荧光定量PCR实验操作流程

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荧光定量PCR实验操作流程

荧光定量PCR实验操作流程

荧光定量PCR实验操作流程1. 检查实验室条件在进行荧光定量PCR实验前,首先要检查实验室的环境是否适合实验。

实验室应该保持干燥、清洁和无菌。

检查PCR仪和读板器是否能正常运转,并准备所有必需的试剂和器械。

2. DNA/RNA的提取和纯化从组织和细胞中提取和纯化DNA/RNA是实验的第一步。

在提取和纯化DNA/RNA的过程中,需要保持无菌和正确的技术。

同时需要注意使用适当的缓冲液和酶切剂,以避免DNA/RNA的损伤和降解。

3. DNA/RNA质量检测检测DNA/RNA的质量和浓度,以确保实验结果的准确性。

可以使用紫外线光谱仪或其他质量检测设备。

同时,需要记录下每个样本的质量和浓度值。

4. 反转录如果需要检测RNA,需要首先进行反转录(Reverse Transcription,RT)。

反转录反应将RNA转录成相应的cDNA,可以使用逆转录酶和随机引物进行反转录反应。

5. 荧光定量PCR反应体系和引物设计荧光定量PCR反应体系包括模板DNA/RNA,荧光探针,引物和PCR反应缓冲液。

引物的设计是至关重要的,需要确保引物与目标序列的特异性和敏感性。

引物的设计可以使用NCBI或其他引物设计软件进行。

6. PCR反应设置PCR反应参数:温度梯度,反应时间和DNA量,浓度和样本装载量等。

注意反应器核心温度的控制,以确保反应的准确性和重复性。

7. 数据分析使用荧光定量PCR的结果进行数据分析。

可以使用数据分析软件,例如GenEx或其他软件。

计算出每个样本的阈值循环数(Ct值),并使用标准曲线法进行定量计算。

总之,荧光定量PCR是一种高灵敏度和高特异性的分子生物学检测技术,不仅可以用于基础研究,还可以用于临床诊断和治疗监测等领域。

在实验前需要认真准备,操作流程中需要注意无菌和正确的技术,以确保实验结果的准确性。

荧光定量PCR实验操作流程

荧光定量PCR实验操作流程

荧光定量PCR实验操作流程1、实验器材多样品研磨珠均质仪台式高速冷冻型微量离心机荧光定量PCR仪超净工作台分光光度计离心管TIP头2、主要实验试剂及耗材RNA提取液三氯甲烷异丙醇无水乙醇引物75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制离心管、TIP头均购湿热灭菌40min,干燥。

二、荧光定量PCR实验步骤1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。

2)取100mg组织,加入到匀浆器中。

3)充分研磨直至无可见组织块。

4)12000rpm离心10min取上清。

5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管15s,充分混匀,静置3min。

6)4℃下12000rpm离心10min。

7)将上清转移到一新的离心管中,加入0.8倍体积的异丙醇,颠倒混匀。

8)-20℃放置15min。

9)4℃下12000rpm离心10min,管底的白色沉淀即为RNA。

10)吸除液体,加入75%乙醇1.5ml洗涤沉淀。

11)4℃下12000rpm离心5min。

12)将液体吸除干净,将离心管置于超净台上吹3min。

13)加入15μl无RNA酶的水溶解RNA。

14)55℃孵育5min。

15)使用UV1800检测RNA浓度及纯度:仪器空白调零后取2.5μl 待测RNA溶液于检测基座上,放下样品臂,使用电脑上的软件开始吸光值检测。

16)将浓度过高的RNA进行适当比例的稀释,使其终浓度为200ng/μl.左右。

2、反转录(枪头和PCR均经过湿热灭菌,无RNA酶)1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。

2)加入1μl 逆转录引物。

3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。

4)于PCR仪上65℃保温5min,迅速置冰上冷却。

5)依次加入4μl 5×buffer,2μl 10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反转录酶,用枪抽吸混匀。

荧光定量pcr实验步骤

荧光定量pcr实验步骤

荧光定量pcr实验步骤荧光定量PCR实验步骤引言:荧光定量PCR(qPCR)是一种广泛应用于生物学研究和临床诊断的技术,可用于准确、快速地定量检测DNA的含量。

本文将介绍荧光定量PCR实验的步骤,以及注意事项和数据分析方法。

一、实验准备1. 准备所需试剂和仪器:包括PCR反应体系的各种试剂(如引物、探针、酶等)和实时荧光定量PCR仪。

2. 根据实验设计,制定合适的实验方案。

确定需要扩增的目标序列,设计引物和探针。

二、样品处理1. 提取待测样品中的DNA,确保提取得到高质量的DNA。

可以使用商业DNA提取试剂盒进行提取,按照厂家说明进行操作。

2. 测定DNA的纯度和浓度,确保测量到的DNA适用于PCR扩增反应。

使用比色法或分光光度计检测DNA的纯度和浓度。

3. 对提取得到的DNA进行稀释,以便在PCR反应中使用。

确保稀释后的DNA浓度恰当,以避免PCR反应的干扰。

三、荧光定量PCR反应体系的准备1. 根据实验设计和目标序列的长度,计算出所需的试剂和反应体系的配比。

2. 根据计算结果,将引物、探针和模板DNA按照适当的比例加入PCR反应管中。

注意保持反应管的清洁和无菌。

3. 加入合适的PCR反应缓冲液、酶和核酸酶抑制剂等试剂。

根据实验设计的需要,可以在反应体系中添加适当的试剂,如酶切酶、胶束等。

四、PCR扩增反应1. 将PCR反应管放入实时荧光定量PCR仪中,设置好PCR反应的程序和参数。

通常包括预热、变性、退火和延伸等步骤。

2. 启动PCR反应,开始扩增。

在反应过程中,实时监测PCR产物的荧光信号强度,并记录下来。

五、数据分析与结果解读1. 在实时荧光定量PCR仪中,可以实时获得PCR反应体系中荧光信号的强度和变化趋势。

根据实验设计的需要,可以选择合适的荧光信号通道进行监测。

2. 根据荧光信号和PCR反应的周期数,可以绘制荧光增幅曲线。

通过观察曲线的形态和特征,可以初步判断PCR反应的特异性和效果。

荧光定量PCR实验使用方法

荧光定量PCR实验使用方法

第一部分一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备;二、技术关键:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;从/网点的genbank中下载所需要的序列。

下载的方式有两种:一为打开某个序列后,直接点击“save”,保存格式为“.txt”文件。

保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。

然后,再打开DNAstar软件中的Editseq软件,点击“file”菜单中的“import”,打开后点击“save”,保存为“.seq”文件。

另一种直接用DNAstar 软件中的Editseq软件,点击“file”菜单中的“open entrez sequence”,导入后保存为“.seq”文件,保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。

然后要对所有的序列进行排序。

用DNAstar软件中的Seqman软件,点击“sequence”菜单中的“add”,选择要比较的“.seq”的所有文件,点击“add”或“add all”,然后点击“Done”导入要比较的序列,再点击“assemble”进行比较。

横线的上列为一致性序列,所有红色的碱基是不同的序列,一致的序列用黑色碱基表示。

有时要设定比较序列的开始与结尾。

有时因为参数设置的原因,可能分为几组(contig),若想全部放在一组中进行比较,就调整“project”菜单下的“parameter”,在“assembling”内的“minimum math percentage”默认设置为80,可调低即可。

再选择几个组,点击“contig”菜单下的“reassemble contig”即可。

选择高低的原则是在保证所分析的序列在一个“contig”内的前提下,尽量提高“minimum math percentage”的值。

荧光定量PCR操作流程

荧光定量PCR操作流程

荧光定量PCR操作流程1.目的基因引物的合成设计合成200-300bp目的基因片段的引物,利用primer 5.0引物设计工具或者手工合成,引物合成过程中注意上下游的Tm值要相似、GC碱基在上下游的引物里均匀、引物与模板序列紧密互补、引物间避免形成稳定的二聚体或发夹结构等事项。

2 总RNA提取(1)准备研钵(灭菌)、离心管(1.5ML),枪头、手套(一次性)、异丙醇、乙醇,三氯甲烷2)取适量家蚕组织,加液氮充分研磨;匀浆加1ml RNAiso Plus后匀浆;3)室温放置5min (可在-70℃下保存1个月)4)加0.2ml氯仿(chloroform),振荡混匀,室温放置5分钟;5)12000g,15min,4℃;6)取上清(约0.6ml),加与上清等体积异丙醇,室温放置10分钟;7)12000g,10min,4℃;8)取沉淀(RNA呈胶状沉淀),加1ml 75%乙醇(可在-20℃保存1年)洗涤;9)12000g,5min,4℃;10)取沉淀,室温干燥10min;11)溶解于DEPC处理水中12)-80℃保存,尽快使用,或在8)保存。

3 反转录(TOYOBO试剂盒)Nuclease-free water up to 10ul5ⅹRT buffer 2ulRT Enzyme Mix 0.5ulPrimer Mix 0.5ulRNA 0.5-1ug4定量PCR反应(本实验室7300系统)SYBR 10ulForward Primer 1ulReverse Primer 1ulROXⅠ 0.4ulc DNA模板2ul一个模板重复三次以尽量减小误差;每个模板都要设内参。

内参是生物体或者细胞中稳定表达的基因,表达量几乎不变。

而后按照试剂盒说明操作流程设定仪器参数即可。

abi quantstudio 荧光定量pcr仪操作规程

abi quantstudio 荧光定量pcr仪操作规程

abi quantstudio 荧光定量pcr仪操作规程以下是abi quantstudio 荧光定量pcr仪的操作规程:1. 打开仪器:确保电源线插入到电源插座中,按下电源开关,荧光定量PCR仪开始启动。

启动完成后,屏幕会显示主界面。

2. 准备样品:将待测样品按照实验方案进行处理和准备,包括提取和纯化核酸、制备反应体系等,确保样品标签的正确性。

3. 设置反应模板:在主界面上选择“新建实验”的选项,并选择荧光定量PCR反应模板。

根据实验需求设置反应模板,包括样品的位置、引物和探针的浓度和体积等。

4. 加载样品:根据设置的标本位置,使用注射器或微量移液器将样品逐一加载到相应的孔中。

确保每个孔都正确对应到相应的标本。

5. 设置PCR反应参数:通过点击“设置反应参数”按钮,进入PCR反应参数设置界面。

根据实验需求设置温度、时间和周期等参数。

设置完成后,保存反应参数。

6. 开始PCR反应:点击“开始实验”按钮,启动PCR反应。

仪器会自动根据设置的参数进行PCR反应。

在PCR反应过程中,可实时监测反应的进展和荧光信号的变化。

7. 数据分析:PCR反应结束后,仪器会自动停止反应。

通过点击“数据分析”按钮,可查看PCR反应结果,包括荧光信号曲线、阈值循环数和浓度等数据。

可以保存数据文件或导出结果。

8. 关机:实验结束后,点击主界面上的“关机”选项,按照仪器提示进行关机操作。

拔下电源线,清理实验平台和反应模板,保持仪器的整洁。

以上是abi quantstudio 荧光定量pcr仪的操作规程,一定要按照实验方案和操作规程进行实验,以保证实验结果的准确性和可靠性。

实时荧光定量PCR具体实验步骤

实时荧光定量PCR具体实验步骤

实时荧光定量PCR具体实验步骤
实时荧光定量(Real Time quantitative PCR)是检测RNA或DNA的一种常用技术,通过检测特定目标的增加(或减少),可以用来测定RNA 或DNA的表达水平,或者基因等的转录水平。

下面我们就对实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的实验步骤进行具体介绍。

1.搭建实验
第一步是搭建实验,即准备实验所需的干燥试剂,第二步是准备RNA 样本,第三步是准备标准曲线,最后是根据实验需要准备实验板和实验试管。

2、RNA样品提取
在实验中,会使用到多种RNAs,一般情况下使用TRIzol或Phenol 抽提方法进行RNA抽提,不同的细胞、组织中RNA的杂质含量不一样,因此需要根据实验需求进行适当调整抽提浓度。

3、RT-qPCR反转录
在RT-qPCR反转录之前,首先要准备反转录试剂,一般采用qPCR反转录试剂盒,这种试剂盒含有足够的反转录荧光探针以及反转录引物,它可以有效帮助反转录过程。

反转录过程通过复制DNA片段的过程完成,最终转录出的cDNA存在细胞核中。

4、qPCR扩增实验
qPCR扩增实验是在反转录完成后进行,一般来说,这个步骤可以采用qPCR扩增试剂盒,该试剂盒中包含所需的扩增物质如DNA聚合酶、前驱核苷酸、dNTPs,检测细胞核中的cDNA。

qpcr的操作流程

qpcr的操作流程

qpcr的操作流程
实时荧光定量PCR(qPCR)是一种高效、准确的分子生物学技朧,广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因型鉴定等领域。

下面将介绍qPCR的操作流程。

1. 样品处理:首先需要从样品中提取RNA或DNA,并进行适当
的纯化处理。

确保提取的核酸质量和浓度符合实验要求。

2. 质控检测:对提取的核酸进行质控检测,包括测定纯度、浓
度和完整性。

确保核酸的质量符合实验要求。

3. 反转录:对RNA进行反转录反应,将RNA转录为cDNA。


转录反应需要使用逆转录酶和引物,确保反转录产物的质量和完整性。

4. 准备qPCR反应体系:根据实验设计和引物设计,准备qPCR
反应体系。

包括模板DNA或cDNA、引物、探针、核酸酶、缓冲液等。

确保反应体系的配比准确。

5. 进行qPCR反应:将准备好的反应体系加入到qPCR仪器中,
进行PCR扩增反应。

根据实验设计和引物特性,设置合适的PCR程
序和参数。

6. 数据分析:分析qPCR反应的数据,包括计算Ct值、绘制标
准曲线、计算目标基因的相对表达量等。

确保数据的准确性和可靠性。

7. 结果解读:根据数据分析结果,解读实验结果。

判断目标基因的表达水平、基因型等信息,为后续实验和研究提供参考。

总的来说,qPCR操作流程包括样品处理、质控检测、反转录、准备反应体系、进行PCR反应、数据分析和结果解读等步骤。

通过严格的实验设计和操作规范,可以获得准确、可靠的实验结果,为分子生物学研究提供重要的数据支持。

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细胞RNA提取
5. 洗涤:
将吸附柱置于一个新的无RNase离心管(CollectionTube1.5ml)中向吸附柱的 中间部位加入30-50μl• RNase-FreeWater,室温放置1min,12,000rpm离心1min, 收集RNA溶液,进行后续试验或-70℃保存RNA,防止降解。• 注意:1)RNase-FreeWate体积不应小于30μl,体积过小影响回收率。 • 2)若提高RNA的产量,可用30-50 μl新的RNase-FreeWater重复步骤5。 • 3)若提高RNA浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,重复步骤5。•
人cDNA RNase-Free Water
0 μl 57.6 μl
2 μl 7.2 μl
3. 将配制的预混体系,分装到八连管中。共加6个孔,每个孔中加 入18 μl的预混体系。
荧光定量PCR
4. 模板加入:
每个孔中分别加入2 μl模板,加样顺序如下:
加样孔 样品 1 原液 2 稀释10倍 3 稀释100 倍 4 稀释1000 倍 5 稀释10000 倍 0 水
6. RNA检测:
用ddH2O,对仪器进行调零;取1ul的RNA溶液进行测定;
测定样品纯度和浓度。
纯度:OD260/OD280 = 1.9-2.1 <1.8 蛋白质或酚类污染 >2.2 RNA水解 浓度:RNA(ug/ml)=40﹡OD260*稀释倍数
逆转录
实验材料:HiFi-MMLV cDNA第一链合成试剂盒,RNA 实验步骤:
荧光定量PCR
北京康为世纪生物科技有限公司
细胞RNA提取
样品:293T细胞 试剂:超纯RNA提取试剂盒、氯仿、70%乙醇 方法:柱式
原理:
• • 细胞在变性剂异硫氰酸胍的作用下被裂解,核蛋白体上的蛋白变性,核酸释放。 释放出来的DNA和RNA由于在特定pH和盐浓度下溶解度的不同而分别位于整个 体系中的中间相和水相,从而得以分离。
Thank You !
加入体 积
2 μl
2 μl
2 μl
2 μl
2 μl
2 μl
5. 混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。 6. PCR反应程序:
步骤 预变性 变性 退火/延伸 融解曲线分 析 温度 95℃ 95℃ 60℃ 95℃ 60℃ 95℃ 60℃ 时间 10min 15s 1 min 15s 1 min 15s 15s 注意事项: 1.首先配制预混体系,再将预混体系分 装到八连管中。 2. 稀释模板时,需要混匀。 不要直接在八连管管壁或管盖上做标
原液 5 μl (从1号管取) 5 μl(从2号管取) 5 μl(从3号管取) 5 μl(从4号管取)
6
45ul
对照
荧光定量PCR
2. 配制PCR预混反应体系:
做5个样本,配制8个样本的预混体系,配制方式如下:
试剂 2×UltraSYBR Mixture Forward Primer,10 µ M Reverse Primer,10 µ M 配制的8个孔的预混 体系 80 μl 6.4 μl 20 μl反应体系 10 μl 0.8 μl
材料:2×UltraSYBR Green Mixture,cDNA,actin引物
实验步骤:
1. 稀释模板:每稀释一个倍数,需要将溶液混匀,并短暂离心。
编号
1 2 3 4 5
模板稀释 倍数
1倍 10倍 100倍 1000倍 10000倍
水用量
0ul 45 μl 45 μl 45μl 45 μl
模板用量
细胞RNA提取
3. 过柱子:
吸取上层水相,至新的RNase-Free管中(注:不要吸到中层) 加入等体积70%的乙醇,颠倒混匀; 将溶液全部加入到已装入收集管(CollectionTube 2ml)的吸附柱 (Spin• Column RM)中。若一次(700ul)不能加完溶液,可分多次入; 12,000rpm离心20s,弃废液,将吸附柱重新放回收集管中;
1. 将 RNA模板、Primer Mix、dNTP Mix、DTT、RT Buffer、HiFi-MMLV和
RNase- Free Water溶解并置于冰上备用。
2. 根据以下表格配置反应体系,总体积为20 μl。
试剂 dNTP Mix,2.5 mM Each Primer Mix RNA Template 5×RT Buffer DTT,0.1 M HiFi-MMLV,200 U/μl RNase-Free Water 20 μl 反应体系 4 μl 2 μl 2 μl 4 μl 2 μl 1 μl 5 μl
4. 洗涤:
向吸附柱加入700 μl Buffer RW1,12,000rpm离心20s,倒掉收集管中的废液, 将吸附柱重新放回收集管中; 向吸附柱中加入500μl• Buffer• RW2(使用前检查是否已加入无水乙醇), 12,000rpm离心20s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中; 重复步骤8;12,000rpm离心2min,弃废液,吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干;
冰上配制 短暂离心
42℃ 50min 70℃ 15min
逆转录
3. 涡旋震荡混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
4. 42℃孵育3Байду номын сангаас~50分钟,70℃孵育15分钟。反应结束后,短暂离心,置于
冰上冷却。 5. 逆转录产物可直接用于PCR和荧光定量PCR,或置于-20℃长期保存。
荧光定量PCR
细胞RNA提取
1. 裂解: 细胞悬液离心,倒掉上清,加入1ml RLT; 反复吹打,使样本充分裂解; 室温放置5min,使核酸蛋白复合物完全分离 2. 抽提: Ø 加入200ul氯仿,剧烈振荡15s,室温放置2min; Ø4℃ 12,000 rpm 离心10分钟,此时样品分为三层; 上层无色水相, 中间白色蛋白质相, 下层红色有机相, RNA在上层水相中
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