乳腺癌基因芯片数据分析

蒋定锋;高峻;赵耐青

【期刊名称】《复旦学报（医学版）》

【年(卷),期】2005(032)002

【摘要】目的以乳腺癌病人的表达谱芯片数据为基础,探寻乳腺癌复发的相关基因.方法对标化芯片数据进行缺失值处理后,分别用单因素COX回归模型和综合了聚类及多因素COX回归的综合法来筛选兴趣基因,然后通过兴趣基因对病人做样品聚类,以灵敏度、特异度、约登指数和Kaplan-Meier法评价分类效果,最后结合文献和蛋白质数据库探寻乳腺癌复发的相关基因.结果综合法筛出的30个P<0.01的基因对乳腺癌病人复发状况的预测效果最佳;单因素COX回归筛出的102个P<0.01的基因的预测效果较差;单因素COX回归筛出的15个P<0.001的基因预测效果最差.结论综合法筛选得到的30个基因可用来评价病人的预后状况,为进一步的生物学研究提供待选基因.

【总页数】4页(169-172)

【关键词】乳腺癌;基因芯片;聚类分析;COX回归模型

【作者】蒋定锋;高峻;赵耐青

【作者单位】复旦大学公共卫生学院卫生统计与社会医学教研室,上海,200032;复旦大学公共卫生学院卫生统计与社会医学教研室,上海,200032;复旦大学公共卫生学院卫生统计与社会医学教研室,上海,200032

【正文语种】中文

【中图分类】R737.9;O212.1

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