凝胶电泳实验报告模板
凝胶电泳成像实验报告

凝胶电泳成像实验报告凝胶电泳成像实验报告一、实验目的和原理本次实验的目的是通过凝胶电泳成像的方法,对DNA样品进行分离和检测。
凝胶电泳是一种将DNA、RNA或蛋白质等生物大分子按照大小分离的方法。
凝胶电泳的原理是利用电场作用力将带电生物大分子移动,使其在凝胶介质中分离成不同的带状图案。
二、实验器材和试剂实验器材:凝胶电泳仪、电源、电极、试管、显微镜、CCD成像仪等。
实验试剂:DNA样品、电泳缓冲液、琼脂糖、DNA标记物等。
三、实验步骤1. 准备工作:将琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,并加热至沸腾。
2. 制备样品:将待检测的DNA样品加入到琼脂糖缓冲液中,并充分混合均匀。
3. 装填凝胶:将制备好的琼脂糖混合液倒入凝胶槽中,并在两端装入电极。
4. 电泳分离:将电极接入电源,设定电压和时间,开始进行电泳。
5. 成像观察:将电泳结束后的凝胶放置在显微镜下,利用CCD成像仪进行成像观察。
6. 结果分析:根据成像结果,对DNA样品进行分析和判断。
四、实验结果根据实验操作和成像观察,我们得到了一幅DNA样品的凝胶电泳成像图。
在该图中,我们观察到了多个带状图案,每个带状图案代表着不同大小的DNA片段。
并根据DNA标记物,我们可以进一步确定每个DNA片段的大小和浓度。
五、实验总结通过本次凝胶电泳成像实验,我们成功地对DNA样品进行了分离和检测。
凝胶电泳成像是一种常用的生物分子分离技术,具有简单、快速、准确的特点。
通过实验结果的观察和分析,我们可以获得有关生物大分子的信息,为后续的实验和研究提供参考和依据。
六、存在问题和改进方向在本次实验中,由于时间和条件限制,我们只使用了DNA样品进行了凝胶电泳成像。
在之后的实验中,我们可以尝试使用RNA或蛋白质样品进行凝胶电泳,以获得更多有关生物分子的信息。
另外,在电泳和成像过程中,我们还需要更加精确和准确地操作,以提高实验结果的可靠性和可重复性。
凝胶电泳实验报告模板

凝胶电泳实验报告模板降低了对流运动,故电泳的迁移率又是同分子的摩擦系数成反比的。
已知摩擦系数是分子的大小、极性及介质粘度的函数,因此根据分子大小的不同、构成或形状的差异,以及所带的净电荷的多少,便可以通过电泳将蛋白质或核酸分子混合物中的各种成分彼此分离开来。
在生理条件下,核酸分子的糖-磷酸骨架中的磷酸基因呈离子状态从这种意义上讲,D N A 和RNA多核苷酸链可叫做多聚阴离子( Polyanions ) 。
因此,当核酸分子被放置在电场中时,它们就会向正电极的方向迁移。
由于糖- 磷酸骨架结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因而它们能以同样的速度向正电极方向迁移。
在一定的电场强度下,DNA分子的这种迁移速度,亦即电泳的迁移率,取决于核酸分子本身的大小和构型,分子量较小的DNA分子比分子量较大的DNA 分子迁移要快些。
这就是应用凝胶电泳技术分离DNA片段的基本原理。
聚丙烯酰胺凝胶电泳,普遍用于分离蛋白质及较小分子的核酸。
琼脂糖凝胶孔径较大适用于分离同工酶及其亚型,大分子核酸等应用较广。
琼脂糖和聚丙烯酰胺可以制成各种形状、大小和孔隙度。
琼脂糖凝胶分离DNA度大小范围较广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的DNA段。
琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。
聚丙烯酰胺分离小片段DNA(5-500bp)效果较好,其分辩力极高,甚至相差1bp的DNA段就能分开。
聚丙烯酰胺凝胶电泳很快,可容纳相对大量的DNA,但制备和操作比琼脂糖凝胶困难。
聚丙烯酰胺凝胶采用垂直装置进行电泳。
目前,一般实验室多用琼脂糖水平平板凝胶电泳装置进行DNA电泳。
3.1 凝胶电泳的分类按照分离物质来分凝胶电泳可以分为核酸凝胶电泳和蛋白质凝胶电泳;按照分离介质来分可以分为琼脂糖凝胶电泳技术和PAGE凝胶电泳。
本次实验我们采用按介质的分类方法来学习的。
3.1.1琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。
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凝胶电泳实验报告模板————————————————————————————————作者:————————————————————————————————日期:重庆大学研究生专业实验教学实验报告书重庆大学研究生院制实验课程名称: 凝胶电泳实验实验指导教师: 学 院:专业及类别: 生物学学 号: 姓 名: 实验日期: 成 绩:一、实验目的1.理解凝胶电泳的分类及琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳实验的基本原理。
2.熟练琼脂糖凝胶电泳实验的基本操作。
3.通过实验了解凝胶电泳实验的注意事项并在以后的实验中尽量避免。
4.利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度、浓度和分子量以及分离大小不同的DNA 片段。
5.了解聚丙烯酰胺凝胶电泳测定DNA和蛋白分子量大小的方法。
二、实验材料、用具及试剂1.材料:菌落PCR产物(待检测DNA片段);2.用具:①琼脂糖凝胶电泳:电泳仪,水平板型电泳槽,电子天平,微量移液器(10µl),枪头,三角瓶,点样板,梳子,微波炉,凝胶成像仪;②聚丙烯酰胺凝胶电泳:垂直板电泳槽,稳压稳流电泳仪,梳子;3.试剂:琼脂糖,1×TAE缓冲液,载样缓冲液(Loading buffer),goldviwe染料,DL5,000 DNA Marker (Takara)。
三、实验原理核酸凝胶电泳是分子克隆核心技术之一,用于分离、鉴定和纯化DNA或RNA 片段,具有以下优点:便于分离、便于检测和便于回收。
其工作原理相对而言比较简单、主要用到了物理学的电荷理论。
当一种分子被放置在电场当中时,它们就会以一定的速度移向适当的电极,这种电泳分子在电场作用下的迁移速度,叫做电泳的迁移率。
它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比。
也就是说,电场强度越大、电泳分子所携带的净电荷数量越多,其迁移的速度也就越快,反之则较慢。
由于在电泳中使用了一种无反应活性的稳定的支持介质,如琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺胶等,从而降低了对流运动,故电泳的迁移率又是同分子的摩擦系数成反比的。
电泳实验报告模板

一、实验名称(请在此处填写实验名称,例如:DNA琼脂糖凝胶电泳)二、实验目的(请在此处填写实验目的,例如:通过DNA琼脂糖凝胶电泳技术,分离和分析DNA 片段)三、实验原理(请在此处简要介绍实验原理,例如:DNA在碱性溶液中带负电荷,在电场作用下向正极移动。
琼脂糖凝胶具有一定的孔径,不同长度的DNA分子在凝胶中受到的阻力不同,从而实现分离。
)四、实验器材及药品(请在此处详细列出实验所需器材和药品,例如:)1. 器材:- 电泳仪- 紫外检测仪- 水平电泳槽- 移液器- 一次性手套- 琼脂糖- 溴化乙锭(EB)- pH8.3 Tris-硼酸-EDTA缓冲液- 加样缓冲液- 分子量不同的DNA片段2. 药品:- Tris- EDTA-Na2- 丙烯酰胺- 甲叉双丙烯酰胺- 过硫酸铵(AP)- 脂肪族叔胺- 考马斯亮蓝(CBB)五、实验步骤(请在此处详细描述实验步骤,例如:)1. 准备琼脂糖凝胶:- 称取琼脂糖1g,加入10倍电泳缓冲液10ml,再加入蒸馏水90ml,在电炉上加热溶解,配制成1%琼脂糖凝胶;- 稍凉后加入配好的EB溶液数滴;- 将电泳模板两端密封,倒入琼脂糖凝胶溶液。
2. 制备DNA样品:- 将DNA片段溶解于加样缓冲液中;- 使用移液器将DNA样品加入琼脂糖凝胶的孔道中。
3. 电泳:- 将电泳槽充满电泳缓冲液;- 将电泳仪设置为合适的电压和时间;- 启动电泳仪,待DNA片段分离后停止。
4. 染色:- 将电泳后的凝胶置于紫外检测仪下观察;- 使用考马斯亮蓝(CBB)染色,使DNA片段着色。
- 观察凝胶上的DNA条带,记录其位置和颜色;- 使用分子量标准品,比较DNA片段的分子量。
六、实验现象(请在此处描述实验现象,例如:)- 观察到凝胶上出现清晰的DNA条带,颜色为橙红色;- 不同分子量的DNA片段在凝胶上呈现出不同的迁移距离。
七、实验结果与分析(请在此处分析实验结果,例如:)- 通过比较DNA片段的迁移距离和分子量标准品的迁移距离,可以确定DNA片段的分子量;- 通过观察DNA条带的颜色和强度,可以判断DNA片段的含量。
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一、实验目的
实验目的是提取细菌或病毒的DNA核酸,对其进行凝胶电泳分离,以
获得纯的DNA核酸片段,并观察凝胶电泳的实验结果,以便进一步的实验
或应用。
二、实验原理
凝胶电泳是以DNA核酸片段的重量不同而产生电泳的基本原理,它是
一种分离DNA核酸片段的有效手段,通过调整电压,可以使它们在凝胶内
移动,从而使片段分离出来。
三、实验步骤
1.提取DNA核酸:提取DNA核酸需要通过其中一种可行的方法,如通
过合成DNA、病毒感染细胞提取DNA,或者采用DNA核酸定量PCR技术提
取DNA核酸。
2.进行凝胶电泳:在凝胶电泳实验中,会将获得的DNA核酸放置在凝
胶上,然后施加电压,使得DNA核酸在凝胶内部移动,从而使片段分离出来。
3.分析凝胶电泳结果:在凝胶上分离出来的DNA核酸片段会呈现出特
定的形状,通过对分离出来的片段的形态以及片段的大小和分布进行分析,可以了解片段的性质,以及它们在凝胶电泳实验中的分离情况。
四、实验结果
[图片]
由图可见,在凝胶电泳实验中,DNA核酸片段被成功分离出来,从而可以进一步的应用,例如:进行后续的克隆实验或PCR实验。
蛋白质凝胶电泳实验报告

蛋白质凝胶电泳实验报告蛋白质凝胶电泳实验报告一、实验目的:本次实验旨在通过蛋白质凝胶电泳技术,对不同来源的蛋白质进行分离和检测,掌握蛋白质电泳的原理、操作方法及结果分析。
二、实验原理:1. 蛋白质凝胶电泳原理蛋白质凝胶电泳是一种常用的分离和检测蛋白质的方法。
其原理是利用聚丙烯酰胺(polyacrylamide)凝胶作为分离介质,将不同大小和电荷的蛋白质分离开来。
当通电时,带有不同电荷的蛋白质会在凝胶中移动,并最终被定位在相应位置。
2. 凝胶制备聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺单体和交联剂组成。
单体与交联剂经过聚合反应形成三维网状结构,从而形成凝胶。
根据所需分辨率可选择不同浓度的聚丙烯酰胺溶液。
3. 样品处理蛋白质样品需要经过还原、变性和煮沸等处理步骤,使其呈现线性结构,便于电泳分离。
4. 电泳操作将凝胶浸入电泳缓冲液中,通电后将样品加在凝胶上,再进行电泳。
根据所选缓冲液和电场强度的不同,可实现不同程度的分离效果。
5. 染色检测经过电泳分离后,使用染色剂对凝胶进行染色,以便观察蛋白质条带并进行定量分析。
三、实验步骤:1. 准备工作:制备聚丙烯酰胺凝胶、制备缓冲液、样品处理等。
2. 制备凝胶:按照所需浓度配制聚丙烯酰胺溶液,并加入交联剂和引发剂,混合后倒入模板中,在上方覆盖一层异丙醇以防止表面干燥。
待凝固后取出模板。
3. 制备缓冲液:根据所需 pH 值和离子强度配制缓冲液。
常用的缓冲液有 Tris-HCl 缓冲液、MES 缓冲液等。
4. 样品处理:将蛋白质样品加入还原剂和变性剂混合,煮沸 5 分钟后降温至室温。
5. 电泳操作:将凝胶浸入缓冲液中,通电后将样品加在凝胶上,根据所选缓冲液和电场强度进行电泳。
6. 染色检测:将凝胶浸泡在染色剂中,染色后观察蛋白质条带并进行定量分析。
四、实验结果与分析:经过本次实验,我们成功地利用蛋白质凝胶电泳技术对不同来源的蛋白质进行了分离和检测。
通过观察凝胶上的蛋白质条带及其大小和位置,我们可以得到以下结论:1. 蛋白质的大小和电荷会影响其在凝胶中的移动速度和位置。
琼脂糖凝胶电泳实验报告

实验一:琼脂糖凝胶电泳对DNA提取实验目的:学习使用水平式琼脂糖凝胶电泳进行DNA的提取。
实验原理:琼脂糖凝胶电泳是利用琼脂糖溶化再凝固后能形成带有一定孔隙的固体基质的特性。
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。
根据DNA分子量不同,采用外加电场使其分开,用生物染料嵌入DNA分子后在紫外下显色。
1)在电场的作用下及中性pH的缓冲条件下,带负电的核酸分子向正极迁移。
由于糖——磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速度向正极方向移动。
2)在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即DNA分子本身的大小和构型。
具有不同的相对分子质量和不同构型的DNA片段泳动速度不一样,可进行分离。
3)生物染料在紫外光照射下能发射荧光,当DNA样品在琼脂糖凝胶中从负极向正极泳动时,生物染料从正极向负极移动,就会嵌入DNA分子中形成络合物,使DNA在紫外光下发射很强的荧光。
在生物染料足够的情况下,荧光的强度正比于DNA的含量,这样就可以检测DNA的浓度。
实验材料:微量移液器(2μl和4μl),高压灭菌锅,电泳仪,琼脂糖平板电泳装置,微波炉等。
TAE电泳缓冲液,琼脂糖凝胶,PCR扩增样品实验步骤:1胶液的制备:称取0.2g琼脂糖,置于200ml锥形瓶中, 加入20ml TAE稀释缓冲液,放入微波炉里加热至琼脂糖全部熔化,沸腾。
取出摇匀。
加热时应盖上封口膜, 以减少水份蒸发。
2胶板的制备:将有机玻璃胶槽两端分别用透明胶带(宽约1cm)紧密封住。
将封好的胶槽置于水平支持物上,插上样品梳子。
3向冷却至50-60℃的琼脂糖胶液中小心地倒入胶槽内, 使胶液形成均匀的胶层。
检查有无气泡。
4室温下约20分钟后,琼脂糖溶液完全凝固,小心垂直拔出梳子和挡板,注意不要损伤梳底部的凝胶,清除碎胶。
将凝胶放入电泳槽中。
5加入电泳缓冲液(TAE)至电泳槽中,使液面高于胶面约1mm。
(完整版)SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳实验报告

分子生物学实验报告实验名称:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳班级:生工xxx姓名:xxx同组人:xxx学号:xxxx日期:xxxxSDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳1 引言SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)是目前分离蛋白质亚基并测定其分子量的常用方法,为检测电泳后凝胶中的蛋白质,一般使用考马斯亮蓝(CBB)染色[1]。
本次实验的目的在于学习聚丙烯酰胺凝胶电泳的原理,并掌握聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳分离蛋白质的操作技术。
2 材料和方法2.1实验原理2.1.1 聚丙烯酰胺凝胶的性能及制备原理2.1.1.1 性能聚丙烯酰胺凝胶的机械性能好,有弹性,透明,相对地化学稳定,对pH和温度变化比较稳定,在很多溶剂中不溶,是非离子型的,没有吸附和电渗作用。
通过改变浓度和交联度,可以控制孔径在广泛的范围内变动,并且制备凝胶的重复性好。
由于纯度高和不溶性,因此还适于少量样品的制备,不致污染样品。
2.1.1.2 制备原理聚丙烯酰胺凝胶是用丙烯酰胺(Acr)和交联剂甲叉双丙烯酰胺(Bis)在催化剂的作用下聚合而成。
聚丙烯酰胺凝胶聚合的催化系统有化学聚合和光聚合两种。
本实验是用化学聚合。
化学聚合的催化剂通常多采用过硫酸铵(AP)或过硫酸钾,此外还需要一种脂肪族叔胺作加速剂,最有效的加速剂是N,N,N’,N’-四甲基乙二胺(TEMED)。
在叔胺的催化下,由过硫酸铵形成氧的自由基,后者又使单体形成自由基,从而引发聚合反应。
叔胺要处于自由碱基状态下才有效,所以在低pH时,常会延长聚合时间;分子氧阻止链的延长,妨碍聚合作用;一些金属也能抑制聚合;冷却可以使聚合速度变慢。
通常控制这些因素使聚合在1小时内完成,以便使凝胶的性质稳定。
聚丙烯酰胺凝胶电泳和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳有两种系统,即只有分离胶的连续系统和有浓缩胶与分离胶的不连续系统,不连续系统中最典型、国内外均广泛使用的是著名的Ornstein-Davis高pH碱性不连续系统,其浓缩胶丙烯酰胺浓度为4%,pH = 6.8,分离胶的丙烯酰胺浓度为12.5%,pH = 8.8。
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重庆大学研究生专业实验教学实验报告书实验课程名称:凝胶电泳实验实验指导教师:学院:专业及类别:生物学学号:姓名:实验日期:成绩:重庆大学研究生院制一、实验目的1.理解凝胶电泳的分类及琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳实验的基本原理。
2.熟练琼脂糖凝胶电泳实验的基本操作。
3.通过实验了解凝胶电泳实验的注意事项并在以后的实验中尽量避免。
4.利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度、浓度和分子量以及分离大小不同的DNA 片段。
5.了解聚丙烯酰胺凝胶电泳测定DNA和蛋白分子量大小的方法。
二、实验材料、用具及试剂1.材料:菌落PCR产物(待检测DNA片段);2.用具:①琼脂糖凝胶电泳:电泳仪,水平板型电泳槽,电子天平,微量移液器(10µl),枪头,三角瓶,点样板,梳子,微波炉,凝胶成像仪;②聚丙烯酰胺凝胶电泳:垂直板电泳槽,稳压稳流电泳仪,梳子;3.试剂:琼脂糖,1×TAE缓冲液,载样缓冲液(Loading buffer),goldviwe染料,DL5,000 DNA Marker (Takara)。
三、实验原理核酸凝胶电泳是分子克隆核心技术之一,用于分离、鉴定和纯化DNA或RNA 片段,具有以下优点:便于分离、便于检测和便于回收。
其工作原理相对而言比较简单、主要用到了物理学的电荷理论。
当一种分子被放置在电场当中时,它们就会以一定的速度移向适当的电极,这种电泳分子在电场作用下的迁移速度,叫做电泳的迁移率。
它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比。
也就是说,电场强度越大、电泳分子所携带的净电荷数量越多,其迁移的速度也就越快,反之则较慢。
由于在电泳中使用了一种无反应活性的稳定的支持介质,如琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺胶等,从而降低了对流运动,故电泳的迁移率又是同分子的摩擦系数成反比的。
已知摩擦系数是分子的大小、极性及介质粘度的函数,因此根据分子大小的不同、构成或形状的差异,以及所带的净电荷的多少,便可以通过电泳将蛋白质或核酸分子混合物中的各种成分彼此分离开来。
在生理条件下,核酸分子的糖-磷酸骨架中的磷酸基因呈离子状态从这种意义上讲,D N A 和RNA多核苷酸链可叫做多聚阴离子( Polyanions ) 。
因此,当核酸分子被放置在电场中时,它们就会向正电极的方向迁移。
由于糖- 磷酸骨架结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因而它们能以同样的速度向正电极方向迁移。
在一定的电场强度下,DNA分子的这种迁移速度,亦即电泳的迁移率,取决于核酸分子本身的大小和构型,分子量较小的DNA分子比分子量较大的DNA 分子迁移要快些。
这就是应用凝胶电泳技术分离DNA片段的基本原理。
聚丙烯酰胺凝胶电泳,普遍用于分离蛋白质及较小分子的核酸。
琼脂糖凝胶孔径较大适用于分离同工酶及其亚型,大分子核酸等应用较广。
琼脂糖和聚丙烯酰胺可以制成各种形状、大小和孔隙度。
琼脂糖凝胶分离DNA度大小范围较广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的DNA段。
琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。
聚丙烯酰胺分离小片段DNA(5-500bp)效果较好,其分辩力极高,甚至相差1bp的DNA段就能分开。
聚丙烯酰胺凝胶电泳很快,可容纳相对大量的DNA,但制备和操作比琼脂糖凝胶困难。
聚丙烯酰胺凝胶采用垂直装置进行电泳。
目前,一般实验室多用琼脂糖水平平板凝胶电泳装置进行DNA电泳。
3.1 凝胶电泳的分类按照分离物质来分凝胶电泳可以分为核酸凝胶电泳和蛋白质凝胶电泳;按照分离介质来分可以分为琼脂糖凝胶电泳技术和PAGE凝胶电泳。
本次实验我们采用按介质的分类方法来学习的。
3.1.1琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。
其分析原理与其他支持物电泳的最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。
琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。
但由于其孔径相当大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。
蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,根据这个原理可将其分开。
电泳缓冲液的pH在6-9之间,离子强度0.02-0.05为最适。
常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。
琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广。
普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达107bp的DNA片段。
3.1.2聚丙烯酰胺凝胶电泳实验室中常采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—PAGE)。
SDS—PAGE是蛋白分析中最经常使用的一种方法。
它是将蛋白样品同离子型去垢剂十二烷基硫酸钠(SDS)以及巯基乙醇一起加热,使蛋白变性,多肽链内部的和肽链之间的二硫键被还原,肽链被打开。
打开的肽链靠疏水作用与SDS结合而带负电荷,电泳时在电场作用下,肽链在凝胶中向正极迁移。
不同的大小的肽链由于在迁移时受到的阻力不同,在迁移过程中逐渐分开,其相对迁移率与分子量的对数间成线形关系。
SDS—PAGE可分为圆盘状和垂直板状、连续系统和不连续系统。
本实验采用垂直板状不连续系统,其基本原理如下:不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳包含了两种以上的缓冲液成分、pH值和凝胶孔径,而且在电泳过程中形成的电位梯度亦不均匀。
由此产生的浓缩效应、电荷效应和分子筛效应。
⑴浓缩效应样品在电泳开始时,通过浓缩胶被浓缩成高浓度的样品薄层(一般能浓缩几百倍),然后再被分离。
当通电后,在样品胶和浓缩胶中,解离度最大的Cl—有效迁移率最大,被称为快离子,解离度次之的蛋白质则尾随其后,解离度最小的甘氨酸离子(PI=6.0)泳动速度最慢,被称为慢离子。
由于快离子的迅速移动,在其后边形成了低离子浓度区域,即低电导区。
电导与电势梯度成反比,因而可产生较高的电势梯度。
这种高电势梯度使蛋白质和慢离子在快离子后面加速移动。
因而在高电势梯度和低电势梯度之间形成一个迅速移动的界面,由于样品中蛋白质的有效迁移率恰好介于快、慢离子之间,所以,也就聚集在这个移动的界面附近,逐渐被浓缩,在到达小孔径的分离胶时,已形成一薄层。
⑵电荷效应当各种离子进入pH8.9的小孔径分离胶后,甘氨酸离子的电泳迁移率很快超过蛋白质,高电势梯度也随之消失,在均一电势梯度和pH的分离胶中,由于各种蛋白质的等电点不同,所带电荷量不同,在电场中所受引力亦不同,经过一定时间电泳,各种蛋白质就以一定顺序排列成一条条蛋白质区带。
⑶分子筛效应由于分离胶的孔径较小,分子量大小或分子形状不同的蛋白质通过分离胶时,所受阻滞的程度不同,因而迁移率不同而被分离。
此处分子筛效应是指样品通过一定孔径的凝胶时,受阻滞的程度不同,小分子走在前面,大分子走在后面,各种蛋白质按分子大小顺序排列成相应的区带。
3.1.3 琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳的特点琼脂糖凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳(1)因不含硫酸根和羧基,几乎消除了琼脂的电渗。
(2)对蛋白质吸附极微,故无拖尾现象。
(3)凝胶结构均匀,孔径较大,可用于分离酶的复合物、核酸、(1)PAGE具有电泳和分子筛的双重作用(2)PAGE是目前最常用的电泳方法。
(3)设备简单(4)样品量小(1-100ug)病毒等大分子物质。
特点(4)透明度较好,可直接或干燥成薄膜后进行染色。
(5)不吸收紫外光,可直接利用紫外吸收法做定量测定。
(6)有热可逆性。
(7)易破碎,浓度不能太低。
(8)易被细菌污染,不易保存,临用前配置。
(9)琼脂糖支持层上的区带易于扩散,电泳后必须立即固定染色。
(10)与PAGE相比,分子筛作用小,区带少。
(5)时间短(30-60min)(6)操作方便(7)分离范围广(多肽、蛋白、多糖等)(8)可提高灵敏度改为超微量测定(10-12-10-9)(9)可用于蛋白质分子量测定3.2 影响DNA迁移速率的决定因素(1)DNA分子的大小: 双链DNA分子迁移的速率与其碱基对数的常用对数近似成反比(2)琼脂糖浓度: 浓度越低,相同核酸分子迁移越快表1 不同类型和浓度琼脂糖分离DNA片段的范围浓度(%)标准(kb)高强度(kb)低熔点(kb)0.31-500.50.7-250.80.5-150.8-100.8-1010.25-120.4-80.4-81.20.15-60.3-70.3-71.50.08-40.2-40.2-420.1-30.1-330.05-146(3)DNA的构象: 同一分子的迁移速率:超螺旋环状>线状>切口环状(4)凝胶和电泳缓冲液中的溴化乙锭:溴化乙锭(EB)插入双链DNA造成其负电荷减少、刚性和长度增加(5)所用的电压:低电压时DNA片段迁移率与所用的电压成正比3.3 常见琼脂糖种类及性质常见琼脂糖的种类有两种,分别为:标准琼脂糖和低熔点琼脂糖表2 不同类型琼脂糖的性质琼脂糖类型 凝结温度/℃ 熔化温度/ ℃ 标准琼脂糖35~38 90~95不同厂家生产的不同商品其凝结温度和熔化温度有一定差异40~4285~90 高强度琼脂糖 修饰的低熔点/ 凝点琼脂糖 34~43 25~35 85~95 63~65 35 65 超低熔点 8~15 40~45 低黏性低熔点琼脂糖25~30 70 38 85 30753.4 电泳缓冲液电泳缓冲液是指在进行分子电泳时所使用的缓冲溶液,用以稳定体系酸碱度,同时电泳缓冲液的另外一个重要作用是使溶液具有一定的导电性,以利于DNA 分子的迁移。
常用的电泳缓冲液有:TAE(Tris-乙酸)缓冲液 、TBE (Tris-硼酸)缓冲液 ,两者的区别主要有以下几点:1)TAE 的缓冲容量最低,如长时间电泳会被消耗,此时凝胶的阳极一侧将发生酸性化;2)TBE 比TAE 花费稍贵,但有高得多的缓冲容量; 3)双链线状DNA 片段在TAE 中比在TBE 中迁移快10%;4)对于高分子质量的DNA ,TAE 的分辨率略高于TBE ,对于低分子质量的DNA ,TAE 要差些。
超螺旋DNA 在TAE 中的电泳分辨率要好于TBE 。
3.5 凝胶载样缓冲液载样缓冲液是临上样到凝胶加样孔之前与待电泳的样品相混合的一种缓冲液,在电泳时具有以下作用:(1)增加样品密度保证DNA沉入加样孔内;(2)使样品带有颜色便于简化上样过程;(3)其中的染料在电场中以可以预测的泳动速率向阳极迁移。
表3 6×凝胶载样缓冲液类型 6 ×缓冲液贮存温度I 0.25%溴酚蓝4℃0.25%二甲苯氰FF40% (m/V)蔗糖水溶液II 0.25%溴酚蓝室温0.25%二甲苯氰FF15% Ficoll(Type400)水溶液III 0.25%溴酚蓝4℃0.25%二甲苯氰FF30%甘油水溶液IV0.25%溴酚蓝4℃40% (m/V)蔗糖水溶液3.6 核酸染料电泳后,核酸需经染色才能显色出带型,溴化乙锭(ethidium bromide, EB)是最常用的核酸染色剂,灵敏度高,它可嵌入核酸双链的配对碱基之间,在紫外线激发下,发出桔红色荧光。