石斛的分子生物学鉴定_基于RAPD分析
16种观赏石斛兰的遗传关联性分析

16种观赏石斛兰的遗传关联性分析余松金【期刊名称】《现代农业科技》【年(卷),期】2024()9【摘要】石斛兰种质资源的评价与创新是育种工作的基础。
为了挖掘石斛兰资源有效的分子标记以及优良目的性状相关基因,本研究主要观测了16份石斛兰种质资源形态学性状以及利用RAD-seq分子标记技术分析这些品种资源之间的遗传进化关系,对16种观赏石斛兰形态学与RAD-seq分子标记进行了关联分析。
结果表明,形态学分析显示16个石斛兰品种间遗传变异较大,相似系数在0.776~0.926之间;与形态学结果相比,16个石斛兰品种RAD-seq的测序结果显示种间遗传差异更大,与参考基因组相比相似系数在0.2522~0.8982之间。
RAD-seq聚类分析表明,聚石斛、霍山石斛和金钗石斛亲缘关系较近;形态学关联分析发现,这3个石斛兰品种都具有花香且花序侧生现象,其他石斛兰品种没有此特征。
对这3个石斛兰品种区别于其他品种的SNP标记位点相关序列进行提取和注释,发现了大量的次生代谢途径和光合作用相关基因。
16个观赏石斛兰品种间存在较丰富的遗传多样性,其中聚石斛、霍山石斛和金钗石斛亲缘关系较近,并发现分类结果可能与花香和花序侧生现象相关。
【总页数】7页(P98-103)【作者】余松金【作者单位】漳州市农业科学研究所【正文语种】中文【中图分类】S682.31【相关文献】1.基于SRAP分子标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析2.秋石斛兰F1代主要观赏性状的遗传表现3.基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建4.基于测序基因分型技术的3种石斛兰遗传关系分析5.基于RAPD分子标记的观赏春石斛遗传多样性分析因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
31种石斛属植物的RAPD遗传多样性分析

遗 传多 样性 分析 , 目的是评 估 石斛 种 间 的遗 传 多样 性 , 一 步 验 证 RAP 进 D标 记 技 术 在石 斛 种 间 鉴别 研 究
中的可 行性 .
收 稿 日期 :0 1O — O 2 1一33
基 金 项 目: 家 自然科 学 基 金 (0 7 19 30 0 9 ,0 7 1 0 ; 江省 科 技 计 划 项 目 (0 8 2 8 ,o 6 3 0 6 ; 州 市 重 点 实 验 室 项 国 36 0 9 , 1 72 8 3 8 0 8 ) 浙 2 0 C10 1 2 o c 2 1 )杭 目(0 84 2 6 2 0 0 3 T1 ,0 0 02 2 )钱 江人 才 计 划 资 助 项 目. 20 0 3T0 ,0 9 2 3 5 2 1 1 3 B 5 ;
Vo 1 . L O NO 4
J1 2 1 u. O1
DOI 0 3 6 /.sn 1 7 — 3 X. 0 1 0 . 1 :1 . 9 9 jis . 6 42 2 2 1 . 4 0 0
3 1种 石 斛 属 植 物 的 RA D 遗传 多样 性分 析 P
朱胜 男, 振 华 , 尚 国, 周 冯 汪 尚 , 索娜 娜 , 慧 中 王
标 记 技 术 可 以用 于 石 斛 属 植 物 的 物 种 鉴 定 和 遗 传 多样 性 研 究 . 关 键 词 :石 斛 属 ; RAP 遗 传 多 样 性 D; 中 图分 类 号 : 2 2 7 R 8 . 文 献 标 志 码 :A
文 章 编 号 :1 7 — 3 X( 40 3 - 7
确 鉴别 物种 . L 、 L  ̄ 、S R 、 S [ ]核 糖体 基 因 r RF P ] AF P ] I S [ S R 、 DNA I Sn 、 T [] 叶绿 体基 因 maK 基 因[ 等 t
石斛属植物化学成分和药理作用的研究进展

石斛属植物化学成分和药理作用的研究进展一、本文概述石斛属(Dendrobium)植物,作为一种重要的中药材,具有悠久的药用历史。
近年来,随着现代科学技术的发展,对石斛属植物化学成分和药理作用的研究不断深入,揭示了其丰富的生物活性及药用潜力。
本文旨在综述石斛属植物的主要化学成分,包括多糖、生物碱、黄酮类化合物等,以及这些成分在抗肿瘤、抗氧化、抗炎等方面的药理作用研究进展。
通过梳理和分析相关文献,以期为石斛属植物的深入研究和临床应用提供参考。
二、石斛属植物的化学成分石斛属植物是一类具有丰富化学成分的中药材,其主要包括多糖、生物碱、黄酮类化合物等多种化学成分。
这些成分的存在不仅赋予了石斛属植物独特的药理活性,也为其在中医药领域的应用提供了物质基础。
多糖是石斛属植物中含量较高的一类化学成分。
多糖具有良好的免疫调节作用,可以提高机体免疫力,对抗病毒、细菌等外来病原体。
多糖还具有抗氧化、抗肿瘤等多种生物活性,对维持人体健康具有重要意义。
生物碱是石斛属植物中的另一类重要化学成分。
生物碱具有广泛的生物活性,如抗炎、抗菌、抗病毒等。
同时,一些生物碱还具有明显的抗肿瘤作用,对多种肿瘤细胞具有抑制作用。
黄酮类化合物也是石斛属植物中的重要化学成分之一。
黄酮类化合物具有良好的抗氧化作用,可以清除自由基,保护细胞免受氧化损伤。
同时,黄酮类化合物还具有抗炎、抗过敏等多种生物活性,对维持人体健康具有重要作用。
除了以上三类化学成分外,石斛属植物中还含有其他多种化学成分,如酚酸类、甾醇类、挥发油等。
这些成分的存在也为石斛属植物的药理作用提供了物质基础。
石斛属植物中含有多种化学成分,这些成分的存在不仅为其独特的药理作用提供了物质基础,也为石斛属植物在中医药领域的应用提供了广阔的前景。
未来,随着对石斛属植物化学成分和药理作用的深入研究,相信会有更多的应用被发掘出来。
三、石斛属植物的药理作用石斛属植物,作为传统中药材,具有广泛的应用价值和深远的药理作用研究前景。
石斛的药食同源功效——以铁皮石斛为例

石斛的药食同源功效——以铁皮石斛为例作者:王含芝熊梓君郝蓉蓉郭雅敏来源:《海外文摘·学术版》 2019年第11期王含芝熊梓君郝蓉蓉郭雅敏(陕西师范大学生命科学学院,陕西西安 710119)摘要:本文主要描述了石斛食用药用的发展历史,石斛的种质资源,并以铁皮石斛为主阐述了其药食同源功效;旨在提高人们对石斛的认知度,引起社会对铁石斛药食同源功效的关注,拓广石斛的应用价值,进而推动石斛种质资源的收集、保存和育种工作的开展以及铁皮石斛系列产品的开发。
关键词:铁皮石斛;药食同源;种质资源;主要功能;产品市场中图分类号:R2-03文献标识码:A 文章编号:1003-2177(2019)11-0125-041 石斛简介石斛(学名:Dendrobium nobile Lindl),又名仙斛兰韵、不死草、还魂草、紫萦仙株、吊兰、林兰、禁生、金钗花等。
茎直立,肉质状肥厚,稍扁的圆柱形,长10~60厘米,粗达1.3厘米。
为中国中草药中的常用药。
据清代医家赵学敏的《本草纲目拾遗》中可知,石斛可“清胃,除虚热,生津,已劳损,以之代茶,开胃健脾。
”在1995年出版的《中国植物志》[1]中,兰科石斛属项下共收载了76个植物种(含2个变种),2010年将石斛、铁皮石斛收入2010年版《中华人民共和国药典》[2]。
石斛多生长于云南,广西,台湾,四川等地[3]现代药理研究表明,石斛含有石斛碱、石斛次碱、6-羟基石斛碱,以及多糖,人体必需的氨基酸和微量元素等多种活性成分。
2 石斛的历史石斛属药材自2000年前的《神农本草经》中便有药用的记载,且被列为上品[4]。
石斛最早出现在《名医别录》中,至《神农本草经》正式定名,至今已拥有2000多年的药用历史。
2018年4月27日,卫健委发文“为进一步做好按照传统既是食品又是中药材物质(以下简称食药物质)管理工作,按照《食品安全法》规定,我委正会同有关部门和单位研究调整食药物质目录,拟在前期工作基础上,再增补一批物质。
道地药材霍山石斛及其相似种的分子鉴定

收稿日期:2008-04-27;修回日期:2009-03-31作者简介:刘明珍(1974-),女,汉,助理研究员,硕士,主要从事药用植物的组培及分子生物学研究;通讯作者:陈乃富(1962-),男,汉,教授,硕士,主要从事植物生化及植物资源开发应用研究,E 2mail:cnf505@s ohu 1com 。
基金项目:皖西学院自然科学青年研究项目(WXZ Q0716);植物细胞工程安徽省工程技术研究中心重点资助项目(CPCG2007001A )doi ∶10.3969/j 1issn 11008-9632.20091051034道地药材霍山石斛及其相似种的分子鉴定刘明珍1,陈乃富2,3,刘秀珍4,邓 辉2,3,李耀亭2,3,何祥林5(11皖西学院专科部,六安237012;21植物细胞工程安徽省工程技术研究中心,六安237012;31皖西学院化学与生命科学系,六安237012;41巢湖学院体育系,巢湖238000;51安徽省霍山县长冲中药材有限责任公司,霍山237266)摘要:为检测霍山石斛与霍山产铜皮石斛、霍山产铁皮石斛及其它产地的几种药用石斛的差异,对霍山石斛及其相似种进行I SS R 分子标记比较研究。
结果表明,尽管霍山石斛及其相似种的外部形态差异较小,但在I SSR 分子标记指纹图谱上却存在着显著而稳定的差异。
因此,根据I SS R 分子标记指纹图谱所显示的多态性位点差异,能准确鉴别霍山石斛及其相似种植物及药材。
此方法简单、稳定性高、可重复性好,在霍山石斛的分子鉴定研究中有较大的应用价值。
关键词:霍山石斛;霍山产铜皮石斛;霍山产铁皮石斛;I SSR 分子标记指纹图谱;鉴别中图分类号:Q94312文献标识码:A 文章编号:1008-9632(2009)05-0034-03霍山石斛(D endrobium huoshanense C 1Z 1Tang et S 1J 1Cheng ),又名霍石斛、霍斛、米斛、大别山石斛。
美花石斛RAPD—PCR反应体系的建立

LS IH NM DCN N A E I E IAR SA C 07V L 1 N . I Z E E IIEA DM T RAM DC E E R H20 O .8 O3 H
时珍 国 医 国药 20 0 7年 第 1 8卷第 3期
M e ho s o e ct n c n to s o tmied by a piyn e h lg n t o o CR a e n ioa ig g no i DNA t d S me r a i o diin wa pi z m l ig tc noo y a d me h d f P o f b s d o s ltn e m c fo D. 1d g si Re uls r m o die i. s t Th es mpl c t y t frD. 1 d i siwa sf lws:ttlra to olme25 l n l d n e b ta i a i s sem o i f on o dgei sa ol o oa e ci n v u ,ic u i g 1 2 mmo . l・L 一 M g , 2 n t q p lme i c.0. 1 u ie Ta oy r 3 mm o l・L r n om rme ,46 n e ad p] r g tmplt ae DNA n 6 mo adl0m l・L 一
Absr c : jcie T s bih te b s e cin c n io fRAP —P mpic t ns s m fD n rbu o dg s . t a t Obe t oet l h e trat o dt n o v a s o i D CR a l ai yt o e do im ld iei i f o e i
石斛生药学综述

3 DNA指纹图谱分析方法DNA 指纹图谱泛指一切具有某一种质特异性的谱带,目前它是区分不同的种质资源,鉴别不同种和品种的有力工具,且不受组织部位、发育时期和外界环境等因素的影响。
目前,在石斛属植物上应用较多的主要有以下5种。
3.1 RAPD图谱朱胜男等[1] 利用18条RAPD引物就区分开31种石斛属植物。
肖鲲等[2] 则报道了用RAPD技术构建石斛属内7种石斛和一种石仙桃属植物的RAPD 指纹图谱。
而在种内,包英华等[3] 和丁鸽等[4] 分别采用RAPD技术分析了不同产地的野生美花石斛( D. loddigesii )和铁皮石斛,筛选的引物均能有效地鉴别各自不同的野生居群。
上述丰富的扩增多态性证明,RAPD技术对石斛种质及其石斛伪品的鉴定是有效的。
3.2 AFLP图谱Zhu和Li [5] 利用AFLP技术分析了中国石斛的37个种和源于日本、韩国的63个石斛杂交品种,8对引物共扩增出1655条多态性带。
白音[6] 利用筛选的8 种coR I和Mse I选择性引物组合也将41种药用石斛及其混淆品完全区别开。
Li等[7] 则利用AFLP标记技术分析了12个铁皮石斛居群,发现居群内存在遗传分化,而居群间遗传变异达26.97%。
这些结果证明,AFLP标记可用于石斛原生种、商业品种以及混淆品的指纹图谱研究,而对石斛居群遗传多样性和居群结构研究同样有效。
虞泓等[23]采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对石斛内4个种和1个外类群种进行基闪组DNA多态性分析.结果从64对引物组合中选出5对引物组合构建了5个种的DNA图谱.通过聚类分析。
石斛属4种植物聚成一个大类,彼此关系得到了很好的分辨,并获得了bootstrap 检验的有力支持.该实验充分说明AFLP技术可用于药用石斛DNA指纹图谱研究.3.3 SSR图谱Yue等[8] 以42个石斛杂交品种为材料开发了14个SSR多态性标记,并将其用于石斛品种鉴定和石斛新品种的保护。
铁皮石斛phytocyanin基因家族全基因组分析

in symbiotic with Tulasnella calospora and asymbiotic germinated seeds from D.( ̄icinale hy using RNA-seq data
showed that 1 6 DoPCs were expressed in symbiotic germinated seeds,and DoUCL2,4 and DoENODLI 4 had the highest expression with different levels. Seven DoPC genes were obviously up—regulated and only one was down—reg-
Research Institute of Forestry,Chinese Academy of Forestry,Beijing 100091,China)
Abstract:[objective]To study the sequence characteristics of Dendrobium off icin rIfP[Method]Local BLASTP was used to search the phytoo,an,in gene of D.t ̄ cinale(DoPCs)in the database of Dendrobium whole genome,and
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第26卷第4期 西 南 农 业 大 学 学 报(自然科学版)Vol.26,No.4 2004年8月Journal of Southwest Agricultural U niversity(Nat ural Science)Aug.2004文章编号:1000-2642(2004)04-0437-04石斛的分子生物学鉴定 基于RAPD分析彭 锐,李泉森,李隆云(重庆市中药研究院,重庆 400065)摘要:利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了15种石斛属药用植物,选用10个有效引物(10bp)扩增出99条DNA片段,用于遗传多样性分析、构建U PGM A聚类图。
分析结果表明:RA PD方法能有效鉴别所试石斛属植物,其多态位点百分率为84.85%,表现出丰富的遗传多样性。
关 键 词:石斛属;RA PD;遗传多样性中图分类号:S567.901 文献标识码:ARAPD-BASED M OLECULAR IDENTIFICAT ION OF DENDROBI UM SPECIESPENG Rui,LI Quan-sen,LI Long-yun(Chongqing Academy of Chinese M ateria M edica,Chongqing400065,China)Abstract:Fifteen species of the g enus Dendr obium were analyzed,using RAPD(random amplified polymorphic DNA)technique.T en decanucleotide pr imers(10bp)w ere selected from70pr imers,and99bands o f amplification w er e obtained,which w ere used for RA PD analysis.Based on the RAPD profile,a dendrog ram of cluster analysis of the species studied was co nstructed according to their similar ity coefficients.It is concluded that RAP D is effective in characterizing Dendrobium species.T he hig h per centage of polymorphic loci (84.85%)in the species indicates that this genus is highly diverse genetically.Key words:Dendr obium;RAP D;genetic diversity中药石斛为贵重中药材,药用研究悠久,中国药典2000年版收载的石斛来源有铁皮石斛(Dendrobi-um off icinale Kimura et Migo C,D.candidum Wasll ex Lindl,Ch.P.)、金钗石斛(Dendr obiunm nobile Lindl)、束花石斛(Dendrobium chrysanthum Wall.ex Lindl)、粉花石斛(Dendrobium loddigesii Rolfe)、流苏石斛(Dendr obium f im br iatum H ook)的新鲜或干燥茎。
石斛的生境独特,资源紧缺,因此能够采到的石斛均被收购做药用,致使野生资源遭到毁灭性破坏,而且造成商品石斛的来源十分复杂。
目前市场上流通的商品石斛中,药典收载种类较少,主流品种大多为非药典收载种,有30余种石斛属及部分石仙桃属(Pholidota lind.Ex H ook)、金石斛属(Fliclingeria Haw kes)和石豆兰属(Bulbop hyllum Thou)植物在市场上流通做石斛用,这些植物的茎加工成药材后,外形相似,形态鉴别比较困难,不仅如此,石斛属植物种间化学成分差异较大,且化学成分研究也不够深入,用理化方法鉴定石斛药材种类十分困难。
因此建立有效的中药石斛鉴定方法,研究我国石斛植物的种系关系十分必要。
20世纪90年代在Polymerase China Reaction (PCR)技术基础上发展起来的随机扩增多态性DNA (radom amplified polymorphic DNAs,简称RAPD),已成功地应用于遗传多样性的检测、基因定位、品系鉴定和系统研究等诸多领域,也成功地应用于中药材品种鉴定,这一方法快速、简便、灵敏度高。
为此,我们运用RAPD分析技术,对15种石斛进行研究,以确定它们之间的分类位置,并为中药石斛鉴定提供新方收稿日期:2003-12-30基金项目:重庆市科委应用基础课题资助项目(2000-6271)作者简介:彭 锐(1970-)男,四川营山人,重庆市中药研究院助理研究员,硕士,从事药用植物生物技术和资源再生研究。
法。
1 材料与方法1.1 材料供试材料的名称及来源见表1,搜集到的资源种植于重庆市中药研究院标本园。
形态学鉴定均根据植物的花、叶、茎、根按检索表分类鉴定。
表1 供试材料和来源T able1 Experimental accesi ons and source编 号number材料来源material origin采集地点collection place1Dendr obium nobile 金钗石斛四川合江2D.lohohense 罗河石斛重庆南川3D.pe ndulum 肿节石斛云南思茅4D.f alconer i 串珠石斛云南思茅5D.monilif or me 细茎石斛云南景洪6D.lodd igesii 环草石斛云南景洪7D.cand idu m 铁皮石斛贵州荔波8D.d enneanu m 迭鞘石斛四川合江9D.p ar ishii 紫瓣石斛云南景洪10D.lituif loru m 喇叭唇石斛云南思茅11D.f imbriatu m 马鞭石斛贵州荔波12D.moschatum 杓唇石斛贵州独山13D.stuposum 叉唇石斛贵州独山14D.capillipes 短棒石斛贵州赤水15D.d ensif loru m 密花石斛贵州赤水1.2 方法1.2.1 石斛总DNA提取 改进CTAB法:参照曾 查等[4],并做适当修改。
称取新鲜嫩叶0.5g,装入5mL离心管中,最后沉淀缓冲液为[CTAB1%,Tris -H CL(pH8.0)50mol/L,EDTA10mol/L,巯基乙醇1%],室温放置40min,10000r/min离心10min,小心去上清液,用75%乙醇洗涤3次,弃洗液,挥干。
溶于100 L双蒸水中。
1.2.2 引物的筛选 引物选用上海生物工程公司(Sangon)的S序列引物(S20~80,S161~170)共计70个进行筛选,每4个样品筛选10个引物后更换另外4个引物,依次类推,直到70个引物全部筛选,从中选择谱带清晰且呈多态性的引物用于所有样品的扩增,以此鉴定石斛不同种的PCR谱带多态性。
1.2.3 RAPD分析 反应总体积25 L,其中引物2 L、T ag酶1.5U、dNTps0.2mmol/L、M gCl21.5 mmol/L、10 PCR buffer2.5 L。
扩增程序为预变性94 1m in,36 1min,72 2min共30个循环,最后延伸72 10min。
取10 L扩增产物于1.1%琼脂糖凝胶(含溴化乙锭,EB)中,4V/cm电压下电泳,电泳缓冲液为0.5 TBE,以 DNA作为分子量标准,电泳后用紫外光透射反射仪拍照。
PCR反应每1个随机引物重复2次,从中选择再现性好的谱带进行分析。
PCR进行0/1数据处理,在相同迁移位置上带记为 1 ,无带记为 0 。
种间相似数(S)采用公式S=2N ij/(N i+N j),其中N i,N j 为2样品的总扩增带数,N ij为2样品的共有扩增带数,相似系数越大,表明其种系关系越近;利用非加权成组算术平均法UPGMA(U nw eighted pair proup method using an arithmetic average)进行聚类,聚类分析采用RAPDISTANCE[3]统计分析软件。
2 结果与分析2.1 引物筛选及DNA扩增结果利用70个随机引物对石斛材料总进行扩增(图1),从70个随机引物中对所有实验材料扩增产物具有多态性的引物18个,占所有引物的25.7%,其中重复性好、多态性明显的有效引物10个,分别是S26, S35,S66,S69,S70,S80,S163,S165,S166,用于15个种的正式扩增。
共扩增出99条DNA带谱,其中多态性带84条,占总带数的84.85%,每个引物扩增DNA带数6~15条,平均9.9条(表2)。
扩增的DNA带的长度范围为0.5~2.2Kpb。
不同引物得到了各自不同的RAPD产物图谱,图1列示出引物S70产生的多态型图谱。
表2 10个有效引物的扩增结果Table2Amplification of10effective primers引 物Primers总扩增带Total sites多态性带Polymorphicsi te多态性带比例/%Ratio ofpolymorphic S268787.5S356466.67S6*******.09S669888.89S696583.33S7*******.31S8*******.33S163151280.00S1*******.00S1669888.89总 带998484.852.2 聚类分析根据DNA扩增结果计算品种及类型间的相似系数(表3),用U PGMA法作成遗传聚类树状图(图2),由图2可见,取相似系数0.701时,参试种分为3类,第1类包括短棒石斛和密花石斛,第2种包括细茎石斛、环草石斛和铁皮石斛,第3类包括紫瓣石斛、喇叭唇石斛、迭鞘石斛、马鞭石斛、叉唇石斛、金钗石438西 南 农 业 大 学 学 报 (自然科学版) 2004年8月斛、罗河石斛、肿节石斛、串珠石斛、杓唇石斛共10种。
如果取相似系数0.847时,则参试种聚为7类,如图2所示。
图1 由引物S 70产生的RAPD 带型(图上数字的代表种见表1,M : DNA/Hind +EoR )Fig 1 RAPD profiles generated by primer S 70(The number on top refers to the species listed in Table1,M : DNA/Hind +EcoR )3 讨论3.1 RAPD 技术在中药石斛鉴定应用上的可行性由于RAPD 技术简单、快速、灵敏度高,对研究材料的数量要求少及质量要求低等特点,因而受到人们的广泛关注,汪小全等[7]利用RAPD 技术对升麻属(Cimicif iga 、类升麻属(Actaea)和乌头属(A coni -tum )进行了属间分类,结果与经典分类学的研究相吻合;曾 明等[8]利用RAPD 技术对葛属(Puerar ia)6种植物进行分析,结果表明,RAPD 技术可用于葛属植物鉴别;肖小河等[9]运用RAPD 分析了姜黄属(Curcuma L.)10种植物,能将10种姜黄属植物鉴别,澄清了姜黄属植物的一些分类学争议;黄璐琦等[10]探讨了在细辛类药材中RAPD 反应的影响因素及其解决办法,结果表明RAPD 方法可用于属以下的等级鉴定。