放线菌分类的研究II.吸水放线菌类t的鉴定
微生物,放线菌分类
3 基于核酸结构的分析
(1) 16S rRNA / rDNA基因序列的分析
该技术目前在放线菌分类中常被用于放线菌种属的 初步鉴定, 但是值得注意的是仅根据该指标并不能 确定菌株的种属, 必须结合其他的分类指标。
(2)16S-23S rRNA 转录间区序列的分析
16S-23S rRNA转录间区序列( 16S-23S rRNA）的进 化速率比16S rRNA大10倍, 其序列大小比16S r RNA更具直接测序优势, 可鉴别防线菌属与种。但 是16S-23S rRNA的不同拷贝之间大小比较相近且不 易区分。
经典分类学：按微生物 表型特征分类
表型特征：形态学、生理生化学、生 态学等，推断微生物的系统发育。 表型特征结合分子水平上的基因型特 征（如16S rRNA)，探讨微生物进化地 位、系统发育关系并进行分类鉴定。
微生物系统学： 按亲缘关系和进 化规律分类
★微生物分类学的三个任务：分类、鉴定及命名 ☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。 ☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的哪个分类类群的过程。 ☆命名是根据国际命名法规给每一微生物类群及种类以科学的名称。
5 多相分类系统
由于微生物生理生化学的迅速发展，加速了这趋势 并逐渐打破了原来经典的描述分类，建立了如数值 分类、化学分类、分子分类以至于现在的多相分类 新的标准，大大推进了分类学的发展。多相分类是 将表型、基因型以及系统进化分析数据综合起来作 为分类和进化分析的依据。
3 放线菌的应用
在植物病害防治中的应用 放线菌是人们最早应用到生产中的生防微生 物，但是已投入使用的微生物源杀虫活性物质中 多数是来自真菌，有部分来自细菌如昆虫的病原 菌苏云金杆菌，放线菌来源的较少，从放线菌中 发现的活性物质中，80%是来自链霉菌属。
《放线菌分类》PPT课件
2020/11/15
三、放线菌生物技术的发展
• （一）分离培养和纯化技术 • 近年来，国内外科学家正在开展一种从自然生态环境中选择性分离放线
菌的分离技术。 • 非链霉菌或稀有放线菌作为新的生理活性物质的重要来源成为关注的热
点。 • Colwell 实验室在1982年提出活的但不可培养微生物的概念，他们发
用前景有： • 1、基因，尤其是编码功能蛋白的基因 • 2、代谢产物，如具有生物活性的次生代谢产物，尤其是各类先导化合物 • 3、特殊代谢途径，如合成和分解，利用某些特殊化合物的新代谢途径，
用于生物降解等 • 4、新的代谢调控机理，如用于筛选或者构建高产或高活性菌 • 5、具有不同生态功能的微生物活细胞等，如生物膜用于污水处理，污染
2020/11/15
• 三、几个值得重视的问题 • 1、在以rRNA为主的分子分类已经比较普及的今天，应按照系统学的要
求，吸取基因组学、蛋白质组学、生物信息学及其他学科最新成就， 建立完善细菌分类系统，使系统学更能反映生物进化的本来面目和生 物之间的真实关系。 • 2、从我国学者发表论文和内容来看，发现少创新少，大多沿用或改进 国外分类系统和方法进行的工作。 • 3、现行杂交方法有较大误差，应该探索新途径。 • 4、特定类群的快速鉴定 • 5、及时扩大研究范围 • 6、设计新的独特的分离方法分离未知菌，才能不断提供新的菌种资源。
第二节 放线菌系统分类学的过去和 现在
• 一、国外概况 • 1、历史及著名研究单位 • 最早描述放线菌的学者——Cohn，他自人泪腺感染病灶中分离到一株丝状病
原菌——链丝菌。而后Harz建立了放线菌属。 • 美国新泽西农业试验站，Rutgers大学微生物研究所 • 1942年发现链霉素。 • 《放线菌的属和种分类鉴定和描述》，放线菌分类学开始形成。 • 整个70年代是放线菌化学分类时代 • 构建放线菌系统发育树，进入分子分类时代
海洋放线菌的分类鉴定
海洋放线菌的分类鉴定一、放线菌㈠、放线菌的分布放线菌常以孢子或菌丝状态极其广泛地存在于自然界。
不论数量和种类，以土壤中最多。
河流和湖泊中，放线菌数量不多，大多为小单孢菌、游动放线菌和孢囊链霉菌，还有少数链霉菌。
海洋中的放线菌多半来自土壤或生存在漂浮海面的藻体上。
海水中还存在耐盐放线菌。
放线菌有一种土霉味，使水和食物变味，有的放线菌也能和霉菌一样使棉毛制品或纸张霉变。
放线菌主要能促使土壤中的动物和植物遗骸腐烂，最主要的致病放线菌是结核分枝杆菌和麻风分枝杆菌，可导致人类的结核病和麻风病。
放线菌最重要的作用是可以产生、提炼抗生素，目前世界上已经发现的2000多中抗生素中，大约有56%是由放线菌（主要是放线菌属）产生的，如链霉素、土霉素、四环素、庆大霉素等都是由放线菌产生的。
此外有些植物用的农用抗生素和维生素等也是由放线菌中提炼的。
㈡、放线菌的形态与结构放线菌菌体为单细胞，大多由分枝发达的菌丝组成，最简单的为杆状或具原始菌丝。
放线菌是一种革兰氏阳性菌。
放线菌菌丝细胞的结构与细菌基本相同。
根据菌丝形态和功能可分为营养菌丝、气生丝和孢子丝三种。
⑴营养菌丝匍匐生长于培养基内，主要生理功能是吸收营养物，故亦称基内菌丝。
营养菌丝一般无隔膜；直径0.2-0.8微米，但长度差别很大，短的小于100微米，长的可达600微米以上；有的无色素，有的产生黄、橙、红、紫、蓝、绿、褐、黑等不同色素，若是水溶性的色素，还可透入培养基内，将培养基染上相应的颜色，如果是非水溶性色素，则使菌落吨呈现相应的颜色。
色素是鉴定菌种的重要依据。
⑵气生菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝为气生菌丝。
它叠生于营养菌丝上，以至可覆盖整个菌落表面。
在光学显微镜下，颜色较深，直径比营养菌丝粗，约1-1.4微米，其长度则更悬殊。
直形或弯曲而分枝，有的产生色素。
⑶孢子丝气生菌丝上分化出可形成孢子的菌丝即孢子丝。
孢子丝的形状和在气生菌丝上的排列方式，随菌种而异。
孢子丝的形状有直形、波曲和螺旋形。
放线菌及其代谢产物的研究
放线菌及其代谢产物的研究1. 引言放线菌（Actinomycetes）是一类具有丰富代谢能力的微生物，广泛存在于土壤、水体等环境中。
由于其特殊的代谢途径和生物活性产物的丰富性，放线菌及其代谢产物一直是研究的热点之一。
本文将着重介绍放线菌及其代谢产物的研究，包括放线菌的分类、生物活性代谢产物的种类、研究方法以及应用前景等。
2. 放线菌的分类放线菌是真菌界中的一个重要类群，其属于放线菌纲（Actinobacteria），并且是细菌中最大的纲。
根据16S rRNA 基因序列的分析，放线菌可以分为封端放线菌目（Corynebacteriales）和链霉菌目（Streptomycetales）。
封端放线菌目包括了许多重要的病原性菌种，如白色念珠菌（Candida albicans）、白色念球菌（Corynebacterium diphtheriae）等；而链霉菌目是放线菌中最大的目，几乎包括了所有具有生物活性代谢产物的菌种。
3. 生物活性代谢产物的种类放线菌及其代谢产物以其丰富的化学结构和多样的生物活性而受到广泛关注。
根据其作用机制，生物活性代谢产物可以分为抗生素、抗肿瘤剂、免疫调节剂等几大类。
以下是一些常见的放线菌代谢产物：3.1 抗生素•链霉素：是一种广谱抗生素，对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌都有较强的抑菌作用。
•四环素：广泛应用于临床治疗中，是一类静菌抗生素，对多种细菌有抑制作用。
•青霉素：是第一个被广泛使用的抗生素，对革兰氏阳性菌有强烈的抗菌作用。
3.2 抗肿瘤剂•霉素类：如阿霉素、链霉素等，具有抗肿瘤活性，可用于治疗多种癌症。
•紫杉醇：是一种来自于放线菌代谢产物的天然化合物，在抗肿瘤领域有着重要的应用价值。
3.3 免疫调节剂•真菌素：是一种来源于放线菌的抗生素，具有抗真菌活性，可以用于治疗真菌感染性疾病。
4. 研究方法在放线菌及其代谢产物的研究中，涉及到多种实验方法和技术手段。
以下是一些常用的研究方法：4.1 放线菌的分离和鉴定放线菌的分离和鉴定是研究的第一步，常用的方法包括土壤稀释法、表面光滑法和荧光显微镜观察等。
放线菌分类2
对营养的要求相当弹性，能降解一些杀虫剂和除草剂
嗜皮菌属(Dermatophilus)
寄生于哺乳动物，导致刚果嗜皮菌病的皮肤感染
链霉菌亚目
目前该亚目只有链霉菌科，该科目前有三个属，即 链霉菌属、北里孢菌属和嗜酸链霉菌属。
该科成员均为革兰氏阳性菌好氧菌，产生发育良好、 不易断裂的分支状基内菌丝，大多数产生分支状气
模式种：白色链霉菌
北里孢菌属
该属特征为：基内菌丝发达，类似链霉菌，基内和 气生菌丝上着生常超过20个孢子的长孢子链。基内 菌丝不断裂，无孢囊。细胞壁含甘氨酸、半乳糖，
全细胞水解液含半乳糖，但不含阿拉伯糖、马杜拉
糖和木糖。磷酸类脂类型为P2型， DHA的（G+C） mol%含量范围为66-67
微球菌亚目
包括十四个科，典型科为微球菌科，该科的典型属为微球菌
微球菌属(Micrococcus)
广泛存 在于土壤中，水中和哺乳动物皮肤上，后者更为 常 见，但并无致病性
节杆菌属(Arthrobacter)
杆菌一球菌的生长循环：对数期时，细菌呈不规则，分支
的杆状，以断裂繁殖。当它们进入稳定期，细胞变成球状
பைடு நூலகம்
鱼孢菌科及主要属
该科典型属是鱼孢菌属 鱼孢菌属：菌丝和孢子革兰氏阳性，不抗酸，细胞壁化 学组分Ⅲ型。无基内菌丝。气生菌丝一般短，(0.5～
1.2)×(10～25)微米，少分枝；基部细胞下面形成球冠状
固着器,用以将气生菌丝固定在固体培养基的表面;气生菌 丝断裂成表面光滑的孢子，孢子球形或杆状，有时呈长 达6微米的鱼形,本科因此得名。孢子有颈饰痕迹和1～3 根端生鞭毛,能游动;革兰氏染色不定；细胞壁Ⅰ型。本属 现只发现多形鱼孢菌1种。
放线菌的分离和鉴定
放线菌的分离和鉴定放线菌的分离和鉴定实验器材：1.⼟壤材料 5 ---10cm 处⼟壤，放于采集袋中带回实验室。
2.培养基淀粉琼脂培养基（⾼⽒Ⅰ号培养基( w /v)）可溶性淀粉2%，KNO3 0. 1%，NaCL 0. 05%，K2HP04 0. 05%，MgSO4 0. 05%，FeSO4 0. 001%，琼脂2% 3.溶液和试剂（1) 20% ⽢油( 2) 0. 1%美蓝 A 液: 美蓝0. 3g ，95% ⼄醇300ml;B 液: 0. 01% KOH 100ml 混合A 和B 液即成⾰兰⽒染液3( 1) 结晶紫染⾊液: 甲液结晶紫2g，95% ⼄醇20ml;⼄液草酸铵0. 8g，蒸馏⽔80ml。
甲⼄液先分别溶解，然后混合在⼀起，过滤除去残渣后装⼊滴瓶中备⽤。
( 2) 碘液: 碘1g，碘化钾2 个，蒸馏⽔100ml 先取少量蒸馏⽔加⼊碘和碘化钾，使碘完全溶解后再加⼊全部蒸馏⽔，分装于滴瓶中备⽤。
( 3) 复红酒精溶液: 碱性复红0. 4g，95%⼄醇100ml，溶解装⼊滴瓶备⽤。
4.仪器和其他⽤品⽆菌纸、带玻璃珠的三⾓烧瓶、1ml⽆菌吸管、⽆菌试管、⽆菌培养⽫⼀.⽬的要求：1. 掌握倒平板的⽅法和常⽤分离纯化微⽣物的基本操作。
2. 初步观察⼟壤中放线菌菌落形态。
3. 初步了解掌握微⽣物分类的基本⽅法。
⼆.实验原理：放线菌在⾃然界中主要⽣存于陆地和淡⽔中，⼟壤为这类微⽣物的主要习居场所，⽆论在种类和数量上都⽐其他地⽅繁多。
在中性或偏碱性的⼟壤和有机质等丰富的⼟壤中较多。
放线菌以孢⼦和菌丝⽚段的形式存在于⼟壤，每克⼟壤内含有数万、数⼗万的孢⼦。
放线菌的⽣活史和形态特征放线菌的孢⼦和孢囊孢⼦在适宜的环境下吸收⽔分，膨胀萌发，⽣出芽管1 －3 个，芽管伸长长出分枝，分枝越来越多，形态菌丝体。
因其菌丝体在培养基内，即基内菌丝或称营养菌丝体。
基内菌丝体⼀般没有横隔，由于菌丝体长⼊培养基内和培养基表⾯，并纠缠在⼀起形成密集的菌落，所以⽤接种针将整个菌落培养基挑起⽽不破裂。
放线菌
放线菌（网址/view/35926.ht ml?wtp=tt#sub35926）放线菌（Actinomycete）是原核生物的一个类群。
大多数有发达的分枝菌丝。
菌丝纤细，宽度近于杆状细菌，约0.5～1微米。
可分为：营养菌丝，又称基质菌丝，主要功能是吸收营养物质，有的可产生不同的色素，是菌种鉴定的重要依据；气生菌丝，叠生于营养菌丝上，又称二级菌丝。
目录编辑本段径与细菌直径基本相同；③最适生长PH范围与细菌基本相同，一般呈微碱性；④都对溶菌酶和抗生素敏感，对抗真菌药物不敏感；⑤繁殖方式为无性繁殖，遗传特性与细菌相似。
编辑本段形态与结构放线菌种类很多，多数放线菌具有发育良好的分支状菌丝体，少数为杆状或原始丝状的简单形态。
菌丝大多无隔膜，其粗细与杆状细菌相似，直径为1微米左右。
细胞中具核质而无真正的细胞核，细胞壁含有胞壁酸与二氨基庚二酸，而不含几丁质和纤维素。
以与人类关系最密切、分布最广、种类最多、形态最典型的链霉菌属为例。
链霉菌主要由菌丝和孢子两部分结构组成。
菌丝（mycelium）根据菌丝的着生部位、形态和功能的不同，放线菌菌丝可分为基内菌丝、气生菌丝和孢子丝三种。
1.基内菌丝(substrate mycelium) 链霉菌的孢子落在适宜的固体基质表面，在适宜条件下吸收水分，孢子肿胀，萌发出芽，进一步向基质的四周表面和内部伸展，形成基内菌丝，又称初级菌丝（primary mycelium）或者营养菌丝（vegetative mycelium），直径在0.2～0.8微米之间，色淡，主要功能是吸收营养物质和排泄代谢产物。
可产生黄、蓝、红、绿、褐和紫等水溶色素和脂溶性色素，色素在放线菌的分类和鉴定上有重要的参考价值。
放线菌中多数种类的基内菌丝无隔膜，不断裂，如链霉菌属和小单孢菌属等；但有一类放线菌，如诺卡氏菌型放线菌的基内菌丝生长一定时间后形成横隔膜，继而断裂成球状或杆状小体。
2.气生菌丝（aerial mycelium）是基内菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝，又称二级菌丝（secondary mycelium）。
放线菌的分类方法
2012届本科毕业论文（设计）放线菌的分类方法姓名: __ __ __________系别:__ 生命科学学院_____专业：___ 生物工程_________学号：_ _ _指导教师：____ ____ ____2012年5 月9日目录摘要 (1)1 放线菌的分类研究意义与方法 (2)1.1放线菌 (2)2放线菌的分类方法的发展历程与意义 (3)2.1形态学与培养特征上的分类与鉴定 (3)2.2数值分类方法 (3)2.3化学分类 (3)3 放线菌的分子生物学分类的发展情况 (4)3.1.DNA碱基组成分析： (4)3.2.DNA-DNA同源性分析： (4)3.3.DNA-rRNA同源性分析： (4)3.4.核酸的一级结构的分析： (5)3.5.16S rRNA基因序列分析： (5)3.7.PCR-RFLP分析： (5)3.8.rep-PCR指纹分析技术： (5)3.9.RAPD分析： (6)3.10.AFLP指纹分析技术： (6)4放线菌的分类在未来发展的方向及意义 (6)参考文献 (6)致谢................................................................ 错误!未定义书签。
放线菌的分类方法摘要：放线菌是原核生物的一个类群，相关分类学经历了早期的形态学上的经典分类（主要从其形态结构来进行分类），数值分类（运用计算科学与技术对放线菌进行描述分类），化学分类（运用化学分析的方法对放线菌的细胞壁和组成成分进行分析归类），直至今天的分子分类。
通过对放线菌的分类进而建成系统进化树，更加方便了放线菌的研究与应用。
由于科学进步的发展放线菌在分子分类中又有了不同的研究方法，由（G+C）mol%的差别而分析的物种亲缘关系的远近形成的DNA碱基组成分析发展到在DNA杂交中的DNA序列互补程度来推断它们的的DNA-DNA同源性分析，从核酸的一级结构上的分析到RNA的二级结构上的分析等方法。