ChemOffice2008实用教程
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2.3 绘图操作基础
1 2 3
图形基本操作 撤销与重做命令 插入对象
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2.3.1 图形基本操作
图2-11 采用“套索” 或“蓬罩”工具套选图像
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2.3.1 图形基本操作
ChemDraw 11.0的文件基本操作包括剪切、复制、粘贴、清除、选择、 图形的放大或缩小等。可以通过不同的方法来完成这些操作。 (1)通过菜单栏完成操作 (2)通过工具栏完成操作 (3)通过快捷键完成操作
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1.1 ChemOffice2008简介
图1-1 ChemOffice发展历史
3
1.2 ChemOffice2008模块
ChemDraw:化学结构绘图(Chemical Structure Drawing Standard)
Chem3D:分子模拟分析绘图(Molecular Modeling and Analysis)
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2.2.2 打开文件
图2-7 “Open(打开)”对话框
图2-8 “Files of type(文件类型)”下拉列表
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2.2.3 保存文件
图2-9 “Save As(另存为)”对话框
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2.2.4 打印文件
图2-10 “Print(打印)”对话框
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2.2.5 关闭文件
• 关闭文件的操作非常简单,可以直接单击菜单栏中的“File(文 件)”→“Close(关闭)”命令,或按快捷键<Ctrl+W>,或单击窗 口右上角的(关闭)按钮。 •【注意】文件在被关闭之前,如果未保存,系统会弹出对话框提 醒用户保存文件。
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1.2.2 Chem3D模块组件
•Excel Add-on:与微软的Excel完全整合,并可与ChemFinder联合使用。 •Gaussian Client:量子化学计算软件Gaussian 03W的客户端接口,可直接在 Chem3D中运行Gaussian,并提供数种坐标格式(需要安装Gaussian 03W)。 Gaussian是做半经验计算和从头计算时使用最广泛的量子化学软件,可以研究分 子能量和结构、过渡态的能量和结构、化学键、反应能量、分子轨道、偶极矩和多 极矩、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、NMR、极化率和超极化率、 热力学性质以及反应路径等。计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激 发态。Gaussian 03还可以对周期边界体系进行计算。Gaussian是研究取代效应、 反应机理、势能面和激发态能量的有力工具(需另外获得GAMESS)。 •CS GAMESS:量子化学计算软件GAMESS的客户端接口,可直接在Chem3D中 运行GAMESS的计算。 •MOPAC:Fujitsu公司的量子化学计算软件MOPAC已包含在Chem3D Ultra中,搭 配Chem3D的图形界面。分子计算的方法有AM1、PM3、MNDO、MINDO/3和新 的MINDO/d,可以计算瞬时的几何形状及物理特性等。
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1.3 ChemOffice 2008的安装与启动
1 2
系统配置要求 安装、启动及退出
3
如何获得帮助
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1.3.1 系统配置要求
ChemOffice 2008可以在Windows上运行(ChemDraw 2008可在Macintosh 操作系统上运行)。操作系统要求Windows 2000、Windows XP或Windows Vista。需注意的是,到目前为止,ChemOffice 2008只支持32位操作系统, 而不支持64位Windows XP或Windows Vista系统。除此之外,ChemOffice 2008的运行还需Internet Explorer 6.0或更高版本的浏览器,同时也可支持 Mozilla Firefox 1.5(包括Mozilla Firefox 2.0)、Netscape 7.x和Mozilla 1.x 等其他浏览器。需特别注意的是,为了能顺利运行Chem & Bio 3D,显示器 分辨率至少要设置为800×600或以上。 【注意】在本教程的撰写过程中以Windows XP作为操作平台,因此在后面 的介绍中,所有的软件安装及使用都以Windows XP作为默认操作平台。
ChemFinder:化学信息搜寻整合系统(Searching & Information Integration)
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1.2.1 ChemDraw模块组件
• • •
•
• •
AutoNom:是Beilsteiny最强的软件,现已包含于ChemDraw Ultra 中,它可按照IUPAC的标准自动命名化学结构。 ChemNMR:预测13C和1H-NMR谱图,节省实验费用。 ChemProp:预测沸点(BP)、熔点(MP)、临界温度(Tc)、 临界气压(CP)、吉布斯自由能(G)、logP、折射率(n)、热 结构(HF)等性质。 ChemSpec:提示用户输入JCAMP及SPC频谱数据,以比较 ChemNMR预测的结果。 ClipArt:高质量的实验室玻璃仪器图库,用于搭配ChemDraw使用。 NameStruct:输入IUPAC化学名称后可自动生成ChemDraw结 构。
图3-16 “Model Building(建模)”选项卡
图3-5 模型显示工具栏
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3.1.2 文件基本操作
新建文件 打开文件 保存文件
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3.1.3 图形基本操作
撤销及重做 复制、剪切及粘贴 全选及清除 打印
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3.1.4 自定义Chem3D的工作界面
图3-6 “Preferences(参数)”对 话框中的选项卡及功能
图3-7 “General(整体设 置)”选项卡
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1.3.3 如何获得帮助
用户可以通过多种不同的方式轻松获得ChemOffice 2008 的帮助: ①在ChemOffice窗口模式下的“Help”菜单获取帮助文件; ②登录美国剑桥软件公司的主页(http://www. /)获取技术支持。
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1.4 其他绘图软件
图2-4 主工具栏
图2-5 文本工具栏
23
2.1.5 图形工具箱
图2-6 图形工具箱
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2.2 文件基本操作
1 2 3
新建文件 打开文件 保存文件 打印文件 关闭文件
4
5
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2.2.1 新建文件
• 在ChemDraw的文件操作中,当打开软件时会默认建立一个 新的文件,默认的文件名为“Untitled Document-1”。 • 通过单击菜单栏中的“File(文件)”→“New(新建)”(快捷 键为<Ctrl+N>)或“Open Special”命令建立一个新的文件。 • 通过单击工具栏中的“新建(New)”按钮来新建文件。
ChemOffice2008实用教程
——化学结构绘图 分子模拟 数据整合
主编:曾炜、孙延辉、李红霞
时间:2009年8月
目录
1. ChemOffice基础知识 2. ChemDraw操作基础 3. Chem3D操作基础 4. ChemFinder操作基础
1
1. ChemOffice基础知识
1.1 ChemOffice2008简介 1.2 ChemOffice 2008的模块 1.3 ChemOffice 2008的安装与启动 1.4 其他绘图软件
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3. Chem3D操作基础
1 2
工作环境及工作界面
Chem3D模型的建立及操作
化学计算 综合实例
3
4
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3.1 工作环境及工作界面
1
工作环境
2
3 4
文件基本操作
图形基本操作 自定义工作界面
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3.1.1 工作环境
图3-2 标准工具栏
图3-3 构建工具栏
图3-4 动画工具栏
图3-1 Chem3D工作界面
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2.4 自定义ChemDraw的工作界面
1 2 3
页面参数设置 文档设置
工具条的显示及隐藏
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2.5 利用ChemDraw绘制图形
1 2
绘图工具 文本的操作 绘制结构式、反应式及生物分子 化学查询工具及高级绘图技巧 综合实例
3
4 5
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2.6 ChemDraw的扩展功能
1
显示分析信息、物理性质、元素周期表 预测NMR谱图 结构式与名称的相互转换 ChemDraw与Word及Chem3D关联 ChemDraw的在线工具
1 2
ChemWindow ChemSketch ISIS/Draw
3
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2. ChemDraw操作基础
1 ChemDraw的工作环境
2 文件基本操作 3 绘图操作基础 4 自定义ChemDraw的工作界面 5 利用ChemDraw绘制图形 6 ChemDraw的扩展功能
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2.1 ChemDraw的工作环境
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2.3.2 撤销和重做命令
与Word等软件相同,ChemDraw具有保持前一步所做工作的功能。在 绘图区右击,弹出的快捷菜单中即包括“Undo(撤销)”和“Redo(重 做)”命令; 也可以单击工具栏中的(Undo)和(Redo)按钮进行操作。
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2.3.3 插入对象
图2-12 “Insert Object(插入对象)”对话框
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3.1.4 自定义Chem3D的工作界面
图3-13 “Model Settings(模型 设置)”对话框中的选项卡及功能
图3-14 “Colors & Fonts(颜色和字体)” 选项卡
图3-15 “Model Display (模型显示)”选项卡
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3.1.4 自定义Chem3D的工作界面
化学软件chemoffice安装和基本教程
双击需要改变元素符号的原子,弹出输入框,输入元素符号,按回车 键完成原子序号的更改。若原子的三维结构中显示孤对电子,执行关闭 “Tools”菜单中的“Show H’s ans Lp’s”命令,可不显示氢原子和孤对电子。
ChemDraw结构式与3D模型的转换
(1)ChemDraw结构式转换为3D模型 (2)3D模型转换为平面结构式
化学物质检索方法
“ChemFinder”对话框
图 4-40分子结构信息对话框
请按
化学反应的检索
查找免费网络资源
免费资源查找链接
分子模型及仿真软件Chem3D
主界面
3D模型绘制与编辑
(1)利用键工具建立模型 (2)利用文本工具建立模型
(3)利用子结构建立3D模型
子结构模型库
使用模板建立3D模型
利用模板建立富勒烯 3D模型
改变元素序号与替换元素 ➢ 改变元素序号:
首先选中模型。执行“Edit”菜单中的“Select All”命令或ctrl + A快捷键; 然后整理结构,执行“Tools”菜单中的“Clean Up Structure”菜单命令。 使用垂直工具栏中 的工具,双击需要改变序号的原子,弹出输入框, 输入原子序号,按回车键完成原子序号的更改。
结构式 名称
(2) 结构式名称
预测核磁共振化学位移(structure---predict 1H-NMR shifts)
Structure—predict 1H-NMR shifts
分析结构估计性质
(3)化学反应方程式绘制举例
OH
(CH3CO)2 70°C80°C 15min水浴
COOH
OOCCH3 COOH
➢环己烷的椅式构型直接点击为水平放置,按Shift键点 击可由水平变为垂直。
ChemOffice软件的操作与使用
化学化工软件应用技术 王震 主讲 9
主
菜单栏
结构工具栏
主工具栏
格式栏
界
面
模板工具栏
绘图区
状态栏
2015年4月11日3时40分
化学化工软件应用技术 王震 主讲 10
O H2N CH CH2 C OH
N NH
H OH H HO H H OH OH OH H O
HO H
H
化学家能懂的chemdraw也应该能chemoffice中使用最为频繁的组件chemdrawexe结构工具栏主工具栏格式栏绘图区模板工具栏菜单栏状态栏14套索切割键切割楔键黑体键黑体楔键空心楔键波浪键表格环丙烷环环戊烷环环庚烷环环己烷椅式橡皮文本箭头轨道绘图元素基元化学符号弧形原子反应模板环丁烷环环己烷环环辛烷环环己烷椅式苯环hoohohohhoohohoh箭头轨道绘图元素括弧化学符号询问工具模板rna模板超分子模板垂直工具栏上的模板按钮包含了常用的和重要的模板如多种较复杂的分子种类和玻璃仪器模板单击选取框按钮选中画好的阿司匹林结构式
14
2.2.2 结构绘制功能
1. 简单的无机反应式和有机分子式
ChemDraw中可以一次性输入反应式文本,在应用“Formula” 进行优化,其Formula格式化的智能程度较其他软件有所增 强。
2. Fischer(费舍尔)投影式 3. Haworth(霍沃思)投影式 4. Newman(纽曼)投影式 5. 立体化学
2.2.4 ChemProp—— 分子物理化学性质计算和标准命名
2015年4月11日3时40分
化学化工软件应用技术 王震 主讲
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2.2.5 原子轨道图与分子轨道图的制作
ChemDraw的简单使用教程
ChemDraw的简单使用教程1、ChemDraw的简介ChemDraw软件是目前国内外最流行、最受欢迎的化学绘图软件。
它是美国CambridgeSoft公司开发的ChemOffice系列软件中最重要的一员。
由于它内嵌了许多国际权威期刊的文件格式,近几年来成为了化学界出版物、稿件、报告、CAI软件等领域绘制结构图的标准。
ChemDraw是世界上使用最多的大型软件包ChemOffice中的一个组件,其它两个组件为Chem3D(分子结构模型)和ChemFinder(化学数据库信息),其最新版本是Chem Office 2004(ChemDraw Pro 8.0、Chem3D Ultra8.0、ChemFinderUltra8.0) 。
ChemDraw可以建立和编辑与化学有关的一切图形。
例如,建立和编辑各类化学式、方程式、结构式、立体图形、对称图形、轨道等,并能对图形进行翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等多种操作。
基于国际互联网技术开发的智能型数据管理系统,包含的多种化学通用数据库共四十多万个化合物的性质、结构、反应式、文献等检索条目的分析和利用,可为化学家的目标化合物设计、反应路线选择和物化性质预测以及文献的调用提供极大的方便。
该软件可以运行于Windows平台下,使得其资料可方便地共享于各软件之间。
除了以上所述的一般功能外,其ultra版本还可以预测分子的常见物理化学性质如:熔点、生成热等;对结构按IUPAC原则命名;预测质子及碳13化学位移动等。
2、ChemDraw的基础知识1、菜单栏:含有操作chemdraw应用文件和内容的命令设置。
2、工具栏:含有常用命令图标,单击图标时,效果与选择菜单中相应的命令一样。
3、编辑区:供绘制图形结构的工作区。
4、滚动栏:含有滚动框、滚动按钮和滚动条。
5、状态栏:标出当前的工作内容以及鼠标指到某些菜单按钮时的说明图形工具板含有所有能够在文件窗口绘制结构图形的工具,选择了这些工具的图标后,光标将随之改变成为相应的工具形状。
Chemoffice_2008_使用教程
C hemoffice2008使用教程ChembioOffice简介ChembioOffice是由CambridgeSoft开发的综合性科学应用软件包。
该软件包是为广大从事化学、生物研究领域的科研人员个人使用而设计开发的产品。
同时,这个产品又可以共享解决方案,给研究机构的所有科技工作者带来效益。
利用ChemBioOffice你可以方便的进行化学生物结构绘图、分子模型及仿真、可以将化合物名称直接转为结构图,省去绘图的麻烦;也可以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合物名。
目前最新的版本为Chemoffice 2010。
Chemoffice2008包括以下几个部分:1.ChemDraw Ultra11.0:化学结构绘图。
2.Chem3D Ultra11.0:分子模型及仿真。
3.ChemFinder Ultra11.0:化学信息搜寻整合系统4.E-Notebook11.0:整理化学信息、文件和数据,并从中取得所要的结果。
Chemoffice安装方法:1.运行setup.exe2.输入证书时输入:Name:lZ0email:lz0@Serial:011-256104-71993.然后点击"Activate Later"4.复制crack.reg文件到C:\Program Files\CambridgeSoft\ChemOffice2008\Common\DLLs 双击确定即可ChemDraw的使用方法:1.绘制结构式以水杨酸(salicylic acid)为例步骤:1.打开ChemDraw2.单击垂直工具栏右下角的图标,鼠标变成苯环的样子,在绘图区单击鼠标出现一个苯环3.单击图标,将鼠标移至苯环的一个角上,出现深色的正方形连接点4.自连接点横向拉出一根实线单键,松开鼠标,自单键终点向右下方再次拉出一根单键,与前一根单键夹角约为109°,其余类推。
5.选中垂直工具栏中的文本工具,分别将鼠标移至应该出现羟基或氧原子的位置,待出现连接点后,点击键盘上的O键。
Sigma2_2006_e
Total losses in excess of USD 230bn
Total losses of USD 230bn, of which USD 135bn stemming from Katrina
The catastrophes recorded by sigma caused directly attributable financial losses totalling more than USD 230bn. A major part of these losses occurred in the industrialised nations, where catastrophes impacted a high concentration of property assets. In the US, for instance, a series of hurricanes caused tremendous damage, Katrina alone an estimated USD 135bn, followed by Wilma with 20 and Rita with USD 15bn. However, the earthquake in Kashmir, the floods in India in July, and hurricane Stan in Central America in October caused economic losses in the billions in non-industrialised nations, too.
3
Catastrophes in 2005
397 catastrophes
sigma recorded 149 natural catastrophes and 248 man-made disasters¹ in 2005, thus continuing the trend towards more events in both categories that has been in evidence for a number of years.
理论课9-ChemOffice
9
Multiple Bonds 多键
箭头 Arrows
轨道 Orbitals
括号 Brackets
绘图元素 Drawing Elements
化学符号 Chemical Symbols
模板 Templates 查询工具 Query Tools
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氨基酸模板工具 芳香化合物模板工具 双环模板工具 生物模板工具 玻璃仪器模板工具(I) 玻璃仪器模板工具(II) 构象异构体模板工具
ChemNMR:预测13C和1H的NMR光谱, 节省实验的花费
ChemProp:预测BP、MP、临界温度、 临界气压、吉布斯自由能、logP、折 射率、热结构等性质
ChemSpec:可让输入JCAMP及SPC频 谱资料,用以比较ChemNMR预测的结果
ClipArt:高品质的实验室玻璃仪器图库。 Name=Struct:输入IUPAC化学名称后就可自动产生ChemDraw结构
Chemoffice主要包括 ChemDraw Ultra 化学结构绘图 Chem3D Ultra 分子模型及仿真 ChemFinder 化学信息搜索整合
2
1.1 ChemDraw Ultra
ChemDraw 是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件,是各论文期 刊指定的格式。内置功能有:
AutoNom:可自动依照IUPAC的标准 命名化学结构
9 MDL MolFile (*.mol):MolFile文件格式用于其它一些在Windows、Macintosh和Unix环境下的化学
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12 MSI ChemNote(*.msm):一种ASCII文本文件,可以用于像ChemNote一类的应用程序 13 SMD 4.2 (*.smd) :ASCII文本文件,用于检索化学文摘数据库 14 Windows Metafile(*.wmf):图片文件格式,将ChemDraw图片传输到其它应用程序中。
ChemOffice使用简介
鄙人水平有限,不足之处,请大家批评指正。
仪器1(Clipware, part 1) 仪器
EXAMPLE
2.2 特殊工具
插入表格、括号、薄层色谱图 版 、 插入表格、括号、薄层色谱图(06版)、对象加标注按钮
薄层色谱
2.3 质谱碎片
2.4 显示分子性质
2.5 显示光谱性质
2.6 保存格式
常用格式: 常用格式:cdx
2.ChemDraw简介 2.ChemDraw简介
基本功能与 chemwind相同 相同 特殊功能: 特殊功能: (1)分子结构模板众 (1)分子结构模板众 多 (2)玻璃容器与玻璃 玻璃容器与玻璃 管模板: 管模板:可制作实 验装置
质谱碎片
弧线 电子云 图形 插入表格 结构与仪器模板 配位键及手性 标注 薄层色谱图
3.7 其他计算
从头算程序: 从头算程序:Gamess Gaussian 需另外安装这两个程序。 需另外安装这两个程序。 半经验或分子力学计算 Mechanics Mopac (Am1, Mindo/3, Mndo, PM3) 计算方式:计算性质,最小能,过渡态优化, 计算方式:计算性质,最小能,过渡态优化,光谱分析
ChemOffice使用简介 使用简介
药物化学: 丁锴
1. ChemOffice简介 ChemOffice简介
Chemoffice : 每年出新版本 版本: 版本:3.5 : 约20MB 2002: 约 80MB 2006:约 170MB : 基本功能 ChemDraw : 结构制作与简单仪器制作 Chem3D : 空间结构显示与量化计算 ChemFinder: 化学数据库制作
计算结果: Bond Lengths 计算结果:
C(1)-C(2) 1.397 C(1)-C(6) 1.400 C(1)-H(15)1.102 C(2)-C(3) 1.396 C(2)-H(14)1.102 C(3)-C(4) 1.396 C(3)-H(13)1.102 C(4)-C(5) 1.397 C(4)-H(12)1.102 C(5)-C(6) 1.400 C(5)-H(11)1.102 C(6)-C(7) 1.509 1.392 1.392 1.100 1.392 1.100 1.392 1.100 1.392 1.100 1.392 1.100 1.497
ChemOffice2008实用教程
图2-4 主工具栏
图2-5 文本工具栏
23
2.1.5 图形工具箱
图2-6 图形工具箱
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2.2 文件基本操作
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新建文件 打开文件 保存文件 打印文件 关闭文件
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2.2.1 新建文件
• 在ChemDraw的文件操作中,当打开软件时会默认建立一个 新的文件,默认的文件名为“Untitled Document-1”。 • 通过单击菜单栏中的“File(文件)”→“New(新建)”(快捷 键为<Ctrl+N>)或“Open Special”命令建立一个新的文件。 • 通过单击工具栏中的“新建(New)”按钮来新建文件。
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2.3.2 撤销和重做命令
与Word等软件相同,ChemDraw具有保持前一步所做工作的功能。在 绘图区右击,弹出的快捷菜单中即包括“Undo(撤销)”和“Redo(重 做)”命令; 也可以单击工具栏中的(Undo)和(Redo)按钮进行操作。
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2.3.3 插入对象
图2-12 “Insert Object(插入对象)”对话框
图3-9 “GUI(图形用户界面)”选项 卡
图3-10 “Popup Info.(弹出信息)”选 项卡
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3.1.4 自定义Chem3D的工作界面
图3-11 “File(文件)”选项及设置
图3-12 “Dhedral Driver(二 面角设置)”选项卡
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3.1.4 自定义Chem3D的工作界面
工作环境 文件基本操作 图形基本操作 自定义工作界面
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3.1.1 工作环境
图3-2 标准工具栏
图3-3 构建工具栏
图3-4 动画工具栏
绝对实用chemdraw教程教案资料
绝对实⽤chemdraw教程教案资料绝对实⽤c h e m d r a w教程ChemDraw软件Chemdraw7.0是Cambridgesoft公司出品的Chemoffice系列的最新版本Chemoffice2002的重要组成部分。
⼀、ChemDraw软件简介1、启动:在Windows下,有两种打开⽅式:在桌⾯上,双击ChemDraw图标;或者在“开始菜单”⾥选择ChemDraw选项。
2、界⾯简介:下图为ChemDraw的图形化⽤户界⾯(GUI)。
关于画图的主要⼯具——⼯具栏,其主要功能如下图所⽰:仅供学习与交流,如有侵权请联系⽹站删除谢谢2ChemDraw为绘制化学结构,提供了以下⼯具。
化学键⼯具, 环⼯具, 脂肪链⼯具, ⾃动错误矫正, 在ChemDraw Ultra 中还新增了从化学名称到结构的功能。
⑴、化学键的绘制:绘制化学键有以下⼏种⼯具,利⽤这些⼯具,可以直接在⽂档中单击或者拖拉来绘制化学键。
默认的键长和键⾓⽤Object菜单中Fixed Lengths 和Fixed Angles选项固定。
仅供学习与交流,如有侵权请联系⽹站删除谢谢3仅供学习与交流,如有侵权请联系⽹站删除谢谢4⑵、环的绘制:环的绘制,可以使⽤右边的⼯具:环的绘制可以⽤以下的⽅法,注意以下的细节:如果选择环⼯具之后,在⼀个原⼦上单击,则会在该原⼦上添加⼀个环,如果在⼀条键上单击,则会在键上添加环,具体的演⽰如下:如果想要绘制共轭环结构,可以按下CTRL 键的同时,在⽂档中单击放置环。
这样,会在环中出现⼀个圆圈。
当然,这种情况下,环已烷的椅式结构除外。
⑶、脂肪链键的绘制:选择脂肪链⼯具,在⽂档上拖动⿏标即可画出长链。
也可以在⽂档空⽩区域或者⼀个原⼦上单击,在出现的对话框输⼊想要链长的原⼦数。
⑷、键的编辑:改变键的类型:选择键⼯具,指向已经存在的键,单击,则会出现新的类型的键。
改变楔形键和虚格键的⽅向:选择楔形键和虚格键⼯具,点击适当的位置,则⽅向被⾃动调整。
chemoffice2008破解
首先先下载chemoffice2008 的镜像文件使用虚拟光驱载入镜像文件之后打开,如下图所示:
B.T.W.怎样使用虚拟光驱加载映像文件很简单的事情对不?
不过不知道咋回事自己的DT加载这个bin镜像时好像报了错的(即使打开的是cue都不行),不过好像可以把后缀名称改下,改成iso就没事了(PS.难道是自己的Rp不到位?)
第二步,不用我说了吧,就是打开主安装程序安装但是很奇怪的是,主安装程序在一个叫Cambridgesoft的文件夹的Chemoffice里如图所示。
下面就是该干啥干啥,且慢,在安装前会跳出来一个要求注册的对话框,就像下面的
现在打开注册机(呵呵,注册机在那里?大家看第一幅图的说明)就像是这样
现在就按找第三幅的提示办~!Creat By Essential。
