实验室分子生物学实验基本操作规范及注意事项

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实验室分子生物学实验基本操作规范及注意事项

实验室分子生物学实验基本操作规范及注意事项

一、酶与载体的分装

酶类与载体:T载体(50 ng/μl)用灭菌水稀释4倍(12.5 ng/μl)后分装成10 μl或20 μl;

连接酶(solutionΙ)按5 μl分装;

dNTP(10 mM)分装成50 μl;

无菌水分装成1 ml;

注意:(1)所有分装都必须用已灭菌的管。

(2)所有工具酶和载体的使用过程均在冰浴中进行。

(3)工具酶、载体以及试剂盒等实验室共用物品,用完后必须及时放回原处,以免耽误她人使用。

(4)当你发现你使用的是最后一管(盒)公用物品时,请马上告知负责人购买,以免耽误使用。

(5)感受态,氨苄青霉素和IPTG由研究生轮流负责制备。每人负责六个月。其它试剂则由第一位使用新包装的同学分装。由于分子实验工具酶比较容易失活,必须在冰上进行分装。

二、常见抗生素及IPTG的配置

以氨苄青霉素为例:

1.准备足够量的1.5 ml的EP管、两个100 ml的离心管、0.22 μm水系滤器、注射器、蒸馏水,以上用品均要进行高压灭

菌。

2. 洁净工作台紫外灭菌,然后进行以下操作。

3.称取2 g的氨苄青霉素粉末于离心管中,加入灭菌水至总体积为20 ml,轻摇离心管,至氨苄青霉素粉末完全溶解,以免过滤时堵塞滤膜。

4.用注射器吸取配制好的溶液,然后把滤器安在注射器上,缓缓推动注射器活塞,把溶液经滤膜推至100 ml的离心管中。

注意:动作要缓和,使滤出液出口正对着离心管,还要防止染菌。

5.把100 ml离心管中已除菌的氨苄青霉素溶液分装到1.5 ml的EP管中,每管0.5 ml。在EP管上做好标记,包括名称、浓度、日期等。

6.把做好标记的盛有氨苄青霉素的EP管于-20℃保存。

注意:当你发现你使用的是最后一管抗生素时,请马上告知有关人员及时配制,以免耽误使用。

表1.常见抗生素的储存浓度及工作浓度

名称储存浓度工作浓度

氨苄青霉素(ampicillin)100 mg/ml 50 μg/ml~100 μg/ml

卡那霉素(kanamycin)10 mg/ml 10 μg/ml~50 μg/ml

氯霉素(chloramphenicol)25 mg/ml 12.5 μg/ml~25 μg/ml

链霉素(streptomycin)50 mg/ml 10 μg/ml~50 μg/ml

四环素(tetracyyline)10 mg/ml10 μg/ml~50 μg/ml

IPTG 1 M 0.05-0.6 mM

三、分子生物学实验中各种试剂与溶液的配制

分子生物学实验中各种试剂与溶液的配制参见《分子克隆》。

四、总DNA的提取

具体步骤参考试剂盒说明书。注意:革兰氏阳性菌DNA提取时需要加溶菌酶。

五、基因扩增

1.引物与合成:设计引物序列,发至生工公司进行合成()。

2.引物配制:合成后的引物先离心至管底,然后按说明书用无菌水稀释至10-50μM,分装至无菌EP管中,做好标记(一定要标记浓度!)后,于-20度保存备用。

3. PCR反应体系配制:将所需各组分在冰浴中化开后,进行PCR反应体系配制。反应体系及反应参数按不同聚合酶的说明书进行,以transgen 的easyTaq酶扩增1kb基因序列为例,100 μl反应体系为:10×buffer 10 µl,dNTP (10 mM) 2 µl,引物各 2 µl(10-50μM),模板 1 µl(根据浓度加减体积),Taq酶 1 µl,ddH2O 82 µl(注意:加入顺序为:水,buffer,dNTP,引物,模板,酶)。涡旋混匀,分装至四-五管,瞬时离心。

注意:若反应时间较长在反应混合液的上层加10-20 µl 的矿物油防止样品在PCR的过程中蒸发。

4.将管放入PCR仪中,在PCR仪上设置好PCR反应参数,例如:94 ℃ 5 min,94 ℃ 40 sec,Tm 55℃ 1 min, 72 ℃

2 min,72 ℃ 10 min,16 ℃ 1 h,一般设30个循环。待温

度降至16 ℃后停止PCR仪,尽快取出样品,不允许过夜。

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