南京大学分子生物学第11讲

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(二)II类修饰-限制酶 1,酶分子的构成 2,识别位点 3,切割位点 4,对底物的作用 5,酶切位点
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Nanjing (三)I类酶
University
1,酶分子的构成
(1)三个亚基:
(2)两种功能
(3)基因突变和万一保安机制
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Nanjing 2,I类酶的作用位点
University
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三、胸腺嘧啶二聚体修复的分子生
物学机制 Nanjing
University
(一)光复活(photoreactivation)
1,光复活的定义
2,光复活的过
(二)切除修复
1,切除修复一般过程
2,大肠杆菌的切除修复 (1)修复过程
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(2)大肠杆菌切除修
Nanjing University
Nanjing
and University modification)
一、限制-修饰现象 1,大肠杆菌噬菌体的限制和修饰 模式 2,大肠杆菌的限制-修饰系统 (1)限制-修饰作用 3,居民DNA
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二、限制-修饰系统的分类 Nanjing(一)细菌中三种不同类型的修饰 -限制酶 University
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四、其他损伤类型及其修复
Nanjing University
(一)非标准碱基的修复
1,非标准碱基及其相应的 DNA糖基酶
2, DNA糖基酶的修复机 制
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Nanjing(二)碱基的丢失
University
1,去嘌呤作用 (depurination)
2,无碱基内切酶的作用
3,碱基插入酶
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(三)烷基化损伤的修复
Nanjing
University 1,烷基化的主要位点
2,Ada蛋白在烷基化损伤 的修复中的作用
(1)ada基因产物 (2)Ada蛋白的自杀行为
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Nanjing 3,E.coli对烷基化的适
University
应性反应
(1) Ada蛋白的作用
(2)alkA基因的作用 (3)alkB的作用
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(四)链的断裂
Nanjing
University 1,造成DNA链断裂的因 素
2,修复方式
(1)单链断裂修复
(2)双链断裂修复
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(五)交联
Nanjing University
1,致交联因素
2,交联种类
3,修复方式
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(六)真核生物的 Nanjing
University
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5,LexA蛋白在在SOS修复中的
Nanjing University
作用
(1)LexA蛋白的作用
(2)由LexA控制的SOS基因构 成一个调控元
•din(damage inducible genes)基因,或SOS基因
•SOS框
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Nanjing University
(五)嘧啶二聚体 糖基酶修复系统
(1)EcoB和EcoK的识别位点
EcoB的识别序列
(2) EcoB和EcoK的甲基化 位点
(3) I类酶的切割位点
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3, I类酶的限制-修饰机制
Nanjing University
(1)M亚基首先与辅助因子S-腺
复的类型
A.短补丁修复(short-
patch repair)
B.长补丁修复(longpatch repair)
3,真核生物的切除修复
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(三)重组修复
Nanjing University
1,除Uvr系统之外,还存在其
他的暗修复系统
2,重组修复(复制后修复) 的机制
(1)重组修复的姐妹链交换 假说(图4-10)
保 证 DNA 稳 定 性 的 机 制
1,复制修复系统 2,损伤修复系统 3,限制-修复系统
Baidu Nhomakorabea
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第一节 复制修复 Nanjing
University
一、尿嘧啶糖基酶系统
(一)DNA中尿嘧啶的产生
(二)尿嘧啶糖基酶系统 的组成
(三)修复过程
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Nanjing University
二、错配修复系统(mismatch
(2)重组修复所涉及的基因
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(四)SOS修复
Nanjing University
1,SOS反应
2,SOS修复的概念
3,SOS修复的结果
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Nanjing 4,RecA蛋白在SOS修
University
复中的作用
(1)RecA蛋白的主要生化 活性
(2) RecA蛋白的作用
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4 , DNA 连 接酶连接 切刻
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(三)错配修复系统其
Nanjing
他作用 University
1,去除渗入DNA的碱基类 似物
2,在基因转换中起重要 作用
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第二节 损伤修复
Nanjing
致损伤因素 University DNA分子损伤的类型
一、胸腺嘧啶二聚体的产生及其 后果
repair system)
(一)错配修复系统的组 成
(二)错配修复的过程
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Nanjing 1,错配矫正酶与未甲基化 University 的GATC及同一条链上的错
配碱基结合
2,错配矫正酶在两者之间 切除一段包括错配碱基的 DNA单链
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Nanjing University
3 , DNA 聚 合酶III进 行缺口充 填
二、胸腺嘧啶二聚体修复的生物学指 征
(一)细菌的活存曲线
(二)修复类型
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Nanjing University
1,光复活(photoreactivation)
2,暗修复 •除了可作用于胸腺嘧啶二聚体 外,还可以修复其他类型的损 伤,包括: (1)切除修复 (2)重组修复 (3)SOS修复 (4)二聚体糖基酶修复
修复系统
1,酵母 2,哺乳动物
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3,真核生物蛋白质的多聚ADP Nanjing 核糖基化与DNA修复的关系
University
(1)真核生物蛋白质的多聚 ADP核糖基化(ADPribosylation)
(2)多聚ADP核糖基化的可能 作用
A.观点一
B.观点二
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第三节 限制与修饰(restriction
Nanjing University
第四章
以修复作用为中
心的DNA的安全
保障体系
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Nanjing University
导致DNA不稳定的因素
1,偶然的复制错误 2,环境紫外线、电离辐 射化学物质(突变剂) 造成的核酸分子损伤 3,外源遗传物质的侵入
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