第4章 群体遗传学基础
动物遗传学-第十章 群体遗传学基础

三、群体遗传结构
❖基因频率和基因型频率间的关系(以一对等位基因为例)
因为牛角遗传中,无角P对有角p是显性,PP和Pp个体表型 都是无角,所以: q 0.98 0.9899
D+H=0.02,R=0.98, p 1 R 1 0.9899 0.0101
例二:一对等位基因呈共显性时 D=p2
通过 H=2pq 直接计算群体的基因频率 R=q2
如,安达鲁西鸡有三种毛色:黑色、蓝色和白花。 由一对等位基因B和b控制。 表 型: 黑色 蓝色 白花 基因型: BB Bb bb 调查结果: 49% 42% 9% 基因型频率:0.49 0.42 0.09 B基因频率:p=0.49+(1/2)×0.42=0.70
无穷世代
伴性基因频率在雌雄群体中变化的特点:
✓ 雄性群体中,基因频率等于基因型频率;雄性群体当代基因 频率等于上一代雌性群体的基因频率。
✓ 后代中雌性群体的基因频率等于亲代雌雄群体基因频率的平 均数。
✓ 雌、雄群体中的基因频率不相等,其差异每通过一代随机交 配减少一半,且符号相反 。
四、 遗传平衡定律
设喜马拉雅兔在群体中占的比率为H,白化兔的比率为A
则: A=r2 r A
H q2 2qr
H A q r2 1 p2
p 1 H A
所以: q 1 p r
例四:伴性基因频率的计算
对伴性基因而言,可分成雌、雄两个群体来考查。 对雄异型生物来说,雌性群体中基因频率与基因 型频率的关系与常染色体上基因一样;雄性群体中, 基因频率就等于基因型频率。 雌异型生物的情况则刚好相反。
群体遗传学的基本概念与原理PPT优质课件

二、HardyWeinburg定律
❖ 1、基本概念 随机交配(Panmixia): 在有性生殖生物中,一种性别的任何一个个 体有同样的机会和相反性别的个体交配的方式称 随机交配(random mating)。 即各种类型的个体交配的频率完全取决于自 身频率的大小,而不受任何其他因素的影响。实 行随机交配的结果是所有的基因型都是孟德尔式 分离所产生的配子随机结合而形成的。
群体遗传学的基本概念与原理
(优选)群体遗传学的基 本概念与原理
一、基因频率与基因型频率
❖1、群体的遗传结构
▪ 孟德尔群体(Mendelian population): 一个 孟德尔群体,是一群能够相互繁殖的个 体,它们享有一个共同的基因库。在有 性繁殖的生物中,一个物种就是一个最 大的孟德尔群体。
❖ 5、基因频率计算 ❖ 例1(记数法) Greenland血型数据(据569个体) ❖ M 83.5%, MN 15.6%, N 0.9%.计算基因频率 ❖ 解:定义M、MN和N的频率为D、H和R;等位基
因M、N的频率为p和q。我们有
注意:如果是频数资料,则: p = (2D + H) /2N; q = (2R + H)/2N 。
的比率。D, H, R
一、基因频率与基因型频率
❖ 4、基因频率计算 P(AA)=D; P(Aa)=H; P(aa)=R; p=P(A) =P(A|AA)P(AA)+P(A|Aa)P(Aa)+P(A|aa)P(aa) =D+(1/2)H p=D+(1/2)H q=R+(1/2)H
一、基因频率与基因型频率
二、HardyWeinburg定律
❖ 2、HardyWeinburg定律 ❖ ①在随机交配下的孟德尔群体中,若没有其他
4.群体遗传 遗传学课件

M的频率:(250X2+500)/1000x2=0.5
N的频率:(250X2+500)/1000x2=0.5
● Hardy-Weinberg定律与群体遗传结构
◆ 计算群体的基因和基因型频率
◆ 检验群体中决定某性状的基因及基因型频 率是否处于Hardy-Weinberg平衡
◆ 基因型频率:一个群体中不同基因型所 占的比率。全部基因型频率的总和等于1。
◇ 核酶(ribozyme)的发现推测 RNA是最初的replicator
◇ RNA world ◇ 47亿年前最早的生物--现有细 胞的前体出现。
◆ 生物进化的历程
◇ 化石记录指出, 至今所发现的确切的细胞 于35亿年前出现在澳大利亚(13-12)
◇ 最早的细胞迅速进化成三界:细菌、古 菌(archaea)和真核生物(13-13)
◆人类的起源与进化
◇ 人类35亿年前从灵长类进化而来(13-14)
◇ Wilson 及其同事通过比较来自不同地区的女人 (如非洲的美国人, 亚洲人,新几内亚人,澳大利 亚人等)的mtDNA序列,提出现代人于200000年前起 源于非洲(13-15)
● 基因组的进化
◆ DNA的变化(第十二章)是基因组进化的基础 ◆ 复制使基因组增大。 ◆ 利用基因组间遗传差异构建分子种系发生树
◆复制使基因组增大。
◇四个层次水平的复制增加基因组大小(13-16)
◇转座引起的复制(13-17)
◇来自不等交换的复制(13-18)
◇随机遗传漂变和突变使复制序列成为假基因→ 基因组中的随机DNA序列。
◇选择造成的复制基因的多样性,能产生新基因。
◆利用基因组间遗传差异构建分子种系发生树
◆ 基因库(gene pool):一个群体中所有个 体的等位基因的总和。
动物遗传学-群体遗传学基础

01
结构变异 染色体数目变异
4
突变是进化的原动力;可以形成新基因,为选择提供原材料;可以改变基因频率
5
突变mutation
1
突变 变异 遗传重组
2
基因突变 染色体畸变
3
315
6
在群体中,突变往往分为正、反突变,即: A a
在共显性或不完全显性时,计算比较简单。因为基因型和表型一致,即由表型直接可以识别基因型,因此,只要知道表现型比例,就可知道基因型频率,再通过基因型频率计算出基因频率,所用公式为:
P=D+1/2H; q=R+1/2H
短角牛中有白色、红色和沙毛色,而沙毛色是红色、白色牛杂交的后代。在牛群中白、沙、红三种毛色分别占35%,50%和15%,于是基因频率分别为:
3.在平衡群体中,基因频率和基因型频率的关系为: D=P2 H=2pq R=q2
1/2,就绝对不是平衡群体。
利用这个性质可知,只要
三、平衡群体的性质
01
性质2:杂合子频率是两个纯合子频率乘积平方根的二倍。
02
H=2(DR)0.5
03
检测群体是否平衡的简便方法:两个性质
平衡定律的证明
01
在一个牛群中,红色个体的比例为60%,沙毛 个体为40%,白色为0,试计算各代的基因频率和基因型频率。
4
p=(2n1+n2)/2N=D+1/2H
01
q=(2n3+n2)/2N=R+1/2H
02
一对等位基因
基因型频率与基因频率的性质
01
同一位点的各基因频率之和等于1 即: p+q=1
02
群体中同一性状的各种基因型频率之和等于1 即:D+H+R=1
本科大学遗传学期中整理重点

第一章绪论1、遗传学的研究对象遗传学(Genetics)是研究生物遗传和变异的科学遗传与变异是生物界最普通、最基本的两个特征遗传(heredity):指生物亲代与子代相似的现象,即生物在世代传递过程中可以保持物种和生物个体各种特性不变;变异(variation):指生物在亲代与子代之间,以及在子代与子代之间表现出一定差异的现象。
2、遗传与变异的关系遗传学(Genetics)是研究生物遗传和变异的科学矛盾对立统一遗传是相对的、保守的,而变异是绝对的、发展的;3、遗传、变异与环境环境改变可以引起变异生物所表现出的性状变异分为:可遗传(heritable)变异和不可遗传(non-heritable)变异二、遗传学的发展简史*(一)、古代遗传学知识的积累(二)、近代遗传学的奠基1. 拉马克:器官用进废退与获得性状遗传2. 达尔文:泛生假说3. 魏斯曼:种质连续论4. 高尔顿:融合遗传假说5. 孟德尔:遗传因子假说(三)、遗传学的建立和发展1. 初创时期(1900-1910)(1)1900年,德弗里斯、柯伦斯和丘歇马克分别重新发现孟德尔规律,是遗传学学科建立的标志(2) 1901-1903年,狄·弗里斯发表“突变学说”。
(3) 1903年,Sutton和Boveri分别提出染色体遗传理论,认为:遗传因子位于细胞核内染色体上,从而将孟德尔遗传规律与细胞学研究结合起来。
(4) 1909年,约翰生(W.L.Johannsen 1859~1927)发表“纯系学说”,并提出“gene”的概念,以代替孟德尔所谓的“遗传因子”。
(5) 1908年,哈德和温伯格分别推导出群体遗传平衡定律。
2.全面发展时期(1910-1952)(1) 细胞遗传学/经典遗传学(1910-1940)1910,摩尔根(Morgan 1866-1945, 美国生物学家, 曾获1933年诺贝尔生理学-医学奖)等:性状连锁遗传规律。
(2) 数量遗传学与群体遗传学基础 (1920-)费希尔(Fisher)赖特(Wright)等:数理统计方法在遗传分析中的应用。
群体遗传学与种群动力学

群体遗传学与种群动力学群体遗传学和种群动力学是生物学中非常重要的两个领域,它们研究了生物群体中的遗传变异和种群数量动态的规律。
本文将从基本概念、研究方法和应用方面对群体遗传学和种群动力学进行探讨。
一、群体遗传学群体遗传学是研究生物群体中遗传变异和遗传漂变的学科,它关注的是遗传物质在群体层面上的分布和变化规律。
群体遗传学采用多种方法和模型来研究群体间和群体内的基因频率和遗传多样性。
其中最经典的是哈迪-温伯格平衡理论,它描述了自然选择和遗传漂变对基因频率的影响。
群体遗传学的研究方法包括群体遗传结构分析、基因流和迁移模型、亲权指数和遗传多样性评估等。
这些方法能够帮助研究人员了解不同群体间的遗传差异、基因流动态以及遗传演化的模式和速率,为进化生物学和保护遗传资源提供基础和理论支持。
二、种群动力学种群动力学是研究生物种群数量和结构动态变化的学科,它关注的是种群数量、密度和空间分布等因素对种群演化和生态系统稳定性的影响。
种群动力学的重要概念包括出生率、死亡率、迁移率、繁殖成功率和种群增长率等。
种群动力学的研究方法主要有种群模型和实地调查两种。
种群模型通过数学方程模拟种群数量变化趋势,常用的模型有指数模型、对数模型和Logistic模型等。
实地调查则是通过野外实地观察和数据采集,了解种群数量、密度和特定环境条件下的种群生态学特征。
三、群体遗传学与种群动力学的应用群体遗传学和种群动力学在许多领域都有广泛的应用。
在自然保护生物学中,它们可以用来评估种群数量和遗传多样性的健康状况,为物种保护和环境管理提供科学依据。
例如,通过群体遗传学分析,可以了解到不同地理分布的种群之间的遗传联系,从而为物种的保护和栖息地修复提供指导。
而种群动力学的研究则可以帮助确定以保护濒危物种为目标的保护策略,通过控制种群数量和空间分布来提高保护效益。
在人类遗传学领域,群体遗传学也有重要的应用。
例如,通过研究人类群体的遗传多样性和演化历史,可以了解到人类种群的迁移和扩散过程,为人类进化和社会学研究提供重要线索。
第五章 群体遗传学基础

p2:2pq:q2时,这样的群体处于
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处于遗传不平衡的群体只需随机杂交一代后,即可达 到遗传平衡。
例如:一个数目为100的群体中,AA有60,aa有20,Aa有20,则: AA = 60/100 = 0.6 Aa = 20/100 = 0.2 aa = 20/100 = 0.2 AA:Aa:aa = 0.6:0.2:0.2 = 3:1:1
一世代基因型及其频率 后 代 频 率 AA Aa D02 2D0H0 2D0R0 H 02 2H0R0 R02 D02 D0H0 1/4H02
aa
D0H0 2D0R0 2/4H02 1/4H02 H0R0 H0R0 R02
D1=(D0+1/2H0)2 = p02
H1=2(D0+1/2H0)(R0+1/2H0)=2p0q0
pD
qR
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性染色体:家畜 雌 A1 A1 频率 P
p ( A1 )
雄 A2 A2 Q
3n
A1 A2 H
2nPf nP m
A1 R
A2 S
2 1 p f pm 3 3
1 (2 P H R) 3
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第二节 哈代-温伯格定律
英国数学家Hardy和德国医生Weinberg经过 各自独立的研究,于1908年分别发表了 “基因平衡定律”的论文,后人为了纪念 他们就将此定律称为Hardy-Weinberg 定律
p = 1 - q = 99/100
携带者频率 = 2pq = 2 × 1/100 × 99/100 = 0.0198
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3.复等位基因
医学遗传学群体遗传 ppt课件

例如,根据在丹麦的一项调查发现: 108名软骨发育不全性侏儒生育了 27个孩 子,这些侏儒的 457个正常同胞共生育了 582 个孩子。如以正常人的生育率为 1 , 侏儒患者的相对生育率(f)则为: f=27/108÷582/457=0.20
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选择的作用在于增高或降低个体的适合 度,一般用选择系数(selection coefficient, S) 表示。 S代表在选择的作用下,降低了的适合度 (S=1-f)。 例如,软骨发育不全性侏儒的选择系数 S=1-f=1-0.20=0.80。
即
u=Sq2
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例如,苯丙酮尿症是一种隐性遗传病, 在我国人群中的发病率约为1/16500,即 0.00006。 已知这种病患者的f=0.15 所以 S=0.85。 u=Sp2
代人公式
=0.85×0.00006
=51×10-6/代。
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(三)选择对X连锁基因的作用
一个群体中,XR基因只有在男性才受选 择的影响 女性中的杂合体以XAXa状态存在而不受选择 的影响 女性XaXa由于数量过少而可以忽略 如果致病基因频率为q,选择系数为S, 每一代中将有1/3Sq的致病基因被淘汰, u=1/3Sq
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第二节
遗传平衡定律
1908年,英国数学家Hardy和德国内科医
生Weinberg分别同时提出——遗传平衡定律。 ※ 内容: 在一定条件下,群体的基因频率和基因型频 率在一代一代繁殖传代中保持不变。
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※ 条件:
在一定的条件下
①群体很大
②随机交配
③没有自然选择
④没有突变发生
⑤没有个体的大规模迁移
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同样可以证明: p2=p0,q2=q0;……,pn=p0,qn=q0 也就是:一代一代下去,基因频率不变。
无论0时代的基因型频率如何,其基因频率总 是p0和q0,在随机交配下,一世代的基因型频 率就是p02,2p0q0和q02,基因频率仍为p0和q0。 因而二世代的基因型频率就是p02,2p0q0和q02。 由于p0= p1=p2…= pn,q0= q1 = q2…=qn,所 以每个世代的基因型频率都是p02,2p0q0和q02, 始终保持不变。
例如,在某一随机交配的大兔群中,全 色兔占75%,“八黑”兔占9%,白化兔 占16%。则三种基因频率分别为: p=1-(H+A)1/2=1-(0.09+0.16)1/2 =1-0.5=0.5 r=A1/2=0.161/2=0.4 q=1-p-r=1-0.5-0.4=0.1
2、人的ABO血型决定于三个等位基因。其中IA对 i显性,IB对i也是显性,而IA与IB之间共显性。 基因型IAIA和IAi表现为A型,IBIB和IBi表现为B型, IAIB表现为AB型,ii表现为O型。 设IA的频率为p,IB的频率为q,i的频率为r,A型 人的比率为A,O型人的比率为O。 O=r2 r=O1/2 A+O= p2+2pr+r2=(p+r)2=(1-q)2 ∴ 1-q=(A+O)1/2 q=1-(A+O)1/2 p=1-q-r
A基因的频率:
即:(A)=[AA]+1/2[Aa]
a基因的频率:
即:(a)=[aa]+1/2[Aa]
( )表示基因频率,[ ]表示基因型频率。
对于伴性基因,可以把雌雄看作两个群 体,雄异型生物(XX♀,XY或XO♂)的 雌性群体中,基因频率与基因型频率的 关系与上面一般基因一样;在雄性群体 中,基因型只有两种(AO和aO),所以 基因频率等于基因型频率。 雌异型生物(如家禽)的情况正相反。
p0 A p02 AA p0q0 Aa q0 a p0q0 Aa q02 aa
p0 A q0 a
由表可见,一世代的基因型频率:
D1= p02,H1= 2p0q0,R1= q02。
由此计算一世代的基因频率: p1=D1+1/2H1=p02+p0q0=p0(p0+q0)= p0, q1=R1+1/2H1=q02+p0q0=q0(p0+q0)= q0
又叫哈代—温伯格定律(Hardy-Weinberg Law), 也叫基因平衡定律。 1、在随机交配的大群体中,若没有其他因素的 影响,基因频率一代一代下去始终保持不变。 2、任何一个大群体,无论其基因频率如何,只 要经过一代随机交配,一对常染色体基因的基因 型频率就达到平衡状态,没有其他因素的影响, 以后一代一代随机交配下去,这种平衡状态保持 不变。 3、在平衡状态下,基因频率与基因型频率的关 系是:D=p2,H=2pq,R=q2。
性质2:杂合子频率是两个纯合子频率乘积 平方根的2倍。
因此,如果H=2(DR)1/2,则为平衡群体。
(六)定律的意义
1、正因为具有这样的规律,群体的遗传性才能保 持相对的稳定。生物的变异归根结底是基因和基 因型的差异所引起的。同一群体内个体间的变异 是由于等位基因的差异,而同物种的不同群体间 的变异是由于基因频率的差异。因此基因频率的 平衡对群体的稳定性起着保证作用。 2、即使由于各种因素(选择、杂交、人工诱变、 迁移等)改变群体的基因频率,只要这些因素不 继续作用,又可恢复平衡。 3、目前改变群体的基因频率,仍是动植物育种工 作中的主要手段之一。
举实例说明:
0世代:D0=0.6,H0=0.4,R0=0。 则:p0=D0+1/2H0=0.8;q0=R0+1/2H0=0.2 一世代: D1=p02=0.64;H1=2p0q0=0.32;R1=q02=0.04 p1=D1+1/2H1=0.8;q1=R1+1/2H1=0.2 二世代: D2=p12=0.64;H2=2p1q1=0.32;R2=q12=0.04 p2 =D2+1/2H2=0.8;q2 =R2+1/2H2=0.2
1
实际 观察人 数 理论人 数
1788
1788×0.49 72=889
1788×0.28 86 1788 =516
(五)平衡群体的性质
性质1:在二倍体遗传平衡群体中,杂合子 (Aa)的频率H=2pq的值永远不会超过0.5。 根据这个性质可知,H值可大于D或R,但不 能大于D+R;所以,只要H>1/2,就绝对不 是平衡群体。
第二节 基因频率的计算
一、不完全显性或共显性时基因频率的计算
二、完全显性时基因频率的计算
三、伴性基因频率的计算 四、复等位基因频率的计算
一、不完全显性或共显性时基因频率的计算
不完全显性或共显性时,表型与基因型一致,可 以直接由表型识别基因型,统计表型的比率就得 到基因型的频率,即可计算基因频率。 例如安达鲁西鸡,有三种羽色:黑色、蓝色和白 色,且已知该性状是由一对基因控制的,黑色的 基因型为BB,蓝色的基因型为Bb,白色的基因型 为bb。譬如调查大群安达鲁西鸡,黑色鸡占49%, 蓝色鸡占42%,白色鸡占9%。 所以,BB的基因型频率为0.49,Bb的基因型频率 为0.42,bb的基因型频率为0.09。 同时还可计算出,B的基因频率 =0.49+0.42/2=0.7,b的基因频率 =0.42/2+0.09=0.3。
血型 基因型 观察频 率 基因型 理论频 率
M 0.2220 P2 =0.46282 =0.2142 397 1788× 0.2142 =383
MN 0.4816
N 0.2964
总计 1
2pq =2×0.4628 q2=0.53722 =0.2886 ×0.5372 =0.4972 861 530
(二)基因频率与基因型频率
1、基因频率 基因频率:一个群体中某一基因对其等位基 因的相对比率。任何一个位点上全部等位基 因频率之和等于1或100%。 例如,牛角有无由一对等位基因控制,无角 由显性基因P控制,有角由隐性基因p控制, 如果二者的比例为90:10,则基因P的频率为 90%,p的频率为10%。 如果在100个个体中,PP个体为30个,Pp个体 为50个,pp个体为20个,则P的基因频率是: (30×2+50)/ 200 = 55%
(三)数学证明
设一个群体中,0世代基因A与a的频率 分别为p0和q0,三个基因型AA、Aa、aa 的频率分别为D0,H0,R0,且p0+q0=1。 1世代基因频率为p1和q1,基因型频率为 D1,H1,R1。 2世代基因频率为p2和q2,基因型频率为 D2,H2,R2。
0世代的个体所产生的配子,带有A基因 与a基因的概率分别为p0和q0。若进行随 机交配,各雌雄配子随机结合,一世代 个体的各基因型频率为:
3、二者的性质
①同一位点的各基因频率之和等于1; ②群体中同一性状的各种基因型频率之 和等于1; ③基因频率的范围为: 0≤p≤1; 0≤q≤1 ④基因型频率的范围为: 0≤D≤1; 0≤H≤1; 0≤R≤1
4、二者的关系
例如,设A与a是一对等位基因,其频率 分别为p和q。这一对基因可组成三种基 因型,即AA、Aa、aa,它们的频率分别 为 D、H、R。那么,在群体中有D个AA 基因型,每个基因型有两个A基因,因 此有2D个A基因;有H个Aa基因型,就有 H个A基因和H个a基因;有R个aa基因型, 就有2R个a基因。所以在群体中有A基因 2D+H,有a基因2R+H。
C C Ch c CC p2
Ch C Ch Ch Ch Chc pq q2 qr Cc Ch c cc
c pr qr r2
C Ch pq Cc pr
各种基因型频率: CC=p2 ;CCh =2pq ;Cc=2pr ; ChCh = q2 ;Chc= 2qr ; cc=r2
由此可见: H=q2+2qr ,A=r2 H+A= q2+2qr+r2=(q+r)2=(1-p)2 ∴ 1-p=(H+A)1/2 p=1-(H+A)1/2 A=r2 r=A1/2 q=1-p-r
2、基因型频率
基因型频率:一个群体中某一性状的各种基 因型之间的比率。 例如上述牛群中,角的有无这一性状,有三 种基因型PP、Pp、pp,PP为0.81,Pp为0.18, pp为0.01,三者之和为1。基因型不等于表型, 基因型频率并不是表型频率。表型有角与无 角二者的比率为0.01和0.99(0.18+0.81)。 如果在100个个体中,PP个体为30个,Pp个体 为50个,pp个体为20个,请问每种基因型频 率是多少?PP为0.30,Pp为0.50,pp为0.20。
由上可见,基因型频率,虽然D1≠D0, H1≠ H0,R1≠ R0,但经过一代随机交 配,D1= D2……=Dn= p2,H1=H2……=Hn= 2pq,R1=R2……=Rn=q2。至于基因频率, 则自始至终一直保持不变。
(四)生物学证明
例:人的MN血型是由一对常染色体基因控制的。 这一性状构成的群体满足基因平衡定律所要求的 群体条件。1977年某中心血站曾对居民中的788人 进行了MN血型调查。M、MN、N型血液的人频率依 次为0.2220、0.4816、0.2964,总和为1。以此数 据可计算LM、LN基因频率p和q。 p=D+H/2=0.2220+0.4816/2=0.4628 q=R+H/2=0.2964+0.4816/2=0.5372 进而求出M、MN、N血型的理论频率和理论人数, 并与这三种血型的实际人数和频率比较,看看该 群体是否是一个平衡群体。