋白酶K 是具有高活性的丝氨酸蛋白酶,属枯草杆菌蛋白酶,可以水解范围广泛的肽键,尤其适合水解羧基末端至芳香族氨基酸和中性氨基酸之间的肽键。K 指该蛋白酶通过水解角蛋白(keratin)可以为该霉菌提供所有所需的碳源和氮源。

20. Lysozymes 溶菌酶。一类水解细菌细胞壁中肽聚糖的酶,常用的是卵清溶菌酶,用于破碎细胞。

第三章

1. Vehicle 载体。将外源DNA 或基因携带入宿主细胞(host cell)的工具称为载体。具备以下三个必须元件:复制原点、多克隆位点和筛选标记。

2. Gene clone 基因克隆。克隆作动词时,指从单一祖先产生同一的DNA 分子群体或细胞群体的过程;作名词时指从一个共同祖先无性繁殖下来的一群遗传上同一的DNA 分子、细胞或个体所组成的特殊的生命群体。利用重组DNA 技术分离目的基因,称之为基因克隆。

3. Gene library 基因文库。由大量的含有基因组DNA(即某一生物的全部DNA 顺序)的不同DNA 片段的克隆所构成的群体,称之为基因文库。

4. Plasmid incompatibility 质粒不相容性。利用同一复制系统的两个质粒在同一宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性,它是指在第二个质粒导入后,在不涉及DNA 限制系统时出现的现象。

5.α-complementation α-互补。指lacZ 基因上缺失近操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的α-半乳糖苷酶阴性的突变体之间实现的互补。这两个无酶学活性的产物混合在一起时,可恢复α-半乳糖苷酶的活性。

6. X-gal/IPTG 两者都是乳糖的衍生物,X-gal:乳糖操纵子底物,可以作为生色剂,被α-半乳糖苷酶分解后可产生兰色产物,可使菌落呈现兰色;IPTG:乳糖操纵子诱导物。

7. lytic growth 裂解生长状态。噬菌体侵染宿主细胞后,大量复制并组装成子代噬菌体颗粒,导致宿主细胞裂解的现象称裂解生长状态。

8. lysogenic state 溶源状态。噬菌体侵染宿主细胞后,将λ噬菌体基因组DNA 通过位点专一性重组整合到宿主的染色体DNA 中,并随宿主的繁殖传给子代细胞的现象称溶源状态。

9. Multiplicity of infection 感染复数。指单个宿主细胞感染的噬菌体颗粒数,等于实验所用的噬菌体与细胞的数量之比。

10. Insertion vectors 插入型载体。通过特定的酶切位点允许外源DNA 片段插入的载体称为插入型载体。

11. Replacement vectors 置换型载体。而允许外源DNA 片段替换载体的非必须DNA 片段的载体,称为置换型载体。

12.Cosmid 粘粒。带有将DNA 包装到噬菌体颗粒中所需的cos 序列的质粒。包括质粒复制起点,可以象质粒一样转化并增殖;包括cos 位点,可以象噬菌体颗粒一样包装、侵染。

13. Replicative form DNA 复制型DNA 。在宿主细胞内,感染性的单链噬菌体DNA (正链)在宿主酶的作用下转变成环状双链DNA ,用于DNA 的复制,这种双链DNA 称为复制型DNA 。

14. Phagemid 噬菌粒。具有ColE1 复制起点及单拷贝的丝状体噬菌体主要基因间隔区的质粒载体。此基因间隔区含病毒DNA 合成的起始与终止及噬菌体颗粒形态发生所必须的全部顺式作用序列。含phagemid 的细菌被噬菌体感染后,基因Ⅱ蛋白作用于间隔区,启动滚环复制产生ssDNA 并进行包装。

15. M13K07 help phage M13KO7 辅助噬菌体。M13 单链丝状噬菌体的衍生株,基因Ⅱ带有一个G--T 的突变。M13KO7 基因组双链DNA 可表达产生子代单链DNA 所必需的所有蛋白。M13K07 中突变的基因Ⅱ产物与自身携带的噬菌体复制起点的作用尚不如它与克隆于噬菌粒pUCll8 和pUCll9 中的病毒复制起点的作用有效,可以确保在细胞所产生的病毒颗粒中来自噬菌粒的单链DNA 能够占据优势。

16. Yeast artificial chromosomes 酵母人工染色体载体。利用酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)染色体的复制元件来驱动外源DNA 片段复制的载体称为酵母人工染色体载体。由自主复制序列、着丝粒、复制子及选择标记等元件组成。

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