酶促反应机制

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酶催化反应机制及其研究进展

酶催化反应机制及其研究进展

酶催化反应机制及其研究进展酶催化是生命体系中一种重要的化学反应过程。

通过酶催化反应,生物体能够高效地合成、分解有机物质,维持正常的生命活动。

酶催化反应涉及多种生物化学过程,包括代谢环路、信号转导、DNA复制等。

了解酶催化反应机制及其研究进展,对于揭示生命体系的生物化学过程和研究开发新药物具有重要意义。

1. 酶催化反应机制酶催化反应的机制是一种复杂的生物化学过程。

酶是一种生物催化剂,可以加速化学反应的速率,但不改变反应物之间的化学结合能。

酶催化反应的机制一般可以分为两个主要方面:酶与反应底物的相互作用、酶催化过程中的过渡态和中间态。

酶与反应底物的相互作用:酶与反应物相互作用是酶催化反应的第一步,也是反应速率决定步骤。

酶通过其特定的结构与反应底物相互作用,形成酶底物复合物。

酶底物复合物的形成受多种因素影响,如温度、pH值、离子强度、酶浓度等。

酶催化过程中的过渡态和中间态:酶催化过程涉及多种反应中间态和过渡态。

酶与反应物的相互作用形成的酶底物复合物能够稳定反应物之间的化学结合能,从而降低反应能垒。

酶催化反应过程中产生的反应中间态和过渡态对反应的速率和选择性起重要作用。

有些酶能够诱导形成反应中间态,促进反应的进行。

有些酶则能够降低反应的自由能,并引导反应进入能量最低的通道。

2. 酶催化反应的研究进展在过去几十年中,酶催化反应的研究取得了巨大的进展。

随着生物化学和分子生物学技术的不断提高,研究者们能够更深入地了解酶催化反应的机制,并探索酶催化反应对于生命体系的重要性。

其中,一个重要的突破是对酶底物动力学的理解。

通过对酶底物复合物的结构和动力学特征的研究,研究者们能够更好地了解酶如何选择不同的反应底物,并探究反应底物与酶结合的方式和动态特征。

另一个重要的进展是对酶催化机理的理解。

研究者们通过结构生物学和分子动力学模拟等多种手段,探索酶催化过程中的关键反应中间态和过渡态,并发现酶在这些关键中间态和过渡态方面具有非常高的活性和特异性。

酶促反应的机制

酶促反应的机制

酶-底复合物形成时,酶分子构象发生变化,底物分子 也常常受到酶的作用而发生变化,甚至使底物分子发生扭 曲变形,从而使底物分子某些键的键能减弱,产生键扭曲, 有助于过度态的中间产物形成,从而降低了反应的活化能。

诱导底物变形,扭曲,促进了化学键的断裂。
酶中某些基团可使底物分子的敏感键中某些基团的电子 云密度变化,产生电子张力,降低了底物的活化能。 底物与酶结合诱导酶的分子构象变化,变化的酶分子又 使底物分子的敏感键产生“张力”甚至“形变” ,从而促 使酶-底物中间产物进入过渡态。
-OH的亲核催化(胰蛋白酶)
某些通过共价催化机制进行的酶反应

3-磷酸甘油醛脱氢酶
共价中间络合物
酰基-酶
参与共价中间络合物 形成的氨基酸残基
Cys
D-氨基酸氧化酶 乙酰CoA酰基转移酶 Gly咪基转移酶
蔗糖磷酸化酶 转醛醇酶 胰蛋白酶 木瓜蛋白酶 碱性磷酸酯 ATP-柠檬酸解酶 果糖二磷酸醛缩酶 磷酸葡萄糖变位酶 琥珀酰CoA合成酶
氏双曲线。

在底物足够过量而其它条件固定的情况下,并且 反应系统中不含有抑制酶活性的物质及其他不利 于酶发挥作用的因素时,酶促反应的速度和酶浓 度成正比。
(一)、底物对酶促反应的饱和现象:
反应级数
(二)、曲线的基本含义 研究前提
I. II.
单底物、单产物反应; 酶促反应速度一般在规定的反应条件下,用单位时间内 底物的消耗量和产物的生成量来表示; 以内)时的反应速度;
子的排除、排斥,在非极性环境中可显著增高两个带电基团 之间的静电作用,有利于同底物的结合;同时,酶的催化基 团被低介电环境所包围,底物分子的敏感键和酶的催化基团 之间就会有很大的反应力,有利于酶加速反应的。

酶促反应的机制

酶促反应的机制
总结与展望
对酶促反应机制的深入理解
酶的高效性
酶能够显著降低反应的活化能, 从而加速反应速率,其高效性源 于酶与底物之间的特异性相互作 用。
酶的专一性
酶对底物具有选择性,即一种酶 通常只能催化一种或一类特定的 化学反应,这种专一性保证了生 物体内代谢途径的精确调控。
酶的结构与功能关

酶的结构决定了其功能,包括催 化活性中心、底物结合部位以及 酶活性调节部位等,这些结构特 点共同保证了酶的高效催化作用。
酶催化底物发生化学反应的过程
1 2 3
降低活化能
酶通过降低化学反应的活化能,加速反应的进行。 活化能是反应物分子从初始状态到过渡态所需的 最小能量。
酸碱催化
酶可以提供质子或接受质子,从而改变底物的电 荷状态,促进反应的进行。这种催化作用称为酸 碱催化。
共价催化
在某些情况下,酶会与底物形成共价中间物,然 后通过一系列的反应步骤将底物转化为产物。这 种催化作用称为共价催化。
一些酶在细胞内以无活性的酶原形式存在,当需要时,可以通过 特定的信号或条件激活或抑制这些酶原,从而调节酶的活性。
酶抑制剂与激活剂的作用机制
酶抑制剂
酶抑制剂是一类能够与酶结合并降低其活性的物质。它们可以通过竞争性或非竞争性的方式与酶的活 性中心结合,从而阻止底物与酶的结合或降低酶的催化效率。酶抑制剂在药物设计和疾病治疗中具有 重要的应用价值。
针对特定酶的抑制剂设计,可 用于疾病治疗、农药创制以及 环境保护等领域,但需要克服 抑制剂选择性、毒性以及环境 友好性等方面的挑战。
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酶促反应的动力学特征
反应速率与底物浓度关系
在酶促反应中,反应速率与底物浓度呈正相关,符合米氏方程。

酶促反应效率高的原理

酶促反应效率高的原理

酶促反应效率高的原理
酶促反应效率高的原理主要有以下几个方面:
1. 酶的专一性:酶对特定底物具有高度的选择性,只能与特定的底物结合形成酶底物复合物,并催化底物转化为产物。

这种专一性降低了非特定反应的发生概率,从而提高反应效率。

2. 酶的固定化:酶通常被固定在某种载体上,形成酶固定化系统。

这种固定化使得酶能够保持较高的活性和稳定性,在反应过程中不易失活。

同时,酶固定化可以提高酶的浓度,在相同底物浓度下增加酶的有效接触面积,加速反应速率。

3. 酶的催化机制:酶通常通过降低反应的活化能来促进反应进行。

酶底物复合物的形成可以改变底物的反应构象,使得反应路径更有利于产物形成。

此外,酶还可以提供亲和力、电子转移、质子传递等条件,加速反应速率。

4. 反应条件优化:酶促反应的效率还与反应条件有关。

适当的温度和pH值可以保持酶的活性,并提供适合反应进行的环境。

此外,酶促反应还可以通过调节底物浓度、反应时间等参数来提高反应效率。

综上所述,酶促反应效率高的原理主要是由于酶的专一性、固定化、酶催化机制以及反应条件的优化等因素的综合作用。

这些因素使得酶能够高效地催化底物转
化为产物,从而提高反应效率。

酶催化反应的生物催化机制

酶催化反应的生物催化机制

酶催化反应的生物催化机制酶催化反应是生物体内的一项非常重要的反应过程,它能够使生化反应在较低的温度和压力条件下进行,提高反应的速度和效率。

酶催化反应的生物催化机制复杂而多样,下面本文将从酶的特性、酶反应的机理、酶反应的控制等方面来探讨酶催化反应的生物催化机制。

一、酶的特性酶是一种能够催化生化反应的特殊蛋白质,在生物体内起着非常重要的作用。

酶具有很高的催化活性和专一性,能够识别和催化特定的底物,并将其转化为特定的产物。

酶的催化活性在生物温度范围内最高,随着温度的升高会降低酶的活性,甚至会导致酶的变性,失去催化活性。

酶的催化活性与其构象密切相关。

酶的构象是指其三维结构,由多个氨基酸残基组成。

酶的三维结构对酶的催化活性、专一性、稳定性等都有着很大的影响。

酶分子中还存在着许多活性中心,这些活性中心能够与底物产生特定的作用,催化特定的反应。

二、酶反应的机理酶催化反应的机理主要包括两个方面:首先是酶与底物之间的相互作用,然后是在酶底物复合物内发生的底物转化反应。

对于酶催化反应来说,最基本的反应机理是亲和剂理论,即“酶底物复合物稳定”。

其次是求负荷理论,即底物在酶上的位置比在水中更加有利于产生反应。

第三,酶对底物分子的作用是使底物分子达到高能状态,使其更容易发生转化反应。

根据基本酶动力学理论,酶催化反应的速率取决于酶与底物之间的亲和力和酶的催化活性。

此外,生物体内酶催化反应还具有调节和控制作用。

这主要通过调节酶的表达和酶的活性来实现。

例如,酶在局部能够被生物分子(如异宗酶)识别和调控,从而对其催化的反应进行调控,在细胞内起到协同调控的作用。

三、酶反应的控制酶催化反应的控制主要通过以下几种途径来实现:酶底物复合物的浓度、底物的交换速率、底物浓度的变化和底物结构的变化。

其中,酶底物复合物浓度的变化是酶催化反应速率变化的主要原因。

酶底物复合物浓度的变化受到酶浓度和底物浓度的影响。

底物浓度的变化也可以通过控制生物体内配合物来实现,这可以使底物浓度在不同的组织和细胞内发生变化。

酶催化机制的原理

酶催化机制的原理

酶催化机制的原理
酶催化机制的原理是通过酶与底物之间的特异性结合和构象调整,使得底物的转化速率显著提高。

具体来说,酶分子是由氨基酸残基组成的,其中包括了一些特殊的功能残基,如活性位点和辅助基团。

这些功能残基可以与底物分子进行氢键、离子键和范德华力等相互作用,从而使底物能够与酶分子结合形成酶底物复合物。

酶底物复合物的形成不仅可以降低底物的自由能,还可以使底物分子的构象发生调整,使得关键反应的活化能降低,从而促进反应的进行。

酶还可以通过强化过渡态的稳定性,加速反应速率。

除了特异性结合和构象调整,酶还可以通过引入亲电基团、氧化还原反应,或者通过酸碱性基团在反应中接受或释放质子等方式,直接参与催化反应的进行。

总之,酶催化机制的原理主要包括了酶底物复合物的形成和构象调整、过渡态的稳定以及酶催化反应中功能残基的直接参与等多个方面。

这些机制相互作用,最终实现了酶对底物的高效催化。

酶促反应的作用机制

酶促反应的作用机制

酶促反应的作用机制嘿,朋友们!今天咱们来聊聊酶促反应这个超酷的东西。

你可以把酶想象成超级英雄,而底物呢,就像是陷入困境的小市民。

酶促反应就像是一场精心编排的救援行动。

酶这个超级英雄有着独特的形状,那形状就像是为底物量身定制的魔法口袋。

底物呢,懵懵懂懂地在细胞这个大城里晃悠,一旦碰到了酶这个超级英雄,就像小绵羊找到了牧羊人,乖乖地被酶的特殊结构“吸”了过去,这就是酶和底物的特异性结合,就像钥匙和锁一样精准,要是底物这个小迷糊有点小变形,还进不去呢,酶就会傲娇地摆摆手:“你不是我要救的那个小可怜,一边去。

”然后呢,酶开始施展它的魔法啦。

这个过程就像是厨师在做菜,酶像大厨一样,挥舞着它的魔法小铲子(活性中心),把底物这个原材料进行改造。

酶让底物发生反应的速度那叫一个快啊,就像闪电侠在奔跑,底物还没反应过来呢,就已经被酶改造成产物了。

如果没有酶这个大厨,底物自己反应就像乌龟爬,慢得要死,可能等个天荒地老都看不到结果。

而且啊,酶这个超级英雄还特别节约能量。

就像一个超级会过日子的小能手,它不会像那些没头没脑的暴力分子,靠大量能量去推动反应。

它就用一点点小能量,像巧妙地拨动一个小机关,就把整个反应带动起来了。

在这个反应过程中,酶就像一个经验丰富的老工匠,它对待底物小心翼翼,不会把底物搞得乱七八糟。

它按照一定的规则,就像按照古老的工艺秘籍,把底物转化成完美的产物。

有时候呢,酶还会和其他小伙伴合作,就像复仇者联盟一样。

几个酶联合起来,共同应对那些复杂的底物,每个酶发挥自己的特长,就像钢铁侠负责高科技,美国队长负责指挥,把底物这个大反派打得落花流水,然后生产出各种各样有用的产物。

一旦反应完成,酶这个超级英雄又可以去寻找下一个底物小市民啦,就像一个忙碌的救火队员,在细胞这个城市里到处奔波,拯救那些需要反应的底物。

酶促反应就是这么神奇又有趣的一个过程,它就像一场细胞里的魔法秀,而酶就是那个掌控魔法的神奇魔法师。

怎么样,朋友们,现在是不是觉得酶促反应超级酷呢?。

植物物质代谢中的酶促反应机制研究

植物物质代谢中的酶促反应机制研究

植物物质代谢中的酶促反应机制研究植物是地球上最重要的生物之一,其在生态系统中占据着至关重要的地位,对于人类的生存和大自然的平衡起着不可估量的作用。

而植物的生长与代谢涉及到大量的生物化学反应,其中酶促反应便是其中一个十分重要的环节。

本文将从植物物质代谢的角度,探讨酶促反应机制的研究进展。

一、植物代谢中酶促反应的重要性植物代谢的过程是一个高度复杂的化学反应网络,并涉及到各种物质代谢途径。

其中,许多代谢通路都需要通过酶促反应来完成,包括碳酸循环、糖原合成、脂肪酸合成和氨基酸代谢等。

这些酶促反应对于植物的生存和繁殖都至关重要,因为它们直接影响着植物的生长、发育、产量和品质等方面。

酶是催化生物化学反应的重要分子,由蛋白质构成,可加速化学反应速率。

在植物细胞内,酶扮演着重要的角色,协助调节代谢通路的速率和产物的分配比例。

根据最新研究,植物代谢过程中涉及的酶已经超过20万种,这些酶对于植物生命的各个方面都至关重要。

因此,研究酶促反应机制成为了植物生物学和农业科技研究的热点方向之一。

二、植物酶促反应机制的研究进展随着生物技术和分子生物学的不断发展,人们开始逐渐深入探究酶促反应在植物代谢中的作用。

现代分子生物学技术的飞速发展,为揭示酶促反应机制提供了强有力的工具。

1. 酶的结构解析酶的结构解析是揭示酶促反应机制的关键之一。

随着X射线晶体学和核磁共振技术的发展,科学家们已经成功地解析了大量酶的三维结构,从而揭示了酶分子催化机制的关键特征。

例如,近年来发表的一篇名为《侧片状甜菜碱合成酶和5-氮杂底物的共价中间体》的论文,通过结合分子动力学模拟和生化实验等多种手段,揭示了侧片状甜菜碱合成酶(BvMTT2)催化反应的分子机制。

该研究为揭示植物中酶促反应机制提供了有力的实验支持。

2. 酶的功能解析酶的功能解析是酶促反应机制研究的另一个重要内容。

通过分离纯化、克隆和基因工程等手段,研究人员可以获得纯化的酶,进一步了解其催化反应的具体过程。

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Vr= k-1 [ES] 在反应达到平衡时,正反应速度等 与逆反应速度:
k1 [E] ·[S] = k-1 [ES]
自由酶浓度等于总酶浓度减去结合酶
k1 ([E] total -[ES]) ·[S] = k-1 [ES]
([E] total -[ES]) ·[S] =
[ES]
k-1 k1
= Ks
∴ [ES] = [E] total ·[S]
Catalytic Essential group groups of Binding enzyme in group active site
溶菌酶的活性中心
第二节 酶促反应的特点和机制
酶在化学反应前后质与量均未改 变,只能加速可逆反应的进程, 而不能改变反应的平衡点。
一、酶促反应的特点
(一)酶促反应具有极高的效率 降低活化能
金属酶:结合紧密 金属激活酶:不甚紧密 辅酶:结合松散,可透析超滤去出 接受基团或质子后离开酶蛋白。 辅基:结合紧密,不可透析超滤去 出,不离开酶蛋白。
二、酶的活性中心
必需基团:酶分子氨基酸侧链上一 些与酶活性密切相关的化学基团。 酶的活性中心:酶分子一些一级结 构上可能相差很远的必需基团,在 空间上互相靠近,组成具有特定空 间结构的区域,能与底物特异性结 合,并将底物催化成产物。
因素包括:酶浓度,底物浓度, pH,温度,抑制剂和激动剂等。
一、底物浓度对反应速度的影响
米氏方程的修正
[ES] 的生成速度 = k1 [E] ·[S] = k1 ([E] total -[ES]) ·[S]
[ES] 的分解速度 = k-1 [ES] + kcat ·[ES] k1 ([E] total-[ES]) ·[S]=k-1[ES]+ kcat ·[ES]
经整理: ∴ [ES] =
k1 ·[E] total ·[S] k1 ·[S] + k-1+ kcat
= [E] total ·[S]
k-1+ kcat k1
+ [S]
设:Km =
k-1+ kcat k1
则:v = kcat ·[ES Nhomakorabea = kcat ·[E] total ·[S] Km + [S]
与 [S] 成正比
Km 和Vmax 的意义
Km 1,反应速度达到最大反应速度一
半是的底物浓度 2,表示酶和底物的亲和程度 3,km是酶的特征常数之一 Vmax 是酶完全被底物饱和时的反 应速度
双倒数作图法
双倒数作图法
0
1/[S]
Hanes-Woolf 作图法
0
[S]
Eadie-Hofstee作图法 (v对v/[S]作图法)
当反应速度达到最大反应速度的一半 时: Km = [S]
米氏方程的推导
V0 = kcat [ES].
(2)
[ES] = [E]total . (最大反应速度应该是
所有酶均与底物结合时的速度)
Vmax = kcat [E]total .
(3)
正反应速度为:
Vf = k1 [E] ·[S] 逆反应速度为:
3,反竞争性抑制作用
反竞争性抑制的反应式
反竞争性抑制的双倒数作图法
反竞争性抑制 剂存在时,Vmax 降低,Km 亦 降低。
各种可逆性抑制作用的比较
结合部位 Km
Vmax
无竞争剂 竞争性抑制 非竞争性抑制 反竞争性抑制
E E , ES ES
Km 增大 不变 减小
Vmax 不变 减小 减小
六、激活剂对反应速度的影响
Vmax对Km作图法
表2-1 四种作图法特征比较
作图方 式
1/v~ 1/[S] [S]/v~ [S]
斜率
Km/ Vmax
1/ Vmax
v~v/[S] -Km
Vmax ~Km
v/[S]
纵轴截 横轴截


1/ Vmax
-1/Km
Km/ Vmax
-Km
Vmax
Vmax /Km
v
[S]
二、酶浓度对反应速度的影响
Ks + [S]
v = kcat ·[ES] = kcat ·[E] total ·[S] Ks + [S]
∵ Vmax = kcat ·[E]total
∴ v = Vmax ·[S] Ks + [S]
当 [S] >> Ks 时, v ≈ Vmax
当 [S] << Ks 时, v ≈
Vmax ·[S] Ks
论述题:
1,简述膜的流动镶嵌学说
2,简述膜蛋白的分类
3,试推导米氏方程并简述Km及Vmax的意义
4,当S=0.5Km; S=4Km; S=9Km; S=9.9Km时, 计算反应速度分别达到Vmax的百分之几?
5,以双倒数做图法画出竞争性、非竞争性 和反竞争性抑制作用的特征曲线,并说 明各曲线中Km及Vmax的变化。
第三章 酶
酶是生物催化剂
蛋白酶 酶
核酶:RNA核酶,DNA核酶
第一节 酶的分子结构与功能
酶是蛋白质,同样具有一、二、三 甚至四级结构。 单体酶:仅具有三级结构 寡聚酶:多个相同或者不同的亚基 多酶体系:有几种不同的酶聚合 多功能酶:多种不同催化功能在一 条多肽链上。
一、酶的分子组成
单纯酶:仅由多肽链构成
变构酶: 催化亚基 调节亚基
变构激活剂 变构抑制剂
单底物酶与 异构酶的反 应速度曲线
肌红蛋白和血红蛋白的结构
酶的共价修饰调节:可逆性的共 价结合某些化学基团,从而改变 酶的活性。
磷酸化 脱磷酸化
二、酶含量的调节
(一)酶蛋白合成的调节 诱导 阻遏
(二)酶蛋白降解的调节
三、同工酶
同工酶:是指催化的化学反应相 同,但酶蛋白的分子结构,理化 性质或免疫学性质不同的一组酶
(二)酶促反应具有高度的特异性 绝对专一性 相对专一性 立体异构专一性
(三)酶促反应的可调节性
二、酶促反应的机制
(一)酶与底物复合物的形成与 诱导契合假说 (二)酶促反应的机制
邻近效应与定向排列 多元催化 表面效应
诱导契合假说
第二节 酶促反应动力学
酶促反应动力学是研究梅促反应速 度及其影响因素的。
必需基团有两类: 结合基团:结合底物和辅酶 催化基团:影响底物的稳定性
酶的活性中心是酶分子中具有三 级结构的区域,如裂缝或凹陷, 可由疏水性氨基酸的基团组成疏 水口袋。
Essential groups of enzyme out of active site
peptide substrate
active site
随着酶浓度的增 加,反应速度成 正比变化。
三、温度对酶促反应的影响
四、pH 对酶促反应的影响
五、抑制剂对反应速度的影响
抑制剂:凡是能使酶的催化活性 下降而不引起酶蛋白变性的物质。
可逆性抑制 不可逆性抑制
(一)不可逆性抑制
不可逆性抑制:抑制剂通常与酶 的活性中心上的必需基团以共价 键结合,使酶失活。 不能用透析,超滤等方法除去。
农药可使酶失活解磷定可以解毒
(二)可逆性抑制
可逆性抑制:抑制剂通常与酶 通过非共价键结合,使酶失活。 能用透析,超滤等方法除去。
竞争性抑制作用 非竞争性抑制作用 反竞争性抑制作用
1,竞争性抑制作用
竞争酶的活性中心
竞争性抑制的反应式
PABA FH2
磺胺类药物竞争性抑制酶的活性
竞争性抑制作用
竞争性抑制的 动力学关系
酶蛋白
结合酶
辅酶
辅助因子 (全酶) 金属离子
辅基
或小分子有机物
酶蛋白决定反应的特异性 辅助因子决定反应的种类与性质 金属离子是最多见的辅助因子。 小分子有机化合物是一些化学稳 定的小分子物质,主要作用是参 与酶的催化过程,在反应中传递 电子,质子或一些基团。
酶蛋白与辅助因子结合形成的复 合物成为全酶。
激活剂:使酶从无活性变为有 活性或使酶的活性增加的物质。
必需激活剂 非必需激活剂
第四节、酶的调节
一、酶活性的调节
酶原的激活 变构酶 酶的共价修饰调节
酶原的激活:体内的酶以无活性 的酶原形式存在,在一定条件下, 水解几个肽键,使酶分子的构象 发生改变,表现出活性。
酶原的激活实际上是酶的活性中心 形成和暴露的过程。
如:乳酸脱氢酶
第六节 酶与医学的关系
一、酶与疾病的关系 二、酶与疾病的诊断 三、酶与疾病的治疗
二、酶在医学上的应用
(一)酶作为试剂用于临床检验 (二)酶作为药物用于临床治疗
名词解释: 1,脂质体 2,内在蛋白(整合蛋白) 3,外周蛋白(外在蛋白) 4,脂锚定蛋白 5,米氏常数 6,竞争性抑制作用 7,非竞争性抑制作用 8,反竞争性抑制作用
竞争性抑制的双倒数作图法 竞争性抑制的 Hanes-Woolf 作图法
竞争性抑制剂存在时,Vmax 不变, Km 值增大
Dixon 作图
2,非竞争性抑制作用
竞争酶的活性中心以外的必须基团
非竞争性抑制的反应式
非竞争性抑制的双倒数作图法 非竞争性抑制的 Hanes-Woolf 作图法
非Km竞值争不性变抑。制剂存在时,Vmax 降低,
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