imagej常用功能教程

ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数，也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后，开启图档

ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数，也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后，开启图档

step 2.请先做校正，选择Analyze底下的Calibrate选项，再选择校正的模式，使用Uncalibrate OD，再按ok

按下ok之后会出现校正的图形

Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项)，再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1)，此时框架中会出现一个号码1，之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2)，当然可以一直加下去，最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。

Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度，此时可以看到有几个比较高的区段，就是我们想定量的band，使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再，使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。

Step 5.当我们点选分析时，在result的对话视窗会出现分析的数据，依序点选就会出现每个band的值。

注：当我们选择分析的条带也可以是横向选取，就可以只比较相同大小的DNA 的含量，同样也可以应用在western blot或其它类似实验条带的分析上。

使用ImageJ 分析图像中的颗粒数

[] 原创教程，转载请保留此行

1，到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。

2，打开ImageJ并打开要分析的图片。请看演示图片。

3，把图像二值话或者设定阈值。选择Image - Adjust - Threshold...

根据提示设定你需要的阈值。这一步非常重要，关系到结果的正确性。设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。示例中颗粒都被染成了红色。

4，菜单Analyze - Anelyze particles... 自动统计结果。示例图片中有2个1像素的点都被统计出来了。结果非常准确。

ImageJ 功能强大，其他功能请自学或者听下回分解！再见~~~ #1

使用ImageJ 分析图像中的颗粒数

[] 原创教程，转载请保留此行

1，到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。

2，打开ImageJ并打开要分析的图片。请看演示图片。

3，把图像二值话或者设定阈值。选择Image - Adjust - Threshold...

根据提示设定你需要的阈值。这一步非常重要，关系到结果的正确性。设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。示例中颗粒都被染成了红色。

4，菜单Analyze - Anelyze particles... 自动统计结果。示例图片中有2个1像素的点都被统计出来了。结果非常准确。ImageJ 功能强大，其他功能请自学或者听下回分解！再见~~~

附件:

particle.JPG(9.26 KB)

adjust.JPG(26.63 KB)

adjust2.JPG(22.57 KB)

analyze.JPG(24.67 KB)

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2007/4/6 21:53

生物医学影像分析软件--ImageJ计算细胞数

2009年04月21日 22时21分52秒 来源：未知 浏览： 522次

相信许多朋友也许也在找一种影像软体，可以自动帮你计算细胞数，比方说常常用使用4'-6-Diamidino-2-phenylindole (DAPI)，或是用其它的抗体在做免疫染色(Immunohistochemistry Staining)，要如何把影像的资讯数量化呢?最常用的就是计算染色的细胞数。那有没有软体可以自动帮你算细胞数呢?大概在90

年中就有人在做这种影像分析，在2000年左右也有不少文章介绍各实验室自己开发的软体，也免费的提供下载。最近由猪排饭同学介绍一套软体ImageJ，是由National Institutes of Health (NIH)所开发免费且跨平台(windows、Mac、Linux都可用)的影像分析软体，试用一下觉得相当好用。请参考以下之教学：

step 1. 下载安装ImageJ软体: /ij/download.html 或ImageJ下载

/html/protocol/ruanjianjiaocheng/2009/0421/284.html

请依据不同作业系统选择适合的版本

step 2. 打开软体，再开启要分析的图片(File->Open)。

step 3.

设定分析影像的阈值(Image->Adjust->Threshold,或快捷键Ctr+Shift+T)

step 4.调整阈值再按set决定。

step 5.

选择analyze particle(Analyze->Analyze particle)

并且记得要选择summarize，才会有分析的结果。

step 6.

分析结果，可以看到原图像的视窗会出现电脑判读的数据，summary会显示个数及分析影像的区域大小

Using ImageJ to Quantify Gel Images

This is a quick tutorial abour using ImageJ to process gel images taken with the GelDoc. ImageJ is a free program that was originally written at NIH. ImageJ is used to analyze/process all sorts of images in biology-related research. You can use ImageJ to crop/invert/rotate/enhance your gel images. There is even a way to quantify your bands.

Rotating/Cropping Gel Images

Open ImageJ using the shortcut on the desktop.

You can drag the image you want to open onto the ImageJ window. Once the gel image is open, you can zoom in with "Ctrl+" and zoom out with "Ctrl-". Your gel will look something like this (see below).

C:/…/index.html1/10