青杄PwUSP2基因的克隆和表达分析
柑橘绿霉病菌中多聚半乳糖醛酸酶基因(PdPG2)的表达分析
柑橘绿霉病菌中多聚半乳糖醛酸酶基因(PdPG2)的表达分析由书妍;于瑞君;刘红霞;李红叶【摘要】柑橘绿霉病菌Penicillium digitatum是储藏期柑橘腐烂病最主要的病原之一,严重影响柑橘产业的发展.已有研究表明,柑橘绿霉病菌中多聚半乳糖醛酸酶(PdPG2)对其致病性有重要作用,PdPG2基因功能缺失突变株的致病性会下降,然而有关PdPG2基因的表达研究尚不完善.本文研究了PdPG2基因在不同条件下的表达情况,结果表明PdPG2是酸性表达基因,其表达量随着pH的升高而降低,pH为3.0时其表达量为对照条件下的10倍,pH为8.0时其表达量为对照条件下的0.36倍.柑橘果胶能够诱导PdPG2的表达,其表达量为对照的3.6倍.因此,在侵染过程中PdPG2表达的升高是由于发病部位酸化以及橘皮降解物诱导共同引起的.%Penicillium digitatum is the most important pathogen causing green mold disease of postharvest citrus.Previous studies indicated that PdPG2 played an important role in pathogenicity,and disruption of PdPG2 resulted in attenuated virulence of P.digitatum.However,the expression profiles of PdPG2 were not well characterized.In this study,we investigated the expression profiles of PdPG2.The results indicated that PdPG2 was up-regulated under acidic conditions.The expression level of PdPG2 was approximately 10 fold at pH 3.0 and 0.36 fold at pH 8.0 compared with that in the control.Pectin could induce the expression of PdPG2 and the expression level was about 3.6 fold of that in the control.These results indicated that acidic condition and pectin could induce PdPG2 expression.The decreased pH of citrus rind during infection was suitable for PdPG2 expression,and pectin might be also helpful during infection.【期刊名称】《植物保护》【年(卷),期】2017(043)002【总页数】4页(P138-140,162)【关键词】柑橘绿霉病菌;多聚半乳糖醛酸酶;基因表达【作者】由书妍;于瑞君;刘红霞;李红叶【作者单位】大连市农业科学研究院,大连116036;大连市农业科学研究院,大连116036;大连市农业科学研究院,大连116036;浙江大学农业与生物技术学院,杭州310058【正文语种】中文【中图分类】S432.1柑橘绿霉病菌引起的柑橘腐烂病是贮藏期柑橘的主要病害之一,其造成的损失通常占所有损失的90%以上,严重影响了我国柑橘的经济效益[1-2]。
（医学专业论文）人ALEX2基因的克隆、表达与纯化及生物信息学分析
蓬麓；毖簿鹱秉承学校严谨的学风与１Ｊｃ良的科学道德，本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究Ｔ作及取得的研究成果。
尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，不包含本人或他八已申请学位或其他用途使用过的成果。
与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中１乍了明确的说明并表示了致谢。
申请学位论文与资料若有不实之处，本人承翅一切相关责任。
论文作者签名日期：————缫护链识产衩葶隳本人完全了解第四军医大学有关保护知识产权的规定，即：研究生在较攻读学位期间论文工作的知识产权单位属第四军医大学。
本人保证毕业离校后，发表论文或使用论文工作成果时署名单位仍然为第四军医大学。
学校可以公布论文的全部或部分内容（含电子版，保密内容除外），可以采用影印，缩印或其他复制手段保存论文。
学较有权允许论文被查阅和借闻，并在校园网上提供论文内容的浏览和下载服务。
论文作者签名导师鞯坪蛔吼一一第四军医大学硕士学位论文缩略语ＡｍｐＢＬＡＳＴｂｐＢＳＡｃＤＮＡＤＡＢＤＥＰＣｄＮＴＰＤＴＴＥＢＥ．ｃｏｌｉＥＤＴＡＩＰＴＧＫｂＯＤＯＲＦＰＡＧＥ缩略语表英文全称ａｍｐｉｃｉｌｌｉｎｂａｓｉｃｌｏｃａｌａｌｉｇｎｍｅｎｔｓｅａｒｃｈｔｏｏｌｂａｓｅｐａｉｒｂｏｖｉＲｅｓｅｒｕｍａｌｂｕｍｉｎｃｏＩｌｌｐｌｅｍｅｎｔａｒｙｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｉｃＤＮＡａｃｉｄ３－３’ｄｉａｍｉｎｏｂｅｎｚｉｄｉｎｅｄｉｅｔｈｙｐｙｒｏｃａｒｂｏｎａｔｅＤｅｏｘｙｒｉｂｏｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｔｒｉｓｐｈｏｓｐｈａｔｅｓＤｉｔｈｉｏｔｈｒｅｉｔｏｌｅｔｈｉｄｕｍｂｒｏｍｉｄｅＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａｃｏｌｉｅｔｈｙｌｅｎｅｄｉａｍｉｎｅｔｅｔｒａａｃｅ－ｔｉＣａｃｊｄｇｌｕｔａｔｈｉｏｎｅＳ－ｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅｉｓｏｐｒｏｐｙｌｔｈｉｏ—Ｂ—Ｂ—ｇａｌａｃｔｏｓｉｄｅｋｉｌｏｂａｓｅｏｐｔｉｃａｌｄｅｎｓｉｔｙＯｐｅｎｒｅａｄｉｎｇｆｒａｍｅｐｏｌａｃｒｙｌａｍｉｎｅｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉＳｌ中文全称氨苄青霉素基本局部相似性查询软件碱基对牛血清白蛋白互补ＤＮＡ３—３’二氨基联苯胺焦碳酸二乙酯脱氧核糖核苷三磷酸二硫苏糖醇溴化乙锭大肠杆菌乙二胺四乙酸谷胱甘肽Ｓ一转移酶异丙基硫代一Ｂ—Ｄ一半乳糖苷千碱基对光密度值开放读码框聚丙烯酰胺凝胶电泳damdoc为您倾心整理(小店)(QQ@2218108823)第霾攀蔽大学矮圭学位论文ＰＢＳＲＴ—ＰＣＲＳＤＳＴｒｉＳＰｈｏｓｐｈａｔｅ—ｂｕｆｆｅｒｅｄｓａｌｉｎｅ磷酸盐缓冲液ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ反转录聚合酶链斌ｒｅｖｅｒｓｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ反旋ｓｏｄｉｕｍｄｏｄｅｃｙｌｓｕｌｆａｔｅ十二烷基硫酸钠Ｔｒｉｈｙｄｒｏｘｙｍｅｔｈｌａｍｉｎｏｍｅｔｈａｎｅ三羟甲基氨基甲烷２damdoc为您倾心整理(小店)(QQ@2218108823)人ＡＬＥＸ２基因的克隆、表达与纯化及生物信息学分析硕士研究生导烬张勇炳建屡教授第四军医火举病理教研室，西安７１００３２中文摘要ＡＬＥＸ２基因（Ａｒｍｐｒｏｔｅｉｎｓｌｏｓｔｉｎｅｐｉｔｈｅｌｉａｌｃａｎｃｅｒｓ，Ｘｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ，２），矮子ＡＬＥＸ家族戎昃，豫ＡＬＥＸ２基嚣岁｝，该家族还毯舔ＡＬＥＸｌ和ＡＬＥＸ３基阑。
猪细小病毒自然弱毒N株VP2基因的克隆、测序及生物信息学分析
gene o fna t ur a la t t enu a t edp o r ci ne p a r vo vi r us
N (PPV� � N ) st r a i n ,a nda na l e � t he h o mo l o g ,h er ed i t evo l ut i o n,c o do n p r ef er enc e,gl c o s l a t i o n si t es,p h o sp h o rl a t i o n si t es,B c� el lep i t o p es,sec o nd a r st r u ct ur ea n dt h r ee- d i m ensi o na lst r u ct ur e o fVP2 p r ot ei n b u si n g bi o i nf or ma t i c sso f t a r e.T h er esu l t ssh � � o� edt h a t eh a ve a mpl i fi eda 1 901 ba se p a i r s(bp ) f r a gm entc o n t a i ni ng O RFo f gene a ndc o nst � � r � u ct edt he r ec o m bi na � n tp l a sm i d p M D18 - T -VP2 su c c essf ul l .T he seq u enc e o f gene (1 7 40 bp ) a s seq u enc ed a n� dsu bm i t t � edt o G enB � a nk (H M 35 5 8 07 ).T h eot h er r esu l t sr evea l edt h a tt he PPV gene a sh i gh l � � co� nser va t i ve, � a n � dt he c o nsa ngu i ni t bet een PPV- N st r a i n a nd N ADL- 2 st r a i n a s cl o sel h i ch i mpl i ca t ed PPV- N st r a i ni s na t ur a la t t en u a t ed p o r ci ne p a r vo vi r u s.T he VP2 a mi no a ci d c o do n o fPPV-N st r a i n pr ef er r edt o A t h e endo fc o d o n. It a � sa l so sh o edt h a tt h er e er e 9 ser i nep h o sp ho rl a t i o n si t es,7 t h r eo n i ne p h o sp h o rl a t i o n si t es a nd8 t r o si � ne ph o sp h o rl a t i o n si t es p o ssi bl e i st si n PPV-N st r a i n VP2 p r ot ei n,a ndp o ssi bl c o nt a i ni ng a t ot a lo f 24 B c el lep i t o p es.T � h en t h e pr ed i ct i o n o fsec o n d a r st r u ct ur e o fVP2 p r ot ei n r evea l edt h a ta l ph ah el i ,bet ash eet a nd r a nd o m co i la c c o u nt f o r11. 7 4% ,22. 97 % a n d65 . 28 % ,r esp ec t i vel ,a nd t h e pr ed i ct i o n o ft h r ee-d i m ensi o na l � st r u ct ur er evea l � edt h a tso m e a l ph a hel i esa ndbet a sh eet se i sti n VP2 p r ot ei n h i l er a nd o m co i l a sm a j o r pa t t er n. � T h � e � r � esu l t so � ft h e p� r esentst ud oul d be p r o vi dso m e ba si c mo l ec u l a rbi ol o g of gene, h i ch o u l d su bse. gen o a pp l bi o l . o r g/d o i/ 1 0. 3 969/ga b. 02 9. 0 00 8 4 9 基金项目： 本研究由广西自然科学基金项目(桂科自 07 28 102)和广西基本科研业务费专项(桂兽研专项 09- 4)共同资助
水稻中一个SUSIBA2相似基因的克隆与表达分析
ｏ ｒ ｕｔｒ ｃｅｃ， ｕｈ ｕ ３ ０ ０ ； ｏｌ ｅ ｆ ｉ ｃ ｎｅＰ ｋｎ ｎｖｒｉ ， ｅ ｉｇ １０ ８ ， ｆ ｇｉ ｌ ｅ ｉ ｅ Ｆ ｚｏ ， ５ ０ ３ ３ ｌｇ ｏ Ｌｆ Ｓｉ ｃ， ｅｉｇＵ ｉｅｓ Ｂ ｉｎ ，０ ０ １ ａ ｃｕ Ｓ ｎ Ｃ ｅ ｅ ｅ ｙ ｔ ｊ Ｃ ｒｅｐ ｎ ｉｇ ｕｈ ｒｗ ｗ ２ ０ ＠ｙｈｏｃ ｍ． ｏｒｓｏ ｄｎ ｔｏ， ｒ ｕ ０ ５ ａ ｏ ｏ ｃ ａ ｎ
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新基 因 、 新种 质 、 品种 新
Ｎｅ Ｇｅ ｅ＆ Ｇｅ ｍｐ ａ ｍ ｗ ｎ ｒ ｌｓ
水稻 中一个 Ｓ ＳＢ ２相 似基 因的克 隆与表 达分 析 Ｕ ＩＡ
陈坚 ｔ 林 忠平 ３ 段远霖 。
通 讯 作者 ， ｒ ｕ ０ ５ ａｏ ．ｏ ｃ ｗ ｗ ２ ０ ＠ｙｈ ｏｃ ｍ． ｎ
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
兰涛 吴 为人
酶基 因 ｓｅ， ６， ６的表达 ， 从而影响胚乳 中淀粉 的合成 。我们根据 Ｓ ＳＢ Ｕ ＩＡ２的序列 ， 从水稻 基因组序 列中搜索到一
个与其相似 的 ＷＲ ＫＹ基 因ｆ 称为 Ｓ ＳＲ）含 ６个外显子 。 ＵｌＩ ， 采用 Ｒ —Ｃ ＴＰ Ｒ技 术， 我们从水稻 的幼穗 中克隆到该基
GAPC2基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达
Ａｒｓｏ ｍ ｅ ｃ ；其 他 常用 试 剂 购 于成 都 博瑞 克 生 物 公 司 。 １ ２ 方 法 ． １ ２ １ 基 因 全 长的扩 增 根 据 Ｎ Ｂ 上 已发表 的Ｇ Ｐ ２的基 因序 列 ．． ＣＩ ＡＣ 设 计特 异 性 引物 ，引 物序 列如 下 ：
—
因 片段 。
匕 弓 物 为Ｆ： ５ 一 Ｇ Ｇ Ｔ Ｃ Ｔ Ｇ Ｔ Ａ Ａ Ｇ Ａ Ａ Ｃ Ｇ 一 ’， 游 Ｉ ’ＣＧＡＣＡＧＣ ＧＣＡＡＧＴＡＡ ３ Ｆ 弓 物 为Ｒ ５ 一 Ｃ ｃ Ｔ Ｇ ｃ Ａ Ａ ｃ ＧＡ Ｇ Ａ Ｇ Ａ Ａ Ａ Ｔ Ａ Ａ 一 ’ 中设 计 的 酶 切 位 点 为 Ｂ ｍ Ｉ Ｓ ｌ 。 以拟 南 芥 ｃ Ｎ 为模 板 ，加 ａＨ和 ａＩ ＤＡ
Ｌ１ ａ的 Ｂ 三 磷 酸 一 油 醛 脱 氢 酶 （ ｌ Ｃ ｒ １ ｅ ｙ ｅ ３ Ｐ ０ Ｐ ａ ｅ Ｇ Ｐ ２ 化 大 肠 杆 菌 Ｂ ２ 感 受 态 细 胞 中 ，在 含 有 Ｋ ｎ Ｌ 平 板 上 甘 Ｇ Ｙ ｅ ｅ ｄ ｈ ｄ 一 一 ｈ ｈ ｔ Ａ Ｃ 转 Ｓ ｄｈｄｏｅａｅ ｅｙｒｇｎｓ， 忉 是 高 等植 物 体 内糖 酵 解 和 糖异 生 途 径 中 培 养 过 夜 。挑 取 菌 落进 行Ｐ Ｒ 定 ，０ ８ 的琼 脂 糖凝 胶 电泳 检 测 Ｃ鉴 ．％ 的 关 键 酶 ，能 够 催 化 ３ 磷 酸 甘 油 醛 转 变 为 １ ３ 二 磷 酸 甘 油 酸 。 一 ，一 目的条 带 大 小 。 ．． 位于细胞质中 的 是 由４ 同种 亚基 个 组 成 的 多 聚 体 ，而 １ ２ ４ 融 合 蛋 白的 诱 导 表 达 挑 取 单 个 含 表 达 质 粒 的 阳 性 菌 落
１材 料 与 方 法
１ １ 材 料 ．
重 悬 沉 淀 。 分别 取 ２ ｌ 液 重 悬 于Ｓ Ｓ Ｐ Ｇ 上 样 缓 冲 液 中 ， ０ 菌 ｕ Ｄ —Ａ Ｅ ｌ０ 煮沸３５ ｉ ０℃ － ｍ ｎ，冷 却 后 准 备 上 样 。用 微 量 注 射 器 取 ２ 样 ０ｌｌ Ｉ 品 上样 ，进 行 Ｓ Ｓ Ｐ Ｇ 电泳 。考 马 斯 亮蓝 Ｒ ２ ０ 色 ｌ ，脱 色 至 Ｄ—Ａ Ｅ 一５染 ｈ 胶 上 出现 清 晰条 带 。
拟穴青蟹抗菌肽CrusSp基因克隆表达及抑菌活性分析
黄青霉 Ｐ ｎｃｌ ｍ ｃｒ ｏｅｕ Ａ ． ８０ 和 绿 色 ｅｉｌｕ ｈｙ ｇｎｍ（ Ｓ３３ ９ ） ｉｉ ｓ 木 霉 Ｔｉ ｏｅｍ ｉｄ （ Ｓ３ ２４ ） 于 广 州 市 微 ｒｈｄｒ ａｖ ｉｅ Ａ ． ９２ 购 ｃ ｒ
华 南师范大学学报 （自然科 学版 ）
２ １ 年 ２月 ０１
Ｆｂ ０ １ ｅ ．２ １
Ｊ ＯＵＲＮＡＬ ＯＦ Ｓ ＴＨ ＯＵ ＣＨＩ ＮＯＲＭＡＬ ＵＮＩ ＮＡ ＶＥＲＳＴＹ Ｉ
２１ 第 １ ０ １年 期
Ｎｏ ．１。２ １ ０１
（ Ａ Ｕ ＡＬＳ Ｉ Ｎ ＥＥ ＩＩ Ｎ） Ｎ Ｔ Ｒ ＣＥ Ｃ Ｄ ＴＯ
白的抗真 菌和 细菌 的生 物 活 性 ， 为进 一步 探 讨 其 抗 菌 感染 机 制奠 定 了基 础 ．
１ 材 料 和 方法
１１ 材 料 ．
１ １ １ 供 试 蟹 和 菌 种 拟 穴 青 蟹 （ ｃｌ ａａ ． ． Ｓｙｌ Ｐ ｒ． ａ ｍ ｍｏａｎ 购 于深 圳 南 澳 海 鲜 街 ． 黄 色 葡 萄 球 菌 ａ ｓｉ） 金 Ｓａｈｌｃｃｕ ｕｅｓＣ Ｃ２０ ３ 、 ｔ ｙｏｏｃｓ ｒ （ ＭＣ ６０ ） 大肠 埃 希 氏菌 ｐ ａ ｕ Ｅｃｅｉ ｉ ｃｌ Ｃ Ｃ４ ８５ 、 ｓ ｒｈａ ｏｉ ＭＣ ４ ２ ） 短小 芽 孢 杆 菌 Ｂｅｉ ｈ ｃ （ ｒ — ｖ
不 仅具 有广 谱 抗各 种 革 兰 氏 阳性 菌 、 兰 氏阴性 菌 革 和真 菌 的活性 ， 而且 具 有抗病 毒 、 原生 动 物和肿 瘤 细 胞 等作 用 Ｊ ． 自 １９ ９ ３年 美 国学 者 Ｄ Ｐ Ｃ Ａ Ｋ等 首 次 从 牛 ．．Ｌ Ｒ 蛙 皮肤 内发 现抗 菌肽 Ｒ ｎｌ ｉ ＿ ， ａａｅ ｎ后 ４ 国外 学者 对 其 ｘ Ｊ
松褐天牛、棉卷叶野螟泛素基因的克隆与表达的开题报告
松褐天牛、棉卷叶野螟泛素基因的克隆与表达的开题报告
一、研究背景和意义
松褐天牛和棉卷叶野螟是两种重要的害虫，它们能够在林业和农业生产中造成巨大的经济损失。
目前，研究表明泛素在调节昆虫生长发育、免疫、生殖等多个生理功
能中发挥重要作用，因此克隆和表达松褐天牛和棉卷叶野螟泛素基因，对于深入研究
其生物学特性、开发特异性杀虫剂等方面具有重要的理论和实际意义。
二、研究内容和方法
1. 克隆松褐天牛和棉卷叶野螟泛素基因。
通过生物信息学技术，设计引物并进行PCR扩增，克隆出松褐天牛和棉卷叶野螟泛素基因的全长cDNA序列。
2. 构建表达载体。
选用高表达载体pET-28a，将松褐天牛和棉卷叶野螟泛素基因克隆到该载体中。
3. 表达并纯化蛋白。
将重组载体转化到大肠杆菌BL21(DE3)中，在IPTG诱导条件下进行表达，利用亲和层析柱纯化表达的松褐天牛和棉卷叶野螟泛素蛋白。
4. 常规分子生物学技术分析蛋白表达特性。
利用Western blot、SDS-PAGE等分子生物学技术分析表达的泛素蛋白的分子量、纯度等特性。
三、预期结果和意义
通过克隆和表达松褐天牛和棉卷叶野螟泛素基因，在分析其结构和生物学特性的同时，为研究它们的生长发育、免疫、生殖等重要生理功能提供了有力的工具和基础，为研发特异性杀虫剂提供了新的研究思路，具有广阔的应用前景和意义。
葡萄VviSEP2基因的克隆及表达分析
葡萄VviSEP2基因的克隆及表达分析朱惠君;唐玉瑾;张胜平;张朝红;李琰【期刊名称】《西北农林科技大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2018(046)007【摘要】[目的]克隆葡萄VviSEP2基因的完整开放阅读框(ORF)序列,明确其与胚珠败育型无核葡萄胚珠败育的关系.[方法]通过RT-PCR技术在‘无核白’葡萄中克隆葡萄VviSEP2基因的完整ORF序列,并对该序列及其编码产物进行生物信息学分析,采用半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR技术分析VviSEP2的表达模式.[结果]克隆得到一个无核葡萄胚珠发育相关基因,该基因cDNA序列长度为1 132 bp,ORF为741 bp,编码246个氨基酸.氨基酸多序列比对和进化树分析确认,该基因是E类MADS-box基因家族成员,命名为VviSEP2.表达分析结果表明,VviSEP2只在花蕾、花和胚珠中有表达,而在根、茎、叶中无表达,并且该基因在有核葡萄‘黑比诺’花与花蕾中的相对表达水平明显高于无核葡萄‘无核白’,同时VviSEP2基因在‘黑比诺’胚珠发育各时期的相对表达水平均高于‘无核白’,为后者的3～5倍.[结论]VviSEP2基因与无核葡萄的胚败育可能存在一定关系.【总页数】8页(P139-146)【作者】朱惠君;唐玉瑾;张胜平;张朝红;李琰【作者单位】西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学园艺学院,农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,陕西杨凌712100;南京中山制药有限公司,江苏南京210046;西北农林科技大学园艺学院,农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,陕西杨凌712100;西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100【正文语种】中文【中图分类】S663.1【相关文献】1.葡萄耐铝毒基因MATE的克隆与表达分析 [J], 张永福;莫丽玲;徐金会;徐仕琴;裴徐梨2.金线莲呋甾皂苷26-O-β-葡萄糖苷酶基因克隆与表达分析 [J], 林江波;王伟英;邹晖;戴艺民3.茶树中葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因(CsG6PDHs)的克隆与表达分析 [J], 王彦丁;钱文俊;王缓;李娜娜;王璐;郝心愿;王玉春;丁长庆;杨亚军;王新超4.葡萄VvSUC27基因的克隆及病原响应表达分析 [J], 吴佳鸿;黄金宝;刘梅;彭军波;乔广行;邢启凯5.小桐子磷酸葡萄糖变位酶cPGM与pPGM基因的克隆及原核表达分析 [J], 王海波;李芙蓉;杨金翠;高永;郭俊云因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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青杄PwUSP2基因的克隆和表达分析
周xx,xx 班级
摘要
广泛逆境胁迫蛋白(USPs)参与碳缺乏、缺氧、干旱和高盐 等多种非生物胁迫, 但在植物中的研究尚不深入。
本文通 过RACE-PCR 的方法获得青杄PwUSP2基因的cDNA 全长, 共987 bp ,其中编码区723 bp ,共编码240个氨基酸。
利用 生物信息学工具对其理化性质、二级结构和三级结构进行 分析,结果显示,该蛋白理论分子质量为26.84 kDa ,理论等 电点为4.61,有丝氨酸和苏氨酸结合位点,为非跨膜的亲水 蛋白。
PwUSP2具有USP 家族典型的UspA 结构域,但无典 型的A TP 结合位点G-2X-G-9X-G[S/T]。
RT-qPCR 分析表明, PwUSP2在青杄花粉、果实、种子、成熟叶、幼叶、成茎中 均有表达,在果实中表达量较高。
同时,PwUSP2在脱落酸 (ABA )、茉莉酸甲酯(MeJA )等非生物胁迫下表达量有明显 变化,推测PwUSP2可能参与青杄对逆境胁迫的响应。
材料与方法
青杄植 物材料
实验结果
通过RACE-PCR 方法获得PwUSP2基因的末端序列,与EST 序列拼接后获得完整的cDNA 序列全长。
PwUSP2基因cDNA 序列全长共987 bp , 编码区共723 bp , 共编码240个氨基酸。
在85 bp 处为起始密码子ATG , 805 bp 处为终止密码子TGA , 968 bp 处为Poly(A)20尾巴。
青杄PwUSP2
全长cDNA 的获得 生物信息 学分析
组织特异 性表达 胁迫
处理 PwUSP2在不同非生物胁迫下的表达模式不同。
PwUSP2受4℃低温诱导,表达量上调,且在12 h 表达量达到最高,在42℃热激胁迫下, PwUSP2呈现不同的表达模式,表达量呈整体下降趋势。
PwUSP2在ABA 胁迫下表达量出现下降, 与42℃热激胁迫模式相似,而在MeJA 胁迫下,PwUSP2基因受到诱导, 表达量显著上调。
ABA 和MeJA 胁迫下PwUSP2的表达分析
在NaCl 胁迫下, PwUSP2基因的表达量先上升后下降,同时PwUSP2基因的表达受干旱胁迫诱导上调。
温度胁迫下PwUSP2的表达分析
NaCl 和干旱胁迫下PwUSP2的表达分析
讨论
目前,在细菌和植物中,只有少数USPs 基因被克隆和分离,且部分参与了多种逆境胁迫。
PwUSP2是广泛逆境胁迫蛋白,本研究结果显示其在多种逆境胁迫下存在表达差异,对不同胁迫的反应时间也存在差别,暗示其可能广泛参与多种逆境胁迫响应。
PwUSP2在抗逆过程中的具体功能, 以及参与的信号转导路径和调控机制仍有待于研究。
林学院第五届学生学术论坛
PwUSP2全cDNA的核苷酸序列及推导的氨基酸序列。