常用生物软件大汇总

序列综合分析

Vector NTI Suite8.0

不喜欢装备各种专业性强的软件,而希望用一个综合性的软件代替的同志可以选择本软件。本阶段的大部分功能它都有。该软件具体特有良好的数据库管理(增加、修改、查找,对要操作的数据放在一个界面相同的数据库中统一管理。软件中的大部分分析可以通过在数据库中进行选定(数据->分析-

>结果(显示、保存和入库三步完成。在分析主界面,软件可以对核酸蛋白分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析和操作,生成重组分子策略和实验方法,进行限制酶片段的虚拟电泳,新建输入各种格式的分子数据、加以注释,输出高质量的图像。Ve ctor NTI Suite

还有以下独立的分析程序,完成相关分析。这些独立的程序,可以通过选定->分析- >

结果三步调用。

l 3DMol-显示PDB格式分子的三维结构

l Align X-序列相似性比较

l Align Xblocks-序列局部完全相同比较

l ContigExpress-将小片段拼装成长序列

l GCGConverter-GCG格式文件转换成NTI的格式

l PubMed/Entrez Search-搜索PubMed、PDB、GenBank

l Back Translation-核酸->蛋白->核酸反向翻译的工具

l Matrix Editor-矩阵数据编辑

l Tools Manager-

连接其他程序和网络连接的界面。分成Align、Analyze、Assemble、Tools四部分。

DNAStar5.03即著名的Lasergene Suite,由EditSeq MegAlign、GeneQuest MapDraw PrimerSelect Protean SeqMan

II七个模块组成,该软件的MegAlign模块,可以对多达64000的片段进行拼装。整个拼装过程即时显示,并提示可能的完成时间。拼装结果采用序列、策略等方式显示。DN Astar是哈佛大学医学院是使用的序列分析软件,可见其功能强大。

Omiga2.0实际上,大部分对核酸蛋白的序列分析功能,在O miga

2.0中都能找到;而且界面非常友好。Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软件,它还兼有引物设计的功能。主要功能:编辑、浏览、蛋白质或核酸序列,分析序列组成。用Clu stal.

W进行同源序列比较,发现同源区。实现了核酸序列与其互补链之间的转化,序列的拷贝、删除、粘贴、置换以及转化为RNA链,以不同的读码框、遗传密码标准翻译成蛋白质序列。查找核酸限制性酶切位点、基元(Motif及开放阅读框(ORF,设计并评估PCR、测序引物。查找蛋白质解蛋白位点(Proteolytic

Sites、基元、二级结构等。查寻结果可以以图谱及表格的显示,表格设有多种分类显示形式。利用Mange快捷键,用户可以向限制性内切酶、蛋白质或核酸基元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信息。每一数据库中都设有多种查寻参数,可供

选择使用。用户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数。可从M acVectorTM、Wisconsin

PackageTM等数据库中输入或输出序列。另外,该软件还提供了一个很有特色的类似于核酸限制酶分析的蛋白分析,对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生多肽片段。

DS gene :Omiga 2.0的换代产品,accelrys公司Discovery studio系列,accelrys

公司的insight II,GCG是业内蛋白分析和核酸分析的权威软件,DS gene是G CG

的个人机简版,功能强大,而且可以直接与GCG服务器相连。由于受到vector NTI 的界面影响,DS gene与Omiga2.0相比界面有了很大的改变。

DNASIS for Windows2.5版是日立软件公司(Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能,可进行DNA,RNA,蛋白质序列的编辑和分析,甚至还能进行质粒作图、数据库查询等功能,足可满足一般实验室的要求。在DOS时代,DNASIS

7等版本便是流传甚广并曾给过许多人以帮助的分子生物学软件,因此我们有理由期待Win版的DNASIS会带给我们惊喜。

DNASIS MAX 1.0 DNASIS

2.5的更新换代产品。综合序列分析软件,体积比上一个版本一下膨胀了许多。界面风格也改变了很多。

DNATools5.1与O miga, DNAsis,

PCgene等软件属于同一类的综合性软件,操作简单功能多。DNATools设计的用户友好、强壮,以便快速、方便地获取、贮藏和分析序列及数据库查询获得的序列相关信息。DNATools包容性很好,能把几乎所有文本文件打开作为序列。当程序不能辨别序列的格式时(通过寻找常用序列格式的特征,会显示这个文件的文本形式,以便你编辑生成正确的蛋白质或DNA序列,编辑后可以再被载入程序。若你的序列是DNAToo ls格式时(DNA或寡核苷酸序列,程序不加注解的载入序列,程序模式调整成可以接受载入的数据类型(蛋白质、DNA和寡核苷酸引物序列。在一个项目中可以加入几千个序列或引物,并在整个项目中分析这些序列及标题。这个程序的一个特点是给每个序列或引物添加文本标题。这样就可以用自定义的标题识别序列,而不必通过它们的文件名。

Bioedit一个具有序列简单分析和序列对比功能的软件。该软件有一个简单亲切的界面,集成其他已经很有效果的序列比对软件。另外该软件还有很多有用的相关站点连接。虽然该软件看起来结构简单,但却又很强的可充性,可以自由整合许多软件, 例如viewtree.

Jellyfish2.1

只水母不简单,可以用来进行DNA翻译,序列排队比较,限制酶消化,提交序列进行BL AST,研究项目管理等。操作十分简单,只需拖动与点击便可。Genetools

Genebio公司的核酸序列分析软件,虽然不及vect NTI 和DS gene强大,它具有r epeat

/vect find 使其他分析软件所不具有的,值得一提的是该软件具有的CpG

island分析。DNAMAN

限制酶分析,引物设计,对排(aligment,翻译,数据库操作,Blast,序列装配(Sequence assembly.易学易用,操作方便。

十一、数据统计类软件

SAS世界排名第一,专业性极强,能做各种统计,是FDA唯一批准有效的统计软件。但人机对话不方便,主要是类似DOS下的命令操作,最新的8.0版本,稍有改进,鼠标操作性较好,若今后能进一步改进操作的话,其应用将大大广泛。是专业统计人员的首选软件。

SPSS,世界排名第二,最新版本11.01,其特点:功能强大,易于操作,简单明了,人机对话方便,数据库接口丰富,最新SPSS可以读出SAS数据,是业余人员的首选。最新版本纠正以往的不稳定、运行速度慢的缺点。11.0运行速度是

10.0的十倍以上,主要原因是SPSS公司将原有的内核全部更换了。但SPSS分为不同

版本,如basic

版、standard版和a dvance版。许多复杂的统计功能只在advance版中才出现,如复杂多元相关、神经网络统计,而前两版中许多复杂统计并没有(可能为了便于安装使用吧,1 1.0的basic版约60M,standard约110M-

150M,而高级版本则几百M。象SAS完成安装则达6张CD!因而绝大多数人不可能使用它全部功能。因而常规建议是SPSS+origin6.0一个统计,一个作图,而且二者数据可以通用,效果很好!

statisitic:最新10.0,运行速度最快,模块化操作,不同统计数据有不同界面风格,使

用方便,目前国内有很多用户。但其知名度在前二者之下,对一般用户可以考虑选用。

Origin7.0

是一个非常有名并且易于使用的科学用途数据绘图与数据分析处理工具软件,各种期刊上的统计图,几乎都是出自他的手笔。

以上的软件过于强大,下面是一些小巧易用的数据统计作图,更适合生物学的数据分析:

GraphPad

Prism著名的数据处理软件,用来进行生物学统计、曲线拟合以及作图。短小而功能齐全。

SigmaPlot 2002

著名的绘图和数据分析软件包可以根据各种数据,绘制精确的两维或三维曲线,可以自由定制各数据轴的特性,并能进行数据的各种统计分析。进行一般的生物类数据处理作图,功能足以。

Simstat

一个易于使用的智能统计软件尤其适合对统计知识了解不多的人使用,它具有一个“ 专家系统”,引导你对数据进行统计分析。可与S igmaPlot结合生成高质量数据图。

CurveExpert

ELISA标准曲线拟合、及其它各种有关的实验数据分析,都可以应用C urveExpert进行数据分析。它使用非常方便,可以说是实验数据处理的圣手,并且可以生成漂亮的曲线应用到论文之中。

十二、文献管理

reference Manager 10.0

可以在线通过查找关键词搜索PubMed和609个Z39.50数据库中的专业资料,同时保存查找的资料为本地文件。资料内容和记录分上下两个屏幕,如有全文或想连接网络时敲键盘就可以到相应的全文文章和摘要。可以直接在WORD中查找资料,并插入

引用。在文章中对引用的文献可以格式化,引用的参考资料格式有很强的用户自定义功能,可以符合各种杂志对引用格式的要求,引用时不用多窗口切换. Endnote6.0

专业参考文献查询软件,可在线查找Ineternet上的各种文献数据库,将查找到的资料保存入本地数据库,并自动生成格式化的参考文献清单插入各种文字处理软件。

十三、进化树分析

Phylip

最为通用的进化树分析软件。主要包括五个方面的功能软件:i,DNA和蛋白质序列数据的分析软件。ii,序列数据转变成距离数据后,对距离数据分析的软件。iii,对

基因频率和连续的元素分析的软件。iv,把序列的每个碱基/氨基酸独立看待(碱基/氨基酸只有0和1的状态时,对序列进行分析的软件。v,按照DOLLO简约性算法对序列进行分析的软件。vi,绘制和修改进化树的软件。

PUZZLE

核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具。根据序列数据的最大相似性构建进化树,一个软件,并且对树进行bootstrap评估。可对大量数据进行快速分析构建,程序还包含数个统计测试。

Paup

一种功能强大的商业版系统进化分析软件,据称价值一万大洋。

常用工具软件

常用工具软件常用工具软件北京大学出版社教学目标通过本章的学习，使学生了解最常用的计算机工具软件，如压缩和解压缩软件、浏览工具软件、备份与恢复软件、多媒体播放软件简介、防病毒软件、下载工具软件的基本功能，熟练掌握其操作方法，并熟悉一些相应的使用技巧。2013-11-16 新编计算机基础案例教程 2主要教学内容 7.1 常用工具软件概述7.2 “WinRAR的使用”案例7.3 “ACDSee 软件的使用” 案例7.4 “使用一键Ghost对系统进行备份与恢复” 案例 7.5 “多媒体播放软件的使用” 案例7.6 “杀毒软件的安装使用” 案例7.7 “常用下载工具软件的使用” 案例2013-11-16 新编计算机基础案例教程 37.1 常用工具软件概述常用的工具软件有四大类，包括网络、媒体、图文及系统工具软件，这些软件均是在日常办公、娱乐、上网冲浪、获取信息时经常接触到的实用软件。了解并熟练掌握使用这些工具软件，可以更方便、更有效地使用计算机，大大提高工作效率和改善工作质量。2013-11-16 新编计算机基础案例教程 47.1.1 压缩和解压缩软件简介现在比较流行的压缩和解压缩工具软件有WinRAR和WinZip等。WinRAR与WinZip的功能比较: WinRAR有官方的简体中文版，并且安装文件很小，界面友好，使用方便，压缩功能强大，其独特的多媒体压缩算法和紧固式压缩法更是有针对性地提高了压缩率，并且能够对文件进行分卷压缩。完全兼容RAR和ZIP格式，提高了其易用性。 WinZip仅有英文版汉化包，安装文件比较大，兼容性较好，压缩后生成的.zip文件的大小较WinRAR仍要大。WinZip 保持了压缩速度的优势，在压缩大文件和比较多的文件时，比起 WinRAR基本上要快出2倍。2013-11-16 新编计算机基础案例教程 57.1.2 图像浏览工具软件简介用户想快速的浏览，整理和分享，就需要图像浏览工具来帮忙。 ACDSee是目前非常流行的图像浏览工具，它是ACD System公司开发的图像浏览软件，

常用分子生物学软件简介

常用分子生物学软件简介公司内部编号：（GOOD-TMMT-MMUT-UUPTY-UUYY-DTTI-

常用分子生物学软件一、基因芯片： 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。Arraypro Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 phoretix? Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境后后，才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。 3、基因芯片数据分析软件 Cluster

斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显着性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。 4．基因芯片聚类图形显示 TreeView 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计 Array Designer DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具二、RNA二级结构。 RNA Structure RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退

生物信息学软件及使用概述

生物信息学软件及使刘吉平 liujiping@https://www.360docs.net/doc/654054586.html, 用概述生物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m

生物信息学是一门新兴的交叉学生物信息学的概念：科，它将数学和计算机知识应用于生物学，以获取、加工、存储、分类、检索与分析生物大分子的信息，从而理解这些信息的生物学意义。生物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m

分析和处理实验数据和公共数据，生物信息学软件主要功能 1.2.提示、指导、替代实验操作，利用对实验数据的分析所得的结论设计下一阶段的实验 3.实验数据的自动化管理 4.寻找、预测新基因及其结构、功能 5.蛋白质高级结构及功能预测（三维建模，目前研究的焦点和难点）生物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m

功能1. 分析和处理实验数据和公共数据，加快研究进度，缩短科研时间 ?核酸：序列同源性比较，分子进化树构建，结构信息分析，包括基元(Motif)、酶切点、重复片断、碱基组成和分布、开放阅读框（ORF ），蛋白编码区（CDS ）及外显子预测、RNA 二级结构预测、DNA 片段的拼接； ?蛋白：序列同源性比较，结构信息分析（包括Motif ，限制酶切点，内部重复序列的查找，氨基酸残基组成及其亲水性及疏水性分析)，等电点及二级结构预测等等； ?本地序列与公共序列的联接，成果扩大。生物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m

Antheprot 5.0 Dot Plot 点阵图 Dot plot 点阵图能够揭示多个局部相似性的复杂关系生物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m

常用生物学软件简介

网址： https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/ 1. Oligo 6是目前使用最为广泛的一款引物设计软件，除了可以简单快捷地完成各种引物和探针的设计与分析外，还具有很多其他同类软件所不具有的高级功能：a) 已知一个PC R引物的序列，搜寻和设计另一个引物的序列。b) 按照不同的物种对MM子的偏好性设计简并引物。c) 对环型DNA片段，设计反向PCR引物。d) 设计多重PCR引物。e) 为LCR反应设计探针，以检测某个突变是否出现。f) 分析和评价用其他途径设计的引物是否合理。g) 同源序列查找，并根据同源区设计引物。 h) 增强了的引物/探针搜寻手段。设计引物过程中，可以“Lock”每个参数，如Tm值范围和引物3’端的稳定性等。i) 以多种形式存储结果；支持多用户，每个用户可保存自己的特殊设置。网址： Oligo 6.71 Demo（引物设计软件）：https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/Soft/2006/112.htm Oligo—引物设计软件电子教程（引物设计和评估） Oligo 6 Tour 主要功能介绍 https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/ 2．Vector NTI Suite是一套功能最全，而且界面最美观，最友好的分子生物学应用软件包。主要包括四个大型软件，它们分别可以对DNA、RNA、蛋白质分子进行各种分析和操作。Vector⑴NTI：作为Vecto r NTI Suite的核心组成部分，它可以在生物研究的全过程中提供数据组织和序列编辑的软件支持。Vector NTI 是以一种窗口形式，且支持项目组织的数据库来完成这一功能的；通过这个数据库，可以保存和组织大部分的实验数据，比如：基因结构、载体、序列片断、引物、蛋白质、多肽、电泳Markers和限制性内切酶等。实际上，该数据库还支持对Vector NTI Suite中各种小型的绘图和结果展示工具的管理。Vector NTI 可以按照用户要求设计克隆策略。用户只需提供克隆载体，外源片断序列，明确载体克隆的大致位置或酶切位点，其它工作由软件完成。设计结果以图文形式输出到屏幕；最后根据客户定制的条件进行模拟电泳。Vector NTI 还具有强大的设计和评估PCR引物、测序引物和杂交探针功能。BioPlot⑵：BioPlot 是一个对蛋白质和核酸序列进行各种理化特性分析的综合性工具，它是一种方便的桌面程序。和其他程序不同的是，BioPlot可以绘制50种以上预定制的蛋白质特征图谱，如疏水性和抗原性；并将序列与特征图谱和活性序列区域一一对应。BioPlot还可以对核酸序列进行8种不同类型的分析，如：退火温度、自由能和GC含量等。AlignX⑶：AlignX可以对多个蛋白质或核酸序列进行同源比较，以寻找不同序列之间的同源区域或相似性很高序列中的不同碱基，并绘制进化树；为下一步设计PCR引物、探针及研究系统发育提供基础。AlignX可以识别所有标准TXT格式，如FASTA、GeneBank、EMBL、SWISS－PROT、GenPept 和ASCII Text。ContigExpress⑷：Contig Express是用来对多个小核酸片段进行拼接而形成连续的长序列。这些小片段可以是Text序列，也可以是直接从自动测序仪得到的测序图。它用同一个浏览窗口来组织序列片段和拼接结果，同时还有一个由多个子窗口组成的窗口将序列和它们的特性测序图及拼接示意图分别对应。拼接的结果可以直接保存成GeneBan k、EMBL或FASTA文件。Vector NTI Suite⑸其他功能：支持多用户。提供PubMed/Entrez－Search、B last Search、Blast Viewer和3D－Mol(用来看PDB文件)等在线工具。网址： Vector NTI7.0 中文使用手册 Vector NTI Suite 9.1 Demo（综合性蛋白核酸分析工具包）https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/Soft/2007 /460.htm https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/solutions/vectornti/index.html 3．DNAStar 是一款基于Windows和Macintosh平台的序列分析软件，特点是操作简单，功能强大。主

常用工具软件教学提纲

第一章常用软件基础班级： 1301 姓名：马新林一、填空题 1．关于计算机软件，根据其用途可以分为两大类，即系统软件和应用软件。 2．操作系统的功能通常包括处理器管理、文件管理、存储管理、设备管理和作业管理等。 3．应用软件是用户可以使用的各种程序设计语言，以及用各种程序设计语言编制的应用程序的集合，分为应用软件包和用户程序。 4. 工具软件是指除操作系统、大型商业应用软件之外的一些软件。工具软件一般是共享软件、免费软件、自由软件或者软件厂商开发的小型商业软件。 5．获取软件的渠道主要有3种，包括从实体商店购买、从软件开发商网站下载、在第三方的软件网站下载。 6．软件许可证的许可范围包括发表权权、署名权权、发行权、修改权权、复制权权、信息网络传播权权、出租权权、翻译权等权利。二、选择题 1．以下（ B ）属于系统软件。 A. MS Office B. Windows XP C．Photoshop D．酷我音乐盒 2．以下（ B ）不属于办公软件。 A．MySQL B.金山WPS C．MS Office D. 红旗2000 RedOffice 3. 以下（ D ）类软件授权是允许用户自行修改源代码的。 A．商业软件 B.共享软件C．免费软件 D. 开源软件 4．保护软件知识产权的目的不包括（ C ）。 A．鼓励科学技术创新B．保护行业健康发展 C．与国际接轨D．保护消费者的利益 5．以下（ D ）不是开源许可证的共同特征。 A．发布义务 B．保护代码完整C．允许修改D．允许与非开源代码混合第二章计算机主要硬件指标及硬件检测软件一、填空题 1．在冯·诺依曼的经典计算机理论中，计算机硬件系统由运算器、控制器、存储器、输入设备和输出设备组成。 2．现代的计算机应用了大规模集成电路技术，将运算器和控制器集成在了一起。 3．控制器负责控制程序指令的执行顺序，并给出执行指令时计算机各部件所需要的操作控制命令，是向计算机发布命令的神经中枢。 4．影响计算机硬件工作的外部因素主要包括环境温度、环境湿度等。 5．计算机运行时，室内温度不应高于 30℃。当温度超过 35℃时，就应停止计算机的工作。 6．计算机硬件工作时，室内的空气湿度最佳范围是 40% 到 60% 。二、选择题

《常用工具软件》实验

《常用工具软件》实训1 “请按照要求进行上机实践，切勿玩游戏！” 1. 通过Google或百度等搜索引擎查找以下版本的软件，了解各版本软件的含义。 2. 访问以下国著名的软件下载站点并回答下列问题：（请在Word中做答，并将此答题文档和主题以“行政班级+学+学号”的方式命名，发到stonebiaoqq.）。 ●华军软件园——https://www.360docs.net/doc/654054586.html, ●硅谷动力下载——https://www.360docs.net/doc/654054586.html, ●太平洋下载——https://www.360docs.net/doc/654054586.html, ●天空软件站——.skycn. ●21cn下载——dl.it.21cn. 选择其中的一个回答下列问题：（1）该站点在国那些城市建立了镜像站点，为什么建立这么镜像站点，每个镜像站点的容是不是都是一样的。（2）该站点将软件分为哪些类别及其子类，列举每一个子类具有代表性的软件（1-2个）。（3）该站点从那些方面给出了一个可供下载软件的信息（例如：软件大小、运行环境和网友评论等）。（4）采用站搜索方式下载一个特定的软件：比如通用解压缩软件WinRAR。（5）列出该中目前下载人数最多，人气最旺的软件（前十名）。 3. 在“2”中的任意一个过分类查找或名字搜索的方式查找下列最常用的工具软件，了解软件的功能（可通过查看软件简介了解）、运行环境、网友的评价等信息。下次上课时会就此容提问，例如“给定你一个下表中某个软件的名字，请你回到它是那个类别的软件，主要有些什么功能？，或者倒过来问你“给出某个软件类别，请你给出该类别中被广泛使用的软件有哪些？

4. 在“2”中的任意一个中下载你熟悉的2—3个工具软件并安装，结合上课时所讲的容体会软件安装的基本流程，安装完毕后验证软件启动和退出的多种方法，最后通过多种方式卸载所安装的软件。 5. 查看实验室电脑上你所熟悉的软件的版本，并到网上查找该软件的最新版本，如果发现当前软件不是最新的，请使用不同的更新方式更新这些软件。（选做题） 6. 了解绿色软件的概念，访问一些目前流行的绿色软件下载：（选做题） ●绿色软件联盟——.xdowns. ●绿色下载站——https://www.360docs.net/doc/654054586.html, ●绿色软件站——https://www.360docs.net/doc/654054586.html, 在其中下载1-2个你熟悉的绿色软件，体验其优点。

常用生物软件大汇总(精)

常用生物软件大汇总序列综合分析 Vector NTI Suite 8.0 不喜欢装备各种专业性强的软件,而希望用一个综合性的软件代替的同志可以选择本软件。本阶段的大部分功能它都有。该软件具体特有良好的数据库管理(增加、修改、查找,对要操作的数据放在一个界面相同的数据库中统一管理。软件中的大部分分析可以通过在数据库中进行选定(数据->分析->结果(显示、保存和入库三步完成。在分析主界面,软件可以对核酸蛋白分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析和操作,生成重组分子策略和实验方法,进行限制酶片段的虚拟电泳,新建输入各种格式的分子数据、加以注释,输出高质量的图像。Vector NTI Suite 还有以下独立的分析程序,完成相关分析。这些独立的程序,可以通过选定->分析->结果三步调用。 l 3DMol-显示PDB格式分子的三维结构 l Align X-序列相似性比较 l Align Xblocks-序列局部完全相同比较 l ContigExpress-将小片段拼装成长序列 l GCGConverter-GCG格式文件转换成NTI的格式 l PubMed/Entrez Search-搜索PubMed、PDB、GenBank l Back Translation-核酸->蛋白->核酸反向翻译的工具 l Matrix Editor-矩阵数据编辑 l Tools Manager-连接其他程序和网络连接的界面。分成Align、Analyze、Assemble、Tools四部分。

DNAStar5.03即著名的Lasergene Suite,由EditSeq MegAlign、GeneQuest MapDraw PrimerSelect Protean SeqMan II七个模块组成,该软件的MegAlign模块,可以对多达64000的片段进行拼装。整个拼装过程即时显示,并提示可能的完成时间。拼装结果采用序列、策略等方式显示。DNAstar是哈佛大学医学院是使用的序列分析软件,可见其功能强大。 Omiga 2.0实际上,大部分对核酸蛋白的序列分析功能,在Omiga 2.0中都能找到;而且界面非常友好。Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软件,它还兼有引物设计的功能。主要功能:编辑、浏览、蛋白质或核酸序列,分析序列组成。用Clustal. W 进行同源序列比较,发现同源区。实现了核酸序列与其互补链之间的转化,序列的拷贝、删除、粘贴、置换以及转化为RNA链,以不同的读码框、遗传密码标准翻译成蛋白质序列。查找核酸限制性酶切位点、基元(Motif及开放阅读框(ORF,设计并评估PCR、测序引物。查找蛋白质解蛋白位点(Proteolytic Sites、基元、二级结构等。查寻结果可以以图谱及表格的显示,表格设有多种分类显示形式。利用Mange 快捷键,用户可以向限制性内切酶、蛋白质或核酸基元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信息。每一数据库中都设有多种查寻参数,可供选择使用。用户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数。可从MacVectorTM、Wisconsin PackageTM等数据库中输入或输出序列。另外,该软件还提供了一个很有特色的类似于核酸限制酶分析的蛋白分析,对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生多肽片段。 DS gene :Omiga 2.0的换代产品,accelrys公司Discovery studio系列,accelrys 公司的insight II,GCG是业内蛋白分析和核酸分析的权威软件,DS gene 是GCG 的个人机简版,功能强大,而且可以直接与GCG服务器相连。由于受到vector NTI 的界面影响,DS gene 与Omiga 2.0相比界面有了很大的改变。 DNASIS for Windows 2.5版是日立软件公司(Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能,可进行DNA,RNA,蛋白质序列的编辑和分析,甚至还能进行质粒作图、

生物学软件_大全

生物学软件大全 1.三维分子类 RASMOL：观看生物分子3D微观立体结构 RasTop：为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件 CHIME：直接在浏览器中观看3D分子 MolMol：将pdb等格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件raswin.exe.gz：rasmol(win)2.7.0.1 rasmol新版本及汉化版本CrystInfo：用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构PDViewer：PDB格式文件的查看程序 Weblab Viewlite：三维分子浏览工具及大量分子文件例子 Weblab ViewerPro：三维分子浏览工具 ICMLite：三维分子浏览工具，有一些其他软件没有的功能VMD：三维分子浏览工具，可以进行动态显示 CN3D：3D分子结构观察软件 WPDB：PDB文件检索显示分析软件 DTMM：三维分子模型显示、编辑与构建程序 Mole：高性能的大分子三维图形显示计算工具 gopenmol：显示并分析分子结构及其特性 POV-Rayv：生成三维图像工具软件 MolPOV：将PDB文件转化为POV格式文件的软件 Mol2Mol：分子文件格式转换软件 PovChem：将PDB文件转化为POV格式的文件 Ortep-3 for Windows：生成分子的热椭圆形点图 PLATON：通用结晶学软件工具 Mage：读取并演示Kinemage格式文件的专用软件 Prekin ：将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件 Swiss-Pdb Viewer：PDB文件显示与分析软件 DINAMO：蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具PCMoleeule2 Lite：查看PDB格式文件的免费软件 StrukEd ：化学分子编辑与三维模型生成软件 JMVC：使用JA V A技术编写的三维分子查看器 ReView：读取及分析XYZ格式三维分子文件 Oscail：用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包 Moilin：分子构建与观察软件 Tinker：与Moilin配套的DOS下的分子设计建模 Biodesigner：免费的分子建模与显示软件 MoluCAD：全功能的分子建模与显示工具软件 Viewer Activex Control：三维分子显示控件 MarvinView：JA V A语言编写的化学分子二维与三维显示程序 ACD/3D Viewer for ISIS：免费的ISISDraw三维显示插件 Amira：高等三维显示建模系统 AmiraMol：Amira 2.3 相应的显示三维分子的增强工具Visualize：分子建模和研究软件包

常用工具软件学习报告

学习报告题目：常用工具软件的分类、安装与使用技巧院系：数学科学系姓名：学号：专业：年级：授课教师：完成日期：

常用工具软件的分类、安装与使用一、学习内容 1、常用工具软件的分类第一类：windows系统工具软件作用：维护系统的正常的运行优化系统使得到最佳的运行效果管理系统。比如：windows自带备份与还原工具，磁盘清理磁盘碎片整理程序，系统还原，任务管理器。第二类：系统优化与设置工具作用：是计算机性能最优化，保证计算机处于工作的理想状态。比如：windows优化大师，超级兔子等。第三类：磁盘工具软件作用：对硬盘及时维护、备份，使系统保持稳定。比如：分区魔术师，还原精灵等。第四类：压缩工具软件作用：便于文件存储和数据传输。比如：WinRAR，WinZip等。第五类：下载工具作用：下载所需资源。比如：BT下载，迅雷，快车，电驴，QQ旋风等。第六类：聊天工具作用：与人沟通交流。比如：腾讯QQ，MSN，新浪UC，ICQ，阿里旺旺等。第七类：安全工具作用：抵御病毒，查杀有害病毒，采取措施把损失降到最低，使计算机正常工作。比如：360杀毒，金山毒霸，卡巴斯基，瑞星等。第八类：光盘刻录作用：电脑里暂时不用的软件比较占空间的刻录到光盘，节省电脑的空间，把重要数据备份，按自己喜好选择性的收藏。比如：刻录工具Nero，刻录音乐，视频等。第九类：多媒体工具作用：播放视频，音乐等娱乐，阅读浏览图片处理制作，浏览网页。比如：影音风暴，酷狗，ACDSee，红蜻蜓抓图精灵，超星阅览器，搜狗高速浏览器等。第十类：汉化翻译作用：进行各类语言翻译，并将其转换为汉文使人得以看懂，，不必学习很多语言也能通过翻译理解。比如：金山快译，南极星全球通，东方快车等。

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一、基因芯片： 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境JRE1.2后(5.1M)后，才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze 2.44 ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。

3、基因芯片数据分析软件 Cluster 斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显著性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。4．基因芯片聚类图形显示 TreeView 1.5 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计 Array Designer 2.00 DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具二、RNA二级结构。 RNA Structure 3.5 RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA

常用分子生物学软件简介

常用分子生物学软件一、基因芯片： 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 phoretix?Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境JRE1.2后(5.1M)后，才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze 2.44 ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。 3、基因芯片数据分析软件 Cluster 斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显著性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。 4．基因芯片聚类图形显示 TreeView 1.5 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计 Array Designer 2.00 DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具二、RNA二级结构。 RNA Structure 3.5 RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由T urner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠

生物学软件大全

MolPOV：将PDB文件转化为POV格式文件的软件 Mol2Mol：分子文件格式转换软件 PovChem：将PDB文件转化为POV格式的文件 Ortep-3 for Windows：生成分子的热椭圆形点图PLATON：通用结晶学软件工具 Mage：读取并演示Kinemage格式文件的专用软件 Prekin ：将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件Swiss-Pdb Viewer：PDB文件显示与分析软件 DINAMO：蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具PCMoleeule2 Lite：查看PDB格式文件的免费软件StrukEd ：化学分子编辑与三维模型生成软件 JMVC：使用JA VA技术编写的三维分子查看器ReView：读取及分析XYZ格式三维分子文件 Oscail：用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包Moilin：分子构建与观察软件 Tinker：与Moilin配套的DOS下的分子设计建模Biodesigner：免费的分子建模与显示软件 MoluCAD：全功能的分子建模与显示工具软件 Viewer Activex Control：三维分子显示控件MarvinView：JA VA语言编写的化学分子二维与三维显示程序 ACD/3D Viewer for ISIS：免费的ISISDraw三维显示插件

十大常用工具软件集锦

实用为上！十大常用工具软件集锦随着电脑及互联网的普及，人们传统的工作方式、学习方式及思维方式逐渐发生变化，很多传统的信息查询方式都逐渐被电脑所取代，比如以前我们通常通过去书店买本词典来查询英语单词，而今我们只需安装一款免费的词典软件即可轻松查询单词甚至进行全文翻译，再比如现在很多人喜欢在网上淘宝，买到心仪的商品后很多人喜欢查询快递到达情况，我们再也无需要拿着快递单号去快递公司查询了直接在网上通过软件即可查询。为了生活的更加舒适和便捷，我们需要诸如此类的实用信息查询软件，随着这些软件大多是一些名不见经传的小软件，但是却是日常生活中实用性非常强的好工具，相信有了这些软件的帮助，我们的生活一定会更加舒适和便捷！ 1.淘友必备：快递查询软件推荐——快递精灵随着互联网的普及和人们消费观念的更新，网上购物已经被越来越多人所接受，网购成了时尚，成了不可阻挡的潮流，即使在全球金融风暴的阵阵寒流中，也依然可以看到“风景这边独好”。网购的不断发展，不仅仅给经营者和消费者带来实实在在的实惠，还带动了诸多行业的飞速发展，尤其是物流快递业，作为卖家与买家之间的纽带，快递业无疑遇到了行业发展的春天！很多网友在网购后盼货心情急切，因此对快递跟单查询产生大量需求，一般情况下用户可以进入快递公司的网站进行查询，但是由于快递公司比较多，四处查找快递公司的网址比较不便，因此小编这里为大家推荐一款可以直接查询快递跟单信息的小工具：快递精灵。

快递查询精灵资料：快递查询精灵软件预览：快递查询精灵可以帮助用户查询几乎所有快递公司的跟单信息，包括邮政快递、申通快递、圆通快递等淘宝网常见合作快递单位，如图所示，用户只需在程序界面左侧输入快递单号即可轻松跟踪到快递运输情况。注意：快递查询服务必须在联网状态下进行。

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Excel 提速12招 https://www.360docs.net/doc/654054586.html,生物谷网站Excel是一个全能的电子表格，它功能强大、操作方便，除了可以快速地生成、格式化各种表格外，还可以对表格中的数据完成很多数据库的功能。下面向您介绍几个快速使用Excel的方法技巧。 1、快速启动Excel。若您日常工作中要经常使用Excel，可以在启动Windows时启动它，设置方法：（1）启动“我的电脑”进入Windows目录，依照路径“Start Menu\Programs\启动”来打开“启动”文件夹；（2）打开Excel 所在的文件夹，用鼠标将Excel图标拖到“启动”文件夹，这时Excel的快捷方式就被复制到“启动”文件夹中，下次启动Windows就可快速启动Excel了。若Windows已启动，您可用以下方法快速启动Excel。方法一：双击“开始”菜单中的“文档”命令里的任一Excel工作簿即可。方法二：用鼠标从“我的电脑”中将Excel应用程序拖到桌面上，然后从快捷菜单中选择“在当前位置创建快捷方式”以创建它的快捷方式，启动时只需双击其快捷方式即可。 2、快速获取帮助。对于工具栏或屏幕区，您只需按组合键Shift＋F1，然后用鼠标单击工具栏按钮或屏幕区，它就会弹出一个帮助窗口，上面会告诉该元素的详细帮助信息。 3、快速移动或复制单元格。先选定单元格，然后移动鼠标指针到单元格边框上，按下鼠标左键并拖动到新位置，然后释放按键即可移动。若要复制单元格，则在释放鼠标之前按下Ctrl即可。 4、快速查找工作簿。您可以利用在工作表中的任何文字进行搜寻，方法为：(1)单击工具栏中的“打开”按钮，在“打开”对话框里，输入文件的全名或部分名，可以用通配符代替；(2)在“文本属性”编辑框中，输入想要搜寻的文字，最好是您认为是唯一的单词或短语，以便搜寻更容易成功；(3)选择“开始查找”即可。在找到满足条件的文件前，“打开”对话框的状态栏都会显示“找到了0个文件”的信息，您应该耐心等待，只有当“打开”按钮由灰化状态变成可用状态时，才表明搜寻结束。 5、快速打印工作表。若选择“文件”菜单中“打印”命令来打印，会出现“打印”对话框让您选择，程序繁琐。若要跳过该对话框，您可以单击“常用”工具栏上的“打印”按钮或者按下Shift键并单击“打印预览”按钮，Excel将使用“选定工作表”选项打印。 6、快速切换工作表。按Ctrl＋PageUp组合键可激活前一个工作表，按Ctrl＋PageDown组合键可激活后一个工作表。您还可用鼠标去控制工作表底部的标签滚动按钮快速地移动工作表的名字，然后单击工作表进行切换。 7、快速切换工作簿。对于较少工作簿切换，可单击工作簿所在窗口。要对多个窗口下的多个工作进行切换，用“窗口”菜单最方便。“窗口”菜单的底部列出了已打开了工作簿的名字，要直接切换到一个工作簿，从“窗口”菜单选择它的名字即可。“窗口” 菜单最多能列出9个工作簿，若多于9个，“窗口”菜单则包含一个名为“多窗口”的命令，选用该命令，则出现一个按字母顺序列出所有已打开的工作簿名字的对话框，只需单击其中需要的名字即可。 8、快速插入Word表格。Excel可以处理Word表格中列出的数据，您可用以下方法快速插入Word表格：(1)打开Word表格所在的文件；(2)打开要处理Word表格的Excel文件，并调整好两窗口的位置，以便能看见表格和要插入表格的区域；(3)选中Word中的表格；(4)按住鼠标左键，将表格拖到Excel窗口中，松开鼠标左键将表格放在需要的位置即可。 9、快速链接网上的数据。您可以用以下方法快速建立与网上工作簿中数据的链接：(1)打开Internet上含有需要链接数据的工作簿，并在工作簿选定数据，然后单击“编辑”菜单的“复制”命令；(2)打开需要创建链接的Excel工作簿，在需要显示链接数据的区域中，单击左上角单元格；(3)单击“编辑”菜单中的“选择性粘贴”命令，在“选择性粘贴”对话框中，选择“粘贴链接”按钮即可。若您想在创建链接时不打开Internet工作簿，可单击需要链接处的单元格，然后键入(=)和URL地址及工作簿位置，如：=https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/[filel.xls]。

生物软件

常用生物软件大汇总(window 版）一、基因芯片： 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 phoretix? Array Nonlinear Dyna mics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境JRE1.2后(5.1M)后，才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze 2.44 ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。 3、基因芯片数据分析软件 Cluster 斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显著性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。 4．基因芯片聚类图形显示 TreeView 1.5 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计 Array Designer 2.00 DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具二、RNA二级结构。 RNA Structure 3.5 RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA 二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA 折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单

常用工具软件的分类、安装与使用技巧

常用工具软件的分类、安装与使用技巧姓名（系别班级学号：）计算机软件(Computer Software)是指计算机系统中的程序及其文档。程序是计算任务的处理对象和处理规则的描述；文档是为了便于了解程序所需的阐明性资料。程序必须装入机器内部才能工作，文档一般是给人看的，不一定装入机器。软件是用户与硬件之间的接口界面。用户主要是通过软件与计算机进行交流。软件是计算机系统设计的重要依据。为了方便用户，为了使计算机系统具有较高的总体效用，在设计计算机系统时，必须通盘考虑软件与硬件的结合，以及用户的要求和软件的要求。计算机软件总体分为系统软件和应用软件两大类：系统软件是各类操作系统，如windows、Linux、UNIX等，还包括操作系统的补丁程序及硬件驱动程序，都是系统软件类。应用软件可以细分的种类就更多了，如工具软件、游戏软件、管理软件等都属于应用软件类。系统软件是负责管理计算机系统中各种独立的硬件，使得它们可以协调工作。系统软件使得计算机使用者和其他软件将计算机当作一个整体而不需要顾及到底层每个硬件是如何工作的。一般来讲，系统软件包括操作系统和一系列基本的工具（比如编译器，，存储器格式化，文件系统管理，用户身份验证，驱动管理，网络连接等方面的工具）。应用软件是为了某种特定的用途而被开发的软件。它可以是一个特定的程序，比如一个图像浏览器。也可以是一组功能联系紧密，

可以互相协作的程序的集合，比如微软的Office软件。也可以是一个由众多独立程序组成的庞大的软件系统，比如数据库管理系统。我们知道，使用电脑就是让电脑帮我们工作，学习和娱乐，这些都离不开软件，所以电脑知识学习就一定要知道软件安装使用。在电脑运行过程中，不少问题，就有可能是因为软件安装或使用不正确。下面是一些软件安装使用经验: 软件安装使用的一些经验系统，1. 软件选择经验: 仔细选择适合自己的软件。现在软件太多了，看看软件下载的网站就知道，如何选择适合自己软件也是一门学问. 同类软件，款式众多，性能、品位亦有差别。因而，除了选择功能合适，特别要注意软件的口碑。这种比较，可以借助于权威评价或论坛评论，而不用自己都去安装一下，也会减少因为安装软件而引起的系统不安全. 总的来说选择一个比较有品牌的软件是比较安全的。 2不要安装功能太相同软件相同功能软件，选择一个自己认为好的就行了，不用都安装. 如果安装多个同类软件，不仅会占用系统资源事小，电脑知识。还有可能软件之间相互冲突，轻则软件打架，重则系统崩溃。也可能会造成系统运行的不正常，是潜在的威胁。如下载软件，迅雷，快车，电驴等都想要设置成默认下载软件，让你不得安宁。 3.软件安装经验: 小心各种破解软件和破解补丁虽然各种破解软件和破解补丁，让我们使用功能更全的软件，但有时候这些东西被别有用心里的人动过手脚，会使系统存在安全问题，甚至是中毒、中木马、安装垃圾插件等问题。所以使用这些软

启动子生物信息学分析软件

https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/seq_tools/promoter.html 2. PlantCARE（plant cis-acting regulatory elements）, a database of plant cis-acting regulatory elements http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtoo ls/plantcare/html/ 3. promoter 2.0 prediction server http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ 4. 启动子分析网址: 1 https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/seq_tools/promoter.html 2 http://alggen.lsi.upc.es/recerca/menu_recerca.html 3 http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ 4 https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/~molb470/ ... s/solorz/index.html 5 https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/molbio/proscan/ http://bip.weizmann.ac.il/toolbo ... ters.html#databases https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/seq_tools/promoter.html https://www.360docs.net/doc/654054586.html,.sg/promoter/CGrich1_0/CGRICH.htm https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/pub/programs.html#pmatch https://www.360docs.net/doc/654054586.html,.hk/~b400559/arraysoft_pathway.html#Promoter http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalup.html http://intra.psb.ugent.be:8080/PlantCARE/ http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/molbio/proscan/ https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/molbio/signal/ https://www.360docs.net/doc/654054586.html,/thread-41571-1-1.htm 常用启动子分析网址： http://bip.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html#databas es