酵母双杂交的原理

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酵母双杂交

酵母双杂交

酵母转录因子(Gal 4)
与BD-fusion ---诱饵蛋白(bait protein ) 与AD-fusion ---猎物或靶蛋白(prey or target protein)
报告基因(reporter gene)
---Lac Z(编码β -半乳糖苷酶)
报道株
经改造的、含报告基因的重组质粒的宿 主细胞。 酵母细胞作为报道株的酵母双杂交系统具有 许多优点:
酵母双杂交系统
一、酵母双杂交系统的简介
酵母双杂交系统(yeast two-hybrid system) 是由Fields和song等在1989年提出的一种在真 核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋 白质相互作用的遗传系统。 酵母双杂交系统的建立得力于对真核细 胞调控转录起始过程的认识。研究发现,许 多真核生物的转录因子都是由两个可以分开 的、功能上相互独立的结构域组成的。
DNA结合结构域(BD)
(DNA binding domain)
转录激活因子
转录激活结构域(AD) (activation domain)
•这两个结构域各具功能,互不影响,
•单独存在时都没有转录激活的功能,
•只有二者在空间上充分接近时,才表现出一个完整的
激活特定基因表达的激活因子的功能。
二、酵母双杂交系统的建立
五、酵母双杂交的应用
酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的, 研究活细胞内蛋白质相互作用,对蛋白质之间微弱的、 瞬间的作用也能够通过报告基因的表达产物敏感地检 测得到,它是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间 关系的技术。
大量的研究文献表明,酵母双杂交技术既可以用 来研究哺乳动物基因组编码的蛋白质之间的互作,也 可以用来研究高等植物基因组编码的蛋白质之间的互 作。因此,它在许多的研究领域中有着广泛的应用。

酵母双杂交原理与实验具体流程.

酵母双杂交原理与实验具体流程.

图2romoters and other cis-acting regulatory elements play a crucial role in yeast-based expression systems and transcriptional assays such as the MATCHMAKER One- and Two-Hybrid Systems. Differences in the promoter region of reporter gene constructs can significantly affect their ability to respond to the DNA-binding domain of specific transcriptional activators; promoter constructs also affect the level of background (or leakiness) of gene expression and the level of induced expression. Furthermore, differences in cloning vector promoters determine the level of protein expression and, in some cases, confer the ability to be regulated by a nutrient (such as g al actose in the case of the G AL 1p romoter) .
酵母双杂交系统原理及具体 操作流程
酵母双杂交系统可进行两个蛋白互作分析,可用
一个已知的蛋白因子(在双杂交系统中称为诱饵蛋白)

亚细胞定位,酵母双杂交技术的原理流程

亚细胞定位,酵母双杂交技术的原理流程

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酵母双杂交原理

酵母双杂交原理

酵母双杂交酵母双杂交系统的建立是基于对真核生物调控转录起始过程的认识。

细胞起始基因转录需要有反式转录激活因子的参与。

反式转录激活因子,例如酵母转录因子GAL4在结构上是组件式的(modular),往往由两个或两个以上结构上可以分开,功能上相互独立的结构域(domain)构成,其中有DNA结合功能域(DNA binding domain,DNA-BD)和转录激活结构域(activation domain,DNA-AD)。

这两个结合域将它们分开时仍分别具有功能,但不能激活转录,只有当被分开的两者通过适当的途径在空间上较为接近时,才能重新呈现完整的GAL4转录因子活性,并可激活上游激活序列(upstream activating sequence, UAS)的下游启动子,使启动子下游基因得到转录。

根据这个特性,将编码DNA-BD的基因与已知蛋白质Bait protein的基因构建在同一个表达载体上,在酵母中表达两者的融合蛋白BD-Bait protein。

将编码AD的基因和cDNA文库的基因构建在AD-LIBRARY表达载体上。

同时将上述两种载体转化改造后的酵母,这种改造后的酵母细胞的基因组中既不能产生GAL4,又不能合成LEU、TRP、HIS、ADE,因此,酵母在缺乏这些营养的培养基上无法正常生长。

当上述两种载体所表达的融合蛋白能够相互作用时,功能重建的反式作用因子能够激活酵母基因组中的报告基因HIS、ADE、LACZ、MEL1,从而通过功能互补和显色反应筛选到阳性菌落。

将阳性反应的酵母菌株中的AD-LIBRARY载体提取分离出来,从而对载体中插入的文库基因进行测序和分析工作。

在酵母双杂交的基础上,又发展出了酵母单杂交、酵母三杂交和酵母的反向杂交技术。

它们被分别用于核酸和文库蛋白之间的研究、三种不同蛋白之间的互作研究和两种蛋白相互作用的结构和位点。

第一张商品化的抗体芯片是由美国BD Clontech公司推出的。

《酵母双杂交系统》课件

《酵母双杂交系统》课件

01
明确研究目标,确定需要验证的蛋白间相互作用或筛选与特定
蛋白相互作用的候选蛋白。
挑选合适的酵母菌株
02
根据研究目的选择适合的酵母菌株,如用于筛选候选蛋白的酵
母菌株或用于验证已知相互作用蛋白的酵母菌株。
构建诱饵和猎物蛋白的表达载体
03
将目的蛋白分别克隆到酵母表达载体上,构建诱饵和猎物蛋白
的表达载体。
应用领域
蛋白质互作网络研究
利用酵母双杂交系统可以大规模地筛选蛋白质之间的 相互作用,构建蛋白质互作网络。
疾病机制研究
通过研究疾病相关蛋白的相互作用,有助于深入了解 疾病的发生和发展机制。
药物靶点发现
发现新的药物靶点,为药物研发提供新的思路和方向 。
02
酵母双杂交系统的实验流程
准备阶段
确定研究目的
基因表达调控研究
研究转录因子与DNA的结合
利用酵母双杂交系统可以筛选与特定DNA序列结合的转录因子,进而研究其在基因表达调控中的作用 。
发现新的转录因子
通过与已知转录因子的相互作用筛选,可以发现新的转录因子,进一步揭示基因表达调控的机制。
药物发现与设计
寻找药物靶点
利用酵母双杂交系统可以筛选与药物作用靶点相互作用的蛋白质,为药物发现提供潜在 的靶点。
对生命科学领域的影响与贡献
促进基础研究
酵母双杂交系统作为一种强大的研究工具,有助于深入揭示生命 过程的奥秘,推动生命科学领域的基础研究。
疾病机制与治疗研究
通过研究疾病相关蛋白的相互作用,为疾病机制的解析和药物研发 提供有力支持。
生物技术产业
酵母双杂交系统的应用有助于推动生物技术产业的发展,如新药发 现、生物制品开发等。

酵母双杂交

酵母双杂交

酵母双杂交系统原理酵母双杂交系统由Fields和Song等首先在研究真核基因转录调控中建立。

典型的真核生长转录因子,如GAL4、GCN4、等都含有二个不同的结构域: DNA结合结构域(DNA-binding domain)和转录激活结构域(transcription-activating domain)。

前者可识别DNA上的特异序列,并使转录激活结构域定位于所调节的基因的上游,转录激活结构域可同转录复合体的其他成分作用,启动它所调节的基因的转录。

二个结构域不但可在其连接区适当部位打开,仍具有各自的功能。

而且不同两结构域可重建发挥转录激活作用。

酵母双杂交系统利用杂交基因通过激活报道基因的表达探测蛋白-蛋白的相互作用。

主要有二类载体: a 含DNA -binding domain 的载体; b 含DNA-activating domain的载体。

上述二类载体在构建融合基因时,测试蛋白基因与结构域基因必须在阅读框内融合。

融合基因在报告株中表达,其表达产物只有定位于核诓拍芮 ǜ婊 虻淖 肌@ 鏕AL4-bd具有核定位序列(nuclear-localization sequence),而GAL4-ad 没有。

因此,在GAL4-ad氨基端或羧基端应克隆来自SV40的T-抗原的一段序列作为核定位的序列。

双杂交系统的另一个重要的元件是报道株。

报道株指经改造的、含报道基因(reporter gene)的重组质粒的宿主细胞。

最常用的是酵母细胞,酵母细胞作为报道株的酵母双杂交系统具有许多优点: 〈1〉易于转化、便于回收扩增质粒。

〈2〉具有可直接进行选择的标记基因和特征性报道基因。

〈3〉酵母的内源性蛋白不易同来源于哺乳动物的蛋白结合。

一般编码一个蛋白的基因融合到明确的转录调控因子的DNA-结合结构域(如GAL4-bd,LexA-bd);另一个基因融合到转录激活结构域(如GAL4-ad, VP16)。

激活结构域融合基因转入表达结合结构域融合基因的酵母细胞系中,蛋白间的作用使得转录因子重建导致相邻的报道基因表达(如lacZ),从而可分析蛋白间的结合作用。

酵母双杂一缺二缺三缺板原理

酵母双杂一缺二缺三缺板原理1. 酵母的基本知识说到酵母,大家可能脑海里第一反应就是泡面或是烘焙,那种面包香味扑鼻而来,是不是很诱人?其实,酵母可不是一个简单的小家伙,它是个微小的生物,专门负责发酵的工作。

发酵就像是酵母的魔法秀,能把糖变成酒精和二氧化碳,气泡冒出来,面团变得松软,味道也香得不得了。

说白了,酵母就像是厨房里的小魔法师,没它,咱们的面包和啤酒都要失色不少。

1.1 酵母的类型酵母种类可多了,最常见的就是酿酒酵母,咱们叫它“萨克酵母”。

它在酿酒和面包制作中是明星级的角色,绝对不容小觑。

还有一种叫“啤酒酵母”,专门为啤酒服务,给啤酒增加那种独特的风味。

虽然它们小,但可不简单,生存能力强得很,能够在各种环境下活得滋润。

1.2 酵母的作用那酵母到底怎么工作呢?你看啊,它在发酵的过程中,糖被它转化成二氧化碳和酒精,就像我们喝酒前的那种兴奋感,都是酵母的功劳。

其实,发酵也能产生一些有益的营养成分,对我们的肠胃好得很,简直是健康饮食的小帮手。

2. 双杂交实验好啦,咱们进入正题,今天要说的就是酵母双杂交实验。

别被这个名字吓到,其实说白了就是利用两种不同的酵母,进行基因的互换。

简单点说,就像是把两个不同的风味结合在一起,结果可能会让你惊艳。

2.1 双杂交的意义这双杂交实验可有意思了!它帮助科学家了解基因之间的相互作用。

就好比一个团队,里面有不同的成员,大家各自发挥自己的特长,才能把工作做得更好。

通过双杂交实验,科学家能找到哪些基因是互相影响的,哪些是“缺位”的,没参与其中。

这样一来,咱们就能对基因的功能有更深入的认识,能说是如虎添翼。

2.2 实验步骤双杂交的步骤其实也挺简单的。

首先,科学家得选择两种酵母,别忘了,还要在基因层面做些小手脚。

接着,把它们培养在一起,看看有没有什么新鲜的变化。

如果碰巧“碰撞”出新组合,那就太棒了,就像在厨师和食材的结合中,爆发出意想不到的美味。

3. 缺失实验再来说说缺失实验,这个听上去有点复杂,但其实不然。

酵母双杂交实验 教案

酵母双杂交(Yeast Two-Hybrid)一、实验目的掌握酵母双杂交原理和方法。

二、实验原理酵母双杂交系统的原理是利用转录激活因子在结构上是组件式的,即这些因子往往由两个或两个以上相互独立的结构域构成,其中有DNA结合结构域(DNA binding domain, DB)和转录激活结构域(activation domain, AD),它们是转录激活因子发挥功能所必需的。

单独的DB虽然能和启动子结合,但是不能激活转录。

而不同转录激活因子的DB和AD形成的杂合蛋白仍然具有正常的激活转录的功能。

根据转录因子的这一特性,将BD 与已知的诱饵蛋白质X 融合,构建出BD-X质粒载体;将AD 基因与cDNA 文库,基因片段或基因突变体(以Y表)融合,构建AD-Y质粒载体。

两个穿梭质粒载体共转化至酵母体内表达。

蛋白质X 和Y的相互作用导致了BD与AD在空间上的接近,从而激活UAS 下游启动子调节的酵母菌株特定报告基因(如ADE2,HIS3,MEL1或 LacZ)等的表达,使转化体由于HIS3 或LEU2 表达,而可在特定的缺陷培养基上生长,同时因LacZ 表达而在X-Gal 存在下显蓝色。

图 1-1 酵母双杂交基本原理酵母双杂交系统在发展中增添了接合型酵母双杂交和反向酵母双杂交系统。

其中接合型双杂交系统就是已预先将文库转化了某个接合型的单倍体酵母,然后再和转化了诱饵质粒的相反接合型的单倍体进行接合,形成二倍体,并检测报告基因的表达。

酵母双杂交系统由三个部分组成:(1)与DBD融合的蛋白表达载体,被表达的蛋白称诱饵蛋白(bait)。

(2)与AD融合的蛋白表达载体,被表达的蛋白称靶蛋白(prey)。

(3)带有一个或多个报告基因的宿主菌株。

常用的报告基因有HIS3,URA3,LacZ和ADE2等。

而菌株则具有相应的缺陷型。

双杂交质粒上分别带有不同的抗性基因和营养标记基因。

这些有利于实验后期杂交质粒的鉴定与分离。

酵母双杂交系统常应用在:(1)研究两个已知蛋白是否存在相互作用,同一蛋白是否有自身相互作用以及相互作用的分子区域。

酵母双杂交

酵母双杂交系统(yeast two-hybrid system)是在酵母体内分析蛋白质-蛋白质相互作用的基因系统,也是一个基于转录因子模块结构的遗传学方法。

该法由Fields等人于1989年首次建立并得到广泛地应用。

酵母双杂交衍生系如酵母双杂交的二元诱饵系统、逆向双杂交系统、非转录读出特点…酵母双杂交系统(yeast two-hybrid system)是在酵母体内分析蛋白质-蛋白质相互作用的基因系统,也是一个基于转录因子模块结构的遗传学方法。

该法由Fields等人于1989年首次建立并得到广泛地应用。

酵母双杂交衍生系如酵母双杂交的二元诱饵系统、逆向双杂交系统、非转录读出特点的双杂交系统(如Sos蛋白招募系统、PI3K介导的靶蛋白识别系统和断裂-泛素为基础的双杂交系统)以及转录激活因子与其相关蛋白之间的相互作用的双杂交系统(如以polⅢ为基础的杂交系统和RTA系统)等在很大程度上克服了传统酵母双杂交系统的局限性,扩大了被研究的蛋白质的范围,提高了系统的灵敏度。

酵母双杂交及其衍生系统是鉴定及分析蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA、蛋白质-RNA相互作用的最常用、最有效的工具之一。

一、酵母双杂交系统原理双杂交系统的建立得力于对真核生物调控转录起始过程的认识。

细胞起始基因转录需要有反式转录激活因子的参与。

80年代的工作表明,转录激活因子在结构上是组件式的(modular), 即这些因子往往由两个或两个以上相互独立的结构域构成, 其中有DNA结合结构域(DNA binding d omain,简称为DB)和转录激活结构域(activation d omain,简称为AD),它们是转录激活因子发挥功能所必需的。

前者可识别DNA上的特异序列,并使转录激活结构域定位于所调节的基因的上游,转录激活结构域可同转录复合体的其他成分作用,启动它所调节的基因的转录。

二个结构域不但可在其连接区适当部位打开,仍具有各自的功能,而且不同两结构域可重建发挥转录激活作用。

酵母双杂交原理介绍

酵母双杂交技术酵母双杂交技术¾酵母双杂交系统( two-hybridsystem) 也叫相互作用陷阱( interaction trap),是1989年由Song和Field基于酵母的细胞内检测蛋白间相互作用的遗传系统建立的。

¾酵母双杂交技术是一种有效的真核活细胞内研究方法,在蛋白质相互作用的研究方面得到了广泛的应用并取得了许多有价值的重要发现。

在此基础上又发展了反向双杂交,三杂交及核外双杂交等多项技术。

Stanley Field酵母双杂交技术的提出2.酵母双杂交原理介绍酵母中,半乳糖代谢所需的基因被两个调节蛋白所控制:GAL4,GAL80当存在半乳糖时,GAL4蛋白与UAS上游的基因中的GAL4效应元件结合,激活转录。

不存在半乳糖时,GAL80结合GAL4阻碍转录激活。

2.酵母双杂交原理介绍完整的酵母转录因子GAl4分为结构上可以分开的、功能上又相互独立的2个结构域。

一个是位于N端1-174位氨基酸残基区段的DNA结合域(DNA binding domain, DNA-BD)。

另一个是位于C端768~881位氨基酸残基区段的转录激活域(Activation domain,AD)。

酵母双杂交技术原理很多真核生物的位点特异转录激活因子通常具有两个可分割开的结构域,即DNA特异结合域(DNA-binding domain,BD)与转录激活域(Transcriptional activation domain ,AD)。

这两个结构域各具功能,互不影响。

但一个完整的激活特定基因表达的激活因子必须同时含有这两个结构域,否则无法完成激活功能。

酵母双杂交系统组成酵母双杂交系统由三个部分组成:(1)与BD融合的蛋白表达载体,被表达的蛋白称诱饵蛋白(bait);(2)与AD融合的蛋白表达载体,被其表达的蛋白称靶蛋白(prey);(3)带有一个或多个报告基因的宿主菌株。

常用的报告基因有HIS3,URA3,LacZ和绿色荧光蛋白等2.酵母双杂交原理介绍一个酵母双杂交系统包括3个部分:带有1个或多个报告基因的宿主菌株;与GAL4-BD 融合表达蛋白,被表达的蛋白称为旅馆诱饵蛋白(bait);GAL4-AD 融合表达载体,被表达的蛋自称为靶蛋白(prey)。

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酵母双杂交的原理
酵母双杂交(YeastTwo-hybridSystem,Y2H)是一种具有实验性方法的蛋白质相互作用实验,它可以用来验证和确定两个蛋白在体内及体外之间存在相互作用。

这种蛋白质相互作用可以发生在体内,也可以发生在体外。

在这种实验中,使用的物质是由两个融合的蛋白质组成的双融合蛋白,一个蛋白是结合调控区或结合位点,另一个蛋白质是响应元件,它可以检测到调控区里结合的物质的存在,从而启动一系列的反应,其结果是显示双杂交蛋白中调控区是否与响应元件相结合。

二、酵母双杂交的原理
酵母双杂交的基本原理源于酵母菌的基因调控机制。

它的基本原理是,将一个结合调控区的蛋白(称为“结合蛋白”)与一个响应元件(称为“受体蛋白”)结合起来,当结合蛋白结合到调控区并激活响应元件时,酵母细胞就会对外在的细胞因子做出反应。

当结合蛋白结合调控区并激活响应元件时,酵母细胞就会产生一种光变化,从而表明蛋白质之间存在相互作用。

简单地说,酵母双杂交的原理是利用双融合蛋白将一个结合调控区的蛋白和一个响应元件结合在一起,当结合调控区的蛋白结合到结合调控区时,响应元件就会激活,酵母细胞就会产生一些外在细胞因子,如光变化。

从而可以检测到蛋白质之间发生相互作用。

三、酵母双杂交的应用
酵母双杂交技术的应用非常广泛,可以用来验证和确定蛋白质之
间的相互作用,也可以用来研究蛋白的结构和功能,并有助于发现新的药物靶标。

此外,它也可以用于研究基因调控机制,研究染色体的结构,以及研究蛋白质和核酸之间的相互作用等。

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