湖北肠道病毒EV71型流行株VP1基因以及蛋白结构特征分析

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肠道病毒71型简介

肠道病毒71型简介

第二节肠道病毒71型(EV71)作者:李兰娟出版社:浙江科学技术出版社肠道病毒71型(EV71)属于小RNA病毒科(Picornaradae)肠道病毒属(Enterovirus)的成员,归属于人类肠道病毒A。

1974年Schmidt等人首次报道从美国加利福尼亚暴发的表现为神经系统症状疾病(1969~1973年)的患者中分离到EV71,随后,世界上许多国家相继报道了EV71病毒在不同地区的流行情况,EV71病毒已在世界范围内引起多次暴发与流行,人们逐渐认识到EV71病毒是手足口病的主要病原。

目前已知EV71的感染可以导致手足口病、疱疹性咽峡炎、无菌性脑膜炎(asepic meningitis)、脑炎(encephalitis)和脊髓灰质炎样的麻痹性疾病(poliomyelitis-like paralysis)等多种与神经系统相关的疾病。

EV71可导致大范围的暴发流行,可伴有严重的CNS并发症或致死性肺水肿。

近年来,EV71病毒的流行在亚太地区呈上升趋势,1975年保加利亚大流行,共有705名患儿感染,死亡44例;1997年马来西亚大流行感染2628人,死亡30多人;1998年,台湾地区暴发EV71的大流行,约有12万以上的人被感染,死亡78人。

因此,有关EV71的病毒生物学特性、致病机理、诊断和预防等的研究日益受到人们的重视。

一、病毒的一般特征(一)病毒颗粒结构该病毒的颗粒为二十面体立体对称的球形结构,无包膜和突出,直径约24~30nm,核酸为单股正链RNA。

如同其他肠道病毒属成员一样,EV71型病毒基因组编码的分子量分别为34KD、30 KD、26 KD和7KD的多肽VP1(α)、VP2(β)、VP3(γ)、VP4(δ),构成原聚体,后者再拼装成具有五聚体样结构的亚单位(pentameric unit),60个亚单位通过各自的结构域相互连接,最终形成病毒的外壳。

VP1 、VP2和VP3三个多肽暴露在病毒外壳的表面,而VP4包埋在病毒外壳的内侧与病毒核心紧密连接,因而抗原决定簇基本上位于VP1-VP3上。

肠道病毒71型检测与VP1基因特征分析

肠道病毒71型检测与VP1基因特征分析

肠道病毒71型检测与VP1基因特征分析摘要】目的分析肠道病毒71型2011年本地流行株VP1基因特征学特征。

方法收集2011年本地手足口病患者临床标本332份,进行EV71荧光定量RT-PCR鉴定,采用RT-PCR对15株分离到的EV71进行VP1编码区基因扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测序和分析。

根据VP1测序结果与国内外报道的各基因型和基因亚型EV71 VP1序列进行同源性和亲缘进化分析。

结果 165份标本鉴定为EV71,分离株的VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是97.5%~99.9%和99.4%~100%。

与C4a亚型的核苷酸和氨基酸最高。

亲缘进化树显示,本地株全部属于C4基因亚型的C4a进化分支。

结论本地区分离的EV71与近几年国内其他地区EV71分离株亲缘关系很近,有共同进化的趋势,属于C4基因亚型的C4a进化分支,并存在多个传播链。

【关键词】肠道病毒71型基因特征遗传进化手足口病(hand,foot and mouth disease, HFMD)是由多种肠道病毒引起的,严重威胁儿童健康的全球性传染病。

临床表现为手、足、口腔等部位的疱疹,伴有发热、咽痛、倦怠乏力等症状,个别重症患儿病情进展快,可发生死亡。

为全面了解本地区手足口病病原学分布的情况,对本市446份手足口病临床诊断标本进行检测,现将结果报告如下。

1 材料和方法1.1 标本来源2009~2010年各医院送检的HFMD临床诊断标本共332份,其中粪便、咽拭子、肛拭子、脑脊液、气管洗液标本各201、72、43、12、4份。

1.2 核酸提取和荧光定量RT-PCR检测采用QIAGEN Reansy Mini Kit试剂盒,操作步骤参照Rneasy Mini kit Handbook。

上海之江生物科技有限公司生产的肠道病毒71型荧光检测试剂盒和柯萨奇病毒A 组16型荧光检测试剂盒。

1.3 EV71 VP1基因扩增将检测为EV71阳性的病毒核酸进行全长VP1编码区的核苷酸序列测定和分析。

肠道病毒71型灭活疫苗

肠道病毒71型灭活疫苗

灭活疫苗仍然存在问题
1
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3
EV71 免疫保护机制复杂,除体液免疫外, 细胞免疫也发挥着重要的作用。然而,灭活疫苗主要诱导的是体液免疫, 细胞免疫不够充分。
灭活疫苗生产和运输成本高昂。疫苗效力较高而疫苗价格较低的常规免疫才符合我国的成本效益 , 这可能会制约灭活疫苗的应用。
EV71 本身存在抗体依赖性增强感染现象,不恰当的疫苗接种有可能会增加重症病例的风险。
Enterovirustype71inactivatedvaccine
课程:生物技术制药
班级:2013生技一班
肠道病毒71型灭活疫苗
EV71图片
肠道病毒 71 型( enterovirus 71, EV71) 为单股正链 RNA病毒,是小 RNA 病 毒 科 肠 道 病 毒 属 中 的 重 要 成 员 之 一。EV71 基因组由 7400 多个核苷酸构成, 包含一个开放读码框,编码大约 2200 个氨基酸的多聚蛋白。该多聚蛋白可被进一步水解成 P1、 P2 和 P3 三个前体蛋白,P1 前体蛋白编码VP1、 VP2、 VP3 和 VP4 四种结构蛋白,P2、 P3 前体蛋白编码 7种非结构蛋白( 2A ~ 2C 和 3A ~ 3D) EV71 包括 A、 B 和C 3 种基因型,11 个基因亚型, 每种亚型感染均可引起手足口病( hand, foot and mouth disease, HFMD
EV71 疫苗除能诱导中和抗体外,还能诱导细胞免疫应答,其也具有免疫保护作用。
EV71疫苗可行性
01
02
03
04
全病毒灭活疫苗
减毒活疫苗
基因工程疫苗
病毒样颗粒( VLPs)疫苗
肠道病毒 71 型疫苗分类

肠道病毒EV71新型VLPs疫苗的制备及鉴定

肠道病毒EV71新型VLPs疫苗的制备及鉴定

肠道病毒EV71新型VLPs疫苗的制备及鉴定董轲;王希;龙敏;王琳;张惠中【摘要】目的制备肠道病毒71型(EV71)的新型病毒样颗粒(VLPs)疫苗,为手足口病防治奠定基础.方法应用分子克隆技术构建外壳蛋白VP1融合基因cVP1,免疫细胞化学及Western Blot测定该融合基因在HeLa细胞表达情况;将cVP1克隆于杆状病毒表达载体pFastbac1,应用昆虫细胞TN5制备重组杆状病毒cVP1 rBV,再将此重组病毒与本室保存的gag rBV以不同MOI比例共感染昆虫细胞TN5,得到含有VP1的重组嵌合病毒样颗粒cVP1 VLPs,最后以Western Blot及电镜进行鉴定.结果免疫细胞化学及Western Blot结果显示构建的融合基因cVP1可在真核细胞内表达,并成功制备成cVP1 rBV,该重组杆状病毒和gag rBV共感染昆虫细胞制备的VLPs结构完整.结论成功制备了EV71的新型VLPs疫苗,为后续研究打下了基础.【期刊名称】《中国妇幼健康研究》【年(卷),期】2015(026)006【总页数】3页(P1125-1127)【关键词】手足口病;肠道病毒71型;病毒样颗粒;制备及鉴定【作者】董轲;王希;龙敏;王琳;张惠中【作者单位】第四军医大学唐都医院临床实验与检验科,陕西西安710000;第四军医大学唐都医院临床实验与检验科,陕西西安710000;第四军医大学唐都医院临床实验与检验科,陕西西安710000;第四军医大学唐都医院临床实验与检验科,陕西西安710000;第四军医大学唐都医院临床实验与检验科,陕西西安710000【正文语种】中文【中图分类】R512.5手足口病(hand, foot and mouse disease,HFMD)为一组肠道病毒引起的传染性疾病,近年来在我国持续爆发,严重危害公众健康并带来巨大社会负担。

引发手足口病的肠道病毒包括A组柯萨奇病毒、埃可病毒和肠道病毒71型等,其中肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)病毒感染是部分患者出现中枢神经系统、呼吸系统和循环系统严重并发症并导致死亡的重要原因[1-2]。

2024年肠道病毒 EV71疫苗市场需求分析

2024年肠道病毒 EV71疫苗市场需求分析

肠道病毒 EV71疫苗市场需求分析简介肠道病毒 EV71 (Enterovirus 71) 是一种主要通过飞沫传播引起手足口病的病毒,严重感染可导致中枢神经系统疾病甚至死亡。

针对肠道病毒 EV71 的疫苗成为公众关注的焦点之一,本文将对肠道病毒 EV71 疫苗市场需求进行分析。

市场背景近年来,全球范围内手足口病的发病率呈上升趋势,尤其是亚洲地区。

肠道病毒EV71 是手足口病的主要病原体之一,严重感染可引发脑干脑炎或心肌炎等并发症,造成儿童死亡。

因此,肠道病毒 EV71 疫苗的研发和上市具有重要的公共卫生意义。

市场需求分析1. 全球疫情形势推动疫苗需求增长随着全球范围内手足口病的爆发,肠道病毒 EV71 疫苗的需求日益增长。

政府和公共卫生部门愈发关注儿童健康和疫苗接种,全球范围内对肠道病毒 EV71 疫苗的需求预计将持续增长。

2. 亚洲市场潜力巨大亚洲地区是肠道病毒 EV71 流行的高发区域,尤其是中国、越南、马来西亚等国家。

这些国家拥有庞大的人口基数和高发病率,对疫苗的需求潜力巨大。

同时,亚洲国家还相对缺乏肠道病毒 EV71 疫苗的供应,市场空间广阔。

3. 儿童疫苗接种率提高随着儿童健康意识的增强和医疗条件的改善,儿童疫苗接种率逐渐提高。

肠道病毒 EV71 疫苗的研制和上市,将有助于进一步提高儿童疫苗接种的整体水平。

这也为肠道病毒 EV71 疫苗市场需求带来了积极的影响。

4. 创新疫苗技术推动市场发展肠道病毒 EV71 疫苗领域正在不断涌现创新疫苗技术。

例如,重组蛋白疫苗、基因工程疫苗等新技术的应用,为疫苗的研发和生产提供了更多选择。

这些新技术的不断发展将进一步推动肠道病毒 EV71 疫苗市场的发展。

市场挑战分析尽管肠道病毒 EV71 疫苗市场需求前景广阔,但仍面临一些挑战。

1. 疫苗供应不足目前,肠道病毒 EV71 疫苗的供应相对不足,无法满足市场需求。

疫苗生产的复杂性和技术难度,限制了供应量的提高。

肠道病毒71型简介简述

肠道病毒71型简介简述

第二节肠道病毒71型(EV71)作者:李兰娟出版社:浙江科学技术出版社肠道病毒71型(EV71)属于小RNA病毒科(Picornaradae)肠道病毒属(Enterovirus)的成员,归属于人类肠道病毒A。

1974年Schmidt等人首次报道从美国加利福尼亚暴发的表现为神经系统症状疾病(1969~1973年)的患者中分离到EV71,随后,世界上许多国家相继报道了EV71病毒在不同地区的流行情况,EV71病毒已在世界范围内引起多次暴发与流行,人们逐渐认识到EV71病毒是手足口病的主要病原。

目前已知EV71的感染可以导致手足口病、疱疹性咽峡炎、无菌性脑膜炎(asepic meningitis)、脑炎(encephalitis)和脊髓灰质炎样的麻痹性疾病(poliomyelitis-like paralysis)等多种与神经系统相关的疾病。

EV71可导致大范围的暴发流行,可伴有严重的CNS并发症或致死性肺水肿。

近年来,EV71病毒的流行在亚太地区呈上升趋势,1975年保加利亚大流行,共有705名患儿感染,死亡44例;1997年马来西亚大流行感染2628人,死亡30多人;1998年,台湾地区暴发EV71的大流行,约有12万以上的人被感染,死亡78人。

因此,有关EV71的病毒生物学特性、致病机理、诊断和预防等的研究日益受到人们的重视。

一、病毒的一般特征(一)病毒颗粒结构该病毒的颗粒为二十面体立体对称的球形结构,无包膜和突出,直径约24~30nm,核酸为单股正链RNA。

如同其他肠道病毒属成员一样,EV71型病毒基因组编码的分子量分别为34KD、30 KD、26 KD和7KD的多肽VP1(α)、VP2(β)、VP3(γ)、VP4(δ),构成原聚体,后者再拼装成具有五聚体样结构的亚单位(pentameric unit),60个亚单位通过各自的结构域相互连接,最终形成病毒的外壳。

VP1 、VP2和VP3三个多肽暴露在病毒外壳的表面,而VP4包埋在病毒外壳的内侧与病毒核心紧密连接,因而抗原决定簇基本上位于VP1-VP3上。

EV71与CB3病毒VP1融合蛋白的构建表达与抗原性初步评价


E V 7 1 ) 、 柯 萨 奇 病 毒 。柯 萨 奇 病 毒 B组 3型 ( C O X —
s a c k i e v i r u s B 3, C B 3 ) 可引起病 毒性心肌 炎、 无 菌 性
脑 膜炎 等 严 重 并 发 症 导 致 死 亡 _ 2 - 3 1 。E V 7 1与 C B 3 病 毒均 属 于小 R N A病 毒科 j , 其基 因组 为单 股正 链 R N A, 5 端和 3 端各 有一 个非 编码 区 , 中间 编码 区 由
1 . 1 . 3 主要 试 剂及仪 器 T a q D N A 聚合 酶、 T 4 D N A连接 酶和 p f u T a q D N A聚合 酶 及 限制 性 内切 酶 购于 N E B公 司 ; 质 粒 提 取 和 纯 化 试 剂 盒 购 自北 京 B i o m e d有 限公 司 ; 逆转 录试 剂 盒 购 于北 京 全式 金 生
安徽 医科 大学学报
A c t a U n i v e r s i t a t i s Me d i c i n a l i s A n h u i 2 0 1 3 J u n ; 4 8 ( 6 )
・5 8 3・
◇基 础 医学研 究 ◇
E V 7 1与 C B 3病毒 V P 1融合蛋 白的构 建表达与抗原性初步评价
r e a c t i o n , S O E — P C R) 技 术构 建融 合基 因 , 利 用大肠 杆 菌 表达 系统 对 E V 7 1及 C B 3的外 壳 蛋 白 V P 1进 行 融 合蛋 白表 达 纯 化 , 将 该 融合 蛋 白命 名 为 E C V P 1 , 并 对其 抗原 性进 行初 步分 析 。
是 由多种肠 道 病毒 引起 的 以婴幼 儿发病 为 主 的一种

肠道病毒EV71疫苗的比较研究

肠道病毒EV71疫苗的比较研究摘要】肠道病毒EV71(EV71)是引起手足口病(Hand, foot and mouthdisease,HFMD)主要病原体,可引起严重的神经系统并发症,是手足口病婴幼儿死亡的主要原因。

由于临床上尚无有效的治疗手段,目前疫苗的研发迅速,已有疫苗用于临床实验阶段。

本文主要对全病毒灭活疫苗, 病毒样颗粒疫苗,减毒活疫苗的研发进展和存在的优缺点作一综述。

【关键词】肠道病毒EV71;手足口病;疫苗【中图分类号】R726 【文献标识码】A 【文章编号】1007-8231(2015)23-0083-03肠道病毒71(EV71)1963年在荷兰被首次发现,1969年美国第一次对其描述[1]。

EV71引起手足口病,主要通过粪口传播,可引起严重的神经系统并发症,包括无菌性脑膜炎,脑干脑炎,脊髓灰质炎,脑脊髓炎和死亡。

幸运的是,一些后备的EV71疫苗已经被报道,由于动物模型得到很好的效果,自2010年开始用于临床试验阶段。

但是我国研制的一株EV71灭活疫苗在Ⅲ期临床试验中的结果显示,并不能有效地预防手足口病的发生,与研究者之前普遍认为的EV71疫苗乐观的前景相矛盾,提醒我们应该重新思考EV71疫苗研究中存在的问题。

1.EV71疫苗研究的进展到目前为,没有任何的临床治疗手段和疫苗能有效的阻止EV71感染儿童。

但是疫苗确实最后的的控制和阻止EV71流行的有效手段。

接下来我们总结了各种后备疫苗的研究进展,并进行了比较分析。

2.疫苗的研发进展和存在的优缺点比较2.1全病毒灭活疫苗(inactivated whole-virion vaccine)全病毒灭活疫苗是最安全的生产疫苗的方法,生产工艺成熟,有良好的免疫原性,例如流感病毒,脊髓灰质炎病毒或者狂犬病毒。

灭活的EV71是作为疫苗最主要的备选方案。

福尔马林灭活EV71疫苗在小鼠和恒河猴的体内实验中,表现出令人满意的免疫保护性水平和中和抗体的交叉反应。

肠道病毒71型VP1蛋白原核表达及初步鉴定

肠道病毒71型VP1蛋白原核表达及初步鉴定李小青;何威;段明月;李丹;冯媛【期刊名称】《临床和实验医学杂志》【年(卷),期】2014(000)016【摘要】目的采用分子克隆技术,构建肠道病毒71型( EV71)VP1全长基因大肠杆菌原核系统表达载体,诱导重组VP1融合蛋白表达。

方法自EV71感染患者血清中提取病毒总RNA,进行一步法RT-PCR,扩增编码VP1蛋白的全长基因片段(891 bp),以pET32(a)为表达载体,构建重组表达质粒pET32(a)- VP1,转化E. coli. Rosseta感受态细胞,获得重组工程菌株。

经诱导培养,SDS-PAGE电泳,免疫印迹鉴定表达产物。

结果获得了含重组表达质粒pET32( a)- VP1的正相阳性工程菌株,经IPTG诱导能高效表达VP1融合蛋白。

结论重组工程菌可表达VP1融合蛋白,对研究EV71发病机制及疫苗研制具有重要意义。

%Objective The aim of this study are to construct recombinant expression vector containing VP1 whole gene of enterovirus 71 (EV71)by DNA recombinant technology and to induce expression of VP1 fusion protein in E. coli. Methods The interested gene with total extracted from the serum of patients. These patients were infected by EV71 virus. We inserted it into pET32(a)expression vector to construct recombinant expression vector pET32(a)- VP1. The verified recombinants pET32( a)- VP1 were transformed into E. coli. Rossena to produce bacteria strain with positive recombinants,then the strain were analyzed with SDS - PAGE and immunoblotting to verify the expression product -- VP1 fusion protein.Results The positive bacteria containing the recombinant expressive vector pET28(a) - VP1 were constructed successfully, and high level expression of VP1 fusion protein was performed by inducing with IPTG. Conclusion It played an important role in investigating the pathogenesis of EV71 and developing vaccine in the future that the VP1 fusion protein of the positive strain with recombinant were expressed efficiently in E. coli system.【总页数】4页(P1314-1317)【作者】李小青;何威;段明月;李丹;冯媛【作者单位】西安交通大学医学院附属儿童医院儿科疾病研究所陕西西安710003;西安交通大学医学院附属儿童医院儿科疾病研究所陕西西安 710003;西安交通大学医学院附属儿童医院儿科疾病研究所陕西西安 710003;西安交通大学医学院附属儿童医院儿科疾病研究所陕西西安 710003;西安交通大学医学院附属儿童医院儿科疾病研究所陕西西安 710003【正文语种】中文【相关文献】1.肠道病毒71型重组VP2蛋白原核表达及初步鉴定 [J], 施静;朱冰;钟家禹;王长兵;许甜甜2.肠道病毒71型结构蛋白VP1的原核表达及初步鉴定 [J], 岳盈盈;李志会;李鹏;宋楠楠;赵元昊;孟红3.人细小病毒B19 XA株VP1蛋白原核表达及初步鉴定 [J], 李小青;张国成;许东亮;李志宏4.人肠道病毒71型及柯萨奇病毒A组16型VP1蛋白的真核表达 [J], 徐晓园; 李文丽; 徐岚; 李蕊5.肠道病毒71型VP1蛋白原核表达及在高通量抗体筛选中的应用 [J], 崔珂;孔亚茹;马传敏;张振杰;史卫峰;全传松因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

中国EV71病毒VP1蛋白生物信息学分析

来 自 Gnak 01La ( H -8 G l72 ) 12 ebn : 0一nJ C N) ( Q 114 ,4- 1 0
G H . o ( u 9 15 。 3G 。刚 鳓 ZC N2 8 c 1o7 )3 .ZC 0 7 ( U l 1 G O 9
7 , 2. SS .H - ( U 535) 52A h i 8 9) 511 —D C N0 E 737 , 4 . nu- 8 7 0 ( J6 1 )56A h i ( 盯64 1 ,79 . M—H 一 F75 6 , .n u- F 52 ) 00F N C N 4 6 8 0
ecpais nehli)和脊 髓 灰质 炎 样 的麻痹 ( oi yli t Plm eis o t— l eprl i) 等 多 种 与 神 经 系统 相 关 的疾 病 _ 。 i aa s k ys l J
分别为 G 368 U 920和 G 858 , Q 525 其他 、 基 因序列 l
( 兰州生物制 品研 究所 , 州 7 oo ) 兰 3 0o
摘 要: 以肠道病毒 7 1型 ( ne v u 1E 7 )V 1 E t oi ̄ ,V 1 P 蛋白基因序列为基础 , r r7 利用生物软件对 E 7 V 1病毒 中国分离株
V 1 白进行进化树 、 糖基化位点 、 P蛋 N. 二级结构及抗原位点的预测 和分析。结果显示国内分离株多为 C 4亚 型 , 有
0 ( U 182) 0 1FN H - E 906 ) 1o一 7 E 906 , 78 - M C N0 7( U l88 ,9 1
16 99年美国加利福尼亚州首次分离 出该病毒, 此后 全球 各地 均有 流行 , 中 17 其 95年保 加利 亚 、97年 19 马来 西 亚 、 9 8年 中 国 台 湾 发 生 3次 爆 发 4J 19 ,
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行 分 析 。结 果 2 0 1 1年 湖 北 省 E V7 1型 流 行 株 的 基 因亚 型 为 C 4 a亚 型 , 其 VP 1区核 苷 酸 和 蛋 白 氨基 酸 序 列 同源 性较 高 , 分别
为9 6 . 5 ~9 8 . 7 和9 8 . 3 ~1 0 0 。VP 1蛋 白特 征 分 析 发 现 该 区 主 要 免 疫 表 位 均 没 有 发 生 变异 且 存 在 较 多 亲 水 性 区域 。 二 级 结 构 以无 规 则 卷 曲 为 主 , 其 次 为 0片 层 。 蛋 白质 同源 建 模 未 发 现 不 同毒 株 r . - J VP 1蛋 白 三 级 结 构 差 别 。结 论 2 0 1 1 年湖
o f VP1 g e n e o f e nt e r o v i r u s 71 s t r a i n s i n Hu b e i Pr o v i nc e
L I J i n g, L EI Ya — k e , J I ANG Xi a o — q i n g, YANG Z h a o — h u i , ZHANG Ti n g, ZHAN J i a n — b o
湖北肠道病毒 E V 7 1型 流 行 株 V P 1基 因 以及 蛋 白结 构 特 征 分 析
李 静, 雷亚克 , 蒋 晓清 , 杨朝晖, 张 婷, 占建波
摘 要 : 目 的 全 面 研 究 和 了解 2 0 1 1年 湖 北 省 肠 道 病 毒 7 1型 的 VP 1基 因及 蛋 白结 构 特 征 , 分析 E V7 1型 病 毒 在 湖 北 省 的 基 因型 别 , 探 讨 该 型 病 毒 在 全 省 的地 理 分 布 特 征 。 方 法 对 2 0 1 1年 湖 北 省 8个 区市 的 2 o株 E V7 1流 行 株 进 行 VP 1区全 长 基 因序列测定 , 并 对 核 苷 酸 序 列 进 行 同源 性 比较 及 系 统进 化 分 析 , 并 对 VP 1蛋 白序 列 的 亲 水 性 、 柔 韧 性 等 二 级 和 三 级 结 构 进
关键 词 : 肠道 病毒 7 1型 ; VP1区; 基 因特 征
中 图分 类 号 : R 3 7 3
文献标识码 : A
文章编号 : 1 0 0 2 —2 6 9 4 ( 2 0 1 3 ) 1பைடு நூலகம்1 —1 0 9 9 —0 6
Ge ne t i c ,s t r u c t u r a l a n d f u nc t i o na l c ha r a c t e r i s t i c s
中 国 人 兽 共 患 病 学 报
2 01 3, 29 ( 1 1 )
Ch i ne s e J o ur n a l o f Zoo n os e s 1 O9 9
O OI : 1 0. 3 9 6 9 / c j z . i . i s s n . 1 0 0 2—2 6 9 4 . 2 01 3. 1 1 . 0 1 4
北省 E V7 1型 流 行 株 与 我 国其 它地 区 的 毒株 有 较 高 同源 性 , 且 存 在 一 定 的 地 理 区域 聚 集 性 特 征 和 遗 传 多样 性 特 点 。 同 时综 合 多种 方 法 预 测 E V7 1 VP 1的二 级 结 构 和 三 级结 构 , 为 进 一 步 研 究开 发 相 关 药 品 和 防 治 E V7 1 感 染提供理论基础。
t e r i s t i c s o f VP1 g e n e s a n d t h e d i s t r i b u t i o n o f EV7 1 s t r a i n s we r e a n a l y z e d i n t h i s s t u d y . Th e c o mp l e t e VP1 s e q u e n c e s o f 2 0 EV7 1 s t r a i n s f r o m c l i n i c a l s a mp l e s we r e a mp l i f i e d b y RT— P CR a n d s e q u e n c e d f o r t h e h o mo l o g i c a l a n d p h y l o g e n e t i c a n a l y s i s a s we l l a s t h e a n a l y s i s o f t h e h y d r o p h i l i c i t y ,f l e x i b i l i t y ,t h e s e c o n d a r y a n d t e r t i a r y s t r u c t u r e o f E V7 1 v i r a l p r o t e i n . Th e r e s u l t s s h o we d t h a t t h e EV7 1 s t r a i n s i n Hu b e i b e l o n g e d t o C 4 a c l u s t e r o f t h e C4 s u b g e n o t y p e .Th e n u c l e o t i d e a n d a mi n o a c i d i d e n t i t y
( Hu b e i Ce n t e r fo r Di s e a s e C o n t r o l a n d Pr e v e n t i o n,Wu h a n 4 3 0 0 7 9 ,C h i n a)
ABSTRACT: To i n ve s t i ga t e t he ge ne t i c b ac kgr ou nd of e n t e r o vi r u s t yp e 71 ( EV 71) i n Hu be i Pr ov i nc e,t he ge n e t i c c ha r ac —
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