家蚕基因组甲基化谱发表

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“家蚕基因组甲基化谱”在《NatureBiotechnology》发表

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家蚕基因组DNA甲基化分析

家蚕基因组DNA甲基化分析

家蚕基因组DNA甲基化分析
翁宏飚;曹锦如;叶爱红;牛宝龙;何丽华;沈卫锋;孟智启
【期刊名称】《蚕业科学》
【年(卷),期】2008(34)1
【摘要】DNA甲基化在生物的基因表达调控与发育调节过程中具有重要作用。

应用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术对7个家蚕保存品种的胞嘧啶甲基化模式和程度进行评估。

在所能检测的CCGG序列中,至少有8.6%~10.9%的胞嘧啶发生了甲基化;12对引物共获得1156条扩增带,其中376条在品种间呈多态性,多态性比例为32.5%。

结果显示:家蚕基因组可检测到DNA甲基化,各品种间的甲基化模式存在差异,CCGG序列中胞嘧啶外部甲基化(10.9%)高于内部甲基化(8.6%)。

【总页数】5页(P28-32)
【关键词】家蚕;DNA甲基化;甲基化敏感扩增多态性
【作者】翁宏飚;曹锦如;叶爱红;牛宝龙;何丽华;沈卫锋;孟智启
【作者单位】浙江省农业科学院蚕桑研究所
【正文语种】中文
【中图分类】S881.2
【相关文献】
1.应用DNA甲基化芯片对胃癌及其癌旁组织基因组甲基化的分析 [J],
2.应用DNA甲基化芯片对胃癌组织基因组甲基化的分析 [J], 彭涛;杨永江;赵轶峰;
高建朝;Muhammad Abbas;王国强;孙虹;李曙光
3.子宫内膜癌DNA甲基化谱的全基因组分析预测新甲基化标记物 [J], 王瑶;金鑫
4.糖尿病肾病大鼠肝DNA甲基化酶活性及基因组DNA对DNase敏感性的分析[J], 汪琛颖;马晴;何忠效
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AnnualReviewofEntomology:家蚕基因组序列解析推动了家蚕的前沿研究

AnnualReviewofEntomology:家蚕基因组序列解析推动了家蚕的前沿研究
4 8




3 3卷
的发生 ; 另一方 面 , 融洽 的邻 里关 系可 以在 施
用农 药上 互 相告 知 , 从 而 可 以避 免 或 减 少 中 毒 情况 的发 生 。
2 . 3 试 喂
立 即用鲜 石 灰粉将 蚕 正在 啃食 的桑 叶完全 盖
住, 避免 蚕进 一步 食下 更 多含有 农药 的桑 叶 ,
同时加 强蚕 室 的通 风 透气 ; 紧接 着 是 用 相 应
大小 的蚕 网铺 在 蚕 座 上 面 , 随 即撒 上 安 全 干
试 喂是 指一 般先 选 择 2 0 ~3 O头 蚕 来 单 独放置, 然后 将 不 确 定 安 全 与否 的桑 叶 给 这
净 的新 鲜 桑 叶 , 待 大 部 分 未 中毒 或 中毒 不 严 重 的蚕 上 网取 食 后 , 通 过 抬 蚕 网将 蚕 与有 毒
发育 、 免疫 与疾 病 抗 性 等 重 要 性 状 分 子 基 础 解 析 研 究 方 面 的 突 破 ; 全 面 概 述 了 基 于 家 蚕 全 基 因 组 序 列 所 开 展 的 家 蚕 遗 传操 作及 重 要 育 种 素 材 创 新 研 究 。该 综 述 不 仅 是 对 家 蚕 基 因 组 计 划 实 施 以 来 家 蚕 基 因 组 及 功 能 基 因 组 研究 的 总结 , 也对 家 蚕基 因 组 生物 学研 究 的未 来 走 向做 出 了展 望 。 该 工 作 主 要 由 国家 9 7 3 项 目、 8 6 3项 目及 国家 自然 科 学 基 金 项 目支 持 。三 个 研 究 小 组 的青 年 学 者 及 研 究 生 在 资 料 收 集 和 数 据 分 析 中做 了大 量 工 作 。
序 列解 析推 动 了家蚕 的前 沿研 究

家蚕基因组甲基化谱发表

家蚕基因组甲基化谱发表
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p u d n d v p r r m a b e d c mp sto nAph n my e o n sa a sfo c b a e o o i n o o g i ao cs
a b s u a c rh z u g s ac n e u n e o e u r s in r u c lrmy o r ia f n i o s q e c fwe d s pp e so i a
s no n a rop toe s f eel b r s a i us ]Pat i fuglot a gn ras yBa i s e[. ln o f h oc s c ts J
【 ] 陈新 娟. 2 0 中国芸薹属蔬 菜硫代葡萄糖苷 及其影响 因子研究 【】 D.
杭 州 : 江 大学 ,0 6 浙 20.
[1 陈新娟, 2】 周胜 军. 3个芜菁 品种硫 代葡萄糖 苷含量 的比较研究
【 _ 江 农 业 科 学 , 0 92: 1 — 1. J浙 】 20 ()4 5 4 7
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:・ 科技动态 ・




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家 蚕 基 因 组 甲基 化 谱 发 表
5月 3日,由中 国科 学院 昆明动物研 究所 、深圳华 大基 因研 究 院、西南大学 、上海
果“ 家蚕基 因组 甲基化谱”H O 0 Y ( 自 》 N T R IT C N L G 》 《 然 生物
a n m ns p l ai ae png cs o t po lsJ S i med et pi t nbsdu o l oi l e rfe 【. ol a c o u na i ]

家蚕变态发育的基因表达谱及microRNA的调控研究的开题报告

家蚕变态发育的基因表达谱及microRNA的调控研究的开题报告

家蚕变态发育的基因表达谱及microRNA的调控研
究的开题报告
摘要:
家蚕是重要的经济昆虫,其变态发育是其生命周期中最为重要的生理过程之一。

本文计划通过基因表达谱和microRNA的调控等方面探究家蚕变态发育过程中的分子机制,以期深入了解家蚕的生命周期和其生理调控机制。

研究内容:
1. 基因表达谱分析
利用RNA-Seq技术测序家蚕的不同发育阶段,包括卵、幼虫、蛹和成虫阶段,获取家蚕变态发育过程中的基因表达谱。

通过基因表达量的统计和差异表达基因的筛选,筛选出具有生物学意义的基因,进一步分析它们在家蚕变态发育过程中的调控作用。

2. microRNA调控分析
基于RNA-Seq测序结果,探究家蚕变态发育过程中microRNA的表达谱,并使用生物信息学分析工具对这些microRNA的靶基因进行预测。

通过分析microRNA与其靶基因之间的调控关系,以及这些关系在家蚕变态发育过程中的动态变化,揭示microRNA对家蚕变态发育过程的精细调控作用。

3. 数据整合与分析
将基因表达谱和microRNA的调控结果进行整合,通过生物信息学方法对其进行生物学意义上的分析及可视化,展示家蚕变态发育过程中的分子机制,并探究家蚕整个生命周期的调控机制。

预期结果:
本研究可望深入了解家蚕变态发育过程中的分子机制及其调控,为
家蚕的农业生产、疾病预防和治疗等方面提供重要的参考价值。

同时,
本研究也可为其他昆虫的变态发育及其分子机制的研究提供参考和启示。

家蚕基因组中的分子标记遗传图谱

家蚕基因组中的分子标记遗传图谱
工作 中 已取 得 一定 进 展 …。
遗传 标 记 是 基 因组 研 究 的 重 要 内容 。是 构 建 物 种 遗 传 图 谱 的 基 础 。分 子 标 记 技 术 为 物 种 基 因组 的 结 构 分 析 和 比较 提 供 了有 力 的 工 具 ,较 高 密度 的 分 子 标 记 遗 传 图谱 已 有 效
分子标 记 技术构 建 的家蚕 基 因组分 子标记 遗传 图谱 进行 了讨论 。
关 键词 家蚕 限制 性酶 切片 段长度 多态 性 D A随 机 扩 增 多 态 性 N 扩 增 片 段 长 度 多 态 性
简单 重复 序列 P R 分子 标记 遗传 图谱 C
分 子 标 记 技 术 本 质 上 是 以检 测 生 物 个 体 在 基 因或 基 因 型 上 所 产 生 的 变 异 来 反 映 基 因
记 和 同工 酶标 记 等 表 达 型 标 记 的 局 限性 ,具 有 稳 定 性 高 、受 环 境 条 件 的影 响小 、信 息 含 量 高 、不 同层 次 和 类 群 之 间广 泛 可 比等 优 越 性 ,广 泛 用 于 昆 虫 系 统 进 化 、种 群 遗 传 结
构 、生态 习性 和行 为等 研 究领 域 。
组 之 间 的 差 异 的 。是 随着 分 子 生 物 学 技 术 的 飞 速 发 展 而 出 现 的 遗 传 学 标 记 技 术 ,主 要 包
括 限 制 性 酶 切 片段 长度 多 态 性 ( sit nf g r tci a- er o r
met eghp l op i R L ) N il r .t o m rh m. F P 、D A随 机 扩 y s
家 蚕 分 子标 记 遗传 图谱 。
增 多 态 性 ( n o mpie oy rh N r d m a l d pl p i D A, a i f mo c R P 、扩 增 片 段 长 度 多 态 性 ( pie a- A D) m f a l dfg r

“家蚕甲基化图谱论文”研究亮点首登Nature China










“ 家蚕 甲基 化 图谱 论 文 ’ 究 亮点 首登 NaueChn ’ 研 tr ia
[ 7 崔 广 华. 甲壳 素 的 性 质 、 备 及 其 应 用 [] 中 国物 资再 生 . 9 6 3 2] 制 J. 19 ()
/ 50.4 [8 GB T 0 9 4 2]
[ 9 金青哲 , 2] 王树刚 , 蚕蛹新鲜度的研 究口] 食品科学.0 3 1 ) 7 8 等. . 2 0 ( 1 7 —7 [ O 施 自伦 , 朝 品 , 群 红 等 .蚕 蛹 蛋 白的 现 代 研 究 概 况 [] 安 徽 农 业 科 学 ,0 9 3 () 3 5 —3 5 3] 李 刘 J. 2 0 ,7 7 :0 1 0 2 [ 1 金 明 晓 , 红 光 , . 蛹 蛋 白 粉 脱 臭 工 艺 研 究 [] 食 品科 学 ,0 5 2 ( ) 2 1 9 3] 曲 等 蚕 J. 2 0 ,69 :9 —24
陈芳 艳 .蚕 蛹 蛋 白提 取 工 艺 条 件 的筛 选 []广 东 蚕 业 . 8 3 :9 2 J. 3 () 2 —3 吴海 龙 , 梅 珍 , . 蛹 酿 制 酱 油 的研 究 [] 西 农 业 大 学学 报. 0 19 3 3 4 9 徐 等 蚕 J江 2 0 ,( ) 9 —3 5 [ 4 蒋艳 忠 , 2] 杨克迪 , 蚕蛹油超临界 C 萃取研究 [] 油脂开发. 0 7 4 4 4 等. O。 j. 2 0 ( )6— 7 [ 5 吕秋 楠 , 高 峰 , . 素 包 合 法 纯 化 蚕 蛹 油 中 一 2] 史 等 尿 亚麻 酸工 艺 研 究 [] 中 国 油脂 .0 9 (4 8 J. 20 .3 ) [ 6 杨 克 迪 , 小 明 . 酸银 络 合 萃取 蚕 蛹 油 中 亚 麻 酸 酯 口] 2] 胡 硝 .中 国 油脂 .0 83 ) 2 0 (3 1

美科学家发现恒河猴幼猴大脑存在两个焦虑感应区

生 , 我 国科 学 家 取 得 的 又 一 重 大 基 因组 研 究 成 果 。 是
[ 经科 学] 神

美科学家发现恒 河猴 幼猴 大脑 存在两个焦虑感应 区 据 中国军网 2 1 0 0年 8月 1 2日援 引新 华社 华盛 顿 2 1 00
[ 动物繁 育技 术]
我国西藏林芝人工繁育异齿裂腹鱼 获成功 。 填补 国际 空白
的课题。
此项研 究揭示了果蝇体 内存在一 种巧妙 的调节机制 , 可
以保证果蝇 在原 始生殖 细胞数 量异常 减少 的情况 下避免 不 育 。研究人员认 为 , 这一发现可能有助 于揭示 其他动物 避免
不育的 机制 , 为研究 精巢 以外 器官 中的干 细胞及其 “ 近细 邻
胞” 的调节机 制提供启 示 , 并有望 给人类不育疗 法提供新 的

7 ・ 4
生物学 教学 21 年( 6 第1 01 第3 卷) 期
据报道 , 王立东教 授及其 同事 利用 全基 因组关 联分析 , 对 2 5万多例 中国汉族 、 . 哈萨克族 和维吾尔族等不 同民族食 管癌患者 和健康对照组作 了对 比分析 , 发现不同民族 患者均
与磷脂酶基 因亚运型 和核黄 素转运基 因密切相关 , 揭示 了食 管癌发病 的基 因因素 。 中国老一代科学家在河南食管癌高发 区的研究 已证 实 ,
现, 易患脑膜炎人 群和健 康人 之 间在一 种名 为 H 因子 的蛋 白质相关基 因上存在差异。研究显示 , H因子本身在人 体免 疫系统 中帮助辨别和杀死入侵的细菌 , 但在易患脑膜 炎的人
范围可能 比科学 界此前认为的大得多 , 光合作用 的效率 也远
超科学家的想象 。 研究人员认为叶 绿素 f 有望广 泛应 用于植 物生 物技 术 及生物能源开发研究领域 。 德科学家发现植物免疫 系统激活机制 据 中国军网 2 1 8月 2 00年 0日援 引新华社柏 林 2 1 0 0年

第二届家蚕功能基因组学与现代丝绸之路国际研讨会会议述评

专 家 和 学 者 也 应 邀 出席 本 次 研 讨 会 。本 次 会 议 分 大会 主题 报 告 和分组 交 流 。4个 主题 :家蚕 功 能基 因组 学 、昆 虫 比较 基 因组 学 、桑 树 基 因组 学 、 国
际蚕丝 产 业 。
谱 ,是对 大范 围的基 因甚至是全基 因组的甲基化 分析 。D A 甲基化 作 为 表 观 遗传 学 的一 种 重要 标 N
c N q ecs ”的报告 ,M t教授介绍 了对家 D As une e ) i a
蚕 mR A 进 行 了转 录 组 学 的测 序 分 析 , 对 家 蚕 N
成不但对理解昆虫表观遗传 学调控 的提供 了重要
的参 考 资 料 ,也 为 进 一 步 发 掘 家蚕 人 工 驯 化 过 程
个基 因序列与家蚕编码基因不相一致 ,进一步补 充 了 由西 南 大 学 家 蚕 基 因组 生 物 学 国家 重 点 实 验 室为主完成的 “ 家蚕全基 因组精细图谱 ”和 4 0个
蚕 类 基 因组 重 测 序 和 高 精度 遗 传 变异 图谱 的 结 果
【 ;在 昆 虫 比较基 因组学 方 面 ,中所 王 文研 究 员 做 了 “ 蚕 与野 蚕 的 比较 甲 家
基 化 组学 ( o p rt em ty m e ew e o s C m aai e l i b tend me— v ho s
国 、日本 、德国、加拿 大、瑞典、新加坡 、印度 、
希腊 、泰 国及 中 国 台湾 和 国 内科 研 机 院所 的 代 表
第4 6卷 第 1 期 21 0 2年 3月
广



Vo .6 No 1 1 . . 4
M AR.201 2
GUANGDONG CANYE

我国构建高分辨率家蚕基因组甲基化图谱

酮 类 等 化 合 物 组 成 的 化 合 物 ,可 以作 为低 级 燃 料 直 接 燃 烧 , 也可 以经 过进 一步精制 得到不 同级别 的生物质液 体燃料或
化工产品 。同时 ,还得到 以乙酸为主 的水溶相产物 ,可 以作
近 年 来 ,由 于全 球 气 候变 化 、水 体 富 营 养 化 等 原 因 ,造 成 海 洋 大 型 海 藻 浒 苔 绿 潮 频 频 爆 发 , 量浒 苔 漂 浮 聚 集 到 岸 大 边 ,阻 塞 航 道 ,同 时浒 苔 堆 积 腐烂 繁殖 后 ,破 坏 海 洋 生 态 系 统 ,成 为 世 界 各 地 的主 要 海 洋 环 境 问题 之 一 。 复 旦 大 学 环 境 科 学 与 工 程 系 张士 成 课 题 组 , 过 多 次研 经
配套集成技 术, 发一批具有 自主知识产权和市场 竞争力的 研 新产 品,力 争获取 5 0项 以上重大发 明专利 ,促进 食品、汽 0 车 、石 化 、农 业 等 1 4Байду номын сангаас 千 亿 元 产 业 以及 新 材 料 、新 能源 等
4个 战 略 性 新 兴 产 业 的整 体 技 术 、 装 备 水 平 接 近 先 进 水 平 。
提供 了重要资料, 也为进一步发掘家蚕人工驯化过程 中潜在
的表 观 遗 传 学 奠 定 了坚 实 的 研 究 基 础 。( 学 时报 ) 科
复旦 大 学 用 大 型 海 藻 制 成 生 物 油
复 旦 大 学 6月 2 3目宣 布 ,该 校 环 境 科 学 与 工 程 系 张 士
基 因育种 是 目前 国际上普遍采用 的新技术 , 中国科 学家
作 , 用 新 一 代 测 序 技 术 构 建 了第 一 张 单 碱 基 分 辨 率 的 昆虫 利 甲 基 化 谱 一 一 家 蚕 丝 腺 甲 基 化 谱 。 该 成 果 在 N t r au e
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的三元低温共聚技术, 得到的聚合物具有 良好可纺性 能和满 足高性能碳纤维碳 化的工艺要求 。 其中具有 自主知识产权 的 三元凝固成型技术 ,对原丝实旅 改性 ,改性 后的原丝具有预 氧化温度低,碳化过程缓慢稳定 ,可大大减 少碳化过程中纤 维缺 陷问题 的产生 。尤其该技术 中实现了较低聚合温度 ,为 目前国内该行业 的最低温度 , 创新的同时达到 了节能减排和 环保 的要求 ;该项 目还独立开发 了原丝油剂 ,经北京化工大
华大基因科学家表示 , 家蚕 甲基化谱的完成 不但对理解
昆虫表观遗传学 调控提供 了重要的参考资料 , 为进一步发 也 掘家蚕 人工驯化过程 中潜 在的表观遗 传学贡献奠定 了坚实
的研 究 基础 。( 技 日报 ) 科
我 国研制成功新型三维 图像 悬 浮 显 示 装 置
随着 3 D电影在全球票房获得 巨大成功,人们将 目光热 切地投 向了带来精美立体画面和 巨大感官享受的 3 D技术 。 最近 , 中科院长春光机所研制的一种单源光路 的三维 图像多 方 位 悬 浮 显示 装 置 显 示 出新 ~ 代 3 D显 示 技 术 未 来 发 展 的 端 倪。 该装置不需借助任何助视仪器,即可使多人 同时围绕 显 示 区域 多角 度 地 观 看三 维 图 像 。 长春 光机所研制 的三维 图像 多方位悬浮显示 装 , 利用新一 代 测序 技 术构 建 了第 一 张单 碱基 分辨 率 的 昆虫 甲基化 谱
— —
家蚕丝腺甲基化谱 。研究发现大约 0 1% . 1 的基因组胞嘧
啶被 甲基化修饰 ,不及哺乳动 物和 植物 的 1 5 。甲基化区 /0 域主要富集在基 因区 ,并且与基 因表达水平成 正相关 。动植
碳纤维 国产化核心技术瓶颈终获突破
制约我 国碳 纤维材料 原丝质量 不过关等若干关键 “ 瓶 颈 ”技术难题终被突破 。 哈尔滨天顺化工科技开发有限公司 经 过三年 自主研发 , 取得 了高性能碳纤维国产化核心技术的 创 新突破 ,中试产 品达到 国际高性能碳纤维 的指标要求。 近期 , 由哈尔滨天顺化工科技开发有 限公司完成的黑龙 江 省科技攻关 项 目 “ 高性 能聚丙烯腈 碳纤维原丝的聚合工 艺 研 究 ”通 过 了 由黑 龙 江 省科 技厅 组织 的专 家 鉴 定 。 内人 业 士 认为该项 目的实施 将结束我 国不能生产 高性能碳 纤维材 料 的历史 , 对满足 国防和 民用需要,带动与碳纤维相关产业
发展意义重大。 据悉, 高性能聚丙烯腈碳纤维是先进复合新材料的核心
家蚕 基 因组 甲基 化 谱 发 表
近期 ,由中国科学 院昆明动物研究所 、深圳华大基 因研 究 院 、西 南 大 学 、上海 肿瘤 所 等 合 作 的研 究 成 果 “ 家蚕 基 因 组 甲基化 谱”在 国际著 名学术杂志 N T R IT C N L G AUEBOEHOOY ( 自然》生物技 术分 刊)上发表 ,这是我 国科学家在家蚕 《 基因组研究领域取得 的又一项重要成果。 作 为 表 观遗 传 学 的一 种 重 要 标 记 ,DA甲基 化 在 基 因 组 N 防御 、基因调控等方面都发挥着重要作用 。相对于动植物 , 昆虫 甲基化 水平 很 低 ,其 功 能 也 一直 存 在 争 议 。近 年 来 ,随
材料, 国防以及风 电等诸多国 民经济领域有着广泛的应 用 在 和需求 。 哈尔滨天顺化工科技开发有限公司总经理盂凡钧针 对 国 内尚未 掌握 高性 能碳 纤维原丝核心技 术的情况而开始
致 力 于 其 国产 化 技 术 的 创 新 研 发 。 该 项 目在 多 个 方 面 取 得 了创 新 突 破 , 们 采 用 自主 研 发 他
着 越 来越 多 昆虫 甲基 化 基 因 和 甲基 化 酶 的报 道 , 昆虫 甲基化 的 功 能 和 生物 学 意 义 引起 研 究人 员 的广 泛 关 注 。最 近 ,中 国 科学院 昆明动物研 究所王文研 究员领导的 马普小组的相辉 博 士等 ,与深 圳 华 大 基 因 研 究 院 、西 南 大 学蚕 桑 学重 点实 验
物 中被 报道 发 挥 重 要 作 用 的 启 动子 区 、核 糖 体 rN D A区 甲基 化 调控 ,以及 转座 子 区 的 甲基 化 抑 制 ,在 昆虫 中 似 乎还 不 具
备。
学碳纤维及 复合 材料研究所试 验证 明该 油剂 基本满足预氧
化要求 ,在实验选定的工艺范围 内,无粘黏、结焦现象 ,原 丝灰分小于 0 4 % . 5 ;同时该项 目所开发的立式梯度逆流洗涤 设备也是国内独家,具有节能环保 的优 点。该生产线具有完 全独立的 自主 知识产权 。( 科技 网)
开采 发 挥 出重 要 作 用 。
此次湿地遥感制图的完成 , 能为我 国湿地大调查提供 资 源 配 置 依 据 ,为 长 期湿 地 变 化 监 测 打 下 基 础 。同 时 ,由于 湿
地 和 血 吸 虫 病 、 疾 、 流 感 等 与 环 境 相 关 的疾 病 传 播 息 息 疟 禽 相 关 ,及 时 掌握 湿 地 分 布 和 变化 状 况 ,能 为深 入 了解 疾 病 传 播途径提供重要 的环境参数 。( 科技 日报 )
国内首 台油井光纤高温 高压传 感器 研 制成 功
近期 , 山东省科学院激光研究所 自主研发的固定式高精 度光纤压力传感器获得 成功 。 台光纤高温高压传感器可在 这 油井下温 度 2 0C 2  ̄和压力 I OP O M a下长期作业,解 决了常规 电子传感 器和光纤压 力传感器受 油井下高温 高压干扰 而无 法 正 常 工 作 的难 题 。光 纤 高温 高压 传 感 器 的 研 发 成功 ,不仅 打破 了国外对此技术的长期垄断, 更将对 我国油气井的科 学
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