嗜热脂肪土芽孢杆菌普鲁兰酶基因的异源表达及重组酶性质

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嗜热脂肪芽孢杆菌中普鲁兰酶的分离纯化

嗜热脂肪芽孢杆菌中普鲁兰酶的分离纯化

嗜热脂肪芽孢杆菌中普鲁兰酶的分离纯化
赵淑琴;杨孝朴;胡先望
【期刊名称】《甘肃农业大学学报》
【年(卷),期】2011(046)004
【摘要】嗜热脂肪芽孢杆菌经细胞破碎机破壁后,采用硫酸铵盐析法除杂蛋
白,DEAE-32阴离子交换纤维素纯化胞内普鲁兰酶,并通过L9(34)正交试验优化盐析除杂蛋白工艺条件.结果表明:菌体与缓冲液比1:3、硫酸铵饱和度40%、pH值7.0分离效果最佳,其中,pH值对分离效果的影响差异性显著(F>F0.05);纯化后的普鲁兰酶比活力为26.50 U/mg,纯化倍数为8.01,回收率为73%;经SDS-PAGE 检测,显示一条电泳区带,相对分子质量为55.4ku,表明获得了纯酶.
【总页数】6页(P133-138)
【作者】赵淑琴;杨孝朴;胡先望
【作者单位】甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070;甘肃省商业科技研究所,甘肃兰州730020;甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070;甘肃省商业科技研究所,甘肃兰州730020
【正文语种】中文
【中图分类】Q55
【相关文献】
1.嗜热脂肪芽孢杆菌普鲁兰酶酶学性质研究 [J], 赵淑琴;杨孝朴;刘霞;杨学山
2.嗜热脂肪土芽孢杆菌普鲁兰酶基因的异源表达及重组酶性质 [J], 肖亚朋;沈微;李
婷霖;陈献忠;樊游
3.热协同超高压对不同介质中嗜热脂肪芽孢杆菌芽孢的灭活作用 [J], 武玉艳;李汴生;阮征;黄娟
4.嗜热脂肪芽孢杆菌检测牛奶中抗生素残留的研究 [J], 杨起恒;李红
5.嗜热脂肪土芽孢杆菌木聚糖酶基因的合成及其在大肠杆菌中的表达(英文) [J], 张志刚;裴小琼;吴中柳
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嗜热脂肪地芽孢杆菌NAD激酶克隆表达及酶学性质研究

嗜热脂肪地芽孢杆菌NAD激酶克隆表达及酶学性质研究

嗜热脂肪地芽孢杆菌NAD激酶克隆表达及酶学性质研究侯堃;李红梅;侯立琪【期刊名称】《工业微生物》【年(卷),期】2014(44)6【摘要】NAD激酶能催化NAD生成NADP.本研究采用PCR技术从嗜热脂肪地芽孢杆菌基因组中获得NAD激酶基因,以pET30a(+)为表达载体、E.coliBL21(DE3)为宿主菌,实现其在大肠杆菌中异源表达,并进行酶学性质研究.结果显示,嗜热脂肪地芽孢杆菌中NAD激酶编码基因大小为816 bp,酶分子量大约为35 kD.酶学性质分析表明,来源于嗜热脂肪地芽孢杆菌的NAD激酶最适反应温度和pH分别为35℃、pH 7.5,在35℃中保温2h后仍能保持80%左右的活性.Mn2+、Ca2+对该酶有较强的激活作用,在最适反应条件下该酶的比活力为4.43 U/mg.动力学性质分析结果显示NAD激酶对底物NAD催化的Km和Vmax分别为1.46 mmol/L和0.25 μmol/(L·min).NAD激酶在大肠杆菌的异源表达为以NAD为底物生物合成NADP提供了更多生物资源.【总页数】6页(P39-44)【作者】侯堃;李红梅;侯立琪【作者单位】上海理工大学医疗器械与食品学院,上海200093;上海理工大学医疗器械与食品学院,上海200093;上海立瞻生物科技有限公司,上海200000【正文语种】中文【相关文献】1.嗜热脂肪芽孢杆菌普鲁兰酶酶学性质研究 [J], 赵淑琴;杨孝朴;刘霞;杨学山2.嗜热脂肪芽孢杆菌木聚糖酶A的H297F定点突变、表达及酶学性质变化 [J], 李婵娟;石慧;王曼玥;王婧3.短小芽孢杆菌脂肪酶基因的克隆、表达及酶学性质研究 [J], 苏二正;吴向萍;高蓓;魏东芝4.嗜热脂肪芽孢杆菌氨基酰化酶在大肠杆菌中的克隆、表达及细胞固定化研究 [J], 苏志鹏;张培德5.嗜热玫瑰红球菌嗜热脂肪酶的重组表达与酶学性质研究 [J], 周艳杰;耿鹏;时祎;顾正华;辛瑜;石贵阳;张梁因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

在枯草芽孢杆菌中高效表达普鲁兰酶的方法及重组枯草芽孢杆菌[发明专利]

在枯草芽孢杆菌中高效表达普鲁兰酶的方法及重组枯草芽孢杆菌[发明专利]

专利名称:在枯草芽孢杆菌中高效表达普鲁兰酶的方法及重组枯草芽孢杆菌
专利类型:发明专利
发明人:李阳源,王建荣,杨玲,瞿曼,陈丽芝,黄佳乐
申请号:CN201710032183.9
申请日:20170116
公开号:CN106754833A
公开日:
20170531
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明涉及基因工程领域,具体涉及在枯草芽孢杆菌中高效表达普鲁兰酶的方法及重组枯草芽孢杆菌。

所述方法包括构建碱性蛋白酶和中性蛋白酶缺失的枯草芽孢杆菌菌种;构建包含启动子、信号肽和普鲁兰酶基因的表达载体;将上述载体导入上述枯草芽孢杆菌中。

本发明分别组合优化了表达普鲁兰酶的启动子和信号肽,最终得到了一系列能高效表达普鲁兰酶的启动子和信号肽,为普鲁兰酶的工业化应用奠定基础。

申请人:广东溢多利生物科技股份有限公司
地址:519060 广东省珠海市南屏科技工业园屏北一路8号
国籍:CN
代理机构:北京法思腾知识产权代理有限公司
代理人:高宇
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一种中性普鲁兰酶的高效表达及重组酶在粉丝制作中的应用

一种中性普鲁兰酶的高效表达及重组酶在粉丝制作中的应用

一种中性普鲁兰酶的高效表达及重组酶在粉丝制作中的应用王婕; 朱新文; 德青美朵; 姚雁; 沈微; 陈献忠; 樊游【期刊名称】《《食品与发酵工业》》【年(卷),期】2019(045)014【总页数】6页(P122-127)【关键词】普鲁兰酶; 嗜热脂肪土芽孢杆菌; 马铃薯粉丝【作者】王婕; 朱新文; 德青美朵; 姚雁; 沈微; 陈献忠; 樊游【作者单位】工业生物技术教育部重点实验室(江南大学) 江苏无锡 214122; 无锡先秦生物科技有限公司江苏无锡 214073; 江南大学中国高校工业微生物资源数据平台江苏无锡 214122【正文语种】中文粉丝是我国具有悠久历史的传统美食,深受各族人民的喜爱。

传统的粉丝制作原料主要是绿豆淀粉,近年来由于绿豆价格上涨,以薯类淀粉为原料的粉丝市场占有量不断上升。

传统的薯类淀粉粉丝生产工艺一般需要加入明矾,以提高粉丝的韧性。

过量摄入明矾会损害人体健康[1],因此寻找合适的明矾替代物是一个关系我国人民群众健康的重要研究课题。

近年来研究者尝试了黄原胶、魔芋胶、复合磷酸盐等多种明矾替代物[2-5],这在一定程度上解决了明矾的问题。

本文作者在前期工作中通过用普鲁兰酶处理芡糊,建立了一种完全不使用明矾的薯类淀粉粉丝制作方法,所制作的粉丝质量与添加明矾的粉丝基本一致[6]。

普鲁兰酶的处理可以提高芡糊中直链淀粉的含量,这可能是其提高粉丝质量的关键原因。

有研究表明直链淀粉溶液在温度下降时发生不可逆凝胶化和结晶,形成淀粉的短期回生现象[7-8]。

回生是粉丝制作中的重要环节,芡糊制作和后期粉丝成型晾干都涉及短期回生,这与淀粉凝胶形成和凝胶软硬度直接相关,进而影响粉丝的品质[9]。

谭洪卓等[5]研究了不同添加剂对甘薯粉丝回生的影响,其中明矾对于甘薯淀粉糊的保持强度、最终黏度和回生值的影响最为明显,但其指标仍未超过绿豆淀粉。

绿豆粉丝中含有35%以上的直链淀粉,使其凝胶强度大,粉丝韧性高,且回生产生的紧密结构也使绿豆淀粉不易糊汤,因此绿豆粉丝的质量普遍好过红薯粉丝和马铃薯粉丝[10-11]。

海洋交替单胞菌(Alteromonas sp.Y-389)普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析

海洋交替单胞菌(Alteromonas sp.Y-389)普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析

海洋交替单胞菌(Alteromonas sp.Y-389)普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析魏家强; 高志远; 陈颢【期刊名称】《《海洋科学进展》》【年(卷),期】2019(037)004【总页数】9页(P664-672)【关键词】Alteromonassp.; 普鲁兰酶; 克隆与表达; 酶学性质【作者】魏家强; 高志远; 陈颢【作者单位】自然资源部第一海洋研究所山东青岛 266061【正文语种】中文【中图分类】Q814.1普鲁兰酶(Pullulanase,EC 3.2.1.41)是一类淀粉脱支酶,可以专一的切开支链淀粉中的α-1,6糖苷键,由于众多的淀粉原材料中支链淀粉含量较高,普鲁兰酶可以使淀粉原料的利用更加充分,使得淀粉原材料的利用率提高,产品的质量也增加,因此,在淀粉加工业中有重要的应用价值[1]。

按照普鲁兰酶水解位点的不同可将其分为I型普鲁兰酶和II型普鲁兰酶两种类型。

I型普鲁兰酶属于糖苷水解酶13家族,专一性水解糖苷键,具有特异性的4种结构域,水解形成麦芽三糖和线性的以α-1,4-糖苷键连接的多聚物;Ⅱ 型普鲁兰酶,也被称为淀粉普鲁兰酶,它对α-1,6糖苷键与α-1,4糖苷键均具有水解作用。

此外,普鲁兰酶在洗涤剂行业、纺织业和医学上也有很好的应用前景[2-4]。

有关普鲁兰酶的研究已经将近60多a的历史,1961年能够产生普鲁兰酶的产气杆菌(Aerobacter aerogenes)被首次报道[5]。

随后,许多普鲁兰酶被发现并研究,但是由于不同的野生菌具有不同的最适生存条件,野生菌产的普鲁兰酶表达能力很差,因此无法应用到真正的工业生产中。

因此,只有通过基因工程的手段构建异源表达系统使用工程菌产生大量的酶以满足需要。

20世纪90年代以来,新的普鲁兰酶基因异源表达载体被不断构建成功,而且酶学性能有了很大提高,例如,1985年Mikami等[6-7]鉴定了来源于Klebsiella pneumoniae的普鲁兰酶编码基因,随后其又成功的解析了它的晶体结构,为普鲁兰酶的结构研究提供了模型支持。

【CN109880783A】一种嗜热重组II型普鲁兰酶及其应用【专利】

【CN109880783A】一种嗜热重组II型普鲁兰酶及其应用【专利】

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201910318050.7(22)申请日 2019.04.19(71)申请人 江南大学地址 214000 江苏省无锡市蠡湖大道1800号(72)发明人 周哲敏 周丽 崔文璟 刘中美 庞博 (74)专利代理机构 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211代理人 林娟(51)Int.Cl.C12N 1/21(2006.01)C12N 15/56(2006.01)C12N 9/44(2006.01)C12N 15/70(2006.01)C12P 19/14(2006.01)C12P 19/00(2006.01)C12P 19/04(2006.01)C12P 7/48(2006.01)C12R 1/19(2006.01)(54)发明名称一种嗜热重组II型普鲁兰酶及其应用(57)摘要本发明公开了一种嗜热重组II型普鲁兰酶及其应用,属于基因工程技术领域。

本发明通过在大肠杆菌中异源表达II型普鲁兰酶,获得一种嗜热重组II型普鲁兰酶,其最适pH为6.6,在pH5.8-8.0条件下有较好的pH耐受性,最适温度为95℃,在95℃保温10h,剩余酶活大于50%,能够在强还原条件下展现出较高的比酶活,如在培养环境中加入DTT ,能使Sumo -Pul Py 比酶活提升237.2%。

本发明还提供了II型普鲁兰酶Sumo -Pul Py 的组合截断突变体△28N+△791C,该酶突变体的比酶活为32.18±0.92U/mg,是野生酶的5.99倍,具有重要的工业应用价值和潜力。

权利要求书1页 说明书6页序列表11页 附图7页CN 109880783 A 2019.06.14C N 109880783A权 利 要 求 书1/1页CN 109880783 A1.一种重组大肠杆菌,其特征在于,(1)表达了SEQ ID NO.3所编码的II型普鲁兰酶;或,(2)表达了SEQ ID NO.1所编码的II型普鲁兰酶,且在含有强还原试剂的培养环境中蛋白分泌能力增强。

Thermotoga petrophila普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析

Thermotoga petrophila普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析

第52卷㊀第3期河南农业大学学报Vol.52㊀No.32018年㊀㊀6月JournalofHenanAgriculturalUniversityJun.㊀2018收稿日期:2017-11-03基金项目:科技部 十二五 农村领域科技计划项目(2013AA102101 ̄2)ꎻ河南省重点科技攻关计划项目(142102110086)作者简介:邢岩(1992 )ꎬ男ꎬ河南信阳人ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事酶工程研究ꎮ通信作者:王明道(1972 )ꎬ男ꎬ河南新野人ꎬ副教授ꎬ博士ꎮ文章编号:1000-2340(2018)03-0404-08Thermotogapetrophila普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析邢岩1ꎬ邱爽1ꎬ聂慧慧1ꎬ孙利鹏2ꎬ邱立友1ꎬ王明道1(1.河南农业大学生命科学学院ꎬ农业部农业微生物酶工程重点实验室ꎬ河南郑州450002ꎻ2.河南仰韶生化工程有限公司ꎬ河南渑池472400)摘要:通过生物信息学筛选出来源于超嗜热菌Thermotogapetrophila(DSM13995)的普鲁兰酶基因ꎬ以从德国菌种保藏中心购买的基因组作为出发材料ꎬ克隆出普鲁兰酶基因TP ̄pulAꎻ通过二步PCR方法构建含有该嗜热普鲁兰酶基因的载体pET21a ̄TP ̄pulAꎻ将重组质粒转入大肠杆菌Rosetta(DE3)中测定其酶学性质ꎮ结果表明ꎬTP ̄pulA为Ⅰ型普鲁兰酶ꎬ最适pH值为6.4ꎬ最适温度是85ħꎬ半衰期为26.28hꎬNa+㊁K+㊁Ca2+㊁Mg2+对其酶活性有明显的促进作用ꎬMn2+㊁Co2+㊁AL3+㊁Fe3+㊁SDS及EDTA对酶活性有不同程度的抑制作用ꎬKm㊁Vmax㊁Kcat及Kcat/Km值分别为0.72g L-1㊁0.0049mmol L-1 s-1㊁154.63s-1㊁214.76L g-1 s-1ꎮ本研究采用的生物信息学方法比传统的筛菌方法简单方便耗时短ꎬ且获得的嗜热普鲁兰酶的热稳定性好㊁催化效率高㊁对普鲁兰糖有较强的底物亲和能力ꎬ具有良好的应用前景ꎮ关键词:超嗜热菌ꎻ普鲁兰酶ꎻThermotogapetrophilaꎻ异源表达ꎻ酶学性质分析中图分类号:Q556.2㊀㊀㊀㊀文献标志码:AHeterologousexpressionandenzymaticcharacterizationofthepullulanasefromThermotogapetrophilaXINGYan1ꎬQIUShuang1ꎬNIEHuihui1ꎬSUNLipeng2ꎬQIULiyou1ꎬWANGMingdao1(1.KeyLaboratoryofEnzymeEngineeringofAgriculturalMicrobiologyofMinistryofAgricultureꎬCollegeofSciencesꎬHenanAgriculturalUniversityꎬZhengzhou450002ꎬChinaꎻ2.HenanYangshaoBio ̄productsCo.ꎬLtd.ꎬMianchi472400ꎬChina)Abstract:ThepullulanasegenewasscreenedfromthehyperthermophilicbacteriumThermotogapetro ̄phila(DSM13995)bybioinformaticsandthegeneTP ̄pulAwasclonedusingthegenomepurchasedfromtheLeibnizInstituteDSMZ ̄GermanCollectionofMicroorganismsandCellCulturesasthestartingmaterial.ThecarrierpET21acontainingthepullulanasegenewasconstructedbythetwo ̄stepPCRmethod.TherecombinantplasmidwastransferredintotheEscherichiacoliRosetta(DE3)andtheen ̄zymaticpropertiesweredetermined.TheresultsshowedthatTP ̄pulAwasatypeⅠpullulanase.TheoptimumpHwas6.4andtheoptimumtemperaturewas85ħ.Thehalf ̄lifetimewas26.28handNa+ꎬK+ꎬCa2+ꎬMg2+hadasignificantenhancementontheenzymeactivity.Mn2+ꎬCo2+ꎬAL3+ꎬFe3+ꎬSDSandEDTAinhibitedtheactivityofenzymesindifferentdegreesandthevalueofKmꎬVmaxꎬKcatandKcat/Kmwas0.72g L-1ꎬ0.0049mmol L-1 s-1ꎬ154.63s-1ꎬ214.76L g-1 s-1ꎬrespectively.第3期邢岩ꎬ等:Thermotogapetrophila普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析405㊀Thebioinformaticsanalyticalmethodinthisstudywassimpleꎬconvenientꎬandtime ̄savingꎬcomparedwiththetraditionalmethodofscreening.Thehighthermalstabilityꎬcatalysisefficiencyandsubstrateaffinityofthispullulanasehadagoodapplicationforeground.Keywords:hyperthermophilicbacteriumꎻpullulanaseꎻThermotogapetrophilaꎻheterologousexpres ̄sionꎻanalysisofenzymaticproperties㊀㊀普鲁兰酶(Pullulanase)作为一种重要的淀粉脱支酶[1]ꎬ可以水解支链淀粉中的α-1ꎬ6-糖苷键ꎬ从而提高淀粉的水解效率ꎮ工业上在淀粉的糖化反应中加入普鲁兰酶ꎬ可以使糖化值达到97%~98%[2]ꎮ普鲁兰酶根据作用位点的不同分为2类[3]:Ⅰ型普鲁兰酶(TypeIpullulanaseꎬEC.3.2.1.41)ꎬ专一性水解普鲁兰糖和支链淀粉中的α-1ꎬ6-糖苷键ꎬ生成麦芽三糖和直链淀粉ꎬ属于糖苷水解酶GH13家族(GlycosideHydrolase13ꎬGH13)ꎬ在数据库中公布的比较多ꎬ如Thermuscal ̄dophilusGK ̄24[4]和BacillusthermoleovoransUS105[5]的普鲁兰酶ꎻⅡ型普鲁兰酶(TypeⅡpul ̄lulanaseꎬEC.3.2.1.1/41)ꎬ又称淀粉普鲁兰酶(AmylopullulanseꎬApase)[6]ꎮ它既能水解普鲁兰糖和支链淀粉中的α ̄1ꎬ6 ̄糖苷键ꎬ又能水解淀粉中的α ̄1ꎬ4 ̄糖苷键[7]ꎮⅡ型普鲁兰酶最早由KURIKI等[8]在Bacillusstearothermophilus的发酵中获得ꎮ后来研究人员在Sulfolobusacidocaldarius[9]㊁Ther ̄mococcushydrothermalis[10]中也发现了这种普鲁兰酶ꎮⅡ型普鲁兰酶属于糖苷水解酶GH13和GH57家族[11]ꎮ根据反应温度的不同可以将普鲁兰酶分为低温酶㊁中温酶㊁嗜热酶和超嗜热酶ꎮ低温酶的作用温度一般为2~20ħꎬ这一类酶在数据库中鲜有报道ꎻ中温普鲁兰酶的作用温度一般为20~55ħꎬ在酶数据库BRENDA(http://www.brenda ̄enzymes.org/)中收录了18个中温普鲁兰酶ꎻ嗜热普鲁兰酶是指作用温度在55~80ħ的普鲁兰酶ꎬ这类酶具有较高的热稳定性ꎬ在数据库BRENDA中收录了17个嗜热普鲁兰酶ꎬ如YAMASHITA等[12]从Klebsiella中克隆出的普鲁兰酶ꎬ该酶最适温度60ħꎬ最适pH值为5.5ꎬ相对分子量为65kDꎻ超嗜热普鲁兰酶则是指作用温度在80ħ以上的普鲁兰酶ꎬ在数据库BRENDA中收录了21个超嗜热普鲁兰酶ꎬ如BADAL等[13]从Clostridiumthermohydrosulfuricum克隆出的超嗜热普鲁兰酶ꎬ其最适温度为90ħꎮ普鲁兰酶在工业上的应用非常广泛ꎬ但目前报道的大部分普鲁兰酶的热稳定性和比酶活性不高ꎬ或是不能适应酸性高温的作用环境ꎮ因此ꎬ寻找并获得高比酶活性并耐酸耐热的普鲁兰酶就显得尤为重要ꎮ目前ꎬ中国对于新普鲁兰酶的发现主要借助于传统的筛菌ꎬ这种方法既耗时又费力ꎬ且往往达不到预想的效果ꎮ大多数嗜热酶都来源于嗜热微生物ꎮ这部分微生物生长温度比较高ꎬ绝大多数属于厌氧微生物ꎬ筛选和培养比较困难ꎮ而通过生物信息学筛选ꎬ可以从许多菌种保藏中心获得含有该嗜热酶基因的微生物ꎮ另外ꎬ微生物酶在其野生菌株中的表达量都比较低ꎬ借助于异源表达系统可以实现微生物酶的高效表达ꎮ本研究所筛选的Thermotogapetrophila是TAKAHATA等[14]从日本新舄县的油田中分离出来的一株严格厌氧的超嗜热菌ꎬ其最佳生长温度为80ħꎬ基因组全长为1823kbꎬ含有多个注释的酶基因ꎬ包括内切α ̄1ꎬ5 ̄L ̄阿拉伯糖酶[15-16]㊁木聚糖酶[17]㊁内切β ̄1ꎬ4 ̄甘露聚糖酶[18]㊁内切β ̄1ꎬ4 ̄葡聚糖酶[19]和α ̄淀粉酶[20]ꎮ经生物信息学分析显示该菌基因组上含有普鲁兰酶基因ꎬ且对应氨基酸序列为普鲁兰酶ꎮ因此ꎬ以德国菌种保藏中心购买的基因组为模板ꎬ将该普鲁兰酶基因异源表达后进行酶学性质分析ꎬ通过生物信息学筛选方法获得酶学性质优良的普鲁兰酶ꎬ为新酶的开发提供了思路ꎮ1㊀材料与方法1.1㊀试验材料pET21a质粒㊁大肠杆菌Rosetta(DE3)和DH5α菌株均为河南农业大学酶工程重点实验室所保藏ꎮThermotogapetrophila(DSM13995)的基因组购自德国菌种保藏中心DSMZ(https://www.dsmz.de/)ꎮ1.2㊀试剂与药品普鲁兰糖购于东京化成工业株式会社(日本)ꎬ优级纯ꎻSDS㊁EDTA㊁IPTG㊁氯霉素㊁氨苄青霉素和琼脂购于索莱宝(北京)科技有限公司ꎬ分析纯ꎻ酵母提取物㊁胰蛋白胨购于OXID(英国)公司ꎬ分析纯ꎻNa2HPO4㊁NaH2PO4㊁NaCl㊁KCl㊁CaCl2㊁MgCl2㊁ZnCl2㊁MnCl2㊁CoCl2㊁AlCl3㊁FeCl3购于国药集团(上海)化学试剂有限公司ꎬ分析纯ꎻ葡萄糖㊁麦芽二糖购于永大(天津)化学试剂有限公司ꎬ分析纯ꎻ麦芽三糖购于阿拉丁(上海)有限公司产品ꎬ406㊀河㊀南㊀农㊀业㊀大㊀学㊀学㊀报第52卷分析纯ꎮCo2+螯合琼脂糖凝胶TALONMetalAffin ̄ityResin购于TaKaRa(日本)公司ꎻT4DNALigaseꎬQ5超保真DNA聚合酶购于NEB(美国)公司ꎻλ ̄HindⅢDNAMarker购于近岸蛋白质(上海)科技有限公司ꎻ蛋白质Marker购于Smobio(台湾)科技有限公司ꎻ琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒ꎬDNA产物纯化试剂盒ꎬ质粒小量提取试剂盒购于索莱宝(北京)科技有限公司ꎻ所有的引物合成和测序工作均由金唯智(苏州)科技有限公司完成ꎮ1.3㊀耐热普鲁兰酶基因的筛选从数据库KEGG(http://www.kegg.jp/)中查找关键词 pullulanase ꎬ将所有的注释的来源于嗜热菌的普鲁兰酶候选基因保存下来ꎮ将其中相应的氨基酸序列放在BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)中进行保守序列的分析ꎬ将分析结果中有 pulA ̄typeI 的氨基酸序列的作为主要分析对象ꎮ把相应的菌株名在PubMed(ht ̄tps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)中进行查找ꎬ确认该菌株中没有发表的关于普鲁兰酶的文章ꎮ最后从德国菌种保藏中心购买相应嗜热菌的基因组ꎮ1.4㊀重组质粒的构建参照韩来闯等[21]方法ꎬ通过二步PCR法构建重组质粒ꎮ根据已公布的嗜热菌株Thermotogapetrophila的普鲁兰酶基因序列设计并合成引物:F:5ᶄCATATGGTGAAGACTAAACTCTGGTTGTTA3ᶄꎬ引物5ᶄ端做磷酸化处理ꎻR:5ᶄGGTGGTGGTGGTG ̄GTGCTCTCTGTACAAAACGTACGCG3ᶄꎬ引物5ᶄ端含有一段载体上的序列ꎮPCR扩增嗜热菌Thermotogapetrophila(DSM13995)中的普鲁兰酶基因TP ̄pulAꎬ反应体系(50μL):ddH2Oꎬ34μLꎻ5ˑQ5反应缓冲液ꎬ10.0μLꎻ10mmol L-1dNTPsꎬ1.0μLꎻ10μmol L-1上游特异引物Fꎬ2μLꎻ10μmol L-1下游特异引物Rꎬ2μLꎻDNA模板(TP基因组)ꎬ0.5μLꎬ2U μL-1Q5酶ꎬ0.5μLꎮ反应条件:98ħ预变性3minꎬ98ħ变性40sꎬ63ħ退火40sꎬ72ħ延伸1min20sꎬ共25个循环ꎬ72ħ延伸4minꎮ切胶纯化后4ħ保存备用ꎮ设计引物VR:5ᶄGTATATCTCCTTCTTAAAGT ̄TAAACAAAATTATTTCTA3ᶄꎬ引物5ᶄ端磷酸化ꎮ然后以纯化后的TP ̄pulA为上游引物ꎬVR为下游引物ꎬ设置反应体系(50μL):ddH2Oꎬ25.5μLꎻ5ˑQ5反应缓冲液ꎬ10.0μLꎻ10mmol L-1dNTPsꎬ1.0μLꎻ20ng μL-1TP ̄pulA长引物ꎬ10μLꎻ10μmol L-1VRꎬ2μLꎻDNA模板(pET21a)ꎬ0.5μLꎬ2U μL-1Q5酶ꎬ0.5μLꎮ反应条件:98ħ预变性3minꎬ98ħ变性40sꎬ64ħ退火40sꎬ72ħ延伸4minꎬ共20个循环ꎬ72ħ延伸7minꎮ扩增出线性PCR产物pET21a ̄TP ̄pulAꎮ切胶纯化后4ħ保存待用ꎮ用T4DNAligase连接线性产物ꎮ连接体系如下:ddH2Oꎬ14μLꎻ48ng μL-1纯化后的pET21a ̄TP ̄pulAꎬ3.0μLꎻT4DNA连接酶ꎬ1.0μLꎻ10ˑT4DNA连接酶缓冲液ꎬ2μLꎮ反应条件如下:16ħꎬ16hꎻ65ħ灭活30minꎮ直接转化大肠杆菌DH5α感受态细胞ꎬ涂布培养平板ꎬ挑取阳性克隆ꎬ提取质粒ꎮ将位置正确的质粒送由金唯智公司测序ꎮ1.5㊀目的基因的诱导表达与纯化将测序正确的质粒转入大肠杆菌Rosetta(DE3)中ꎬ挑取转化子到含抗生素(氯霉素终质量浓度0.036g L-1ꎬ氨苄青霉素质量浓度0.1g L-1)的5mLLB培养液中ꎬ37ħ培养12~16hꎮ取2mL菌液接种到200mL含抗生素(同上)的液体LB培养基中ꎬ37ħ㊁220r min-1培养2~3h(OD600值达到0.6左右)ꎬ加入终浓度0.2mmol L-1的IPTGꎬ220r min-1㊁30ħ培养6~8hꎮ于4ħ㊁6000r min-1离心10min收集菌体ꎬ加入0.1倍发酵液体积的蒸馏水使菌体充分混匀ꎬ取500μL作为全细胞蛋白样品ꎬ余下放置冰上进行超声波破碎(超声波破碎3sꎬ静置4sꎬ循环重复99次)ꎬ然后于4ħ㊁12000r min-1离心30minꎬ取出上清液ꎬ沉淀加入等体积蒸馏水重悬ꎮSDS-PAGE检测诱导表达效果ꎮ取5mLCo2+螯合琼脂糖凝胶装入50mL离心管中ꎬ加入灭菌后的去离子水ꎬ轻轻混匀静置后ꎬ除去上清液ꎬ重复3~5次ꎮ用5个柱床体积的灭菌后的去离子水冲洗树脂ꎬ弃上清液ꎬ重复3次ꎮ再用5个柱床体积1ˑEquilibration/WashBuffer(pH值7.0)平衡树脂ꎬ弃上清液ꎬ重复3次ꎮ将粗酶液加入处理过的树脂中ꎬ4ħꎬ110r min-1ꎬ亲合10h后静置除去上清液ꎮ加入5个柱床体积的1ˑEquilibration/WashBuffer(pH值7.0)ꎬ弃上清液ꎬ反复3次ꎻ然后将树脂装入20cmˑ11mm层析柱ꎬ再用5个柱床体积的1ˑEquilibra ̄tion/WashBuffer(pH值7.0)平衡树脂ꎮ分别用10个柱床体积的5㊁20㊁50㊁80㊁100㊁200㊁300㊁500mmol L-1咪唑浓度的洗脱液进行洗脱ꎬ观察树脂颜色变深时开始收集ꎮ洗脱完毕后ꎬ用5个柱床体积的MESBuffer流洗树脂ꎬ再用5个第3期邢岩ꎬ等:Thermotogapetrophila普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析407㊀柱床体积的1ˑEquilibration/WashBuffer(pH7.0)流洗树脂ꎬ最后用5个柱床体积的无菌去离子水流洗树脂ꎬ置于体积分数为20%乙醇中4ħ保存ꎮ用DNS法检测所收集酶液的活性ꎬ将有普鲁兰酶活性酶液进行SDS ̄PAGE的检测ꎬ进一步分析纯化的效果ꎮ将纯化效果好的酶液合并收集ꎬ置于4ħ保存ꎮ最后用截留相对分子量为50kD超滤管将酶液超滤除盐ꎮ1.6㊀酶水解产物分析分别配制质量分数为1%的葡萄糖㊁麦芽二糖㊁麦芽三糖和普鲁兰糖标准溶液ꎮ将100μL酶液与100μL质量分数1%的普鲁兰糖混合均匀ꎬ在70ħ条件下保温30minꎬ将反应后的产物和质量分数1%的葡萄糖㊁麦芽二糖㊁麦芽三糖和普鲁兰糖同时进行薄层层析检测[22]ꎮ上行展开2次ꎮ将展开后的硅胶板用体积分数10%的硫酸乙醇显色ꎬ显色条件为高温烘箱100ħ加热10minꎮ1.7㊀酶学性质分析1.7.1㊀最适pH值㊀配置pH值为5.8㊁6.0㊁6.2㊁6.4㊁6.6㊁6.8㊁7.0㊁7.2㊁7.4㊁7.6㊁7.8㊁8.0的磷酸缓冲液ꎮ在冰浴条件下ꎬ每100μL酶液加入100μL1%普鲁兰糖和100μL不同pH值的磷酸缓冲液ꎬ在70ħ条件下反应15minꎬ加入600μLDNS溶液终止反应ꎬ煮沸10min显色ꎬ冷却后用蒸馏水定容至5mLꎬ混和均匀ꎬ在540nm波长下测吸光值ꎮ以灭活的酶液作为对照ꎬ每个反应设置3个重复ꎬ取平均值ꎮ以pH值梯度为横坐标ꎬ普鲁兰酶的相对活性为纵坐标ꎬ以最大酶活性为100%ꎬ绘制曲线ꎬ确定酶最适反应pH值ꎮ1.7.2㊀最适温度㊀设置温度梯度为55㊁60㊁65㊁70㊁75㊁80㊁85㊁90㊁95ħꎮ在冰浴条件下ꎬ每100μL酶液ꎬ加入100μL1%普鲁兰糖和100μL最适pH值下的磷酸缓冲液ꎬ在不同的温度条件下反应15minꎬ加入600μLDNS溶液终止反应ꎬ煮沸10min显色ꎬ冷却后用蒸馏水定容至5mLꎬ混和均匀ꎬ在540nm波长下测吸光值ꎮ以灭活的酶液作为对照ꎬ每个反应设置3个重复ꎬ取平均值ꎮ以温度梯度为横坐标ꎬ以普鲁兰酶的相对活性为纵坐标ꎬ以最大酶活性为100%ꎬ绘制曲线ꎬ确定酶的最适反应温度ꎮ1.7.3㊀半衰期㊀将酶液在普鲁兰酶常用的半衰期测定温度70ħ下进行保温ꎬ分别在保温的0㊁3㊁6㊁9㊁12h取出450μL样品置于冰水混合物中ꎬ待全部取出后再进行反应ꎮ在冰浴条件下ꎬ取100μL不同保温时间的酶液ꎬ加入100μL1%普鲁兰糖和100μL最适pH下的磷酸缓冲液ꎬ在最适温度下反应15minꎬ加入600μLDNS溶液终止反应ꎬ煮沸10min显色ꎬ冷却后用蒸馏水定容至5mLꎬ混和均匀ꎬ在540nm波长下测吸光值ꎮ以灭活的酶液做对照ꎬ以保温0h的酶液测得的酶活性作为100%ꎬ每个反应设置3个重复ꎬ取平均值ꎮ以保温时间为横坐标ꎬ以相对残余酶活性为纵坐标绘制酶的半衰期曲线ꎬ确定酶的半失活时间ꎮ1.7.4㊀不同化学试剂对酶活性的影响㊀用与最适pH的磷酸缓冲液酸碱度一样的蒸馏水分别配制浓度为10mmol L-1的NaCl㊁KCl㊁CaCl2㊁MgCl2㊁ZnCl2㊁MnCl2㊁CoCl2㊁AlCl3㊁FeCl3㊁SDS㊁EDTA的溶液ꎮ在冰浴条件下ꎬ分别取100μL上述溶液加入到100μL酶液中ꎬ使其终浓度为5mmol L-1ꎬ在50ħ水浴锅中保温30minꎮ然后向上述保温的体系中分别加入100μL1%普鲁兰糖ꎬ在最适温度下反应15minꎬ加入600μLDNS溶液终止反应ꎬ煮沸10min显色ꎬ冷却后用蒸馏水定容至5mLꎬ混和均匀ꎬ在540nm波长下测吸光值ꎮ以灭活的酶液做对照ꎬ以未加入化学试剂测得的酶活性为100%ꎬ每个反应设置3个重复ꎬ取平均值ꎮ以不同的化学试剂为横坐标ꎬ以相对酶活性为纵坐标做柱状图ꎬ分析不同化学试剂对酶活性的影响ꎮ1.7.5㊀酶促动力学参数㊀分别配制质量浓度为2㊁4㊁6㊁8㊁10㊁12㊁14㊁16g L-1的普鲁兰糖溶液作为底物ꎮ在冰浴条件下ꎬ取100μL稀释后的纯酶液ꎬ100μL最适pH的磷酸缓冲液和100μL不同质量浓度的普鲁兰糖底物混合ꎬ最适温度下反应10minꎻ加入600μLDNS溶液ꎬ煮沸10minꎬ冷却后用蒸馏水定容至5mLꎬ混和均匀ꎬ在540nm波长下测吸光值ꎮ以灭活的酶液做对照ꎬ每个反应设置3个重复ꎬ取平均值ꎮ将测得的OD值代入葡糖糖标准曲线ꎬ计算酶水解不同质量浓度底物得到的还原糖质量ꎬ从而算出不同底物质量浓度[S]下酶的反应速度Vꎬ根据Hanes ̄Woolf法作图以[S]/V-[S]作散点图ꎬ并进行线性拟合得一直线ꎬ斜率为1/Vmaxꎬ与坐标轴横轴的截距为-Kmꎮ通过计算得到Km㊁Vmax㊁Kcat及Kcat/Km的值ꎮ2㊀结果与分析2.1㊀TP ̄pulA生物信息学分析根据1.3中所描述的生物信息学方法筛选出多条含有普鲁兰酶基因的嗜热菌ꎮ其中Thermoto ̄408㊀河㊀南㊀农㊀业㊀大㊀学㊀学㊀报第52卷gapetrophila(DSM13995)的普鲁兰酶序列(图1)在NCBI中明确的给出了I型的预测结果ꎮ如图2所示ꎬTP ̄pulA含有注释的CBM41_pullulanase和pulA ̄typeI普鲁兰酶保守结构ꎮ图1㊀TP ̄pulA核苷酸与氨基酸序列Fig.1㊀ThenucleotideandaminoacidsequencesofTP ̄pulA图2㊀TP ̄pulA保守序列比对Fig.2㊀TheconserveddomainsofTP ̄pulA2.2㊀重组质粒构建以FTP㊁RTP为引物ꎬ以Thermotogapetrophila的基因组为模板扩增得到的普鲁兰酶基因TP ̄pulA(NCBI登录号WP_004082389.1)ꎮ如图3 ̄a所示ꎬ大小为2532bpꎻ用回收的TP ̄pulA为长引物ꎬ以质粒pET21a为模板扩增得到的pET21a ̄TP ̄pulAꎬ结果如图3 ̄b所示ꎬ大小为7887bpꎮM:λ ̄HindIIIMarkerꎻ1 ̄2.TP ̄pulA基因ꎻ3.线性pET21a ̄TP ̄pulAM.λ ̄HindIIIMarkerꎻ1 ̄2.GenesofTP ̄pulAꎻ3.LinearpET21a ̄TP ̄pulA图3㊀PCR扩增TP ̄pulA和pET21a ̄TP ̄pulA的电泳Fig.3㊀ElectrophoresisofPCRproductsofTP ̄pulAandpET21a ̄TP ̄pulA将图3-b中7887bp处的条带进行割胶回收ꎬ用T4DNA连接酶将线性的pET21a ̄TP ̄pulA连接环化并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞ꎬ提取阳性转化子的质粒ꎬ如图4所示ꎮ将该质粒送去金唯智测序ꎬ测序结果与理论序列完全一致ꎮM.λ ̄HindIIIMarkerꎻ1 ̄3.重组质粒pET21a ̄TP ̄pulAM.λ ̄HindIIIMarkerꎻ1 ̄3.RecombinantplasmidpET21a ̄TP ̄pulA图4㊀重组质粒pET21a ̄TP ̄pulA的电泳Fig.4㊀ElectrophoresisofplasmidsofpET21a ̄TP ̄pulA2.3㊀目的蛋白的诱导表达对诱导表达后胞内粗酶样品和胞内沉淀样品进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分析ꎬ结果如图5所示ꎮ第3期邢岩ꎬ等:Thermotogapetrophila普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析409㊀普鲁兰酶TP ̄pulA有850个氨基酸ꎬ理论相对分子质量为96876Dꎬ而目的蛋白实际相对分子质量明显偏小ꎮM.ProteinMarkerꎻ1.胞内粗酶ꎻ2.胞内沉淀M.ProteinMarkerꎻ1.Intracellularcrudeenzymeꎻ2.Intracellularprecipitate图5㊀粗酶的SDS ̄PAGE检测Fig.5㊀SDS ̄PAGEanalysisofcrudeenzymes2.4㊀酶的纯化粗酶经Co2+螯合琼脂糖凝胶纯化后ꎬSDS ̄PAGE检测纯化效果ꎬ结果如图6所示ꎬ可以看出纯化效果较好ꎬ适于纯酶酶学性质分析ꎮM.proteinmarkerꎻ1.纯酶M.ProteinMarkerꎻ1.Pureenzyme图6㊀TP ̄pulA纯酶的SDS ̄PAGE检测Fig.6㊀SDS ̄PAGEanalysisofpureenzyme2.5㊀水解产物分析TLC法检测TP ̄pulA的水解普鲁兰糖的产物ꎬ结果如图7所示ꎬTP ̄pulA可以水解普鲁兰糖ꎬ且水解产物是麦芽三糖ꎬ可以推断TP ̄pulA作用于普鲁兰糖时主要水解α ̄1ꎬ6 ̄糖苷键ꎬ说明它是Ⅰ型普鲁兰酶ꎮ2.6㊀酶学性质分析2.6.1㊀最适pH值㊀用纯化后的TP ̄pulA进行最适pH值的测定ꎬ结果如图8所示ꎮTP ̄pulA的最适pH值为6.4ꎬ并在pH值6.0~6.6时保持最大酶活性的80%以上ꎬ在pH值7.0时相对酶活性仍能保持63%ꎮ1.葡萄糖ꎻ2.麦芽糖ꎻ3.麦芽三糖ꎻ4.普鲁兰糖ꎻ5.TP ̄pulA与普鲁兰糖反应产物1.Glucoseꎻ2.Maltoseꎻ3.Maltotrioseꎻ4.Pullulanꎻ5.ProductofpullulanhydrolyzedbyTP ̄pulA图7㊀水解产物的TLC检测Fig.7㊀TLCanalysisofthehydrolyzate图8㊀纯酶的最适pH值Fig.8㊀TheoptimumpHofpureenzyme2.6.2㊀最适温度㊀用纯化后的TP ̄pulA进行最适温度的测定ꎬ结果如图9所示ꎮTP ̄pulA最适温度是85ħꎬ是一种超嗜热普鲁兰酶ꎮ该酶在75~90ħ能保持相对酶活性的80%以上ꎮ90ħ以上时相对酶活性急剧下降ꎬ在95ħ时相对酶活性仅为51%ꎮ图9㊀纯酶的最适温度Fig.9㊀Theoptimumtempertureofpureenzyme2.6.3㊀半衰期㊀用纯化后的TP ̄pulA进行半衰期的测定ꎬ结果如图10所示ꎮ随着保温时间增加ꎬ相410㊀河㊀南㊀农㊀业㊀大㊀学㊀学㊀报第52卷对残余酶活性不断下降ꎬ当保温时间为15h时ꎬ该酶相对残余酶活性为58%ꎮ根据酶残余酶活性与保温时间的指数函数计算得到在70ħ条件下的半失活时间为26.28hꎬ说明TP ̄pulA具有很高的热稳定性ꎮ图10㊀纯酶的半衰期Fig.10㊀Thehalf ̄lifeofpureenzyme2.6.4㊀不同化学试剂对酶活性的影响㊀按照1.7.4所描述的方法对不同化学试剂对酶活性的影响进行研究ꎬ结果如图11所示ꎮ终浓度为5mmol L-1的Na+㊁K+㊁Ca2+㊁Mg2+对TP ̄pulA的酶活性有明显的促进作用ꎻ终浓度为5mmol L-1的Mn2+㊁Co2+㊁AL3+㊁Fe3+㊁SDS及EDTA对TP ̄pulA的酶活性有不同程度的抑制作用ꎬ终浓度为5mmol L-1的Zn2+对TP ̄pulA的酶活性有明显的抑制作用ꎬ在终浓度为5mmol L-1的SDS的作用下酶活性基本丧失ꎮ1.CKꎻ2.NaClꎻ3.KClꎻ4.CaCl2ꎻ5.MgCl2ꎻ6.ZnCl2ꎻ7.MnCl2ꎻ8.CoCl2ꎻ9.AlCl3ꎻ10.FeCl3ꎻ11.SDSꎻ12.EDTA图11㊀部分化学试剂对TP ̄pulA酶活性的影响Fig.11㊀EffectsofdifferentchemicalreagentonenzymeactivityofTP ̄pulA2.6.5㊀酶促动力学参数㊀按照1.7.5中所描述的方法ꎬ对酶的动力学参数进行测定ꎬ根据Hanes ̄Woolf作图法得到如图12所示的曲线ꎮ计算得到Km㊁Vmax㊁Kcat及Kcat/Km分别为0.72g L-1㊁0.0049mmol L-1 s-1㊁154.63s-1㊁214.76L g-1 s-1ꎮ图12㊀TP ̄pulA的酶促动力学参数测定Fig.12㊀KineticparametersofTP ̄pulA3㊀结论与讨论TP ̄pulA具有较高的热稳定性ꎮ推测是由于嗜热酶中热稳定性高的异亮氨酸㊁脯氨酸㊁谷氨酸的含量比较高ꎬ脯氨酸是一种容易折叠但是特别难以解折叠的氨基酸残基[23]ꎬ谷氨酸是带有大侧链的氨基酸ꎬ这些大侧链为蛋白质的高级结构带来疏水作用力和离子键作用[24]ꎮ而且嗜热酶分子包含有许多微结构ꎬ如稍长的螺旋结构㊁三股链组成的β-折叠结构㊁C端和N端氨基酸残基间的离子的作用以及较小的表面环等ꎬ这些微结构形成了嗜热酶的紧密而有韧性的空间结构ꎬ从而提高酶分子的稳定性[25]ꎮCa2+对酶活性有促进作用可能是由于在TP ̄pulA的保守结构域中存在Ca2+结合位点ꎬ在Ca2+离子存在的情况下可以有效的促进酶的活性ꎮSDS能断裂酶分子内和分子间的氢键ꎬ使分子去折叠ꎬ进而破坏蛋白分子的二级结构和三级结构ꎮ因此ꎬ在SDS存在时TP ̄pulA的活性基本丧失ꎮ本研究利用生物信息学方法ꎬ在数据库中选取编码普鲁兰酶基因的嗜热菌基因组作为试验材料ꎬ用以筛选热稳定性高的普鲁兰酶ꎬ这比从自然界中盲目筛选能够产生普鲁兰酶的菌株具有一定的优越性ꎬ并为新酶的开发提供了思路ꎮ该普鲁兰酶的最适温度为85ħꎬ半衰期为26.28hꎬ属于超嗜热普鲁兰酶ꎮ与低温和中温普鲁兰酶相比ꎬ该酶具有较高的热稳定性ꎬ便于运输和储藏ꎬ可降低成本ꎬ且该酶在高温下能保持较高的活性ꎬ为其在糖化反应中的应用奠定了基础ꎮ参考文献:[1]㊀NAIRSUꎬSINGHALRSꎬKAMATMY.InductionofpullulanaseproductioninBacilluscereusFDTA ̄13[J].BioresourceTechnologyꎬ2007ꎬ98(4):856-859.第3期邢岩ꎬ等:Thermotogapetrophila普鲁兰酶基因的异源表达与酶学性质分析411㊀[2]㊀唐宝英ꎬ朱晓慧ꎬ刘佳.耐酸耐热普鲁兰酶菌株的筛选及发酵条件的研究[J].微生物学通报ꎬ2001ꎬ28(1):39-43.[3]㊀JIAOYLꎬWANGSJꎬLVMSꎬetal.AGH57familyamylopullulanasefromdeep ̄seaThermococcussiculi:expressionofthegeneandcharacterizationoftherecom 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嗜热脂肪芽孢杆菌中耐热蛋白酶基因的克隆

嗜热脂肪芽孢杆菌中耐热蛋白酶基因的克隆

嗜热脂肪芽孢杆菌中耐热蛋白酶基因的克隆
杨庆云;江行娟
【期刊名称】《生物工程学报》
【年(卷),期】1991(007)003
【摘要】用鸟枪法把嗜热脂肪芽孢杆菌313-1(供体菌)染色体上的蛋白酶基因克隆到质粒pPL603上,并在枯草杆菌中得到表达。

此基因位于6.6kb的EcoRI酶切片段上,带有重组质粒的枯草杆菌所产生的蛋白酶活性比供体菌株约提高30倍左右。

该酶的最适反应温度为75℃,最适pH为7.0左右,是一个中性蛋白酶,在80℃作用30min后仍保留85%以上的酶活。

【总页数】6页(P207-212)
【作者】杨庆云;江行娟
【作者单位】不详;不详
【正文语种】中文
【中图分类】Q785
【相关文献】
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嗜热脂肪土芽孢杆菌普鲁兰酶基因的异源表达及重组酶性质肖亚朋;沈微;李婷霖;陈献忠;樊游【摘要】用PCR方法扩增得到嗜热脂肪土芽孢杆菌(Geobacillus stearothermophilus)XQ3506的普鲁兰酶编码基因GsP,在大肠杆菌中进行异源表达.在没有外源信号肽的条件下,重组酶部分分泌到周质中,少量分泌到培养液中.重组酶表观分子量约为81 kDa,纯酶比活力为38.2 U/mg.重组酶最适温度为60℃,能短时耐受70℃高温;重组酶最适pH6.5,在pH5.5~7.5的范围内具有较好的稳定性;重组酶Km值为0.086 μmol/L,Vmax为0.083μmol/min;K+和Mg2+对重组酶有激活作用,而Ca2+则有抑制作用.重组酶水解普鲁兰糖产物为单一麦芽三糖,对直链淀粉未发现降解作用,是一种Ⅰ型普鲁兰酶.重组酶GsP在直链淀粉、抗性淀粉生产和粉丝酶法生产工艺中有一定的应用前景.%Gene GsP encoding pullulanase was amplified from genome DNA of Geobacillus stearothermophilus XQ3508 by PCR and heterologously expressed in Escherichia coli.Despite absence of exogenous signal peptide,part of the recombinant enzyme was secreted to periplasm and culture medium.The apparent molecular weight of GsP was approximately 81.3 as measured by SDS-PAGE.Specific activity of the purified enzyme was 38.2 U/mg,and optimum pH and temperature of the recombinant enzyme were 6.5 and 60 ℃C,respectively.The enzyme could keep active within a short time at 70 ℃C.The maximal reaction velocity and Michael constant of the GsP was 0.083 μmol/min and 0.086 μmol/L,respectively.The enzyme activity of GsP could be increased by K + and Mg2 + and partially inhibited by Ca2+ The GsP did not degrade amylose.High-performance liquid chromatographyanalysis showed that pullulan could be hydrolyzed by GsP and maltoriose was the single product.Thus,GsP belongs to type Ⅰ pullulanase and it is thermostable.GsP can be applied in production of resistant starch and pure amylose.【期刊名称】《食品与发酵工业》【年(卷),期】2017(043)005【总页数】7页(P30-36)【关键词】嗜热脂肪土芽孢杆菌;异源表达;Ⅰ型普鲁兰酶;蛋白纯化;酶学性质【作者】肖亚朋;沈微;李婷霖;陈献忠;樊游【作者单位】江南大学,工业生物技术教育部重点实验室,江苏无锡,214122;江南大学,中国高校工业微生物资源数据平台,江苏无锡,214122;江南大学,工业生物技术教育部重点实验室,江苏无锡,214122;江南大学,工业生物技术教育部重点实验室,江苏无锡,214122;江南大学,中国高校工业微生物资源数据平台,江苏无锡,214122【正文语种】中文普鲁兰酶是一类淀粉脱支酶,目前工业化生产的普主要是针对淀粉制糖工业中的糖化工艺开发的耐酸性普鲁兰酶[1-3]。

近年来,随着社会发展和产品的日益丰富,以普鲁兰酶为催化剂的新产品和新工艺不断被开发,例如以普鲁兰糖为原料的麦芽三糖制作工艺[4],以淀粉为原料的直链淀粉、抗性淀粉[5-7]生产工艺,以及粉丝酶法生产工艺[8]等都需要用到普鲁兰酶。

在这些产品的生产工艺中,反应条件不一定是酸性,但酶的热稳定性都对反应的顺利进行、防止杂菌污染以及酶的节约使用有所帮助。

嗜热脂肪土芽孢杆菌(Geobacillus stearothermophilus)具有较高耐热性,土芽孢杆菌属的模式株即属于该种。

近年来,土芽孢杆菌属的Geobacillus thermoleovorans,以及该属的近缘种厌氧芽孢杆菌属的普鲁兰酶基因先后被克隆并报道了酶学性质[9-11],而嗜热脂肪土芽孢杆菌的普鲁兰酶基因的表达与重组酶性质却未见报道。

本研究将报道嗜热脂肪土芽孢杆菌 XQ3506普鲁兰酶基因在大肠杆中的高效表达以及重组酶的酶学性质。

1.1 实验材料1.1.1 菌株及质粒出发菌株嗜热脂肪土芽孢杆菌和表达载体pLac03购自无锡先秦生物技术有限公司,产品编号分别为: XQ3506和XQ3619。

G. stearothermophilus XQ3506的16S rDNA基因序列和pLac03全序列已登录美国国家生物技术信息中心(NCBI: ),登录号分别为:KX674365和KX674364。

XQ3506的16S rDNA基因序列与嗜热脂肪土芽孢杆菌模式株IFO12550只有1个碱基差异。

载体pLac03是一种以lac启动子控制外源基因表达的大肠杆菌表达载体。

1.1.2 工具酶和主要试剂核酸内切酶EcoRI、HindIII,以及T4连接酶、Extaq DNA聚合酶等均购自大连宝生物有限公司;胶回收试剂盒、PCR产物纯化试剂盒、质粒提取试剂盒为康宁生命科学(吴江)有限公司产品;氨苄青霉素、IPTG 、SDS均购自上海生工生物工程技术服务有限公司;普鲁兰糖以及葡萄糖、麦芽糖等HPLC 检测标准品均购自Sigma公司;考马斯亮蓝G-250购自国药集团化学试剂有限公司;TB培养基购自北京吉美生物科技有限公司;其他试剂为国产分析纯试剂。

1.1.3 引物在NCBI公布的嗜热脂肪土芽孢杆菌菌株22的基因组序列(登录号:NZ_JQCS01000088.1)中有一条推测为普鲁兰酶编码区的基因,据此设计扩增普鲁兰酶编码基因GsP的引物如下:Pgst1: 5’-AATTACCGGAATTCTTATGCTTCAC ̄A ̄T ̄C ̄AGCCGAAC-3’Pgst2: 5’-AATTACCGGGATCCTTATTTTCCGT ̄T ̄T ̄T ̄C ̄CAC-3’引物Pgst1与鲁兰酶基因编码区5’端一致,引物Pgst2与普鲁兰酶基因编码区3’端互补,引物5’-端各添加了EcoRI和BamHI识别位点。

引物设计后由上海赛百盛基因技术有限公司合成。

1.2 方法1.2.1 大肠杆菌重组表达载体的构建提取嗜热脂肪土芽孢杆菌XQ3506的染色体DNA,以其为模板,用引物Pgst1和Pgst2进行PCR扩增,得到目标基因片段,用EcoR和BamHI酶切,电泳分离后回收目的片段,与经同样酶切的表达载体pLac03连接后转化大肠杆菌JM109 感受态细胞,在含氨苄青霉素的平板上挑取阳性转化子并提取质粒进行酶切验证和测序。

1.2.2 重组普鲁兰酶诱导表达及产物的SDS-PAGE分析取重组菌单菌落接种含有氨苄青霉素的LB液体培养基,37 ℃,200 r/min振荡培养过夜。

以1%的接种量转接至含有氨苄青霉素的50 mL TB液体培养基,37℃,200 r/min振荡培养。

当菌体的OD600达到0.8时,加入IPTG至终浓度为0.5 mmol/L继续振荡培养36 h,取适量菌液分别进行胞外、周质和胞质酶活检测。

检测方法如下:12 000 r/min 离心1 min,收集上清液检测胞外酶活。

菌体重悬于含有25%(w/v)蔗糖的高渗处理液中,冰浴4 h,离心去上清,菌体重悬于与发酵液等体积的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液中,离心,上清液为周质组分,沉淀部分超声波破碎获胞质组分。

SDS-PAGE电泳分析重组酶在细胞周质及全细胞中的表达情况,使用Image Lab 4.0分析重组普鲁兰酶表观分子量。

1.2.3 重组普鲁兰酶的纯化与酶活测定酶的纯化方法:取周质空间粗酶液2 mL,经0.22 μm滤膜过滤,pH 7.0,0.02mol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液平衡后上QFF 1 mL阴离子交换柱,用含1mol/L NaCl的pH 7.0,0.02 mol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液线形梯度洗脱,流速1 mL/min,自动部分收集器收集洗脱液,每管1 mL,逐管测定酶活力。

然后SDS-PAGE 蛋白电泳验证纯化效果,考马斯亮蓝法测定蛋白质含量,计算酶比活力,纯化倍数和回收率。

酶活检测方法同文献[3]。

1.2.4 重组普鲁兰酶酶学性质研究酶的最适温度测定:在45~70 ℃的范围内,间隔5 ℃测定不同温度对酶活性的影响,以最高酶活性为100%,计算各温度条件下酶的相对活性。

最适pH测定:在pH4.5~8.0的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液中,间隔0.5,测定酶活,以酶活最高者为100% ,计算相对酶活性。

重组普鲁兰酶稳定性测定:将酶液分别在50、55、60、65、70 ℃金属浴中保温,间隔1.5、3、4.5、6、7.5、9 h分别取样测定酶活性,未经热处理的酶活性为100%,计算酶相对活性;金属离子对酶活影响的测定:以10 mmol/L浓度的金属离子盐溶液代替反应体系中的磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液,为避免金属离子与磷酸根反应,用去离子水替代缓冲液,用盐酸或NaOH调整至pH6.5,对照用水取代金属离子溶液,测定酶活力,对照为100%,计算酶相对活性。

1.2.5 重组普鲁兰酶动力学参数的测定取8支1.5 mL离心管,依次加入浓度为0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4μmol/L 普鲁兰多糖溶液250 μL和最适pH缓冲液175 μL,预热5 min,再各加75 μL适当稀释的纯普鲁兰酶液(各管反应体系中的底物终浓度依次为0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7 μmol/L),最适温度下反应5 min.空白管为对应的不同浓度的底物250 μL+缓冲液175 μL+蒸馏水75 μL,最适温度下进行反应。

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