西瓜G17AB雄性不育两用系的转能和利用
西瓜育种ppt

无籽西 瓜
开发矮 生西瓜
1.品质育种
目前西瓜生产从数量上看,已经满足或接近满足市场的 基本需求,下一步的育种主要目标是提高西瓜的品质。
瓜瓤颜色正在被越来越多的人重视,深红色比浅红色更
受人欢迎,令人惊奇的是,近年来引进的黄瓤品种很受欢
迎,所以这个目标看来具有灵活性。
反映西瓜甜度的可溶性固形物在西瓜育种中仍是
五、西瓜育种
西瓜的育种方式: •常规杂交育种 •杂种优势 •多倍体育种方法 •诱变育种方法 1).化学诱变 2).辐射诱变
•生物技术应用
1).分子标记 3).组织培养 4).染色体工程 2).转基因
(一)、杂种优势
杂种优势育种则主要是利用杂种F 1代的优良性状,
而并不要求遗传上的稳定。作物育种上就常常在寻找某
2.西瓜皮颜色
我国科学家选用 A : 中育十号(非黄); B : 中育一号(非黄); C : 中育六号(非黄); D : 金西瓜(黄)。以A、B、C 为母本分别与
D 杂交。
F1结果如图:
把三个组合的F1 自交, 在F2抽蔓期鉴定,结果如表2
研究进一步证实: 西瓜黄皮性状对非黄皮性状呈完全显性遗传, 是受一对 基因控制的. 符合孟德尔遗传学第一定律的遗传规律。非黄 色果皮上的深色及花纹(黑色、深绿色条带) 均能使黄色高球形,皮色暗绿底子青黑色条 斑,肉色深红极为均匀艳丽,汁水特别丰多,肉质细嫩爽口, 果重约9公斤(大的可达15公斤以上),丰产,不易空心崩裂, 且不易变为沙软走味,贮运力特强,本品种适应地区广泛, 栽培时必须栽花粉品种。
8.早春红玉类型
在低温弱光条件下,雌花的形成及着果性好、特别适合 温室等保护地栽培。橄榄型小型西瓜的代表品种。果重 2KG左右,糖度13.5度,果皮极薄但不易裂果。商品性好。
第10章 雄性不育

因此,孢子体不育的特点是:不 育系与恢复系杂交时,所获得的杂种 一代,花粉全部正常,结实也全部正 常,但杂种二代因不育基因分离重组, 将有不育株产生。
当孢子体中带有可育的细胞质基因N 或核Rf时,不论配子体(花粉)的基因是 Rf或rf,这种花粉都是正常可育的。不育 系与纯合的恢复系杂交所得到的杂交种F1 是正常雄性可育的,F1自交的F2群体中的 植株产生3∶1或9∶7或15∶1 的育性 (可育∶不育)分离。
第一季高不育系混合种子自交种子有标记无标记恢复系具有显性标记杂交苗用于大田用于制种高不育系利用杂种优势示意图90二核不育系的选育和利用1核不育系的选育将适宜做不育系的品种进行诱变处理在其后代群体中可获得核不育株核不育株经与原品种杂交杂种表现可育收获其种子种植成群体单株间将会出现不育和可育的分离该群体自由授粉在不育株上收获种子后代又呈现不育和可育分离几代后分离比例将稳定为11
(1)诱导育性转换的主导因子是光和 温。根据光温作用可分为三类:
第一类,光照长度是决定育性转换的 主要因子,温度只起协调作用,称为光敏 型核不育 。这类型包括长光不育、短光可 育和短光不育、长光可育两种。
第二类,育性受控于幼穗发育敏 感期的温度,光照长度基本不起作用, 称为温敏型核不育,这类型包括高温 不育低温可育和高温可育低温不育两 种。
2、配子体雄性不育
配子体雄性不育是指不育系花粉的育 性受配子体本身基因型控制的这一类型的 雄性不育,配子体基因为不育时花粉表现 不育,配子体基因为可育时花粉育性表现 正常。
因此,配子体不育的特点是:不育系与恢复 系杂合所获得的杂种一代,花粉有二类(不育与 可育),而且各占1/2。即子一代的花粉只有半 数左右是正常的,但是它并不影响结实,子一代 的结实率全部正常。由于子一代带有不育基因的 花粉败育不参加受精,因此子二代配子有两种基 因型(Rf Rf、Rf rf)存在,但都结实正常,没 有不育株出现。
BSA_联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因

江苏农业学报(JiangsuJ.ofAgr.Sci.)ꎬ2024ꎬ40(1):165 ̄173http://jsnyxb.jaas.ac.cn张朝阳ꎬ程㊀瑞ꎬ徐兵划ꎬ等.BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因[J].江苏农业学报ꎬ2024ꎬ40(1):165 ̄173.doi:10.3969/j.issn.1000 ̄4440.2024.01.018BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因张朝阳ꎬ㊀程㊀瑞ꎬ㊀徐兵划ꎬ㊀顾㊀妍ꎬ㊀黄大跃ꎬ㊀孙玉东(江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所/淮安市设施蔬菜重点实验室ꎬ江苏淮安223001)收稿日期:2022 ̄11 ̄28基金项目:淮安市农业科学研究院发展基金项目(HAN201714)ꎻ淮安市自然科学研究技术专项(HAB202079)ꎻ国家西甜瓜产业技术体系淮安综合试验站项目(CARS ̄25)作者简介:张朝阳(1982-)ꎬ男ꎬ江苏连云港人ꎬ硕士ꎬ副研究员ꎬ从事西甜瓜遗传育种研究ꎮ(E ̄mail)287362703@qq.comꎮ程瑞为共同第一作者ꎮ通讯作者:孙玉东ꎬ(E ̄mail)sunyudong@jaas.ac.cn㊀㊀摘要:㊀叶片是植物重要的功能器官之一ꎬ不仅是植株进行光合作用的主要场所ꎬ也可作为重要的形态标记ꎬ应用于育种中ꎮ叶片颜色作为形态标记ꎬ不仅可用于苗期杂种的清除ꎬ亦可用于种子纯度的测定ꎮ以西瓜全生育期叶片黄化突变体纯合自交系ly104为母本(P1)㊁绿叶自交系w3为父本(P2)ꎬ通过杂交创制F1代㊁F2代㊁BC1代群体ꎮ遗传分析结果表明ꎬ该突变体的叶片黄化由单隐性基因控制ꎮ采用混合分组分析(BSA)进行初定位ꎬ通过简化基因组测序(RAD)开发全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记构建西瓜高密度遗传图谱ꎬ将西瓜叶片黄化基因定位于2号染色体13950306~15517591bp(大小约为1 57Mb)ꎮ以西瓜97103v2为参考基因组ꎬ该区间包含24个注释基因ꎮ对P1(P1Y)㊁P2(P2G)和F2代群体中黄叶(F2Y)㊁绿叶(F2G)株系进行转录组水平分析ꎬ结果表明ꎬ目标区间内基因Cla97C02G035950㊁Cla97C02G036010㊁Cla97C02G036020㊁Cla97C02G036060在黄化叶片与正常绿叶材料中的表达量差异显著ꎬ可能是西瓜叶片的黄化候选基因ꎮ研究结果可为进一步解析西瓜叶片黄化基因功能和生物学特性奠定重要基础ꎮ关键词:㊀西瓜ꎻ黄化ꎻBSAꎻ遗传图谱ꎻ基因定位中图分类号:㊀S651.01㊀㊀㊀文献标识码:㊀A㊀㊀㊀文章编号:㊀1000 ̄4440(2024)01 ̄0165 ̄09IdentificationofcandidategenesforwatermelonleafyellowingbasedonBSAandtranscriptomeanalysisZHANGChao ̄yangꎬ㊀CHENGRuiꎬ㊀XUBing ̄huaꎬ㊀GUYanꎬ㊀HUANGDa ̄yueꎬ㊀SUNYu ̄dong(HuaiyinInstituteofAgriculturalSciencesoftheXuhuaiDistrictofJiangsuProvince/HuaianKeyLaboratoryforFacilityVegetablesꎬHuaian223001ꎬChina)㊀㊀Abstract:㊀Theleafisoneoftheimportantfunctionalorgansofplants.Itisnotonlythemainplaceforphotosynthesisofplantsꎬbutalsocanbeusedasanimportantmorphologicalmarkerinbreeding.Asamorphologicalmarkerꎬleafcolorcanbeusednotonlyforremovinghybridsattheseedlingstageꎬbutalsofordeterminingseedpurity.InthisstudyꎬF1ꎬF2ꎬandBC1populationswerecreatedbyhybridizationꎬandthemutanthomozygousinbredlinely104inthewholegrowthperiodofwatermelonwasusedasthefemaleparent(P1)ꎬandthegreenleafinbredlinew3wasusedasthemaleparent(P2).Geneticanalysisshowedthatleafyellowingwascontrolledbyasinglerecessivegene.Thebulkedsegregantanalysis(BSA)wasusedforprimarymappingꎬandgenome ̄widesinglenucleotidepolymorphism(SNP)markersweredevelopedbyrestriction ̄siteassociatedDNA ̄sequencing(RAD)toconstructahigh ̄densitygeneticmapofwatermelon.Thewatermelonleafyellowinggenewaslocalizedonchromosome2at13950306 ̄15517591bp(about1.57Mb).Watermelon97103v2wasusedasthereferencegenomeandthein ̄tervalcontained24annotatedgenes.ThetranscriptomelevelsofP1(P1Y)ꎬP2(P2G)andyellowleaf(F2Y)andgreenleaf(F2G)linesinF2populationwereanalyzed.TheresultsshowedthattheexpressionlevelsofCla97C02G035950ꎬCla97C02G036010ꎬCla97C02G036020andCla97C02G036060inthetargetintervalweresignificantlydifferentbetweenetio ̄latedleavesandnormalgreenleaves.Thesegenesmightbecandidategenesforetiolationofwatermelonleaves.There ̄561sultsofthisstudycanlayanimportantfoundationforfurtheranalysisofthefunctionandbiologicalcharacteristicsofwatermelonleafyellowinggenes.Keywords:㊀watermelonꎻetiolationꎻBSAꎻgeneticmapꎻgenelocation㊀㊀叶片是植物进行光合作用最主要的器官ꎬ对植物的生存具有重要意义ꎬ叶片颜色在很大程度上决定了植物的光合效率[1]ꎮ植物叶色突变不仅是研究叶绿素相关基因功能及植物发育的重要材料[2]ꎬ也是优良的形态标记性状ꎬ在实际生产中常被用来进行品种纯度鉴定[3]ꎮ关于水稻㊁大麦㊁小麦㊁玉米㊁棉花㊁大豆㊁蚕豆㊁番茄㊁拟南芥等多种植物叶色突变的研究已有报道[4]ꎬ叶色突变类型丰富多样ꎬ包括白化㊁黄化㊁黄绿化等[5 ̄6]ꎮ植株叶色的形成不仅受到叶绿体生物合成途径㊁叶绿素降解途径㊁血红素代谢途径㊁类胡萝卜素代谢途径等与光合色素代谢途径相关基因的影响ꎬ受到与叶绿体发育相关基因的调控ꎬ还与光㊁温度㊁植物激素㊁矿物元素和金属离子等外界环境因素息息相关[6 ̄9]ꎮ目前ꎬ关于水稻㊁玉米㊁拟南芥等模式植物中叶色的研究较为深入ꎬ水稻㊁玉米中已报道的叶色突变体均超200个[10 ̄13]ꎬ对拟南芥的研究发现ꎬ叶色突变以隐性遗传为主ꎬ目前已经发现27个编码15种叶绿素生物合成酶的核基因ꎬ它们的任何异常突变都会导致叶绿素缺乏ꎬ从而产生黄色突变[14]ꎮ近年来ꎬ随着高通量测序技术的应用ꎬ关于辣椒㊁甜瓜和黄瓜等一些重要经济作物的叶色突变研究也逐渐展开[15 ̄19]ꎮ西瓜是全球十大水果之一ꎬ中国西瓜栽培面积和消费量均居世界首位ꎮ随着杂交育种的发展ꎬ西瓜育种已基本实现杂种一代化ꎬ对制种纯度提出了更大挑战ꎬ叶形㊁叶色虽是重要的形态标记性状ꎬ但尚未应用于育种中ꎮ西瓜的遗传基础狭窄ꎬ自然突变率低ꎬ目前有关西瓜叶色突变的报道有斑驳突变类型[20]㊁白化突变类型[21 ̄22]㊁不完全显性黄叶突变类型[22]㊁后绿突变类型[23]㊁黄化突变类型[24 ̄25]等ꎬ但研究主要集中于遗传规律㊁生理特性[21 ̄25]ꎮ西瓜基因组的公布和测序技术的快速发展为西瓜重要性状定位㊁关键基因功能研究奠定了重要生物学基础[26 ̄29]ꎮKidanemariam[30]发现ꎬ西瓜后绿突变体Houlv中的ClCG03G010030基因存在1个单核苷酸多态性(SNP)变异ꎬ导致该基因编码的FtsH胞外蛋白酶序列中精氨酸突变为赖氨酸ꎬFtsH蛋白主要参与叶绿体早期发育ꎬ进而影响西瓜叶片颜色ꎮZhu等[25]对叶片黄化突变西瓜材料w ̄yl进行精细定位ꎬ认为基因Cla97C02G036040㊁Cla97C02G036050和Cla97C02G036060可能是导致西瓜叶片黄化的主要基因ꎮ探索叶片颜色变异机制可为遗传改良提供理论依据ꎬ满足人们在生产㊁选种和育种等方面的需求ꎻ开发叶色形态标记ꎬ能够有效缩短育种周期ꎬ提高育种效率与制种纯度ꎮ本研究拟以全生育期叶片黄化西瓜材料ly104和绿叶西瓜材料w3为试验材料ꎬ通过混合分组分析(BSA)测序初步定位叶片黄化基因在染色体中的位置ꎬ进一步利用简化基因组(RAD)测序开发全基因组SNP分子标记ꎬ利用F2代群体构建高密度遗传图谱进行西瓜叶片黄化基因定位ꎬ结合转录组测序及基因功能注释锁定关键候选基因ꎮ本研究结果可为进一步全面解析西瓜叶片黄化基因及其生物学功能奠定重要基础ꎮ1㊀材料与方法1.1㊀试验材料2014年ꎬ利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变获得的稳定遗传的叶片黄化西瓜材料ꎬ经5代连续自交获得相对纯合的叶片黄化突变材料ly104ꎮ本研究以ly104为母本(P1)ꎬ以正常绿叶西瓜材料w3为父本(P2)构建F1代㊁F2代㊁BC1代群体ꎬ群体的构建与表型调查试验均于淮安市农业科学研究院科研创新基地进行ꎬ群体配制过程严格自交㊁杂交ꎬ整个生育期采取商品化管理ꎮ1.2㊀形态观察与遗传规律分析以第1张完全展开的真叶进行表型统计与分析ꎬ采用人工观察和便携式色差仪RM200QC(爱色丽X ̄Riteꎬ美国)对叶片颜色指数进行测定ꎬ测定指标为亮度值(L∗)㊁红绿值(a∗)和黄蓝值(b∗)3个颜色参数ꎮ对F1代㊁F2代㊁BC1代群体分离表型进行统计ꎬ分析西瓜叶片黄化遗传规律ꎬ并进行卡方检验ꎮ1.3㊀通过BSA测序进行叶片黄化初定位BSA测序即混合分组分析法ꎬ是一种简单快速的目标性状定位方法ꎬ已被广泛应用于多种园艺作物重要性状的基因定位[31]ꎮ本研究从F2代西瓜群体中选取黄叶㊁绿叶极端表型植株各20株ꎬ采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法[32]提取植株幼叶基661江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期因组DNA并检测其浓度ꎬ通过等量混匀构建2个极端混池ꎬ利用亲本DNA构建亲本池进行测序分析ꎬ送至上海凌恩生物科技有限公司ꎬ利用IllunimaHiSeq4000进行测序ꎬ亲本测序深度为10ˑꎬ混池测序深度为20ˑꎬ测序读长为150bpꎮ对原始序列(Read)进行过滤ꎬ去除接头ꎬ过滤掉包含未确定碱基(N)>15%和低质量的read(质量值ɤ20的碱基数占整个Read的10%以上)ꎬ将获得的干净序列(Cleanread)用于后续分析ꎮ使用BWA软件[33]将高质量的Cleanread映射到西瓜基因组97103v2(ht ̄tp://cucurbitgenomics.org/organism/21)上ꎮ然后用GATK[34]㊁SnpEff[35]软件对突变位点进行检测和注释ꎬ用SNP ̄index算法进行关联分析ꎬ阈值为0 5ꎮ1.4㊀西瓜高密度遗传图谱的构建为了更精确地定位获得西瓜叶片黄化突变位点ꎬ本研究根据F2代群体中黄叶㊁绿叶分离比选取共100份单株ꎬ分别提取基因组DNAꎬ采用RAD建库方式构建长度范围在300~500bp的双端文库ꎮ将产物送至上海凌恩生物科技有限公司ꎬ利用IllunimaHiSeq进行测序ꎬ测序读长为150bpꎮ对原始Read采用以下标准进行质控:(1)去除Read中的接头序列ꎻ(2)修剪测序质量较低的Read末端(测序质量值小于Q20)ꎻ(3)去除含N比例达到10%的Readꎻ(4)舍弃接头及质量修剪后长度小于100bp的小片段ꎮ用BWA软件将Cleanread比对至参考基因组97103v2ꎬ并对映射结果进行统计分析ꎮ用GATK软件进行变异位点检测获得SNPꎮ对获得的SNP按以下标准进行过滤:(1)去除比对Read质量值小于20的位点ꎬ同时过滤掉缺失率大于50%的SNPꎻ(2)删除无义SNP位点ꎻ(3)用joinmap4.0软件[36]对过滤后的SNP进行卡方测验ꎬ先后过滤掉P<0 01和缺失率30%以上的标记ꎬ对于最终获得的SNPꎬ采用joinmap4.0软件进行西瓜遗传图谱构建ꎬ选用Kosamb s参数ꎮ1.5㊀转录组分析从亲本及其F2代群体中取ly04和w3单株各3份ꎬ当第1张真叶完全展开后取样进行转录组分析ꎮ用PlantRNAPurificationReagent试剂盒(购自上海凌恩生物科技有限公司)提取植物总RNAꎬ并构建转录组测序文库ꎮ送至上海凌恩生物科技有限公司采用IlluminaHiSeq进行测序ꎬRead长度为150bpꎮ测序数据经质控过滤获得Cleanreadꎬ用Hisat2软件[37]将其映射到西瓜基因组97103v2上ꎮ用每个基因在一个样本中所对应的基因转录本数(FPKM)计算基因表达水平ꎮ基于KEGG(http://www.ge ̄nome.jp/kegg/)和GO(http://www.geneontology.org/)数据库进行基因注释和功能分析ꎮ差异表达基因以差异倍数(Foldchange)ȡ1 5㊁Pɤ0 005为标准ꎮ1.6㊀候选区域功能注释与候选基因筛选结合遗传规律分析及BSAꎬ利用RAD测序开发全基因组SNP标记ꎬ加入叶色表型标记进行西瓜2号染色体图谱的构建ꎬ对西瓜叶片黄化基因进行定位ꎮ以97103v2为参考基因组对定位区间基因进行注释ꎬ通过基因序列分析及转录组测序差异表达情况分析进一步筛选并确定候选基因ꎮ2㊀结果与分析2.1㊀西瓜叶片黄化特性及遗传规律分析经EMS诱变获得叶片黄化的西瓜材料ꎬ经5代连续自交后ꎬ获得遗传稳定的叶片黄化材料ly104ꎬ该材料从子叶期至果实收获时的叶片均保持黄化状态(图1A)ꎮ通过对ly104㊁w3的叶片颜色指标进行测定ꎬ发现叶片黄化西瓜材料与绿叶西瓜材料在叶片颜色指标上存在极显著差异(图1B)ꎮ㊀㊀分析结果显示ꎬly104和w3的杂交F1代所有植株叶片均呈绿色ꎬ表明控制黄色和绿色的基因是等位基因ꎬ黄色的突变基因为隐性遗传ꎮF2代群体中有174个单株为绿叶ꎬ63个单株为黄叶(表1)ꎮ在F1代与叶片黄化亲本(P1)回交群体后代中ꎬ有73个单株为绿叶ꎬ63个单株为黄叶ꎮ卡方检验发现ꎬF2代群体的分离比符合3ʒ1的孟德尔分离比[χ2(1ꎬn=237)=0.31646ꎬP=0.5737>0 0500ꎬn为群体样本数量]ꎬBC1群体的分离模式符合1ʒ1的孟德尔分离比[χ2(1ꎬn=136)=0.73529ꎬP=0.3912>0 0500](表1)ꎬ说明西瓜叶片的黄色突变符合单基因控制的隐性遗传规律ꎬ叶片绿叶对黄色表现为显性遗传ꎮ表1㊀F2代和BC群体中叶片黄化突变型与野生型的分离比Table1㊀Segregationratioofyellow ̄leafmutantandwildtypeinF2andBCpopulations群体类型群体数量绿叶植株数量黄叶植株数量期望分离比卡方检验值(χ2)BC113673631ʒ10.74F2237174633ʒ10.32χ2检验采用0.05水平ꎮ761张朝阳等:BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因A:表型ꎻB:颜色指数ꎮL∗:亮度(阈值0~100)ꎻa∗:红绿色范围(阈值-128~+127)ꎻb∗:黄蓝色范围(阈值-128~+127)ꎻMT:突变体叶片黄化材料ꎻWT:野生型材料ꎮ∗∗表示不同材料间差异极显著(P<0 01)ꎮ图1㊀西瓜绿叶和黄叶突变体的表型及颜色指数Fig.1㊀Phenotypeandcolorindexofwatermelongreen ̄leafmutantandyellow ̄leafmutant2.2㊀西瓜叶片黄化基因的BSA初定位原始Read经质控过滤ꎬ2个混池共获得12.4Gb高质量CleanreadꎬQ30在93 0%以上ꎬ与参考基因组97103v2的平均比对率在98 0%以上ꎮ使用GATK软件进行变异检测ꎬ共获得523303个SNPꎬ经过滤后用SNP ̄Index算法对性状相关侯选区域进行选择ꎬ作图窗口大小为1Mbꎬ作图步移为10kbꎬ阈值为0 5ꎬ结果表明ꎬ西瓜叶色黄化基因定位于2号染色体8490001~26410000bp(大小约为17 92Mb)(图2A)ꎮ2.3㊀高密度西瓜遗传图谱的构建与叶片黄化基因的定位㊀㊀根据分离比ꎬ从F2代群体中选取76株绿叶㊁24株黄叶西瓜单株进行RAD测序ꎬ共获得69 17Gb高质量CleanreadꎬQ30在91 3%以上ꎬ与参考基因组的平均比对率在97 6%以上ꎮ使用GATK软件进行变异检测ꎬ共获得229704个SNPꎬ经过滤筛选ꎬ最终确定4273个SNP用于西瓜高密度遗传图谱的构建ꎮ西瓜遗传图谱总长度为1602.44cMꎬ平均遗传距离为0 39cMꎬ最大间隔为7 38cM(表2)ꎮ㊀㊀为了进一步精确定位西瓜叶片黄化基因ꎬ用RAD测序结果对西瓜2号染色体上的SNP标记进行过滤筛选ꎬ剔除检测率低于40%的样品单株和标记ꎬ最终用91份单株(68份绿叶ꎬ23份黄叶)㊁286个SNP标记进行叶片黄化基因定位ꎬ叶片颜色标记(Leafcolor)用绿叶(D)㊁黄叶(B)表示ꎬ用joinmap4进行西瓜叶片黄化基因的定位ꎮ结果显示ꎬLeafcol ̄or定位于Clas97Chr02 ̄13950306与Clas97Chr02 ̄15517591标记之间(大小约为1 567Mb)(图2B)ꎬ以西瓜97103v2为参考基因组ꎬ该区间包含24个注释基因(图2C㊁表3)ꎮ表2㊀西瓜高密度遗传图谱构建结果Table2㊀Constructionofhighdensitygeneticmapofwatermelon基因组位置标记数量遗传长度(cM)平均遗传距离(cM)标记最大间隔(cM)Lg01437161.150.372.62Lg02504185.490.372.32Lg0310960.130.553.16Lg04628278.320.443.87Lg05314114.810.372.87Lg0638095.080.252.75Lg07481186.900.392.82Lg0820572.030.352.17Lg09437147.520.342.21Lg10459121.600.262.40Lg11319179.410.567.38合计42731602.440.39-861江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期2.4㊀西瓜黄化叶片转录组分析及候选基因的筛选RNA ̄seq共检测12个样本ꎬ其中P1㊁P2分别选取3个样本ꎬF2代群体中叶片黄化类型㊁绿叶类型分别选取3个样本ꎬ每个样本平均获得6 4Gb高质量Cleanread数据ꎬQ30在92 0%以上ꎬ平均基因组比对率为91 4%ꎮ分别以P2G(亲本绿叶)与P1Y(亲本黄叶)和F2G(F2代绿叶)与F2Y(F2代黄叶)为对比组进行独立分析ꎬ其中P2G与P1Y对比组中共检测到1356个差异表达基因ꎬ其中上调表达的基因529个ꎬ下调表达的基因827个ꎻF2G与F2Y对比组中共检测到4180个差异表达基因ꎬ其中上调表达的基因1378个ꎬ下调表达的基因2802个(图3Aꎬ图3B)ꎮP2G与P1Y对比组和F2G与F2Y对比组中均显著下调表达的基因共有327个㊁均显著上调表达的基因共有132个(图3A)ꎮ以上结果表明ꎬ亲本中黄叶和绿叶差异表达基因数量显著小于F2代群体ꎬ说明P1和P2已相对纯合ꎻGO和KEGG富集分析结果表明ꎬ差异表达基因富集通路多与光合㊁应激反应等有关ꎬ说明黄叶和绿叶西瓜植株在光合作用等方面存在较大差异ꎮ表3㊀候选区间注释基因Table3㊀Genefunctionannotationinformationincandidateinterval基因㊀㊀染色体起始位置(bp)终止位置(bp)基因方向基因功能注释㊀㊀㊀㊀㊀Cla97C02G035890染色体21395641713957327-acanthoscurrin ̄1 ̄likeCla97C02G035900染色体21402996814031110-未知的蛋白质Cla97C02G035910染色体21403120214032265-acanthoscurrin ̄1 ̄likeCla97C02G035920染色体21403358014037379-未知的蛋白质Cla97C02G035930染色体21405567614057378-含BPTI/Kunitz结构域的蛋白质2亚型X2Cla97C02G035940染色体21415712214158310+未知的蛋白质Cla97C02G035950染色体21420137314202375-与TMA7相关的翻译机制蛋白质Cla97C02G035960染色体21426731014270809-B类锌指蛋白质转录因子ꎬ包含DUF1664结构域Cla97C02G035970染色体21427090614274847+脂质结合血清糖蛋白质Cla97C02G035980染色体21427768614278904-蛋白质核融合缺陷6ꎬ叶绿体/线粒体样亚型X1Cla97C02G035990染色体21428304714283329+未知的蛋白质Cla97C02G036000染色体21437008614372002+抗坏血酸氧化酶同源物Cla97C02G036010染色体21437643914376782+未知的蛋白质Cla97C02G036020染色体21446137614464307-双组分反应调节蛋白质Cla97C02G036030染色体21449460714497114+双组分反应调节蛋白质Cla97C02G036040染色体21454976514550425+包含DUF679结构域的蛋白质Cla97C02G036050染色体21455062614551935-DNAJ同源亚家族B成员13Cla97C02G036060染色体21467069314671707+蛋白质Ycf2Cla97C02G036070染色体21483721914875277-U11/U12小核核糖核蛋白(相对分子质量65000)蛋白质亚型X2Cla97C02G036080染色体21499052014990719-未知的蛋白质Cla97C02G036090染色体21505989915063209+环型E3泛素转移酶Cla97C02G036100染色体21515520915157456+含五肽重复的家族蛋白质Cla97C02G036110染色体21516514215226986+尼曼 ̄匹克C1蛋白样亚型X2Cla97C02G036120染色体21523146015231976-锌指家族蛋白质+ 表示基因注释在染色体正链ꎻ - 表示基因注释在染色体负链ꎮ㊀㊀对西瓜2号染色体13950306~15517591bp(大小约为1 56Mb)内的24个注释基因进行功能分析和转录组表达差异分析ꎬ结果显示ꎬ24个注释基因中有17个在植株叶片中表达ꎬ仅有基因Cla97C02G036060㊁961张朝阳等:BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因A:BSA定位结果ꎮB:西瓜2号染色体遗传图谱及叶色黄化标记定位ꎮC:根据西瓜参考基因组97103v2注释候选区域的基因ꎮSNPindex:单核苷酸多态性指数ꎮ图2㊀西瓜叶片黄化基因精细定位Fig.2㊀FinemappingofleafyellowinggenesinwatermelonA:P2G与P1Y对比组及F2G与F2Y对比组上调和下调基因数量Venn图ꎻB:P2G与P1Y对比组及F2G与F2Y对比组上调和下调基因数量柱形图ꎻC:F2G与F2Y对比组差异基因火山图ꎬ标注基因为候选区间基因ꎮP1Y:亲本黄叶ꎻP2G:亲本绿叶ꎻF2G:F2代绿叶ꎻF2Y:F2代黄叶ꎮ图3㊀西瓜黄叶与绿叶转录组差异表达基因分析Fig.3㊀Analysisofdifferentiallyexpressedgenesinthetranscriptomeofwatermelonyellowleafandgreenleaf071江苏农业学报㊀2024年第40卷第1期Cla97C02G035950㊁Cla97C02G036010㊁Cla97C02G036020在叶片黄化植株与绿叶植株中的表达存在显著差异ꎬCla97C02G036060在P2G和F2G中均显著上调表达(图3C)ꎬ其注释功能为Ycf2蛋白编码基因ꎬ该编码基因为被子植物中最重要的质体基因ꎬ与植物光合作用有关ꎮ3㊀讨论与结论化学EMS诱变是人工创造突变体最常用的处理方式之一ꎬ叶片黄化是最常见的诱变表型[22]ꎮ笔者所在课题组前期通过EMS诱变西瓜种子ꎬ获得稳定遗传的西瓜叶片黄化材料ꎬ其整个生育期均可保持黄化状态ꎮ植物叶片黄化突变ꎬ又称叶绿素缺乏突变ꎬ通常是由叶绿素合成或降解途径被破坏所致[38]ꎮ目前ꎬ研究者已经在水稻[39]㊁番茄[40]㊁黄瓜[19]㊁拟南芥[41]等植物中发现了黄化突变体ꎮ有研究发现ꎬ不同类型的叶色突变的遗传规律差异较大ꎬ有些叶色突变可能是核遗传ꎬ也可能是细胞质遗传ꎬ水稻[42]㊁玉米[43]㊁小麦[44]㊁黄瓜[45]㊁番茄[46]等都由1对或2对隐性核基因控制ꎮZhang等[21]研究证实ꎬ西瓜叶片白化突变是由1对隐性等位基因(jaja)控制的ꎮProvvidenti[20]发现ꎬ西瓜叶色斑驳突变由1对隐性基因(slv)控制ꎮKidanemariam等[30ꎬ47]发现ꎬ西瓜叶色后绿突变是由1个隐性基因(dgdg)控制的ꎮZhu等[25]研究发现ꎬ西瓜黄化突变体w ̄yl由1对隐性核基因控制ꎬ与本研究结果一致ꎮ西瓜作为重要的园艺经济作物[48 ̄51]ꎬ在中国的栽培面积和产量均居世界首位ꎮ经长期人工选择ꎬ栽培西瓜遗传背景狭窄ꎬ多态性分子标记开发受限ꎬ致使西瓜分子标记辅助育种及品种改良进展缓慢ꎮ高密度遗传图谱的构建不仅是开发西瓜重要农艺性状遗传基因/QTL紧密连锁分子标记的重要手段ꎬ亦是深入挖掘和解析西瓜重要农艺性状基因的基础ꎬ通过遗传图谱构建进行基因/QTL定位研究已经在西瓜多种性状研究中得到成熟应用[52 ̄53]ꎮ本研究基于BSA定位ꎬ将西瓜叶片黄化基因定位于2号染色上ꎬ为了进一步获得可靠定位基因ꎬ本研究开发了SNP标记ꎬ用于构建高密度西瓜遗传图谱ꎬ并将西瓜叶片黄化基因定位到2号染色体13950306~15517591bp(大小约为1 56Mb)ꎬ比对西瓜参考基因组97103v2发现ꎬ在候选区段内包含24个注释基因ꎬ17个基因在叶片中表达ꎬ4个基因在黄叶与绿叶转录组分析中存在显著差异表达ꎬ其中基因Cla97C02G036060是Ycf2蛋白的编码基因ꎬYcf2/FtsH调控的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 ̄苹果酸脱氢酶是叶绿体或非光合质体在黑暗中产生腺嘌呤核苷三磷酸的关键酶[54]ꎬ是光合生长必需的酶[55]ꎮ目前ꎬYcf2基因已被证实是被子植物中最重要的质体基因[56]ꎬ它在高等植物中发挥着重要功能[57]ꎮ在本研究中ꎬ由于双亲重测序深度不高ꎬ候选区间注释基因编码区中未发现可靠突变ꎬ但转录组结果显示ꎬYcf2在叶片黄化西瓜材料中的表达量显著下调ꎬ说明叶片黄化西瓜材料的光合作用系统可能与正常绿叶植株光合系统存在显著差异ꎬ相关机制需要进一步研究ꎮ本研究结果可为进一步挖掘叶片黄化植株光合作用机制奠定一定科学基础ꎮ参考文献:[1]㊀陈婷婷ꎬ符卫蒙ꎬ余㊀景ꎬ等.彩色稻叶片光合特征及其与抗氧化酶活性㊁花青素含量的关系[J].中国农业科学ꎬ2022ꎬ55(3):467 ̄478. 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作物育种学试题及答案

作物育种学试题及答案《作物育种学》课程考试样卷1一、名词解释(每小题2 分,共10 分)1.DUS:农作物的品种的三个基本要求(0.5分),既特异性(0.5分)、一致性(0.5分和稳定性(0.5分)。
2.选择育种:直接利用自然变异,即不需要人工创造新变异而从中进行选择并通过比较试验的育种途径称为选择育种。
(2分)3.聚合杂交:通过一系列杂交将几个亲本的优良基因聚合于一起。
(2分)4.杂种优势:杂种优势是指杂交种品种(即F1)表现出的某些性状或综合性状对其亲本品种(系)的优越性。
(2分)5.体细胞杂交:又称原生质体融合,两种原生质体间的杂交。
(2分)二填空题(每空1分共15分)1.现代农业对作物品种性状的要求主要有高产、?稳产?优质、适应性强;2.根据作物品种的繁殖方式、商品种子生产方法、遗传基础、育种特点和利用形式等可将作物品种区分为下列类型?自交系品种或纯系品种?杂交种品种群体品种和?无性系品种;3.种质资源工作的内容包括收集、保存、?研究?创新?利用;4.轮回选择的方法包括群体间改良和?群体内改良;5.配合力是自交系的一种内在属性,受多种基因效应支配,农艺性状好的自交系不一定就是配合力高,只有配合力高的自交系才能产生强优势的杂交种。
试用格子方试验计算SCA和GCA填表(表格在最后)。
? 0.45 ⑴ 0.33 ⑵ -0.09 ⑶ 0.31⑷0.71 ⑸0.27 、三、选择题(每小题 1 分,共11分)1.杂合基因型的作物,自交后代的生活力(1 );衰退?增强?不变?难以确定2.由胚珠或子房壁的二倍体细胞经过有丝分裂而形成胚,和由正常胚囊中的极核发育成的胚乳而形成种子,这种生殖方式称为(3 )。
无孢子生殖?二倍体孢子生殖?不定胚生殖?单性生殖3. 纬度相近的东西地区之间引种比经度相同的南北之间引种成功的可能性(1 )一些。
大?小?不好确定4.纯系学说认为,在自花授粉作物原始品种群体中选择(1 )有效?无效?有的人选择有效,有的人选择无效?难以确定5.从理论上讲,杂交育种工作中,所用亲本越多越(1 )好?不好?易行(成本越低)?难以育出好品种6.杂种优势的遗传基础是( 2 )显性假说?显性假说和超显性假说?超显性假说?纯系学说7.作物诱变育种中,主要处理植物的(3 )植株或植株的局部?花粉?种子?都可以8.普通小麦×硬粒小麦杂交,是(1 )种间杂交?属间杂交?种内不同类型杂交?)亚种间杂交9. 小种分化明显的的病原菌群体,实由若干个毒性有所不同的小种组成,其中比例较小的小种,称为( 2 )优势小种?次要小种?生理小种?)毒性小种10.群体改良有各种不同的方法,常用的是(3 )。
西瓜雄性不育两用系一代杂种制种技术

西瓜雄性不育两用系一代杂种制种技术
武兴丽;刘寅安
【期刊名称】《北方园艺》
【年(卷),期】2003(000)002
【摘要】@@ 西瓜一代杂种具有显著的产量优势,一般可比对照品种增产30%~50%,因此西瓜一代杂种已在国内外广为利用.
【总页数】2页(P32-33)
【作者】武兴丽;刘寅安
【作者单位】沈阳市农业科学院,110034;沈阳市农业科学院,110034
【正文语种】中文
【中图分类】S6
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西瓜杂交制种的关键技术措施

西瓜杂交制种的关键技术措施
西瓜杂交制种的关键技术措施是去雄和授粉受精。
去雄是保证制种纯度的根本措施,授粉受精是制种成败的关键。
1 去雄
西瓜的雄蕾和雌蕾很容易区分,没有子房的花蕾为雄蕾。
因此,从母本苗刚现蕾就可以去雄,将母本蔓上所有的雄蕾全部去除,不要等到开花时再去除,也不一定每天都要去雄,一次可以将瓜蔓上每节的雄蕾都去掉,整个生长期去雄3-4次。
去雄同时给雌蕾套袋,以防被漏掉的雄花自然授粉。
2 授粉受精
2.1 授粉工具和物品的准备主要有小竹篮(盛放纸筒、标签绳等),小竹棍(直径为2cm左右,长20-30cm,做隔离纸筒用)、隔离用小纸筒(用旧报纸或其它纸卷套在小竹棍一端糊好,再抽出即可,纸筒长4-5cm、口径大小以能套过雌花子房为宜)、标签绳(可将红色或白色包装带剪成20cm左右的1条条绳子,用作标记)。
2.2 雄花的采集在父本田采集雄花以前进行1次除杂工作,将所有不纯正、不健壮的父本苗拔除。
在雄花开放前1天傍晚或当天清晨,采集生长健壮的纯父本花朵,雄花的采摘量以1朵雄花可授3朵雌花进行估算。
雄花采好后放在小篮子里,盖上湿纱布备用。
2.3 授粉操作授粉时间晴天气温较高时应在上午6-9时进行,阴天气温较低时可相应推迟到上午10时。
因为雌雄花大都在这段
时间开放。
授粉时先拿去套在雌花上的纸筒,取篮子内刚开放的雄花,去掉花瓣,将雄花花药轻轻涂在刚开放的雌花柱头上,然后用剪好的标签绳系在授粉的雌花花柄上或此节的蔓上,作为制种瓜的标记,超过上午10时应停止授粉。
凡漏授粉的雌花和10时后开的雌花全部去除,确保后面开的雌花在杂交制种后提高坐果率。
作物育种学试题及答案-完整版

作物育种学试题及答案第一章绪论一、选择题:1.作物进化的基本因素有: ( )A. 遗传B. 变异C. 选择D. 漂变2.作物育种的实质: ( )A. 遗传B. 作物的进化C. 选择D. 作物的人工进化3.作物育种学的基本理论是( )。
A. 遗传学B. 生物学C. 植物学D. 生物进化论4.在人工选择的过程中,自然选择起作用吗? ( )。
A. 不起作用 B.起一定作用 C.起主要作用 D.起有利作用5.从生态学上讲,一个作物品种就是一个()。
A. 地区型B. 地理型C. 地域型D. 生态型6.在育种历史上,大幅度提高了作物单位面积产量的育种途径是哪些?( )。
A.系统育种 B.抗病育种 C.矮化育种 D.杂种优势利用E.辐射育种7.品种是人类根据一定地区生产和生活需要而创造的一种作物群体,它具有( )。
A.遗传性状的相对稳定性B.遗传性状的相对一致性C.遗传性状的新颖性 D.区域性 E.时间性8.作物育种的基本任务是( ) 。
A. 研究作物牲状的遗传规律 B.搜集、研究和创造种质资源C.培育作物新品种 D.研究育种方法 E.研究种子生产技术二、填空:1.作物进化与生物进化无本质区别,它们都涉及、、这几个主要因素。
是植物进化的基础,能够巩固和积累优良的变异,可使变异向有利方向巩固和发展,形成新类型、新物种。
2.作物育种和良种繁育学研究的对象是:三、判断下面各题的正误,正确的划“√”,错误的划“×”。
1.如果是杂交种,在品种标准中,除说明栽培技术要点外,还需要说明杂交制种技术。
( )2.农业种子可归纳为三种类型,即真正的种子、类似种子的果实,营养器官。
()3.作物育种学又称为人工进化的科学。
它是利用人工创造的遗传变异,而不是利用自然发生的变异培育新品种。
( )4.生物进化的三大要素是生存竞争、变异和选择( )。
5.从生态学来讲,一个作物品种就是一个地区型。
( )6. 品种是植物学上的分类单位。
G-蛋白与光敏胞质雄性不育小麦育性转换关系

G-蛋白与光敏胞质雄性不育小麦育性转换关系胡海蓓;邱慧;何之常【期刊名称】《武汉大学学报:自然科学版》【年(卷),期】2000(46)4【摘要】用孔雀绿定磷法测定在不同光照条件下 ,光敏胞质雄性不育小麦育性转换期叶片和幼穗中 G-蛋白的GTPase活性变化 .结果表明 :在 16 h/d光照 (L D)下 ,(牡山羊草 )白皮 2 2 4[(Aegilopsjuvenalis) baipi2 2 4]和 (牡山羊草 ) NPFP[(Aegilops juvenalis) NPFP]在光敏感期 ( )内 G-蛋白的 GTPase活性分别高出 10 h/d(SD)处理下的30 %和 6 0 % .光敏期后 ,幼穗的 GTPase活性也表现出 L D处理高于 SD处理 .这种差异表明 :G-蛋白的 GTPase活性变化与光敏胞质雄性不育小麦的育性转换有关系 .【总页数】4页(P483-486)【关键词】G-蛋白;光敏胞质雄性不育小麦;育性转换【作者】胡海蓓;邱慧;何之常【作者单位】武汉大学生命科学学院【正文语种】中文【中图分类】S512.103.5;Q513.3【相关文献】1.带Aegilops crassa山羊草胞质的小麦光敏胞质雄性不育 [J], Murai,K;李素华2.温光敏小麦雄性不育系C49S的育性转换及恢复研究 [J], 王涛;张作仕;曾秀英;李竹林3.光敏胞质雄性不育小麦育性转换期叶片中NAD激酶和NADP磷酸酶?… [J], 杨万年;干华忠4.小麦细胞质光敏雄性不育育性恢复的遗传研究 [J], 王艳;郭小丽;张爱民;吴晓华;李润枝5.小麦D^2型光敏性细胞质雄性不育系在不同光照条件下可溶性蛋白的比较分析[J], 姜静;刘伟华;石锐;张月学;李集临因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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西瓜G17AB雄性不育两用系的转能和利用
张寅安;陈安邦
【期刊名称】《中国西瓜甜瓜》
【年(卷),期】1991(000)002
【摘要】西瓜G17AB雄性不育两用系自1987年由沈阳市农科所育成以来,在西瓜种质资源的开拓、杂交制种和西瓜生产诸方面起了积极的作用。
本文仅对它的转育和应用情况作以下介绍。
1 西瓜G17AB雄性不育两用系西瓜G17AB雄性不育两用系(下简称G17AB系)来源于一个常规西瓜品种自然群体的两个雄性不育株,经五代选育而成,其遗传机制为细胞核不育类型,两用系群体的育性分离为1:1。
其中可育株(杂合体)群体即是不育系的保持系。
G17AB系属中早熟西瓜品系,秧蔓生长势中等,叶片开裂,果型中等大小,果实圆球形,果皮绿色衬有墨绿色条带,红瓤、褐籽,含糖量9%左右,果实生育期32天。
【总页数】5页(P6-10)
【作者】张寅安;陈安邦
【作者单位】不详;不详
【正文语种】中文
【中图分类】S651.03
【相关文献】
1.西瓜雄性不育两用系G17AB的改良及利用 [J], 张显;魏大钊;赵尊练
2.甘蓝型油菜生态雄性不育两用系的研究Ⅰ.雄性不育两用系的遗传 [J], 杨光圣;傅
廷栋
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5.甘蓝型油菜生态雄性不育两用系的研究Ⅱ.环境条件对雄性不育两用系的影响[J], 杨光圣;傅廷栋;马朝芝;杨小牛
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