茄子品种基于WRKY转录因子的指纹图谱构建及遗传相似性分析

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茄子分子遗传育种研究进展

茄子分子遗传育种研究进展摘要茄子(Solanum melongena L.)为世界重要的蔬菜之一，具有重要的经济价值和保健作用。

利用各种分子标记技术和连锁遗传图谱，定位重要性状的基因位点，并通过与之紧密连锁的分子标记，进行辅助选择，可大大提高茄子育种效率。

近年来，茄子的分子遗传育种研究进展很快。

本文综述了近年来国内外茄子分子育种的主要研究进展，包括茄子分子标记的开发、遗传图谱的构建、重要性状的基因定位及其在茄子育种中的应用,同时对茄子的分子育种研究进行了展望。

关键词茄子；分子育种；分子标记；遗传图谱茄子含有丰富的矿物质和维生素，其紫色果皮中含有丰富的维生素E和维生素P，果实中含有的多酚类物质具有重要的抗氧化活性(Nisha et al., 2009; Sudheesh et al., 1999)，而且茄子中还富含多种植物化学物质。

目前，许多研究报道了茄子提取物对癌症、糖尿病、高血脂、胆固醇、动脉粥样硬化、抗血管增生、消炎等方面具有积极的作用(Han et al., 2003; Jenkins et al., 2005; Kashyap et al., 2003)。

与同科植物番茄、辣椒等作物相比，茄子的研究基础还比较薄弱，且其分子遗传育种起步较晚。

近年来，随着分子生物学的发展，茄子的分子育种也在快速发展。

本文旨在对目前国内外茄子分子标记的开发、遗传图谱的构建、重要性状的基因定位及其在茄子育种中的应用等方面的进展进行综述，为茄子今后的分子育种提供参考。

1茄子分子标记的主要类型1974年，Grodzicker等建立了限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)技术；1980年，人类遗传学家Botstein等提出将RFLP作为新型的遗传标记，从而开始了DNA分子标记技术的发展阶段。

随着PCR技术的诞生以及DNA测序技术的迅猛发展，分子标记的类型也得到飞速发展。

茄科物种全基因组抗病基因鉴定及其进化分析

茄科物种全基因组抗病基因鉴定及其进化分析随着测序技术的快速发展,近年来多个茄科物种的基因组数据相继被释放,这为全基因组范围鉴定抗病基因和物种间比较基因组学的应用提供了平台。

植物中大部分(80%)抗病基因属于NBS-LRR类。

本研究通过隐马尔科夫模型(Hidden Markov Model,HMM)和BLAST的方法从栽培番茄Heinz1706、野生番茄LA716、栽培马铃薯DM1-3、栽培辣椒Zunla-1、野生辣椒Chiltepin和栽培烟草TN90中分别鉴定出463、485、1,152、1,665、2,042和374个NBS-LRR类抗病基因。

相比已报道的结果,本研究从番茄Heinz1706和马铃薯DM1-3中鉴定出69和397个新抗病基因。

辣椒基因组内(尤其是野生辣椒Chiltepin)的抗病基因数目在已报道的二倍体物种中是最大的。

使用BLSATN的方法(E值为1e-10),我们将本研究从茄科物种鉴定出的绝大多数抗病基因(>92%)划分到了87个抗病基因亚家族中,其中16个亚家族为TIR-NBS-LRR(TNL)类,71个为non-TNL(n TNL)类。

分析表明,TNL类抗病基因家族的基因结构较n TNL类抗病基因亚家族的基因结构更保守。

本研究以番茄基因组的抗病基为对象构建了147个VIGS沉默载体,覆盖番茄Heinz1706中81个抗病基因亚家族的64个,为未来番茄抗病基因的克隆提供了新的途径。

虽然茄科物种间抗病基因数目有巨大的差异(如野生辣椒Chiltepin中有2,042个抗病基因而栽培番茄Heinz1706只有463个),但是各个物种内抗病基因亚家族的数目却差不多(如野生辣椒Chiltepin和栽培番茄Heinz1706分别包含83和81个抗病基因亚家族)。

进一步分析发现,茄科物种间抗病基因数目的差异主要是由一些大的抗病基因亚家族造成,例如辣椒中22个大的抗病基因亚家族包含全基因组约80%的抗病基因,其中在辣椒Zunla-1和辣椒Chiltepin中最大的5个抗病基因亚家族(Rpi-blb2、BS2、SL-0273、Sw5-c和I2)分别包含832(50.0%)和1,027(50.3%)个抗病基因同源体,而这5个抗病基因亚家族在番茄Heinz1706、番茄LA716和烟草TN90却只含有84(18.1%)、95(19.6%)和73(19.5%)个抗病基因同源体。

茄子主要栽培种遗传多样性分析

ｓｒｅｄ３ｈｎｔｐｃ８．８％）ｗｒｌｒｈｃ８ｐｌｍｏｈｃｐｍｍｗｒｓｌｔｏ０ＩＳｒｅｓ８ＤＡｆｇｎｓｅｖａ３ｐｅｏｉｄｎｙｓ（９１ｅｐｙｐｉ；ｏｙｒｉｒｅｅｅｅｅｆｍ５ＳＲｐｍｒ．６Ｎａｍｅｔｅｅｍｏｐｉｅｃｄｒｉｒ
科学依据。
共观察３个性状，７非数据型质量型性状，根据不同表现型状态给予赋值，ｌＸ・Ｘ７分别代表播种ｘ、２・３・期、定植期、始花期、子叶色（绿色２１浅紫３）下紫、胚轴颜色（绿色２１紫绿３紫）株型（直立２半直、１
理研究员，研究方向为作物栽培与分子生物学，为通讯作者。
复性等问题０因此，本文结合传统形态标记和现代
ＩＳＳＲ分子标记的优劣，从不同角度来分析广西及全
西
南
农
业
学
报
２３卷
国部分地区茄子栽培品种的遗传多样性构成特性，旨在为茄子的种质资源利用和育种提供更为全面的
ｌｍｉ．ＣｌｓｅａｙｉｉｇＳＳｏｔａｅｓｏｄｔａｈｕｔａｅｔｄｉｈｓｓｄｏｌｅｄｖｄｎｏｓｒｕｓｎｈｅｕｔｉｔｄｅｕｔｒａｌｓｓｕｓＰＳｓｆｒｈｗｅｈｔｔｅｅｌｉｒｔｓｅｎｔｉｔｙｃｕｄｂｉｉｅｉｔｉｇｐ，ａｄｔｅｒｓｌｎｎｗｖｓｕｄｘｏｓ
有一定关系，而分子标记类群的划分与地理来源没有明显的联系。关键词：茄子；遗传多样性；形态标记；ＳＩＲ标记Ｓ

茄子主要栽培种遗传多样性分析

茄子主要栽培种遗传多样性分析梁任繁;王益奎;李文嘉;黎炎;吴永官【摘要】To make clear the genetic background of the dominant eggplant germplasm species in China,54 eggplant cultivars from Guangxi and other parts of China were assessed with Morphological markers and 1SSR markers. The results indicated that ? 37 phenotypics were observed and 33 phenotypics (89.18 % ) were polymorphic; 8 polymorphic primers were selected from 50 ISSR primers. 68 DNA fragments were amplified and each primer resulted in 8.5 DNA fragments on average. 58 fragments were polymorphic ( percentage of polymorphic bands was 85.29 % ) ; The genetic similarity index of all the germplasms varied from 0.04 to 1.00, the total average value were 0.52 and 0.60 respectively, suggesting that the genetic difference between individual cultivars was significant, but the genetic diversity of total cultivars was limited. Cluster analysis using SPSS software showed that the cultivars tested in this study could be dividedinto six groups, and the results of Morphological markers were relatedwith geographical origin of cultivars, but groups based on ISSR markers had no evident relation with geographical regions.%为了明确我国茄子主要栽培种的遗传背景,对主要来自广西及全国部分地区的54份茄子栽培种进行表形标记和ISSR标记分析.结果表明,在37个表形性状中,表现为多态性有33个,占89.18％；从50条ISSR引物中共筛选出8条多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,扩增出68条谱带,平均每条引物扩增出8.5条带,多态性带58条,占85.29％；品种间两类型标记遗传相似系数均在0.04 ～1.00之间,总体平均数分别为0.51、0.60,表明个别品种间遗传差异很大,但群体整体遗传基础相对较狭窄；应用SPSS软件聚类分析,两类标记均能在欧氏距离14～15间将54个栽培种划分为6个类群,其中表形标记类群的划分与地理来源有一定关系,而分子标记类群的划分与地理来源没有明显的联系.【期刊名称】《西南农业学报》【年(卷),期】2011(024)005【总页数】6页(P1861-1866)【关键词】茄子;遗传多样性;形态标记;ISSR标记【作者】梁任繁;王益奎;李文嘉;黎炎;吴永官【作者单位】广西农业科学院蔬菜研究所,广西南宁530007;广西作物遗传改良生物技术重点实验室,广西南宁530007;广西农业科学院蔬菜研究所,广西南宁530007;广西作物遗传改良生物技术重点实验室,广西南宁530007;广西农业科学院蔬菜研究所,广西南宁530007;广西农业科学院蔬菜研究所,广西南宁530007;广西农业科学院蔬菜研究所,广西南宁530007【正文语种】中文【中图分类】S641.1茄子(Solanumm elongena L.)起源于东南亚、印度，中国为茄子第二起源中心，也是世界目前茄子生产第一大国［1］。

利用SRAP分子标记技术分析茄子遗传多样性

利用SRAP分子标记技术分析茄子遗传多样性肖熙鸥;林碧桦;林文秋;李威;高晓敏;吕玲玲【摘要】The genetic diversity of 36 eggplant was analyzed by SRAP maker. Two hundred-ninety-two polymorphic bands were amplified by 22 SRAP primers with an average of 13.27 polymorphic bands per primer pair. The genetic similarity was from 0.568 to 0.870 with an average genetic similarity w 0.757. The result suggested that the genetic diversity of 36 eggplants was related narrow. Thirty-six eggplants were clustered into 5 groups at 0.690 coefficients by UPGMA method.%利用SRAP技术对36份茄子栽培种进行遗传多样性分析。

结果表明：22对引物对36份茄子DNA进行PCR扩增，经过染色后共获得292条多态性条带，平均每个引物组合扩增出13.27条多态性条带。

36份茄子品种间遗传相似系数在0.568～0.870，平均遗传相似系数为0.757，这表明该群体的遗传背景相对狭窄。

利用UPGMA法对36份茄子资源进行聚类分析，结果显示，在相似系数为0.690处，可将36份茄子资源划分为5个组。

【期刊名称】《热带农业科学》【年(卷),期】2016(036)003【总页数】5页(P19-23)【关键词】茄子;SRAP;遗传多样性【作者】肖熙鸥;林碧桦;林文秋;李威;高晓敏;吕玲玲【作者单位】中国热带农业科学院南亚热带作物研究所广东湛江 524091;;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所广东湛江 524091;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所广东湛江 524091;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所广东湛江 524091;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所广东湛江 524091【正文语种】中文【中图分类】S641.1②肖熙鸥(1988～)，男，硕士研究生，研究实习员，主要研究方向为蔬菜育种及生物技术。

茄子种质资源农艺性状遗传多样性分析

茄子种质资源农艺性状遗传多样性分析作者：贾利苗永美江海坤严从生张建秦艳梅方凌来源：《长江蔬菜·学术版》2016年第12期摘要：以56份茄子种质为材料，综合应用多样性分析和聚类分析的方法，对26个主要农艺性状的遗传多样性进行分析。

试验结果表明，参试材料存在广泛的遗传多样性，果实大小多样性指数最高，其次是开展度；最大叶性状变异系数最高，其次是单果质量；基于种质间农艺性状的遗传差异，将56份茄子资源划分为三大类群，第Ⅰ类群在选育密植型品种时利用，第Ⅱ类群可在选育高产型品种时利用，第Ⅲ类群在选育特异材料时利用。

综合分析了茄子种质资源主要农艺性状的遗传多样性，为茄子资源的高效利用提供可参考的依据。

关键词：茄子；种质资源；农艺性状；遗传多样性中图分类号：S641.1 文献标识码：A 文章编号：1001-3547（2016）24-0044-06茄子（Solanum melongena L.，2n=24），属茄科茄属，为世界第四大蔬菜作物，起源于亚洲东南的印度、缅甸及临近的热带区域。

中国是茄子的第二起源地及次生演化中心，拥有丰富的茄子种质资源[1]。

茄子种质创新、遗传改良和品种选育需要丰富的种质资源，而开发利用种质资源的前提是对其进行评价鉴定[2]。

农艺性状的鉴定和描述是种质资源研究最直接、最基本的方法和途径[3]，通过对此类性状进行遗传多样性分析，可以从整体上把握资源的丰富程度[4]，为育种者下一步进行种质筛选、亲本选配、品种分类和资源保护等提供重要依据[5]。

茄子是我国栽培的主要蔬菜之一[6]，但由于我国南北各地生态气候与消费习惯不同，各地区的育种目标有较大差异[7]，因而引进资源均需试种和评价后才可推广应用。

如黄文枫等[8]、汪诗华等[9]、沈鹤忠[10]、黄文静等[11]开展引种、品比试验，筛选出适合各自地区的优良品种；王佳慧[12]、张念等[13]、苏晓梅等[14]、李宁等[2]、肖熙鸥等[15]、林鉴荣等[16]利用形态标记或分子标记对当地来源不同的茄子种质资源进行了多样性分析和评价。

茄子RAPD分子标记体系的建立与优化

的差别，优化体系仍然不同。因此，优化体系的建立对于任何物种进行ＲＰＡＤ分析都是必不可少的。本研究表
明，在反应仪器固定、试剂来源和型号一致、保证ＤＡ模Ｎ板质量前提下，对试剂用量和扩增条件加以严格控制，其
重复性还是很的最佳反应体系：ＡＤ— Ｃ
ｍｏＬｄＴ．Ｌ５ＵＴｑＥ０２Ｉ、．ｍＬＬＰｍｒＬ１ｇＬ模板ＤＡ３、菌双蒸水９３。扩增程序ｍｌＮＰ０５Ｉ、／／ｚａ．Ｌ０１ｏ／ｒｅＩ、０ｎ／ｘｉ３ｘＮ灭．
为：４ｃ预变性５ｍｎ９９ｃｉ；ｃ４ｃ变性１ｍｎ３ｉ，７℃ 退火１ｍｎ７ｉ，２℃ 延伸１５ｍｎ４．ｉ，５个循环；７ｃ伸１ｉ后４℃ 保存。２ｃ延０ｍｎ关键词：子；ＡＤ；系优化茄ＲＰ体
ｐａｔｓｅｔｂｉｈｄ，ａｄｉｃｎａｎｄ２ｌｎｓａｌｅｗａｓｎｔｏｔｅ５ｍｍｏ／Ｃｌ２０Ｌ，１ ×ＰＲｕｆｒ．ＬｉｌＬＭｇ２．０ＣＢｆ０ＩＬ，１ｅ２０ｍｍｏ／ＮＰ０５Ｌ，／ａｌＬｄＴ．５ＵＬＴｑ
（氯仿：异戊醇＝４１，２：）颠倒混匀１ｍｎ４１００ｒ０ｉ。（）２０／ｍｎ４℃离心２ｉ。（）ｉ，０ｍｎ５取上清液，加等体积异丙醇
（２）１５Ｌ离心管中，一０ａ于．ｍＣ轻轻上下颠倒混匀。（）６
一
本文以茄子ＤＡ为模板，ＲＰＮ对ＡＤ反应的各种因素进行

茄子及其近缘野生种遗传多样性的SRAP分析

茄子及其近缘野生种遗传多样性的SRAP分析房超;李跃建;帅波;刘独臣;刘小俊;粱根云;杨宏【摘要】应用SRAP分子标记技术对87份来茄子及其近缘野生种进行了遗传多样性分析.结果显示,从88对SRAP引物中筛选出18对多态性高、稳定性好的引物组合,共检测出309清晰个位点,平均每对引物检测到17.2个扩增位点..参试茄属植物种质群体位点的平均杂合度为0.6962；平均多态信息含量为0.6441.82份栽培种茄子材料的平均相似系数为0.822,表明茄子栽培种的基因库较小,遗传基础较为狭窄.聚类分析结果表明,87份材料可分成4大类,可以较好地将茄子栽培种与其近缘野生种分开,并且基本可将高级栽培种(S.melongena L.subsp.melongena)和原始栽培种(S.melongena L.subsp.ovigerum Salis)在亚种水平上区分开来.由此可见,SRAP标记在茄子遗传研究中是一种经济、有效和可靠的分子标记手段.%The genetic diversity of 87 accessions including 82 Solarium mdongena L. (inluding S. Mdongena L. Subsp. melongenaL. And S. Melongena L. Subsp. Ovigerum Salis ) and relate species ( S. Integrifolium L. And S. Macaonense L. ) were revealed by SRAP markers. 18 of the 88 primers were employed and showed polymorphism and stability. Total 309 alleles were screened, the average number of alleles per primer were 17.2. The heterozygosity average value, and average of polymorphism information content of 309 SRAP loci were 0.6962, and 0.6441. Phenetic tree were constructed using Jaccard' s coefficient and UPGMA and the analysis of cluster suggested that 87 accessions could be divided in to four groups. Average similarity of 82 cultivar eggpant was 0.822, which indicated their genetic relationship was close. The subgrops of cultivar specie ( 5. Mdongena L. ) were almostdifferentiated by the SRAP marker. All these results showed that SRAP markers were economic, effective, and reliable.【期刊名称】《西南农业学报》【年(卷),期】2011(024)005【总页数】8页(P1853-1860)【关键词】茄子;遗传多样性;SRAP( Sequence-related Amplified Polymorphism)【作者】房超;李跃建;帅波;刘独臣;刘小俊;粱根云;杨宏【作者单位】四川省农业科学院园艺研究所,四川成都610066;蔬菜品种改良与种质创新四川省重点实验室,四川成都610066;四川省农业科学院,四川成都610066;四川省仁寿县宝马乡农办,四川仁寿620500;四川省农业科学院园艺研究所,四川成都610066;四川省农业科学院园艺研究所,四川成都610066;四川省农业科学院园艺研究所,四川成都610066;四川省农业科学院园艺研究所,四川成都610066【正文语种】中文【中图分类】S641.1茄子(S.melongena L.)，又名 aubergine，guinea squash or brinjal，是世界上许多热带和温带地区的重要蔬菜，也是多样而庞大的茄科植物中18个被驯化作物的主要成员之一，其家族中还有马铃薯、番茄和辣椒等重要的农作物［1］。

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ｇｒｒｎｉｐｗａｏｓｒｃｅｎｄｔｅ３ｇｌｎｓａｃｓｉｎｓｃｕｄｂｄｎｔｅｙｔｏｅｐｉｔｎｇｍａｓｃｎｔｕｔｄａｈ４ｅｇａｔｃｅｓｏｏｌｅｉｅｉｄｂｈｅｃｍｂｉａｐｉｆｎ—
性条带８＂８４１１条，平均为１２条。对所得到的３３４个茄子品种的指纹图谱进行组合和综合分析，可以将供试的３４个茄子品种区分开来。明利用ＷＲ表ＫＹ转录因子分子标记技术可以用以鉴定茄子
种质资源。照ＵＰ按ＧＭＡ法进行聚类，分子水平上将供试品种大体分为５个类群，从第一类群又可
ｓｏｓｂｌｃｌｒｍａｋｅａｅｎＷＲＫＹｒｎｃｐｉｎｆｃｏ．ＴｈｅａｉｎｓｉｍｏｇｔａｉｔｅｉｎｙｍｏｅｕａｒｒｂｓｄｏｔａｓｒｔｏａｔｒｉｅｒｌｔｏｈｐｓａｎｈｅｖｒｅｉｓｗｅｅｅａｕｔｄｂｒｖｌａｅｙＵＰＧＭＡ，ｈｏｎｈｔｔｅｔｓｅｇｐａｔｖｒｅｉｓｃｎｂｌｓｉｅｎｏｆｖｒｕｓｓｗｉｇｔａｈｅｔｄｅｇｌｎａｉｔｅａｅｃａｓｆｄｉｔｅｇｏｐｉｉ
ＡｂｔｃＡｏａｆ３ｇｐａｔａｃｓｉｎｅｅｉｖｓｉａｅｎｔｉｓｕｙｉｅｐｍｅｍｐｅｐｌ— ｓｒｔ：ｔｔｌｏ４ｅｇｌｎｃｅｓｓｗｒｎｅｔｔｄｉｈｓｔｄ．ＦｖｒｒａｌｏｙａｏｇｉｓｍｏｐｉｍｎｏｌｉｔｇｉｈａｌｔｅｍａｅａｓｓｕｉｄＴｅｎｍｂｒｏｏｙｒｈｃｂｎｓｗｒ６，ｒｈｓａｄｃｕｄｄｓｎｕｓｌｈｔｒｌｔｄｅ．ｈｕｅｆｐｌｍｏｐｉａｄｅｅ６３ｉｉＥｃｆｐｍｅｅｅｔｏｙｒｈｃｂｎｓｖｒｄｂｔｅｎ８ｎ８ｉｎａｅａｅｏ３．ｈｎａｈｏｒｒｄｔｃｌｍｏｐｉａｄａｉｅｗｅ４ａｄ１１ｗｔａｖｒｇｆ１２Ｔｅｆ — ｉｐｅｈｉ
ｔｎａｄａａｙｉｏｖｒｍｅａｒＴｅｒｓｌｄｃｔｄｔａｓｆａｉｌｏｉｅｔｙｅｇｌｎｃｅ — ｉｎｎｌｓｓｆｅｐｉｒｐｉｏｆｉｓ．ｈｅｕｔｉｉａｅｔｔｉｅｓｂｅｔｎｉｇｐａｔｃｓｓｎｈｉｄｆａ
ｏｈｌｃｌｒｌｖ１ｎｔｅｍｏｅｕａｅｅ．Ｍｏｅｖｒｈｒｔｇｏｐｃｎｂｕｔｅｌｓｉｅｎｏｔｕｇｏｐ，Ｔｅｒｏｅ，ｔｅｆｓｒｕａｅｆｒｈｒｃａｓｉｄｉｔｗｏｓｂ－ｒｕｓｈｉｆ
ＮｕＹｎｉＺａｕｕｎＳｎＱｎｐｎａｇＡｚｅｉａｘｈｏＦｋａｕｉｇｅｇＹｎｉｎｕｈ（ｅａｍｎｏＢｏｅｈｏｏｙＢｉｎｎｖｒｔｏＡｒｕｔｅＢｉｎ０２６ＣｉａＤｐｒｅｔｆｉｃｎｌ，ｅｉｇＵｉｓｙｆｇｉｌｒ，ｅｉｇ１２０，ｈｎ）ｔｔｇｊｅｉｃｕｊ
ＧｅｅｉＤｖｒｉｓｉＥｇｌｎｓ（ｏｎｍｍｅｏｇｎ．ｎｔｉｓｉｇｐｔＳｌｕｌｅａＬ）ｃｅｔｎｅａａｎ
ｂｌｃｌｒａｋｒＢｓｄｏＲＫａｓｒｔｎＦｃｏｙＭｏｅｕａｒｅａｅｎＷＭＹＴｒｎｃｉｉａｔｒｐｏ
意酬Ｉｉ Leabharlann 】２０试验究０．研１５
茄子品种基于ＷＲＹ转录因子的Ｋ
指纹图谱构建及遗传相似性分析
牛艳秀赵福宽孙清鹏杨爱珍
（北京农学院生物技术系北京１２Ｏ）Ｏ２６
摘要：应用ＷＲＫＹ转录因子分子标记构建３４个茄子品种的指纹图谱及进行遗传相似性分析，筛选出５对多态性高的引物进行ＰＫ扩增，Ｃ结果显示，增多态性带６３条，对引物检测到多态扩６每
分为２个亚类群．ＷＲＫＹ转录因子分子标记分类与传统的以果形或果皮颜色单一形态学性状为基础的分类没有直接的相关性。
关键词：子；录因子；子标记；纹图谱；类分析茄转分指聚ＥｓａｌｈｔｂｉｍｅｔｏｉｇｒｒｔｇａｄＩｅｔｉａｉｎｏｓｎｆＦｎｅｐｉｉｎｎｉｃｔｆｎｎｄｆｏ