TrendsinCellBiology驱动突变或有稳态作用?

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非小细胞肺癌常见的驱动基因突变类型

非小细胞肺癌常见的驱动基因突变类型

非小细胞肺癌常见的驱动基因突变类型非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)是目前肺癌的主要类型,约占所有肺癌的85%。

驱动基因突变是NSCLC发生和发展的重要原因之一。

本文将介绍非小细胞肺癌中常见的几种驱动基因突变类型。

1. EGFR突变表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)是一种经常发生突变的驱动基因。

EGFR突变包括点突变和插入/缺失突变,常见的突变位点有Exon 19和Exon 21。

EGFR突变可以导致受体激活异常,进而促进细胞增殖和进化,是NSCLC中最为常见的驱动基因突变。

EGFR突变与亚型NSCLC的发生有关,对EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)有较好的治疗反应。

2. ALK融合基因ALK基因重排是NSCLC中另一种常见的驱动基因突变。

ALK基因重排导致ALK蛋白与其他蛋白(如EML4)融合,形成具有激酶活性的融合蛋白。

这种融合蛋白能够激活多个信号通路,促进肿瘤细胞的增殖和生存。

ALK融合基因在NSCLC中的检出率约为5%,主要见于非吸烟者和年轻患者。

对于ALK阳性的NSCLC患者,ALK 抑制剂是一种有效的治疗选择。

3. ROS1融合基因ROS1基因融合是NSCLC中另一种重要的驱动基因突变。

ROS1融合基因的患者通常是非吸烟者和年轻人。

ROS1融合基因可以激活多个信号通路,促进肿瘤细胞的增殖和生存。

ROS1融合基因在NSCLC中的检出率约为1-2%。

针对ROS1阳性的NSCLC患者,ROS1抑制剂是一种有效的治疗选择。

4. BRAF突变BRAF基因突变是NSCLC中较为罕见但具有重要意义的驱动基因突变。

BRAF突变通常见于不吸烟的患者,尤其是女性。

BRAF突变可以导致信号通路的异常激活,进而促进肿瘤细胞的增殖和生存。

BRAF突变在NSCLC中的检出率约为1-4%。

对于BRAF阳性的NSCLC患者,BRAF抑制剂是一种有效的治疗选择。

深度突变扫描技术:原理、优点、应用和展望

深度突变扫描技术:原理、优点、应用和展望

深度突变扫描技术:原理、优点、应用和展望深度突变扫描技术(deep mutational scanning, DMS)是一种用于研究蛋白质序列和功能之间关系的技术。

它可以在一个实验中同时检测成千上万种突变对蛋白质功能的影响,从而提高效率和覆盖度。

它还可以揭示突变之间的上位效应(epistasis),即两个或多个突变的组合效应不同于各自效应的总和,从而反映出蛋白质结构和功能的复杂性。

它还可以为蛋白质工程和设计提供有价值的信息,帮助寻找改善蛋白质性能的优化突变或组合。

本文将介绍深度突变扫描技术的原理、优点、应用和展望。

原理深度突变扫描技术的基本原理是:•首先,利用合成生物学或定向进化的方法,构建一个包含大量突变的蛋白质文库。

这些突变可以是单点突变、组合突变或随机突变,覆盖蛋白质的特定区域或整个序列。

•然后,利用高通量筛选的方法,对文库中的每个突变体进行功能评价。

这些筛选方法可以是基于荧光、结合亲和力、催化活性、稳定性等不同的功能指标。

•最后,利用高通量测序的方法,对文库中的每个突变体进行序列鉴定。

这样,就可以得到每个突变体的序列和功能数据,并分析它们之间的相关性。

图1展示了一个深度突变扫描技术的示意图。

优点深度突变扫描技术的优点是:•它可以在一个实验中同时检测成千上万种突变对蛋白质功能的影响,从而提高效率和覆盖度。

这样,就可以得到一个全面和系统的蛋白质序列-功能图谱(sequence-function landscape),反映出每个氨基酸残基对蛋白质功能的重要性和敏感性。

•它可以揭示突变之间的上位效应(epistasis),即两个或多个突变的组合效应不同于各自效应的总和,从而反映出蛋白质结构和功能的复杂性。

这样,就可以了解不同氨基酸残基之间是如何相互作用和协调的,以及如何影响蛋白质的稳定性、折叠、构象、活性等。

•它可以为蛋白质工程和设计提供有价值的信息,帮助寻找改善蛋白质性能的优化突变或组合。

这样,就可以根据目标功能指标,选择最适合的突变体或设计新型或改良型的蛋白质。

新发现!Science揭示靶向疗法导致癌细胞耐药性产生的根本原因!

新发现!Science揭示靶向疗法导致癌细胞耐药性产生的根本原因!

新发现!Science揭示靶向疗法导致癌细胞耐药性产生的根本原因!基因突变是癌症发生与发展的重要驱动力,肿瘤内部遗传异质性的产生使得癌细胞能够更好地适应环境中的选择压力。

通过对遗传位点进行分析,我们已经找到了对细胞癌化以及癌症进展来讲十分重要的突变类型以及相应蛋白产物的活性瞬时变化特征1。

然而,目前我们并不清楚导致基因组稳定性下降的分子机制。

今天发表在Science杂志上的一项研究揭示了靶向表皮生长因子受体(EGFR)或BRAF 信号的药物会导致结直肠癌(CRC)细胞的基因组稳定性下降以及遗传异质性的升高,从而推动了癌细胞耐药性的产生。

图片来源:Science研究背景早在1943 年,Luria 和Delbrück 等人发现:细菌对噬菌体产生抵抗力是由于自发的随机突变造成的2。

因此,人们理所当然的认为癌细胞对药物产生的耐受性也是由药物治疗之前已经存在的「自发突变」所导致的。

基于这一观点,药物治疗后癌症的复发是由于在药物治疗之前该肿瘤组织中已经存在具有耐药性的「亚克隆」。

而癌症复发的时间仅仅决定于最初的耐药性亚克隆数量以及其扩增的速度。

然而,微生物领域的研究表明:在有选择压力的情况下,细菌与真菌也会因基因组不稳定而产生新的突变,这一现象被称为「压力诱变」。

压力诱变在正常情况下对个体往往有害,但在外界压力存在时则有利于微生物的存活。

例如,通过降低生长速率,细菌能够在含有抗生素的环境中持久地生存。

DNA 错配修复效率的下降以及易错 DNA 聚合酶活性的上升均帮助微生物提高了突变的几率。

从群体角度来看,突变率的上升会提高细菌的遗传多样性,从而能够帮助它们适应复杂的生存条件,而在细菌已经完全适应之后,又会有相应的反向调控机制激活,以防止有害突变的积累3。

基于对微生物的「生存策略」的进一步了解,我们不禁怀疑:是否癌细胞也有相似的「定向进化特征」呢?此前研究表明,当使用靶向药物杀伤肿瘤细胞时,通常会观察到耐药性亚群的出现,随着药物治疗的持续,这部分携带耐药性突变的肿瘤细胞亚群最终占据主导地位并使得药物不再有效。

2022-2023学年福建省部分地市高三(第1次)质量检测生物试卷+答案解析(附后)

2022-2023学年福建省部分地市高三(第1次)质量检测生物试卷+答案解析(附后)

2022-2023学年福建省部分地市高三(第1次)质量检测生物试卷1. 下列关于蓝细菌和酵母菌的比较,错误的是()A. 细胞结构:二者均具有B. 遗传物质的复制:二者均可进行C. 核膜:蓝细菌不具有,酵母菌具有D. 有氧呼吸:蓝细菌不能进行,酵母菌可进行2. 下列实验中,对其实验思路和结论的分析错误的是()选项实验思路结论A 在3个培养瓶中分别培养大草履虫、双小核草履虫及混合培养,观察它们种群数量的变化通过单独培养和共同培养,探讨生物因素对种群数量的影响竞争中不占优势的生物被淘汰,竞争中占据优势的生物种群数量持续增长B 向植物分别提供H218 O和C18O2,检测光合产物氧气中18O2的比例用同位素示踪的方式探寻氧气中O元素的来源光合作用产物氧气中的O元素来自于水C 分别用DNA酶、蛋白酶、RNA酶、酯酶处理S型肺炎链球菌提取物,与R型菌混合,观察菌落特征对细胞提取物分别进行不同的处理,探究哪种物质是“转化因子”促使R型活细菌转化为S型活细菌的“转化因子”很可能是DNAD 将接触或未接触过胚芽鞘尖端的琼脂块,置于去除尖端的胚芽鞘一侧,观察其生长情况通过琼脂块收集尖端产生的物质,探究引起胚芽鞘向光弯曲的信息本质引起胚芽鞘向光弯曲生长的是某种化学物质A. AB. BC. CD. D3. 下列关于健康人体内环境稳态的叙述,正确的是()A. 组织液不断生成与回流并保持动态平衡B. 寒冷环境下作用于骨骼肌的神经递质减少C. 肾上腺素的分泌受下丘脑-垂体-肾上腺皮质轴的调控D. 蛋白质是形成人体细胞外液渗透压的主要物质4. 下列关于人体内遗传信息流动的叙述,正确的是()A. 青少年体内大多数细胞会发生DNA→DNA的遗传信息流动B. 人的成熟红细胞中会发生DNA→RNA的遗传信息流动C. 人体肌肉细胞中不存在RNA→蛋白质的遗传信息流动D. 艾滋病人的T细胞内可能会发生RNA→DNA的遗传信息流动5. 东北鼢鼠会在其生活的洞穴中挖掘土壤并推至地表,形成土丘,造成草地退化。

肿瘤的生物学基础特征-下一代(林博翻译)

肿瘤的生物学基础特征-下一代(林博翻译)

肿瘤的生物学特征-下一代作者及通讯地址:Douglas Hanahan1,2,* and Robert A. Weinberg3,*1The Swiss Institute for Experimental Cancer Research (ISREC), School of Life Sciences, EPFL, Lausanne CH-1015, Switzerland2The Department of Biochemistry & Biophysics, UCSF, San Francisco, CA 94158, USA3Whitehead Institute for Biomedical Research, Ludwig/MIT Center for Molecular Oncology, and MIT Department of Biology, Cambridge,MA 02142, USA*Correspondence: dh@epfl.ch (D.H.), weinberg@ (R.A.W.)DOI 10.1016/j.cell.2011.02.013另:Weinberg因对致癌基因ras的研究荣获过诺贝尔医学奖西安万隆制药市场部林博译另:请大家将来在PPT中或产品资料汇编中使用该文章时,顺便把译者名字标上肿瘤的六大生物学特征是人体肿瘤在一步步发展的过程中获得的。

这些基础特征构成了我们系统性理解肿瘤--这种复杂的新生冗余物的基础逻辑框架。

这些基础特征包括:持续不断的增殖信号;躲避生长抑制;抵抗细胞死亡;永不停止的复制能力;引发血管新生的能力;侵袭与转移的能力。

跟这些特征密切相关的还有基因组的不稳定,基因组的不稳定导致了基因的多样性从而加速了这六大特征的获得。

炎症也对其中的多个特征的产生有促进作用。

上个十年新的概念性进展包含很有潜力的新兴两大特征:异常途径的能量代谢和避免免疫摧毁。

华医网继续教育答案-肺癌精准治疗与转化研究新进展

华医网继续教育答案-肺癌精准治疗与转化研究新进展

肺癌精准治疗与转化研究新进展题库答案华医网继续教育答案目录一、早期肺癌的精细化诊疗和转化研究 (1)二、临床视角:IB期EGFR突变NSCLC的辅助治疗 (3)三、晚期NSCLC一线EGFR-TKI耐药后的治疗策略 (5)四、少见突变NSCLC治疗进展及思考 (7)五、抗体偶联药物在NSCLC中的运用 (9)六、肺癌局部介入消融治疗的应用——着眼局部,控制大局 (10)七、类器官在肺癌领域的研究和应用 (12)八、肺癌分子病理检测的指南与实践 (14)九、肺癌脑转移的研究现状 (16)十、从统计学角度解读肺癌临床研究设计 (18)十一、恶性胸膜间皮瘤治疗新进展 (20)十二、免疫时代的外科临床思考 (21)十三、免疫联合治疗的临床和转化研究 (23)十四、免疫治疗耐药机制和应对策略 (25)十五、免疫治疗生物标志物的探索 (27)十六、irAE全程动态管理——从“抓重放轻”到“端口前移” (28)一、早期肺癌的精细化诊疗和转化研究1.目前肺癌筛查的标准工具是?A.LDCTB.X rayC.CEA、cyfra21-1D.纤支镜E.PET-CT参考答案:A2.ctDNA甲基化相比突变的最大优势是?A.稳定B.数量大C.易分析D.分子小E.长度短参考答案:B3.EGFR突变的术后辅助治疗首选?A.化疗B.放疗C.靶向治疗D.免疫治疗E.细胞治疗参考答案:C4.肺结节中恶性比例为?A.0.3B.0.2C.0.1D.0.05E.<5%参考答案:E5.肺癌辅助化疗提高多少5年生存率?A.0.05B.0.1C.0.15D.0.2E.0.25二、临床视角:IB期EGFR突变NSCLC的辅助治疗1.以下哪类患者可能不能从术后辅助化疗中获益A.肿瘤直径<4cmB.IB期有高危因素的C.肿瘤直径≥4cmD.II期E.III期参考答案:A2.根据NCCN指南(2022年第5版),以下高危因素描述不正确的是A.低分化肿瘤(肺神经内分泌肿瘤[包括高分化神经内分泌肿瘤])B.楔形切除C.脏层胸膜浸润D.肿瘤>4cmE.淋巴结状态未知(Nx)参考答案:A3.JACC第八版分期Ib期(T2aN0M0)患者的生存率约为A.77%B.68%C.53%-65%D.60%E.36%参考答案:B4.基于EVIDENCE研究,埃克替尼在国内获批适应症A.单药适用于IB-IIIA期EGFR突变NSCLC术后辅助治疗B.用于ⅠB-ⅢA期存在EGFR外显子19缺失或外显子21(L858R)突变的NSCLC术后辅助治疗C.单药可试用于治疗既往接受过至少一个化疗方案失败后的局部晚期或转移性NSCLCD.用于ⅠI-ⅢA期存在EGFR外显子19缺失或外显子21(L858R)突变的NSCLC术后辅助治疗E.单药适用于II-IIIA期EGFR突变NSCLC术后辅助治疗参考答案:E5.关于I期NSCLC患者生存的影响因素,以下说法不正确的是A.与楔形切除术相比,肺叶切除术和肺段切除术在总生存率方面具有显著优势B.肺叶切除术和肺段切除术的3年或5年生存率存在显著差异C.肺叶切除术比亚肺叶切除患者有更好的生存D.对IB期患者肺叶切除后辅助化疗是更有效的治疗模式E.手术切除方式是影响I期NSCLC患者生存的最主要因素参考答案:B三、晚期NSCLC一线EGFR-TKI耐药后的治疗策略1.对于EGFRmNSCLC患者使用奥希替尼治疗后出现T790M和C797S突变且为反式模式,可以使用下列那种组合药物治疗?A.吉非替尼+埃克替尼B.吉非替尼+阿法替尼C.埃克替尼+达克替尼D.吉非替尼+奥希替尼E.阿美替尼+奥希替尼参考答案:D2.下列哪两个基因突变可能会导致非小细胞肺癌向小细胞肺癌的转化?A.RB1和TP53B.RB1和C797SC.RB1和METD.RB1和RETE.RET和TP53参考答案:A3.对于没有敏感突变基因突变的EGFR-TKI耐药患者来说,选择哪种治疗方式可能会获得较好疗效?A.铂类为基础的两药化疗B.抗血管治疗C.免疫治疗D.抗血管联合免疫E.免疫+化疗+抗血管参考答案:E4.对于EGFRmNSCLC患者使用奥希替尼治疗后出现T790M和C797S突变且为顺式模式,可以使用下列那种药物治疗?A.BrigatinibB.阿法替尼C.阿美替尼D.奥希替尼E.吉非替尼参考答案:A5.目前市面可及的三代EGFR-TKI药物OS最长超过多长时间?A.2年B.3年C.2.5年D.4年E.5年参考答案:B四、少见突变NSCLC治疗进展及思考1.治疗少见突变晚期NSCLC的抗肿瘤药物不包括以下哪种IB.双特异性抗体C.内分泌治疗药物D.ADCE.免疫检查点抑制剂参考答案:C2.肺癌中驱动基因发生率最高的病理类型是A.鳞癌B.腺癌C.小细胞肺癌D.神经内分泌癌参考答案:B3.以下叙述错误的是A.少见突变NSCLC围手术期靶向治疗的地位已确立B.不同TKI药物的耐药机制存在差异C.一种靶向药物可能可同时抑制不同的少见突变基因变异D.同一种驱动基因变异可在不同病理类型的实体瘤中发生E.以靶向少见突变的特异性抑制剂为主的联合治疗或可延缓耐药发生参考答案:A4.以下描述错误的是A.液体活检相比于组织活检,具有克服肿瘤组织的异质性、样本可及性高、样本类型多、微创等优点,所以液体活检优于组织活检。

生态系统的多稳态与突变

生态系统的多稳态与突变

生态系统的多稳态与突变
生态系统的多稳态和突变是生态学中重要的概念,描述了生态系统在面对外界压力和变化时的响应和行为。

多稳态(Multistability)是指生态系统具有多个稳定状态的能力。

生态系统中的稳定状态可以是指生物群落的组成和结构、物种多样性、能量流动和物质循环等方面的稳定性。

当生态系统处于不同的环境条件下,它可以呈现出不同的稳定状态,而这些稳定状态之间可以在一定条件下相互转变。

例如,湿地生态系统可能具有水生植物优势和湿地草甸优势两种稳定状态,它们的存在取决于水位、养分和气候等环境因素。

突变(Regime Shift)是指生态系统由一个稳定状态突然转变到另一个稳定状态的现象。

这种转变可能是突然和剧烈的,对生态系统的结构和功能产生重大影响。

突变通常是由外部压力、环境变化或内部相互作用的累积效应引起的。

突变可能导致生态系统的功能失调、生物多样性的丧失、生态过程的改变以及可持续性的崩溃。

经典的例子是珊瑚礁生态系统的白化现象,由于环境变化导致的压力,珊瑚的共生藻类受损或丧失,导致整个珊瑚礁生态系统的结构和功能发生突变。

多稳态和突变的概念强调了生态系统的动态性和复杂性。

生态系统并不是处于一个固定的状态,而是在不同的环境条件和相互作用下呈现出多样性的稳定状态和可能的转变。

了解多稳态和突变对于生态系统的管理和保护具有重要意义,有助于预测和应对环境变化带来的潜在影响,以促进生态系统的健康和可持续性。

细胞生物学名词解释与习题

细胞生物学名词解释与习题

细胞生物学名词解释与习题第一章绪论名词解释(补充)思考题1.根据细胞生物学研究的内容与你所掌控的生命科学科学知识,恰当地评价细胞生物学在生命科学中所处的地位以及它与其他生物学科的关系。

(x)细胞生物学是研究和揭示细胞基本生命活动规律的科学,它从显微、亚显微与分子水平上研究细胞结构与功能,细胞增殖、分化、代谢、运动、衰老、死亡,以及细胞信号转导,细胞基因表达与调控,细胞起源与进化等重大生命过程。

(p1)细胞生物学、分子生物学、神经生物学和生态学并列入生命科学的四大基础学科。

细胞生物学与其他学科之间的交叉扩散日益显著。

(辅导p3)2.如何认识细胞学说在细胞学乃至生物学发展简史中的重要意义?(辅导p3)(1)1838-1839年,德国植物学家施莱登和德国动物学家施旺明确提出细胞学说,基本内容就是:①细胞是有机体,一切动植物都是由细胞发育而来,并由细胞和细胞产物所构成。

②每个细胞作为一个相对独立的单位,既有它自己的生命,又对与其他细胞共同组成的整体的生命有所助益。

③代莱细胞可以通过已存有的细胞产卵产生。

(p5-6)(2)1858年,魏肖尔对细胞学说做了重要的补充,强调细胞只能来自细胞。

细胞学说的提出对生物科学的发展具有重大的意义。

细胞学说、进化论和孟德尔遗传学称为现代生物学的三大基石,而细胞学说又是后两者的基石。

对细胞结构与功能的了解是生物学、医学及其各个分支进一步发展所不可缺少的。

(p6)3.试简明扼要地分析细胞生物学学科构成的客观条件以及它今后发展的主要趋势。

(辅导p3-4)(1)细胞生物学学科形成的客观条件如下:①细胞的发现②细胞学说的建立(2)细胞生物学今后发展的主要趋势归纳出来存有两点:一就是基因与基因产物如何掌控细胞的关键生命活动;二就是基因产物,即为蛋白质分子与其他生物分子构筑与装配成细胞的结构,并行使细胞的有序的生命活动。

4.当前细胞生物学研究的热点课题中你最感兴趣的是哪些?为什么?(x)一.名词解释1.细胞生物学细胞生物学是研究和揭示细胞基本生命活动规律的科学,它从显微、亚显微与分子水平上研究细胞结构与功能,细胞增殖、分化、代谢、运动、衰老、死亡,以及细胞信号转导,细胞基因表达与调控,细胞起源与进化等重大生命过程。

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TrendsinCellBiology驱动突变或有稳态作用?
亮点:
癌症驱动突变,在非癌组织细胞中广泛传播,影响大多数组织细胞。

这种传播过程会随着衰老或暴露于外在伤害(例如紫外线照射、吸入烟雾和炎症信号)而加剧。

虽然正常细胞中的经典驱动突变通常被视为致癌过程的第一步,但推测在某些状态下,它们可以在面对压力和老化组织修复的同时发挥有益的稳态作用。

2021年8月6日,Lautenberg免疫学和癌症研究中心的Eli Pikarsky 教授等人在《Trends in Cell Biology》上发表了一篇“Putative homeostatic role of cancer driver mutations”的文章。

随着测序能力的提高,了解到正常体细胞从受孕到整个生命过程都会积累突变。

对细胞不利的因素会导致细胞死亡或衰老,而其他因素可能会带来优势,导致组织内的克隆扩增。

赋予细胞选择性优势的突变被认为是驱动突变。

当细胞克隆积累了许多驱动突变,使其能够影响细胞增殖速度、侵入邻近组织并扩散到其他器官的组织中时,就会出现癌症。

然而,很难估计跨越正常细胞和癌细胞之间边界所需的驱动突变数量,但已经估计了 1 到 10 个驱动突变的范围,并且其变化由癌症类型决定。

正常组织中驱动突变的发生会随着衰老和面临环境损害而加剧,有时几乎所有组织都被突变克隆取代,以牺牲非突变细胞为代价进行扩增。

正常组织中驱动突变的频繁发生(表1)对癌症诊断具有深远的影响,但它也提出了有关组织稳态的基本问题。

我们将指出正常组织中频繁发生的驱动突变,比较它们在正常组织和恶性组织中的发生,讨论可能调节携带这些突变的克隆的扩张和收缩的环境和因素,并提出正常组织中某些驱动突变的稳态作用。

绝大多数携带驱动突变的细胞不会转化为癌症。

此外,即使在器官水平上,携带突变克隆并不意味着该器官中癌症的急剧增加。

因此,虽然在大多数人中,老化的食管和子宫内膜上皮被驱动突变克隆重塑,但估计患食管癌的终生风险为0.4%至2.4%,子宫内膜癌为3%。

更令人惊讶的是,正常组织中某些驱动突变的发生率,例如正常衰老的食
道中NOTCH1突变,可能超过来自年龄匹配个体的相同组织的癌症发生率(表1),此外,与野生型NOTCH1患者相比,NOTCH1突变型黑色素瘤患者的高峰年龄延迟,表明NOTCH1突变可能对黑色素瘤有保护作用。

携带驱动突变的正常组织细胞克隆何时会向恶性肿瘤漂移?在对小鼠模型中热点Tp53突变的研究中出现了解决这个难题的重要线索。

发现其中两个突变的肿瘤水平表达,称为功能获得(GOF)致癌突变,通过下调Wnt过度激活来抑制近端小鼠肠道的肿瘤发生,从而驱动肠道肿瘤发生。

相比之下,在局部丰富的微生物代谢物的支持下,这些突变在远端肠道中的表达被证明具有高度致癌性(图1)。

基于大量DNA测序证明特定突变的共现/排他性。

然而,这主要是基于给定组织中突变等位基因频率的推断。

准确确定正常人体组织中的克隆进化只能基于单细胞数据。

迄今为止,相关组织的单细胞序列数据非常有限,需要进一步发展低错误率的测序技术,以更好地解决克隆进化和克隆与克隆之间的关系。

虽然将注意力集中在基因突变上,但进化的体细胞表观遗传排列也可以区分体细胞克隆突变之外的克隆身份,甚至独立于体细胞克隆突变,这一点是非常合理的。

这些可以产生“表观遗传克隆”,其重要性可能不亚于在正常组织稳态中高度研究的基因不同克隆。

表观遗传克隆的存在和对衰老和疾病组织动力学的影响可以使用改进的表观遗传技术,使用批量或单细胞方法来解决。

这可以为追踪多克隆进化及其对正常组织中细胞物种形成的贡献增加另一个维度。

注意到单一代谢物可以影响正常组织中驱动突变的克隆。

因此设想克隆也可以通过它们的代谢特征来区分。

此外,代谢物可以作为影响给定克隆中细胞状态的共同驱动因素决定组织的命运。

代谢特征可以通过氧张力、自由基、营养线索或来自不同来源的其他代谢物来确定。

开发空间代谢组学技术在区分组织中代谢不同的细胞克隆以及将潜在的驱动作用归因于特定代谢物方面具有重要价值。

设计模型,使我们能够以时间和空间解析的方式生成、跟踪和影响单个克隆。

新的动物模型也可能测试控制正常突变细胞克隆的扩张、
收缩或转化的外在因素,以及研究突变克隆在损伤修复和维持体内平衡方面的可能益处。

还应在新模型中研究不同克隆种群的相互依赖性。

驱动突变的人和小鼠细胞的离体3D培养模型或突变和非突变细胞的3D混合物可用于研究克隆相互依赖性和组织结构如何有利于稳态突变克隆的扩展。

识别驱动突变在衰老和疾病中起作用的环境、邻近细胞、代谢、结构等参数对于理解和预测这些突变如何决定细胞和生物体命运是必要的,并且可以指示降低恶性转化风险的措施。

教授介绍
Eli Pikarsky 教授首席研究员
临床试验显示出免疫治疗对癌症患者有显着益处。

炎症和癌症之间的联系现已确定,但潜在的分子机制尚未解决。

随着肿瘤的进展,将炎性细胞调节为致瘤性免疫抑制表型。

已经证明炎症细胞通过雕刻实质上皮细胞来进行交互。

正在研究这些相互作用,并假设它们是炎症和癌症之间联系的核心。

肝癌是全球癌症相关死亡的第三大常见原因,其长达30年的急剧上升使肝癌成为美国癌症死亡人数增长最快的原因。

肝癌是炎症诱发癌症的原型。

我们采用几种策略来分析肝脏肿瘤出现前后炎症细胞中发生的变化,这是基于初步发现表明炎症细胞的变化先于肿瘤发生。

我们正在全面绘制炎症诱导的肝细胞癌(HCC)(最常见的原发性肝癌形式)小鼠模型中不断变化的炎症微环境。

最近表征一种新形式的炎症,其特征在于存在免疫细胞的局灶性集合(也称为异位淋巴样结构)。

令人惊讶的是,这种形式的炎症通过劫持淋巴细胞分泌的分子促进癌症生长,淋巴细胞通常与抗肿瘤反应有关。

我们正在测试新的和令人兴奋的免疫检查点药物如何与这些病灶相互作用。

这可能会影响癌症的免疫治疗,其中淋巴细胞通常被认为是抗癌反应的积极介质。

参考文献
1、AvanthikaVenkatachalam, Eli Pikarsky, Yinon Ben-Neriah. Putative homeostatic role ofcancer driver mutations.(2021)。

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