抗生素生物合成原理及应用
植物天然抗生素的生物合成及其应用研究
植物天然抗生素的生物合成及其应用研究随着人类对自然环境的不断破坏和抗生素滥用，微生物对抗生素的耐药性日益增强，研究和发现新型抗生素成为当今急需解决的问题。
与此同时，植物中的天然产物在抗生素、抗菌和抗肿瘤等领域展示出了较好的活性和效果，因此研究植物天然抗生素的生物合成及其应用具有重要的意义。
植物天然抗生素是指植物体内产生、维持自身生命活动所需的具有杀菌、抗病、抗虫等功效的代谢产物。
在植物的生长发育过程中，植物体会合成出一些具有生物防御和调节生长的有机物，例如黄酮类、生物碱类、甾体类、酚类、鞣质类等，实现了植物的自我保护和生物调节。
其中，一些植物天然产物具有广泛的药用价值，因其具有抗菌、抗病毒、降低人体胆固醇、促进免疫等诸多功效，被广泛用于治疗多种疾病。
对于植物天然抗生素的生物合成及其应用的研究，主要分为两个方面：一是解析植物中天然产物的生物合成途径及其调控机制，二是对植物天然产物进行开发和应用。
植物天然抗生素的生物合成植物天然抗生素的生物合成大多源自一系列基础骨架化合物，这些化合物起始于基础代谢途径合成的一些糖类、脂肪酸和氨基酸等，经过复杂的转化途径，生成了一系列具有生物活性的次生代谢物。
以黄酮类为例，其基础骨架为苯骈吡喃酮结构，从苯酮和乙酰辅酶A出发，通过二羧酸途径以及WAES途径、美宁裂解酸途径等复杂的代谢反应路径，经过数个酶的催化、调节和催化剂的供应等步骤最终生成黄酮类物质。
在这一过程中，多个酶、转运蛋白、激酶等参与其中，并通过基因调控和蛋白受体配合等方式实现了生物合成。
对于植物天然抗生素的生物合成研究，最近几年有学者提出可以通过代谢工程策略来实现植物天然产物的生产。
例如，在植物细胞外分泌体系中，可以通过敲除多个具有抑制或竞争作用的代谢途径等设计，来提高目标产物的生物产量、纯度和稳定性。
这为植物天然产物的工业化制造奠定了基础。
植物天然抗生素的应用研究植物天然抗生素具有广泛的应用价值。
在医学上，植物天然抗生素广泛应用于疾病的诊断与治疗、生物防治、环境保护等领域。
抗生素的作用与原理
抗生素的作用与原理抗生素是一类能够抑制或杀死病原微生物的药物。
它们在医学上被广泛应用于治疗细菌感染或预防细菌感染的疗程中。
抗生素的作用机制多种多样，常见的包括靶标抵制、细胞壁破坏、蛋白质合成抑制等。
本文将重点探讨抗生素的作用和原理。
一、抗生素的作用机制1. 靶标抵制（Target inhibition）抗生素可以通过抑制病原菌内特定的靶标来发挥作用，进而影响其正常生理功能。
例如，青霉素类抗生素能够干扰细菌的细胞壁生物合成，通过抑制细菌壁合成酶（穆雷因酶）从而导致细菌细胞壁的形成异常，最终导致细菌死亡。
2. 细胞壁破坏（Cell wall disruption）某些抗生素可以直接破坏细菌细胞壁的结构，使其无法维持正常的形态。
青霉素类抗生素、β-内酰胺类抗生素等能够通过抑制细菌细胞壁的合成或破坏细菌细胞壁的稳定性，造成其溶解和死亡。
3. 蛋白质合成抑制（Protein synthesis inhibition）部分抗生素能够抑制细菌的蛋白质合成。
例如，氨基糖苷类抗生素能够与细菌的核糖体结合，阻止其正常的蛋白质合成过程，从而导致细菌不能正常生长和繁殖，最终导致其死亡。
4. 核酸代谢抑制（Nucleic acid metabolism inhibition）一些抗生素通过干扰细菌的核酸代谢来发挥作用。
喹诺酮类抗生素通过抑制细菌DNA合成酶（DNA gyrase和topoisomerase IV）的活性，阻碍其DNA的复制和修复，从而导致细菌死亡。
二、抗生素的使用注意事项1. 合理使用抗生素抗生素的滥用和不合理使用容易导致微生物耐药性的产生。
在使用抗生素时，应严格按照医生的处方用药，不得随意停药或更改用药剂量。
同时，应尽量减少不必要的抗生素使用，例如对病毒感染、非细菌性感染无需使用抗生素。
2. 注意过敏反应部分人群对某些抗生素可能存在过敏反应，如药疹、过敏性休克等。
在使用抗生素前应告知医生过敏史，避免使用可能引发过敏的药物。
抗生素的提取方法
抗生素的提取方法抗生素是一类能够抑制或杀灭细菌生长的药物。
这些药物主要通过提取自微生物（如细菌、真菌、放线菌等）来获得。
提取抗生素的方法可以分为传统方法和现代分离技术。
传统的抗生素提取方法主要是基于微生物发酵的原理。
一般来说，通过筛选具有抗菌活性的微生物，然后在适当的发酵条件下培养和繁殖这些微生物，使其合成并分泌出抗生素。
常用的发酵方法有液体发酵和固体发酵两种。
液体发酵是将发酵基质和产生抗生素的菌株放入发酵罐中，通过调节适宜的温度、pH值、氧气供应、搅拌速度等因素，促使菌株进行生长和代谢产物的合成。
在菌株生长的过程中，微生物会合成出抗生素，并通过发酵液进一步分泌出来。
随后抗生素可以通过离心、过滤、提纯等步骤从发酵液中提取出来。
固体发酵是把含有抗生素活性的菌株悬浮在固态基质上进行培养，比如在麦芽糊精、豆粉等基质中，菌株通过代谢活动合成出抗生素。
固体发酵相对来说操作简单，但由于难以控制好发酵条件，因此产量相对较低。
从固态发酵物中提取抗生素可以通过浸提、溶解、过滤等步骤进行。
除了传统的发酵方法，现代分离技术也在抗生素的提取过程中得到广泛应用。
现代分离技术利用了化学、生物、物理等多种方法，以提高抗生素的提取效率和纯度。
常用的分离技术包括悬浮-沉淀、萃取、色谱层析、凝胶过滤等。
悬浮-沉淀是一种将发酵液中的细胞和杂质通过悬浮和沉淀的方式分离出来，其中抗生素溶于悬浮液中，可以通过离心等方式进行分离。
萃取是通过萃取剂与发酵液中的抗生素相亲和性差异进行分离。
常用的萃取剂有有机溶剂如乙酸乙酯、正己烷等。
通过调整萃取剂的性质和条件，可以实现抗生素的富集和分离。
色谱层析是一种基于物质在固定相和流动移动相之间差异的分离技术，常用的色谱层析方法有薄层层析、柱层析、气相色谱等。
色谱层析可以根据抗生素的性质来选择合适的分离方法，如极性柱层析适用于亲水性抗生素的富集和纯化。
凝胶过滤是一种利用分子的大小和形状差异进行分离的技术，通过将发酵液通过特定的孔径大小的过滤膜来分离抗生素。
抗生素原理
抗生素原理抗生素是一类专门用来治疗和预防细菌感染的药物。
它利用特定物质来抑制细菌的生长和繁殖，从而降低或抑制病原体的复制，有效控制病情，治疗和预防传染病。
抗生素的发明成就了医学的历史，为临床治疗带来了巨大的进步。
本文将对抗生素的原理做一个简单的介绍。
抗生素分为生物性抗生素和化学性抗生素。
生物性抗生素是由生物体产生的抗菌物质，它们可以杀死细菌或阻止它们的生长和繁殖。
例如，有些细菌能产生抗性酶，它们可以分解抗生素，从而对细菌无效。
化学性抗生素是由人工合成的有效抗菌剂，它们具有不同的作用机制。
例如，抗结核病药物有可以抑制细菌的蛋白合成，有的可以干扰细菌的细胞膜通透性，有的可以抑制细菌的DNA合成。
抗生素的功效依赖于其对待细菌的特异性。
抗生素只能有效地抑制和杀灭特定的细菌，而对其他细菌无效。
这种特异性使得抗生素能够准确地抑制感染源，从而有效地预防和治疗感染病。
抗生素可以以不同的方式进入细菌，使之停止生长和繁殖。
抗生素通常可以通过四种途径进入细菌，即抑制细菌膜通透性、抑制蛋白合成、抑制DNA合成和抑制细菌细胞代谢过程。
第一，抗生素可以通过抑制细菌膜通透性的方式递送药物至细菌内，这种药物有去甲肾上腺素酶抑制剂、伊曲康唑等。
第二，抗生素也可以通过抑制细菌蛋白合成的方式，抑制细菌的生长。
其中不同类型的抗生素可以抑制不同酵素，如抗结核药物可以抑制结核杆菌的DNA依赖RNA合成酶，而亚硝酸盐类抗生素可以抑制细菌的RNA依赖DNA合成酶。
第三，抗生素也可以通过抑制细菌DNA合成的方式来杀灭细菌，其中有氧基四环素类抗生素可以抑制细菌的DNA合成酶，而氧基六环素可以抑制细菌的RNA合成酶。
第四，也可以通过抑制细菌细胞代谢过程，从而实现抗生素的功效，有的抗生素可以抑制细胞色素合成酶，从而可以抑制细菌的光合作用。
抗生素的有效性往往取决于它们的度和作用时间，即药物的暴露时间。
如果药物的暴露时间太长，可能会导致耐药性的发生，从而导致病原体的耐药性。
合成生物学在抗生素开发中的应用
合成生物学在抗生素开发中的应用在医学领域，抗生素的发现和应用是人类对抗细菌感染的重要武器。
然而，随着时间的推移，细菌对抗生素的耐药性逐渐增强，使得传统抗生素的疗效大打折扣。
为了应对这一挑战，科学家们将目光投向了合成生物学这一新兴领域，试图通过创新的技术和方法来开发更有效的抗生素。
合成生物学是一门融合了生物学、物理学、化学、计算机科学等多学科的交叉领域，其核心思想是通过设计和构建基因、蛋白质等生物分子组件，来实现生物系统的定制化和优化。
在抗生素开发中，合成生物学具有巨大的应用潜力。
首先，合成生物学可以用于发现新的抗生素化合物。
传统的抗生素筛选方法往往依赖于从自然界中分离微生物，然后检测其代谢产物的抗菌活性。
这种方法效率低下，而且发现的新化合物数量有限。
而合成生物学则可以通过对微生物基因的分析和改造，预测可能具有抗菌活性的化合物，并通过合成和测试来验证。
例如，科学家可以利用基因测序技术获取微生物的基因组信息，然后通过生物信息学分析找到与抗生素合成相关的基因簇。
进一步对这些基因进行克隆和表达，就有可能在实验室中合成出全新的抗生素。
其次，合成生物学能够提高现有抗生素的生产效率。
许多抗生素的天然生产过程复杂，产量低，成本高。
通过合成生物学手段，可以对生产抗生素的微生物进行基因工程改造，优化其代谢途径，提高抗生素的产量。
比如，通过增强关键酶的表达，或者引入新的代谢途径，来增加前体物质的供应，从而提高抗生素的合成效率。
此外，还可以利用合成生物学技术将抗生素的生产转移到易于培养和操作的微生物宿主中，实现大规模工业化生产。
再者，合成生物学为抗生素的结构改造和优化提供了有力工具。
利用基因编辑技术，可以对参与抗生素合成的基因进行定点突变，从而改变抗生素的化学结构。
这种结构改造可以改善抗生素的药代动力学性质，如增加其在体内的稳定性、提高生物利用度等；也可以增强其抗菌活性，扩大抗菌谱，甚至克服细菌的耐药性。
例如，通过对青霉素合成基因的改造，成功开发出了一系列半合成青霉素，如氨苄西林、阿莫西林等，它们在抗菌活性和临床应用方面都有了显著的改进。
放线菌抗生素的生物合成机制及其对生态系统的影响
放线菌抗生素的生物合成机制及其对生态系统的影响放线菌是一类产生抗生素的革兰氏阳性菌，被广泛用于抗生素的生产中。
抗生素是一种能够杀死或抑制生长细菌的药物，是世界上最重要的药物之一。
然而，抗生素的过度使用和滥用已经引发了对人类健康和生态系统的潜在危害。
为了更好地理解放线菌抗生素的生物合成机制及其对生态系统的影响，本文将从以下三个方面进行探讨。
一、放线菌抗生素的生物合成机制放线菌能够合成多种具有生物活性的抗生素，包括青霉素、链霉素、土霉素等。
这些抗生素的生物合成机制类似于植物的化学合成途径，其主要步骤包括：1. 基础代谢通路基础代谢通路是所有生物合成途径的基础，也是放线菌生物合成抗生素的必要条件。
在基础代谢通路中，放线菌将碳源、氮源、磷源等物质分解为能够供给细胞能量的化合物。
2. 发酵条件的调节放线菌的生长环境对于抗生素的合成非常重要。
在适当的氧气、温度、pH值和营养成分条件下，放线菌能够合成大量的抗生素。
3. 抗生素的合成途径放线菌抗生素的合成途径可以分为两种：是由核苷酸基因和非核苷酸基因编码的酶催化。
其中非核苷酸基因编码的酶催化被认为是放线菌抗生素生物合成机制的重要驱动力。
二、放线菌抗生素的生态系统影响尽管抗生素在医疗和养殖行业中具有重要的作用，但过度的抗生素使用和滥用已经引发了对人类健康和生态系统的潜在危害。
1. 对人类健康的影响过度使用抗生素会导致菌株的耐药性，使得原本对某一类抗生素能够有效治疗的菌株发生无效。
这会导致严重的公共卫生问题，使得一些重症疾病变得难以治疗。
2. 对生态系统的影响放线菌抗生素不仅对人类健康有影响，对环境也会造成影响。
具体而言，抗生素残留会在自然界中逐渐积累，导致环境中的微生物种群发生变化，进而影响整个生态系统的平衡性。
三、从微生物层面出发，提高抗生素使用效率为了减少抗生素对人类健康和生态系统的危害，我们需要引入一些新的技术手段。
其中，从微生物层面出发，提高抗生素利用率是非常重要的。
请简述抗生素的概念及其主要作用机制。
抗生素的概念及其主要作用机制
抗生素是一种能够抑制或杀灭细菌的药物，由微生物产生，可以用于治疗各种细菌感染疾病。
抗生素可以分为多种类型，如青霉素类、大环内酯类、氨基糖苷类等，每种类型的抗生素都有其独特的作用机制。
抗生素的主要作用机制是通过干扰细菌的生物合成过程来抑制
或杀灭细菌。
具体来说，抗生素可以通过以下方式来抑制或杀灭细菌: 1. 抑制细菌的蛋白质合成：抗生素可以通过抑制细菌的蛋白质合成来杀死细菌。
例如，青霉素类抗生素可以抑制细菌的转肽酶，从而阻止细菌合成蛋白质。
2. 抑制细菌的核酸合成：抗生素可以通过抑制细菌的核酸合成来杀死细菌。
例如，氨基糖苷类抗生素可以抑制细菌的 DNA 聚合酶，从而阻止细菌合成 DNA。
3. 破坏细菌的细胞壁：抗生素可以通过破坏细菌的细胞壁来杀死细菌。
例如，β-内酰胺类抗生素可以抑制细菌的交叉联结酶，从而破坏细菌的细胞壁。
抗生素的应用范围非常广泛，可以用于治疗各种细菌感染疾病，如肺炎、中耳炎、皮肤感染等。
然而，由于抗生素的滥用和过度使用，导致一些细菌产生了抗药性，使得抗生素的治疗效果降低。
抗生素的作用机理
抗生素的作用机理
抗生素是一类可以抑制或杀灭细菌生长繁殖的药物，广泛应用于临床医学领域，对于治疗细菌性感染起着至关重要的作用。
抗生素的作用机理主要涉及以下几个方面：
1. 阻断细菌细胞壁的合成
细菌细胞壁是由多糖组成的保护性外壳，可以维持细菌的形态结构和稳定性。
抗生素中的青霉素类药物可以通过抑制横纹肽交联酶的活性，破坏细菌细胞壁的合成，导致细菌发生溶解和死亡。
2. 干扰细菌核酸的合成
抗生素如利福平属于广谱抗生素，它们能够干扰细菌DNA 或RNA的合成，阻止细菌进行基因复制和蛋白质合成，从而阻碍细菌的正常功能，最终导致细菌死亡。
3. 阻断蛋白质的合成
氨基糖苷类抗生素如庆大霉素可以通过结合细菌核糖体阻断蛋白质的合成，导致细菌的蛋白合成机器受损，细菌无法正常进行代谢活动，最终使细菌死亡。
4. 干扰细胞膜功能
多环芳烃抗生素如利福平，通过影响细菌细胞膜的结构和功能，改变细胞膜的渗透性，干扰细胞内外物质的交换，最终导致细菌死亡。
抗生素在细菌感染治疗中起着关键作用，但由于细菌对抗生素的耐药性逐渐增强，合理使用抗生素、避免滥用和不合理使用抗生素是保护抗生素疗效和推迟细菌耐药性发展的重要措施。
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氧化还原反应2氧化酶（oxydase）
氧化还原反应3加单氧酶（mono-oxygenase）
Cytochrom P450
氧化还原反应4-加双氧酶 （dioxygenase）
加双氧酶-（2-酮戊二酸依赖型） 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase
2-oxoglutaratedependent dioxygenase
MeO O O MeO
MeO
. .
N
CH3
O
. .
O
N
CH3
rotate
MeO MeO
MeO HO MeO MeO N CH3
coupling, rearomatization via enolization, SAM
coupling, rearomatization via enolization, SAM
糖肽类（肽类）： 万古霉素、博莱霉素；
多肽类（肽类）： 多粘菌素、放线菌素D； 氨基糖苷类（糖类衍生物）： 链霉素、卡那霉素、庆大霉素 大环内酯类： 红霉素、螺旋霉素、麦迪霉素、交沙霉素 四环类： 四环素、金霉素、土霉素； 多烯大环类： 两性霉素B、制霉菌素、杀假丝菌素； 核苷类： 阿糖腺苷、嘌呤霉素、多氧菌素、日光霉素；
席夫碱
曼尼希反应
转氨基反应（transamination） -引入氮原子或者失去氮原子
转氨酶
辅酶PLP
脱羧反应（decarboxylation） 脱去一个碳原子
丙酮酸 乙醛
氨基酸脱羧
Beta-酮酸脱羧，体外自发
a-酮酸脱羧
氧化还原反应1脱氢酶（dehydrogenase）
NAD，NADP
FAD，FMN
酶学水平上的生物合成
• 天然产物是药物的主要来源。
• 天然产物结构上的多样性是生物活性多样 化的基础。 • 由PKS和NRPS催化合成的聚酮和聚肽类化合 物是天然产物中非常有特色的一类。 （青霉素， 红霉素，埃博霉素）
聚酮类化合物的生物合成机制
• 以小分子羧酸为前体，由聚酮合酶pks催化合成的 一类天然产物。 • 以红霉素为例的组合生物合成：红 霉 素 的大环 内醋环即6一脱氧红霉内醋(6-deoxyerythronolide B, 6-dEB)的生物合成是由丙酸和甲基丙二酸在复合 酶系一多酮合成酶（PKS）的催化作用下，经缩合、 酮还原、脱水和烯还原等多轮循环完成的。丙酸 和甲基丙二酸均由初级代谢产物分解而来，因PKS 具有脱梭酶的活性，甲基丙二酸脱竣也能产生丙 酸。
radical
(has resonance)
Even mild oxidizing agents (like O2 )can initiate coupling.
OXIDATIVE COUPLING MAKES SIMPLE COMPOUNDS MORE COMPLEX VERY QUICKLY
乙酸途径
• 单元：乙酰辅酶A • 来源：糖酵解 • 酚类、前列腺素类、大环内脂类、脂肪酸类
Erythromycin Biosynthesis
Rifamycin biosynthesis
Tetracycline biosynthesis
莽草酸途径（shikimate pathway）
初级代谢 初级代谢与次级代谢
组合生物合成 (combinatorialbi osynthesis)
• 对自然产物的生物合成路径中编码酶的基 因应用基因操作，重新设计抗生素的结构， 实现新的结构和功能的组合，使其产生新 的活性，进而获得新的产物。
前景
• 应 用组 合 生物合成可以改变抗生素原有的 生物合成过程，使其结构多样化，而这一 点通过化学方法是很难甚至是无法达到的。 因此，这方面的进一步研究将有助于理解 医学上的一些重要二级代谢产物的结构和 功能的关系。相信，随着这一研究方法的 不断发展，人们将能够合成更多抗酸且对 耐药性致病菌具有活性的新的红霉素类物 质，从而使更安全、更有效的药物不断出 现。
C1
C2
C5
C6C3
C6C2N
C4N C5N
吲哚C2N
吲哚C2N+C5+C1
组装机制 天然产物由一系列酶催化产生
• 烃化反应：亲核取代，亲电加成 • 迁移反应：Wagner-meerwein重排 • C-C键形成：羟醛反应（aldol reaction）和 克莱森反应（Claisen reaction） • 希夫碱的形成以及曼尼希反应 • 转氨基反应 • 脱羧反应 • 氧化还原反应 • 糖基化反应
• 抗生素品种从化学结构类别包括（续）：
聚醚类：盐霉素、莫能霉素；（兽药） 蒽环类： 柔红霉素、阿克拉霉素； 醌类： 丝裂霉素C； 甾体类： 羧链孢酸； 安莎类： 利福霉素； 其他： 灰黄霉素、新生霉素、林可霉素、磷霉素、 氯霉素、赤霉素、有效霉素（井岗霉素）。
链霉素
多粘菌素
氧化还原反应5-胺氧化酶 （amine oxidase）
氧化还原反应5酚的氧化偶联（phenolic oxidative coupling）
anion
OH
.. O: ..
-e
()
. .
COUPLING !
at any of the indicated positions
()
.
.. O. ..
()
MeO
N
. .
O
CH3
MeO O
N
CH3
MeO O
MeO OMe
SAM
cularine
AMARYLLIS ALKALOIDS
THREE TYPES
HO HO HO NH
oxidative coupling + other steps
HO HO HO N
A
fold
HO HO NH
OH HO HO N
APORPHINES
MeO HO HO MeO N
(TWO TYPES)
standard benzylisoquinoline
CH3
2 tyrosine
[O]
Note how the benzene ring can rotate around its attachment to make a different substitution pattern.
制霉菌素 红菌素
四环素 嘌呤霉素
莫能霉素
柔红霉素
次级代谢产物的生物合成途径
乙酸途径（acetate pathway） 莽草酸途径（shikimate pathway） 甲羟戊酸途径（mevalonate pathway） 磷酸脱氧木糖途径（deoxyxylulose phosphate pathway）
MeO O MeO O MeO
.
N
.
CH3
HO MeO
N
CH3
coupling
O
(S)-orientalinone
NADPH
MeO HO MeO N CH3 MeO HO MeO N H CH3
MeO HO N CH3
+
(S)-isothebaine
-H2O
MeO HO
H+
orientalinol
CULARINE
1. 烃化反应：亲核取代
L-蛋氨酸
S-腺苷甲硫氨酸 S-adenosylmethionine SAM
SAM作用下的O-烃化及N-烃化
优良的离去基团
SAM作用下的C-烃化
DMAPP作用下的氧烃化
焦磷酸是优良的离去基团
1. 烃化反应：亲电加成
• 分子内和分子间的加成
IPP
GPP
碳正离子产生过程
糖基化反应
SN2
UDPglucose
复杂天然产物生物合成的分子基础
• 复杂天然产物的生物合成是从简单的小分 子前提到终产物形成的多步骤反应。 • 有特定的蛋白酶催化 • 分子水平的研究和基因组计划给复杂天然 产物的合成带来福音：参与复杂天然产物 生物合成的基因，通常特征性的成簇分布 与微生物染色体的某一区域。
OH
B
rotate
OH HO NH OH HO N OH OH
C
Compounds can “fold”, twist rings around, and adopt other conformations before oxidative coupling takes place. This makes interesting bicyclics and some variations in the substitution pattern.
碳正离子的脱去过程
迁移反应：Wagner-meerwein重排
1,2氢迁移，甲基迁移，烃基迁移
羟醛缩合和克莱森反应
Claisen缩合产物
羟醛型产物
生物合成中辅酶A的参与
共振降低a氢酸性
Aldol reaction
Reverse aldol and reverse Claisen
希夫碱的形成以及曼尼希反应
MeO
N
CH3
(+)-corydine
MeO OMe
(+)-glaO HO MeO HO N
From a poppy-relative that grows in China.
standard benzylisoquinoline
CH3
2 tyrosine
[O]
The formation of a beta-keto ester from two esters, one of which has an alphahydrogen atom; malate synthase, citrate synthase, and ATP citrate lyase all catalyze such reactions.