基因工程实验报告

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基因工程

甘薯ADK基因反义载体的构建

(西南大学生命科学学院,重庆400715)

摘要:以甘薯为材料,提取甘薯的基因组DNA,以其基因组DNA为模板在体外克窿甘薯ADK基因核心片段并电泳检测基因的纯度。利用含有pHB载体质粒的大肠杆菌提取pHB质粒。将PHB质粒和ADK基因片段进行双酶切,构建ADK基因反义载体,检验是否构建成功,最后转入大肠杆菌中检验观察是否转入成功。

关键词:甘薯;腺苷酸激酶基因(adk);反义载体;PCR

英文摘要:

1.综述

1.1甘薯

甘薯(Ipomoea batatas (L. ) Lam.)属旋花科(Convolvulaceae)甘薯属((Ipomoea)蔓生一年生草本植物,染色体数为2n=6x=90。在我国因各地语言差异,甘薯的中文俗名较多,又名番薯、白薯、地瓜、山芋、红芋、红苔、红薯等[u1,其英文一般写作sweet potato,在美国也有写为sweetpotato[27. 1989年美国甘薯合作者组织规定用Sweetpotato表示甘薯,以便更准确地表达甘薯的特性及与Potato(马铃薯)相区别[37。目前,此表达方式已在美国、澳大利亚等许多英语国家采用,并逐步被其他国家或地区的甘薯研究者所接受〔引。目前学术界一致公认甘薯起源于热带美洲,经“Kumara"路线、"Batata"路线、"Kamote"路线传播到世界各地〔.5J,由于甘薯具有耐旱、耐痔,繁殖力强、适应性广、栽培简便、产量高,用途广泛等特点,现已在全世界广泛栽培。我国的甘薯栽培己有400多年的历史。据史料记载,甘薯于16世纪的1563-1594年间,经陆海多种渠道传入我国。在我国,甘薯的栽培分布很广,南起海南诸岛,北至内蒙古,西北达陕西、陇南和新疆一带,东北经辽宁、吉林延展到黑龙江南部,西南抵藏南和云贵高原。‘四川盆地、黄淮海、长江流域和东南沿海各省是我国甘薯的主

产区

1.2 ADK基因

腺昔酸激酶(EC.2.7.4.3, adenylate kinase, ADK)催化ATP和AMP合成两分子ADP的可逆反应,是调控这三种前体分子在淀粉代谢库和核酸代谢库中分配的关键酶。IbADK全长1314bp,其编码区长度为855bp,编码长度为284个氨基酸残基的ADK蛋白(IbADK);生物信息学预测IbADK分子量为30.86kDa,等电点为6.46。

1.3 反义载体

将目的基因与载体用相同限制性内切酶酶切后,将目的片段反向插入载体中,可以起到基因沉默的目了,构建过程主要是酶切,连接检测,最后测序确定。

1.4质粒(Plasmid)

是一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。质粒主要存在于细菌、放线菌和真菌细胞中,他具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。

2.材料与方法

2.1材料

2.1.1大肠杆菌:含PHB载体质粒的大肠杆菌;含PMD-T-aIb ADK质粒的大肠杆菌;大肠杆菌DH5α菌株。

2.1.2仪器

PCR扩增仪,PCR用薄壁管,电泳仪,恒温水浴锅,THZ-C水平摇床1台,冷冻离心机1台,涡旋仪1台,超净工作台1台,移液枪1套,锥形瓶若干,培养皿2套,室内使用的大中型枪头各2盒,浮标1个,室内使用的1.5mL的EP管若干,涂棒1根,凝胶成像系统1台,恒温培养箱1台,一次性PE手套,计时器1个,药勺若干。

2.1.3试剂

氨苄青霉素,AP/Amp:溶于无菌水,0.22μm滤膜过滤。

卡那霉素,km/Kan:溶于无菌水,0.22μm滤膜过滤。

TIANGEN质粒小提试剂盒(离心柱型);BamHΙ、XbalΙ(Fermentas公司);ddH2O;TIANGEN 普通琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(离心柱型);DNAligation连接试剂盒;CaCl21瓶;常规PCR试剂1套;上游引物FaADK;下游引物RaADK;TBE缓冲液;回收级琼脂糖;溴化乙锭;Taq DNA聚合酶;10×PCR buffer;MgCl2;dNTP;marker(DL2000、λDNA/HindⅢ

各1支)。

2.1.4培养基

LB液体培养基:蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,NaCl 10g/L,pH7.0,灭菌后4℃保存。LB琼脂平板(400ml、800ml):蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,NaCl 10g/L,琼脂15g/L,pH7.0,灭菌后冷至60℃左右铺平板,视具体需要加相应抗生素做成Amp(50mg/L)或Kan (50mg/L)等平板。

2.2方法

2.2.1常用试剂及培养基的配制

配制LB液体培养基和LB琼脂平板。

2.2.2 质粒DNA的提取、纯化、电泳检验及酶切

1、将含有pHB载体质粒的大肠杆菌和含有PMD-T-aIb ADK质粒的大肠杆菌接种在加相应抗生素(Kan、Amp)的L B液体培养基中摇菌培养至合适浓度后采用质粒提取(小量)试剂盒(TIANGEN)抽提质粒。

具体方法与步骤见试剂盒说明。

2、抽提的质粒DNA用琼脂糖凝胶电泳检测、并拍照。

3、对提取的PHB载体质粒和PMD-T-aIb ADK质粒进行BamHⅠ、XbalⅠ双酶切鉴定。

酶切反应体系为:

去离子水23µL

10×K buffer 5µL

质粒(PHB/ PMD-T-aIb ADK) 20µL

BamHⅠ1µL

XbalⅠ1µL

总体积50 µL

短暂离心混匀后,于37 C水浴过夜反应。反应结束后加入5µL的10×Loading Buffer 停止反应,再进行琼脂糖凝胶电泳检测、照相。

2.2.3酶切片段的回收与表达载体的连接反应

1.目的片段的回收纯化

将质粒pMD-T+aIb ADK进行BamH I+Xba I完全双酶切后,电泳表明均切下一条0.85 kb 左右的目的条带(aIb ADK,为855-bp)。回收aIb ADK,同时对pHB进行BamH I+Xba I完全双酶切,酶切产生两个分子量差异极大的片段,小片段是多克隆位点,大约几十bp,电泳根本无法看到;大片段就是pHB载体骨架(约12 kb)。回收该大片段。

对酶切后目的基因片段aIb ADK(小片段)和pHB载体骨架(大片段)进行切胶回收。采用胶回收(小量)试剂盒(TIANGEN)进行。操作步骤见试剂盒说明。

2. 回收目的基因aIb ADK小片段与pHB大片段载体骨架的连接

连接体系:

在200 µL Eppendorf管中加入下列组分:

pHB大片段 1.5µl

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